钙黏素家族相关基因与涎腺腺样囊性癌转移的关系

目的筛选与涎腺腺样囊性癌转移相关的钙黏素（CDH）家族基因。方法对涎腺腺样囊性癌转移能力不同的两个细胞株的基因表达谱进行生物信息学分析,筛选出可能与转移相关的CDH家族基因,通过荧光实时定量PCR技术对相关基因的表达差异进行验证,并用免疫组织化学技术研究有差异的CDH基因在临床样本中的表达及其与转移的关系。结果生物信息学分析发现,表达谱中有14个CDH家族基因在两个细胞株中的表达有差异,实时定量PCR验证发现CDH4、CDH5、CDH12在两细胞株之间的表达差别有统计学意义（P〈0.05）,免疫组织化学发现CDH12在有转移的临床标本中的表达高于没有转移的标本（（P〈0.05）。结论 CDH12可能与涎腺腺样囊性癌的高转移能力有关。     

Notch信号通路相关基因的表达与涎腺腺样囊性癌转移的关系

目的筛选与涎腺腺样囊性癌转移相关的Notch信号通路基因。方法对已构建的涎腺腺样囊性癌高低转移细胞株ACC-M、ACC-2基因表达谱进行生物信息学分析,在与Notch信号通路基因进行比对后,筛选出差异基因,通过荧光实时定量PCR技术对相关基因的表达差异进行初步验证。结果涎腺腺样囊性癌的表达谱中有46个基因与Notch信号通路有关。验证发现,Notch-1,Notch-2,Notch-4,CHUK,FOXC1,FZD2,FZD3,GBP2和RUNX1在2个细胞株中的表达差别有统计学意义（P〈0．05）,同时Notch-1在发生转移的涎腺腺样囊性癌中的表达明显高于未发生转移的涎腺腺样囊性癌（P〈0．05）。结论Notch信号通路中的多个基因可能参与了涎腺腺样囊性癌的发生和发展;Notch-1的表达与涎腺腺样囊性癌的发生、转移密切相关。     

人涎腺腺样囊性癌细胞系中RUNX3基因5'-CpG岛甲基化及蛋白表达

目的 探讨人涎腺腺样囊性癌细胞株中RUNX3基因启动子5'-CpG岛甲基化及其表达情况.方法 以定量甲基化特异性PCR(qMSP)检测ACC-2、ACC-3和ACC-M细胞在甲基转移酶抑制剂5-氮脱氧胞苷(5-Aza-dc)处理前后RUNX3基因5'-CpG岛甲基化状况,并分别用反转录-聚合酶链反应、免疫荧光化学和Western印迹法分析RUNX3的表达变化.结果 RUNX3在ACC-2和ACC-3细胞中弱表达,在ACC-M中表达缺失.经5-Aza-dc处理后,RUNX3在ACC-2和ACC-3细胞中表达增加,在ACC-M中恢复表达.激光共聚焦发现RUNX3蛋白主要定位在细胞质中,经300 nmol/L5-Aza-dc处理72 h后,在ACC-2和ACC-3细胞核中出现表达,而在ACC-M细胞中仍定位在细胞质中.RUNX3基因启动子区域5'-CpG岛在ACC-2、ACC-M和ACC-3中均为部分甲基化,其甲基化程度分别为50%、75%和33%.5-Aza-dc处理后,RUNX3基因在三株细胞株中均呈现为非甲基化状态.结论 RUNX3甲基化是ACCs中RUNX3表达缺失的主要原因之一,而RUNX3蛋白在ACCs细胞质中的异位表达,也可能与RUNX3蛋白的功能被抑制有关.     

应用抑制性消减杂交技术分析涎腺腺样囊性癌转移相关基因

目的：克隆涎腺腺样囊性癌转移相关的基因。方法：应用mRNA抑制性消减杂交技术，研究涎腺腺样囊性癌高、低转移细胞系基因表达上的差异。结果：以高转移细胞ACC-M为测试子，低转移细胞ACC-2为驱赶子，获得高表达的基因序列有7个，均为已知序列同源基因。其中XAGE-1b基因为肿瘤睾丸抗原家族中的一个重要基因。结论：与ACC-2相比ACC-M中部分基因的高表达与涎腺腺样囊性癌高转移特性的获得有关，此结果为进一步探索腺样囊性癌肿瘤转移分子机理以及肿瘤转移控制和基因治疗提供了重要的依据。     

