癌-睾丸抗原MAGEC2 HLA-A3限制性细胞毒性T淋巴细胞表位的鉴定

目的:预测并初步鉴定HLA-A3超型限制性MAGEC2抗原特异性细胞毒性T细胞(CTL)表位肽,为基于超型表位的MAGEC2治疗提供实验基础及新的候选靶标。方法:通过BIMAS、SYFPEITHI和IEDB软件预测打分来选取MAGEC2的HLA-A3限制性表位;结合力实验用于检测候选表位与T2A3细胞表面HLA-A3分子的结合能力,ELISPOT实验检测候选表位肽诱导的CTL分泌IFN-γ的能力,体外细胞毒实验检测侯选表位肽诱导的CTL杀伤靶细胞的能力。结果 :表位肽P147、P167、P196、P229和P251具有较好的HLA-A3结合力。ELISPOT实验结果显示表位肽P167、P196和P251诱导的CTL具有分泌IFN-γ的能力。细胞毒实验结果显示表位肽P196和P251诱导的CTL对靶细胞有一定的杀伤作用(P0.05或P0.01)。结论 :P196和P251有更高的HLA-A3分子亲和力,保留了原有的免疫原性,是优秀的MAGEC2抗原的HLA-A3限制性CTL候选表位,可以成为新的抗肿瘤多肽免疫治疗疫苗的候选表位。     

人锌转运蛋白8的HLA-A~*0201限制性CTL表位的预测及初步验证

目的预测和初步鉴定1型糖尿病(T1DM)主要自身抗原锌转运蛋白8(ZnT8)的HLA-A*0201限制性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocytes,CTL)表位,为基于ZnT8抗原表位的特异性免疫治疗奠定基础。方法选取BIMAS预测工具预测该抗原HLA-A*0201限制性结合肽,人工合成待测表位肽,利用T2细胞株测定各肽与HLA-A*0201分子的结合力。利用酶联免疫斑点检测(enzyme-linked immunospotassay,ELISPOT)方法检测候选肽刺激T1DM患者外周血单个核细胞分泌IFN-γ和IL-2的能力,利用标准51Cr释放试验检测特异性CTL诱导活性。结果在所筛选的5个候选CTL表位中,ZnT8(107-115)、ZnT8(115-123)及ZnT8(145-153)与HLA-A*0201分子具有较高的结合荧光强度,可在体外有效诱导抗原特异性CTL的产生,刺激T1DM患者PBMC分泌IFN-γ和IL-2,并对抗原肽负载的T2细胞具有明显的杀伤效应。结论 ZnT8(107-115)、ZnT8(115-123)及ZnT8(145-153)可能是HLA-A*0201限制性CTL表位,为基于人ZnT8抗原表位的特异性免疫治疗奠定理论基础。     

肿瘤抗原PIWIL2的HLA-A2限制性CTL表位鉴定

目的:鉴定肿瘤抗原PIWIL2的人类白细胞抗原A2(HLA-A2)限制性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位。方法:首先运用RT-PCR、Western blot方法检测PIWIL2在肿瘤细胞系MCF-7、SW480和HT-29中的表达情况,然后通过BIMAS、Rank Pep、Net MHC、Net CTL1.2及IEDB软件预测打分来选取PIWIL2的HLA-A2限制性的表位。候选表位肽通过标准的Fmoc化学合成法合成,结合力实验用于检测候选表位与T2A2细胞表面HLA-A2分子的结合能力,ELISPOT实验检测候选表位肽诱导CTL分泌IFN-γ的能力,体外细胞毒性实验检测候选肽诱导CTL的能力。结果:PIWIL2在肿瘤细胞系MCF-7、SW480和HT-29中均有表达。候选肽P485、P493、P965具有中等结合力。ELISPOT实验结果显示表位肽P485和P965诱导的CTL具有分泌IFN-γ的能力。细胞毒性实验结果显示表位肽P485和P965对MCF-7细胞均有一定的杀伤作用。结论:表位肽P485和P965是优秀的PIWIL2抗原HLAA2限制性CTL候选表位,可能成为新的抗肿瘤多肽免疫治疗疫苗的候选表位。     

胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白3限制性表位肽诱导的细胞毒性T淋巴细胞的体外免疫应答

目的探讨胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白3(IGF2BP3)限制性细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位诱导的CTL对肺癌细胞的作用。方法使用软件Net CTL 1.2、SYFPEITHI和IEDB预测选取IGF2BP3的人类白细胞抗原A2(HLA-A2)限制性表位肽。T2A2与表位肽的亲和力实验检测候选表位与T2A2细胞表面HLA-A2分子的结合能力,酶联免疫斑点(ELISPOT)实验检测候选表位肽诱导CTL分泌γ干扰素(IFN-γ)的能力,羧基荧光素二醋酸盐琥珀酰亚胺酯(CFSE)荧光染色检测细胞诱导CTL的能力。结果 P143、P199、P280、P409、P515具有较好的结合力。表位肽P409、P515诱导的CTL具有较好的分泌IFN-γ的能力,并且对靶细胞具有一定的杀伤作用。结论 P409、P515有望用于肿瘤的过继免疫治疗,可以成为抗肿瘤多肽免疫治疗疫苗的候选表位。     

肝素酶HLA-A2限制性CTL表位肽的筛选及其活性鉴定

目的 预测并鉴定新的人乙酰肝素酶(Hpa)抗原的HLA-A2限制性CTL表位,为恶性肿瘤多肽疫苗的免疫治疗提供依据. 方法 采用SYFPEITHI和BIMAS软件预测方法,对肝素酶HLA-A2限制性CTL表位进行预测,合成候选表位肽;利用T2细胞特点,对合成的候选肽与HLA-A2分子进行亲和力分析;利用乳酸脱氢酶释放试验检测待检肽特异性CTL诱导活性;利用ELISPOT检测T细胞活性. 结果 在所筛选的6条候选CTL表位肽中,Hpa(310～318)FLNPDVLDI与HLA-A2分子具有高亲和力,在体外可有效诱导肝素酶特异性CTL的产生,对肝素酶阳性且HLA-A2限制性的HCC-LM6肝癌细胞及SW-480结肠癌细胞具有明显的杀伤效应,且能有效诱导IFN-γ分泌,增强免疫活性. 结论 首次发现Hpa(310～318)FLNPDVLDI可能是肿瘤肝素酶抗原的HLA-A2限制性CTL表位.     

慢性白血病抗原CML28 HLA-A*0201限制性CTL表位预测

目的鉴定慢性白血病肿瘤抗原CML28的HIA-A*0201限制性CTL表位。方法 采用超基序和量化基序结合的方法初步预测CM128的HLA-A*0201限制性CTL表位；利用T2细胞亲合力实验初步验证预测结果。结果 在预测的4个候选CTL表位中，ALVDAGVPM和ALDSDGTLV有较高的亲和力，ALFCGVACA和SLLACCLNA仅有低度亲和力。结论ALVDAGVPM与ALDSDGTLV最有可能是慢性白血病肿瘤抗原CML28的HLA-A*0201限制性CTL表位。     

尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性CTL表位的预测、筛选及鉴定

目的预测、筛选及合成尤文肉瘤EWS-FLI1蛋白HLA-A2.1限制性细胞毒性T淋巴细胞(Cytotoxic T Lymphocyte,CTL)表位,初步鉴定EWS-FLI1表位肽。方法综合运用BIMAS、SYFPEITHI、Predep和IEDB方案对EWS-FLI1蛋白进行HLA-A~*0201限制性CTL表位的预测,应用多项式方案、量化基序方案对预测的CTL表位进行筛选,并将筛选的CTL表位与HLA-A~*0201分子进行动力学模拟,应用标准Fmoc方案合成CTL表位肽;通过表位多肽刺激CTL释放颗粒溶素的检测,以及靶细胞杀伤实验验证表位多肽的免疫效应。结果综合预测得出了8个可能的表位肽,进一步筛选确定其中4个肽为候选合成表位,应用分子动力模拟初步验证了4个候选表位肽与HLA-A2.1分子的结合力,合成的各条肽经色谱分析纯度均在98%以上,经质谱分析各肽的分子量测定值与理论值相符,颗粒溶素释放实验及靶细胞杀伤实验证实了筛选的表位均能产生刺激效应,其中,表位肽QIQLWQFLL(EWS-FLI1 304)的刺激效应最为显著。结论综合运用多个方案可提高预测效率,分子动力学模拟可初步验证表位肽与HLA-A~*0201的结合力,所合成的多肽为高纯度肽,通过免疫学实验初步鉴定了EWS-FLI1的表位。     

HIV-1 pol抗原HLA-A＊0201限制性低亲和性CTL表位预测及改造分析

目的:初步筛选HIV-1 pol抗原的HLA-A*0201 限制性低亲和性CTL表位,预测并初步鉴定修饰后的表位与HLA-A*0201之间亲和性的变化.方法:采用超基序、蛋白酶解、HLA结合力等预测相结合的办法筛选HLA-A*0201限制性低亲和性CTL表位,通过氨基酸置换适当修饰,并以T2细胞检测HLA-A*0201分子与肽的亲和力和稳定性来评价修饰后表位.结果:筛选出的低亲和性CTL候选表位,经修饰后与HLA-A*0201 之间的亲和性均有不同程度的提高.其中,YVSLSFPQI (pol52-60Y1),YVSQIIEQL(pol673-681Y1),YIQKETWEA(pol548-556Y1)HLA-A*0201呈高亲和力结合,同时肽-HLA-A*0201复合物半数解离时间(Dissociation Complex50,DC50)均大于8 h.结论:预测的pol抗原表位经过修饰可能会成为潜在的HLA-A*0201限制性表位.     

基于骨肉瘤高表达抗原PBF CTL表位改造及鉴定

目的:观察骨肉瘤高表达抗原乳头瘤病毒结合因子(PBF)的改造表位是否有HLA-A2限制性抗肿瘤能力,开发基于骨肉瘤的多肽免疫治疗。方法:首先运用RT-PCR和Western blot方法检测PBF在骨肉瘤细胞系U2OS和Saos-2的表达情况。然后通过Net CTL 1.2、SYFPEITHI和IEDB软件预测打分来选取PBF的HLA-A2限制性表位。替换PBF抗原锚定位点氨基酸获得改造肽。候选表位肽的合成方法是标准的Fmoc化学合成法,结合力实验用于检测候选表位与T2A2细胞表面HLA-A2分子的结合能力,ELISPOT实验检测候选表位肽诱导细胞毒性T淋巴细胞(CTL)分泌干扰素γ(IFN-γ)的能力,乳酸脱氧酶(LDH)释放实验和羧基荧光素琥珀酰亚胺脂(CFSE)细胞毒实验检测候选肽诱导CTL的能力。结果:PBF在骨肉瘤细胞系U2OS和Saos-2均有表达,候选肽P75-1Y2L、P412-1Y、P416-1Y2L9V、P107-1Y和P435-1Y2L具有较好的结合力,且改造肽与HLA-A2的结合力高于原肽。ELISPOT实验结果显示表位肽P412、P412-1Y、P416、P416-1Y2L9V和P435-1Y2L诱导的CTL具有分泌IFN-γ的能力;P412-1Y和P416-1Y2L9V诱导特异性T细胞免疫分泌的IFN-γ略高于原肽。LDH释放实验和CFSE细胞毒实验结果显示表位P412、P412-1Y、P416和P416-1Y2L9V对U2OS细胞均有一定的杀伤作用,P412-1Y和P416-1Y2L9V特异性CTLs对U2OS细胞杀伤率高于原肽特异性CTLs。结论:PBF抗原改造表位P412-1Y和P416-1Y2L9V与天然表位P412和P416相比有更高的HLA-A2分子亲和力,保留了原有的免疫原性,并且改造肽抗肿瘤免疫效应强于天然表位。P412-1Y和P416-1Y2L9V是优秀的PBF抗原的HLA-A*0201限制性CTL候选表位,可以成为新的抗肿瘤多肽免疫治疗疫苗的候选表位。     

