浙江省2006-2007年暴发性胃肠炎中诺如病毒的分子流行病学分析

目的 分析浙江省2006-2007年暴发性病毒性胃肠炎中诺如病毒感染的分子流行病学特征.方法 收集监测期间暴发性病毒性胃肠炎疫情患者的粪便标本及相关流行病学资料.采用RT-PCR及荧光定量RT-PCR检测诺如病毒.随机选掸部分阳性标本扩增部分多聚酶区和衣壳蛋白片段,进行序列测定,结合诺如病毒I(GI)、Ⅱ(GⅡ)基因型参考株进行进化分析.结果 诺如病毒感染暴发性胃肠炎共5起,发生时间均集中于9-12月,送检标本63份,诺如病毒检测阳性45份.序列分析结果显示,浙江省诺如病毒序列与诺如病毒GⅡ/4型参考株同源性最高,其中与北京2006年、荷兰2006年诺如病毒GⅡ/4型变异株最为接近,核苷酸同源性分别为99.7%和98.5%～99.0%.诺如病毒与北京、荷兰流行的GⅡ/4型变异株处于同一分支.结论 诺如病毒是浙江省病毒性腹泻暴发疫情的重要病原体,流行时间集中于秋季,其流行株为GⅡ/4型变异病毒株.     

诺如病毒性腹泻暴发调查报告

目的 对一起由诺如病毒引发的腹泻疫情进行流行病学调查与实验室检验结果分析。方法 以涟水县2020年6月-2021年12月由诺若病毒引发的58例腹泻患者为对象,采用现场流行病学调查法对疫情发生、发展过程进行调查,并采集病例、食品以及饮用水等样本进行实验室检验,分析结果。结果58例患者中,腹泻占70.69%,发热占65.52%,腹痛占41.38%,呕吐占37.93%。流行时间呈点暴露特征,涉及30多个班级,32间宿舍,以学生为主,男女发病率相当,可疑食品以奶茶、豆浆为主。诺如病毒均显示阳性,其中GⅠ检出率为8.62%,GⅡ检出率为81.03%,混合检出率为10.34%。结论 诺如病毒临床症状较轻,多发于集体环境,GⅡ是感染诺如病毒的主要基因,误食不卫生食品可诱发诺如病毒性腹泻。     

2015年北京市西城区诺如病毒感染聚集性和暴发疫情分析

目的通过分析北京市西城区2015年诺如病毒感染聚集性和暴发疫情的流行特征,为病毒性腹泻相关预防控制策略和措施的制定提供依据。方法采用现场流行病学调查方法对诺如病毒疫情进行调查,采集病例及相关人员标本进行腹泻病毒检测;对全年资料进行汇总分析。结果共调查处置诺如病毒感染暴发疫情1起、聚集性疫情4起,均发生在小学和托幼机构,共计病例85例,总罹患率为24.85%,流行时间为四五天。共检测便标本109件,总阳性率43.12%;病例检测阳性率为79.59%,密切接触者检测阳性率为16.00%。除1起聚集性疫情由GⅠ组诺如病毒引起外,其余4起均由GⅡ组诺如病毒引起。结论学校和幼儿园是诺如病毒疫情防控的重点,应加强监测,切实落实各项防控措施,以减少疫情的发生和传播。     

2018年上海市松江区诺如病毒聚集性及暴发疫情流行病学特征分析

目的 了解上海市松江区2018年诺如病毒聚集性及暴发疫情流行病学特征,为制定有效诺如病毒感染防控措施提供数据支持。 方法 对2018年上海市松江区诺如病毒聚集性及暴发疫情资料开展回顾性分析。 结果 2018年松江区共发生16起诺如病毒聚集性疫情与1起暴发疫情,涉及病例254例,总罹患率1.56%。疫情集中于11月(64.71%)及10月(17.64%),疫情场所以小学(41.18%)、幼儿园(35.29%)为主。病例主要表现为呕吐(80.31%)、腹泻(44.49%)、腹痛(25.59%)、发热(15.35%)。17起疫情均检出诺如病毒GⅡ型。疫情主动报告率为94.12%,首发病例发病-疫情报告时间间隔与疫情持续时间呈正相关趋势(r_s=0.611,P<0.05)。 结论 2018年松江区诺如病毒聚集性及暴发疫情均发生于集体单位,高发季节为秋冬季,传播途径以接触传播及气溶胶传播为主,优势病原型别为诺如病毒GⅡ型。及时发现、报告与正确处置是防控诺如病毒感染的关键。     

