Effect of single-nucleotide polymorphisms -705T/C and -603T/A in P1 promoter region of human insulinlike growth factor-Ⅰ Gene on promoter activity

目的 探讨人胰岛素样生长因子-I(ICF-I)基因P1启动子区域单核苷酸多态性(SNP)-Y05T＞C和-603T＞A对启动子活性的影响.方法 招募152名健康志愿者参与本研究,取静脉血样品,使用基因组DNA提取试剂盒从血样中提取全基因组DNA.通过限制片段长度多态性分析(RFLP),对每名志愿者的SNP-705T＞C和-603T＞A进行基因分型,统计各基因型的频率.使用PHASE v2.1软件程序分析P1启动子单体型的类型和频率.通过荧光素酶报告基因测定不同P1启动子单体型的活力差异.结果 成功提取了每名志愿者的全基因组DNA并测定了SNP -705T＞C和-603T＞A的基因型.基因型-70ST/T、705T/C、-705C/C的频率分别与-603T/T、-603T/A、-603A/A相同,分别为43.4％、45.4％、11.2％.等位基因-705T、-705C的频率分别与-603T、-603A相同,分别为66.1％、33.9％.SNP -705T＞C和-603T＞A之间存在完全的连锁不平衡,其组成的P1启动子单体型只有-705T/-603T和-705C/-603A两种,频率分别为66.1％和33.9％.报告基因分析结果表明,P1启动子-705C/-603A单体型的活力显著高于-705T/-603T单体型.结论 人IGF-Ⅰ基因P1启动子区域SNP -705T/C和-603T/A能够影响P1启动子的活性.     

人胰岛素样生长因子-Ⅰ基因P1启动子区域CA微卫星多态性对启动子活性的影响

目的 探讨人胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)基因P1启动子区域CA微卫星多态性对启动子活性的影响.方法 收集131名健康中国人的血液样品,提取基因组DNA并进行基因扫描分析,测定人IGF-Ⅰ基因P1启动子区域CA微卫星多态性并计算其频率分布.通过PCR方法扩增含有不同长度CA微卫星的P1启动子单体型片段,插入至缺少启动子的pGL4.10质粒载体上的荧光素酶报告基因的上游.通过双荧光素酶报告基因分析法测定含不同长度CA微卫星的P1启动子单体型的活力,比较CA微卫星多态性对P1启动子活性的影响.结果 共发现9种CA微卫星多态性,分别为13CA、16CA、17CA、18CA、19CA、20CA、21CA、22CA和23CA,其中分布频率大于5%的有17CA、18CA、19CA、20CA和21CA多态性,分布频率最高的为19CA多态性.双荧光素酶报告基因分析结果表明,P1启动子单体型之间存在活力差异,其中16CA启动子单体型的活力最高,21CA启动子单体型的活力最低.结论 人IGF-Ⅰ基因P1启动子区域CA微卫星多态性能够影响P1启动子的活性.     

大鼠NR2B基因核心启动子区单核苷酸多态性研究

 目的:对大鼠NR2B基因核心启动子区进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)筛查及分析.方法:提取16只健康SD大鼠海马组织基因组DNA,聚合酶链式反应(PCR)扩增NR2B基因核心启动子区序列和SNP库已报道的rs8169392所在区域序列,结合DNA测序方法进行SNP筛查和验证.结果:在大鼠NR2B核心启动子区705bp中,发现1个新的SNP位点,为-217位C/T多态;本研究中未筛查到NCBI-SNP库报道的rs8169392.结论:-217位C/T多态的发现为NR2B基因多态性数据库提供了新信息.     

重度抑郁障碍与肿瘤坏死因子α和白细胞介素6基因启动子区多态性的相关性

目的 探讨肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor,TNF-α)基因启动子区-308G/A、-857C/T位点,白细胞介素6(interleukin-6,IL-6)基因启动子-174G/C和-572C/G多态性与重度抑郁障碍症发生的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法检测393例重度抑郁障碍症患者和393名健康者对照各个多态性位点的基因型,采用SPSS 13.0进行统计学分析.结果 TNF-α基因启动子-857C/T位点的基因型及等位基因频率分布在重度抑郁障碍症组与正常对照组间存在统计学意义(P＜0.05).其中,-857T的等位基因频率只在男性重度抑郁障碍症组与对照组间存在显著差异(OR=0.309,95％ CI:0.218 ～0.439,P＜0.01),而-308A位点的等位基因频率只在女性病例组与对照组间存在统计学意义差异(OR=0.399,95％ CI:0.246～0.648,P＜0.01).结论 证实TNF-α基因启动子区多态性可能是中国北方汉族重度抑郁障碍患者的风险因素.TNF-α基因启动子区多态性可能与重度抑郁障碍的发病存在关联.     

