深圳市输入性寨卡病毒分离株的进化分析及生物学特性研究

目的 对从深圳宝安国际机场口岸入境的1例自柬埔寨归国发热人员进行寨卡病毒实验室检测,研究寨卡病毒分离株的遗传进化和生物学特征,为寨卡病毒病的预防控制提供参考依据。方法 采集患者血液、唾液和尿液样本,采用荧光RT-PCR方法进行寨卡病毒核酸检测;选用多种组织培养细胞分离病毒,分别观察病毒株的致病变效应、空斑形成及病毒滴度等,并对两株病毒基因序列进行分子遗传进化研究,分析输入性病例来源。结果 荧光RT-PCR结果显示,该病例血清、唾液以及尿液样本寨卡病毒核酸阳性并持续一段时间。首次成功从唾液和尿液标本中分离到寨卡病毒株,将其分别命名为ZIKV/S/SZ1901和ZIKV/U/SZ1901。两分离株均可引起Vero细胞病变,不引起BHK-21细胞病变;均可在Vero细胞中形成空斑,滴度分别为3.4×10⁵ pfu/mL、1.4×10³ pfu/mL。RT-PCR扩增出预期大小约10 272 bp片段,测序结果表明该片段与ZIKV/Hu/Thai/KngSG/17-D501株相应序列的同源性为99.6%。系统进化树显示该病毒属亚洲谱系,与输入至我国的其它寨卡病毒株位于不同的进化分支。寨卡病毒编码区氨基酸位点分析提示,SZ1901毒株在结构基因的氨基酸位点(D683E、V763M、T777M)和非结构基因NS1基因的(A188V)变异与近几年流行株完全相同。结论 根据患者流行病学史、临床表现和实验室检测结果,确诊该病例为深圳市从柬埔寨输入性寨卡病毒感染病例,且寨卡病毒分离株具备与2016年以来流行的寨卡病毒大部分相同的分子基础。     

蝙蝠呼肠孤病毒感染BHK-21和Vero-E6细胞形态发生的比较观察

目的通过对蝙蝠呼肠孤病毒在BHK-21和Vero-E6细胞形态发生的比较研究,筛选出该病毒的最佳宿主细胞。方法将感染呼肠孤病毒XJV株的BHK-21和Vero-E6细胞用戊二醛、锇酸固定,制成超薄切片,用透射电镜观察。同时测定病毒滴度。结果XJV在2种细胞中的适应程度不同,XJV更适于在BHK-21细胞中增殖。XJV在2种细胞中的形态发生不同,在BHK-21细胞中形成的包涵体呈典型的晶格状排列,在Vero-E6细胞中形成的包涵体呈杂乱的球状。XJV用BHK-21和Vero-E6细胞育传5代,病毒滴度分别为105.5TCID50/ml和104.5TCID50/ml。结论BHK-21细胞是蝙蝠呼肠孤病毒XJV株的最佳宿主细胞。     

3D聚合酶突变对肠道病毒A组71型复制影响的研究

目的 研究3D聚合酶(3D polymerase,3D^pol)突变对肠道病毒A组71型(Enterovirus A71,EV-A71)复制的影响。方法 扩增EV-A71病毒基因组并克隆至TOPO-XL2-PCR载体;应用体外点突变方法在病毒3D^pol区引入N16S和I256V突变;采用T7聚合酶转录病毒基因组RNA并转染RD细胞,获得N16S和I256V病毒突变株。观察亲本病毒与突变病毒株的增殖特征以及病毒RNA含量。结果 RNA转染RD细胞后可获得具有感染性的病毒。体外增殖试验显示,正常培养条件下(36.5 ℃)3株病毒增殖趋势一致, 感染细胞72 h后病毒滴度和RNA拷贝数均达到峰值且组间差异无统计学意义。温度敏感性试验显示,与正常培养条件比较,病毒在高温(39.5 ℃)的滴度和RNA拷贝数均大幅下降,并且高温对N16S和I256V突变株的增殖抑制较亲本株更为显著。结论 成功构建EV-A71感染性克隆并获得病毒突变株,3D^pol的N16S和I256V突变在高温条件下可能进一步降低病毒复制能力。     

