上海市沙门菌血清型流行特征

目的建立本市沙门菌数据库,初步了解本地区部分沙门菌血清型的流行特征。方法以1999-2007年于从业人员体检、食品、腹泻病人质控(QC)和沙门菌监测对象分离的1078株沙门菌的血清型进行回顾性分析;其中2006年和2007年按照全球沙门菌监测(GSS)方案进行连续性腹泻病例监测。结果血清型谱显示本市不同来源的沙门菌型在分布上存在优势交叉,GSS分离菌株中有7个型为国内首次报告;通过分子分型证明本市2006年的山夫登堡和2007年的汤卜逊病例分别属于2个和1个克隆型。结论肠炎、鼠伤寒仍是本市优势致泻性血清型,山夫登堡和汤卜逊病例符合沙门菌性相对散发和集中暴发的分子流行特征。加强对沙门菌综合监测和准确及时的血清、分子分型能力有助于检索和追溯流行菌型。     

多个地区不同来源山夫登堡沙门菌分子分型研究

目的研究不同地区、不同来源山夫登堡沙门菌之间的传播关系,并分析其耐药情况。方法对分离的70株山夫登堡沙门菌采用K-B纸片扩散法分析其耐药性,并通过脉冲场凝胶电泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis,PFGE)分子分型技术进行山夫登堡沙门菌的聚类分析。结果 70株山夫登堡沙门菌对于大多数抗生素耐药性较低,但是对于磺胺异噁唑,耐药和中介耐药的菌株达到了60%以上。同时还出现了3株对头孢噻呋耐药的菌株。PFGE结果分析显示70株山夫登堡沙门菌可分为42个不同的PFGE带型。北京市、上海市、南京市的部分菌株,有人、食品和环境3种不同来源,表现出完全相同的PFGE带型,亲缘关系十分密切。结论山夫登堡沙门菌具有遗传多态性,可能在环境、食品和人之间相互传播,应该加强监测,防止其进一步扩散。     

2014-2020年宁夏沙门菌分子分型与耐药性研究北大核心CSCD

目的分析2014-2020年宁夏食品及病例来源沙门菌耐药情况、流行优势血清型及PFGE型别。方法对2014-2020年各类食品及临床病例中分离培养的188株沙门菌进行血清分型、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型和肉汤稀释法药物敏感性实验。结果肠炎沙门菌在食品及病例中均为优势血清型,病例来源分离76株,占49.35%(76/154),食品来源分离18株,占52.94%(18/34),总构成比为50%(94/188)。188株不同来源沙门菌有182株出现不同程度的耐药,176株为多重耐药菌株。其中耐2~4种抗生素101株(55.49%),耐5~8种抗生素52株(28.57%),耐9~12种抗生素23株(6.59%)。将所有分离株经Xbal酶切,脉冲场凝胶电泳后,共获得93条PFGE带型,相似度为42.1%~97.1%,优势带型为NXSM0065型,其次为NXSM0074和NXSM0069,共41株,占所有分离株的21.81%。结论宁夏地区沙门菌流行优势血清型为肠炎沙门菌,病例及食品来源分离株耐药状况普遍较为严重,不同来源,同一血清型PFGE带型同源性较高,且与耐药谱未体现出明显的关联性。     

2015-2021年西安市腹泻患者沙门菌耐药性及分子分型研究

目的 分析2015-2021年西安市腹泻患者沙门菌分离株的血清型分布、耐药情况及分子分型特征，为沙门菌引起腹泻的防治提供科学依据。方法 对分离自2015-2021年西安市感染性腹泻病例的128株沙门菌进行血清学分型，采用微量肉汤稀释法和脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行菌株的药物敏感性测定和分子分型分析。结果 128株沙门菌分为23种血清型，优势血清型为沙门菌4,[5],12:i:-、肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌，占比分别为34.38%、21.88%和17.19%。111株菌(86.72%)对至少1种抗生素耐药，对氨苄西林耐药率最高为78.91%,其次为四环素(69.50%)、链霉素(67.19%)和萘啶酸(53.12%)。共检出41种耐药谱，菌株的耐药谱相对分散，最常见耐药谱为氨苄西林-四环素-链霉素。多重耐药率高达76.56%,沙门菌4,[5],12:i:-和鼠伤寒沙门菌多重耐药现象严重。PFGE聚类分析得到94种带型，相似度为56.8%～100.0%,共聚集形成13个簇。相同血清型菌株PFGE带型相似度较高，同一血清型带型相同或成簇的菌株耐药谱有较高的一致性。结论 西安市腹泻患者沙门菌血...     