人铜锌超氧化物歧化酶基因启动子驱动的红色荧光蛋白报告基因载体的构建及表达

目的 构建人铜锌超氧化物歧化酶基因(Cu/Zn SOD,SOD1)启动子驱动的红色荧光蛋白报告基因载体,并对其功能进行鉴定,为研究细胞内SOD1基因表达调控和相关的信号转导机制提供重要工具.方法 提取人基因组DNA,FCR扩增SOD1 5'非编码区启动子序列(-1 499- +17);采用基因重组技术构建由SOD1启动子驱动的红色荧光蛋白报告基因载体,将该载体瞬时转染Hella细胞,观察静息或佛波酯(PMA)刺激下红色荧光蛋白表达,以检测SOD1启动子的转录活性及其基凶表达.结果 酶切和DNA测序证明所构建红色荧光蛋白报告基因载体正确;该表达载体静息状态下在Hella细胞表达少量红色荧光蛋白,经PMA刺激后,能够表达较多高亮度的红色荧光蛋白.结论 成功构建了SOD1启动子驱动的红色荧光蛋白报告基因载体,其对相关刺激有很好的反应,可用于SOD1基因表达信号调控机制的研究.     

β-防御素-1基因多态性与重症脓毒症真菌易感性的相关性研究

目的 通过病例-对照关联研究,探讨β-防御素1(DEFB1)基因多态性与重症脓毒症患者真菌感染易感性的相关性.方法 依据1992年和2002年美国胸科医师协会/美国危重病学会(ACCM/SCCM)制订的重症脓毒症诊断标准,将ICU中符合重症脓毒症诊断标准的211例患者纳入研究,并根据在ICU期间是否发生真菌感染将其进一步分为真菌感染组和对照组.通过DNA直接测序、聚合酶联反应双引物等位基因特异性扩增法(PCR-ASA)或Taqman方法检测DEFB1基因-1816A/G、-390A/T、-52A/G、-44C/G、-20A/G等5位点在两组患者中的等位基因和基因型,用遗传分析法计算其单倍型的分布频率,采用x2检验或Fisher精确概率法分析这些遗传变异与重症脓毒症患者真菌感染易感性的相关性,并以相对风险度(odds ratio,OR)反映该遗传因素与其关联的程度. 结果真菌感染组共纳入80例患者,对照组为131例.真菌感染组中男性43例(53.8%),年龄(60.81±18.30)岁;对照组男性80例(6J.1%),年龄(60.42±17.03)岁,两组间性别组成、平均年龄差异无统计学意义(P＞0.05).DEFB1基因-1816A/G、-390A/T、-52A/G、-44C/G和-20A/G位点在两组人群中都遵守Hardy-Weinberg平衡,其基因型分布和等位基因频率在真菌感染组和对照组之间差异均无统计学意义(P＞0.05).上述5个位点的常见单倍型AAACG、ATGCA、GTGGG和ATACG在真菌感染组和对照组之间的分布频率差异均无统计学意义(P＞0.05). 结论 DEFB1基因-1816A/G、-390A/T、-52A/G、-44C/G和-20A/G位点与重症脓毒症患者真菌感染的发生不相关,提示DEFB1基因遗传变异可能不是重症脓毒症患者真菌易感性的重要遗传学位点.     

