大连市2020年甲型肝炎病毒流行株基因特征

目的 分析大连市甲型肝炎(甲肝)病毒(Hepatitis A virus, HAV)流行株基因特征。方法 采集大连市2020年部分甲肝病例急性期血清或粪便标本,提取HAV核酸,采用巢式RT-PCR扩增目的基因,构建HAV获得序列与GenBank中参考序列的系统进化树,分析HAV序列VP1-2A区核苷酸和氨基酸同源性,确定基因型。结果 从甲肝病例标本中获得54条HAV序列,核苷酸、氨基酸同源性分别为97.15%-100%、98.13%-100%,属于ⅠA基因亚型。获得序列与中国大陆序列中2014年辽宁省丹东市、2019-2020年山东省烟台市和威海市序列的核苷酸同源性最高,为98.42%-99.69%;与其他国家序列中日本、意大利HAV序列的核苷酸同源性最高,为99.07%-100%。在获得序列中,53条序列的氨基酸同源性为100%,1条序列与其存在2个氨基酸差异。结论 大连市2020年HAV优势流行株为ⅠA基因亚型,甲肝可能具有多个传播链和相同感染来源。HAV基因型监测有助于HAV溯源和及时采取应对措施。     

中国部分地区猪胆汁戊型肝炎病毒基因型和中和抗原位点变异研究

目的调查猪胆汁戊型肝炎病毒(HEV)携带率、基因型和中和抗原位点变异。方法在中国4个地区屠宰场采集成年商品猪的胆汁标本,采用real-time RT-PCR检测HEV RNA;采用巢式RT-PCR扩增HEV ORF2区部分基因片段,进行基因分型和中和抗原位点氨基酸序列分析。结果猪胆汁标本HEV RNA总阳性率为8.6%(46/532),4个地区阳性率在3.0%-12.5%之间。19株HEV基因分型成功,均为基因4型,其中11株HEV基因亚型分型成功,均为4a亚型。在该11株HEV的21个中和抗原位点中,2株HEV在ORF2区分别发生第487位氨基酸突变(Ser487Tyr)和第564位氨基酸突变(Thr564Pro)。结论中国部分地区猪胆汁HEV携带率较高,为中国人群中优势流行的基因4型,且部分中和抗原位点发生突变;应加强猪群HEV的持续监测。     

甲型肝炎病毒变异及其生物学意义

甲型肝炎病毒（ＨＡＶ）变异的研究将有助于阐明其根本的生物学行为、ＨＡＶ复制和敏殖效率、毒力和免疫原性的强弱及致病机制,也为ＨＡＶ体外培养的适应、减毒、疫苗研制及其安全性评价提供分子生物学依据,并有利于ＨＡＶ分子流行病学的研究。本文对近年来ＨＡＶ各基因结构区的变异及其相关生物学意义的研究进展作了综述。     

甲型肝炎病毒基因分型研究进展

甲型肝炎病毒只有一个血清型,但可划分为7个基因型,其中基因Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅶ型主要为人源HAV株,基因Ⅱ型为人源或猴源病毒株,基因Ⅳ型、Ⅴ型和Ⅵ型则主要为猴源HAV株。HAV各基因型之间核苷酸差异为15％～25％,基因亚型间的差异为7.5％～15％。基因分型的研究将为HAV的分类提供有用的工具,并为HAV的流行病学追踪调查提供方法,     