江西地区啮齿动物中温州病毒的检及病毒基因特征分析

目的 了解温州病毒在江西地区啮齿动物中感染的情况及病毒基因特征。方法 收集2021年江西省高安市、安义县两地啮齿动物鼠肺组织样本,提取样本核酸,采用温州病毒特异性引物进行巢式PCR扩增,PCR产物进行序列测定。采用Ion GeneStudio S5 二代测序平台(NGS)对1株核酸阳性样本进行病毒基因组测序,采用CLC软件对基因序列进行分析。结果 共收集高安市、安义县啮齿动物肺组织标本164份,通过巢式PCR检出温州病毒3份,均来自高安地区的黄毛鼠。3株病毒部分L基因序列同源性93.66%~98.50%,氨基酸序列同源性95.21%~100%。选取1株病毒(JXGAW45/2021)进行二代测序,获得全基因组序列,其中S、L基因分别含3 429、7 145个核苷酸。基因组比对分析发现JXGAW45/2021与其他温州病毒核苷酸序列同源性为82.58%~85.75%,氨基酸同源性为88.76%~96.83%,在S、L基因系统进化树中均独立分支,为温州病毒新的变异株。结论 首次在江西地区啮齿动物中发现温州病毒。     

人G1型轮状病毒TaqMan荧光定量检测方法的建立与应用

目的本研究旨在建立一种快速准确定量检测人G1型轮状病毒的TaqMan探针荧光实时PCR检测方法。方法以轮状病毒VP6基因为靶基因,分别设计2对引物及其相应的TaqMan探针,扩增目的片段,将目的片段克隆于PCDNA3.1+载体上,体外转录获得RNA,系列稀释后为标准品,建立TaqMan探针荧光定量实时PCR检测方法并对该方法进行验证。结果　设计实验找到最优条件下的引物浓度(250 nmol/L)、探针浓度(300 nmol/L);通过对引起腹泻的人柯萨奇病毒、呼肠孤病毒等进行检测,结果均为阴性,表明该方法具有很好的特异性。该方法的最低检测量为5 copies/μL。对该方法进行重复性实验,发现变异率均小于1%,重复性好。用已建立的方法对4份粪便临床样品进行3次重复试验,病毒RNA的检出率为100%。结论本实验初步建立了人G1型轮状病毒TaqMan探针荧光实时PCR检测方法,为G1型轮状病毒的诊断、检测和分子流行病学研究提供了一种新的方法。     

发热伴血小板减少综合征病毒温度敏感性研究

目的 研究发热伴血小板减少综合征病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV)对温度的敏感性,为SFTSV的消毒和实验室生物安全防护提供依据。方法 将SFTSV细胞培养上清液分装到250 μL的PCR管中,100 μL/管,分别放置在4 ℃冰箱,以及25 ℃、37 ℃、39 ℃、56 ℃、70 ℃金属浴中,处理预定时间后,再将其感染Vero细胞,采用间接免疫荧光法测定病毒滴度。结果 随温度的升高,病毒滴度下降速度加快,在4 ℃、25 ℃、37 ℃和39 ℃放置24 h后病毒滴度由10^7.25/100 μL分别下降到10^7.00/100 μL、10^6.75/100 μL、10^6.50/100 μL和10^5.00/100 μL。同一温度,随放置时间的延长,病毒滴度下降趋势也愈加明显,SFTSV在4 ℃、25 ℃、37 ℃放置72 h后,病毒滴度由10^7.25/100 μL分别下降到10^6.63/100 μL、10^6.50/100 μL和10^3.38/100 μL。SFTSV在39 ℃放置72 h失去感染性,在56 ℃作用180 min或70 ℃放置5 min即被灭活。结论 SFTSV 70 ℃放置5 min即被灭活,但其在4 ℃和25 ℃条件下放置3 d,病毒滴度变化不明显,实验室和医务人员应重视个人防护和对被SFTSV污染过的物品的消毒。     

