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1.
目的 探讨广州市白纹伊蚊不同地理种群的遗传多样性、遗传分化和系统发育关系。方法 本实验于2020年9月至2020年11月期间,采集广州市11个行政区的共计15个白纹伊蚊种群。单只蚊虫提取基因组DNA,通过PCR法扩增COI基因序列并测序,获得的序列在GenBank上经过BLAST比对。BioEdit 7.2软件观察序列峰图。MEGA X软件对齐序列,分析碱基组成,构建系统发育树(NJ法)。DNAsp 6.12软件分析位点多态性,单倍型及其多样性,进行错配分布分析。Arlequin 3.5软件进行分子变异分析、进行中性检验。DAMBE 7.2软件分析序列的系统发育信号。 PopART 1.7软件构建单倍型网络图(Median joining法)。结果 广州市15个白纹伊蚊种群共获得642条序列,其长度为603 bp。A碱基加T碱基平均含量是67.5%,符合线粒体DNA的AT偏向性。单倍型分析共检出45种单倍型,其中单倍型1为优势单倍型。中性检验表明广州市部分种群不符合中性理论,但大部分种群都经历过种群扩张,而错配分布却表明仅有少部分种群经历过种群扩张。Mantel检验表明15个白纹伊蚊种群不存在地理隔离现象。种群遗传分化显示各种群间交流较频繁,且种群间的遗传分化很低,差异更多来自于个体间。结论 广州市的白纹伊蚊种群间基因交流较频繁,遗传分化小,遗传多样性偏低。这可能使不同地理种群的白纹伊蚊具有相似的媒介能力。  相似文献   

2.
目的探讨白纹伊蚊不同地理种群间的进化关系和遗传分化情况,为白纹伊蚊防制和蚊媒病防控提供基础资料。方法在广泛采集样品的基础上,通过PCR扩增、测序获取线粒体基因COI片段,并从GenBank下载了部分序列,比对、剪切后的598bp用于后续分析。结果系统发育分析的结果表明所有白纹伊蚊的COI序列聚成一支,没有明显的遗传差异;60条COI序列分属于19个单倍型,其中4个为共享单倍型;单倍型多样性(Hd)为0.737,核苷酸多样性(π)为0.20%;海南的白纹伊蚊种群与绝大部分地理种群间出现了明显的分化(P0.05);H1和H6形成了2个辐射中心,是较为原始的单倍型。结论我国的白纹伊蚊种群正处于扩张的趋势,海南的白纹伊蚊种群与其它地理种群间出现了明显分化。  相似文献   

3.
目的研究不同地理种群白纹伊蚊(Aedesalbopictus)线粒体蛋白NADH脱氢酶亚基Ⅳ(mtDNA—ND4)基因多态性,探讨其遗传特征。方法采集不同海拔高度、登革热历史流行区与非流行区的白纹的幼虫,实验室饲养至成蚊,PCR扩增mtDNA—ND4基因并遗传分析。结果获mtDNA—ND4长度为324b,碱基A+T含量分别为73:2%,17个碱基置换位点,颠换率为62.5%;19个个体存在5个单倍型,单倍型多态性(h)为0.442。结论福建省不同地理株白纹伊蚊出现小程度的遗传分化,可能由遗传漂变引起的。  相似文献   

4.
目的 探索广州市白纹伊蚊线粒体细胞色素C氧化酶亚基I基因(COI)序列的特征,分析同一城市不同环境下白纹伊蚊的遗传变异。方法 单蚊抽提广州市不同点采集的白纹伊蚊基因组DNA,扩增细胞色素C氧化酶亚基I基因片段,联合单链构象多态性PCR(PCR-SSCP)技术分析COI基因片段多态性并筛选部分样品进行克隆测序,用软件比对分析序列的差异。结果 广州市不同采样点白纹伊蚊PCR扩增后获得709bp的COI基因部分序列,序列分析出现12个变异位点,变异率为1.69%。聚类分析显示广州株白纹伊蚊不同采样点的群体间出现部分分化。结论 广州市不同采样点的白纹伊蚊线粒体COI基因出现部分遗传多态性,可能与城市化发展下白纹伊蚊孳生环境的变化有一定关系。  相似文献   

