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1.
目的 了解广州地区肝炎患者中庚型肝炎病毒(HGV)的感染情况及基因型特点。方法 采用逆转录-套式聚合酶链反应(RT-nested PCR)方法检测出肝炎患者血清中HGV RNA,引物位于HGV基因组的非编码区,并对扩增产物进行直接测序。结果 251例急慢性肝炎血清中共检出25例HGV RNA阳性,总阳性率为9.96%,其中56例非甲-戊型肝炎中要出4例阳性(7.14%),77例乙型肝炎(HB)中检出8例阳性(10.39%),118例丙型肝炎(HC)中检出13例阳性(11.17%);2株HGV广州核苷酸之间的同源性为98.0%,与非洲洲的同源性分别为81.7%和84.2%,与美国株的同源性均为91.1%。结论 广州地区肝炎患者中存在HGV感染,2株HGV广州株可能为同一基因型,且与HGV美国株具有较高的同源性。 相似文献
2.
目的 研究中国庚型肝炎患者分离的病毒基因的特异性及变异规律。方法 应用逆转录-巢式聚合酶链反应(PCR)技术从16例庚型肝炎病毒(HGV)感染住院病人血清中扩增了HGVNS5区部分基因片段。经纯化后采用双脱氧链末端终止法进行序列分析。 相似文献
3.
广东地区肝炎患者血清中庚型肝炎病毒RNA的检测 总被引:1,自引:0,他引:1
目的了解庚型肝炎病毒(HGV)感染在不同临床类型肝炎患者中的存在状况。方法用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术对721例肝炎患者血清进行了HGVRNA检测。结果发现80例HGVRNA阳性,以非甲、乙、丙、丁或戊型肝炎中阳性率为高;慢性丙型肝炎(HCV)和慢性乙型混合丙型肝炎(HBV+HCV)次之;在慢性重型肝炎和肝硬化时较低。结论庚型肝炎病毒在广东地区现症肝炎患者中有一定程度的流行 相似文献
4.
庚型肝炎病毒(HGV/GBV—C)NS3区基因序列的多变性 总被引:8,自引:2,他引:6
用RT-PCR方法从非甲、乙、丙、丁、戊型肝炎病人血清中检测庚型肝炎病毒。采用56个循环周期的减温PCR方法对NS3区基因进行扩增,并对阳性PCR产物进行了克隆、测序。在NS3区,HGV与样品之间核苷酸的同源性在82.0%~91.4%之间;而GBV-C与样品之间的同源性为78.4%~84.2%之间。NS3区变异较大,这种变异可能与HCV的基因变异的趋势相类似。 相似文献
5.
利多组套式引物的测庚型肝炎病毒RNA 总被引:3,自引:0,他引:3
利用庚型肝炎病毒NS3-5区序列合成了四组套式引物,建立了灵敏,特异的 型肝炎病毒RNA双扩增聚合酶链反应检测方法,用此方法检测了10份庚型肝炎病毒抗体阳性患者血清及10份阴性的健康人血清。前者不同组引物的检出率为NS3(1)引物9份了是性,NS3(2)引物8份阳性,NS4引物4份阳性,NS5(1)引物5份阳性,NS5(2)引物9份阳性;后者各组引物匀为阴性。结果表明,庚型肝炎病毒不同区域引物用于 相似文献
6.
庚型肝炎病毒5‘非编码区基因分析及基因型的初步划分 总被引:4,自引:0,他引:4
为了分析我国庚型肝炎病毒(HGV)的基因结构特点,对2名个体供血者、2例慢性肝炎患者及2例肝硬化患者的血清标本进行了庚型肝炎病毒基因组5’非编码区277个核苷酸的基因扩增、分子克隆和序列分析,并利用基因分析软件处理结果。结果表明,分离出的6株HGV5’非编码区基因序列(G001~G006)之间同源性在96.2%以上。而与国外报道的3株HGV序列比较同源性在86.9%~91.6%。通过对6株HGV(G001~G006)及国外报道的3株HGV基因序列变异性的比较,将HGV基因型初步划分为不同的3个组。结果提示我国HGV株5’非编码区序列有较高的同源性,而与国外报道的有较大差异,但不同毒株在此区域均可能形成稳定而相似的二级结构模式。 相似文献
7.