2013-2016年北京市西城区诺如病毒感染聚集性疫情流行特征分析

目的 对2013-2016年北京市西城区诺如病毒感染聚集性疫情的流行病学特征进行分析。方法 采用现场流行病学方法,对2013年1月至2016年12月北京市西城区报告的诺如病毒感染聚集性疫情开展流行病学调查,采集病例及相关人员标本进行腹泻相关病毒检测。结果 2013-2016年西城区共报告15起聚集性疫情,每起疫情发病人数在8~37例之间,罹患率在13.7%-53.3%之间。疫情流行期中位数为3d。四年报告疫情起数呈逐年递增趋势,冬春季为高发季节,其中12月至次年4月共报告10起(66.7%)。疫情主要发生在小学 10起(66.67%)。采集患者、密接及食品从业者便标本共188件,检出诺如病毒核酸103件,阳性率为54.8%,其中患者便标本阳性率最高80.8%。除1起聚集性疫情由GⅠ组诺如病毒引起外,其余14起均由GⅡ组诺如病毒引起。结论 2013-2016年北京市西城区诺如病毒聚集性疫情冬春季高发,小学为重点场所,应加强疫情的监测、报告工作,加强食堂员工及隐性感染者的监测与管理。     

常州市武进区2015年诺如病毒感染聚集性疫情流行病学特征分析

目的分析常州市武进区诺如病毒感染聚集性疫情流行病学特征。方法应用现场流行病学调查方法和描述性流行病学方法,对2015年诺如病毒感染聚集性疫情进行调查分析。结果 2015年发生诺如病毒感染聚集性疫情13起,病例427例,罹患率波动在0.64%~9.19%,临床症状主要为呕吐、腹痛、腹泻等,疫情发生在托幼机构和学校,主要发生在秋冬季,病毒分型为诺如病毒GⅡ型。结论托幼机构和学校是诺如病毒疫情防控重点,要优化防控措施,控制疾病暴发。     

2018年淮安市洪泽区诺如病毒感染聚集、暴发疫情特征

目的了解淮安市洪泽区诺如病毒感染聚集、暴发疫情流行病学特征,为有效控制疫情提供依据。方法收集2018年洪泽区诺如病毒感染聚集、暴发疫情流行病学调查个案、调查报告及实验室检测数据,并进行描述流行病学分析。结果 2018年洪泽区发生诺如病毒感染聚集、暴发疫情各1起,罹患率分别为0.95%、1.18%,分别发生在托幼儿机构、中学,均为诺如病毒GⅡ型;共报告病例47例,实验室确诊病例16例。聚集性疫情、暴发疫情分别发生在2018年4月、11月;主要发病年龄分别在5～6岁、13～14岁,男女比为1.241。聚集性疫情病例集中在幼儿园1个班级;暴发疫情病例发生在某中学1个年级相邻2个班级。临床症状主要为呕吐、腹泻、腹痛、发热等,预后良好。采集病例肛拭子20份,检出诺如病毒GⅡ型阳性16份,阳性率为51.61%。结论诺如病毒感染疫情易发生在托幼机构、学校等集体单位,应及时采取病例隔离、消毒等综合干预措施。     