HIV-1 Gag抗原HLA-A*0201限制性低亲和性CTL表位预测及改造分析

初步筛选HIV-1 Gag抗原的HLA-A*0201限制性低亲和性CTL表位,预测并初步鉴定修饰后的表位与HLA-A*0201之间亲和性的变化。采用超基序、蛋白酶解预测等相结合的办法筛选HLA-A*0201限制性低亲和性CTL表位,通过氨基酸置换适当修饰,并以T2细胞株测定肽与HLA-A*0201分子的亲和力和稳定性试验来评价修饰后表位与HLA-A*0201之间亲和性。结果:筛选出3个低亲和性CTL候选表位,经修饰后的表位与HLA-A*0201之间的亲和性均有不同程度的提高。YIYKRWIIL(259-267Y1),YQANFLGKI(429-437Y1)和YTNNPPIPV(249-257Y1)与HLA-A*0201呈高亲和力结合,荧光系数(flurorescene index,FI)分别为2.68、2.54和2.35,同时肽-HLA-A*0201复合物半数解离时间(dissociation complex50,DC50)均大于8h。预测的低亲和力表位经过修饰可能会成为潜在的HLA-A*0201限制性表位。     

胰腺癌高表达抗原MUC4 CTL表位肽的筛选与改造

目的:观察胰腺癌高表达抗原黏蛋白4(MUC4)的改造表位是否有HLA-A2限制性抗肿瘤能力。方法:首先运用RT-PCR和Western blot方法检测MUC4在胰腺癌细胞系CAPAN-2和ASPC-1的表达情况。通过Net CTL 1.2、BIMAS、SYFPEITHI和IEDB软件预测打分来选取MUC4的HLA-A2限制性表位;替换MUC4抗原锚定位点氨基酸获得改造肽;候选表位肽的合成方法为标准的Fmoc化学合成法,结合力实验用于检测候选表位与T2A2细胞表面HLA-A2分子的结合能力,ELISPOT实验检测候选表位肽诱导细胞毒性T淋巴细胞(CTL)分泌IFN-γ的能力,体外细胞毒实验活性检测候选肽诱导CTL的能力。结果:MUC4在胰腺癌细胞系CAPAN-2和ASPC-1均有表达。P1944-1Y、P1944-2L、P1944-1Y2L、P2004和P2004-1Y9V具有较好的结合力,且P2004-1Y9V、P1944-1Y2L等改造肽与HLA-A2的结合力高于原肽。ELISPOT实验结果显示表位肽P1944、P1944-1Y2L、P2004和P2004-1Y9V诱导的CTL具有分泌IFN-γ的能力。P1944-1Y2L和P2004-1Y9V诱导特异性T细胞免疫分泌的IFN-γ略高于原肽。细胞毒实验结果显示表位P1944、P1944-1Y2L、P2004和P2004-1Y9V对CAPAN-2细胞均有一定的杀伤作用。P1944-1Y2L和P2004-1Y9V特异性CTLs对CAPAN-2细胞杀伤率高于原肽特异性CTLs。结论:MUC4抗原改造表位P1944-1Y2L、P2004-1Y9V与天然表位P1944、P2004相比有更高的HLA-A2分子亲和力,保留了原有的免疫原性,并且改造肽抗肿瘤免疫效应强于天然表位。P1944-1Y2L和P2004-1Y9V是优秀的MUC4抗原的HLAA2限制性CTL候选表位,可以成为新的抗肿瘤多肽免疫治疗疫苗的候选表位。     