庚型肝炎病毒NS3蛋白大肠杆菌中的表达 总被引:2,自引:0,他引:2
目的 获取具备免疫反应原性的庚型肝炎病毒NS3抗原。方法 从重组质粒Iwq2利用反应扩增出GBV-C/HGV NS3基因片段,克隆至表达载体pPROEX HTa后进行核苷酸序列测定,待鉴定正确后经IPTG诱导重组工程菌,用SDS-PAGE和Western blot对重组蛋白进行鉴定。结果 酶切鉴定和核苷酸序列测定结果表明成功地构建了重组工程菌pHTNS3/DH5α且克隆的基因片段为GBV-C/HG 相似文献
8.
目的 表达庚型肝炎病毒(HGV)基因且NS5区部分基因重组抗原,分析其抗原性。方法 分别亚克隆了HGV NS5a、NS5b以及NS5b与C区嵌和的基因至pThoiC表达载体上,构建成3个重组表达质粒,分别大肠埃希菌JM109(DE3),用IPTG诱导表达重组蛋白。表达产物经纯化后采用Western blot和间接ELISA方法分析3个重组蛋白的抗原性。结果 经酶切和序列分析鉴定正确,3种表达蛋白均高效表达且相对分子质量与预期大小相符。Western blot分析和间接ELISA试验表明,3种表达蛋白均能与抗-HGV阳性血清发生特异性反应。将应用重组蛋白检测的抗-HGV抗体与混合重组抗原(包括C区合成肽、NS5a合成肽、NS3区基因重组抗原)的检测结果进行了比较,在混合重组抗原阳性的22份血清中,P5a检出率为68%(15/22),P5b检出率为91%(20/22),Pc-5b检出率为73%(16/22)。在70份阴性标本中,3种抗原的检出率分别为P5a:7%(5/70);P5b:1%(1/70);Pc-5b:6%(4/70)。3个重组抗原单独检出阳性的标本,其中有一部分经RT-PCR检测亦为阳性。结论 原核表达的NS5区蛋白所检测的抗-HGV抗体不能完全被其他区段的抗原所覆盖,是免疫诊断HGV感染所必需的抗原表位之一。 相似文献
9.
庚型肝炎病毒NS3蛋白在大肠杆菌中的表达 总被引:4,自引:0,他引:4
目的 获取具备免疫反应原性的庚型肝炎病毒NS3 抗原。方法 从重组质粒Iwq2利用PCR 反应扩增出GBVC/HGV NS3 基因片段,克隆至表达载体pPROEX HTa 后进行核苷酸序列测定,待鉴定正确后经IPTG 诱导重组工程菌,用SDSPAGE 和Western blot 对重组蛋白进行鉴定。结果 酶切鉴定和核苷酸序列测定结果表明成功地构建了重组工程菌pHTNS3/ DH5α且克隆的基因片段为GBVC/HGV NS3 基因片段。SDSPAGE 分析诱导表达产物发现在相对分子质量约43 810处有一条明显的蛋白表达带,占菌体总量的17 .7 % 。用NiNTA 亲和层析柱快捷地获得了纯化的重组蛋白。Western blot 鉴定发现重组蛋白可与GBVC/HGV RNA 阳性病人血清发生抗原抗体反应。结论 获得了具备免疫反应原性的GBVC/HGV NS3 抗原,该重组蛋白可用于GBVC/HGV 感染的检测。 相似文献
10.
庚型肝炎病毒(GBVCHGV)是近年发现的疑似致人类肝炎的新型单股正链RNA病毒,发病呈全球性分布,在人群中有一定的感染率。目前诊断主要以逆转录聚合酶链反应(RTPCR)为主,有必要研制特异的抗GBVCHGV抗体诊断试剂。杆状病毒的多角体蛋白基因编码表达的蛋白,占感染细胞蛋白总量的比例较高,可使外源基因得到高效表达。由于昆虫细胞能够识别并正确进行诸如信号肽切除、磷酸化、糖基化等蛋白质表达后加工修饰,使得表达的蛋白接近天然蛋白,具有很高的生物活性。BactoBac表达系统表达含有6… 相似文献
11.
