新生儿重症监护室早产儿肠球菌的鉴定及同源性分析

目的对北京协和医院新生儿重症监护室(neonatal intensive care units,NICU)早产儿定植和感染部位、环境及益生菌中分离出的肠球菌进行菌种鉴定及同源性分析。方法收集2017年6月1—10日NICU及益生菌制剂中分离出的肠球菌共11株,用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)进行菌种鉴定,采用微量肉汤稀释法测定临床常用抗菌药物的最低抑菌浓度(MIC),用多位点序列分型(MLST)及脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行菌株同源性分析。结果 11株菌均为粪肠球菌,对氨苄西林、万古霉素、替考拉宁、呋喃妥因、氯霉素、左氧氟沙星、利奈唑胺等抗菌药物均表现为敏感,仅1株菌对四环素和红霉素耐药。11株粪肠球菌经PFGE分为a-d 4个克隆群,MLST分型分别为ST624、ST25、ST40及ST16,PFGE与MLST分型结果一致。结论此次NICU早产儿粪肠球菌定植或感染可能与益生菌制剂的使用及物表定植的粪肠球菌相关。     

2016—2020年内蒙古某教学医院尿液标本分离菌的耐药性分析及部分大肠埃希菌多位点序列分型

目的 了解尿路感染病原菌的分布、耐药变迁及大肠埃希菌多位点序列分型（MLST）。方法 回顾性分析2016—2020年内蒙古医科大学附属医院尿液标本分离菌耐药情况。对2020年部分大肠埃希菌进行多重PCR种系分型;对B2型菌株进行MLST。结果 该院5年间培养分离尿路感染病原菌共计9 008株,革兰阴性菌7 219株,占80.1%,革兰阳性菌1 789株,占19.9%。前5位的菌种分别是大肠埃希菌、屎肠球菌、肺炎克雷伯菌、粪肠球菌和无乳链球菌。粪肠球菌对测试抗菌药物的耐药率均显著低于屎肠球菌,未发现对利奈唑胺和万古霉素耐药的粪肠球菌,发现耐万古霉素的屎肠球菌。大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类抗生素仍高度敏感,但均出现耐药菌株。铜绿假单胞菌对测试抗菌药物的耐药率均显著低于鲍曼不动杆菌。204株大肠埃希菌中B2型占47.1%,MLST分为6个ST型别（ST1193、ST131、ST95、ST12、ST3910、ST4）。ST1193是最主要型别,占54.9%,其次是ST131,占35.2%。结论 尿液标本分离菌以革兰阴性菌为主,大肠埃希菌是引起尿路感染最主要的病原菌。ST1193分离率最...     

浙江地区临床分离粪肠球菌的多位点序列分型及耐药性分析

目的对粪肠球菌进行多位点序列分析(MLST),探讨浙江地 区粪肠球菌的分子分型与耐药性的相关性。方法收集2018年1～8月 浙江地区多家医院临床分离的粪肠球菌,总计74株;根据粪肠球菌的7个管家基因序列对74 株菌株进行多位点序列(MLST)分型;同时对该74株菌株进行药敏实验,分析MLST与药物耐药 性的相关性。结果74株菌分为20个ST型,3个型别为新的型别。ST1 6和ST179是浙江地区的优势型别菌株,同属于CC16克隆复合体,两者占所有菌株的55%以上 ,其中ST16包含21株菌(占28.38%),其次为ST179,包含20株菌(占27.03%),再次是ST4和 ST6,各包含6株(占8.11%)。药敏结果显示,粪肠球菌耐药程度高的抗生素主要是四环素及 红霉素,其耐药率分别为89.2%和73%,不同ST的粪肠球菌均对这两种抗生素产生耐药。ST1 79与ST16两者耐药谱相似,区别主要是ST179对利福平均为敏感,而ST16有部分(33.3%)会 对利福平产生耐药;另外,ST6对喹诺酮类药物及高浓度的庆大霉素耐药,ST4型的粪肠球 菌会对青霉素产生耐药。结论目前浙江省粪肠球菌分离菌株主要以 CC16(包含ST16与ST179)克隆株为主,不同MLST分型的菌株与耐药可能有一定的相关性,仍 需验证。     