114例疑似COVID-19患者呼吸道病毒感染分析

目的 分析114例COVID-19疑似患者呼吸道病毒感染情况, 探讨多种病毒同时检测在疫情防控中的价值。方法 利用Real Time RT-PCR技术检测发热门诊COVID-19疑似患者SARS-CoV-2核酸,利用基因芯片恒温扩增技术检测SARS-CoV-2核酸阴性患者其他常见的18种呼吸道病毒。结果 114例COVID-19疑似患者SARS-CoV-2核酸均为阴性,有21例感染了非其它呼吸道病毒,感染率达18.42%,21例患者中共检测出10种呼吸道病毒,包括冠状病毒NL63/229型、呼吸道合胞病毒、柯萨奇病毒A16型、乙型流感病毒、人副流感病毒1型、人副流感病毒3型、人偏肺病毒、甲型流感病毒、甲型流感病毒季节性H3亚型、肠道病毒/鼻病毒。其中乙型流感病毒感染患者最多,有6例,呼吸道合胞病毒有5例。有3例患者同时感染2种病毒:呼吸道合胞病毒与柯萨奇病毒A16型混合感染、冠状病毒NL63/229型与人副流感病毒1型混合感染、甲型流感病毒与甲型流感病毒季节性H3亚型混合感染。结论 在应对本次SARS-CoV-2疫情中,针对COVID-19疑似患者中,要注意鉴别SARS-CoV-2与其它呼吸道病毒,及时有效地排除疑似病例。     

抗柯萨奇病毒A16型单克隆抗体的制备和应用

目的 制备抗CA16病毒的特异性单克隆抗体,评价单克隆抗体在ELISA和细胞免疫化学染色中的作用,并利用单抗建立CA16快速检测胶体金免疫层析法并对其进行初步评价方法 CA16病毒接种RD细胞大量培养,氯化铯密度梯度超速离心纯化病毒颗粒,透射电镜鉴定纯化产物。福尔马林灭活病毒颗粒后免疫Balb/c小鼠,利用细胞融合技术制备稳定分泌抗CA16单抗的杂交瘤细胞株。ELISA和免疫荧光试验分别对单抗特性进行分析。根据单抗反应特性,分析单抗在细胞ELISA、细胞免疫组化中的应用,并利用特异性抗CA16单抗建立CA16胶体金免疫层析快速检测法结果 氯化铯密度梯度离心纯化病毒颗粒电镜观察显示,病毒颗粒为二十面体立体对称球形结构,大小均匀。经免疫小鼠,获得1株稳定分泌抗CA16单克隆抗体的杂交瘤细胞株(mAb CA16-19),该单抗为IgG2a亚型,细胞免疫荧光表明,单抗与RD宿主细胞内的CA16病毒颗粒结合。细胞ELISA显示,随着病毒滴度增加吸光度也增加。细胞免疫化学染色分析表明,单抗可与CA16病毒感染的RD结合,而不与EV71感染RD细胞和正常RD细胞反应。因此,该单抗可用于细胞ELISA和细胞免疫化学染色。同时,依据前期制备的抗CA16单抗(mAb CA16-10),并结合此次制备的mAb CA16-19共同建立胶体金免疫层析试纸条,该试纸条不与EV71和柯萨奇病毒B型交叉反应,最低检测限为6.25×10^6.25TCID₅₀/0.1 mL结论 利用氯化铯密度梯度离心纯化出CA16病毒颗粒,筛选出1株特异性抗CA16单抗,此株单抗可用于细胞免疫荧光试验、细胞ELISA和细胞免疫化学染色试验。并以单抗为原材料建立了CA16快速检测胶体金免疫层析法,为CA16病毒感染的快速诊断提供帮助。     

抗扎伊尔型埃博拉病毒单克隆抗体的制备和鉴定

目的 采用扎伊尔型埃博拉病毒核蛋白(EBOV NP)的合成多肽为免疫原制备鼠源单克隆抗体,并用4种埃博拉流行株核蛋白基因的真核表达蛋白对制备的单克隆抗体进行特异性分析。方法 用人工合成的扎伊尔型埃博拉病毒核蛋白多肽免疫动物,进行细胞融合后筛选阳性杂交瘤细胞。构建埃博拉病毒4种亚型的真核表达载体转染HEK293T细胞以表达目的蛋白,再以真核表达蛋白为抗原,用免疫印迹方法分析扎伊尔型埃博拉病毒单克隆抗体的特异性。结果 完成了抗扎伊尔型单克隆抗体的制备,共得到能分泌抗扎伊尔型埃博拉病毒单克隆抗体的杂交瘤细胞12株,小鼠腹水抗体效价介于1∶10⁴~1∶10⁵,其中3株杂交瘤细胞株分泌的抗扎伊尔型埃博拉病毒单克隆抗体与其他3种亚型无交叉反应,抗体效价高、特异性好。结论 成功制备抗扎伊尔型埃博拉病毒单克隆抗体,为建立快速检测埃博拉病毒的方法奠定基础。     