2008年广州市婴幼儿诺如病毒感染流行特征及基因型研究

目的了解广州市5岁以下婴幼儿诺如病毒感染状况及对诺如病毒阳性株进行基因型分析。方法收集广州市2008年5家病毒性腹泻监测点医院的门诊临床诊断为病毒性腹泻的5岁以下患儿临床资料及粪便标本692份,采用ELISA方法检测轮状病毒、腺病毒、星状病毒和诺如病毒抗原,将诺如病毒抗原阳性的标本用RT-PCR方法进行诺如病毒核酸扩增,阳性产物回收、纯化并测序,结合GenBank中的相关序列进行型别流行特点分析。结果 692份标本中,ELISA方法检测4种病毒的阳性率分别为轮状病毒31.9%(221/692)、诺如病毒21.2%(147/692)、腺病毒6.1%(42/692)、星状病毒1.2%(8/692),混合感染占6.8%(47/692)。诺如病毒腹泻病例发病高峰在9—11月份,占51.7%(76/147),2岁以下病例数占91.8%(135/147)。临床症状以腹泻、呕吐、发热、腹痛为主。147份诺如病毒ELISA阳性标本中RT-PCR方法检测诺如病毒核酸阳性率为84.4%(124/147),经测序及与GenBank中的相关序列比对,证实124份均属诺如病毒GⅡ遗传组,其中1份是GⅡ2型,其余均为GⅡ4型,GⅡ4型中又有不同分支。结论诺如病毒是广州市5岁以下儿童病毒性腹泻的常见病原之一,仅次于轮状病毒,常见于2岁以下婴幼儿,流行优势株基因型为GⅡ4型。     

RT-LAMP法对Ⅱ型诺如病毒的检测

目的在本实验室建立适合于基层使用的Ⅱ型诺如病毒快速检测方法 RT-LAMP法,并将其应用于临床病毒性腹泻的检测,为了解诺如病毒导致的病毒性腹泻在南京市的流行状况提供方法和数据。方法用实验室保存的诺如病毒阳性标本进行方法学建立,并收集南京地区某医院2011年秋冬因腹泻就诊并临床诊断为病毒性腹泻的57例成年人患者的粪便进行Ⅱ型诺如病毒检测,包括荧光定量PCR法及基于环的等温扩增(LAMP)法,并对检测为阳性标本核酸进行测序分析。结果所建立的Ⅱ型诺如病毒RT-LAMP法和荧光定量检测法均可以检测到稀释到10 000倍的阳性标本,即两种方法具有相同的敏感度。对于诺如病毒I型、甲肝病毒及乙肝病毒没有扩增,即对诺如病毒Ⅱ型的扩增具有特异性。57例临床粪便标本,荧光定量PCR法与RT-LAMP法均检测到6例Ⅱ型诺如病毒阳性病例,两种方法符合率为100%,经测序分析,5例为诺如病毒GⅡ.4亚型,1例为诺如病毒GⅡ.6亚型。5例GⅡ.4亚型分别来源于4个不同的流行株,3个国家和地区,巴西、俄罗斯和北京。结论南京地区2011年诺如病毒腹泻病例以GⅡ.4亚型为主要感染亚型,也有GⅡ.6亚型。结果提示该病毒传播范围的广泛性和流行病学防控的艰巨性。荧光定量PCR与RT-LAMP法都可以快速进行病原检测,但RT-LAMP法因其方法简易、不需要特殊仪器、结果直接肉眼观察而更适合基层使用。     

重庆市九龙坡区诺如病毒感染病原学监测及聚集性疫情流行病学特征

目的分析重庆市九龙坡区诺如病毒感染病原监测结果及聚集性疫情流行病学特征,为防控工作提供依据。方法 2017年9月至2018年9月设立2所哨点医院,采集感染性腹泻门诊儿童散发病例标本,收集2016—2018年九龙坡区诺如病毒感染聚集性疫情流行病学及病原信息,采集标本进行检测。结果检测门诊病例标本阳性率为10.8%(13/120),均为诺如病毒GⅡ型;聚集性疫情病例标本阳性率61.3%(133/217,其中诺如病毒GⅡ型127例、GⅠ型6例);门诊标本第3季度阳性率最高(20.4%,10/49),仅0～5岁有阳性病例检出;聚集性疫情病例标本以6～8岁组阳性率最高(70.5%),3～5岁组次之(64.2%,χ~2=12.22,P0.01)。聚集性疫情流行病学特征:疫情多发于第4季度,以3～11岁居多(97.6%,361/370);小学疫情持续时间长于幼儿园(Z=-2.80,P0.05);疫情持续时间与报告间隔时间、在校学生数、波及班级数呈正相关(r_s=0.8、0.5、0.4,P均0.05)。传播途径均为人密切接触传播。发病症状:低年龄组呕吐、腹痛、发热发生率较高,腹泻发生率较低。结论重庆市九龙坡区诺如病毒感染优势株为GⅡ型,门诊散发病例以0～5岁儿童为主,夏季较多;聚集性疫情以3～8岁儿童为主,好发于冬季。及时发现处置首发病例,是预防疫情扩散的关键措施。     