5.
目的探讨福建省登革热监测点白纹伊蚊线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(mtDNA-COⅠ)基因序列特征和遗传多态性。方法选择福建省登革热监测点2015—2016年送检部分批次白纹伊蚊雌性成蚊,提取基因组DNA,扩增全长mtDNA-COⅠ基因片段并测序,分析基因特征并构建系统发育树。结果 PCR扩增mtDNA-CO Ⅰ基因共12个片段,测序得到的片段长度在1 476bp—1 494bp之间。与白纹伊蚊参比序列相比,同源性为99%,包含9个位点的碱基差异。根据不同单倍体型序列构建种系发育树,发现6个登革热监测点的白纹伊蚊分属3个单倍体型,即H02、H03、H08。结论确定福建省登革热监测点白纹伊蚊mtDNA-COⅠ基因存在9个单核苷酸差异位点,包括H02、H03、H08共3种单倍体型,为福建省虫媒病毒病监测及其防控提供技术支撑。  相似文献   

6.
目的调查福建省不同地域白纹伊蚊线粒体细胞色素C氧化酶亚基I(mtDNA-CO1)基因的遗传多态性和系统发育关系。方法 2015-2017年采集福建省15个媒介监测点的白纹伊蚊成蚊和幼虫样品,提取基因组DNA,扩增全长mtDNA-CO1基因片段并测序,应用Mega6.0和DnaSP5.0软件做基因特征分析和系统发育分析。结果新得到54份白纹伊蚊mtDNA-CO1基因片段序列,用于分析的片段长度为1388 bp。样本间多序列比对显示8个核苷酸差异位点,单倍型多样性为0.746,核苷酸多样性为0.126%。根据单倍型参考序列构建系统发育树,确定福建省白纹伊蚊存在9种单倍型,即:H01、H02、H03、H04、H08、H09、H12、H17、H23,另有6条序列无法确定单倍型。结论根据mtDNA-CO1基因多样性,2015-2017年福建省媒介监测点采集白纹伊蚊分属9种单倍型,这对于当地白纹伊蚊的种群进化研究及相关虫媒病毒病防控具有重要参考价值。  相似文献   

7.
目的 探讨山东省不同地理株及实验室不同抗性品系淡色库蚊及5种常见蚊种的线粒体DNA细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(mtDNA?COⅠ)基因序列特征,分析其遗传多样性。方法 采用山东省济南、济宁、青岛等地现场采集及实验室选育的淡色库蚊成蚊,以济宁市现场采集的5种蚊(淡色库蚊、三带喙库蚊、中华按蚊、白纹伊蚊、骚扰阿蚊)作为样本,PCR扩增mtDNA?COⅠ基因并测序,分析序列特征并构建系统进化树。结果 PCR特异扩增8个不同地理株及4个实验室抗性品系的淡色库蚊mtDNA?COⅠ区域,获得长度均为528 bp的扩增片段,A+T含量为67.4%,存在两个变异位点。不同地理株淡色库蚊mtDNA?COⅠ基因同源性为99.95%,不同抗性品系淡色库蚊基因序列相同,所有蚊虫COⅠ基因具有高度保守性。5种常见蚊虫的mtDNA?COⅠ基因片段长度均为528 bp,有408个保守位点,120个变异位点,42个简约信息位点,78个单态位点,A+T含量为65.7%~68.0%,同源性分析发现蚊种间基因同源性为86.17%~92.05%,所有蚊虫的COⅠ基因分子鉴定与其形态学相吻合。系统进化关系显示,同种和同属之间呈明显的聚集,但阿蚊属成单独的分支,与其他蚊种亲缘关系较远。结论 线粒体COⅠ作为不同地理株及实验室不同品系淡色库蚊的遗传进化分子标记不够理想,但该基因具有种间和属间特异性,可用于蚊虫属和种的区分。  相似文献   