湖北省2016-2021年麻疹病毒流行株基因型特征

目的分析湖北省麻疹病毒流行株基因型特征。方法收集湖北省2016-2021年麻疹监测病例咽拭子标本,进行麻疹病毒核酸检测、分离培养、N基因C末端基因扩增,构建分离株与基因库(GenBank)中麻疹病毒基因型参考株的系统进化树,分析核苷酸同源性和基因型别。结果从湖北省2016-2021年麻疹监测病例中共获得335株麻疹病毒流行株,其中H1基因型327株(2016-2018年)、B3基因型5株(2019年)、疫苗株A基因型3株(2016年和2021年)。H1基因型麻疹病毒分离株之间的核苷酸同源性为98.40%-98.90%,与H1基因型参考株的核苷酸同源性为97.30%-97.80%;B3基因型麻疹病毒分离株之间的核苷酸同源性为99.30%-100%,与B3基因型参考株的核苷酸同源性为97.10%-97.60%。结论2016-2018年湖北省麻疹病毒优势流行株仍为中国本土H1基因型,2019年首次发现B3基因型,2021年仅检测到疫苗株A基因型。需继续加强麻疹病毒基因型监测,及时发现和阻断输入性麻疹传播。     

甲型肝炎病毒基因分型研究进展

甲型肝炎病毒只有一个血清型，但可划分为７个基因型，其中基因Ⅰ型、Ⅱ型和Ⅶ型主要为人源ＨＡＶ株，基因Ⅱ型为人源或猴源病毒株，基因Ⅳ型Ⅴ型和Ⅵ型则主要为猴源ＨＡＶ株。ＨＡＶ各基因型之间核苷酸差异为１５－２５％，基因亚型间的差异为７．５－１５％。基因分型的研究将为ＨＡＶ的分类提供有用的工具，并为ＨＡＶＣ的流行学追踪调查提供方法。     

甲型肝炎病毒TZ84株单克隆抗体在甲型肝炎抗体检测中的应用

将不同位点的甲型肝炎 (甲肝 )病毒 (HAV)TZ84单克隆抗体 (单抗 )或酶标单抗进行混合做包被和酶 ,代替现有试剂中的多克隆抗体 (多抗 ) ,采用竞争抑制法对试剂的灵敏度和可靠性进行测定 ,并通过 2 2 9份甲肝灭活疫苗临床观察血清甲肝病毒抗体的检测 ,对单抗试剂的应用进行研究 ,并对该单抗试剂进行评价。结果表明 :该单抗试剂的灵敏度为 94 % ,特异度均为 98% ,最低检出浓度的变异系数为 9 3% ;单抗试剂、多抗试剂和雅培试剂的最低检出浓度分别为 5 5、98、31mIU/ml。单抗试剂的灵敏度高于多抗试剂 ,特异度低于多抗试剂。     

铝盐佐剂对甲型肝炎病毒抗原和乙型肝炎病毒表面抗原细胞免疫反应的研究

目的　评价铝盐佐剂对甲型肝炎病毒抗原 (HAAg)和乙型肝炎病毒表面抗原 (HBsAg)细胞免疫反应的影响。方法　以甲型肝炎病毒灭活抗原和乙型肝炎病毒基因工程表达抗原为对象 ,采用小鼠迟发型超敏反应 (DTH)、脾脏淋巴细胞增殖实验和淋巴细胞亚型分群实验 ,检测铝盐佐剂吸附前后的细胞免疫反应变化 ,并进行统计学分析。结果　甲型肝炎病毒抗原佐剂吸附后 ,DTH反应强度和特异性T淋巴细胞增殖强度有所降低 ,但无统计学意义 (P >0 0 5 ) ;乙型肝炎病毒表面抗原吸附佐剂后 ,特异性T淋巴细胞增殖显著降低 (P <0 0 5 ) ,CD4+ /CD8+ 比值明显升高(P <0 0 5 )。结论　铝盐佐剂可减弱杀伤型T细胞的分化和增殖 ,优势调节T淋巴细胞向辅助型T细胞 (TH)分化 ,对细胞内病原体的清除可能有一定负面影响     

甲型肝炎病毒的分子生物学进展

近年来,有关甲型肝炎病毒的基因结构、不同株间变异、抗原部位及减毒的分子基础等方面已进行了深入的研究,本文从分子水平综述甲型肝炎病毒研究的最新进展,并阐明其和新疫苗发展的关系。     