2011年-2013年珠海市诺如病毒胃肠炎暴发的病毒分子流行病学分析

目的研究珠海市诺如病毒胃肠炎暴发的分子流行病学特征及流行株基因型的演化情况。方法收集珠海市2011年-2013年28起胃肠炎暴发疫情患者肛拭子标本619份,采用荧光逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)定性检测诺如病毒RNA,按要求选取部分诺如病毒RNA阳性标本扩增诺如病毒衣壳蛋白,进行测序及同源性分析。结果其中17起疫情由诺如病毒感染引发,检测阳性率为19.55%(121/619);选取诺如病毒RNA阳性标本57份进行测序分型,成功分型的标本为47份,全部为No V GⅡ,14株为GⅡ.4型(其中5株为GⅡ.4 2006b,另外9株为GⅡ.4/Sydney_2012);12株属于GⅡ.3型;3株属于GⅡ.5型;18株属于GⅡ.6型。结论珠海市诺如病毒引起的食物中毒流行株属于GⅡ组,但基因亚型存在多样性,并且在短时间内造成多处暴发疫情,提示该状况将是今后防控监测的重点。     

2015—2020年湖南省感染性腹泻病原学及分子流行病学特征分析

目的 了解湖南省感染性腹泻的病原谱,追踪其分子流行病学演变趋势,为感染性腹泻的综合防治提供科学依据。 方法 通过哨点监测结合暴发疫情监测的方法,收集2015—2020年湖南省感染性腹泻标本,对细菌病原采用细菌培养、生化鉴定进行检测;对病毒病原采用分子生物学方法进行分型鉴定,并对部分PCR阳性标本进行序列测定。 结果 哨点医院主动监测的总阳性率为35.61%,病毒检出率20.26%高于细菌检出率11.26%,混合病原感染检出率为4.09%。细菌病原谱以沙门菌O∶4群鼠伤寒型为主,病毒病原谱以轮状病毒A组G9P[8]型和诺如病毒GⅡ.4Sydney[P31]型感染为主。不同监测、不同年份的病原谱构成及其基因型变迁规律各不相同:哨点医院监测细菌阳性率低而病毒阳性率高时,诺如暴发疫情随之增加;暴发疫情中诺如病毒感染为86.78%,其中69.43%为GⅡ型感染,12.42%为GⅠ型感染,混合感染占3.03%。诺如病毒暴发疫情具有明显季节性,优势基因型为GⅡ.2[P16]占42.97%。 结论 2015—2020年湖南省感染性腹泻病毒类病原体高于细菌类,鼠伤寒沙门菌、A组轮状病毒G9P[8]和诺如病毒GⅡ.4 Sydney [P31]是最主要的病原体和优势血清/基因型;GⅡ.2 [P16]是诺如病毒暴发流行的优势基因型;通过连续哨点监测的数据支持,提前为暴发疫情做好了防控,促成了湖南省感染性腹泻发病率的平稳下降。     

