一例Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson综合征患儿的 KAT6B基因变异分析

目的:对1例Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson综合征患儿的 KAT6B基因变异进行分析,明确其可能的致病原因。 方法:提取患儿及双亲外周血DNA,应用全外显子基因组测序法检测相关基因变异,并通过Sanger测序法验证可疑变异,对其进行生物信息学预测。结果:全外显子...     

一例 KAT6A基因新发变异导致的智力障碍患儿的分析

目的分析1例智力障碍、语言发育滞后患儿的遗传学病因, 并为其家系提供遗传咨询及产前诊断。方法收集患儿的临床资料, 采集患儿及其家系成员的外周血样, 提取DNA, 进行全外显子组测序, 对候选变异进行Sanger测序验证, 并对高危胎儿进行产前诊断。结果患儿主要表现为智力障碍、语言发育滞后、睑下垂、斜视、畏光、多动和脾气暴躁等。全外显子组测序结果显示患儿存在KAT6A基因c.5314dupA(p.Ser1772fs*20)致病性杂合变异, 其父母均为野生型, 诊断患儿为Arboleda-Tham综合征。另外患儿还存在AIFM1基因c.56T>G(p.Leu19Trp)半合子变异, 其母亲为杂合变异, 表型正常的外祖父为半合子变异, 可排除其致病性。高危胎儿未携带KAT6A基因c.5314dupA变异。结论 KAT6A基因c.5314dupA(Ser1772fs*20)杂合变异可能是患儿的致病原因, 基因检测为该家系的遗传咨询及产前诊断提供了依据。     

m6A 修饰在免疫系统中的研究进展

N 6 -甲基腺嘌呤 (N 6 -methyladenosine, m 6A) 修饰是 RNA 分子的转录后变化, m 6A 最早是上世纪 70 年代在细胞 mRNA 上发现的, 但直到全基因组 m 6A 定位方法发展后才被广泛研究。 近年来 m 6A 在调节 mRNA 中的作用及其在各种细胞类型中的功能及其重要性已经得到了证实, m 6A 调控多种生理过程中基因 表达的机制研究也越来越多。 此综述总结了最近一些关于 m 6A 修饰在免疫反应中的作用的研究进展, 讨论 了 m 6A 修饰在调节先天和适应性免疫反应以及免疫系统发育中的功能。     

叶酸通过KDM6A影响神经管发育

目的研究低叶酸环境中赖氨酸去甲基化酶(KDM6A)对神经管畸形(NTDs)产生的影响。方法采用小鼠胚胎干细胞(SV129)、NTD小鼠模型以及NTD人标本;通过甲氨蝶呤(MTX)0.02μmol/L处理SV129细胞24 h,并使用Access 2 Immunoassay系统、竞争性受体结合免疫法测量其叶酸水平;Western blot和免疫荧光检测DNA的断裂及KDM6A表达情况;用小鼠NTD模型,测量其DNA断裂相关修复基因的转录水平;检测人NTD标本中的叶酸含量及KDM6A的表达。结果细胞在低叶酸环境中DNA断裂增加并且KDM6A蛋白表达减少,同时小鼠NTD模型中DNA断裂修复基因KU80/70转录水平表达降低(P<0.05);低叶酸NTD标本的KDM6A与KU80表达也减少。结论低叶酸环境中,DNA断裂增加,KDM6A表达减少。可能是由于启动DNA断裂修复途径异常,导致NTD的发生。     

Par6A cDNA的克隆与表达

目的 探讨Par6A基因的克隆表达及功能。方法 用RT-PCR从大鼠L6骨骼肌细胞扩增出Par6A的cDNA,利用分子克隆的方法构建Par6A的克隆载体以及真核表达载体,在293细胞中进行表达,通过免疫共沉淀初步研究Par6A的功能。 结果 成功扩增出Par6A cDNA,片断大小约1kb,并构建了真核重组表达质粒pDsRed-Express-N1-Par6A。在转染293ET细胞24h后,荧光显微镜下可见红色荧光的表达。免疫共沉淀实验表明Par6A与PKCζ存在相互作用。 结论 成功扩增出大鼠骨骼肌的Par6A cDNA,为研究Par6A的相关功能奠定了基础。     

m6A甲基化与代谢性疾病调控

背景:m6A甲基化修饰已逐渐成为生命科学与运动医学的研究热点与新方向,且诸多研究已证实m6A甲基化修饰与各类疾病关系密切,并在代谢类疾病的诊断和治疗中发挥关键作用,但其机制尚未阐明.目的:探讨m6A甲基化与各类代谢性疾病的关系,综述m6A及相关的酶在代谢性疾病调控中的最新研究进展,并对其具体分子机制进行详细概述,旨在为...     