狂犬病两株不同毒力克隆株病毒的神经毒力和全长基因序列比较

目的 对2株毒力不同的狂犬病病毒克隆株(CTN181-3和CTN181-12)进行神经毒力和全长基因序列的比较。方法 分别对2株病毒用10、14和21日龄小鼠脑内接种,测定小鼠的致死力(LD₅₀);同时用空斑法测定2株病毒的病毒滴度(PFU),以lgPFU/lgLD₅₀比较2株病毒的毒力差异;分别对2株病毒进行全基因序列测定并分析,找出毒力差异关键基因位点。结果 2株病毒对10、14和21日龄小鼠的lgPFU/lgLD₅₀,CTN181-3株为0.07、3.40和6.60,CTN181-12株为<-0.9、<-0.6和1.04。全基因序列分析表明,二者共有8个核苷酸和6个位点的氨基酸存在差异。结论 CTN181-3株的神经毒力明显低于CTN181-12株,两者间6个氨基酸的差异是其毒力差异的分子基础。     

Translation of Reovirus Messenger RNAs Synthesized In Vitro into Reovirus Polypeptides by Several Mammalian Cell-Free Extracts

Single-stranded reovirus RNA, synthesized in vitro by reovirus cores, functioned as messenger RNA in cell-free extracts prepared from several mammalian cells: Krebs II mouse ascites cells, mouse L cells, Chinese hamster ovary cells, HeLa cells, and rabbit reticulocytes. As shown by acrylamide gel electrophoresis, all eight polypeptides known to be specified by reovirus were synthesized in the reticulocyte system. In the other extracts, from 5 to 7 complete virus proteins were made.     

Anti-influenza response achieved by immunization with a synthetic conjugate.

The peptide corresponding to sequence 91--108 of the hemagglutinin of type A H3N2 influenza virus has been synthesized by the solid-phase peptide synthesis method and covalently attached to several macromolecular carriers. The conjugate with tetanus toxoid was used for immunization of rabbits and mice. The immunoglobulin fraction of the rabbit antiserum showed the presence and antipeptide antibodies by both agar gel diffusion and radioimmunoassay. In the latter assay, the antibodies showed marked crossreactivity with the intact virus of the A/Texas/77 strain. The antibodies were also capable of inhibiting the hemagglutination of chicken erythrocytes by the virus; the highest hemagglutination inhibition titer (1:32) was achieved with a serum-resistant strain of A/Texas/77. When the in vitro virus plaque formation assay was used with monolayers of Madin--Darby canine kidney (MDCK) cells, the number of plaques was reduced on interaction with the immunoglobulin fraction of the antiserum, which was effective up to a dilution of 1:32. Preliminary results indicate that C3H/DiSn mice immunized with the peptide--tetanus toxoid conjugate are partially protected against a further challenge with A/Texas mouse-adapted influenza virus. The results are thus indicative of the efficacy of the synthetic material in eliciting anti-influenza immune response.     

新型冠状病毒在Vero-E6细胞中的增殖特征分析

目的 了解新型冠状病毒(2019-nCoV)在Vero-E6 细胞中的增殖特征,为病毒的分离培养、抗病毒药物研究以及疫苗研制等工作提供基础.方法 将2019-nCoV做半对数系列稀释,测定病毒的半数组织培养感染剂量(TCID50);以1.74×10-4TCID50/cell的病毒量感染Vero-E6细胞,在病毒吸附后第...     

