甘肃省228株结核分枝杆菌临床分离株Spoligotyping分型研究

目的利用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)方法对甘肃省结核分枝杆菌流行株进行分型研究,了解目前甘肃省结核分枝杆菌流行株基因型的基本情况,为甘肃省结核病防控提供分子流行病学依据。方法采用Spoligo-typing对甘肃省228株临床分离结核分枝杆菌进行基因分型,结果使用Bionumerics-5.01软件统计、分析,并与SpolDB4数据库进行比对,得出菌株分型结果。结果228株结核分枝杆菌被分为北京家族(Beijingfamily)和非北京家族(Non-Beijingfamily)2大基因群,其中北京家族基因群占88.6%(202/228)。非北京家族基因群为11.4%(26/228),228株结核分枝杆菌构成23个基因簇,其中独立基因型12个。结论北京家族基因群菌株在甘肃省结核分枝杆菌流行株中占据绝对优势地位,对该基因群菌株引发的结核病应给予密切关注并应加强对北京家族基因型菌株生物学特性研究。     

结核分枝杆菌传播的分子流行病学特征

目的探讨结核分枝杆菌传播的基因型特征及其对于耐药结核菌近期传播的影响。方法选取13个社区作为监测点,应用分枝杆菌散在重复单位(MIRU)技术分析结核分枝杆菌DNA多态性。结果 558株结核分枝杆菌的12个MIRU位点检测产生143个基因型,其中成簇基因型66个,成簇率86.2%;74.6%的菌株属于北京家族,177个菌株(31.7%)属于山东基因型;耐多药菌株的近期感染估计值(46.7%)明显低于全敏感菌株(72.7%)。结论山东基因型菌株具有较强的在人群中传播的能力、较高的耐药性以及对抗督导化疗的能力;利用基因分型技术开展结核病监测可以有效促进结核病控制工作。     

中国西北部两省区结核分枝杆菌临床分离株Spoligotyping分型初步分析

目的初步了解新疆和甘肃结核分枝杆菌的基因型、主要流行型及其分布特点,比较两省区之间基因型分布。方法采用随机抽样的方法挑选新疆地区结核分枝杆菌临床分离株179株,甘肃地区结核分枝杆菌临床分离株176株,采用间隔寡核苷酸分型(Spoligotyping)技术对所收集的临床分离株进行分型研究,分析我国西北部相邻的两省区结核分枝杆菌的基因型分布、主要流行型及其地区特征。结果新疆地区菌株分为47个基因型,其中28个基因型为新的型别,新疆菌株中北京家族占68.72%(123/179),其次为T家族(6.70%,12/179),H家族(3.91%,7/179)和CAS家族(2.23%,4/179);甘肃地区菌株分为29种基因型,其中10个基因型为新的型别,甘肃菌株中北京家族占86.93%(153/176),其次为T家族(4.55%,8/176),H家族(1.14%,2/176),MANU2(1.14%,2/176)和CAS(0.57%,1/176)。结论北京基因型菌株在新疆和甘肃地区均为主要流行株,但甘肃地区北京基因型菌株比例明显高于新疆地区。     

我国西部贵州地区结核分枝杆菌分子流行病学初步研究

目的 分析结核分枝杆菌临床分离株的基因型特征,估计结核分枝杆菌近期在人群中传播的情况。方法 在肺结核报告发病率高的4个县级结核病门诊收集临床分离结核菌株的相关信息,应用RD105缺失基因和MIRU-VNTR基因分型技术分析结核分枝杆菌DNA多态性。结果 273株结核菌株中49.1%的菌株属于北京基因型,15 MIRU-VNTR位点组合进行分析,273株结核菌株共被分为262种不同的基因型,其中独特型251株,占91.9%,其余22株（8.1%）菌株属于11个不同的基因型,菌株成簇率为8.1%。结论 15位点组合用于本次分子流行病学研究,能准确反映贵州地区结核分枝杆菌分子流行病学特征,贵州省4个县结核分枝杆菌菌株呈现较高的多态性,其中8.1%的患者是由于近期本地区传播造成。     