SLC6A8基因突变家系1例报道

目的 探讨基因检测在脑肌酸缺乏综合征早期诊断中的临床意义,提高广大临床工作者对本病的认识。方法 报道1例通过基因检测确诊的肌酸缺乏综合征1型的中国家庭,该家庭兄弟二人均有明显的智力障碍,父母表型正常。对患者进行详细的病史询、电生理检查和全外显子组测序,基因检测结果通过一代测序验证。结果 在中国家庭中发现了SLC6A8基因的一个新的变异位点c.1569G>A,该变异为无义变异,兄弟二人均为半合子,遗传自母亲,母亲为杂合子,父亲为野生型。结论 扩大了中国人群中SLC6A8基因的变异谱。通过全外显子组测序并结合患者详细的临床评估有利于早期诊断肌酸缺乏综合征。     

RNA m6A修饰在膀胱癌中的作用

近年来,RNA表观修饰引起了全球学者的重视.在所有已知的RNA修饰中,N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰是主要的RNA修饰.作为一种动态且可逆的修饰,m6A被"作家蛋白"(RNA甲基转移酶)催化,被"橡皮擦蛋白"(去甲基酶)去除,并与"阅读蛋白"(m6A结合蛋白)相互作用,从而影响RNA...     

ACTL6A在宫颈癌中的表达及意义

目的:探讨ACTL6A在宫颈癌中的表达及意义。方法:收集2012年1月至2015年1月间我院收治的93例宫颈癌患者的癌组织和癌旁组织石蜡标本,采用免疫组化法测定ACTL6A表达情况,分析其与临床病理参数及预后之间的关系。应用多因素Cox回归分析预测不良事件的指标。结果:ACTL6A在宫颈癌癌组织阳性表达率(63.5%)明显高于癌旁组织(27.9%)(P<0.05)。ACTL6A蛋白高表达与宫颈癌的淋巴结转移、组织学分解、TNM分期相关,而与患者年龄、肿瘤大小无关。随访时间3-60个月,宫颈癌癌组织高表达ACTL6A蛋白的患者总生存明显低于低表达的患者(P<0.05);其中淋巴结转移、组织学分级、TNM分期和ACTL6A均是宫颈癌患者预后的独立影响指标。结论:ACTL6A与宫颈癌的发生和进展关系密切,是判断宫颈癌患者预后的重要指标。     

细胞色素P450 2A6的多态性研究

细胞色素P450 2A6(cytochrome P450 2A6，CYP2A6)是主要的尼古丁C-氧化酶和香豆素7-羟化酶。对已发现的CYP2A6的等位基因及其对CYP2A6活性的影响，CYP2A6的多态性和个体吸烟行为及肺癌、食管癌的易感性的关联进行综述。     

RNA m~6A修饰在肺部疾病中的研究进展

正N~6-甲基腺苷(N~6-methyladenosine,m~6A)修饰是指RNA中腺苷的第6位氮原子处发生的甲基化修饰。在已发现的RNA修饰中,m6A修饰被认为是真核生物m RNA中最常见的修饰类型。此外,这种甲基化修饰也可发生在r RNA、t RNA、mi RNA、circ RNA和lnc RNA[1]。Dominissini等[2]的研究显示,m6A修饰位点主要集中在终止密码子附近和长内部外显子上,这些位点存在共有序列RRm6ACH(R=G/A,H=C/U/A),并且在人类和鼠之间高度保守。由于RNA修饰增加了RNA结构的复杂性,影响生物学过程[3],     

肽6A对家兔动脉的血管再通作用

本工作在家兔腹主动脉血栓模型上观察肽6A(P6A)的血管再通作用。2.2-2.5kg雄性家兔分两组,对照组(n=6),在部分结扎兔腹主动脉和电刺激造成的血栓模型上,经插     

m6A修饰在鳞状细胞癌中的作用研究进展

近年来,RNA表观转录组学已成为生命科学领域研究的热点.作为真核细胞中最丰富的表观转录组修饰,N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修饰是一种动态且可逆的过程[1].研究表明,m6A可以通过调节RNA剪接、稳定性、定位、翻译和衰变,参与神经发育、免疫调节和细胞分化等各种生理行为.m6A修饰的失调...     

