siRNA沉默LBH基因促进人支气管上皮细胞周期进展

目的: 利用合成的小分子干扰RNA(siRNA)转染人支气管上皮细胞16HBE,观察LBH(limb-bud and heart) 基因表达下调对16HBE细胞周期及相关基因表达的影响。方法: 脂质体2000转染靶向LBH 基因的siRNA到16HBE细胞,荧光定量RT-PCR检测siRNA转染后LBH基因表达,流式细胞术检测LBH基因沉默后16HBE 细胞周期的改变,荧光定量RT-PCR及Western blotting检测LBH基因沉默后细胞周期素E1和E2表达水平。结果: 50 nmol/L siRNA转染16HBE细胞48 h后, LBH基因的表达水平只有对照组的14%;siRNA转染16HBE细胞48 h,其G₁期细胞百分率比对照组减少9.28%,而S期细胞百分比增加14.08%;16HBE细胞在50 nmol/L siRNA的转染后,细胞周期素E2的表达水平为对照组的2倍,而细胞周期素E1的表达没有发生明显改变。结论: 靶向于LBH基因的siRNA能有效沉默16HBE细胞中LBH基因的表达,LBH基因的表达下调促进了16HBE细胞周期G₁/S期的进展;细胞周期素E2的表达上调参与了LBH沉默导致的细胞周期G₁/S期的进展。     

荧光定量PCR用于重组杆状病毒鉴定及病毒滴度检测的研究

目的：建立一种高效﹑简便的荧光实时定量PCR方法，用于重组杆状病毒鉴定及病毒滴度的检测。方法：利用Bac-to-Bac载体系统在昆虫细胞中构建含人IL-18基因的重组杆状病毒，收获的病毒母液以10倍梯度系列稀释后，提取病毒基因组DNA。以10倍梯度稀释的重组杆状病毒穿梭质粒（bacmid）作为标准模板，进行荧光定量PCR反应扩增IL-18基因片段并绘制标准曲线，然后以上述的重组杆状病毒基因组DNA作为模板，采用同样体系进行实时PCR反应检测，同时用琼脂糖空斑法测定病毒母液的滴度。结果：成功构建了重组杆状病毒并建立了病毒滴度的实时荧光PCR检测方法。运用标准模板进行的PCR反应显示该方法的线形范围为101-108拷贝，病毒母液的DNA拷贝浓度（vg/mL）值约为空斑检测的滴度 pfu/mL值的10倍。结论：荧光定量PCR方法可灵敏快速地鉴定重组杆状病毒，并在较大的线形范围内检测重组杆状病毒滴度，较之空斑法更准确地反映了重组杆状病毒的实际数量。     

实时荧光定量PCR在检测人ANP基因表达的应用

目的建立心房钠尿肽（ANP）基因mRNA表达水平的实时荧光定量PCR检测方法,并对该方法进行初步评价。方法以基因表达产物为模板,建立实时荧光定量PCR检测方法,对样本中的心房钠尿肽含量进行相对定量,比较不同样本组的基因表达水平。结果所建立的实时荧光定量PCR方法熔解曲线中熔解峰单一。肺癌患者胸腔样本的ANP含量为对照样本的4.68倍,血清样本为对照样本的16.03倍。结论所建立的ANP实时荧光定量PCR检测方法具有较高的特异性。肺癌患者胸腔液和血清中ANP的含量明显增高。     

实时荧光定量RT-PCR法定量检测手足口病病原体的探讨

目的了解北京市门头沟区手足口病患儿感染病毒的型别,探索用荧光定量RT—PCR法对手足口病患者咽拭子标本中肠道病毒71型（EV71）、柯萨奇病毒A16（CoxA16）型病毒载量进行定量检测的可行性。方法采用实时荧光RT—PCR体外扩增法对81例手足口病患儿咽拭子标本提取的RNA进行检测。结果28例手足口病患者体内CoxA16病毒载量〉10^3 copies·ml-1。实时荧光定量RT—PCR法构建的标准曲线显示,样本阈值环数（Ct）值与病毒拷贝数的对数（10g10）之间的相关系数为0．9998,相关性良好。4例手足口病患者咽拭子标本中EV71型病毒载量〉10^3 copies·ml-1。实时荧光定量RT-PCR法标准曲线显示,Ct值与病毒拷贝数的对数之间的相关系数为0．9996,相关性较好。结论门头沟区手足口病病原谱以CoxA16型为主,34．6％的手足口病患儿CoxA16型病毒载量〉10^3 copies·ml-1,4．9％的患儿EV71型〉10^3 copies·ml-1。实时荧光定量RT-PCR法对咽拭子标本中CoxA16、EV71核酸定量检测比较简便快速、结果直观、稳定性强,为进一步探讨患者体内病毒载量与临床症状的关系打下了良好的基础。     