耐万古霉素肠球菌耐药基因、转座子结构和多位点序列分析

目的分析耐万古霉素肠球菌(VRE)耐药基因和多位点序列分型(MLST)情况。方法收集三亚中心医院临床分离的耐万古霉素的80株屎肠球菌和12株粪肠球菌,采用VITEK MS微生物鉴定系统进行菌种鉴定。采用VITEK 2 Compact自动化鉴定药敏仪测定VRE对14种常用抗菌药物的敏感性。采用微量肉汤稀释法测定VRE对万古霉素和替考拉宁的最小抑菌浓度(MIC),并确定耐药表型;采用聚合酶链反应(PCR)筛选VRE的毒力基因(esp、hyl、gelE、asal、cy1A、efaA、ace)和转座子结构;对VRE进行MLST。结果质谱鉴定结果为80株屎肠球菌和12株粪肠球菌。体外药物敏感性试验结果表明,屎肠球菌和粪肠球菌对万方霉素的耐药率均为100%,对氨苄西林的耐药率分别为97.5%和50.0%,但对呋喃妥因的耐药率较低。92株VRE对万古霉素和替考拉宁的MIC分别为192～256和32～256μg/mL,均为VanA表型;92株VRE基因型均为vanA,以esp毒力基因所占比例最高(82.5%);屎肠球菌以esp-hyl基因组合最常见,粪肠球菌以多基因组合为主;通过Tn1546基因转座子结构分析可分为A～E 5个型别;92株VRE的MLST包括7个ST型别,分别为ST17(43.5%)、ST78(32.6%)、ST203(6.5%)、ST363(5.4%)、ST555(4.3%)、ST1392(4.3%)和ST1394(3.4%),其中ST17和ST78均属于CC17克隆复合体。结论 92株VRE均为多重耐药株、vanA基因型和CC17克隆复合体,耐药基因和毒力基因携带率均较高,临床应引起重视。     

4种不同方法用于院内感染肺炎克雷伯菌菌株同源性分析的价值比较

目的比较不同同源性方法对暴发感染的菌株进行同源性分析的价值。方法用肠杆菌科基因间重复序列-聚合酶链反应(ERIC-PCR)、脉冲场凝胶电泳(PFGE)、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)对福建省立医院儿科ICU 1个月内7名新生儿患者检出的15株肺炎克雷伯菌进行同源性分析,并用多位点序列分析(MLST)进行菌株ST分型。结果15株肺炎克雷伯菌经ERIC-PCR分为a类(7株)、b类(7株)和c类(1株); PFGE分为A类(7株)、B类(1株)和C类(7株); MALDI-TOF MS分为Ⅰ类(7株)、Ⅱ类(7株)和Ⅲ类(1株); MLST将菌株分为3个ST型:ST37(7株)、新型ST3006(7株)(gap A 69,inf B 19,mdh 90,pgi 20,pho E 125,rpo B 18,新型ton B 406)和ST1224(1株)。结论 MALDI-TOF MS可用于院内感染肺炎克雷伯菌菌株的同源性分析,与ERIC-PCR、PFGE和MLST方法一致性较好,并具有便捷、快速等特点。     

2014—2018年仙桃市伤寒沙门菌分子分型及耐药性分析

目的了解仙桃市伤寒沙门菌的耐药性及分子分型特征。方法收集2014—2018年分离的29株伤寒沙门菌开展药敏试验、脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型及多位点序列分型(MLST)分析。结果药敏结果显示,29株伤寒沙门菌中27株菌对26种临床常见抗菌药物均为敏感/中度敏感,余2株菌有不同程度的耐药性,其中1株菌株耐药谱分布较广,对β-内酰胺/β-内酰胺抑制剂复合物类药物耐药。PFGE结果显示,29株伤寒沙门菌可分为6种PFGE型别,其中流行优势型为HuBXTSal003型别。MLST分型显示,29株菌株共有2种序列型,其中ST2为优势ST型。结论仙桃市伤寒沙门菌株存在优势PFGE带型及优势ST型,有多重耐药菌株出现。     

516株肠球菌菌型感染分布及耐药分析

目的：分析肠球菌菌型感染分布及耐药性,为临床治疗提供指导。方法对送检标本分离出的516株肠球菌通过法国梅里埃全自动生物分析仪 VITE-K2型进行菌种鉴定。通过药物敏感性试验进行耐药分析。结果516株肠球菌中共有327株粪肠球菌,占63.37％;屎肠球菌145株,占28.10％;其他肠球菌44株,占8.53％。肠球菌对临床常用抗菌药物耐药性严重,特别是屎肠球菌对青霉素、红霉素的耐药性分别高达100.00％、95.17％,同时发现耐万古霉素肠球菌2株。结论院内感染的肠球菌耐药性差异显著,临床治疗应根据药敏试验结果谨慎选择抗菌药物。     