整合法预测HBV相关抗原的HLA-A* 0201限制性结合肽

目的 预测HBV的相关抗原HBsAg、HBcAg、DNA polymerase新的HLA-A*0201限制性结合肽.方法 选取SYFPEITHI、BIMAS、SVMHC、IEDB、EpiJen预测工具以及整合法预测抗原对应蛋白序列P03146,P03138,P03156的HLA-A*0201限制性结合肽,并与现有表位数据库中的结合肽比较.结果 整合法与单个预测算法相比提高了预测的灵敏度和特异性,对3种抗原的预测准确性均有提高,MR(misclassification rate)值分别降为1.14%、3.41%、1.46%;利用此方法发现3种抗原尚未得到实验验证的HLA-A*0201结合肽,分别为,HBcAg:ELMTLATWV(64-72)、LMTLATWVGV(65-74);HBsAg:LMT-LATWVGV(246-254)、IIFLFILLL(244-252)、FLFILLLCU(246-255)、SLYSILSPFL(367-375)以及LLCLIFLLvL(251-260);DNA polymerase:SLFTAVTNFL(513-522)、GLLGFAAPFT(554-563);在HBsAg蛋白序列中发现了31个氨基酸的免疫热点区域FIIFLFILLLCLIFLLVLLDYQGMLPVCPLI(243-273).结论 整合法比单个预测算法性能更好,能够更准确地预测抗原的HLA限制性结合肽,采用该方法所发现的9条可能表位和1个免疫热点区域为后续HBV新表位的鉴定及其功能研究提供了有价值的线索.     

人乳头状瘤病毒11型E7抗原HLA-A*0201限制性细胞毒性T淋巴细胞表位的功能鉴定

目的 筛选和鉴定人乳头状瘤病毒11型E7抗原(HPVllE7)HLA-A*0201限制性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位.方法 预测HPVllE7抗原HLA-A*0201限制性CTL表位并合成相对应的表位多肽和四聚体(tetramer),即HPVllE7 7-15(TLKDIVLDL)、15-23(LQPPDPVGL)、47-55(PLTQHYQIL)、81-89(DLLLGTLNI)和82-90(LLLGTLNIV).从健康HLA-A*0201成人外周血单一核细胞诱导树突状细胞(DC)并负载上述表位多肽,流式细胞技术检测DC成熟分化标记及ELISA法检测DC分泌的IL-12;成熟DC负载各组多肽后观察DC激活T淋巴细胞的效应,ELISA法检测T细胞分泌的IFN-γ;四聚体检测抗原特异性CD8+ T细胞及乳酸脱氢酶(LDH)释放法评价DC诱导的CTL对靶细胞的特异性体外杀伤效应.结果 预测的5条HPVllE7表位多肽均能诱导DC的成熟分化;E7 7-15、82-90和15-23多肽负载的DC能激活T淋巴细胞分泌高水平IFN-γ;E7 7-15多肽负载的DC能刺激特异性tetramer+CD8+细胞增殖且其诱导的CTL对HPVllE7/293细胞产生高效率的特异性杀伤作用(P<0.05).结论 筛选并鉴定出1条HPVllE7HLA-A*0201限制性CTL表位E7 7-15(TLKDIVLDL),负载该表位肽的DC体外可诱导高效、特异性的CTL效应,抗原性较强,有可能作为HPV感染治疗用肽疫苗的候选表位.     

