新冠病毒核酸检测试剂盒的性能分析与评价

目的：对4种新型冠状病毒核酸检测试剂盒的性能包括敏感性与特异性、最低检出限、精密度和分析特异性进行评价,为实验室选择新冠病毒核酸检测试剂盒提供参考,促进新冠肺炎病毒核酸检测技术的创新改进。方法：以20例新冠病毒确诊阳性和10例确诊阴性的咽拭子作为研究样本,经提取得到RNA后根据4种新冠病毒核酸检测试剂盒说明书对其进行检测,分析扩增结果,评估各试剂盒的差异。结果：检测结果显示4种试剂盒对30例研究样本的阴阳性判定情况不尽相同,其中a试剂盒的敏感性和特异性最高,均达到100%;3例阳性样本稀释到100倍时,c试剂盒只能检出其中的1例,而其他三种试剂盒能检出其中的2例,表明c试剂盒的检测敏感性低于其他三种;4种试剂盒在精密度实验中检测样本得到的Ct值的CV值都较接近,且都<10%;加入了8种常见的高浓度干扰物质的临界阳性样本经4种试剂盒检测,结果依然为弱阳性,说明无干扰;4种试剂盒检测5例含非目标病毒的临床样本,检测结果为阴性,即未发生交叉反应。结论：新冠病毒核酸检测试剂盒对低浓度核酸样本的检测能力有所差异,各试剂盒不同的检出限也造成了总体上的敏感性和特异性的差异,实验室在选择新冠病毒...     

咽拭子新型冠状病毒核酸检测的临床价值

 目的 了解某院新型冠状病毒肺炎（COVID-19）患者的临床资料及咽拭子检查结果,评价咽拭子新型冠状病毒（SARS-CoV-2）核酸检测的临床价值,为临床诊断COVID-19提供参考。方法 回顾性收集中南大学湘雅医院2020年1月23日—2月18日经SARS-CoV-2核酸检测确诊COVID-19患者病历资料,分析患者临床资料、病毒核酸检测的取样次数、取样方法、标本类型、检测手段等信息。结果 28例确诊患者平均年龄（43.78±14.46）岁,男女比例为2.5∶1,46.42%的患者有武汉/湖北旅居史,14.29%的患者与确诊COVID-19患者有密切接触史。患者临床表现以发热（78.57%）、咳嗽（53.57%）为主,实验室检查可见白细胞计数正常（71.43%）,淋巴细胞计数下降（53.57%）,肺部CT呈多发磨玻璃影（92.59%）及斑片影（70.37%）。28例确诊病例中,发病至确诊的中位时间为5.5 d。首次采集标本SARS-CoV-2检测阳性者18例（64.29%）,首次可疑阳性1例;首次阴性（包括可疑阳性）,第二次采集阳性者5例（17.86%）;前两次采集阴性,第三次采集阳性者2例（7.14%）;经四次检测阳性者1例（3.57%）;经五次检测后阳性者2例（7.14%）。鼻/口咽拭子采样26例（92.86%）,诱导排痰2例（7.14%）,经鼻咽拭子、咽拭子、痰标本RT-PCR确诊27例（96.43%）,痰标本NGS测序确诊1例（3.57%）。结论 COVID-19临床常表现有发热及干咳,但无特异性,仍需依赖SARS-CoV-2核酸检测才能确诊。咽拭子作为发热门诊首选的SARS-CoV-2核酸采集方式具有简便易行的优势,但检测结果呈阴性并不能排除SARS-CoV-2感染。     

病毒核酸检测信息系统在新冠疫情处置中的应用

目的 对新冠病毒核酸检测信息系统在新冠疫情处置中的应用进行探讨,分析现阶段系统在应用中存在的问题,为完善系统功能提供科学建议。方法 通过收集新冠疫情处置中病例相关信息,结合疫情处置中积累的方法和经验,探讨如何对系统中存储的核酸检测信息进行整理和利用。结果 新冠病毒核酸检测信息系统在新冠疫情调查和处置过程中可发挥快速评估社区全员筛查比例、判定密切接触者、评估阳性感染者传染风险和为不明感染来源阳性感染者提供溯源依据等作用。但在多系统对接、系统承载力、同空间的密接判定等方面存在一定局限性。结论 新冠病毒核酸检测信息系统不仅为大规模核酸筛查工作提供了强大的信息化技术支撑,还在疫情处置中发挥不可或缺的作用;应根据疫情处置的需要,及时对系统进行改造升级。     