轮状病毒半微量空斑技术的研究

本文以轮状病毒(RV)Wa株和SA-11株为代表,采用国产16孔组织培养板,进行了RV半微量空斑技术的研究,并与常规培养瓶空斑法和TCID_(50)滴定法作了比较。结果表明,RVWa株与SA-11株在MA_(104)细胞上的空斑特征和感染滴度有较大差异,半微量法空斑数目与病毒浓度呈良好的线性关系,且重复试验能获得相近空斑滴度,显示了经济方便、稳定可靠的优点。此外,应用空斑中和试验测定了RV型特异性抗血清的中和效价,并首次注意到用活性染料中性红染色的空斑标本经福尔马林固定后可长期保存不褪色。     

甲型H1N1流行性感冒病毒血凝素基因变异状况及序列分析

目的 了解2009年度甲型H1N1流行性感冒(流感)病毒的检测情况和血凝素(HA)基因变异情况.方法 选择国家级流感监测哨点医院以及暴发疫情的疫点,采集流感样病例的鼻咽拭子标本,通过实时(RT)-PCR进行病毒分型及甲型H1N1流感病毒检测,对阳性标本采用狗肾细胞(MDCK)进行病原分离,采用红细胞凝集试验测定病毒效价,用血凝抑制实验进行型别鉴定,通过RT-PCR扩增毒株HA1片段的基因并进行序列测定,利用生物信息学技术进行序列分析.结果 共检测咽拭子样本996份,其中核酸检测阳性病例包括甲型H1N1 337份,季节性H1N1亚型1份,季节性H3N2亚型67份,B型12份,流感核酸检测阳性率为41.87％,其中甲型流感核酸检测阳性率为33.84％.分离出甲型H1N1病毒36株,选择18株.测序成功的10株甲型H1N1流感病毒在多个氨基酸位点发生变异,与疫苗株A/California/07/2009(H1N1)比较,有6个位点发生突变,其中1个位点位于抗原决定簇的B区.结论 2009年度分离到的流感病毒株中以甲型H1N1为绝对的优势毒株,毒株的血凝素基因与世界卫生组织(WHO)提供的疫苗株相比有变异,与疫苗株相比,抗原决定簇B区有改变,但关键位点第222位没有变化.     

Reovirus oncolysis as a novel purging strategy for autologous stem cell transplantation

Hematologic stem cell rescue after high-dose cytotoxic therapy is extensively used for the treatment of many hematopoietic and solid cancers. Gene marking studies suggest that occult tumor cells within the autograft may contribute to clinical relapse. To date purging of autografts contaminated with cancer cells has been unsuccessful. The selective oncolytic property of reovirus against myriad malignant histologies in in vitro, in vivo, and ex vivo systems has been previously demonstrated. In the present study we have shown that reovirus can successfully purge cancer cells within autografts. Human monocytic and myeloma cell lines as well as enriched ex vivo lymphoma, myeloma, and Waldenstr?m macroglobulinemia patient tumor specimens were used in an experimental purging model. Viability of the cell lines or purified ex vivo tumor cells of diffuse large B-cell lymphoma, chronic lymphocytic leukemia, Waldenstr?m macroglobulinemia, and small lymphocytic lymphoma was significantly reduced after reovirus treatment. Further, [35S]-methionine labeling and sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE) of cellular proteins demonstrated reovirus protein synthesis and disruption of host cell protein synthesis as early as 24 hours. Admixtures of apheresis product with the abovementioned tumor cells and cell lines treated with reovirus showed complete purging of disease. In contrast, reovirus purging of enriched ex vivo multiple myeloma, Burkitt lymphoma, and follicular lymphoma was incomplete. The oncolytic action of reovirus did not affect CD34+ stem cells or their long-term colony-forming assays even after granulocyte colony-stimulating factor (G-CSF) stimulation. Our results indicate the ex vivo use of an unattenuated oncolytic virus as an attractive purging strategy for autologous stem cell transplantations.     

Effect of sulfated colominic acid on enteric virus (rotavirus, poliovirus and coxsackievirus) infections in vitro

Sulfated colominic acid exhibited suppressive effects on SA11 (simian rotavirus)- and MO (human rotavirus)-infections, but not on Wa (human rotavirus)-, Sabin 1 (poliovirus 1)-, and Nancy (coxsackie B3 virus)-infections, in vitro. The infection of SA11 was found to be inhibited by mixed treatment and early posttreatment with sulfated colominic acid, but not by pretreatment, by plaque assay and multiple growth assay. The results were confirmed by the infectivity titer, RNA polyacrylamide gel electrophoresis, and electron microscopic analysis. The mechanism of the suppressive effect was suggested to be adsorption inhibition at an early stage of the infection.     