70株浙江省结核分枝杆菌临床分离株Spoligotyping基因分型研究

目的了解结核分枝杆菌临床分离株相关基因型的分布情况，并分析北京家族菌株与耐药的相关性。方法收集浙江省结核分枝杆菌临床分离株，常规罗氏培养基培养，应用Spoligotyping进行基因分型研究，聚类分析采用BioNumerics软件，统计学分析采用卡方检验。结果70株浙江省结核分枝杆菌临床分离株可分为2个基因群，即北京家族（Beijing family）和非北京家族（Non-Beijing family），分别占70％（49／70）和30％（21／70），18种基因型，其中12株为独特类型，剩余58株分为6簇。北京家族菌株中，89．8％（44／49）为典型北京家族（typical Beijing family），非北京家族菌株表现为高度的基因多态性，可分为13个基因型，9株为独特的基因型。北京家族菌株中表现为全敏感者71．4％（35／49），表现为耐药者为28．6％（14／49）；而非北京家族菌株中表现为全敏感者为66．7％，表现为耐药者为33．3％，经卡方检验，两者问的差异无统计学意义（X^2=0．158，P〉0．05）。结论北京家族菌株为浙江的流行优势菌株。北京基因犁与耐药无明显相关性。     

上海市长宁区2005—2006年肺结核分子流行病学研究

<正>结核分枝杆菌可变数目串联重复(variable-number tandem repeats,VNTR)或散在分布重复单位(mycobacterial interspersed repetitive units typing,MIRU)基因型分型法,是利用结核分枝杆菌基因组中特定位点上数目可变的串联重复序列进行基因型分型的方法,通过不同位点和数目的组合其分辨率可以达到或接近于"金标准"     

应用MLVA技术对吉林省294株结核分枝杆菌分型分析

目的初步探讨利用VNTR（variable number of tandem repeat）技术对吉林省294株结核分枝杆菌分型的分布特征。方法采用多位点串联重复序列（MLVA）分型方法初步选取13个分型效果较好的VNTR基因位点,采用聚合酶链反应（PCR）和琼脂糖凝胶电泳,通过BioNumerics（Versiort3．0）软件进行处理,分析吉林省耐药结核分枝杆菌的DNA多态性。结果共对294株结核分枝杆菌的13个VNTR位点进行了检测,根据这些菌株的指纹多态性特征,主要分成13个型,其中占据主要的前三型分别为I型,占81．6％（240／294）,二型占2．1％（6／294）,三型占1．7％（5／294）,由此可以看出本次实验菌株除I型以外,其他菌株基本呈散在分布。结论分析表明吉林省结核分枝杆菌以I型菌株为主,应加强此型菌株流行的监控及研究。     

江苏省260株结核分枝杆菌Spoligotyping基因分型研究

目的 研究江苏省结核分枝杆菌DNA指纹图谱的分布特征,分析北京家族株与结核分枝杆菌耐药的关联性.方法 江苏省30个耐药监测点收集260株结核分枝杆菌分离株,应用比例法检测分离株对于一线抗结核药物(异烟肼、链霉素、利福平和乙胺丁醇)的耐药性,应用间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)方法进行基因分型,使用Bio...     

河南省结核分枝杆菌北京家族基因型及耐药分析

目的了解河南省结核分枝杆菌北京家族基因型的分布、流行特点、与耐药性的相关性。方法 2009年6月-2010年11月在河南省尉氏县结核病防治机构实验室分离培养的165株结核分枝杆菌,采用比例法进行药物敏感性检测,应用RD 105缺失基因检测法和琼脂糖凝胶电泳技术进行北京家族基因型鉴定。结果 164株结核分枝杆菌对4种一线抗结核药物,异烟肼(IN H)、利福平(RFP)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB)药敏情况:全部敏感的菌株为126株(76.8%);任意耐药菌株38株(23.2%),其中,单耐药菌株14株(8.5%),多耐药菌株24株(14.6%);结核分支杆菌对4种一线药的耐药率依次为:INH 16.5%(27/164)、SM 15.9%(26/164)、RFP 9.1%(15/164)、EMB 7.3%(12/164)。164株结核分枝杆菌中,北京家族基因型(Beijing fam ily)占89.6%(147/164),17株为非北京家族基因型,占10.4%;147株北京家族基因型菌株中,全部敏感的菌株为111株(75.5%);耐任一种药菌株36株(24.5%),其中耐多药(MDR)菌株13株(8.8%...     