survivin基因沉默对腺样囊性癌细胞生长和凋亡的影响

目的 探讨RNA干扰下调survivin基因表达后腺样囊性癌细胞生物学行为变化及其与caspase-3基因表达的相关性.方法 设计、合成小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA),构建表达载体pGenesil-shRNA-survivin,将重组质粒导入人腺样囊性癌ACC-2细胞株,G418筛选阳性克隆.采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、Western blot分别检测转染后的ACC-2细胞中survivin、caspase-3 mRNA及蛋白表达的变化,用噻唑蓝(MTT)法检测细胞的增殖,原位细胞凋亡(TUNEL)法及透射电子显微镜研究细胞凋亡.结果 测序证实表达载体构建成功,在pGenesil-shRNA-survivin的ACC-2细胞株中,survivin mRNA及蛋白表达明显降低(P＜0.05),caspase-3 mRNA及蛋白表达明显增加(P＜0.05),survivin与easpase-3的mRNA和蛋白表达呈显著负相关(r=-0.333,P＜0.05).ACC-2细胞增殖受到抑制,透射电镜及TUNEL法可见细胞出现凋亡.结论 成功构建了survivin基因的RNAi真核表达载体,pGenesil-shRNA-survivin重组质粒能有效抑制腺样囊性痛细胞生长.     

应用基因芯片研究E2F-1过表达对胃癌细胞免疫相关基因表达的影响

目的利用基因表达谱芯片技术筛选过表达E2F-1的胃癌MGC-803细胞与对照组间差异表达的免疫相关基因,初步探讨E2F-1对胃癌细胞免疫功能影响的机制。方法分别抽取转染E2F-1的胃癌MGC-803细胞和未转染E2F-1的胃癌MGC-803细胞的总RNA．纯化mRNA,逆转录合成cDNA标记后,与22K人类基因表达谱芯片进行杂交,扫描后筛选出与免疫相关的差异表达基因,半定量RT-PCR方法验证差异表达基因。结果在21522条基因中,两组细胞间差异表达的免疫相关基因有10条,其中上调基因2条,下调基因8条。上调基因中有1条功能信息不明。其中myc的RT-PCR结果与基因芯片扫描结果相似,具有相同的方向性。结论利用基因芯片技术筛选出E2F-1过表达影响胃癌细胞免疫功能的相关基因,为今后更深入的研究E2F-1对胃癌免疫功能的影响奠定了基础。     

siRNA干扰survivin表达对腺样囊性癌细胞株ACC-M的抑制作用

目的探讨靶向survivin基因RNAi对腺样囊性癌增殖的抑制效应。方法设计、合成siRNA(small interfering RNA),构建表达载体pGenesil-shRNA-survivin,将重组质粒导入人腺样囊性癌ACC-M细胞株。采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)、Western-blot法分别检测转染后的ACC-M细胞中survivin mRNA和蛋白表达的变化,用噻唑蓝(MTT)法来检测细胞的增殖。结果测序证实表达载体构建成功,在pGenesil-shRNA-survivin的ACC-M细胞株中,survivin mRNA及蛋白表达明显降低,ACC-M细胞增殖受到抑制。结论pGenesil-shRNA-survivin重组质粒能有效抑制腺样囊性癌细胞增殖。     

利用基因芯片技术筛选不同转移能力骨肉瘤细胞差异表达基因

目的：运用基因芯片技术研究骨肉瘤转移相关基因表达．方法：提取具有不同转移特性的骨肉瘤细胞总RNA，反转录制备杂交探针，应用基因芯片筛选与骨肉瘤转移相关的基因．杂交信号用ScanArray3000扫描，结果用ImaCene3．0软件分析．结果：对原位及转移骨肉瘤细胞基因表达诺分析，发现两种肿瘤细胞中存在差异表达基因，其中有抑癌基因、转移相关蛋白基因、细胞周期蛋白基因等，与肿瘤发生发展密切相关．结论：基因芯片技术对肿瘤转移机制研究有重要意义。     

survivin特异性RNAi表达载体的构建及其干扰效果鉴定

目的 构建survivin基因的RNAi真核表达载体并观察其对转染腺样囊性癌细胞株ACC-2后survivin表达变化以及对细胞凋亡的影响.方法 设计、合成siRNA(small interfering RNA),构建表达载体pGenesil-shRNA-survivin,将重组质粒导入人腺样囊性癌ACC-2细胞株.采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)法检测转染后的ACC-2细胞中survivin mRNA表达的变化,用TUNEL检测细胞凋亡的变化.结果 经测序模版序列和设计序列完全正确,在pGenesil-shRNA-survivin转载ACC-2细胞株中,survivin mRNA表达明显降低,转染的ACC-2细胞凋亡显著增加.结论 成功构建了survivin基因的RNAi真核表达载体,且其对腺样囊性癌细胞有一定的干扰效果.     

