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癌症基因组图谱(TCGA)是一个公共资助的项目,旨在编目和发现引起癌变的主要人类基因组变化,目标是创建癌症基因组的全面“图谱”。TCGA数据库收录了多种癌症组学数据,包括转录组数据、表观遗传组学数据、基因突变数据和疾病样本临床数据等,为认识肿瘤发生的相关知识提供了丰富的资源,可以帮助科研人员更好地学习和认识癌症相关领域知识并促进肿瘤精准医学的实现。调查整理了TCGA数据在线分析工具并对其进行筛选推荐,可以帮助研究人员方便地进行TCGA数据分析。 相似文献
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目的 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库挖掘与乳腺癌预后相关的铁死亡基因,构建乳腺癌预后模型.方法 下载TCGA数据库中转录组与临床数据,获取与预后相关的在乳腺癌组织与癌旁正常组织中存在差异表达的铁死亡基因,利用最小绝对收缩和选择算子(LASSO)回归法构建风险评分模型.将TCGA数据库中获取的患者信息作为模型测试集... 相似文献
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癌症基因组学科学计划的实施,推进了分子层面疾病诊断、疾病预防检测和靶向治疗等临床应用,积累了大规模的癌症基因组学数据,对癌症基因组数据进行有效挖掘和利用,成为该领域的研究重点。在高通量癌症基因组学数据挖掘的基础上,以美国国家癌症研究中心的癌症基因组数据为研究对象,利用文本挖掘技术对特异癌症基因加以注释和可视化展示,即从基因功能描述文本中识别疾病实体和药物实体,从临床应用的角度注释高通量数据挖掘结果,便于研究人员从高通量的数据和科学文献中发现疾病、药物及基因之间的关系。 相似文献
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目的 基于癌症基因组图谱?(TCGA)?数据库筛选调控子宫颈癌发生发展的遗传突变基因,并探讨突变基因的临床价值.方法 从TCGA数据库下载子宫颈癌相关单核苷酸多态性数据和表达谱数据.通过R软件进行差异表达分析.通过DAVID软件对差异表达基因进行基因本体论?(GO)?和京都基因与基因组百科全书?(KEGG)?通路富集分... 相似文献
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目的·基于癌症基因组图谱数据库TCGA(The Cancer Genome Atlas)探讨胃癌可变剪接与肿瘤免疫的关系.方法·下载TCGA数据库中375例胃癌患者及32例配对癌旁正常组织的转录组、基因组数据和所有纳入研究的胃癌患者的临床信息,以及Spliceseq数据库452例胃癌及配对癌旁样本的剪接百分比数据.在G... 相似文献
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基于癌症基因组图谱肺鳞状细胞癌免疫细胞浸润图景及预后分析 总被引:1,自引:1,他引:0
目的 探讨肺鳞状细胞癌组织免疫细胞浸润全景,构建预后风险评估模型,分析并评估患者的预后.方法 利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库肺鳞状细胞癌全转录组数据,通过R 4.0.3软件利用CIBERSORT反卷积算法计算不同免疫细胞浸润相对含量,用单因素和多因素Cox回归分析建立预后风险评估模型,并用ROC曲线评估模型效能,... 相似文献
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《山东中医学院学报》2011,(4):318-318
美国MD安德森癌症中心肿瘤基因组学核心实验室主任张微近日透露,由美国发起的癌症基因组图谱研究计划,已成功绘制出卵巢癌和神经胶母细胞瘤的基因组图谱。未来5年,结肠癌、乳腺癌、白血病、子宫癌等全球25种最主要癌症的基因组图谱将陆续被描绘出来, 相似文献
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目的 应用生物信息学方法分析筛选胃癌患者差异表达基因,探讨其在胃癌发生发展及预后中的临床价值及意义.方法 在癌症基因组图谱(The cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中下载胃癌基因表达相关的数据,利用Perl构建基因表达矩阵并提取患者临床病理信息;利用R语言中的edgeR程序包筛选表达差异基因;U... 相似文献
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旨在通过对中医药学科学数据汇交的目的和意义论述,证实加强、加速对中医药科学数据保护与共享对中医药发展的重要战略意义。特别阐述了对最新科研项目所产生的科学数据汇交中存在的问题以及解决这些问题的对策,说明此项工作对政府确立研究项目分布比重、资助重点等的辅助决策和对研究者科研项目申报参考依据的重要意义。建议在加紧建立中医药数据共享平台的同时,尽快建立和完善中医药科研项目的科学数据汇交制度及相关数据汇交、统计分析平台的利用研究。 相似文献