临床分离万古霉素耐药肠球菌van基因型及分子分型

目的明确临床分离万古霉素耐药肠球菌(VRE)基因型及分子分型。方法收集临床分离VRE 17株;采用16S r RNA测序对临床株进行菌种确认,微量稀释法和琼脂稀释法测定常用抗菌药物最低抑菌浓度(MIC)。多重PCR进行van基因分型;采用多位点序列分型(MLST)进行分子分型。结果 17株VRE经16S rRNA测序确认均为屎肠球菌;其中12株对替考拉宁耐药。13株检出vanA基因,9株检出vanM基因,5株同时检出vanA及van M基因;17株VRE分属6个MLST型,其中ST78型8株、ST80型4株、ST555型2株,其余3株分别为ST117型、ST262型和ST341型。结论 VRE的临床分离株中van基因型主要为vanA(76.5%),其次为vanM(52.9%),首次发现同时携带vanA及vanM的VRE菌株。     

220株肠球菌的分布及耐药性研究

目的 调查重庆市某医院肠球菌属细菌的临床分布及对常见抗菌药物的耐药性.方法 采集临床各科送检的标本,进行肠球菌细菌的分离和培养,使用Vitek-Compact系统对肠球菌细菌进行鉴定,采用仪器法检测抗菌药物的MIC值,并根据CLSI的指导原则判定细菌的耐药性.结果 共分离到220株非重复肠球菌,最常见菌种为粪肠球菌95株(43.2%)、屎肠球菌84株(38.2%)和鹑鸡肠球菌32株(14.5%).药敏试验结果表明,屎肠球菌的总体耐药率高于粪肠球菌;肠球菌属对四环素、红霉素、庆大霉素的耐药率较高,对万古霉素、利奈唑胺保持高度敏感性.结论 肠球菌感染以屎肠球菌和粪肠球菌为主,可引起多部位感染,且对临床常用抗菌药物严重耐药.     

553株肠球菌药敏结果分析

目的 探讨553株肠球菌标本的分布,了解其对18种抗生素的药物敏感情况和耐万古霉素菌株的检出情况。方法 选取2000年1月～2001年12月院内感染患者分离标本,使用Vitek—two鉴定系统进行菌种鉴定及药敏试验,并根据万古霉素和替考拉宁药敏情况进行万古霉素耐药临床分型。结果 553株肠球菌中粪肠球菌508株(91．9％),屎肠球菌45株(8．1％)。粪肠球菌对18种抗生素呈多重耐药,20％粪肠球菌耐高浓度庆大霉素。18株耐万古霉素菌株分型为VanB9株,VanA6株,VanC3株。45株屎肠球菌未发现万古霉素耐药株。结论 肠球菌是院内感染的重要病原菌,由于其多重耐药,成为临床治疗的难题。在治疗肠球菌感染时要合理使用抗生素。     

重症监护室耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌的耐药机制和同源性分析

目的探讨安徽医科大学第一附属医院4个重症监护室(ICU)中耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CRKP)的耐药机制和流行状况,为医院感染控制提供依据。方法收集4个ICU病房中CRKP菌株39株,采用纸片扩散法和Vitek 2 Compact仪器法测定临床常见抗菌药物的敏感性,用Carba NP试验对碳青霉烯酶进行筛选,同时对超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)、头孢菌素酶(AmpC酶)、碳青霉烯酶基因进行PCR扩增和序列分析,用基质辅助激光解吸电离飞行质谱(MALDI-TOF MS)技术及多位点序列分型(MLST)进行同源性分析。结果 PCR检测基因型显示36株CRKP以产KPC-2型酶为主,部分菌株同时拥有ESBL和AmpC耐药基因。MALDI-TOF MS将39株CRKP分为3大簇,MLST结果显示35株菌均为ST11型,ST379、ST751、ST307、ST490各有1株,经eBURST在线软件分析ST11与ST379、ST751的亲缘关系较近,来源于同一克隆株。结论 4个ICU病房中CRKP以产KPC-2型酶为主,是CRKP对碳青霉烯类抗菌药物耐药的主要机制。37株CRKP高度同源,提示不同ICU病房间应进一步加强感染控制。     

Molecular epidemiological analysis of the acinetobacter baumannii isolates from blood and sputum specimens of patients with ventilator-associated pneumonia北大核心CSCD