MDCK悬浮细胞制备及流感病毒敏感性研究

目的 建立无血清悬浮培养MDCK细胞的方法,分析其传代、线性放大过程中的稳定性及增殖流感病毒的敏感性。方法 运用逐步降血清悬浮驯化法将贴壁培养型MDCK细胞驯化为无血清全悬浮培养型MDCK细胞;进一步分析其生长动力学特性、连续传代稳定性,在5L生物反应器中扩大培养;接种流感和禽流感病毒,测定不同时间HA效价、CCID₅₀滴度,分析其病毒敏感性。结果 成功将ATCC引进的贴壁培养型MDCK细胞驯化为无血清全悬浮培养型MDCK细胞(命名为MDCK-XF02细胞)并冻存;不同接种密度培养MDCK-XF02细胞最大增殖密度均达13.0×10⁶ cells/mL以上,且差异无统计学意义(P>0.05);连续传代培养过程中细胞形态和生长状况稳定,比生长速率差异无统计学意义(P>0.05);三个代次的MDCK-XF02细胞以2.0×10⁶ cells/mL接种于5 L生物反应器,细胞生长状态良好,倍增时间小于21 h,在批培养中细胞浓度高达(14.57±0.47)×10⁶ cells/mL,比生长速率分别为(0.027±0.012)h^-1、(0.028±0.013)h^-1、(0.027±0.013)h^-1(P>0.05);接种甲型流感病毒H1N1和H3N2,HA效价达到(6~7)log₂HA/25 μL、CCID₅₀为(4.35~4.68)lgCCID₅₀/mL;接种乙型流感病毒B/P和BX-35增殖效果更好,HA效价达到(9~10)log₂HA/25 μL,CCID₅₀为(6.38~7.31)lgCCID₅₀/mL。接种重组禽流感病毒H5亚型Re-5、Re-6、Re-10均能很好的增殖,HA效价达到(7~9)log₂HA/25 μL、CCID₅₀为(6.21~6.96)lgCCID₅₀/mL。结论 本研究获得一株具有自主知识产权的流感/禽流感病毒敏感的无血清悬浮培养型MDCK-XF02细胞株,实现了生物反应器高密度放大培养,为我国开展流感疫苗研究和生产提供细胞基质,也为其他动物细胞悬浮驯化提供参考。     

Dimethyl sulfoxide enhancement of phlebotomus fever virus plaque formation.

Dimethyl sulfoxide (DMSO)incorporated into an agar overlay containing DEAE-dextran enhanced plaque formation in Vero cells by Naples sandfly fever virus passaged in mouse brain or Vero cell cultures. No plaques were visible when DMSO was used without the DEAE-dextran, some plaques were rarely visible (less than 0.5mm) when DEAE-dextran was used without the DMSO, and up to 10-fold more plaques were clearly visible (0.5-1.5 mm) when both chemicals were used. The combined enhancing effect of DMSO and DEAE-dextran was also observed with mouse brain passaged, but not Vero passaged Sicilian sandfly fever virus. Other Phlebotomus group viruses produced a bit plaques (3-5 mm) and did not require DMSO for plaque formation, although an increase in plaque clarity was obtained with DMSO for some of them. Plaque reduction neutralization tests were assayed successfully under agar containing DMSO. The alphavirus Sindbis produced slightly larger plaques under agar containing DMSO, but there was no effect on clarity or size of plaques produced by the flavivirus dengue-2.     

Cultivation of dengue virus type 2 in baby hamster kidney cells in serum-free medium.

Propagation of dengue virus type 2 (New Guinea C strain) was performed using a shaker culture of baby hamster kidney cells (BHK-21) cultivated in serum-free modified Waymouth medium. Maximum virus titer varied from 10(8.3) to 10(8.8) plaque forming units/ml after incubation of BHK-21 cells in suspension culture at 37 dgrees C for 40-48 hours post-infection.