E-钙黏蛋白和N-钙黏蛋白启动子的构建及活性测定

目的：构建含有E-钙黏蛋白（cadherin）基因和N-钙黏蛋白基因启动子的荧光素酶报告基因载体,并检测E-钙黏蛋白启动子和N-钙黏蛋白启动子的活性。方法利用PCR技术从乳腺癌细胞ZR75-1基因组中扩增出E-钙黏蛋白和N-钙黏蛋白启动子片段,插入到荧光素酶报告基因载体pGL4-basic中,确定所扩增的DNA序列后,将其转染至乳腺癌细胞ZR75-1和肝癌细胞HepG2中,检测启动子的活性。结果测序结果表明,扩增的E-钙黏蛋白启动子序列正确;荧光素酶活性实验表明,E-钙黏蛋白启动子和N-钙黏蛋白启动子在乳腺癌细胞ZR75-1和肝癌细胞HepG2中表达都具有活性。结论成功构建了E-钙黏蛋白启动子和N-钙黏蛋白启动子报告基因表达载体,为进一步筛选调节E-钙黏蛋白和N-钙黏蛋白表达的转录因子提供了重要基础。     

IL-10基因启动子-1082、-592、-819位点多态性与HBV易感性关系的荟萃分析

目的 调查白细胞介素10(IL-10)基因启动子区-1082、-592、-819位点多态性与乙型肝炎病毒(HBV) 感性的关系.方法 在CNKI,Medline,ISI等数据库中使用interleukin-10,polymorphism,hepatitis B virus以及相应的中文名等关键词进行检索,筛选1985年1月-2007年12月间发表的关于IL-10基因启动子多态性与HBV易感性关系的研究文献,最终纳入9篇文献,累计病例3 034例,对照1 289例.结果 -1082位点AA、AG基因型的存在与感染HBV无关联(P＞0.05),而存在GG基因型时不易感染HBV(P＜0.01);等位基因A、G的频率均与HBV感染无关联(P＞0.05).-592位点AA、AC、CC基因型的存在及等位基因A、C的频率均与HBV感染无关联(P＞0.05).-819位点TT基因型的存在与HBV感染无关联(P＞0.05),而TC基因型的存在可增加HBV感染的危险(P＜0.01),CC基因型的存在可降低HBV感染的危险(P＜0.01);等位基因T、C的频率与HBV感染无关联(P＞0.05).结论 IL-10启动子区-1082位点GG基因型、-819位点CC基因型的存在降低了HBV感染的风险,-819位点TC基因型的存在增加HBV感染的风险.其余各位点基因型的存在及各等位基因的频率与HBV感染风险均无关联.     

白细胞介素-6基因启动子多态性与子宫内膜异位症的相关性分析

目的 研究白细胞介素-6(IL-6)基因启动子-174G/C、-572C/G及-597G/A的多态性在子宫内膜异位症(EM)患者及非EM育龄女性(对照组)中的分布.方法 采用病例对照研究的方法 ,选取98例EM患者,其中轻、中、重型(即Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期)分别为22、35、41例,以99名非EM育龄女性外周血白细胞为对照,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术检测IL-6基因启动子-174、-572及-597的多态性,比较两组IL-6启动子基因型和等位基因的分布频率,对两组间基因多态性存在明显差异的基因位点进行组间比较.结果 IL-6基因启动子-174位点的GG、CG和CC基因型在EM组中分别为100%、0%、0%,在对照组中分别为98.99%、1.01%、0%,两组的分布频率差异无显著性;-572位点的CC、CG和GG基因型在EM组中分别为55.10%、42.86%、2.04%,在对照组中分别为70.71%、28.28%、1.01%,两组的基因分布频率差异有显著性;所有实验对象-597位点的基因型均为GG型,两组均无GA及AA基因型存在;-572位点的CC、CG和GG基因型在轻型EM组中分别为59.09%、40.90%、0%,在中型EM组中分别为54.29%、42.86%、2.85%,在重型EM组中分别为53.66%、43.90%、2.44%,轻、中、重组间基因型及等位基因分布频率无明显差异.结论 IL-6基因启动子的-174位点变异率极低,-597位点末发现变异,以上两位点基因变异与EM的发病无明显相关性;而启动子-572位点的多态性分布与EM的发病具有一定程度的相关性,但与疾病的严重程度无关.     