鼠胰岛素B链HLA-A*0201限制性CTL表位拮抗型改造肽的设计与鉴定

目的设计并鉴定具有负调致病细胞毒性T细胞(cytotoxic Tlymphocyte,CTL)免疫应答功能的改造肽配体(al-tered peptide ligand,APL),为基于胰岛素自身抗原的I型糖尿病特异性免疫治疗奠定基础。方法利用InSilico技术模拟构建TCR-pMHC(TCR-HLA-A*0201-mInsB5-14)复合物三维结构,根据结构选择改造位点P6;通过保守/不保守单个氨基酸虚拟替换得到若干候选APL;通过自由能变化计算、相对亲和力检测、细胞因子分泌水平检测等体外功能实验,初步鉴定具有拮抗效应的APL。结果筛选得到的APL mInsB5-14H6F(H→F)与天然肽mInsB5-14空间结构相似,能与HLA-A*0201分子结合,其HLA-A*0201分子的相对亲和力与mInsB5-14相近。该APL作用下mInsB5-14刺激CD8+T细胞分泌IFN-γ的水平明显低于天然肽单独刺激下特异性CTL分泌IFN-γ的水平(P0.05)。结论基于天然自身抗原表位mInsB5-14改造得到的mInsB5-14H6F是HLA-A*0201限制性的APL,该APL通过降低致病CTL特异性分泌IFN-γ的水平,可能诱导HLA-A*0201转基因NOD小鼠的自身耐受,从而为I型糖尿病治疗性疫苗的研发奠定了基础。     

肝癌高表达抗原MAGEC2 CTL表位肽的鉴定

目的:观察肝癌高表达抗原MAGEC2的改造表位是否有HLA-A2限制性抗肿瘤能力。方法:通过Net CTL 1.2、SYFPEITHI和IEDB软件预测打分选取MAGEC2的HLA-A2限制性表位;替换MAGEC2抗原锚定位点氨基酸获得改造肽;结合力实验检测候选表位与T2细胞表面HLA-A2分子的结合能力,ELISPOT实验和胞内因子染色检测候选表位肽诱导细胞毒性T淋巴细胞(CTL)分泌干扰素γ(IFN-γ)的能力,体外细胞毒实验检测诱导CTL的能力。结果:P248、P248-1Y、P356、P356-1Y、P356-2L和P356-1Y2L具有较好的结合力,且P248-1Y和P356-1Y2L等改造肽与HLA-A2的结合力高于原肽。胞内因子染色和ELISPOT实验结果显示,表位肽P248、P248-1Y、P356和P356-1Y2L诱导的CTL具有分泌IFN-γ的能力,且P248-1Y和P356-1Y2L诱导特异性T细胞免疫分泌的IFN-γ略高于原肽(P0.05)。细胞毒实验结果显示表位肽P248、P248-1Y、P356和P356-1Y2L对Hep G2细胞均有一定的杀伤作用,且P248-1Y和P356-1Y2L特异性CTLs对Hep G2细胞杀伤率高于原肽特异性CTLs(P0.05)。结论:MAGEC2抗原改造表位P248-1Y和P356-1Y2L分别与天然表位P248和P356相比有更高的HLA-A2分子亲和力,保留了原有的免疫原性,并且改造肽抗肿瘤免疫效应强于天然表位。P248-1Y和P356-1Y2L是优秀的MAGEC2抗原的HLA-A2限制性CTL候选表位,可以成为新的抗肿瘤多肽免疫治疗疫苗的候选表位。     

肺癌抗原COX-2长肽疫苗的设计及免疫活性检测

目的:设计针对肺癌抗原环加氧酶2(COX-2)的长肽,并鉴定这些长肽的免疫活性。方法:通过Net CTL 1. 2、SYFPEITHI和IEDB软件预测打分来选取COX-2的HLA-A2限制性表位;对细胞毒性T淋巴细胞(CTL)表位集中区域选取合适长度的长肽,通过体外活性实验验证长肽是否具有免疫活性。树突状细胞(DC)荷肽实验和ELISPOT检测荷长肽DC诱导的外周血单个核细胞(PBMCs)中干扰素γ(IFN-γ)的释放;胞内因子染色检测表位肽诱导CTL的能力;乳酸脱氢酶(LDH)实验和CFSE法检测CTL对靶细胞的杀伤活性。结果:ELISPOT和胞内因子染色实验结果显示,长肽P315-338和P375-401诱导的CTL具有分泌IFN-γ的能力。CFSE和LDH细胞毒实验结果显示表位P315-338和P375-401对靶细胞有一定的杀伤作用。结论:成功筛选并鉴定出针对肺癌抗原COX-2的2条长肽。这2条长肽具有用作免疫治疗疫苗的潜能。     