A novel linear neutralizing epitope of hepatitis E virus

Hepatitis E virus (HEV) is a serious public health problem that causes acute hepatitis in humans and is primarily transmitted through fecal and oral routes. The major anti-HEV antibody responses are against conformational epitopes located in a.a. 459–606 of HEV pORF2. All reported neutralization epitopes are present on the dimer domain constructed by this peptide. While looking for a neutralizing monoclonal antibody (MAb)-recognized linear epitope, we found a novel neutralizing linear epitope (L2) located in a.a. 423–437 of pORF2. Moreover, epitope L2 is proved non-immunodominant in the HEV-infection process. Using the hepatitis B virus core protein (HBc) as a carrier to display this novel linear epitope, we show herein that this epitope could induce a neutralizing antibody response against HEV in mice and could protect rhesus monkeys from HEV infection. Collectively, our results showed a novel non-immunodominant linear neutralizing epitope of hepatitis E virus, which provided additional insight of HEV vaccine.     

新疆维吾尔族慢性乙型肝炎患者HBV基因型及亚型分析

目的探讨新疆维吾尔族(维族)慢性乙型肝炎患者中乙型肝炎病毒(HBV)基因型及基因亚型。方法用本实验室建立的HBV基因型及基因亚型特异性引物巢式聚合酶链反应(nPCR)法,对54份新疆维族慢性乙型肝炎患者血清样本进行HBV基因型及亚型分析。随机选取11株经nPCR法鉴定为D基因型的样本,同时进行PreS/S区及PreC/C区测序以鉴定D基因亚型。随机选取2株D型HBV进行基因组全长扩增并克隆测序。从GenBank下载75株各国HBVD1亚型参考序列,根据Kimuratwo-parameter法计算中国新疆地区与其他国家的HBVD1亚型株进化距离。结果新疆维族人群HBV感染以D基因型为主,占66.67%,同时存在B(5.56%)、C(5.56%)基因型及混合感染(22.22%)。新疆存在D1和D3两种亚型,以D1亚型为主。新疆D1亚型与中亚哈萨克斯坦、乌兹别克斯坦、蒙古等国及中东地区土耳其、伊朗、埃及等国的进化距离较近。结论新疆维族慢性乙肝患者中D基因型为优势株,主要为D1亚型,其进化距离与中亚中东等国较为接近。     

江苏省宜兴地区丙型肝炎病毒基因分型研究

目的了解江苏省宜兴地区丙型肝炎病毒（HCV）基因型分布特征和病毒变异情况。方法对宜兴市人民医院收治的158例HCV抗体阳性患者血清进行HCV RNA检测，对阳性标本进行Simmonds分型，采用5’非编码区（5’NCR）1、2、3、1b型特异性引物进行PCR扩增，并对1b型和2型各1株的PCR产物测序验证。分析不同性别、临床类型的丙型肝炎患者基因型分布差异。结果158份血清中，有95份为HCV RNA阳性，其中1b型80份（84．2％），2型5份（5．3％），1b／2型的混合感染5份（5．3％），不能分型的5份（5．3％），1b型的序列与GenBank J-4株的同源性为99．2％，2型与GenBank J-6株的同源性为97．7％。男性和女性在基因型总体分布上存在差异（P〈0．05），并且在单一型感染和混合型感染的分布上差异亦有统计学意义，不同临床类型的丙型肝炎中HCV基因型分布未显示差异。结论江苏省宜兴地区HCV以1b型为主，男女患者HCV基因型分布差异有统计学意义，而不同临床类型的HCV基因型分布无显著差异，基本反映了本地区HCV感染的特点。     