四川地区汉族人群A20基因启动子区SNP分布分析

目的 分析四川地区汉族人群A20基因启动子区SNP分布频率,为进一步研究A20基因地域、人种差异以及与疾病的关系调控奠定基础.方法 使用PCR-DNA测序法,对372例四川地区汉族人群A20基因启动子区所有SNP位点进行检测,计算各SNP的基因型频率及等位基因频率,并进行连锁不平衡分析.结果 在四川地区汉族人群中,发现rs59693083、rs5029924和rs139054966三个SNP位点,突变频率分别为12.81%、8.88%、0.67%,而且前两位点间存在明显的连锁不平衡,CA是最为常见的单体型模式.结论 四川地区汉族人群A20基因启动子区高度保守,SNP分布频率与北京汉族（CHB）人群相似,rs59693083和rs5029924可能是与疾病相关的位点.     

96例冠心病介入治疗患者ABCA1基因启动子区-477C/T单核苷酸多态性分析

目的研究ABCA1基因启动子区-477C／T单核苷酸多态性（SNP）与血浆高密度脂蛋白胆固醇（HDL-C）和冠心病的关系。方法用聚合酶链反应、限制性酶切法（PCR-RFLP）检测96例冠心病患者和100例正常人的ABCA1基因启动子区-477位点基因型,比较基因型在冠心病组与正常人组间、冠心病组中不同病变亚组之间分布的差异性及3种基因型与冠心病相关临床指标的关系。结果冠心病组与正常人组比较,3种基因型CC、CT、TT分布频率差异具有显著性。TT基因型、T等位基因在冠心病组中的分布频率明显高于对照组（P〈0．05、P〈0．01）。冠心病组中,急性冠脉综合征组TT基因型、T等位基因明显高于稳定性心绞痛组（P〈0．05、P〈0．01）,多支病变组TT基因型明显高于单支病变组（P〈0．05）,TT基因型血浆I-IDL-C水平明显低于CC基因型（P〈0．01）。结论ABCAl基因启动子区-477C／TSNP可显著影响中国冠心病者血浆HDL-C水平,而且与冠心病严重程度相关。     

TGF-β1基因-509C/T多态性与牙周炎相关性的Meta分析

目的 采用Meta分析的方法评价转化生长因子β1（transforming growth factor beta1,TGF-β1）基因-509C/T多态性与牙周炎的相关性.方法 计算机检索PubMed、EMbase、中国知网、万方和中国生物医学文献数据库,查找国内外公开发表的TGF-β1基因-509C/T多态性与牙周炎相关性的病例-对照研究,检索时限均为1990-01旬1至2013-08-08,并追溯纳入文献的参考文献,由2位评价员独立进行文献筛选、资料提取和质量评价后,采用Stata12.0软件进行Meta分析.结果 最终纳入4个病例-对照研究,包括牙周炎患者342例,对照组347例.Meta分析结果显示,各基因模型均无统计学意义.C/Tvs.C/C,OR=0.83,95％ CI =0.59-1.17,P=0.29;T/T vs.C/C,OR =0.66,95％ CI =0.29-1.50,P=0.32;（C/T＋ T/T）vs.C/C,OR =0.78,95％ CI=0.55-1.12,P=0.18;T/T vs.（C/T＋ C/C）,OR=0.75,95％CI=0.32-1.72,P=0.49;Tvs.C,OR=0.83,95％ CI =0.60-1.16,P=0.50.结论 TGF-β1基因-509C/T多态性可能与牙周炎发病无关.     

重性抑郁障碍患者与肿瘤坏死因子ɑ基因启动子区多态性的相关性研究

目的：探讨肿瘤坏死因子α（tumor necrosis factor,TNF－α）基因启动子区－308G／A、－857C／T位点多态性与重性抑郁障碍症发生的相关性。方法采用聚合酶链限制性片段长度多态性（ PCR－RFLP）分析方法检测393例重性抑郁障碍症患者和393名健康对照各个多态性位点的基因型,采用SPSS 13.0进行统计学分析。结果 TNF－α基因启动子－857 C／T位点的等位基因和基因型频率分布在正常对照组与重性抑郁障碍症组间存在统计学意义（ P＜0.05）。其中,男性重性抑郁障碍症组与对照组在－857 T的等位基因频率上存在显著差异（ OR＝0.31,95％CI：0.22－0.44,P＜0.01）,而女性病例组与对照组在－308 A位点的等位基因频率存在显著性差异（ OR＝0.40,95％CI：0.25－0.65,P＜0.01）。结论研究证实TNF－α基因启动子区多态性可能是中国北方汉族重性抑郁障碍患者的风险因素。 TNF－α基因启动子区多态性可能与重性抑郁障碍的发病存在关联。     