新冠肺炎方舱核酸检测基地感染防控策略

方舱核酸检测基地是实现快速大规模核酸筛查、控制新型冠状病毒肺炎疫情的核心设施,但由于其检测机构众多、人员构成复杂、水平参差不齐,感染防控风险较大.在张家界航空工业职业技术学院核酸检测基地的实践中,工作人员探索出一套完整的感染防控方案和流程:基地选址、布局、路径规划,完善感染防控组织架构和制定感染防控制度,人员和路径的管...     

医疗机构新型冠状病毒核酸检测的生物安全管理实践

自2019年12月以来,以我国湖北省武汉市为中心暴发的新型冠状病毒肺炎成为重大突发公共卫生事件。新型冠状病毒核酸检测结果作为确诊依据,急需有条件的临床机构开展检测项目。通过对医疗机构快速开展新型冠状病毒核酸检测工作、做好生物安全管理实践的总结,文章认为严格执行各项规章制度、进行实地演练及培训、注重细节管理,是做好生物安全管理、避免在院内产生次生生物安全危害的有效手段。     

新型冠状病毒感染者核酸和抗体检测结果分析

目的了解新型冠状病毒(novel coronavirus 2019,2019-nCoV)感染者不同时期、不同类型标本中病毒核酸和抗体的检测情况,为完善新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)诊疗和防控方案提供科学依据.方法2020年2月26-27曰采集娄底市71例新冠肺炎确诊病例和25例无症状感染者的粪便、血液和咽拭子,应用R...     

从一起新冠病毒灭活疫苗成分污染标本案例分析新冠病毒核酸检测初筛阳性的快速复核

目的 对一起新冠肺炎防控重点单位人员标本新冠病毒核酸检测初筛阳性事件调查处置进行分析,为初筛阳性快速复核提供参考。 方法 制定初筛阳性定义,将复核内容划分为实验室检测复核和流行病学调查复核,并分析、探讨复核结果的判定。 结果 实验室检测复核结果:邵阳市疾病预防控制中心对原始标本的审查结果与初筛结果一致,CT值大于35;重新采集初筛阳性者的标本进行检测,全部为阴性。流行病学调查复核结果:标本在采集过程中使用的治疗推车15 d前曾被用于接种新冠病毒灭活疫苗,该治疗推车使用后未消毒,一直闲置至本次采样前;调查中对治疗推车表面采样进行新冠病毒核酸检测,结果为阳性(CT值为34.2);此外采样人员在采样过程中无菌操作不规范(剪刀剪断拭子后直接放置在治疗推车上),推测原始标本极可能被新冠病毒灭活疫苗成分污染。综合实验室检测复核和流行病学调查复核对本起初筛阳性事件予以排除。 结论 明确复核流程,实验室检测复核和流行病学调查复核同时开展,有利于加快初筛阳性复核速度;制定复核结果的判定依据,可为类似事件的处置和初筛阳性人员明确诊断提供参考。     

郴州市39例新型冠状病毒肺炎确诊病例病毒核酸检测结果分析

目的 分析郴州市39例新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)确诊病例不同时期不同标本的新型冠状病毒核酸检测情况,为新冠肺炎临床诊疗和管理提供科学依据. 方法 以郴州市新冠肺炎疫情期间确诊的39例新冠肺炎病例为研究对象,收集其从确诊、住院诊疗到院后康复管理过程中新型冠状病毒核酸检测的相关信息,描述不同阶段、不同标本的检测结果....     

