75例广东籍汉族人蛋白磷酸酶2A-B56γ亚基基因5'-侧翼区多态性分析

目的 探讨蛋白磷酸酶2A(pp2A)-B56γ亚基基因(PPP2R5C)启动子区的多态性和人群分布.方法 随机选取广东汉族健康人群的全基因组DNA,聚合酶链反应(PCR)获得PPP2R5C基因5'-侧翼区的目的 片段产物直接再测序,序列比对并确证遗传变异位点,采用HaploView软件进行等位基因型人群分布的分析、并与国际单体型图谱计划(Hap-Map)数据进行比较.结果 成功测序75例健康人(150条染色体)PPP2R5C基因-1933nt+241nt的目的 片段,发现该人群中存在5个遗传变异位点且各等位基因型在年龄组和性别之间分布差异无统计学意义(P>0.05),最小等位基因频率(MAF)分别为-1447C>T(0.67%)、-1430G>A(19.33%)、-1274T>C(19.33%)、-563G>C(19.33%)和-526T>C(0.67%);与HapMap的中国北京人群和其他国外人群MAF和分布数据略为不同,但差异无统计学意义(P>0.05).结论 筛查出和首次报道PPP2R5C基因5'-侧翼区在中国南方广东汉族健康人群中的多态性位点及其等位基因型的分布.     

CD14启动子-159位点C／T多态性与血脂的相关性研究

目的研究湖南地区汉族健康人群脂多糖受体(CD14)启动子-159位点基因多态性分布及其对血脂的影响。方法采用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测118名湖南地区汉族健康人群CD14启动子-159位点3种基因型分布,同时检测血脂水平并探讨二者相关性。结果湖南地区汉族健康人群CD14启动子-159位点存在C/T多态性,CC基因型占19.5%,CT基因型占51.7%,TT基因型占28.8%,3种基因型之间比较,TT基因型的血浆低密度脂蛋白胆固醇水平明显低于CC型和CT型(P<0.001,P<0.05),而甘油三脂、总胆固醇、高密度脂蛋白胆固醇,载脂蛋白AI、载脂蛋白B100、体重指数等指标在3种基因型间差异无显著性(P>0.05)。结论湖南地区汉族健康人群CD14启动子-159位点存在C/T多态性,TT基因型可明显影响血浆低密度脂蛋白胆固醇水平。     

广东人群PP2A-Aα亚基基因5′-侧翼区单体型分析

目的探讨蛋白磷酸酶2A(PP2A)-Aα亚基基因启动子区多态性的人群单体型分布特征。方法采用Haploview软件分析部分广东汉族人群PPP2R1A基因5′-侧翼区筛查到的7个多态性位点的遗传学特征、连锁不平衡(LD)、标签(tag)SNP和单体型(域)分布。结果各多态性位点基因型频率均符合H-W平衡(P>0.05);各位点在该人群的杂合度(π)不同,且在-568G>A和+87T>C与HapMap中的不同人群存在明显差异(P<0.05);-1039G>T(+Ins)与+87T>C和+108A>G、-568G>A与-241-/G位点之间呈强LD,+87T>C与+108A>G之间为完全LD;构建该人群中的5种单体型(H1～H5),频率分布为野生单体型(H1)53%、其余4种变异单体型(H2～H5)为44%;得到两个单体型域,筛选出-1039G>T(+Ins)、-512G>A、-241-/G、+107-/C为4个tag SNP,并确定了2个单体型域内标签SNPs(htSNP)及其分别代表的单体型。结论首次确定并报道中国广东汉族健康人群PPP2R1A基因5′-侧翼区的标签SNP和单体型(域)分布。     