8.
目的本研究基于Wolbachia表面蛋白基因(Wolbachia Surface Protein,wsp)初步探讨白纹伊蚊感染Wolba-chia的系统发育关系。方法利用wsp基因对我国23个地理种群的白纹伊蚊种群中感染的Wolbachia进行遗传距离和系统发育分析。结果 wAlbA和wAlbB的种群间的遗传距离分别为0~0.006和0~0.001,系统发育分析也表明白纹伊蚊23个地理种群感染的Wolbachia株系没有分化。结论白纹伊蚊的扩散、取食以及生境影响了Wolba-chia的传播和感染途径,宿主间频繁的基因流和物理接触均为Wolbachia的水平转移提供了条件,使得Wolbachia与其宿主白纹伊蚊间没有明显的协同进化关系。这也为利用Wolbachia开展蚊媒病的防控提供了有利条件,确保防控效力不会因Wolbachia株系间的遗传差异而受到影响。  相似文献   

9.
目的本研究基于Wolbachia表面蛋白基因(Wolbachia Surface Protein,wsp)初步探讨白纹伊蚊感染Wolba-chia的系统发育关系。方法利用wsp基因对我国23个地理种群的白纹伊蚊种群中感染的Wolbachia进行遗传距离和系统发育分析。结果 wAlbA和wAlbB的种群间的遗传距离分别为0~0.006和0~0.001,系统发育分析也表明白纹伊蚊23个地理种群感染的Wolbachia株系没有分化。结论白纹伊蚊的扩散、取食以及生境影响了Wolba-chia的传播和感染途径,宿主间频繁的基因流和物理接触均为Wolbachia的水平转移提供了条件,使得Wolbachia与其宿主白纹伊蚊间没有明显的协同进化关系。这也为利用Wolbachia开展蚊媒病的防控提供了有利条件,确保防控效力不会因Wolbachia株系间的遗传差异而受到影响。  相似文献   

10.
目的探讨福建省不同地理环境白纹伊蚊rDNA ITS2基因序列特征。方法在闽东福鼎市、闽北武夷山市、闽中涵江区和闽南东山县分别现场采集5个点的白纹伊蚊幼虫,实验室饲养,收集羽化成蚊,用75%酒精-20℃保存,PCR特异扩增白纹伊蚊rDNAITS2,用生物信息系统进行白纹伊蚊rDNAITS2基因多态性的分析。结果 PCR特异扩增福建省4个不同地理环境白纹伊蚊rDNA ITS2,在琼脂凝胶电泳上获得500bp左右的扩增片段。序列分析福建不同地理环境的白纹伊蚊在rDNA ITS2表现了基因的多态性,其rDNA ITS2基因单核苷酸存在转换、颠换和缺失,而同一地理环境的5只白纹伊蚊rDNA ITS2基因序列没有差异。结论福建省不同地理区域的白纹伊蚊在rDNA ITS2区表现的遗传多态性,可能与蚊虫生态环境如海拔高度、气温、降雨量和湿度等有一定的关系。  相似文献   

11.
目的 探讨安徽省不同地区日本血吸虫种群的遗传进化关系。 方法 分别从安徽省山丘型流行区(池州市石台县)和湖沼型流行区(安庆市大观区、铜陵市枞阳县)采集钉螺,逸出尾蚴后感染小鼠,每只小鼠感染(50±3)条尾蚴。 35 d 后解剖小鼠,门静脉灌注法收集成虫,提取成虫 DNA,PCR 扩增、克隆和测序成虫的线粒体 NADH(还原型烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)脱氢酶 1(ND1)和细胞色素 C 氧化酶亚基Ⅰ( COⅠ)基因,利用生物信息学软件 Dnasp6. 0 和 Mega X 分析所得序列基本特征并构建系统进化树作遗传进化分析。 结果 安徽省三个地区日本血吸虫样本的 ND1 基因序列存在 15 个变异位点,COⅠ序列存在 74 个变异位点;ND1 基因和 COⅠ基因的核苷酸多样性(Pi)分别为 0. 004 7、0. 017 3,样本间 COⅠ基因序列差异高于 ND1 基因;来自湖沼型流行区的样本 ND1 基因和 COⅠ 基因的变异位点数、核苷酸多样性(Pi)均高于来自山丘型流行区样本。 来自山丘型流行区的样本在 ND1 系统进化树中与来自湖沼型流行区的样本聚集在一起,而在 COⅠ基因系统进化树中单独成簇。 结论 来自湖沼型流行区的日本血吸虫样本群体的基因多样性高于来自山丘型流行区的样本。 安徽省三个地区日本血吸虫群体的 COⅠ基因存在遗传分化,而 ND1 基因尚未产生较明显的遗传分化。  相似文献   