福建地区汉族人群骨保护素基因rs2073617T/C、rs2073618G/C多态性与急性冠脉综合征的相关性研究

目的 探讨骨保护素(OPG)基因启动子rs2073617T/C(950T/C)和第1外显子rs2073618G/C(1181G/C)位点基因多态性在福建地区汉族人群中的分布及其与急性冠脉综合征(ACS)的相关性.方法 纳入福建地区无血缘关系的汉族人720例作为研究对象,分为ACS组(n=360)和对照组(n=360),采用聚合酶链式反应－限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对OPG基因950T/C和1181G/C多态性位点进行基因型分型,同时采用DNA测序对酶切产物进行鉴定.结果 在福建地区汉族人群中,OPG基因950T/C多态性TC、TT、CC 3种基因型在ACS组和对照组中的频率分别为47.8％、26.7％、25.6％和43.3％、33.3％、23.3％;1181G/C多态性GG、GC、CC 3种基因型在ACS组和对照组中的频率分别为51.1％、40.0％、8.9％和60.0％、35.0％、5.0％.ACS组与对照组OPG基因950T/C、1181G/C基因型及等位基因频率分布进行比较均差异无统计学意义(P＞0.05).OPG基因950T/C、1181G/C在ACS组患者单支病变、双支病变及三支以上病变组之间比较差异无统计学意义(P＞0.05).结论 福建地区汉族人群OPG 950T/C、1181G/C位点基因多态性与ACS发生无相关性.     

端粒酶反转录酶启动子突变在放射性碘难治性甲状腺乳头状癌中的意义

目的:通过检测端粒酶反转录酶(TERT)启动子在放射性碘难治性甲状腺乳头状癌(RAIR-PTC)中的突变频率,探讨该基因突变对RAIR-PTC的摄碘特征及碘治疗疗效的影响。方法:对2005年1月至2020年6月在江苏省原子医学研究所附属江原医院进行放射性碘治疗的RAIR-PTC[37例,其中男15例,女22例,年龄(4...     

PLIN基因多态性在汉族肥胖儿童青少年中的分布及其与BMI的关系

目的:初步探讨PLIN基因多态性在中国汉族肥胖儿童青少年中的分布及其与BMI的关系。方法:通过健康体检筛选200名汉族肥胖儿童青少年,常规方法进行体格测量。利用PCR扩增及基因测序方法测定所有受试者DNA中PLIN基因多态性位点PLIN 6209T>C、PLIN 11482G>A和PLIN 14995A>T的基因型,并分析其与BMI的关系。结果:在所有受试者中,PLIN 6209T>C、PLIN11482G>A和PLIN 14995A>T多态性罕见等位基因的频率分别为0.613、0.348和0.335。PLIN6209T>C和PLIN 11482G>A强连锁不平衡(D’=0.923)。在男性受试者中,PLIN 11482G>A罕见基因的携带者(GA+AA)BMI显著高于常见基因GG的携带者(P<0.05);同时携带PLIN 6209T>C和PLIN 11482G>A罕见基因的男性受试者,即CA单倍型携带者BMI显著高于非CA携带者(P<0.05)。结论:PLIN基因多态性可能与中国肥胖儿童青少年的BMI有关,男性肥胖儿童青少年中,PLIN 11482G>A罕见基因携带者发生肥胖的风险可能高于GG基因携带者。     

