三维氨基酸结构描述子矢量SVRDF及其在肽QSAR中的应用

为了建立一种新型氨基酸结构描述子并用于多肽定量构效关系研究，本研究从天然氨基酸150个radial distribution function (RDF)指数经主成分分析得出一种新3D氨基酸描述子-SVRDF(principal component scores vector of radial distribution function)，应用该描述子并通过偏最小二乘(PLS)对苦味二肽、催产素及促凝血酶原激酶抑制剂3个体系建立定量构效关系模型。对3个体系建模复相关系数(r²_cum)与交互检验复相关系数(Q²_cum)分别为0.766和0.724； 0.941和0.811； 0.996和0.919。研究结果表明，SVRDF描述子能够系统地表征肽与生物活性相关的结构信息，有望成为多肽定量构效关系研究中一种有效的结构表征方法。