西藏自治区鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌最低抑菌浓度的测定及研究

目的 根据美国临床和实验室标准协会(CLSI)药敏试验方法中的琼脂平板稀释法，对分离自西藏自治区鼠疫自然疫源地内的164株鼠疫耶尔森菌进行抗菌药物最低抑菌浓度的测定，监测西藏地区耐药鼠疫耶尔森菌株，掌握其抑菌范围，为鼠疫的临床治疗提供基础数据。方法 利用琼脂平板稀释法分别测定氧氟沙星、环丙沙星、复方磺胺甲恶唑(甲氧苄啶-磺胺甲恶唑)、硫酸卡那霉素、链霉素、头孢曲松钠、氨苄青霉素钠、氯霉素、盐酸壮观霉素、头孢呋辛钠、盐酸四环素、莫西沙星共12种抗生素对164株鼠疫耶尔森菌的最低抑菌浓度(MIC)。若发现耐药菌株，则用K-B法进行验证。结果 所测的164株鼠疫耶尔森菌中有1株对链霉素具有耐药性(MIC=4096 μg/mL)，链霉素K-B法检测抑菌环直径为0，这株菌对其余11种抗菌药物均敏感。其余163株菌对12种抗生素均敏感。结论 发现1株鼠疫耶尔森菌对链霉素具有耐药性，这是我国首次发现鼠疫耶尔森菌对链霉素耐药。因链霉素是国内外治疗鼠疫的首选药物，耐药鼠疫耶尔森菌会引起链霉素治疗失败，从临床和公共卫生的角度来看，对鼠疫耶尔森菌分离株的抗菌敏感性监测应常规开展。     

实时荧光定量PCR检测ESBLs基因型方法的研究

目的:建立一种快速检测革兰阴性杆菌产超广谱β内酰胺酶(ESBLs )耐药基因分型的SYBR GREEN Ⅰ实时荧光定量PCR方法.方法:针对临床常见ESBLs的耐药基因SHV、TEM、 CTX-M、OXA及其同源性分析,设计了SHV、TEM 、CTX-M-1、CTX-M-2、CTX-M-8、CTX-M-9、OXA-1、OXA-2及OXA-10 共9对特异性引物,煮沸法提取DNA模板,建立并优化SYBR GREEN I实时荧光定量PCR反应体系,并对其精密度、线性范围进行测定.利用建立方法对51株表型阴性的多重耐药的大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌进行ESBLs耐药基因检测,并与改良三维实验进行对比.结果:从39株ESBLs表型阳性菌株及51株ESBLs表型阴性多重耐药菌株中扩增出除OXA-2外共8种耐药基因型并经测序证实.线性检测范围3×10~3~3×10~8拷贝/mL , r ＝ -0.994 7 ;批间重复性试验变异系数(CV)为9.6%.荧光定量PCR方法与改良三维实验方法比较差异无统计学意义( χ2 = 1.125,P > 0.05).结论:SYBR GREEN Ⅰ实时荧光定量PCR检测ESBLs的耐药基因具有特异性强、灵敏度高、快速、简便的特点,适于临床监测革兰阴性杆菌产ESBLs 基因型.     