新型冠状病毒肺炎病例痰标本和鼻咽拭子标本病毒核酸检测效果比较

目的比较新型冠状病毒肺炎(COVID-19)病例的下呼吸道标本(痰)和上呼吸道标本(鼻咽拭子)病毒核酸的检测效果。方法采用实时荧光PCR方法,分别检测5例COVID-19病例同一时间采集的痰标本和鼻咽拭子标本中新型冠状病毒ORF1ab基因、N基因,并对检测结果进行比较。结果 5例COVID-19病例痰标本核酸检测ORF1ab基因、N基因的CT值低于鼻咽拭子,扩增曲线信号优于鼻咽拭子。结论 COVID-19病例同一时间痰标本病毒载量高于鼻咽拭子标本,核酸检测效果优于鼻咽拭子。     

核酸快速检测系统在新型冠状病毒检测中的应用评价

目的:探讨核酸快速检测系统在新型冠状病毒（SARS-CoV-2）检测中的性能与应用评价。方法:收集北京市疾病预防控制中心和中日友好医院检验科2020年2至7月的临床样本,评价核酸快速检测系统对SARS-CoV-2检测的敏感度、特异度、抗干扰能力、精密度以及临床样本检测符合率。分析敏感度的评价通过检测浓度梯度稀释的SAR...     

新型冠状病毒核酸检测样本DNA污染鉴别方法研究

目的 采用不同实时荧光PCR方法检测各类型DNA污染模拟样本,分析检测方法性能,为在新型冠状病毒(简称新冠病毒)核酸检测中鉴别DNA污染提供依据。 方法 取实验室保存的新冠病毒RNA核酸样本和新冠病毒阳性质控品(含病毒序列的质粒样本),按不同比例混合,并进行梯度稀释,制成模拟样本。分别使用实时荧光RT-PCR、灭活逆转录酶前加样并去除RT步骤的PCR(PCR Set 1)和灭活逆转录酶后加样并去除RT和灭活步骤的PCR(PCR Set 2)三种不同方法,使用同一型号设备对同一批模拟样本进行检测。记录并分析检测结果,确定最佳的DNA污染判断方法。 结果 新冠病毒RNA核酸样本中,相比实时荧光RT-PCR,PCR Set 1下所有样本的Ct值增高2-4个循环,PCR Set 2中除原始样本N基因阳性外,均为阴性。新冠病毒DNA污染样本三种方法检测Ct值无明显差异。含等量DNA污染的混合污染样本和含梯度DNA污染的混合污染样本三种方法检测显示Ct值存在差异。三种方法检测不同新冠病毒基因,变化规律无明显差异。 结论 PCR Set 1和PCR Set 2两种方法均可用于鉴别DNA污染,特别是PCR Set 2方法对各浓度的DNA污染均有较好的区分能力。     

2009年-2011年汉中市流感病毒核酸检测结果分析

目的:分析汉中市2009年-2011年流感病毒核酸检测结果,为流感的预防控制提供科学依据。方法:对国家级流感监测哨点医院送检的流感样病例鼻咽拭子标本采用Real-time RT-PCR方法进行检测。结果:共检测标本896份,检出流感病毒核酸阳性标本236份,总阳性率为26.34%。流感病毒的感染性无性别差异(P>0.05),有城乡差异(P<0.05),各年龄组阳性率有差异(P<0.05)。结论:汉中市2009年-2011年流感主要出现在冬春季,2009年11月-2010年1月、2011年1月-2011年2月以甲型H1N1流感病毒为优势毒株,2010年及2011年的3月-2011年4月以B型流感病毒为优势毒株,H3亚型流感病毒在9月至次年3月以散发的形式存在。     

