肿瘤抗原MAGE-2 HLA-A2限制性新CTL表位的鉴定

目的：寻求新的HLA-A2限制性肿瘤抗原MAGE-2 CTL表位。方法：经超基序与量公基序相结合预测的肿瘤抗原MA-GE-2的4个表位作为研究对象，标准的^51Cr实验与肽结合实验相结合进行验证。结果：预测表位肽MAGE-2220-228，MAGE-2271-279经体外刺激PBMC后可有效的诱导CTL效应产生，当效/靶为100：1时溶破靶细胞效率分别为74.4％，68.2％。HLA-A2分子亲和力分析，荧光系数分别为0.61、0.24阳性肽荧光系数为0.79。结论：多肽MAGE-2 220-228可作为新的HLA-A2限制性CTL表位。     

肝癌相关肿瘤抗原HLA-A2限制性CTL表位的预测

目的：预测肝癌肿瘤抗原的HLA-A2限制性CTL表位。方法：选择与肝癌相关的肿瘤抗原MAGE-1，MAGE-3，MAGE-8，p53及AFP为研究目标，采用SYFPEITHI基序法远程预测系统和量化基序多项式法结合的预测方法进行HLA-A*0201限制性CTL表位预测。结果：共预测出与肝癌相关的肿瘤相关抗原的35个HLA-A2限制性CTL表位。结论：两种预测方法结果的一致性较好。所预测的35个肿瘤抗原HLA-A2限制性CTL表位经实验筛选，鉴定后，可望用于新型肝癌治疗性多肽疫苗的设计研究。为临床肝癌特异性治疗奠定基础。     

肿瘤抗原MAGE-3预测CTL表位的合成与鉴定

目的 合成并鉴定已预测出的４个ＭＡＧＥ－３ ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位多肽,为后续研究奠定基础。方法 采用固相合成法合成多肽,经ＲＰ－ＨＰＬＣ纯化、纯度分析,用质谱进行定性鉴定。结果 ４个合成肽的纯度都在９５％以上,经质谱分析,各肽的分子量测定值与理论值相符,结论 所得多肽为高纯度的目标肽,为后续研究提供了可靠的保证。     

肿瘤抗原MAGE-3 CTL预测表位的计算机分子模拟研究

目的 从理论上分析预测表位与ＨＬＡ－Ａ２分子的结合情况及其为ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位的可能性。方法 应用计算机分子模拟的方法,建立ＭＡＧＥ－３４个ＣＴＬ预测表位的ＨＬＡ－Ａ２结合三维结构和各多肽与ＨＬＡ－Ａ２分子所形成复合的三维结构。结果 ４个预测表位的三维结构完全符合ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位的结构要求,且都能与ＨＬＡ－Ａ２分子结合。结论 ４个ＣＴＬ预测表位为ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位的     

MART-1 HLA-A2限制性CTL表位的预测

目的 预测黑色素瘤分化抗原ＭＡＲＴ－１的ＨＬＡ－Ａ２限制性细胞毒性Ｔ淋巴细胞（ＣＴＬ）表位。方法 采用超基序与量化基序多项式方案相结合的办法,对目的抗原ＭＡＲＴ－１的ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位进行预测。结果 预测出了６个九肽表位。结论 两种方法预测结果的一致性较好,所预测出的６个ＭＡＲＴ－１的ＨＬＡ－Ａ２限制性ＣＴＬ表位经后续实验筛选,鉴定后,可望用于新型ＭＡＲＴ－１肿瘤治疗性多肽疫苗的设计研究     

肿瘤抗原MAGE-A亚家族HLA-A2限制性CTL表位的预测及分析

目的:预测肿瘤抗原MAGE-A亚家族的HLA-A2限制性CTL表位,为肿瘤治疗选择合适的CTL表位提供依据.方法:用SYFPEITHI超基序法远程预测系统和量化基序多项式结合的预测方法进行HLA-A2限制性CTL表位预测,采用DNAstar软件提供的蛋白质核酸序列编辑、分析工具,对MAGE-A亚家族成员进行CTL序列同源性分析.结果:共预测出了50个HLA-A2限制性CTL表位,且部分CTL表位高度相似或一致.结论:SYFPEITHI超基序法和量化基序多项式法结合的预测方法是一种高效、准确的表位预测方法,结合CTL表位的同源性分析,可为肿瘤治疗性疫苗的制备中选择合适的CTL表位提供依据.     