Objective To investigate the molecular epidemiological characteristics of the Acinetobacter baumannii strains isolated from blood and sputum samples of patients with ventilator-associated pneumonia (VAP) in ICU. Methods The patients were analyzed in two groups: Group A, A. baumannii was isolated from both blood and sputum, and Group B, A. baumannii was isolated only from sputum. Clinical data of the patients were collected, including the results of antimicrobial susceptibility test. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) and multilocus sequence typing (MLST) were performed for the strains. Results During the study period from June 2015 to December 2105, 28 nonduplicate A. baumannii strains were collected from 14 patients in group A and 28 nonduplicate strains from 28 patients in group B. The 56 A. baumannii strains were multidrug-resistant (MDR). More than 80% of the strains were resistant to carbapenem, third-generation cephalosporins or aminoglycoside, but highly sensitive to tigecycline. No significant difference was found for the resistance rates between group A and group B. The nonduplicate A. baumannii isolates from blood and sputum samples of the same patient in group A were all homologous strains confirmed by PFGE. Six pulsotypes were identified from the 28 strains in Group A and 9 pulsotypes in Group B. Five pulsotypes were shared between the two groups. MLST analysis showed that there were 9 ST types (ST195, ST208, ST229, ST369, ST373, ST457, ST836 and two new phenotypes ST N2, ST N5) in Group A and 8 ST types (ST195, ST208, ST381 and 5 new phenotypes ST N1, ST N2, ST N3, ST N4, ST N5) strains in group B. There was no significant difference in the proportion of the main ST types between the two groups. eBURST analysis indicated that ST195, ST208, ST457, ST369, ST N1, ST N2, ST N51 belonged to CC92 prevalent strain. Conclusions The antimicrobial susceptibility profile and genotype of A. baumannii isolates from blood and sputum samples are similar. There was CC92 prevalent strain in the ward. There is no direct relation between the risk factors for bloodstream infection in VAP patients and the genotype of A. baumannii strain. It is particularly important to reinforce infection control for prevention and treatment of A. baumannii bloodstream infections. © 2018, Editorial Department of Chinese Journal of Infection. All rights reserved.     

上海市一例肠出血性大肠埃希菌O157∶H7感染病例的病原学分析

目的通过流行病学调查与病原菌鉴定，并结合既往相关菌株资料，对2016年6月上海市腹泻病综合监测中报告的1例肠出血性大肠埃希菌（EHEC）O157∶H7感染病例进行病原学分析。方法对患者开展流行病学调查。 采集标本后进行菌株分离培养、生化鉴定并确定血清型；利用聚合酶链式反应（PCR）检测所携带的毒力基因；采用微量肉汤稀释法进行药敏试验；应用脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术进行分子分型；通过全基因组测序获取序列信息进行多位点序列分型（MLST）及单核苷酸多态性分析。结果流行病学调查未发现可疑传染源。 患者样本分离出EHEC O157∶H7；携带eae、stx2基因；对进行试验的16种抗生素均敏感；菌株图谱带型与以往监测中分离菌株带型均不相同；MLST分型为ST11型，与以往分离菌株核心基因组差异较大。结论上海市较长时间无检出EHEC O157∶H7菌株的病例记录，通过对此次分离的菌株的全面检测，确定了其毒力基因、耐药性和MLST型别，并发现新的PFGE带型，其核心基因组与以往菌株呈现出一定差异，值得进一步关注。     

重症医学科血流感染耐碳青霉烯类高黏液型肺炎克雷伯菌的临床及分子特征

目的分析医院重症医学科(ICU)血流感染患者检出的耐碳青霉烯类高黏液型肺炎克雷伯菌(CR-HMKP)的临床及分子特征。方法2016年1月-2018年12月从ICU血流感染患者中分离40株耐碳青霉烯类肺炎克雷伯菌(CR-KP),通过拉丝试验分为14株CR-HMKP菌和26株CR-非HMKP菌,分析菌株的临床和药敏资料,采用PCR检测菌株的耐药基因、毒力基因及血清荚膜分型,多位点序列分型(MLST)和脉冲场凝胶电泳(PFGE)方法分析细菌的分子流行病学特征。结果CR-HMKP在CR-KP中的检出率为35.0%。CR-KP感染患者均接受两种或两种以上侵袭性操作和联合使用多种抗生素。CR-HMKP菌株感染患者60岁以上的占比、糖尿病患病率、死亡率比CR-非HMKP菌株感染患者高,且差异有统计学意义(P<0.05)。CR-KP菌株均为多重耐药(MDR)菌,CR-HMKP菌株对庆大霉素、妥布霉素、阿米卡星的耐药率比CR-非HMKP菌株低,且差异有统计学意义(P<0.05)。碳青霉烯酶基因以KPC为主(95.0%),rmtB基因在CR-HMKP菌株的检出率小于CR-非HMKP菌株,且差异有统计学意义(P<0.01)。CR-HMKP菌株中仅检出1株K2型菌株,rmpA、iutA、rmpA2三种毒力基因在CR-HMKP菌株的检出率均大于CR-非HMKP菌株,且差异有统计学意义(P<0.01)。PFGE和MLST显示CR-HMKP分为A、B型,A型(n=13,92.9%)均为ST11型,B型(n=1,7.1%)为ST65型。结论ICU血流感染患者分离的CR-HMKP菌株以ST11型为主,均为MDR菌,携带多种耐药基因与毒力基因,且患者死亡率高,应加强防控。CRHMKP与CR-非HMKP对氨基糖苷类抗生素的耐药情况有差别,临床在治疗过程中应区别对待。     