12.
目的分析我国部分地区28种蚊虫的线粒体细胞色素c氧化酶亚基Ⅰ(mitochondrion cytochrome c oxidase subunitⅠ,COⅠ)基因序列,探讨其作为蚊虫分子标记的应用潜力。方法 2015年3月至2016年10月在我国海南、广东、广西、云南、福建、浙江、河南、山西、天津、内蒙古、吉林和黑龙江等12省(自治区、直辖市)的蚊虫孳生地采集幼虫,室内饲养至羽化成蚊,在蚊虫栖息地和蚊虫监测点,采用灯诱法和人诱法采集成蚊。所有成蚊经形态学鉴定后,提取单只蚊虫基因组DNA,采用国际双翅目通用引物PCR扩增并克隆线粒体COⅠ基因5′端片段,并进行测序。所得COⅠ基因序列上传Gen Bank获取登录号。序列通过Clustal1.83和MEGA5.05软件进行多序列比对,用DNAMAN9.0软件分析同源性。采用Mega5.05软件进行序列特征分析、计算遗传距离。每种蚊虫随机选择1~4条线粒体COⅠ基因序列,采用邻接法(NJ)构建系统发育进化树。结果共采集3亚科6属28种301只蚊虫,分别为伊蚊属(Aedes)的白纹伊蚊(Ae.albopictus)等5种、按蚊属(Anopheles)的中华按蚊(An.sinensis)等6种(亚种)、库蚊属(Culex)的二带喙库蚊(Cx.bitaeniorhynchus)等14种(亚种)、阿蚊属(Armigeres)的骚扰阿蚊(Ar.subalbatus)、曼蚊属(Mansonia)的常型曼蚊(Ma.uniformis)和巨蚊属(Toxorhynchites)的华丽巨蚊(Tx.splendens)。PCR扩增结果显示,28种蚊虫线粒体COⅠ基因的长度约711 bp,经多序列比对排齐后长度为651 bp。不同种别蚊虫的线粒体COⅠ序列同源性范围为97.85%~99.97%。种内K2P遗传距离为0.15%~2.89%,属内种间遗传距离为0.25%~14.50%。其中,按蚊属6种蚊虫COⅠ序列存在153个变异位点,131个简约信息位点,T+A平均含量为67.70%;编码的217个氨基酸残基中保守氨基酸206个(占94.9%);6种蚊虫的核苷酸同源性为98.31%~99.72%,种内K2P遗传距离为0.41%~1.56%,种间K2P遗传距离为1.07%~14.50%。28种蚊虫(60条)COⅠ序列的系统发育树分析结果显示,种团内近缘种(尖音库蚊、淡色库蚊和致倦库蚊)聚在一起,但近缘种之间未完全隔开;白跗按蚊(An.albitarsis)和迷走按蚊(An.vagus)聚在一起,其余23种蚊虫分别以种为单位聚在一起。结论基于线粒体COⅠ基因的分子标记可以区分捕获蚊虫的部分蚊种,但尚未能有效及准确地区分近缘种。  相似文献   

13.
白纹伊蚊是目前全球范围内最具威胁的入侵物种之一,同时作为登革热、基孔肯尼亚热等蚊媒传染性疾病的重要传播媒介,它的大量扩散为疾病的暴发流行提供了条件,已成为重要公共卫生问题。白纹伊蚊的种群遗传特征能够反映其入侵过程及传播病毒能力,所以白纹伊蚊种群遗传研究在疾病防控方面显得尤为重要。微卫星标记因其具有共显性遗传和多态性信息含量高等特点,成为目前较为理想用于种群遗传研究的DNA分子标记物。本文根据微卫星标记应用于白纹伊蚊种群研究中的现状进行了综述。  相似文献   