广东人群PP2A—B亚基基因5’-侧翼区多态性连锁不平衡和单体型分析

目的探讨蛋白磷酸酶2A（PP2A）的调节B／PR558亚基基因5’-侧翼区多态性的连锁不平衡和人群单体型分布特征。方法选取经体检排除急慢性疾病的50例广东汉族健康人群为调查对象,以人胱舵D基因5’-侧翼区中-1684A〉G（rslll46169）、-1196C〉T（rs9419202）、-462G〉A（rs7074421）和-1610A〉T为4个纳入的多态性位点,采用HaploView软件分析遗传特征、连锁不平衡（LD）和单体型分布,进行人群分布的x2检验。结果50例广东汉族人群中各多态性位点基因型频率均符合Hardy—Weinberg平衡（P〉0．05）;杂合度（π）分别为-1684A〉G（0．020）、-1610A〉T（0．132）、-1196C〉T（0．059）和-462G〉A（0．059）,且均不存在变异纯合型,其中在-1196C〉T和-462G〉A位点明显低于HapMap人群（P〈0．05）;-1196C〉T和-462G〉A位点之间呈完全LD,但其他位点间未见LD关系;构建了该人群的3种单体型（HI～H3）,频率分布主要是野生单体型（H1,89．0％）,其余2种变异单体型分别为H2（7．0％）和H3（3．0％）;筛选出的3个标签SNP为-1684A〉G、-1610A〉T和-462G〉A。结论确定并报道中国南方广东汉族人群PPP2R2D基因5’-侧翼区中相对保守的标签SNP和单体型分布,为进行该基因启动子区的功能分析提供依据。     

广东省氡辐射地区人群h OGG1基因5'侧翼区多态性单体型分析

目的探讨8-羟基鸟嘌呤DNA糖苷酶1(h OGG1)基因5'侧翼区多态性单体型在广东省氡辐射地区汉族人群中的分布及其遗传特征。方法采用Haplo View软件分析本研究前期筛查确证的广东省氡辐射地区汉族人群中h OGG1基因5'侧翼区目的片段(-1721 nt~+164 nt)中8个多态性位点-1493 G A、-1455 G A、-1293 A T、-1187 C A、-834 G C、-337 C A、-323 G A和-18 G T的群体遗传学特征、连锁不平衡和单体型分布。结果研究对象h OGG1基因5'侧翼区目的片段(-1721 nt~+164 nt) 8个多态性位点中,除-1293 A T和-337 C A外,其余6个位点基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P 0. 05); 8个多态性位点在该人群中均不存在变异纯合基因型,其杂合度分别为-1493 G A(0. 081)、-1455 G A(0. 017)、-1293 A T(0. 361)、-1187 C A(0. 140)、-834 G C(0. 017)、-337 C A(0. 468)、-323 G A(0. 017)和-18 G T(0. 065);连锁不平衡分析结果表明,仅-1493 G A与-18 G T呈较强的连锁不平衡关系。本研究构建了广东省氡辐射地区汉族人群中4种多态性单体型,其中主要的野生单体型(H1)频率为87. 4%,其余3种为变异单体型(H2~H4),频率为9. 3%。结论阐明了广东省氡辐射地区汉族人群h OGG1基因5'侧翼区多态性单体型分布及其群体遗传特征。     

醛固酮合成酶基因及环境因素对高血压交互作用

目的 探讨汉族人群醛固酮合成酶基因(CYP11B2)启动子区-344C/T和第三外显因子K173R多态性位点与原发性高血压(EHT)关系.方法 按病例对照研究方法选择来自黑龙江省哈尔滨市的2组人群(210例EHT患者和391名对照及补充的182例EHT患者和189名对照),利用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性及直接测序技术分别对其进行-344C/T与K173R基因型检测,问卷调查和实验室检查获取传统危险因素.结果 总人群和男性中,-344C/T基因型分布在高血压组和对照组间差异均有统计学意义(P＜0.05),而K173R基因型分布仅在女性高血压组和对照组间差异有统计学意义(x2=11.16,P=0.003 8);总人群中,-344C/T CC+ TC、K173R KK分布与体质指数、腰围、血脂异常、高血糖对EHT均存在正交互作用,饮酒、吸烟与-344C/T CC+ TC分布同时出现对EHT发生有促进作用;按性别分组的亚群中,除男、女血脂异常、女性血糖升高与-344C/T CC+ TC分布同时存在对EHT存在负交互作用外,其余均为正交互作用.结论 -344C/T、K173R基因多态性分布在汉族EHT与正常人群中存在差异;-344 C/T CC +TC、K173R KK与传统危险因素联合作用可促进EHT发生.     