一例 KAT6B变异所致Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson患儿的临床诊断

目的分析1例因反应迟钝就诊的3月龄女婴的临床及分子遗传学特征。方法对患儿进行基因检测, 并将患儿的表型与KAT6B基因变异相关的两种综合征的主要特征进行比较。结果患儿具有手指/脚趾长、面具脸、睑裂短小、睑下垂、泪道异常等特征, 其KAT6B基因第16外显子存在新发杂合致病变异c.3040C>T(p.Gln1014*), 与Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson(SBBYSS)综合征的特征相符。结论患儿被诊断为SBBYSS综合征, 但也具有部分独特的表现。本病例的发现扩大了Say-Barber-Biesecker-Young-Simpson综合征的表型及变异谱。     

13价肺炎链球菌结合疫苗中的6A和6B诱导对新发现血清型6C和6D的交叉保护抗体北大核心CSCD

目的血清型6C和6D是近些年新发现的肺炎链球菌血清型。本研究的目的是考察肺炎链球菌13价结合疫苗PCV13（1、3、4、5、6A、6B、7F、9V、14、18C、19A、19F和23F）里的6A和6B能否诱导对新血清型6C和6D的交叉保护抗体,以及它们对交叉保护抗体的贡献。方法PCV13、6A和6B荚膜多糖分别与CRM197的结合物PCV6A和PCV6B分别于第0天、第14天和第28天以等剂量肌肉注射免疫新西兰兔。免疫前和第35天采血分离血清。采用世界卫生组织（WHO）推荐的定量酶联免疫吸附试验（ELISA）检测兔血清中针对6A、6B、6C和6D荚膜多糖的抗体浓度,并采用WHO肺炎链球菌血清学参考实验室的调理吞噬试验（OPA）检测兔血清抗体针对6A、6B、6C和6D的杀菌功能。结果PCV13能够诱导兔产生针对6A和6B荚膜多糖的抗体,该抗体不仅能够与6C和6D荚膜多糖产生交叉反应,而且能够识别靶细菌6A、6B、6C和6D并激活补体,在激活补体的调理下,靶细菌被分化的HL60细胞吞噬,它们对靶细菌6A、6B、6C的杀菌滴度大致相当,但略高于对6D。PCV6A能够诱导兔产生针对6A荚膜多糖的抗体,该抗体能够与6B、6C和6D荚膜多糖产生交叉反应,它对靶细菌6A、6B和6C的调理吞噬滴度高于对6D。PCV6B能够诱导兔产生针对6B荚膜多糖的抗体,该抗体能够与6A、6C和6D荚膜多糖产生交叉反应,它对靶细菌6A、6B和6C的调理吞噬滴度高于对6D。PCV13、PCV6A和PCV6B免疫后针对6A、6B、6C和6D的荚膜多糖特异性抗体浓度和杀菌滴度均较免疫前有显著性升高（P〈0.01）。结论PCV13能够诱导兔产生针对6A和6B的抗体,它们不仅能够与6C和6D的荚膜多糖产生交叉反应,而且能够交叉保护6C和6D。PCV13中的6A和6B均对产生6C和6D的交叉保护抗体有贡献,其中对6C的贡献多于对6D。     

胃癌相关基因COL1A2、FN1、COL6A3预后分析

目的分析胃癌和癌旁组织差异表达基因,筛选出胃癌相关的关键基因,分析关键基因与胃癌预后的关系。方法利用NCBI(美国国立生物技术信息中心)公共数据平台GEO(Gene Expression Omnibus)中胃癌基因芯片数据GSE2685、GSE19826、GSE79973,采用GEO在线分析工具GEO2R分析数据,选取TOP250,输出差异表达基因,并通过在线生物信息学绘制韦恩图,获得共有差异基因;通过KM plotter数据库的应用分析COL1A2、FN1、 COL6A3与预后的关系。结果通过分析GSE2685、GSE19826、GSE79973芯片数据,共获得6个共表达基因,利用差异倍数作图,选取差异倍数在2倍以上的基因COL1A2、FN1、COL6A3进行分析,KM plotter数据库的分析显示COL1A2、FN1、COL6A3与胃癌的总生存期成负相关。结论 COL1A2、FN1、COL6A3在胃癌组织中表达高于癌旁组织,是胃癌的危险因素,其表达水平越高预后越差。     

柯萨奇病毒A6 型VP1 蛋白的生物信息学分析

目的:预测柯萨奇病毒A组6型(Coxsackievirus A6,CVA6)的衣壳蛋白VP1的基本理化性质、结构功能及线性B细胞表位。方法:应用Bioedit软件、Sub Loc、Target P和生物信息学资源门户Ex PASy中的多种在线工具对CVA6 VP1的氨基酸序列进行分析。结果:CVA6 VP1为一亲水性蛋白,其相对分子量为33.6 k D,等电点为7.92,含有24个可能的磷酸化位点,没有信号肽、跨膜区和可能的脂酰化位点;其二级结构中以无规则卷曲居多,有48.52%的氨基酸残基暴露于溶液界面;该分子内存在多个潜在的线性B细胞表位,其中的155~165位氨基酸残基区域的抗原指数最高。结论:成功预测到CVA6 VP1的基本理化性质、结构功能特征及可能的线性B细胞表位,为该蛋白的进一步研究及疫苗和免疫诊断试剂的研制打下基础。