2017—2018年成都地区诺如病毒聚集性疫情病原基因型分析

目的 分析2017—2018年成都地区诺如病毒聚集性疫情中病毒基因型构成情况,为疾病防控工作提供依据。方法 选取2017—2018年诺如病毒聚集性疫情标本,对病毒基因RdRp及VP1区片段测序,构建进化树并进行同源性分析。结果 测序结果显示,68份肛拭子标本中 16.2%(11/68)为GⅠ群(包括GⅠ.2、GⅠ.3和GⅠ.5型),83.8%(57/68)为GⅡ群(包括GⅡ.P16-GⅡ.2、GⅡ.P17-GⅡ.17、GⅡ.P8-GⅡ.8、GⅡ.P12-GⅡ.3、GⅡ.P7-GⅡ.6和GⅡ.P15-GⅡ.15型)。2017年以GⅡ.P16-GⅡ.2型为主;2018年GⅠ群及GⅡ.P17-GⅡ.17型均显著增加,同时检出其他4种基因型。各基因型病毒变异不明显,核苷酸同源性为93.4%~100%。结论 2018年成都地区诺如病毒流行株基因型构成较2017年复杂,可能与聚集性疫情增长有关。应持续监测诺如病毒基因型流行情况,及时掌握病毒变异动态,以期提高疾病防控的预警能力。     

山东省济宁市病毒性腹泻样本诺如病毒分子流行病学与基因特征分析

目的 了解山东省济宁市诺如病毒的分子流行病学特征及诺如病毒的优势基因型,为诺如病毒感染防控提供科学依据。方法 按照《山东省病毒性腹泻监测方案》,2018年1月-2020年12月从山东省济宁市每县(市、区)每月采集3～5份病毒性腹泻标本,进行流行病学调查,采用Real time RT-PCR方法检测诺如病毒GI/GⅡ组,对阳性样本进行基因型别鉴定。结果 共采集粪便标本1 230份,诺如病毒阳性165份(其中GⅠ8份、GⅡ157份),检出率为13.41%(165/1 230)。每年除2月份外,其他月份均检出诺如病毒,以6月、7月检出率高。基因型分别为GⅡ.4型25份,占32.05%;GⅡ.2型18份,占23.08%;GⅡ.6型14份,占17.95%;GⅡ.3型13份,占16.67%。3年间优势毒株不同,2018年为GⅡ.3型9份,占69.23%;2019年为GⅡ.2型14份,占43.75%;2020年为GⅡ.4型17份,占53.13%。结论 山东省济宁市诺如病毒感染6月和7月流行强度较强,以GⅡ组为主,基因型存在多样性,处于动态变化中,以GⅡ.2[P16]型和GⅡ.4[P31]型为主要型别...     

思明区2013-2015年诺如病毒聚集性胃肠炎基因群分布特征

目的 分析思明区2013年2月至2015年2月诺如病毒聚集性胃肠炎事件分布情况及诺如病毒基因群分布特征.方法 对思明区聚集性胃肠炎事件进行流行病学调查,采集病例生物样本,并对诺如病毒核酸进行实验室确诊、基因分群,分析确诊病例基因群分布特征.结果 思明区2年内共报告18起诺如病毒聚集性胃肠炎事件,其中GⅠ群感染1起,GⅡ群感染14起,GⅠ+GⅡ群混合感染3起.共检测生物样本127例,实验室确诊84例.事件主要发生在学校,以GⅡ群为主,GⅡ群阳性占比远高于餐饮场所;秋冬季高发;0～17岁组GⅡ群占比较高;男女均以GⅡ群为主.结论 思明区诺如病毒聚集性胃肠炎事件主要分布在学校,秋冬季高发;均以GⅡ群诺如病毒感染为主,且存在GⅠ +GⅡ混合感染;年龄组间、暴露场所间确诊病例病毒基因群分布不同.     

广东省2008-2015年诺如病毒感染暴发的危险因素分析

目的 研究2008-2015年广东省诺如病毒感染暴发疫情的危险因素,为诺如病毒感染的预防控制工作提供参考依据。方法 通过"突发公共卫生事件报告管理信息系统"收集2008年1月1日至2015年12月31日广东省报告的诺如病毒感染暴发疫情资料,并进行流行病学分析。采用RT-PCR 方法对2012-2015年73起诺如病毒感染暴发疫情的372份阳性标本进行基因测序亚型分析。结果 2008-2015年广东省共报告96起诺如病毒感染暴发疫情,其中2013-2015年共报告80起（占83.3%,80/96）。暴发地点在学校的占全部疫情的85.4%（82/96）;传播途径为食源性传播占40.6%（39/96）,接触传播占24.0%（23/96）,水源性传播占7.3%（8/96）。基因测序亚型分析显示, 2012-2013年的暴发主要由GⅡ.4/Sydney2012型诺如病毒感染引起（占30.0%,6/20）,2014-2015年的暴发主要由GⅡ.17型诺如病毒感染引起（占62.3%,33/53）。结论 食源性和接触传播及新出现的2种诺如病毒变异株GⅡ.4/Sydney2012变异株和GⅡ.17是引起广东省诺如病毒感染暴发的主要原因。     