中国北方汉族健康受试者IGFBP-3基因启动子-202位点基因型的测定与分析

目的:建立胰岛素样生长因子结合蛋白-3(Insulin-like growth factor binding protein-3,IGFBP-3)基因启动子-202位点A/C多态性(rs2854744)的测定方法,考查该位点基因型在中国北方汉族健康受试者中的分布情况。方法:采用聚合酶链式反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)分析技术检测该位点的基因型,并用直接测序验证检测方法的准确性。结果:对100例无亲缘关系的汉族健康受试者的分析结果表明:-202位点等位基因A和C的频率分别为0.750和0.250,AA、AC和CC的频率分别为0.560、0.370和0.070。结论:中国北方汉族人IGFBP-3基因启动子-202位点存在遗传多态性;本研究建立的基因型测定与分析方法特异、准确,可满足IGFBP-3遗传多态性研究的需要。     

佛山市汉族人群叶酸代谢通路关键酶基因MTHFR C677T多态性分布特征调查

目的 调查佛山市体检人群叶酸代谢障碍关键酶基因5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T位点基因多态性分布情况。方法 以佛山市182位女性和120位男性为研究对象,均为汉族人群,检测其MTHFR C677T基因位点多态性,分析性别、地域与基因多态性分布特征的关系。结果 调查的302例佛山市汉族人群MTHFR C677T位点CC、CT、TT基因型所占比例分别为62.6%、31.8%、5.6%,等位基因C、T所占比例分别为78.5%、21.5%。佛山市汉族男性与汉族女性MTHFR C677T位点多态性分布情况差异无统计学意义(P＞0.05)。佛山市汉族人群与已有数据报道的武汉、西安、长治、青岛、北京、乌鲁木齐等地的汉族人群的MTHFR C677T位点基因型、等位基因的分布情况差异均有统计学意义(P＜0.05)。佛山市汉族人群与回族、蒙族、维吾尔族、苗族MTHFR C677T位点基因型、等位基因的分布情况差异有统计学意义(P＜0.05),与布依族差异无统计学意义(P＞0.05)。结论 佛山市汉族人群MTHFR C677T位点多态性分布情况与其他地区、其他民族有显著差异,在实施个性化日常保健措施时可将遗传因素纳入考虑。     

安徽汉族人群PDCD1基因单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮易感性分析

目的探讨程序性细胞死亡基因（PDCD1）单核苷酸多态性（SNP）对安徽籍汉族人群系统性红斑狼疮（SLE）患者易感性的影响。方法利用病例对照研究方法，收集122例SLE确诊患者和143名正常对照的血标本，用酚-氯仿-蛋白酶K提取法提取基因组DNA，用DNA单向测序法进行SNP因子检测和筛查。结果PDCD1基因7809位点的基因型全部为G／G型，PDCD1基因7872位点存在C和T2种多态性，PDCD1基因8162位点存在G和A2种多态性，在两组中分布差异有统计学意义（x^2=8．55，x^2=11．85，P〈0．05）。PDCD1基因7872位点，病例组C／C、C／T、T／T基因型频率分别为36．1％、41．8％、22．1％，对照组分别为51．7％、35．0％、13．3％，两组间基因型分布差异有统计学意义（0=7．411，P〈0．05）；PDCD1基因8162位点病例组G／G、G／A、A／A基因型频率分别为50．1％、20．3％、28．6％，对照组分别为57．6％、20．8％、22．6％，两组间等位基因型分布差异有统计学意义（x^2=7．547，P〈0．05）。PDCD1-7872杂合型、PDCD1-8162杂合型可能具有阻止汉族人发生SLE的作用（OR=0．583，OR=0．485）。结论安徽籍汉族人群PDCD1基因7809位点不呈现SNP，7872和8162位点SNP与SLE的易感性相关。     