山东地区结核分枝杆菌临床菌株基因型特征研究

目的 探讨山东地区结核分枝杆菌临床分离菌株的基因型特征,评估不同基因型分布对于耐药结核菌近期传播的影响.方法 在山东地区选取13个结核病防治机构作为监测哨点收集临床分离菌株和相关信息,应用分枝杆菌散在重复单位(MIRU)技术分析结核分枝杆菌DNA多态性.结果 1年的研究期内共获得558株结核分枝杆菌,对12个MIRU位点进行检测共产生143个基因型,其中成簇基因型66个,成簇率86.2%.74.6%的菌株属于北京家族,177个(31.7%)菌株属于山东基因型.耐多药菌株的近期感染估计值明显低于敏感菌株.结论 山东地区结核分枝杆菌具有明显的基因多态性,山东基因型菌株在人群中具有较强的传播能力.     

聚合酶链反应扩增指纹多态性快速分型技术在部队结核病分子流行病学研究中的应用

目的 探讨南方部队结核病的分子流行病学规律。方法 设计一对特异性IS6110外向性引物，应用聚合酶链反应(PCR)建立检测结核分支杆菌DNA指纹多态性的方法，分析结核分支杆菌DNA多态性与流行病学的关系。结果 共检测分析了154株结核分支杆菌DNA的指纹多态性。根据这些菌株的指纹多态性特征共分为8个类型，以Ⅰ型(36．4％)、Ⅱ型(31．8％)和Ⅲ型(21．4％)为主，其余各型均少于4％。以20—29岁和30—39岁组在这三型中所占比例最大，分别为31．8％和27．9％。驻城镇部队与驻乡村部队以及结核病患者有无卡介苗接种史，在这三型的分布差异无显著统计学意义(P＞0．05)。但初治与复治患者分离菌株的PCR扩增指纹类型的分布差异有显著统计学意义(P＜0．05)。所检测菌株是否具有耐药性，在这三型中的分布差异也有显著统计学意义(P＜0．05)。菌株耐药主要为单耐异烟肼和利福平，耐药菌株在Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型中所占比例分别是44．4％、29．6％和14．8％。结论 PCR扩增指纹多态性分型技术是一种简便、快速、敏感、特异和重复性好的分型方法，可用于结核病的分子流行病学研究。南方部队结核分支杆菌的传播以Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型为主，应加强此三型菌株流行的监控。     

安徽东部地区结核分枝杆菌基因分型及耐药情况的初步分析

目的 了解安徽东部地区结核分枝杆菌基因分型及耐药情况,为本地区肺结核的防治提供依据.方法 对从临床收集的80例结核菌株进行培养,分别通过可变数目串联重复序列分型技术、药敏实验对菌株进行分型、耐药情况分析.结果 单耐药菌株占25.00％,多耐药菌株占23.75％.单耐药菌株以利福平和对氨基水杨酸占多数,分别为28.75％和22.50％;多耐药菌株以对异烟肼和利福平耐药最多,占52.63％.初治病人和复治病人对吡嗪酰胺耐药差异有统计学意义(P =0.032),对其他药物的耐药差异均无统计学意义(均有P＞0.05).15个基因位点均呈现等位基因多态性,QUB11a位点多态性最高为0.85,Mtub31位点仅为0.11.80株菌株可分为33个基因型,仅有16例患者的分离株为单一基因型,其余菌株可归入14个簇.结论 本地区结核分支杆菌的耐药率较高,基因分型复杂.     

