肿瘤基因表达谱的研究进展

基因表达谱的研究是近年来新的研究热点。通过对肿瘤基因表达谱的研究，深入了解肿瘤的发生机制，有助于找出肿瘤的早期诊断指标、治疗靶点、治疗应答和预后指标。现综述在基因转录和翻译两个层次上发展的基因表达谱的新技术，即核酸层次上的表达序列标签、基因表达系列分析和新近发展的cDNA微阵列技术，蛋白质层次上的二相凝胶电泳和测序质谱技术即蛋白质组技术，以及生物信息学在表达谱研究中的应用。     

长链非编码RNA-蛋白质相互作用在肿瘤研究中的新进展

肿瘤的发生、发展涉及细胞内众多基因表达异常和分子间相互作用的改变.其中,异常表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA)通过与蛋白质相互作用,在信号转导、基因表达、蛋白功能等各个层面调控癌基因、抑癌基因的表达与功能,进而影响肿瘤的发生和发展.本文将围绕着肿瘤细胞中lncRNA-蛋白质相互作用的最新研究进展,结合相关技术,阐明其分子机制,并结合临床研究前沿热点,讨论如何阻断肿瘤中lncRNA-蛋白质相互作用,及在肿瘤治疗中的应用.     

DNA芯片技术及其在肿瘤研究中的应用

DNA芯片技术是一项新兴的生物学技术,可在基因组水平上高通量地对基因的表达、突变和多态性进行快速、准确的检测.肿瘤的形成、发展是多步骤、多基因参与的复杂过程,应用DNA芯片技术在基因组水平上对肿瘤进行研究,可以了解肿瘤细胞基因表达谱的改变,解释肿瘤发生、发展的分子机制,为肿瘤的分子病理诊断、临床肿瘤预后判断及治疗方案的选择提供理论指导.本文综述了DNA芯片的技术原理及近年来在肿瘤研究中的应用.     

基因芯片与肿瘤研究

基因芯片技术作为近期发展起来的一项新技术,不仅能够研究细胞内所有基因的表达谱,同时还具有多样品并行处理能力、分析速度快、所需样品量少、污染少等优点,为研究肿瘤发生发展过程中的基因表达情况提供了强有力的工具.本文对基因芯片技术在肿瘤研究中的应用,包括基因表达谱的研究、突变基因、变异基因、肿瘤转移基因的检测和药物的筛选等方面做一综述.     

外周血基因表达谱在肿瘤诊断中的应用

外周血基因表达谱代表了外周血细胞所有基因表达的格局.通过比较肿瘤患者与健康对照者以及不同种类肿瘤患者之间外周血基因表达的不同,可以得出差异表达基因,从而进一步分析其特征性基因表达谱进行辅助诊断和治疗.目前,外周血基因表达谱已在头颈部肿瘤、胸部肿瘤、腹腔肿瘤、泌尿及男生殖系肿瘤、妇科肿瘤等多种肿瘤领域研究成果显著,给未来临床应用奠定了基础.     

肿瘤蛋白质组学:过去、现在和将来

将蛋白质组学的技术方法应用到肿瘤生物学的研究中,产生了-门新学科--肿瘤蛋白质组学.它以寻找肿瘤标志物为目的,以蛋白质组学方法为手段,结合肿瘤分子机制的基础研究与肿瘤检测、诊断等临床研究.最终产出能应用于临床的肿瘤检测和治疗的蛋白质靶标.肿瘤蛋白质组学经历了表达谱、修饰谱到活性谱的进化过程,在不同的层面上揭示肿瘤可能的致病机制.本文概述了近年来在常见的恶性肿瘤中进行的肿瘤蛋白质组研究,应用各种蛋白质组技术方法,如二维凝胶电泳(two-dimensional gel eleetrophresis,2DE)、细胞培养稳定同位素标记技术(stable isotope labeling by amino acid in cell culture,SILAC)、基质辅助激光解析(matrix assisted laser desorption/ionization,MALDI)质谱等,找到了大量的蛋白质标志物.将来的挑战在于如何从理论上应用候选标志物解析肿瘤的分子机制,以及从实践上鉴定能真正应用于临床的标志物.     

基因芯片在胃癌基因表达谱中的应用

胃癌的产生是一个多因素、多阶段的复杂过程,且涉及大量肿瘤相关基因的结构改变和表达异常。鉴于基因芯片技术快速、准确、高通量检测基因表达谱的优点,现将该技术应用于胃癌发生、发展以及治疗过程中基因表达谱的研究进展作一综述。     

32例子宫内膜癌基因表达谱的层次聚类分析

目的：通过对子宫内膜癌组织基因表达谱的层次聚类分析，寻找子宫内膜癌“高危”患者。方法：以32例内膜样子宫内膜腺癌为实验组，36倒正常子宫内膜组织混合作为对照组。分别用Cy3和Cy5标记实验组和对照组。用含有13824个基因的人全基因表达谱cDNA芯片分析32例内膜癌的基因表达谱，筛选差异表达基因，并对基因表达谱进行层次聚类分析。结果：按肿瘤的分化程度、分期以及分化分期相结合进行分组，分别筛选出差异表达基因46、12和138个（P〈0．001）。对32例内膜癌进行层次聚类分析的结果与肿瘤的分化、FIGO分期分类基本相符，并且能够发现一些子宫内膜癌“高危”患者。结论：对子宫内膜癌基因表达谱的研究可以发现与子宫内膜癌浸润、转移相关的基因；基因表达谱的聚类分析可以在术前帮助判断子宫内膜癌的“高危”病患。     

基因表达谱芯片胃癌差异表达基因的筛选

目的:利用基因表达谱芯片研究胃癌组织中差异表达的基因,从多基因角度研究胃癌发生的分子机制.方法:抽提6例胃癌组织和相应的癌旁组织的总RNA,反转录成cDNA同时进行标记.将标记的cDNA与基因表达谱芯片杂交,经过芯片的扫描和数据处理,分析出胃癌组织和癌旁组织之间差异表达的基因.结果:通过对胃癌组织和癌旁组织的基因表达谱的比较分析,发现在胃癌组织中表达差异＞2倍的基因共有696个,其中表达上调的基因318个,表达下调的基因378个.差异表达的基因主要参与信号转导、免疫反应和细胞运动等生物学过程.结论:胃癌组织与癌旁组织的表达谱存在较大差异,利用基因表达谱芯片可筛选出胃癌差异表达的基因,从而有利于在临床上对肿瘤的诊断和治疗.     

基因芯片对中段食管癌基因表达谱的研究

目的研究中段食管癌基因表达谱,筛选特异性基因。方法利用基因芯片技术对食管癌的基因表达进行分析,通过生物信息学手段研究其内在关系。结果筛选出在中段食管癌中显著差异表达的基因21个,其中11个基因表达水平增高,10个基因表达水平降低。结论利用基因芯片技术可以高通量地筛选出肿瘤组织差异表达基因,这些特异性基因的表达水平,可以区分不同的肿瘤组织。对将来基因诊断和治疗有一定价值。