耐亚胺培南的肺炎克雷伯菌中碳青霉烯酶的表达情况

目的 检测临床分离的耐亚胺培南肺炎克雷伯菌临床分布、耐药情况及碳青霉烯酶的表达情况,为临床合理使用抗生素提供依据。方法 收集徐州3家三级医院微生物室培养出的非重复肺炎克雷伯菌,并根据药敏结果筛选对亚胺培南耐药的菌株,对耐药菌株采用改良Hodge实验检测碳青霉烯酶、IPM/EDTA组合纸片法检测金属酶表现型,采用PCR实验检测耐药菌株中blaKPC-2,blaCTX-M-15,blaVIM-1,blaIMP-4,blaNDM-1和blaOXA-48的表达情况。结果 共收集107株非重复肺炎克雷伯菌,其中26株耐亚胺培南,耐亚胺培南菌株均为多重耐药菌株,对常见抗菌药物均为耐药;表现型结果26株耐亚胺培南菌株有23株改良Hodge实验阳性,阳性率为88.5%;6株组合纸片法阳性,阳性率为23.1%;PCR扩增具有碳青霉烯酶活性的相关基因：26株均检测到KPC-2酶基因,25株检测到CTX-M-15酶基因,8株检测到IMP-4酶基因,1株检测到NDM-1酶基因,1株检测到VIM-1酶基因,暂未扩增出OXA-48酶基因。结论 本地区肺炎克雷伯菌耐亚胺培南形势严峻,产生β-内酰胺酶为其主要的耐药机制,KPC-2、CTX-M-15产生率较高,占主导地位,已经存在产NDM-1菌株,相关部门应注意预防其流行和传播。     

二重实时PCR快速检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌

目的 建立二重实时聚合酶链反应（duplexreal-timePCR）快速检测耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）。方法 采用二重SYBR Green实时PCR快速检测MRSA的决定基因mecA和金葡菌的种特异性基因nuc，经熔解曲线分析鉴定产物。结果 所有MRSA菌株的熔解曲线均呈现mecA、nuc基因特异性的峰，甲氧西林敏感的金葡菌仅有nuc峰，耐甲氧西林的表葡菌仅有mecA峰，甲氧西林敏感的表葡菌与其他菌种的菌株无特异峰出现；当MRSA菌浓度达10^2cfu／ml时就可检出。在131株金葡菌中，30．53％（40／131）耐药；二重实时PCR扩增mecA基因29．01％（38／131）阳性，nuc基因100％阳性。单引物与二重实时PCR两者阳性扩增符合率为100％。结论 对mecA、nuc基因进行二重实时PCR能准确、快速地鉴定耐甲氧西林的金葡菌和凝固酶阴性的葡萄球菌。     

TaqMan MGB探针法实时荧光定量PCR快速检测支原体的研究

目的:建立特异、敏感、快速检测支原体的TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR方法。方法:针对支原体16S rRNA基因的保守区设计特异性引物和探针,建立支原体TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR方检测方法,验证方法的特异性、敏感性和稳定性。对2008～2010年期间在北京采集的680份小型猪、小鼠、大鼠样本中的支原体进行检测,同时进行分离培养和常规PCR检测。结果:建立的TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR方法对支原体的检测具有高度的特异性,对空肠弯曲菌、支气管鲍特杆菌、肺炎克雷伯杆菌、侵肺巴斯德氏菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、肺炎链球菌、乙型溶血性链球菌均无交叉反应,检测的灵敏度达9.2拷贝。标准曲线显示各浓度范围内具有良好的线性关系,相关系数为0.999,斜率为-3.328,TaqManMGB探针实时荧光定量PCR效率为100%。对680份动物样本进行检测,结果TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR和常规PCR均能检出77份支原体阳性样本,但分离培养未能检出支原体阳性样本。结果显示,建立的TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR方法比细菌分离培养方法更敏感,能够直接从动物样本中检出支...     

铜绿假单胞菌耐亚胺培南相关基因OprD2研究

目的研究铜绿假单胞菌对亚胺培南的耐药机制。 方法取临床分离的铜绿假单胞菌18株，经K-B法检测耐药性，根据耐药性分为耐亚胺培南菌组12株和敏感菌组6株。另设1标准菌株ATCC27853。采用PCR法检测各菌株的OprD2基因，探讨OprD2基因突变与细菌对亚胺培南耐药之间的关系。结果12株耐药菌经OprD2基因扩增，8株阴性，4株阳性；6株敏感菌株及标准菌株扩增全部为阳性。统计学检验结果表明，对亚胺培南耐药菌组和敏感菌组OprD2基因阳性率的差异有极显著性（P＜0.01），且在耐药菌中发现了新的OprD2基因突变方式。 结论OprD2突变是铜绿假单胞菌对亚胺培南耐药的重要机制，突变的方式有缺失突变与插入失活。     

亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌由插入序列ISAba1点突变引起的bla_(OXA-23)表达减低

目的研究临床分离的8株亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌中,与插入序列相关的blaOXA-23 mRNA的表达情况。方法应用双纸片增效法进行金属酶表型筛查并以PCR的方法扩增blaIMP-1、blaIMP-2、blaVIM-2和blaOXA-23 4种β-内酰胺酶基因;实时荧光PCR检测blaOXA-23 mRNA表达量,并以PCR的方法扩增插入序列ISAba1并测序。结果 4株菌金属酶表型筛查为阳性结果,PCR检测8株菌blaOXA-23阳性,2株blaIMP-1阳性、3株blaIMP-2阳性、blaVIM-2基因均为阴性;所有菌株均存在插入序列ISAba1,实时荧光PCR检测显示1株菌blaOXA-23 mRNA表达升高,其余7株菌与对照株比较为表达减低或相近,且这7株菌的插入序列存在点突变现象。结论插入序列ISAba1点突变是引起blaOXA-23碳青霉稀酶活性减低的主要原因。     

亚胺培南耐药鲍曼不动杆菌由插入序列ISAbal点突变引起的blaOXA-23表达减低

目的 研究临床分离的8株哑胺培南耐药鲍曼不动杆菌中,与插入序列相关的blaOXA-23mRNA的表达情况.方法 应用双纸片增效法进行金属酶表型筛查并以PCR的方法扩增blaIMP-1、blaIMP-2、blaVIM-2和blaOXA-234种β-内酰胺酶基因;实时荧光PCR榆测blaOXA-23mRNA表达黾,并以PCR的方法扩增插入序ISAbal并测序.结果 4株菌金属酶表型筛查为阳性结果,PCR检测8株菌blaOXA-23阳性,2株blaIMP-1阳性、3株blaIMP-2阳性、blaVIM-2基因均为阴性;所有菌株均存在插入序列ISAbal,实时荧光PCR检测显示1株菌blaOXA-23mRNA表达升高,其余7株菌与对照株比较为表达减低或相近,且这7株菌的插入序列存在点突变现象.结论 插入序列ISAbal点突变是引起blaOXA-23碳青霉稀酶活性减低的主要原因.     

多重PCR技术检测沙门菌两种四环素耐药基因

应用两对特异性引物同时检测四环素耐药基因tetB和tetC通过对35株沙门菌分离株的四环素耐药性检测，表明所有沙门菌分离株均含tetC基因，与药敏试验结果阳性符合率65．7％，8株同时含有tetB基因，与药敏试验结果阳性符合率100％，tetB基因和tetC基因双阳性的菌株与药敏试验结果阳性符合率也为100％。取其中部分菌株扩增出tetB和tetC基因片段进行序列分析，5株菌的tetB基因扩增产物序列完全相同，与质粒pRT11相应序列同源性达99．7％；14株菌的tetC基因扩增产物与质粒pBR322中的相应序列同源性为100％。证实沙门菌耐药基因普遍存在，且同时含有tetB和tetC基因的菌株表现耐药。多重PCR技术同时检测两种四环素耐药基因，适合大量样本的检测，对开展沙门菌四环素多种耐药基因的分子流行病学监测提供了有效途径。     

耐亚胺培南的铜绿假单胞菌整合子基因研究

目的通过分析耐亚胺培南的铜绿假单胞菌的整合子所携带的耐药基因的种类及特点，探讨其耐药机制，为指导临床用药，预防院内感染和流行病学调查、新药的研发提供参考。方法根据美国国家临床标准化研究所（CLSI／NCCLS）2004年标准，应用纸片扩散法（KB）进行药敏试验，采用多重PCR方法对临床分离的23株耐亚胺培南的铜绿假单胞菌进行整合酶（IntI）检测，并分析整合酶阳性菌株的耐药基因盒。结果药敏试验显示23株耐亚胺培南的铜绿假单胞菌全部为泛耐株，5株为Ⅰ类整合酶阳性，其中3株为缺失型，无耐药基因盒，其余2株耐药基因为blaVIM4和blaPSE-1；14株为Ⅱ类整合酶阳性，其耐药基因盒均为dfr1-sat1-aadA1；3株Ⅰ、Ⅱ类整合酶均为阳性；7株不含Ⅰ、Ⅱ类整合酶。结论耐亚胺培南的铜绿假单胞菌大多都具备Ⅰ、Ⅱ类整合酶基因和基因盒，这是造成它们成为泛耐株的重要耐药机制。     