MAGE-12的HLA-A2限制性细胞毒性T淋巴细胞表位肽的预测及其三维结构构建

[目的]从理论上分析预测肿瘤抗原MAGE- 12(melanoma antigen- 12)的HLA-A2(histocompatility leukocyte antigen-A2)限制性细胞毒性T淋巴细胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位肽并构建其三维结构.[方法]以肿瘤特异性抗原MAGE-12为研究目标,采用超基序法、量化基序法、多项式法、延展基序法与三维结构构建相结合的CTL表位预测方法.[结果]预测出的MAGE-12的表位中有4个符合HLA-A2限制性CTL表位要求.[结论]预测出的4个HLA-A2限制性CTL表位为MAGE-12的表位的可能性较大,经后续实验筛选、鉴定后,可用于基于MAGE-12的肿瘤治疗性多肽疫苗的设计研究.     

CTL表位预测的方法学进展

ＣＤ8 +αβＴ细胞在机体抗感染和抗肿瘤免疫中发挥着极为重要的作用。现已知 ,ＣＤ8+αβＴ细胞所识别的靶抗原需先经抗原递呈途径以“抗原肽 ＭＨＣＩ类分子”复合物的形式呈现于抗原递呈细胞 (Ａｎｔｉｇｅｎｐｒｅｓｅｎｔｉｎｇｃｅｌｌｓ ,ＡＰＣｓ)或靶细胞表面方可被表达有相应αβＴＣＲ(Ｔｃｅｌｌｒｅｃｅｐｔｏｒ)的ＣＤ8+Ｔ细胞所识别 ,相应的与ＭＨＣＩ类分子结合的抗原肽即为ＣＴＬ表位 (ＣｙｔｏｔｏｘｉｃＴｌｙｍ ｐｈｏｃｙｔｅｅｐｉｔｏｐｅｓ)。对于一个已知序列的蛋白抗原 ,若单纯用实验方法来鉴定其ＣＴＬ表位 ,常…     

肿瘤抗原MAGE-12的B细胞表位4分支多重抗原肽的合成及鉴定

目的：设计合成肿瘤抗原MAGE-12的B细胞表位抗原肽并对其进行鉴定。方法：在预测MAGE-12的B细胞表位序列为QSDGESSNEEQE(82-93)的基础上，采用4分支我多重抗原肽结构合成抗原肽。免疫C-57BL/6小鼠，产生多克隆抗体，应用ELISA实验及免疫组化实验检测多克隆抗体是否为人的抗原肽的特异性抗体。结果：免疫C-57BL/6小鼠后可产生MAGE-12的抗原特异性的多克隆抗体，抗体滴度可达1：64。结论：证明所预测的表位为MAGE-12的B细胞表位。     

肿瘤抗原MAGE-n HLA-A2限制性细胞毒性T细胞表位的预测及合成鉴定

目的　采用表位重建技术 ,对预测MAGE n抗原HLA A2限制性CTL表位结合活性进行研究。方法　用SYFPEITHI超基序法远程预测系统和量化基序多项式法结合的预测方法 ,筛选新的MAGE n抗原HLA A2限制性CTL表位作为候选表位。对预测的抗原表位进行多肽合成 ,并用HPLC进行纯化 ,质谱法 (MS)鉴定。候选表位与HLA A2位点的亲和力及结合稳定性用竞争结合抑制实验、T2结合稳定性实验及MHC 肽复合体稳定性实验测定。结果　用表位预测法筛选MAGE n抗原 5个HLA A2限制性CTL表位为候选表位。QLVFGIEVV(15 9 16 7)、IMPKTGFLI(195 2 0 3)和FLIIVLVMI(2 0 1 2 0 9) 3个表位具有较高的HLA A2结合力 (IC50 <15 μM)和结合稳定性 (DT5 0 >6h) ,可作为MAGE n抗原HLA A2限制性CTL候选表位进行进一步研究。结论　表位预测结合表位重建方法可提高肿瘤抗原CTL表位研究的效率。MAGE n抗原HLA A2限制性CTL表位经免疫学鉴定后 ,可望用于新型肝癌治疗性多肽疫苗的设计研究 ,为临床肝癌特异性治疗奠定基础。     