目的探讨临床肝病病人中庚型肝炎病毒(GBV-C/HGV)感染情况及临床特点。方法应用庚型肝炎病毒基因组5’UTR两对寡核苷酸作为引物,建立逆转录套式聚合酶链反应,检测169例不同肝病患者血清标本中GBV-C/HGVRNA,并对其中1例PCR扩增产物进行克隆及测序。结果169例各型肝病病人GBV-C/HGVRNA总的检出率为95%(16/169)。在29例有手术输血史患者中,310%(9/29)GBV-C/HGVRNA呈阳性,明显高于无手术输血史组(5%,P<001)。序列分析显示1株庚肝病毒5’UTR部分基因片段与已知庚肝病毒株核苷酸同源性在8914%~9891%之间。结论GBV-C/HGV感染普遍存在于临床肝病患者中,病人感染GBV-C/HGV的临床表现未发现有特殊性,GBV-C/HGV可能不是非甲~戊型肝炎的主要致病因子。 相似文献
12.
简并引物在扩增GBV-C/HGV NS3高度变异区的应用 总被引:2,自引:0,他引:2
目的试图比较简并引物扩增GBV-C/HGVNS3变异较大的区域的作用。方法设计了简并引物和减温(touchdown)PCR扩增程序以对目的基因进行扩增,并对阳性PCR产物进行克隆及测序。结果该方法能够检测基因变异约达21%的区域。结论提示该法是一项有效的了解基因家系的技术。 相似文献
13.
丙型肝炎病毒E2/NS1区基因cDNA的克隆及序列分析 总被引:1,自引:0,他引:1
从北京地区1份丙型肝炎病毒(HCV)感染者血清中提取RNA,经逆转录和套式聚合酶链反应扩增HCVE2/NS1区基因约930bp,将其插入至pGEM-T质粒载体中,利用双脱氧链末端终止法测出该基因5’端431bp的核苷酸序列,将此序列与其它9个HCV分离株的相应序列进行比较分析,结果表明,此序列与HCVⅡ型序列同源性较高,核苷酸水平同源性在80%以上。由其编码的HCV外膜蛋白N端存在两个高变部位(HVR),在HVR内、外具有几个保守氨基酸残基和氨基酸区域,它们与外膜蛋白空间构型的维持有关。 相似文献
14.
华南地区HGV的流行状况和同源性分析 总被引:2,自引:0,他引:2
目的了解华南地区庚型肝炎病毒(HGV)的流行状况及HGV不同株和不同基因区的同源性。方法采用逆转录聚合酶链反应技术(RT-PCR)检测来自广东、香港、云南的不同人群血清标本共1991份。对其中20份的5端非编码区(5UTR)238bp和3份非结构蛋白5区(NS5)621bp进行了序列测定和同源性分析。结果一般人群HGVRNA阳性率为(0.73~1.34)%,献血员(2.52~2.90)%,静脉吸毒者17.86%,血液透析患者14.13%,接受骨髓移植者41.67%,在非甲~戊型肝炎病人为25.30%,肝细胞癌14.48%,乙型肝炎7.22%,丙型肝炎(8.33~16.13)%。不同株5UTR同源性介乎(90.40~100)%;不同株NS5区核苷酸同源性(93.30~94.00)%,氨基酸为(97~99.2)%。结论接受骨髓移植、血液透析、静脉吸毒者,乙型、丙型、非甲~戊型肝炎病人及肝细胞癌患者是HGV的高感染人群。不同HGV株存在一定的地区性差异;同一地区不同人群的HGV株变异不明显;序列中存在高度保守区及较大变异区 相似文献
15.