杭州地区结核分枝杆菌链霉素耐药相关基因rpsL和rrs突变分析

目的 分析杭州地区结核分枝杆菌链霉素耐药相关基因核糖体蛋白S12编码基因(rpsL)和16S rRNA编码基因(rrs)的突变情况.方法 采用比例法对杭州地区74株结核分支杆菌临床分离株进行药敏试验;设计特异性引物,对目的基因片段rpsL和rrs进行扩增、克隆后测序分析.结果 74株结核分枝杆菌中有31株耐链霉素表型阳性,耐药率41.9％.31株耐药株中,20株rpsL 43(AAG→AGG)位点发生突变,占总耐药菌株的64.5％;2株rpsL 88 (AAG→AGG)位点发生突变,占总耐药菌株的6.5％;2株两个位点同时发生突变者占总耐药菌株的6.5％.43株链霉素敏感结核分支杆菌中未见rpsL和rrs基因发生突变、插入或缺失.结论 杭州地区结核分支杆菌耐链霉素主要由rpsL基因突变引起.其中,rpsL 43 (AAG→AGG)位点突变占绝大部分.     

鲍曼不动杆菌8种RND外排泵介导替加环素耐药表型的研究

目的 探讨鲍曼不动杆菌中8种RND外排泵基因的分布与替加环素耐药表型间的关系。方法 微量肉汤稀释法检测120株鲍曼不动杆菌对替加环素的耐药性,PCR扩增8种外排泵及调控基因。琼脂二倍稀释法测定替加环素耐药菌株对18种抗菌药物的最低抑菌浓度(minimal inhibitory concentration, MIC),利用5种外排泵抑制判定外排泵表型。采用实时荧光定量PCR检测外排泵基因的表达水平。结果 筛选出替加环素耐药菌8株,对18种抗菌药物耐药情况严重,其中6株为广泛耐药菌;3种外排泵抑制剂CCCP、PAβN及维拉帕米的表型阳性率分别为50%、37.5%和12.5%。耐替加环素菌株除ACICU_02904和ACICU_03412基因外均为阳性;替加环素敏感菌中外排泵(adeABC-adeRS、adeFGH-adeL和adeIJK-adeN)基因检测率为38.4%,新近发现外排泵(ACICU_00143、ACICU_03066和ACICU_03646)基因检测率为50.9%,然而,ACICU_02904和ACICU_03412基因检出率为0.9%。在转录水平上,替加环素耐药组的adeB相对表达量是敏感组的23.5倍。结论 鲍曼不动杆菌中adeB相对表达量伴随菌株对替加环素MIC值增加而升高,主动外排泵表达活性增加是替加环素耐药的一个重要机制。     

痰标本中质粒介导喹诺酮耐药基因qnr在肺炎克雷伯菌中的分布特征及耐药分析

目的:了解从痰标本中分离出的肺炎克雷伯菌对16种抗菌药物的耐药性,以及研究由质粒介导的喹诺酮类耐药基因qnr在肺炎克雷伯菌中的存在情况。方法:用PCR及直接测序的方法对135株肺炎克雷伯菌进行qnr基因检测,并用K-B纸片法检测其对16种抗菌药物的体外抗菌活性。另外,用琼脂平皿二倍稀释法检测阳性菌株对左氧氟沙星的MIC值。结果:135株肺炎克雷伯菌中,9株(6.6%)检出qnr基因。阳性菌株均对亚胺培南敏感且对多种抗生素耐药,其中2株qnr阳性菌株对左氧氟沙星敏感。结论:肺炎克雷伯菌中存在质粒介导喹诺酮类耐药基因qnr基因,qnr阳性菌株呈现多重耐药。临床工作中,应加强对耐药基因的监测,降低细菌耐药的发生。     