肿瘤坏死因子基因6个SNPs与河南汉族原发性高血压的相关性研究

摘要：目的探讨肿瘤坏死因子基因6个SNPs位点多态性与河南汉族原发性高血压（EH）的相关性。方法采用限制性扩增片段长度多态性（PCR—RFLP）的方法检测TNF-α启动区基因-238G〉A、-308G〉A、-850C〉T、-857C〉T、-863C〉A及TNF-β第一内含子基因＋252G〉A多态性,并运用卡方检验探讨各SNP位点多态性与EH的相关性。结果TNF-α-308G〉A位点基因型分布和等位基因频率在人群中存在差异显著性（x2=6．407,P=-0．041;Xz=4．781,P=-0．029）,EH组中,TNF-α-308G〉A中基因型GA＋AA人群的收缩压（SBP）、舒张压（DBP）、高密度脂蛋白（HDL）、低密度脂蛋白（LDL）、尿酸（uA）及空腹血糖（FPG）含量明显高于GG基因型人群（P〈0．05）;TNF-α基因-238G〉A、-850C〉T、-857C〉T、-863C〉A及TNF-β基因＋252G〉A多态性各基因型及等位基因频率在EH组和对照组的分布差异无统计学意义。结论TNF-α基因-308G〉A位点基因多态性与河南汉族原发性高血压的发病相关。TNF-α-238G〉A、-850C〉T、-857C〉T、-863C〉A及TNF-β＋252G〉A位点基因多态性与河南汉族原发性高血压无关联。     

PTPN22基因启动子-1123G＞C多态性与温州地区桥本甲状腺炎的相关性研究

目的:了解温州地区汉族人群PTPN22基因启动子-1123G>C位点的基因型分布;探讨该基因单核苷酸多态性与桥本甲状腺炎的关系。方法:运用单一等位基因特异性引物-聚合酶链式反应技术(PCR-SASP)测定无亲缘关系的270例温州地区汉族人群的PTPN基因启动子-1123位点单核苷酸多态性(正常对照组120例,桥本甲状腺炎组150例)。结果:桥本甲状腺炎组PTPN22基因启动子-1123位点的GG、GC和CC基因型频率分别为0.207、0.627和0.167,基因G和C频率分别为0.520和0.480;正常对照组基因型表达频率分别为0.375、0.475和0.150,G和C基因频率分别为0.613和0.388;PTPN22基因启动子-1123位点多态性的分布频率在对照组和病例组间差别有统计学意义(χ2=9.57,P<0.05),且C基因频率在病例组中显著高于对照组(χ2=4.633,P<0.05)。结论:PTPN基因启动子-1123G>C SNP与温州地区汉族人群桥本甲状腺炎的发生有相关性,-1123 C基因是HT的易感基因。     

白细胞介素10基因多态性与慢性牙周炎易感性的病例对照研究

目的 探讨IL-10基因多态性与中国汉族人群慢性牙周炎(CP)发病间的关系.方法 采用病例对照研究设计和PCR方法分别检测病例组(299例)、对照组(308例)IL-10基因-1082、-819位点的基因型和等位基因频率的差异.结果 IL-10基因-1082、-819两个多态性位点的基因型分布与Hardey-Weinberg平衡的理论频数之间差异无统计学意义(P＞0.05).单因素分析表明IL-10基因-1082、-819位点各基因型和等位基因型分布在病例组和对照组中差异无统计学意义(OR=0.93,P＞0.05;OR=103,P＞0.05).结论 IL-10基因-1082、-819位点位点基因多态性与中国汉族人群CP的易感性无显著关联.     

白细胞介素10基因-592 C/A和-819 C/T多态性与β-内酰胺类抗菌药物过敏的相关性研究

目的探讨白介素10（IL-10）基因启动子-592C／A和-819C／T基因多态性，在哥内酰胺类抗菌药物过敏汉族患者与正常人群中的分布及与药物过敏的相关性。方法应用聚合酶联反应-限制性片段长度多态性技术（PCR-RFLP），对44例争内酰胺类抗菌药物过敏的汉族患者及44例对照人群，IL-10基因-592C／A和-819C／T位点进行研究，探讨两者之间的关系，并通过对PCR产物测序，验证聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术的特异性。结果女性药物过敏患者与对照组间的单核苷酸多态性（SNP）差异有统计学意义（P〈0．05，OR=17．5，CI：1.26～533．07），男性药物过敏患者与对照组间差异无统计学意义。结论白介素10基因-592C／A和～819C／T位点多态性可能是中国汉族女性争内酰胺类抗菌药物药物过敏的易感性标志。     