14.
目的 分析不同地理种群棕脊足螨(Gohieria fusca)遗传多样性和遗传分化。方法 自安徽省芜湖市(WH)、蚌埠市(BB)、亳州市(BZ)和浙江省嘉兴市(JX)等4个地区采集螨虫标本并筛选出棕脊足螨,采用PCR技术扩增棕脊足螨线粒体细胞色素b(cytochrome b, Cytb)和核糖体DNA内转录间隔区(internal transcribed spacer, ITS)基因并对扩增产物测序。采用Chromas 2和DNASTAR 1.00软件进行序列校对和拼接,采用DnaSP 5.10.00软件计算各种群单倍型多样性(Hd)、核苷酸多态性(Pi),应用MEGA 10.2软件包计算遗传分化指数(Fst)和基因流(Nm)。采用Arlequin 3.1软件计算Tajima’s D和Fu’s FS值,并进行中性检验和分子方差分析;采用Network 10.2软件基于Median⁃joining法构建单倍型网络图。结果 棕脊足螨样本Cytb基因序列长度为372 bp、ITS基因序列长度为1 301 ~ 1 320 bp。基于线粒体Cytb基因和核糖体ITS基因序列分析发现,4个棕脊足螨地理种群均表现出较高遗传多样性(Hd = 0.804,Pi = 0.006 91)。分子方差分析发现,4个棕脊足螨地理种群间存在遗传分化(Fst = 0.202 40, P < 0.05),且遗传变异主要来自种群内(79.76%)。基因流分析发现,4个棕脊足螨地理种群间局部存在高水平基因流(Nm > 1)。基于Cytb基因的中性检验发现,棕脊足螨WH种群Tajima’s D值和Fu’s FS值分别为-1.796 31和-3.293 98(P均< 0.05),表明WH种群可能发生过历史扩张。单倍型网络图和系统发育树分析结果一致,均表明不同棕脊足螨地理种群无明显地理分布格局。基于ITS基因序列分析发现,4个棕脊足螨地理种群单倍型多样性(Hd)与核苷酸多态性(Pi)均较高,整体值分别为0.985和0.011 97,具有较高遗传多样性。分子方差分析发现,棕脊足螨Fst值为0.104 62(P < 0.05),种群间存在中等程度遗传分化。基于ITS基因的中性检验发现,棕脊足螨整体Tajima’s D值和Fu’s FS值分别为-6.088 20和-1.935 99(P均> 0.05),无明显历史扩张。结论 4个棕脊足螨地理种群遗传多样性较高,存在显著遗传分化。由于不同棕脊足螨地理种群间局部发生高水平基因流,未发现其明显地理分布格局。  相似文献   

15.
白纹伊蚊(Aedes albopictus)是登革热的主要传播媒介之一,分布于世界各地.白纹伊蚊的易感性主要涉及白纹伊蚊和登革病毒之间的相互作用.该文主要从遗传效应和环境因子方面对白纹伊蚊种群遗传、生理遗传、环境因素对虫媒病毒传播的影响及控制易感性的基因等研究进行综述.  相似文献   

16.
目的 探讨人类线粒体基因控制区的多态频率和变异类型。方法 搜集基因文库记录的86个人类线粒体基因D环控制区序列,并与标准剑桥序列进行比对分析。结果 86个序列中共在181个位点发现1253个碱基变异,主要变异形式为碱基转换(占71.75%),其次为碱基插入(16.04%)和缺失(8.62%),碱基颠换较少,仅占3.59%。核酸位点16189、303~315、514~523是变异频率较高,且具有基因长度不稳定的区域。结论 线粒体基因D环区为高度多态变异区,其变异频率的确定可为针对线粒体基因多态性与疾病发生风险评估的其他研究提供参考。  相似文献   

17.
随机复制多样性DNA聚合酶链反应(RAPD-PCR)是以单一的、含10个碱基序列的随机引物体外扩增基因组DNA的随机片段,用以研究基因多态性。此技术快速、简易、不需了解基因背景。本研究用RAPD-PCR技术扩增埃及伊蚊基因组DNA,用统计学方法分析扩增的基因片段,通过基因分析进行亚种和种群的鉴定。  相似文献   