医院感染鲍曼不动杆菌耐消毒剂基因及同源性分析

目的分析从我院院感病人分离的多重耐药鲍曼不动杆菌中耐消毒剂基因qacEΔ1的存在情况及其阳性菌株的同源性。方法采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析75株多重耐药鲍曼不动杆菌中qacEΔ1基因,用重复序列PCR技术(REP-PCR)分析阳性菌株的同源性。结果 75株多重耐药鲍曼不动杆菌中,33株qacEΔ1基因阳性,阳性率44%:25株泛耐药菌株,13株qacEΔ1基因阳性,阳性率52%。33株阳性菌株分为5个基因型,其中A型29株,为主要流行型别,B、C、D、E型各1株。结论我院临床分离的多重耐药鲍曼不动杆菌qacEΔ1基因携带率较高可能是该菌检出率逐年增多的原因之一,且阳性菌株中存在着以A型为主的感染流行。qacEΔ1阳性菌株可能易发生多重耐药。     

金黄色葡萄球菌耐消毒剂基因qacA的研究

目的 检测我院近年来临床分离的金葡菌耐消毒剂的qacA基因水平，为动态监测细菌耐药性的变化趋势、有效控制细菌耐药性的传播提供对策。方法 收集我科临床分离的金葡菌共252株，并经本实验室重新鉴定确认。参照美国CLSI／NCCLS标准，用6μg／ml苯唑西林和4％NaCl平板，筛选出耐苯唑西林金葡菌和对苯唑西林敏感的金葡菌。应用PCR基因扩增试验检测金葡菌中耐消毒剂的qacA基因水平。随机抽取一株MRSA阳性株进行基因测序，作qacA基因验证。作qacA基因阳性株的MIC检测，了解阳性株是否有耐药性的表达。结果 共检测金葡菌252株，其中MRSA84株（带有qacA基因4株），MSSA168株（带有qacA基因1株）。MRSA阳性菌株对消毒剂的MIC值明显高于MSSA菌株。结论 携带含有耐消毒剂基因qacA的金葡菌未在我院流行．     

安徽地区PMQR基因阳性大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌中ESBLs流行特征的研究

目的了解安徽地区临床分离含质粒介导的喹诺酮类耐药基因(PMQR)大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌中编码超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的基因型别,及与PMQR基因在本地区共同传播的流行现状和耐药特征。方法采用琼脂稀释法测定40株临床分离含PMQR基因的大肠埃希菌与肺炎克雷伯菌对临床14种抗菌药物的药物敏感性,CLSI表型确证试验进行表型鉴定,PCR检测blaESBLs基因型;接合实验验证PMQR与blaESBLs基因的转移性;ERIC-PCR进行同源性分析。结果 40株PMQR阳性菌株对喹诺酮类药物显示耐药同时对多种β-内酰胺类药物耐药;PCR法检测PMQR阳性菌株中blaESBLs基因携带率达到60%(24/40),最常见的为CTX-M型ESBLs,检出率达到92%(22/24)。结论安徽地区临床存在PMQR与blaESBLs基因的共同传播及流行,包含PMQR基因的菌株多为产ESBLs菌株,同时携带PMQR与blaESBLs基因的菌株常为多药耐药菌。     