腺病毒介导的P~(53)基因对涎腺腺样囊性癌细胞系生长的影响

目的研究P53基因对涎腺腺样囊性癌细胞系生长的影响。方法以人涎腺腺样囊性癌细胞系SACC-83、SACC-LM、ACC-2、ACC-M和NACC为实验对象,将载有人野生型P53cDNA的重组腺病毒(Ad5CMV-P53)感染涎腺腺样囊性癌细胞系,观察Ad5CMV-P53对涎腺腺样囊性癌细胞生长的影响。结果5种涎腺腺样囊性癌细胞系转染Ad5CMV-P53病毒后,均可以诱导其发生凋亡,使细胞系生长受到明显的抑制。结论Ad5CMV-P53介导的野生型P53基因,可能是一种有效的治疗涎腺腺样囊性癌的辅助手段。     

RNA干扰iNOS基因对腺样囊性癌细胞增殖活性的影响

目的：采用RNA干扰（RNA interference,RNAi）技术下调腺样囊性癌细胞株ACC-M中iNOS的表达,探讨其对肿瘤细胞增殖活性的影响。方法：采用siRNA干扰技术下调iNOS表达,RT-PCR法测定细胞内iNOS mRNA的表达;MTT法测定ACC-M细胞增殖活性的变化。结果：与对照组比较,iNOS的siRNA能有效地抑制实验组ACC-M细胞中iNOS的表达（P〈0.05）,并且实验组细胞的体外增殖活性降低（〈0.05）。结论：RNA干扰iNOS可以降低腺样囊性癌的增殖活性。     

E2F-1过表达对胃癌细胞生物学行为影响的分子机理初步研究

目的 利用基因表达谱芯片技术筛选过表达E2F-1的胃癌MGC-803细胞与对照组间的差异表达基因,探讨E2F-1对胃癌细胞生物学行为影响的分子机理。方法 分别抽取转染E2F-1的胃癌MGC-803细胞和未转染E2F-1的胃癌MGC-803细胞的总RNA。纯化mRNA,逆转录合成cDNA标记后,与22K人类基因表达谱芯片进行杂交,扫描后筛选出表达差异的基因。随机选取3个差异表达基因,分别设计引物,用半定量RT-PCR检测验证。 结果 在21522条基因中,两组细胞间的差异表达基因有740条,其中上调基因405条,下调基因335条。差异基因中有73条功能信息不明。随机选取的3个差异表达基因的RT-PCR结果与基因芯片扫描结果相似,具有相同的方向性。结论 胃癌的发生发展是多基因相互作用、多种信号通路相互调节的结果。生物信息学分析显示, E2F-1基因可以通过TP53信号传导途径影响胃癌MGC-803细胞生物学行为的改变,还与众多基因的差异性表达密切相关。     

Differentially expressed gene in osteosarcoma cell lines with different metastatic potentials

Objective

To study the expression of osteosarcoma metastasis associated gene using a cDNA microarray, and screen new candidate genes related to the development, progress and osteosarcoma metastasis.

Methods

Total RNA of a low metastatic osteosarcoma and a high metastatic osteosarcoma (M6 and M8 cell lines, respectively) was extracted, purified to mRNA and then reverse transcribed to cDNA. M6 was used as the experimental group and M8 as the control group, and the gene expression of cells from both of these two sublines was investigated using cDNA microarrays containig 8064 cDNA clones. The cDNA of M6 was labeled with cy3 and the cDNA of M8 was labeled with cy5. The two sublines were hybridized with the cDNA microarray. The hybridization signals were scanned with a Generation III array scanner and analyzed by Imagequant 5.0 software.

Results

There were 330 differentially expressed genes between M6 and M8. In the M6 subline,152 genes were up-regulated and 178 genes were down-regulated compared to the M8 subline. These genes could be classified according to their function. Cell growth-related genes that were down-regulated included CCNG1, CDC2, APC10, and RPA3, while expression of the tumor suppressor genes, CDKN1A and CDKN2D, was up-regulated. Other genes that were differentially expressed included those that have been implicated in the regulation of signal transduction, metabolism and apoptosis.

Conclusion

This study exploits a cDNA microarray approach to identifying genes that may be associated with metastasis. The gene expression profiles of osteosarcoma cell lines is a potentially important index in the search of new candidate genes related to tumor occurrence, development and metastasis.     