用IS6110限制性片段长度多态性方法分析中国南方部队结核分支杆菌DNA指纹特征

目的：分析南方部队结核病患者和当地患者中结核分支杆菌分离株DNA指纹特征，探讨南方部队结核病的分子流行病学特征。方法：用限制性内切酶PvuⅡ消化结核分支杆菌DNA，后用琼脂糖凝胶电泳，再用Southern免疫转印，用[α^32P]-dCTP标记的DNA IS6110序列中的245bp片段作探针，进行杂交后得到限制性片段长度多态性图谱，结合一般流行病学资料加以分析比较。结果：共检测185株结核分支杆菌分离株。检测菌株的IS6110拷贝数范围为1～22。部队患者和当地患者的IS6110拷贝数分布差异无显著姓。部队患者结核菌分离株的IS6110拷贝数主要集中在6～20个，当地分离株主要集中在7～20个；全部菌株指纹特征分成8个组，部队分离株和当地分离株均主要集中在Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ 3个组里。耐药菌株指纹特征在各组中的分布与敏感菌株差异有显著性；患者是否接种卡介苗在各组中的分布差异无显著性。结论：南方部队患者与当地患者结核菌分离株在遗传关系上较接近，在基因水平上相关程度较强。提示部队结核病的发生与当地结核分支杆菌菌株的传播密切相关。     

Molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis, Buenos Aires, Argentina

To analyze the molecular epidemiology of Mycobacterium tuberculosis strains at a hospital in Buenos Aires, Argentina, and mutations related to multidrug-resistant and extensively drug-resistant tuberculosis, we conducted a prospective case-control study. Our findings reinforce the value of incorporating already standardized molecular methods for rapidly detecting resistance.     

三种不同的DNA分型技术在158株结核杆菌研究中的应用

目的评价IS6110限制性片段长度多态性(RFLP)、间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)及分枝杆菌散在重复单位(MIRU)三种分型方法在结核病流行病学研究中的应用。方法对158株结核分枝杆菌临床分离株应用IS6110RFLP、Spoligotyping及MIRU三种分型方法进行鉴定。结果应用三种分型方法产生的类型数分别为118、20和105个。IS6110RFLP的分辨率大于Spoligotyping,MIRU的分辨能力与IS6110RFLP接近。在MIRU的12个区中,重复区4、10、26、40具有较高的多态性。广东地区与其他地区成簇率和北京基因型所占比例差异有统计学意义(P<0.05),广东地区成簇率和北京基因型所占比例均显著低于其他地区。结论应用IS6110RFLP、Spoligotyping及MIRU三种分型方法进行结核病流行病学研究具有重要意义且非常有效,可以发现中国不同地区菌株的不同特点。     

MTBDR plus线性探针技术快速检测结核分枝杆菌耐药性的临床应用评价

目的评价线性探针杂交技术(简称HAIN技术)对耐药结核分枝杆菌的检测效果,评估其应用价值。方法利用传统罗氏培养及药敏试验和HAIN技术同时对开封市2010年4～10月份登记的453例涂阳肺结核患者进行耐多药检测,以传统罗氏培养及药敏试验为金标准对HAIN技术的检测效果进行评价。结果具有完整耐药检测结果的430例患者纳入分析。HAIN技术对新涂阳患者(P=0.589)和复治涂阳患者(P=1.000)耐药的检测效果与金标准差异无统计学意义。检测初治涂阳患者耐多药灵敏度为66.67%,Kappa值为0.56,阳性预测值为50.00%;检测复治涂阳患者耐多药的灵敏度为69.23%,Kappa值为0.61,阳性预测值为69.23%;所有检测结果的特异度均>91.00%,阴性预测值均>91.00%。结论 HAIN技术同传统方法检测涂阳肺结核患者耐药情况相比差异无统计学意义,但HAIN技术对初治涂阳患者耐多药的阳性预测值偏低,检测效果有一定局限性,可能会在实际应用中造成过度诊断。     

结核分枝杆菌耐药分子机制及耐药基因检测的新进展

近年来由于结核分枝杆菌(MTB)多重耐药株的蔓延,结核病的发病率在世界范围内呈上升趋势,成为严重的公共卫生问题.进一步了解MTB耐药的分子机制,建立快速、敏感、特异的多重耐药基因检测方法,成为有效监测、控制结核病的必要手段.此文就近几年来这些方面的研究进展进行综述.