咽拭子、鼻拭子、痰液中SARS-CoV-2核酸检测结果一致性及检出率分析

目的　通过对不同类型标本严重急性呼吸综合征冠状病毒2（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS-CoV-2）核酸检测结果的一致性及检出率分析,明确检测结果较优的标本类型。方法　回顾分析郑州市疾病预防控制中心自开展SARS-CoV-2核酸检测以来所有同时采集自同一被检者的不同种类的标本核酸检测结果,利用McNemar χ2检验分析不同标本病毒核酸阳性检出率的统计学差异;用kappa检验分析不同标本核酸检测结果的一致性。结果　本研究共有 61例被检者同时进行2种及以上标本的核酸检测,其中检测咽拭子标本158人次,痰液标本144人次,鼻拭子标本35人次;ORF1a/b基因和N基因同时检出率最高的为痰液标本（71.5%）,其次是鼻拭子标本（34.3%）,咽拭子标本检出率最低（29.1%）。同时进行痰液标本和咽拭子标本检测的有144人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为75.0%、33.3%, N基因检出率分别为89.6%、42.4%,差异均有统计学意义（P均＜0.05）,ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4）,N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0）,痰液标本病毒核酸阳性检出率明显高于咽拭子标本;同时进行痰液标本和鼻拭子标本检测的有22人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为63.6%、27.3%,N基因检出率分别为81.8%、40.9%,差异均有统计学差异（P均＜0.05）,ORF1a/b基因检出结果中2者间一致性差（k＜0.4）,N基因检出结果中2者间不存在一致性（k＜0）,痰液标本病毒核酸阳性检出率亦高于鼻拭子标本;同时进行鼻拭子标本和咽拭子标本检测的有35人次,鼻拭子标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本,2者ORF1a/b基因检出率分别为40.0%、25.7%,N基因检出率分别为51.4%、34.3%,但差异均无统计学意义（P均＞0.05）,一致性检验结果则表明2者一致性差（k均＜0.4）,因此2者在病毒核酸阳性检出率方面差异无统计学意义,但在核酸检出与未检出的结果方面存在差异,即检测结果可相互补充以提高检出率。结论　痰液标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本和鼻拭子标本,在人群筛查中3种标本检测结果可互相补充验证以减少漏诊。     

核酸检测及相关技术在食源性致病菌快速检测中的研究

传统的细菌分离、培养与鉴定由于需时较长,难以适应食源性疾病预防控制的需要。近年来,伴随着核酸检测技术的迅猛发展,各种能够快速检测食源性致病菌的方法相继诞生。本文就聚合酶链式反应及其衍生技术、核酸恒温扩增技术、寡核苷酸微阵列技术、免疫磁性细胞分离技术及DNA生物传感器技术在沙门菌、金黄色葡萄球菌、肠出血性大肠埃希菌等食源性致病菌快速检测中的应用研究进行综述。     

一起医疗机构环境新型冠状病毒核酸阳性事件溯源调查分析

目的  针对成都市一起医疗机构环境SARS-CoV-2核酸检测阳性事件,开展溯源调查并分析发生原因,探讨医疗机构环境SARS-CoV-2核酸监测模式及异常处置方案。方法  成都市和双流区疾病预防控制中心联合开展针对A医疗机构的调查,通过对A医疗机构相关影响因素进行流行病学调查,并采用SARS-CoV-2核酸检测试剂盒进行检测、开展二代测序检测溯源。结果  2021年1月18日―2021年1月20日A医疗机构采集环境标本62份,检出SARS-CoV-2核酸阳性标本30份(48.39%,30/62)。30份阳性标本根据采样地点分为公卫楼(9份)和综合楼(21份),公卫楼标本的ORF1ab基因Ct值低于综合楼,差异有统计学意义(t=2.452, P=0.036);根据标本性质分为外环境涂抹样(24份)和清洁工具涂抹样(6份),外环境涂抹样的N基因Ct值低于清洁工具涂抹样,差异有统计学意义(Z=-2.204, P=0.028)。经基因测序分析,本次检出的SARS-CoV-2核酸阳性环境标本序列与SARS-CoV-2疫苗高度同源(＞99.9%)。结论  本次A医疗机构的SARS-CoV-2核酸环境阳性是由于SARS-CoV-2疫苗接种过程中疫苗安瓿瓶破损,导致公卫楼接种室被污染,再经由清洁工人通过清洁工具扩散至发热门诊及综合楼等院内环境。随着SARS-CoV-2疫苗接种工作推进,医疗机构接种区域疫苗液环境污染发生概率大,因此需细化具体实施方案,科学有序开展疫苗接种,减少社会影响。     

急性重度苯酚中毒致心脏骤停1例报告

报道1例急性重度苯酚中毒致心脏骤停,经及时清洗患肢、心肺复苏、连续性静脉-静脉血液透析(CVVHD)联合血液灌流(HP)等对症支持治疗后恢复良好的病例,为该类毒物中毒临床急救提供参考。