结核分支杆菌链霉素耐药基因的杂交检测

目的探讨结核分支杆菌对链霉素（Sm）的耐药分子机制,评估应用PCR-寡核苷酸探针反相斑点杂交技术检测rpsL、rrs基因突变在结核分支杆菌对链霉素耐药性测定中的应用价值。方法采用PCR-寡核苷酸探针反相斑点杂交技术对55株结核分支杆菌临床分离株（其中药物敏感株23株,耐INH或含耐,INH耐多药株32株）和25例耐SM肺结核患者痰标本的rpsL、rrs基因突变进行检测。结果以结核分支杆菌H37RV为对照,23株药物敏感株的rpsL、rrs基因突变率分别为4.3%、0。32株耐链霉素分离株中,21株rpsL基因发生突变,突变率为65.6%;4株rrs基因发生突变,突变率为12.5%。25例耐链霉素肺结核患者痰标本中,rpsL基因18例扩增阳性、rrs基因14例扩增阳性,其基因突变检测率分别为50.0%、7.2%。结论rpsL、rrs基因突变是INH耐药性的重要分子机制。PCR-寡核苷酸探针反相斑点杂交技术可以快速、准确地检测结核分支杆菌rpsL、rrs基因突变,该技术有望直接用于临床标本耐药性检测。     

应用单链探针反向杂交试验检测结核分枝杆菌耐药性分析

目的探讨单链探针反向杂交试验检测结核分枝杆菌耐药性,评价此方法在耐药性检测中的临床应用价值。方法采用聚合酶链反应-单链探针反向杂交试验技术,PCR扩增50株结核分枝杆菌rpoB、katG、rpsL、rrs、embB耐药基因,将标记生物素的基因扩增产物与固定在硝酸纤维膜上的核酸探针杂交,通过链亲和素碱性磷酸酶,BICP/NBT显色系统检测分析基因突变,同时与传统药物敏感实验比对分析。结果 PCR-LiPA方法分析50株结核分枝杆菌临床分离株,耐RFP菌株中检出4株,耐INH菌株中检出5株,耐SM菌株中检出7株,SM敏感株检出1株,50株rrs基因均未检测到相应位点的突变;耐EMB菌株1株、EMB敏感株1株检测到embB基因突变。结论应用PCR-LiPA可快速、简便地检出部分结核分枝杆菌耐药株,可作为临床辅助诊断手段。     

产ESBLs肺炎克雷伯菌中整合子和耐消毒剂基因的研究

目的:研究产超广谱β内酰胺酶(ESBLs)肺炎克雷伯菌整合子携带耐药基因状况及其对常用消毒剂的耐药性。方法:采用PCR方法检测77株产ESBLs和71株非产ESBLs肺炎克雷伯菌Ⅰ整合酶基因,分析Ⅰ类整合子与耐药性关系,并用耐消毒剂试验对耐消毒剂基因予以证实。结果:产ESBLs和非产ESBLs菌株中Ⅰ类整合酶扩增阳性率分别为66.2%(51/77株)和10.0%(2/20株),两者差异有统计学意义(P<0.05)。整合子阳性株对磺胺类、氨基糖苷类和环丙沙星的耐药率较高,与整合子阴性相比差异具有统计学意义(均P<0.01);耐消毒剂基因阳性株对常用消毒剂耐药能力高于阴性株。结论:Ⅰ类整合子在产ESBLs肺炎克雷伯菌中的分布明显高于非产酶株,并参与产ESBLs株多重耐药性的形成,携带耐消毒剂基因的菌株具有抗常用消毒剂的能力。     

临床分离产金属酶铜绿假单胞菌的耐药生分析

目的 研究临床分离耐亚胺培南(IPM)铜绿假单胞菌的产金属酶的检测方法及耐药特征.方法 收集我院临床分离的40株耐IPM铜绿假单胞菌作为研究对象,采用EDTA纸片复合法、E-test法和PCR法分别检测产金属酶菌株,用微量肉汤稀释法测定抗菌药物的最低抑菌浓度(MIC).结果 40株耐IPM铜绿假单胞菌EDTA纸片复合法筛选9株产金属酶菌株;E-test法筛选6株产金属酶菌株;PCR法仅检测到1株bhIMP-1和3株bhVIM-2耐药基因.产金属酶菌株呈多重耐药,对头孢他啶、亚胺培南大多数表现为高水平耐药;阿米卡星抗菌活性最好,其次为环丙沙星.结论 目前从临床分离的产金属酶铜绿假单胞菌多重耐药现象严重.