辽宁地区汉族人群多巴胺D2受体基因启动子区-241A/G的多态性研究

目的探讨辽宁地区汉族人群多巴胺D2受体(dopamine D2 receptor,DRD2)基因启动子区-241A/G多态性位点的基因型及等位基因的频率分布。方法用等位基因特异性扩增技术对101名辽宁地区汉族人的DRD2基因启动子区-241A/G多态性进行了检测,并与其他人群做比较。结果 (1)DRD2基因启动子区-241A/G的等位基因频率分别为49%和51%,均符合Hardy-Weinberg平衡定律。(2)中国人群与其他人群基因多态性分布频率对照研究发现,DRD2基因启动子区-241A/G多态性分布存在显著性差异。结论 DRD2基因启动子区-241A/G多态性分布具有种族差异。     

白细胞介素4及受体基因多态性与维吾尔族变应性鼻炎相关性的研究

目的探讨白细胞介素4(IL-4)及受体(IL-4R)基因多态性与维吾尔族人群(维族)变应性鼻炎的关联。方法采用人群为基础的病例对照研究成组设计,选择新疆喀什地区维族变应性鼻炎(AR)患者109例为病例组,以同居住地、同民族、同性别作为匹配条件,选取393例非AR居民为对照组。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法(PCR-RFLP)检测IL-4rs2243283C/G和IL-4R rs6498011A/G位点基因多态性,比较其在病例组与对照组间基因型和等位基因的频率分布。结果 IL-4R基因rs6498011A/G位点在病例组和对照组间基因型和等位基因型分布频率差异有统计学意义(P=0.008)。IL-4基因rs2243283C/G位点在两组间分布差异无统计学意义(P=0.999)。结论 IL-4Rrs6498011A/G位点与维族变应性鼻炎密切相关。     

ADAM33基因单核苷酸多态性与慢性阻塞性肺疾病易感性研究

目的检测解整合素-金属蛋白酶33(ADAM33)基因单核苷酸多态性与山东汉族人群慢性阻塞性肺疾病(COPD)的关系。方法采用PCR-RFLP对363例COPD患者和372名健康人ADAM33基因T1位点多态性进行分型,对等位基因及基因型分布进行统计学分析。结果 ADAM33基因T1位点3种基因型AA、GA、GG基因型频率在病例组中分别为0.8265、0.1680和0.0055,在对照组中分别为0.8763、0.1156和0.0081,A和G等位基因型的频率在病例组中分别为0.9105和0.0895,在对照组分别为0.9341和0.0659,该位点基因型和等位基因型分布在病例组与对照组P值分别为0.117,0.090,差异均无统计学意义。结论 ADAM33基因T1位点多态性与山东汉族人群COPD发生无明显相关性。     

乌鲁木齐市汉族人群叶酸代谢通路关键酶基因MTHFR、MTRR单核苷酸多态性分布特征调查

目的调查乌鲁木齐市汉族人群叶酸代谢障碍关键酶基因5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)C677T、A1298C及甲硫氨酸还原酶(MTRR)A66G位点基因多态性分布情况。方法随机以乌鲁木齐市216位汉族女性、206位汉族男性为研究对象,检测MTHFR C677T、A1298C及MTRR A66G基因位点多态性,采用统计学方法分析性别、地域与基因多态性分布特征的关系。结果乌鲁木齐的汉族女性MTHFR 677TT纯合突变基因型频率为24.1%,显著高于南方城市湘潭、眉山、南宁、琼海和惠州(P0.05);MTHFR A1298C基因型分布情况与尚志、延边、廊坊、烟台地区的人群差异有统计学意义(P0.05);MTRR A66G位点的基因型频率和等位基因频率与延边、廊坊、济源和镇江等地区比较差异有统计学意义(P0.05)。结论乌鲁木齐市汉族女性与男性MTHFR、MTRR基因多态性分布无差异,该地区汉族女性的基因多态性频度分布具有地区特异性。     