哺乳动物细胞POLK、POLH、POLI基因对甲基硝基亚硝基胍的应答反应及其启动子区转录因子结合部位的生物信息学分析

目的:观察甲基硝基亚硝基胍（MNNG）对培养细胞DNA聚合酶κ、η、ι编码基因表达的影响并用生物信息学方法预测它们的启动子区和启动子区中的转录因子结合部位。方法:利用半定量RT-PCR观察POLK、POLH、POLI基因表达改变。利用在线生物信息学软件，确定它们的启动子区，然后，用转录因子预测软件并结合进化足迹法检出包括启动子区在内的 3 000 bp 碱基上游序列中的转录因子结合部位。结果:0.2 μmol·L-1 MNNG导致细胞POLH和POLI表达水平在处理后6-24 h 间逐渐上升，升高约1倍；而POLK则呈下降；通过转录因子预测软件分析，在POLK 、H和I启动子区分别检出了384个、413个和689个推断的转录因子结合部位；通过进化足迹法分析有效地降低了假阳性率，推断的转录因子结合部位分别下降到158个、80个和40个。结论:低浓度MNNG导致POLH、POLI表达水平升高，而POLK表达水平降低;通过在线软件，我们成功地在POLK，POLH，POLI启动子区分别检出。158、80和40个推断的转录因子结合部位；进化足迹法分析能够有效降低预测软件的假阳性率。     

单细胞实时荧光定量PCR结合比较阈值法在诊断唐氏综合征中的应用

目的探讨单细胞水平实时荧光定量PCR技术对于诊断唐氏综合征的应用价值。方法22例唐氏综合征患者及胎儿、40名正常对照外周血或脐血经梯度离心、显微操作分离单个淋巴细胞，应用引物延伸预扩增及实时荧光定量PER技术扩增基因组12号染色体上GAPDH基因、21号染色体上S100B基因和DSCR1基因。比较病例组与对照组ACT值有无差异，计算病例组S100B／GAPDH、DSCR1／GAPDH的值。结果两组间ACT值差异有统计学意义（P〈0．01），病例组低于对照组。病例组S100B／GAPDH、DSCR1／GAPDH值分别为1．891（1．563～2．287）、1．840（I．562～2．168）。结论实时荧光定量PCR是一种可信的诊断方法，为唐氏综合征的无创性产前诊断及植入前遗传学诊断等提供了新的思路。     

MTH1基因表达的半定量RT-PCR检测方法的建立

目的建立一个检测培养MDCK细胞内MutT同源蛋白1（MTH1）基因表达的半定量RT-PCR体系。方法细胞培养后提取总RNA,经优化RT-PCR反应检测细胞内MTH1基因的表达量。条带经ScionImmage软件分析并与内参基因GAPDH相比,对体系的准确性、重复性和灵敏度进行分析,然后运用本体系检测流感病毒感染后MDCK细胞内MTH1的表达。结果扩增产物经测序分析证实与GenBank中该细胞的MTH1基因序列一致;灵敏度检测发现最低可从50ng总RNA中检出目的基因的表达;重复性测定发现,MDCK细胞MTH1与GAPDH灰度值比值的均值为（2.02±0.09,n=10）,CV值为4.31%。结论本方法的准确性、重复性和灵敏度均较好,可用于半定量检测培养细胞尤其是MDCK细胞内MTH1 mRNA表达量。     