一起GⅡ.17型诺如病毒引起的聚集性腹泻疫情报告

目的调查一起GⅡ.17型诺如病毒感染引起的聚集性腹泻疫情。方法收集该起疫情患者粪便标本,采用实时荧光定量反转录PCR(RT-PCR)检测诺如病毒核酸,阳性标本进行核苷酸序列测定并进行同源性分析。结果该起感染性腹泻疫情共36例患者,采集13例临床表现典型患者的粪便标本进行检测,诺如病毒核酸阳性8份,阳性率为61.54%。将5株测序成功序列进行比对,确定诺如病毒基因型为GⅡ.17型。与2014年中国香港分离的诺如病毒GⅡ.17型参考株Norovirus HK GⅡ.17 2014在同一个进化分支上,核苷酸序列同源性为99.3%~99.7%。结论本次疫情是由GⅡ.17型诺如病毒感染引起的聚集性腹泻疫情,应加强对此毒株的监测工作。     

学校感染性腹泻疫情中诺如病毒的分子流行病学分析

目的研究学校感染性腹泻疫情中诺如病毒的分子流行病学特征。方法对2017年义乌地区的学校感染性腹泻疫情中的粪便标本进行诺如病毒核酸检测,选取部分阳性标本对衣壳蛋白区基因片段进行扩增和测序,通过序列比对和进化分析确定诺如病毒的基因型别。结果 120份感染腹泻标本中检测到诺如病毒阳性45份,阳性率为37. 5%,选取的部分阳性菌株序列分析结果显示均为GⅡ. 2型。结论诺如病毒是引起学校感染性腹泻暴发疫情的重要病原菌之一,流行时间集中在2017年1月-3月,流行型别为GⅡ. 2型。     

金山区2012年诺如病毒聚集性胃肠炎流行病学特征分析

目的分析金山区2012年诺如病毒胃肠炎聚集性疫情的流行特征,为制定预防策略提供科学依据。方法采用实时荧光RT-PCR检测诺如病毒核酸,运用描述性流行病学分析辖区诺如病毒聚集性胃肠炎疫情流行特征。结果金山区2012年共报告8起诺如病毒聚集性胃肠炎疫情,发病132例,疫情罹患率在21.74%~67.86%之间,平均罹患率为38.37%;病例分布在托儿所、幼儿园、学校;冬季高发,男女性别比为1.32:1;疫情均为GⅡ型诺如病毒感染引起,感染来源尚不清楚。结论 GⅡ型诺如病毒是金山区聚集性胃肠炎的主要病原体,应加强托幼机构、学校等重点场所疫情监测,防止疫情发生。     

一起GⅡ.6型诺如病毒聚集性疫情的流行病学调查

诺如病毒感染性腹泻(胃肠炎)是由诺如病毒引起的急性肠道传染病,以起病急、传播快、暴发多、呕吐多见为特征[1].该病毒传染性强,传播途径广泛,极易在学校、托幼机构、养老院、医院、工厂及社区等聚集性场所引起暴发流行[2].近年来,国内外因诺如病毒感染引起聚集性或暴发疫情的报道逐渐增多,其中GⅡ型诺如病毒因基因型较多、毒株变异快,可引起全球性胃肠炎的流行,并导致严重的公共卫生问题.2015年5月22日,北京市某幼儿园发生一起以呕吐为主要症状的急性胃肠炎聚集性疫情.经流行病学调查和实验室检测,证实由GⅡ.6型诺如病毒感染所致,现报道如下.