SSX基因家族HLA-A2．1限制性CTL表位预测及其MHC-I亲和力分析

目的 通过对肿瘤基因SSX家族不同成员进行CTL表位预测，并对其与MHC-I亲和力进行分析，为探索基于SSX肿瘤基因家族的免疫治疗奠定基础。方法 利用基于超基序结合量化基序方案开发的HLA-A2．1限制性CTL表位预测软件，对SSX基因家族不同成员进行CTL表位预测，然后合成SSX相关待测表位肽P1（AMTKLGFKA）、P4（AMT-KLGFNV）、P5（AMTKLGFKV）和P6（VMTKLGFKV），再对这些合成肽与MHC-I结合亲和力及其结合物稳定性进行实验分析。结果与实验阳性肽（HBcAg，18～27）相比，除P1外，P4、P5、P6均显示较高的结合亲和力；而结合稳定性实验（DC50）结果显示，P1、P4与阳性对照肽（HBcAg，18～27）DC。均大于8h，而P5和P6的DC50介于2～4h之间。结论 计算机软件预测的CTL表位肽，经过体外亲和力与结合稳定性实验筛选到2条理想的表位肽，为该表位的下一步体内鉴定奠定基础。     

MAGE-12 mRNA在肺癌中的表达及其意义

目的　探讨肺癌组织中MAGE 12mRNA的表达及其意义。方法　采用RT PCR技术 ,检测了MAGE 12在 5 0例临床病人肺癌标本中mRNA水平的表达。结果　 5 0例临床肺癌标本中有 17例表达 (17 5 0 ,3 4% ) ,且肺鳞癌 (15 3 3 ,45 5 % )与肺腺癌 (2 17,11 8% )有显著差异 (P <0 0 5 )。结论　MAGE 12基因在肺癌有较高的表达率 ,基于MAGE 12基因及其产物作为新的疫苗可能是一个有前途的治疗肺癌的免疫治疗方法     

HPV18E7抗原HLA-A2限制性CTL表位的初步筛选

目的:初步筛选人乳头瘤病毒18型E7抗原的HLA-A2限制性细胞毒性T淋巴细胞(Cytotoxic T lymphocyte,CTL)表位,为表位免疫原性鉴定提供靶肽.方法:采用超基序、多项式和量化基序方案相结合的方法,对靶抗原HPV18E7的HLA-A2限制性细胞毒性T淋巴细胞表位进行预测,并应用固相合成法合成多肽,经RP-HPLC纯化及纯度分析,用质谱进行定性鉴定.结果:分别预测出5条、1条和6条九肽表位,综合三种预测方案确定其中1条为候选合成表位,合成肽的纯度大于95%,经质谱分析合成肽的分子量测定值与理论值相符.结论:超基序、多项式和量化基序方案联合应用提高预测效率,避免了在研究HPV18E7抗原表位时盲目合成多肽;所合成的多肽为高纯度靶肽,为后继的抗原表位的免疫原性的鉴定奠定了实验基础.     

小鼠肝素酶H-2Kb限制性CTL表位预测及其MHC-I亲和力分析

目的预测肿瘤转移相关基因肝素酶的CTL表位,为探索基于肝素酶的抗原表位的免疫治疗奠定基础。方法利用基于超基序、量化基序结合人工神经网络方案开发的H-2Kb限制性CTL表位预测软件,对小鼠肝素酶蛋白的CTL表位进行预测,然后人工合成相关待测表位肽,再对这些合成肽与MHC-I结合亲和力进行检测。结果采用机算机网络系统,预测了5条小鼠肝素酶抗原表位,即mHpa234-241（LGEDFVEL）,mHpa351-358（FAAGFMWL）,mHpa519~526（FSYGFFVI）,mHpa386-393（VDENFEPL）,mHpa398-405（LSLLFKKL）,MHC亲合力实验表明,与阴性对照肽对比,随着预测肽浓度增加,H-2Kb的表达逐渐增加,与MHC-Ⅰ类分子的亲和力亦逐渐增强,当预测肽浓度达到30μmol/L时,其荧光系数（FI）均大于1.5。结论通过计算机软件预测到的5条小鼠肝素酶CTL表位与MHC-Ⅰ类分子均有较高的结合亲和力,为该表位的下一步体内鉴定及基于小鼠肝素酶抗原表位的肿瘤免疫治疗奠定基础。