深圳地区四家医院感染性腹泻来源沙门菌耐药性及分子分型研究

目的分析2012-2016年深圳地区感染性腹泻沙门菌耐药状况及分子型别特征,为沙门菌感染防控提供科学依据。方法收集深圳地区四家医院的137株沙门菌,传统血清学方法鉴定沙门菌血清型,微量肉汤稀释法测定菌株药物敏感性,脉冲场凝胶电泳(PFGE)对鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌作分子同源性分析。结果 137株沙门菌可分为30种菌型,鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌是本地优势菌型。菌株对链霉素、氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸钾耐药最为严重,对青霉素类、头孢类、氨基糖苷类、大环内酯类抗生素的耐药呈逐年增高的趋势。49株鼠伤寒沙门菌经脉冲场凝胶电泳可获得38种带型,相似度65.5%~100%,TY18为优势带型;27株肠炎沙门菌经脉冲场凝胶电泳可获得9种带型,相似度61.8%~100%,EN7为优势带型。结论感染性腹泻来源沙门菌耐药状况比较严重,菌株PFGE带型多样化,呈高度散发,部分带型与其耐药谱之间具有一定的聚集与关联性。     

汤卜逊沙门菌暴发分离株的鉴定及与丙型副伤寒沙门菌的鉴别

目的探讨丙型副伤寒、猪霍乱以及汤卜逊沙门菌的血清型鉴定要点,评价不同诊断血清的鉴定能力。方法用三家不同生产厂家的沙门菌诊断血清对丙型副伤寒、猪霍乱、猪霍乱库氏变种沙门菌三株标准株以及GSS中国区监测的疑似丙型副伤寒暴发分离株、猪霍乱和汤卜逊沙门菌进行血清鉴定,同时利用PCR、生化、以及MLST分型分析对这些菌株进行辅助分析。结果血清分型显示暴发菌株为汤卜逊沙门菌,那些原来鉴定为猪霍乱沙门菌的菌株也是汤卜逊沙门菌;PCR结果显示这些暴发菌株和散发菌株的Vi基因为阴性;还发现某些诊断血清的H:c因子血清能够与H:k抗原发生交叉凝集,从而导致血清型的误判;另外,MLST分型分析显示这些汤卜逊沙门菌菌株与丙型副伤寒、猪霍乱等沙门菌之间有差异;卫矛醇、粘液酸和H2S三种生化反应显示丙型副伤寒、猪霍乱、猪霍乱库氏变种沙门菌之间具有明显的生化差别。结论近期我国报告为丙型副伤寒的暴发中,需要鉴定是否为汤卜逊沙门菌所致,注意诊断血清的交叉反应所致的误判,可用生化鉴定、MLST分型分析以及PCR等方法进一步鉴定。     

2017-2021年辽宁省市售食品中沙门菌的血清型、分子分型及耐药性分析

目的 了解2017-2021年辽宁省市售食品中沙门菌的污染状况、血清型分布、PFGE分子分型特征及耐药特点,为沙门菌感染引起的疾病溯源工作提供科学依据。方法 依据GB4789.4-2016《食品安全国家标准食品微生物学检验沙门菌检验》检验方法对收集的样品进行检测及生化实验鉴定,采用玻片凝集法进行血清学实验,利用脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法对分离到的菌株进行分子分型,使用BioNumerics 7.6软件对PFGE图谱进行聚类分析,采用微量肉汤稀释法进行药物敏感性实验。结果 89株沙门菌包含32种血清型,以肠炎沙门菌为主;经XbaⅠ酶切分为81种带型,同源性为47.4%～100%。同一血清型菌株的PFGE带型相似度较高,且出现成簇现象。药物敏感性分析中,89株沙门菌对萘啶酸(NAL)的耐药率最高,为52.8%(47/89),共发现有35种多重耐药谱,多重耐药率为43.8%(39/89)。结论 辽宁省食品中沙门菌血清型呈现出多样化趋势,不常见血清型较多,PFGE指纹图谱呈多样性,整体耐药水平较高,多重耐药情况严重,应尽快建立高效的管控机制,加强耐药性监测,避免滥用抗生素。     