IL-18基因多态性与婴幼儿巨细胞病毒感染关系的研究

目的通过检测人巨细胞病毒(HCMV)感染患儿白介素-18(IL-18)基因启动子区-607A/C、-137G/C位点单核苷酸多态性(SNPs),探讨其与HCMV感染的关系。方法采用聚合酶链反应结合限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测150例HCMV感染患儿和100名健康对照者IL-18基因启动子区-607A/C、-137G/C位点基因多态性,产物测序法验证RFLP分型。结果 PCR-RFLP法分别测出IL-18启动子区-607A/C、-137G/C位点野生型和突变型纯合子和杂合子,与直接测序所得基因型相符;各基因型多态性分布频率均符合遗传学的Hardy-Weinberg平衡定律;患儿组-607A/C中C、A等位基因频率分别为0.480、0.520,对照组分别为0.490、0.510;患儿组-137G/C中G、C等位基因频率分别为0.867、0.133,对照组分别为0.820、0.180;两组-607A/C和-137G/C位点基因型频率及等位基因频率比较,差异均无统计学意义。结论 PCR-RFLP可用于IL-18启动子区-607A/C、-137G/C位点SNPs的检测;其基因多态性与婴幼儿HCMV感染无关。     

白细胞介素13基因启动子区多态性与特发性肺纤维化的关系

目的 探讨白细胞介素13(IL-13)基因启动子区-1112(C/T)位点基因多态性与特发性肺纤维化(IPF)的相关性. 方法 研究组IPF患者70例,根据肺功能分为3个亚组,以A(弥散功能轻度下降,22例)、B(弥散功能中度下降,20例)、C(弥散功能重度下降,28例)组表示,80例健康体检者作为对照组.外周血提取基因组DNA,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)检测IL-13基因启动子区-1112(C/T)位点的基因多态性. 结果 研究组IL-13基因启动子区-1112(C/T)位点的基因多态性分布为CC纯合子28例(40.0%),TT纯合子6例(8.6%),CT杂合子36例(51.4%);对照组CC纯合子30例(37.5%),TT纯合子11例(13.8%),CT杂合子39例(48.8%),-1112(C/T)位点等位基因C、T在两组间分布及三种基因型之间构成比比较差异无统计学意义(P＞0.05).A组CT和TT基因型共9例(40.9%),B组CT和TT基因型共10例(50.0%),C组CT和TT基因型共23例(82.1%),三组间比较差异有统计学意义(P均＜0.05). 结论 IL-13基因启动子区-1112(C/T)位点基因多态性与IPF的发病无关,但与其肺弥散功能的损害程度有关.     

汉族人群ApoE-CⅠ-CⅡ基因簇及其与血脂水平关系的研究

目的探讨ApoE-CⅠ-CⅡ基因簇之间的遗传联系及其对汉族人群血脂水平的影响.方法采用横断面调查方法对350例汉族人群[年龄(63.64±12.0)岁]进行基因多态性和血脂水平分析.ApoE基因多态性检测用m山ti-ARMS快速分型法,ApoCI启动子HpaI多态性及ApoCⅡ基因AvaⅡ位点多态性均采用PCRRFLP;血脂测定在全自动化分析仪上进行.结果人群中ApoE基因E3/3为主要基因型(73.40%),E2/2、E2/4和E4/4型均较少见(＜1%);ApoCI基因以H1/1基因型为主(79.7%),纯合子突变型H2/2少见(1.70%);未发现ApoE和ApoCI基因多态性与各血脂水平间有统计学意义的联系;ApoCⅡ基因中T1、T2等位基因型频率分别为70.7%和29.3%,T1/2携带者血TG水平[(1.49±0.96)mmol/L]显著高于T1/1携带者[(1.29±0.72)mmol/L],P＜0.05.ApoE、C1和CⅡ各位点基因型和等位基因型分布在男女性别间差异均无显著意义.ApoE和ApoCI两基因在研究人群中未出现连锁不平衡现象.结论人群中Apoe和ApoCI基因未出现连锁不平衡分布,其多态性对各血脂水平间也未产生有统计学意义的影响,可能是汉族人群心血管疾病发病率较低的一个因素.