小鼠3D3/LYRIC基因重组质粒构建及蛋白表达和定位

 目的构建小鼠3D3/LYRIC真核表达载体并证实融合蛋白在细胞内的表达及定位。方法提取小鼠乳腺上皮细胞系
C127 的mRNA,反转录为cDNA。PCR扩增3D3/LYRIC全长编码基因,亚克隆至pEGFP-C1表达载体中。将构建的重组质粒测
序并转染到腺样囊性癌细胞系ACC-2 中,提取细胞蛋白进行Western blot检测。利用免疫荧光显微镜观察pEGFP-m3D3/LYRIC
在腺样囊性癌ACC-2 细胞内的定位。结果3D3/LYRIC全长基因序列克隆到真核表达载体pEGFP-C1 中,酶切鉴定片段大小
为1 740 bp。Western blot 检测到融合蛋白GFP-m3D3/LYRIC 表达,分子量约为91 kDa。pEGFP-C1-m3D3/LYRIC主要在细胞质
内定位,在细胞核内未见表达。结论成功构建了3D3/LYRIC全长基因真核表达载体,pEGFP-m3D3/LYRIC 蛋白主要定位于
细胞质内。     

热休克诱导基因表达谱的变化

目的 研究细胞在热应激时的基因表达谱变化。方法 提取热休克前后Jurkat细胞的总RNA,经逆转录合成cDNA探针后分别与人cDNA表达占阵杂交,再用ESTblot软件进行分析,并用Northern印迹证明基因表达的改变。结果 经42℃1h热休克的细胞中有40个基因的mRNA表达升高,16个基因的mRNA表达降低,其中除热休克基因表达显著增加外,原癌基因c-Jun、cdc样激酶CLK－1基因表达明显增加。整合素integrin ∝－4基因,转化生长因子TGF－β基因表达显著降低。Northern印迹证明c-Jun及hsp90∝基因表达升高。结论 在热应激条件下Jurkat细胞热休克基因、c-Jun、CLK－1基因表达增加,integrin ∝－4基因、TGF－β基因表达减少。     

miR-26a靶向EZH2抑制涎腺腺样囊性癌ACC-M细胞的增殖活性

目的 探讨miR-26a对涎腺腺样囊性癌ACC-M细胞增殖能力的影响及其与EZH2的靶向关系. 方法 构建pcD-NATM6.2-pre-miR-26a、pmirGLO-EZH2野生型（pmirGLO-EZH2-WT）和突变型（pmirGLO-EZH2-MT）重组质粒,并采用荧光实时定量PCR（qRT-PCR）检测pre-miR-26a在ACC-M细胞中的转染效率,并与未处理组（control组）进行比较.同时采用MTT法分析miR-26a过表达对ACC-M细胞增殖活性的影响,并采用双荧光素酶报告基因系统、qRT-PCR和Western blot检测miR-26a与EZH2的靶向关系. 结果 将测序结果采用NCBI BLAST进行序列比对,结果显示pre-miR-26a、EZH2-WT和EZH2-MT重组质粒均构建成功,无碱基缺失或突变.qRT-PCR显示转染pre-miR-26a的ACC-M细胞其miR-26a的表达显著高于未处理组（P＜0.001）.MTT分析显示miR-26过表达可以明显抑制ACC-M细胞的增殖活性（P＜0.05）.此外,双荧光素酶报告基因系统（P=0.001）、qRT-PCR和Western blot均证实miR-26a能够显著下调EZH2的mRNA（P=0.001）和蛋白的表达（P=0.006）. 结论 miR-26a能够显著抑制涎腺腺样囊性癌ACC-M细胞的增殖活性,并且与EZH2之间存在良好的靶向关系.     

Effect of Exogenous bFGF on the Proliferation of Human Adenoid Cystic Carcinoma ACC-2 Cells

To observe the effects of basic fibroblast growth factor （bFGF） on human adenoid cystic carcinoma ACC-2 cell line proliferation and ERK, cyclin D1/p21^waf/cip1 signaling pathways, human adenoid cystic carcinoma cells （ACC-2） were cultured and the influence of bFGF of different concentrations on cell proliferation was determined by MTT. Protein was detected by immuno-precipitation and ERK activity by using ERK agent kit. p-ERK1/2 and down-stream cyclin D1, p21^waf/cip1 expression were detected by Western blotting and the interfering role of mitogen protein-activated kinase （MEK） suppressor U0126 in the afore-mentioned indicators was examined. MTT demonstrated ACC-2 cell proliferation was substantially enhanced by bFGF, immuo-precipitation displayed ERK activity was up-regulated by bFGF, and immuno-imprinting also showed p-ERK1/2, cyclin D1 expression was greatly enhanced and p21^waf/cip1 expression was inhibited by bFGE U0126 suppressed the effect of bFGF. It is concluded that bFGF can promote the proliferation of human adenoid cystic carcinoma ACC-2 cells, and its pathways are associated with the up-regulated activity and expression of p-ERK1/2, inhibited p21waf/cip1 expression and enhanced cyclin D1 expression.