2011-2013年河南省鼠伤寒沙门菌耐药与分子分型研究

目的 分析2011-2013年河南省鼠伤寒沙门菌临床分离株的耐药状况与脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型带型,为以鼠伤寒沙门菌为代表的食源性疾病暴发预警、调查、溯源及公共卫生意义上的抗生素使用策略提供基线与参考数据。方法 根据国际PulseNet 细菌性传染病分子分型监测网络公布的沙门菌PFGE分型技术与美国临床与实验室标准协会(CLSI)沙门菌K-B法药敏测试方案,对2011-2013年分离自我省5个哨点医院的72株鼠伤寒沙门菌进行13种抗生素的药敏测试与PFGE分子分型分析。结果 72株沙门菌对8类13种抗生素均有不同程度的耐药,有65株为多重耐药菌株(90.3%),其中耐3~5种的为6株(8.3%),耐6~8种的为34株(47.2%),耐9~10种的为10株(13.9%)。72株鼠伤寒沙门菌经Xba Ⅰ酶切与脉冲场凝胶电泳后,获得45种带型,每种带型包含菌株数1~9株不等,相似度区间为65.6%~100%。结论 河南省临床分离的鼠伤寒沙门菌耐药状况普遍比较严重,PFGE带型呈现出多样性的同时又具有较显著的优势带型特点,部分带型与其对应的耐药谱具有一定的关联性与相同的聚集性。     

2010-2018年安徽省马鞍山市腹泻患者中非伤寒沙门菌的分子分型与耐药性研究

目的 了解马鞍山地区腹泻监测人群非伤寒沙门菌的感染状况、血清学分布、分子分型与耐药性等特征。方法 对2010-2018年腹泻患者中分离的非伤寒沙门菌进行血清学分型、脉冲场凝胶电泳(PFGE)和药物敏感性试验。结果 从2 998例腹泻患者中检出非伤寒沙门菌腹泻263例(8.8%),其中2例为2种非伤寒沙门菌混合感染;6-7月份非伤寒沙门菌感染率较高,05岁年龄组感染率最高(15.9%)(χ²=72.98,P<0.001);265株非伤寒沙门菌分为36个血清型,优势血清型为阿贡纳沙门菌、肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌;阿贡纳沙门菌的PFGE带型分布较集中,有菌株成簇存在的现象;测试菌株总耐药率为95.6%(66/69),多重耐药率为82.6%(57/69);测试菌株对AMP(79.7%)、STR(75.3%)和Sul(66.6%)耐药率较高,对AMI和AZI 完全敏感;发现2株ESBLs的菌株,均为多重耐药菌株;鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌对不同药物的敏感性有所不同,前者对喹诺酮类药物较敏感,而后者对四环素类药物较敏感。结论 马鞍山地区优势血清型为阿贡纳沙门菌,与其他地区不同。阿贡纳沙门菌有成簇存在的情况,提示有既往暴发的可能。总耐药及多重耐药现象严重,应谨慎用药并加强对病例的耐药监测。     

兰州地区腹泻患儿沙门菌耐药性与分子分型分析

目的 了解兰州地区腹泻患儿沙门菌的血清型分布特征,耐药状况及分子分型特征,为儿童沙门菌感染的防治提供依据。方法 2018-2020年收集兰州地区哨点医院腹泻患儿粪便标本中分离的149株沙门菌菌株进行血清学分型、药物敏感试验和脉冲场电泳分型。结果 腹泻患儿感染沙门菌以夏秋季为主,1~3岁幼儿居多,占59.73%。149株沙门菌分为33个血清型,其中肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为优势血清型,分别占30.87%和28.19%。沙门菌对氨苄西林耐药率最高为79.87%,多重耐药率为78.52%,其中鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌多重耐药率分别为80.95%、76.09%。经PFGE分子分型将肠炎沙门菌分为20个带型,包含2株及以上的带型有6种;鼠伤寒沙门菌分为30个带型,ST1带型包含2株菌。结论 兰州市腹泻患儿中沙门菌以非伤寒沙门菌为主,耐药率呈上升趋势,多重耐药严重,肠炎沙门菌PFGE分型同源性较高,鼠伤寒沙门菌带型呈多样性分布。     