IL-6基因启动子区-634C/G多态性与糖尿病视网膜病变的关系

目的 探讨白细胞介素-6（IL-6 gene,IL-6）基因启动子区-634C/G多态性与中国广东地区汉族人糖尿病（diabetes mellitus,DM）患者视网膜病变（diabetic retinopathy,DR）的关系。方法 在中国广东地区汉族人中,应用聚合酶链反应限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）方法,对245例2型糖尿病（T2DM）患者,其中正常眼底即DR0组153例,非增殖期视网膜病变即DR1组51例,增殖期视网膜病变即DR2组41例,和101例健康对照者（NC组）的IL-6基因启动子区-634C/G多态性进行了检测,并比较分析各组间基因型频率和等位基因频率以及相关临床资料。结果 （1）DR0、DR1、DR2三组间在年龄、性别、血压、体重指数、腰臀比、空腹血糖、餐后2 h血糖、糖化血红蛋白A1c、血脂等指标均无统计学差异,而病程在三组间差异具有统计学意义（F=19.05,P〈0.05）。（2）基因型GG在NC、DR0、DR1、DR2各组间差异有统计学意义（χ^2=20.839,P=0.002）,DR1、DR2组GG基因型明显高于DR0组,差异有统计学意义（χ^2=7.615,P=0.022）;等位基因G在NC、DR0、DR1、DR2各组间差异有统计学意义（χ^2=11.687,P=0.009）,但两组间比较差异无统计学意义。（3）Logistic回归分析表明,IL-6基因启动子区-634G/G基因型、病程及空腹血糖是DR发生的危险因素。结论 在中国广东地区汉族人中,IL-6基因启动子区-634 G/G基因型是DR的遗传危险因素。     

Interleukin-6 promoter genotype and restenosis after femoropopliteal balloon angioplasty: initial observations

PURPOSE: To investigate whether there is an association between a functional polymorphism in the interleukin (IL)-6 gene promoter (-174)G/C and restenosis after percutaneous transluminal angioplasty (PTA) of the femoropopliteal artery. MATERIALS AND METHODS: A total of 281 patients underwent PTA of the femoropopliteal artery during the study period; 23 (8%) patients had to be excluded due to missing genetic data. We studied 258 patients with intermittent claudication (n = 174) or critical limb ischemia (n = 84). The IL-6 promoter genotype was determined from venous blood samples before intervention by using a mutagenically separated polymerase chain reaction, and patients were followed up for 6 months with duplex ultrasonography for the occurrence of restenosis (> or =50%) after angioplasty. Multivariate Cox proportional hazards analysis was performed to assess the association between the IL-6 promoter genotype and restenosis, with adjustment for possible confounders such as atherosclerotic risk factors and angiographic covariates. RESULTS: The 6-month restenosis rate was 26% (23 of 90) in patients with the (-174)GG genotype, 28% (33 of 117) with the (-174)GC genotype, and 43% (22 of 51) with the (-174)CC genotype (P =.044). Homozygous carriers of the (-174)C allele ([-174]CC) exhibited a 2.42-fold increased adjusted risk for restenosis (95% CI: 1.28, 4.58; P =.007) compared with homozygous (-174)G allele carriers ([-174]GG). Heterozygous carriers ([-174]GC) had no significantly increased restenosis risk (hazard ratio, 1.37; 95% CI: 0.84, 2.22; P =.21). CONCLUSION: The IL-6 promoter polymorphism (-174)G/C seems to influence the occurrence of restenosis after PTA. Homozygous carriers of the (-174)C allele have an increased rate of intermediate-term restenosis.     

The C allele in NOS3 -786 T/C polymorphism is associated with elite soccer player's status

The NOS3-786 T/C polymorphism (rs2070744) is a candidate to explain individual variations in sports related phenotypes. We determined the genotype and allele frequency of NOS3-786 T/C in a group of 60 male professional elite soccer players. Their results were compared with those of 100 world-class endurance athletes, 53 elite power athletes, and 100 sedentary, healthy men (controls) of the same Caucasian (Spanish) origin. There were significant differences in genotype frequencies between soccer players, controls, endurance and power elite athletes (all P ≤ 0.02). These results were confirmed when we analysed allelic frequencies (all P<0.01). The likelihood of having the C allele was higher in soccer players compared with (i) controls [odds ratio (OR), 2.165, 95% confidence interval (CI): 1.362-3.441], (ii) endurance athletes (OR: 1.879, 95%CI: 1.184-2.984), and (iii) power athletes (OR: 4.032, 95%CI: 2.307-7.047). In conclusion, the -786C allele is associated with the status of being an elite soccer player, compared with non-athletic controls and also with elite endurance and power athletes. More research is needed in other groups of elite soccer players in order to replicate the results of the present study.