中国南京庚型肝炎病毒部分基因的克隆及cDNA序列分析 总被引:5,自引:0,他引:5
采用反转录聚合酶链反应(RTPCR)从南京地区某输血后丙型肝炎患者血清中克隆出庚型肝炎病毒(HGV)非结构区部分基因。序列分析结果表明:该序列与国外发表的庚型肝炎病毒HGU44402,HGU45966,HGU36380(GBVC)对应位置核苷酸序列同源性分别为8909%,9212%,8727%,与已报道的HGV河北株序列同源性为9394%。对40份输血后丙型肝炎血清和30份非甲非乙非丙非丁非戊型肝炎血清进行了检测,HGVRNA阳性率分别为1000%和667%。 相似文献
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三株克里米亚-刚果出血热病毒中国分离株糖蛋白基因的全序列测定与比较分析 总被引:7,自引:1,他引:7
目的 测定克里米亚-刚果出血热病毒(CCHFV)中国分离株(即新疆出血热病毒,XH-FV)BA66019、BA8402及BA88166糖蛋白(M)基因的全部序列并分析各毒株之间的相互关系。方法 病毒RNA在只与其末端互补的特异引物PCM-Tag和随机引物的共同引发下逆转录成cDNA,以单一PCM-Tag和高保守末端互补的特异引物PCM-Tag和高保真DNA聚合酶扩增出完整的M基因。扩增产物纯化后作为模板进行序列测定,并将所得序列经计算机辅助分析其种系发生与编码策略。结果 XHFV代表株BA6019的M基因与国际原型株IbAr10200的M基因比较多个5个碱基,为5365bp;比BA8402、BA88166多个4个碱基,即5364bp。3株XHFV长ORF起始于M基因的第78位碱基,比IbAr10200株提前15bp。编码的前体蛋白共1689个氨基酸,比IbAr10200株多6个。4株病毒之间核苷酸序列的同源性分别为:80.9%(IbAr10200-BA66019),80.2%(IbAr10200-BA8402),80.2%(IbAr10200-BA88166),83.7%(BA66019-BA8402),83.6%(BA66019-BA88166),99.0%(BA8402-BA88166);对应的氨基酸序列的同源性分别为85.1%,86.3%,86.6%,87.8%,88.0%,98.8%。它们与Dugbe病毒在核苷酸和氨基酸的同源性较低,大约是55%和37.7%。结论 XHFV BA66019、BA8402和BA88166与国际原型株IbAr10200的M基因在进化上形成各自单独的分支,人源分离株BA88166可能是来自蜱的BA8402株的变异株,提示20世纪80年代在新疆疫区可能只流行一种XHFV。 相似文献
17.
目的 关于HGV/BGV-C组织亲和性的研究尚无结论性资料。我们研究了HGV/GBV-C与HCV混合感染者PBMC和肝脏中HGV/GBV-C复制中间体(负链RNA)的存在状况。方法 应用逆转录-巢式PCR技术,检测了32例肝炎患者HGV/GBV-C和HVC正、负链RNA。结果 有26例HGV/GBV-C与HCV混合感染者PBMC和肝脏中均未检测到HGV/GBV-C负链RNA;而在9份PBMC和15 相似文献
18.
贵州地区不同人群TTV核酸检测及部分核苷酸序列分析 总被引:3,自引:0,他引:3
目的 了解贵州地区TTV感染状况,分析TTV贵州株的基因特点。方法 以公布的TTV第1读码区序列设计两对寡核苷酸引物,用套式聚合酶链反应法(nested—PCR)检测贵州地区不同人群血清中TTV核酸(TTV DNA),并对3份TTV DNA阳性血清的PcR产物,用直接测序法测定核苷酸序列。结果 62例正常人,37例志愿献血员,50例血液透析患者,107例静脉药瘾者及139例肝病患者血清中TTV DNA阳性率分别为6.45%(4/62),8.1%(3/37),26.0%(13/50),25.23%(27/107)和16.55%(23/139)。在肝病组中,重型肝炎、肝硬化、肝癌患者的TTV DNA阳性率分别为35.71%(5/14),14.15%(15/106)和15.79(3/19)。测定的282个核苷酸中,3株贵州株的同源性均高于99%,与日本株N22相比,同源性都为98%。结论 贵州存在TTV感染,血透患者中有较高的TTV感染率,TTV可能是重型肝炎的病原因子,3株贵州株可能为同一基因型。 相似文献