脉冲场凝胶电泳在肠炎沙门菌食源性疾病溯源中的应用

目的对2006年广州地区食源性疾病中分离的肠炎沙门菌进行分子分型,探讨广州地区肠炎沙门菌的分子型别和多态性,为食源性疾病溯源及致病菌数据库的建立提供依据。方法采用限制性内切酶XbaI,对2006年分离到的菌株进行PFGE分子分型,使用BioNumericsVersion4.0软件(使用Dice系数和UPGMA法)对菌株进行聚类分析,并与深圳市的肠炎沙门菌PFGE型别进行比较。结果所有74株肠炎沙门菌均得到一致的PFGE克隆型,表明两次不同的食源性疾病均由同一PFGE型引起。广州与深圳的肠炎沙门菌PFGE图谱的比较表明,两地食源性疾病分离株具有很近的亲缘关系。结论PFGE分子分型与流行病学资料紧密结合可增强对肠炎沙门菌食源性疾病的溯源和预警。     

Multidrug-resistant strains of Salmonella enterica serotype typhi are genetically homogenous and coexist with antibiotic-sensitive strains as distinct, independent clones.

OBJECTIVE: The goal of this study was to report the molecular analysis of antibiotic-sensitive and multidrug-resistant (MDR) strains of Salmonella typhi, using pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), with a particular emphasis on the coexistence of these strains in a typhoid-endemic region of Karachi, Pakistan. METHODS: One hundred isolates of S. typhi in humans (50 MDR and 50 antibiotic-sensitive isolates) from sporadic cases of typhoid fever were analyzed by Vi-phage typing, antibiograms and PFGE. RESULTS: The MDR S. typhi strains were resistant to ampicillin, chloramphenicol, and trimethoprim-sulfamethoxazole. Analysis by PFGE showed that 50 MDR isolates of S. typhi had a single, homogenous PFGE profile, which was distinctly different from that of 50 antibiotic-sensitive isolates obtained in the same time frame from the same area. This latter group of isolates showed much greater diversity of PFGE profiles, as has been observed in other endemic regions. CONCLUSIONS: Multidrug-resistant and antibiotic-susceptible strains of S. typhi can coexist in endemic areas as epidemiologically independent pathogens and are not in competition for continued persistence and transmission.     

四川资阳地区健康猪2型猪链球菌分离与分子生物学特征分析

目的了解四川资阳地区健康猪携带猪链球菌状况及其主要毒力基因分布和药物敏感性,分析这些菌株与病人分离株的同源性,为疫情预测和制定防治措施提供依据。方法从屠宰场采集健康猪的咽拭子和扁桃体标本分离培养获得分离株,用API20 Strep进行生化鉴定、猪链球菌诊断血清进行血清分型;聚合酶链反应（PCR）检测猪链球菌种特异性基因（16SrDNA）和相关毒力基因;K—B纸片法进行药物敏感性分析;并用脉冲场凝胶电泳（PFGE）分析菌株的同源性。结果从健康猪分离到了12株猪链球菌,均为血清2型;菌株均具有cps2J、mrp、sty、ef和gapdh毒力基因;所有菌株抗药性一致;PFGE分析结果显示均为SinaI001型,与同期病人分离株带型一致。结论四川资阳地区健康楮携带的2型猪链球菌是高致病性菌株,与同期病人分离株具育一致的生物学特征,是引起猪或入发病的重要传染源;猪带菌率存在季节差异。     

江苏省三起甲型副伤寒爆发菌株与散发菌株的基因型及药物敏感性比较

目的 比较江苏省三地区连续发生的甲型副伤寒爆发与散发菌株在分子水平的联系,及其药物敏感性.方法 采用随机扩增多态性DNA(RAPD)分析方法,对爆发及散发菌株进行基因分型,采用K-B法对两类菌株进行药敏测定.结果 31株菌呈四个基因型图谱,爆发与散发菌株中基因Ⅰ型皆占优势,爆发株对链霉素、氨苄西林、头孢拉啶的耐药率从4.6%～25.9%.结论 RAPD方法能给予表型相同的甲型副伤寒菌株进行基因分型,基因Ⅰ型为江苏省甲型副伤寒的优势菌株.     