乙型肝炎病毒复制特点及其重要基因变异

HBV复制周期包括两个重要的过程:一是自共价闭合环状DNA(cccDNA)产生转录模板,二是以前基因组RNA(pgRNA)为模板逆转录生成HBVDNA基因组。由于病毒以逆转录方式进行基因组的复制,所以时常产生病毒突变体。特定的选择压力,包括内源性的(宿主免疫清除)和外源性的(疫苗和抗病毒药物)易于选择出逃逸突变株。文章就HBV复制特点及其重要的基因变异进行综述。     

上海市1997--2012年戊型肝炎流行特征和基因分型研究

目的 系统分析1997--2012年上海市戊型肝炎(戊肝)的流行特征、血清学和基因分型特点。方法利用国家法定传染病报告数据;采用ELISA检测社区健康人群戊肝病毒(HEV)一IgG抗体,计算标化阳性率;使用巢式RT-PCR、基因测序和GenBank数据构建上海市HEV基因数据库。结果 16年间上海市戊肝以散发为主,发病率呈季节性和周期性,总体略呈下降趋势。男性发病率显著高于女性,患者以30～65岁年中老年人为主。2001--2012年4次社区健康人群抗体水平监测,共采集血清标本3979份,人群HEV-IgG抗体标化阳性率分别为22．32％、18．56％、10．22％和34．43％,抗体阳性率与监测对象的年龄组别和地区分布呈显著关联。对2004--2008年上海市新发现的73株HEV同源性和进化树分析显示,HEV以基因Ⅳ型为主,包含4个已知基因亚型(4a、4d、4h和4i);人病毒株序列与猪基因Ⅳ型病毒株序列(GUl8885l、DQ450072和EF570133)的核苷酸同源性分别为83．09％～97．96％、85．87％一97．26％和83．80％～95．10％;不同区县来源的HEV分离株中,同源性>99％的序列有59对。结论戊肝仍是上海市需长期重点防治的急性传染病之一。其人畜共患命题还有待进一步探索。     

我国2015-2017年急性乙型肝炎病例HBV基因型分布特征分析

目的分析我国急性乙型肝炎(乙肝)病例HBV基因型流行病学分布特征。方法收集2015-2017年中国疾病预防控制信息系统报告的急性乙肝病例620例, 通过巢式PCR扩增获得全长HBV基因组, 构建系统发育树确定HBV基因型, 结合基础资料分析HBV基因型的分布情况。结果在620例急性乙肝病例中, 成功分型519例(83.71%, 519/620), 包括A型(0.19%, 1/519)、B型(27.17%, 141/519)、C型(62.04%, 322/519)、D型(9.06%, 47/519)、I型(0.77%, 4/519)和CD重组型(0.77%, 4/519);2个主要的基因亚型为B2(95.03%, 134/141)和C2(72.67%, 234/322)。基因型在我国7个地区分布不同, C型在东北(94.55%, 52/55)、华北(93.85%, 61/65)、华东(78.87%, 56/71)和华南地区(58.14%, 50/86)的比例较高, B型在华中(58.07%, 36/62)和西南(52.94%, 45/85)地区的比例较高, 西北地区的D型(48.42%,...     

华东地区散发性戊型肝炎病毒系统进化分析

目的 了解华东地区散发性戊型肝炎病毒(HEV)的系统进化特征.方法 2005-2008年收集华东地区14家二级或三级医院413份散发戊型肝炎患者血清,应用巢式RT-PCR方法检测HEVRNA并测序.参照GenBank相关序列,分析各序列之间的同源性,并构建进化树.结果 413例患者的男女性别比为1.75:1,40～69岁患者居多(61.5%).413份患者血清有140份分离出HEV RNA,阳性分离率为34%.所有分离的140份病毒株均属于HEV Ⅳ型,与Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ型参考病毒株的核苷酸同源性分别为77.9%～88.3%、80.8%～90.6%、73.4%～85.2%和91.0%～95.4%.结论 基因Ⅳ型HEV是引起华东地区散发性戊型肝炎的优势病毒株,其起源和进化等问题仍需进一步研究.