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目的:建立基于医院肿瘤大数据中心的单病种科研平台,为科研工作者提供一个肿瘤数据价值可挖掘、科研流程规范化的工作平台,提高科研效率,增加科研产出。方法:利用大数据技术对医院各业务系统数据抽取、整合,建立肿瘤大数据中心。通过自然语言处理等技术对非结构化文本数据进行后结构化处理,使数据更具分析价值。结果:建成基于数据中心的肺癌、胃癌、乳腺癌、宫颈癌、鼻咽癌、食管癌、直肠癌、结肠癌、肝癌9大单病种的科研平台,实现了科研灵感搜寻、研究对象自动入组、CRF数据智能填充、填充数据及时溯源、科研数据辅助统计等系统化、全流程的科研管理。结论:提升了医院的科研效率并加速成果产出。 相似文献
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目的加强医学科研档案管理,提高档案的开发利用效率,为医学科研的发展提供有效服务。方法通过参与医院的一项医学科研计划项目的档案管理,收集、整理资料,并加以分析,提出整改意见,为课题结题和评奖提供有效服务。结果该课题实验研究方法科学,资料完整,数据结果可信。结论重视医院科研档案建设,充分利用现代化信息技术,有效开发利用档案资源,发挥科研档案在医院科研、医疗活动中的指导作用,促进医院的可持续发展。 相似文献
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随着科研数据的增长,对海量数据进行有效的管理和利用成为科学数据共享的研究重点之一。基于USGS数据生命周期模型,以国际癌症研究中心(IARC)发布的肿瘤流行病学发病数据和相应的人口数据为分析对象,介绍了数据的整合与管理方法,为科研人员提供整合和管理科学数据的具体案例和可行性方法,为制定宏观政策提供基础数据和知识支撑。通过使用USGS数据生命周期模型,实现了对不同类型数据的对比分析,验证了数据生命周期模型在数据管理方面的有效性。 相似文献
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传染病实验室监测网络平台信息系统旨在加强对五大症候群和新发突发传染病的监测信息的采集、管理、整合、共享与利用,满足国家传染病重大专项“传染病监测技术平台”的信息管理需要。介绍了传染病监测技术平台信息管理系统建设背景、系统架构与技术特点,简要描述了系统主要功能和应用情况。通过系统开发实现了对传染病监测技术平台的症候群、病例、样本、实验室检测、毒菌种株等信息综合集成管理、实时共享、动态追踪与查询、在线分析和可视化展示,以及对新发、突发传染病的预警、预测等功能;通过系统应用提升了传染病防控、突发传染病事件应急的能力,为疾病控制、传染病疫情分析、预警和防控策略的制定提供科学支撑和技术服务。 相似文献
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在调查分析国内外科研数据管理与共享政策体系建设的理论和实践的基础上,构建了一个由宏观层面的法律法规、中观层面的政策规章、微观层面的管理制度
构成的科研数据管理与共享政策体系。 相似文献
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论述了构建军事科研自产数据资源融合共享体系的意义,分析了美国国防科技信息管理和开发利用的经验,提出了构建我国军事科研自产数据资源融合共享体系的总体构想和推进路径,以及强化管理协调机制、着力数据资源的汇聚挖掘、推动数据资源的融合共享、确保数据安全和保护知识产权等建议. 相似文献
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张嵬 《复旦学报(医学版)》2017,44(1):122-126
临床研究中产生的大量医学数据使临床科研人员逐渐认识到数据长期保存和共享的重要性,进而在实践中形成了研究数据管理的理念和方法。临床研究数据管理,可以促进临床研究的准确和高效进行,满足研究人员、机构、研究资助者的预期和要求。本文通过单个临床研究数据管理和机构临床研究数据管理两个层面,讨论了临床研究数据管理的关键事项及相关策略,帮助临床科研人员及科研管理人员了解临床研究数据管理流程,促进临床科研活动规范执行和机构数据管理的发展。 相似文献
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目的:细化人口健康科学领域个人敏感信息类型,以期推进人口健康科学数据的开放和共享及个人敏感信息的立法保护提供参考,为人口健康科学数据平台的数据管理工作提供借鉴。方法:基于文献调研法考察了国内外个人敏感信息的界定,基于内容分析法总结了人口健康领域中个人敏感信息的类型,并进行了多维特征分析。结果:将人口健康领域中个人敏感信息细化为身份标识信息、生物特征信息、健康医疗信息3个大类,下分9个小类。结论:个人敏感信息细化分类符合依据不同领域特点将敏感个人信息具体化的国际立法的趋势,可作为制定人口健康科学数据收集管理策略和共享策略的参考。 相似文献