内皮型一氧化氮合酶基因在大鼠心肌细胞和非心肌细胞中的表达

根据大鼠内应型一氧化氮合酶（eNOS）和3-磷酸甘油醛脱氨酶（GAPDH）的cDNA序列分别设计特异引物,用逆转录聚合酶链式反应（RT-PCR）检测eNOS基因在大鼠心肌细胞和非心肌细胞中的表达,并以GAPDH为内标,用内参比法作RT-PCR定量。结果表明：eNOS基因在新生大鼠心、肾、脑等组织皆有表达,脑中最多、肾脏次之、心脏较少;在培养的新生大鼠心肌细胞和非心肌细胞中,检测到eNOS基因的表达,其中在心肌细胞的表达高于非心肌细胞;培养基中不同的血清浓度对心肌细胞和非心肌细胞的oNOS基因表达无明显影响。     

实时荧光定量反转录聚合酶链反应检测HLA-DRα基因mRNA表达

目的 建立实时荧光定量反转录聚合酶链反应（RT-PCR）法检测HLA-DRα基因mRNA表达。方法应用T-A克隆技术构建含HLA-DRα基因的载体作为标准模板,采用荧光Taqman方法及探针标记技术,建立实时荧光定量RT-PCR方法,制备标准曲线,检测牛膝多糖（ABPS）诱导人外周血单核细胞的HLA-DRα mRNA表达水平变化,并与半定量RT-PCR检测结果进行比较。结果实时荧光定量RT-PCR检测ABPS诱导人外周血单核细胞实验组HLA-DRα mRNA表达明显升高,而无ABPS诱导人外周血单核细胞对照组HLA-DRα mRNA表达没有改变,且半定量RT-PCR结果显示HLA-DRα出现类似的变化趋势。结论所建立的实时荧光定量RT-PCR用于检测HLA-DRα mRNA表达,结果用拷贝数表示,比半定量RT-PCR更灵敏、准确。     

用SYBR-GreenⅠ实时荧光PER结合融解曲线分析法诊断α-地中海贫血

目的建立自动化、高通量、准确快速检测缺失型α-地中海贫血基因型的技术。方法应用SYBR-Greenl进行两个实时荧光聚合酶链反应（real-time fluorescence polymerase chain reaction with SYBR-Green 1，SYBR-PCR），检测左缺（-α^4.2）、右缺（-α^3.7）等位基因，同时进行融解曲线（dissociation calve，DC）和Tm（melting temperature）值分析。PCR产物重组到pCR2．1，重组子梯度稀释作为模板检测灵敏度，确定两种等位基因型（-α^4.2，-α^3.7）的检测下限，并对110份DNA样品进行检测。结果检测-α^4.2和-α^3.7的PCR产物长度分别为1．65kb、1．9kb，Tm分别为（81．5±0．5）℃、（82．5±0．5）℃，检测下限分别为9×10^2个拷贝、4．3×10^2个拷贝。该检测技术的灵敏度较常规PCR结合琼脂糖凝胶电泳法高10倍。结论SYBR-Greenl实时荧光PCR结合融解曲线分析及Tm分析可以灵敏、准确地检测-α^4.2、-α^3.7、αα（包括α^Tα）及--^SEA4种等位基因，从而为各种缺失型α-地中海贫血做出基因诊断。该技术具有自动化程度高，不需荧光标记探针，成本低，易质控，防污染，高通量等优点，适于临床推广应用。     

耐甲氧西林葡萄球菌荧光定量PCR检测方法的实验研究

目的建立一种简便、特异的mecA基因荧光定量PCR检测方法，用于耐甲氧西林葡萄球菌（MRS）的快速鉴定。方法以煮沸法快速制备DNA模板，采用SYBRGreenI随机参入法，建立mecA基因的实时荧光定量PCR检测体系。并对检测体系的敏感性、特异性和灵敏度进行评价。结果本法对纯菌落的检测敏感性和特异性分别为98．5％和96．9％，检测灵敏度可达10^1CFU／ml，最小检菌量约为3个菌／反应体系。结论本实验所设计的荧光定量PCR方法用于MRS的检测具有快捷、高敏感性、高特异性和高灵敏度的特点。适用于MRS的快速检测。     

利用双色实时荧光定量PCR法快速进行产前诊断

目的利用双色实时荧光定量PCR法进行21-三体与18-三体的快速产前诊断。方法分别以21号的APP基因与18号染色体的TYMS基因为目的基因设计引物和不同荧光标记的Taqman探针,以相对定量指标△CT值判断21号与18号染色体的数目;并将其检测结果与传统染色体核型分析方法进行对比。结果60例羊水细胞区分出了4例21-三体,3例18三体标本,正常人的△CT值为-0．89±0．22,21-三体患者及18-三体患者的ACT值分别-0．04±0．17和-1．55±0．24,患者与正常人标本组之间无交叉重叠,均有明显差异（P〈0．001）。结论实验建立的双重实时荧光定量PCR能用于快速诊断羊水细胞的21-三体和18-三体等非整倍体。     