18.
目的 目的 比较我国大陆地区广州管圆线虫线粒体基因组的多态性。 方法 方法 在种群遗传学研究基础上, 选取7条雌虫进行线粒体基因组的测定。根据广州管圆线虫线粒体基因组已知序列 (GQ398121) 设计12对引物, 进行PCR扩增, 并对目的片段进行测序和拼接。利用多种生物学软件对测定的线粒体基因组进行基因定位、 结构图绘制、 核苷酸及变异位点分析、 进化关系分析。结果 结果 获得5个不同遗传类型的线粒体基因组。这些基因组的大小相似、 结构相同, 即 13 491~13 502对碱基, 含12个蛋白编码基因, 2个核糖体基因, 22个tRNA基因, 2个较大的非编码区。上述基因紧密地排列在同一条DNA链上, 并具有相同的转录方向。通过对这些基因组的比对发现, 变异位点745个, 占整个基因组的5.5%。其中, 缺失/插入突变59个, 碱基颠换105个, 碱基转换581个。这些突变位点均匀地分布在整个线粒体基因组中。结论 结论本研究提供了丰富的广州管圆线虫线粒体基因的突变位点, 为构建种内鉴别诊断技术提供了基础。  相似文献   

19.
目的分析青藏高原细粒棘球蚴的种群遗传结构,为细粒棘球蚴病的防控提供基础资料。方法对采自青藏高原来自不同地区(青海、西藏、四川)不同宿主(人、绵羊、牛)的58株细粒棘球蚴进行了线粒体12S基因的全序列测序,结合已报道的青海地区42个细粒棘球蚴绵羊株的12S全序列进行种群遗传结构分析。结果本次研究56个分离株鉴定为Echino-coccus.granulosus sensu stricto(基因型G1–G3);分析98个青藏高原地区分离株12S序列,包含15个核苷酸变异位点,共检测出13个单倍型(ES1~ES13),单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.381、0.00092。3个地域种群中,四川种群的核苷酸多样性最高(0.001353),种群内遗传距离最大(0.00135)。分子变异分析(AMOVA)显示,种群内的遗传变异大于种群间的遗传变异。构建单倍型NJ树和贝叶斯树显示,ES10和ES11形成一个有别于其他单倍型的单倍型类群。单倍型网络显示,单倍型ES1是优势单倍型,其它单倍型围绕它成辐射状,未发现有地理聚类。基因流(Nm值)和遗传分化指数(FST值)显示各地域种群间未形成显著的遗传分化。结论青藏高原细粒棘球绦虫的基因型为G1-G3型;青藏高原细粒棘球绦虫种群内及种群间都存遗传多样性,其中四川种群的遗传变异性最大;青藏高原细粒棘球绦虫种群内变异是种群变异的主要来源;种群未形成地理聚类,遗传分化不明显。  相似文献   

20.
目的 目的 对长江下游江西、 安徽和江苏3省湖北钉螺的不同地理种群进行群体遗传结构分析, 以探讨rDNA?ITS分 子标记在钉螺扩散路径监测中的应用价值。 方法 方法 采集3省9个种群的钉螺样本, 提取基因组DNA, PCR特异性扩增rD? NA?ITS基因并克隆测序, 统计分析群体间的遗传分化系数 (Fst )、 遗传距离和种群遗传多样性等参数, 利用单倍型构建家系 网络图。结果 结果 9个种群共获得有效序列93条, 检测到78个单倍型, 平均单倍型多样性、 核苷酸多样性分别为0.988和 0.012 88, 表明钉螺种群的遗传多样性水平较高; 其遗传变异主要来自群体内, 种群间遗传距离为0.001 6~0.002 3, 显示钉 螺种群间遗传分化程度较高; 家系网络图显示所有单倍型虽可形成3个主要的家系分支, 但各地理种群在家系网络图中无 明显分化。结论 结论 长江下游江西、 安徽和江苏3省沿长江分布的湖北钉螺群体遗传多样性主要存在个体间, 群体间未形成 明显的遗传分化。rDNA?ITS分子标记在钉螺扩散路径监测中的应用价值值得进一步探讨。  相似文献   

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