沙门氏菌CTX-M型超广谱β-内酰胺酶基因分型及变异研究

目的 通过对不同血清型中沙门氏菌中CTX-M型超广谱β-内酰胺酶分子基因型别、脉冲场凝胶电泳(PFGE)溯源分析及CTX-M氨基酸位点变异情况,研究CTX-M各型别流行特征及在超级耐药克隆中的作用。方法 对来源于江苏及周围地区的61株CTX-M阳性的肠炎沙门氏菌(S. enteritidis)、印第安纳沙门氏菌(S. indiana)、汤卜逊沙门氏菌(S. thompson)等进行CTX-M型别鉴定、PFGE分子分型、全基因测序对不同型别CTX-M氨基酸位点变异分析。 结果 61株菌株分为3个CTX-M群6个型。S. indiana含有6种CTX-M基因型,主要型别是CTX-M- 65和CTX-M- 55; S. enteritidis和S.thompson主要型分别为CTX-M- 55、CTX-M- 65。 PFGE聚类分型有19个型。A2型是携带CTX-M-55型S. enteritidis; B4、B8、B9型是携带CTX-M-55型或CTX-M-65型的S. indiana; D2为携带CTX-M-65型的S.thompson。CTX基因组序列分析显示,在CTX-M-1群、CTX-M-9群、CTX-M-64群易变化氨基酸位点分别是4、3、12个。结论 本地区主要CTX型别为CTX-M-55型或CTX-M-65型,S. indiana是CTX基因主要来源。位于质粒上的CTX-M基因复杂且多变是S. indiana超级耐药克隆形成并广泛流行重要原因之一。     

泰安市感染性腹泻非伤寒沙门菌耐药监测及分型研究

目的分离鉴定泰安市腹泻病沙门菌的血清型分布、耐药性及PFGE分子分型和同源性特点。方法对分离自泰安市腹泻病人的粪便标本中的31株沙门菌进行生化鉴定和血清分型,采用微量肉汤稀释法对其进行16种抗生素敏感试验,利用PFGE进行分子分型及聚类分析。结果 31株沙门菌分属于10种血清型,肠炎沙门菌占35.5%(11/31)为优势血清型;31株沙门菌对头孢西丁和亚胺培南100%敏感,对磺胺异唑的耐药率为77.42%(24/31);31株沙门菌按照100%的相似度可分为17个PFGE型。结论药敏显示所检测样本存在较为严重的多重耐药性,肠炎沙门菌遗传变异在该地区相对较为保守,且存在散发流行的可能,提示应做好肠炎沙门菌传染病的早期预警及防控。     

Molecular characterization of enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 isolates dispersed across Japan by pulsed-field gel electrophoresis and multiple-locus variable-number tandem repeat analysis

We identified seven distinct subtypes of enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157:H7 isolates that were derived from sporadic cases and outbreaks from multiple prefectures in Japan in 2005. A surveillance system utilizing pulsed-field gel electrophoresis (PFGE), PulseNet Japan, was used. Some strains showed indistinguishable PFGE patterns using another restriction enzyme (BlnI or SpeI) in each subtype of EHEC O157:H7 isolates that were routinely subtyped by the XbaI PFGE pattern. In order to examine the genotypic relatedness of these strains, we carried out a multiple-locus variable-number tandem repeat (VNTR) analysis (MLVA). By using the MLVA system, we found that three of seven subtypes of EHEC O157:H7 strains that were isolated from sporadic cases dispersed across multiple prefectures within a few months showed indistinguishable PFGE patterns and identical MLVA types. Strains belonging to the other four subtypes of EHEC O157:H7 in the PFGE analysis were further classified into different clusters of EHEC O157:H7. Therefore, compared to PFGE, MLVA showed greater discriminatory power with respect to analysis of the isolates in this study.