实时荧光定量PCR检测腮腺沃辛瘤中Gadd45β表达

目的：从分子学水平检测腮腺沃辛瘤相对于瘤旁腮腺组织中生长抑制和DNA损伤修复基因45β（ Gadd45β） mRNA表达情况并探讨其在沃辛瘤的形成及发展中的意义。方法搜集30例腮腺沃辛瘤组织及瘤旁正常腮腺组织。提取总RNA，然后进行逆转录得到cDNA，再进行实时荧光定量PCR检测，测出CT值，通过2－△△CT的相对定量的方法对荧光定量PCR检测的CT值进行标准化，从而比较肿瘤组织及瘤旁正常腮腺组织中Gadd45βmRNA表达情况。结果 Gadd45β在正常腮腺组织及肿瘤组织中均有表达，分别为1．516±0．104和1．177±0．089， Gadd45β在沃辛瘤中表达明显下调（P＜0．05）。结论 Gadd45β表达下调可作为沃辛瘤发病机理一部分。     

荧光定量PCR用于重组杆状病毒鉴定及病毒滴度检测的研究

目的：建立一种高效、简便的荧光实时定量PCR方法,用于重组杆状病毒鉴定及病毒滴度的检测.方法：利用Bac-to-Bac载体系统在E.coli菌株DH10 Bac中构建重组杆状病毒穿梭质粒（Bacmid）和在昆虫细胞中构建含人IL-18基因的重组杆状病毒,纯化的重组Bacmid作为PCR检测的标准模板,由昆虫细胞中收获的病毒母液用于空斑测定和病毒DNA提取.以10倍梯度稀释的重组Bacmid作为标准模板,进行荧光定量PCR扩增IL18基因片段并绘制标准曲线,然后以提取的重组杆状病毒DNA作为模板,采用同样体系进行实时PCR反应检测.同时,以琼脂糖空斑法测定病毒母液的滴度.结果：成功构建了重组杆状病毒并建立了病毒滴度的实时荧光PCR检测方法.运用标准模板进行的PCR反应显示该方法的线形范围为101～108拷贝,病毒母液的DNA拷贝浓度（vg/ml）值约为空斑检测的滴度pfu/ml值的10倍.结论：荧光定量PCR方法可灵敏快速地鉴定重组杆状病毒,并在较大的线性范围内检测重组杆状病毒滴度,较之空斑法更准确地反映了重组杆状病毒的实际数量.     

用SYBR—Q—PCR结合融解曲线分析及mPCR检测江西籍三种常见的缺失型α—Thai基因

目的用自动化、高通量、准确快速技术检测江西省缺失型α—Thal基因。方法用实时荧光定量聚合酶链反应（SYBR—Q—PCR）结合融解曲线（D．C）分析及用单管多重聚合酶链反应（mPCR）技术检测-^SEA、-α^3.7和-α^4．2缺失型α-Thal基因。结果SYBR—Q—PCR结合融解曲线分析较mPCR结合琼脂糖凝胶电泳法高出16倍以上，用SYBR—Q—PCR结合D．C、mPCR技术检测出^--SEA、-α^3.7和-α^4.2。19例江西籍α—Thal检出^-SEA／-α^4．2-^SEA／-α^3.7-α^3.7／-α^3.7-α^4.2／-α^4.2-α^3.7／-α^4.2。结论SYBR—Q—PCR和mPCR能简单、省时、经济、准确的检测3种常见α-Thal缺失基因的方法。SYBR—Q—PCR结合融解曲线分析技术是一种高敏感、快速、自动化程度高、高通量，并不需要荧光标记探针。     