2015-2019年北京市西城区人源性单核细胞增生李斯特菌的分子特征分析

目的 研究北京市西城区人源性单核细胞增生李斯特菌(Lm)的血清学分型和分子特征.方法 对2015-2019年北京市西城区40株Lm临床分离株进行多重PCR血清学分型、脉冲场凝胶电泳分型(PFGE)和多位点序列分型(MLST).结果 40例病例中,14例患者为妊娠感染相关病例,其中7例为新生儿感染,均治愈,无死亡病例.非...     

安徽省马鞍山市市售臭干子中沙门菌的污染状况及其耐药性与分子流行特征研究

目的 了解安徽省马鞍山市市售臭干子及其生产原料中沙门菌的污染状况、血清型分布、耐药情况及分子流行特征,探讨不同的血清型、分子型与耐药性之间的关系.方法 2020年6-9月采集马鞍山市市售臭干子及其生产加工的辅料等,并对其中的沙门菌进行检测;用微量肉汤稀释法对菌株进行药物敏感性试验;使用脉冲场凝胶电泳和多位点序列分型方法...     

浙江省富阳区临床分离甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌的流行现状及耐药性分析

目的 分析浙江省富阳区临床分离的甲氧西林耐药金黄色葡萄球菌(MRSA)的检出率、基因分型及药敏特征等流行现状。方法 收集2013年11月至2014年10月两家医院临床标本中分离的金黄色葡萄球菌,对其中经头孢西丁纸片表型筛选确认的44株MRSA进行应用多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、spa、SCCmec基因分型,筛查pvl基因,应用脉冲场凝胶电泳的分型图谱进行菌株间的同源性分析。同时应用16种抗菌药物进行药敏实验。结果 44株MRSA,占金黄色葡萄球菌的16.4%(44/268)。两家医院流行的主要克隆不同,富阳中医骨伤医院以ST59-t437-SCCmecⅣ型为主,菌株间同源程度低;人民医院以ST5-t311-SCCmecⅡ型为主,部分菌株间同源程度高。检出3株pvl阳性菌株,占6.8%。药敏结果表示MRSA对内酰胺类普遍耐药,红霉素、克林霉素的耐药率高(85.0%),未发现万古霉素、利奈唑胺、替加环素的耐药株。结论 富阳地区MRSA的检出率相对较低,流行以ST5-t311-SCCmecⅡ型为主,两家医院MRSA流行的主要克隆有较大差异。MRSA的耐药情况不容乐观,多重耐药现象严重,不同基因型别的菌株其药敏结果有差异。     

尿路感染肠球菌的耐药性分析及临床分布特点

目的 了解引起尿路感染的肠球菌对常用抗菌药物的耐药情况,及其临床分布特点,为临床治疗肠球菌性尿路感染提供参考依据。 方法 对我院2008年1月至2012年12月间临床尿培养检出的肠球菌进行鉴定,采用K-B纸片扩散法进行药敏试验,用WHONET 5.6软件对药敏结果进行统计分析,用Excel表对患者的临床分布特点进行分析。 结果 从临床尿路感染患者中分离出的111株肠球菌中,屎肠球菌61株(55.0%),粪肠球菌47株(42.3%),其他种类肠球菌3株(2.7%)。药敏结果显示引起尿路感染的肠球菌对临床常用抗菌药物耐药严重,耐药率最低的是万古霉素。屎肠球菌对大多数抗菌药物的耐药率要明显高于粪肠球菌,但是氯霉素和四环素例外。肠球菌引起的尿路感染以50岁以上的患者为主,占86.5%;感染最多见于泌尿外科病房和重症医学科,分别占26.1%和22.5%。 结论 肠球菌已成为尿路感染的重要病原菌,屎肠球菌的比率已超过粪肠球菌,不同种类的肠球菌耐药性差别大,应加强对重点人群的监测和管理,并根据药敏结果、感染的严重程度合理选择适当的抗菌药物。