氨基酸非键作用指数用于HLA-A*0201限制性CTL表位定量预测研究

目的 预测SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位.方法 从分子的三维空间结构出发,基于静电、立体、疏水这三类与生物活性直接相关的非键作用方式,经主成分分析技术(PCA)得到了一种新的分子结构表达方法--氨基酸非键作用指数.利用该指数结合偏最小二乘(PLS)算法对152个HLA-A*0201限制性CTL表位进行了定量构效关系(QSAR)建模,再使用该模型对SSX-1和SSX-4抗原HLA.A*0201限制性表位进行预测.结果 预测出8个活性值大于7的九肽表位.结论 通过对SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位的预测,从而为SSX-1和SSD-4抗原HLA-A*0201限制性表位的实验探测和鉴定打下了基础.     

基于SCORE函数估算HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性

目的 建立HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性的定量预测方法。方法基于SCORE打分函数,运用定量构效关系的理论和方法研究了HLA-A*0201限制性CTL表位九肽结构与亲和性间的定量关系,并建立了SCORE得分与亲和性的定量关系模型,并用外部样本(5个HLA-A*0201限制性CTL表位九肽)作为预测集用于检验模型的预测能力。结果基于SCORE打分函数建立的定量模型具有较好的相关性(r=0．9165,RMS=0．38)和对外部样本的预测能力(rpred=0.9847,RMS=0.135)。结论基于SCORE打分函数,运用定量构效关系研究的理论和方法建立了HLA-A*0201限制性CTL表位亲和性的定量预测方法,为实验鉴定高亲和性HLA-A*0201限制性CTL表位提供了理论依据。     

基于癌睾抗原CTNNA2长肽疫苗免疫活性检测

目的:设计针对癌睾抗原CTNNA2的包含多个表位的长肽,并鉴定这些长肽的免疫活性。方法:通过NETCTL1.2、SYFPEITHI和BIMAS软件预测打分选取CTNNA2的HLA-A2限制性的表位;对包含多个优势CTL表位区域选取合适长度的长肽,通过体外活性实验验证长肽是否具有免疫活性。酶联免疫斑点实验(ELISPOT)检测DC荷长肽诱导的外周血单个核细胞(PBMCs)中γ-干扰素(IFN-γ)的释放;细胞因子染色检测表位肽诱导CTL的能力;LDH法和CFSE法检测CTL对靶细胞的杀伤活性。结果:ELISPOT和细胞因子染色实验结果显示长肽P778-800、P857-880诱导的CTL具有分泌IFN-γ的能力。CFSE和LDH细胞毒实验结果显示表位P778-800、P857-880对靶细胞有一定的杀伤作用。结论:成功筛选鉴定出针对癌睾抗原CTNNA2的2条长肽,可能对基于CTNNA2的癌症免疫疗法的未来临床试验具有意义。     

Ran HLA-A 2.1限制性CTL表位的预测及初步鉴定

目的 寻找并鉴定肿瘤相关抗原Ran来源的HLA-A2．1限制性CTL表位，为临床开展基于Ran表位的特异性免疫治疗奠定基础。方法应用超基序和量化基序相结合的方法初步预测Ran的HLA-A2．1限制性CTL表位，利用其与他细胞亲和力实验以及与T2细胞结合稳定性试验初步验证预测结果。结果应用超基序和量化基序相结合的方法得到4个候选表位IMFDVTSRV（88-96），TLGVEVHPL（42-50），YVATLGVEV（39-47）和VLCGNKVDI（118-126），亲和力试验结果显示IMFDVTSRV，TLGVEVHPL和YVATLGVEV有较高的的亲和力而VLCGNKVDI无明显亲和力，结合稳定性试验显示在这4个候选肽中IMFDVTSRV的结合稳定性最好。结论IMFDVTSRV最有可能是肿瘤抗原Ran的HLA-A2．1限制性CTL表位。