RNA干扰抑制BUB1基因表达对染色体分离的影响

目的：研究 BUB1基因表达调控对染色体分离的影响。方法：用定量 RT-PCR 比较 RNA 干扰前后的胚胎细胞内源性基因 BUB1的 mRNA 水平,同时对染色体数目异常率进行比较分析。结果：干扰后 BUB1基因 mRNA 拷贝数/GAPDH 基因 mRNA 拷贝数的均值为干扰前的21．80%,染色体数目异常率均值由干扰前 5．02%上升到29．61%。经统计分析,RNA 干扰前后 BUB1基因 mRNA 水平和染色体数目异常率有显著差异。结论：BUB1基因表达的降低会导致染色体分离的异常,本研究为染色体分离相关蛋白功能研究建立了新的研究手段和实验评价体系。     

小鼠哮喘模型颈静脉-结状神经节内参基因的筛选

目的　观察12个常用看家基因在正常小鼠和哮喘小鼠颈静脉-结状神经节的表达变化,选择合适的内参基因为进一步基因表达分析研究得到可信数据提供依据。 方法　雌性BALB/c小鼠随机分为哮喘模型组和对照组,制备哮喘模型,用实时荧光定量PCR技术,经geNorm及Normfinder程序分析,评价了12个常用看家基因CYC1、UBC、RPL13、YWHAZ、18srRNA、B2M、SDHA、ATP5B、CANX、　ACTB、EIF4A2和GAPDH在小鼠颈-结状神经节的表达稳定性。 结果 12个候选看家基因在小鼠神经节的表达差异较大,其中GAPDH、18srRNA、CANX、ACTB和EIF4A2表达相对稳定,而CYC1、UBC和RPL13的表达在两组小鼠神经节变化幅度较大,结合两种分析证实GAPDH是其中最稳定的内参基因。 结论 本研究结果提示GAPDH是研究哮喘小鼠和正常小鼠颈静脉-结状神经节基因表达的最佳内参基因,同时也为进一步认识在不同实验模型确定适宜内参基因的重要性提供依据。     

α变形菌纲磁螺菌属TaqMan探针实时荧光定量PCR快速检测方法的建立

目的建立一种快速有效检测环境中q变形菌纲磁螺菌属细菌的方法。方法本研究以α变形菌纲磁螺菌属保守且特异的16SrRNA片段为靶序列,化学合成基因序列,制备重组质粒作为磁螺菌属检测的标准品;用实时荧光定量聚合酶链反应（FQ—PCR）技术,针对目的片段基因设计特异性引物和TaqMan荧光探针,进行实时荧光定量PCR检测,运用统计学方法评价该方法的特异性、敏感性及重复性。结果本实验成功构建了质粒PUC19-QC,引物、探针特异性良好,标准曲线在5．10×10^1～5．10×10^7拷贝数之间具有较好的线性关系,相关系数R2=0．999。该法最低可检测到5．10x10个DNA拷贝数,灵敏度明显高于普通PCR;重复性试验表明．荧光定量PCR检测结果Ct值波动范围较小,α值的标准差均小于0．23,表明该法重复性好,可靠性高。析因方差分析表明不同稀释度之间的ct值差异有统计学意义（F=3125．305,P〈0．001）,三个批次的再现性良好,差异无统计学意义（F=0．057,P=0．945）,而浓度分组与时间之间也无交叉效应（F=0．533,P=0．873）。结论本实验所建立的TaqMan探针实时荧光定量PCR检测技术,能够快速有效地检测仅变形菌纲磁螺菌属细菌,且检测结果稳定,受外界条件如时间、气温等影响小。     

竞争性PCR内参照菌的构建及应用

目的　建立一种构建竞争性PCR内参照菌的方法 ,并初步应用于铜绿假单胞菌 (Pseu domonasaeruginosa ,简称PA)的竞争性PCR定量检测。方法　通过整合载体pSX1 2和pUC19 attP tetr 将竞争模板插入大肠杆菌JM83染色体中 ,构建内参照菌JM83/16SN。以JM83/16SN作为内参照 ,建立PA竞争性PCR定量和半定量检测方法。结果　细菌质粒限制性酶切分析、药敏试验及染色体DNA指纹图谱分析证实竞争模板已插入到JM83/16SN染色体中。在竞争性PCR定量法中 ,得出定量回归方程y = 1 99x 14 0 5 (r= 0 97)。将 10倍系列稀释的PA标本作竞争性PCR半定量检测及定量培养 ,其结果存在良好的一致性。结论　通过整合载体可以将竞争模板插入大肠杆菌染色体中来构建内参照菌株。竞争性PCR半定量法可以简便、准确地测定标本中PA浓度范围