肺腺癌中FAT1的表达及其与免疫细胞浸润关系的研究

背景与目的 肺癌是癌症相关死亡的主要原因。非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer, NSCLC）是肺癌最常见的病理分型,其中又以肺腺癌占比最高。非典型性钙黏蛋白1(FAT atypical cadherin 1, FAT1)是一种受体样蛋白,在肺腺癌中存在高频率突变,其编码的蛋白在细胞黏附、细胞增殖、分化等过程中发挥着重要的作用。本研究旨在研究FAT1在肺腺癌中的表达及与免疫浸润的关系。方法 通过下载癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）和基因型-组织表达（Genotype-Tissue Expression, GTEx）相关数据,获得513例肺腺癌样本、397例癌旁样本的基因表达水平及相关临床信息。分析肺腺癌组织中FAT1基因m RNA表达水平以及FAT1基因的表达与肺腺癌患者的预后关系,通过通路富集分析探索FAT1基因调控的相关信号通路。利用免疫蛋白印迹检测FAT1在肺上皮细胞和不同肺癌细胞系中的表达差异,免疫组织化学染色法被用于检测FAT1在肺癌和癌旁组织中的表达。结果 14%的肺腺癌患者中存在FAT1基因突变;TC...     

MAD2L1在肺腺癌中的表达及对免疫微环境的影响

目的 探讨MAD2L1在肺腺癌组织中的表达对患者预后及免疫微环境的影响。方法 通过TCGA和GEO数据库分析在肺腺癌组织及正常肺组织样本中MAD2L1的表达差异，生存分析评价其表达水平与患者预后的关系，StarBase数据库构建肺腺癌miRNA-MAD2L1调控网络，分析肺腺癌组织中MAD2L1的表达与免疫细胞浸润的关系。结果 肺腺癌组织中MAD2L1表达上调且MAD2L1高表达与肺腺癌的病理分期、淋巴结转移显著相关，MAD2L1表达水平高的肺腺癌患者预后较差，miR-101-3p/MAD2L1轴被确定为MAD2L1在肺腺癌中最有潜力的上游调控相关途径，MAD2L1表达水平与肿瘤免疫细胞浸润和免疫检查点表达呈显著相关。结论 MAD2L1在肺腺癌组织中高表达，与肺腺癌不良预后及肿瘤免疫浸润相关，可作为肺腺癌患者治疗的潜在靶点。     

肺腺癌m6A甲基化调控因子相关预后风险模型的构建及临床意义

目的 构建基于N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)甲基化调控因子的肺腺癌预后风险模型,为肺腺癌的预后评估提供科学依据。方法 从TCGA数据库下载mRNA表达和临床数据。使用R软件对24种m6A甲基化调控因子进行差异表达分析。利用单因素Cox回归分析初步筛选出与生存相关的m6A调控因子,在此基础上通过Lasso回归进一步筛选纳入模型的变量,将Lasso回归得到的m6A调控因子用于构建Cox回归模型并计算每个样本的风险评分。qRT-PCR检测模型基因HNRNPC及IGF2BP1在正常肺上皮细胞(REAS-2B)及肺腺癌细胞株(A549、H1299、PC9)中的表达。采用TCGA数据库中配对组织的差异分析检测模型基因在肺腺癌及正常肺组织的差异表达。使用Kaplan-Meier生存曲线及ROC曲线对模型效能进行评估。通过热图分析不同风险组的临床特征,并结合其他临床参数进行单因素和多因素Cox回归分析对风险模型的独立预后性进行检验。结果 19个m6A甲基化调控因子在肺腺癌和正常组织中显著差异表达。单因素Cox回归分析发现4个肺腺癌生存显著相关的m6A调控因子(P＜0.01),进一步采用Lasso回归联合Cox回归算法构建了包含2个基因(IGF2BP1、HNRNPC)的预后风险模型。qRT-PCR结果显示HNRNPC和IGF2BP1相对表达量在肺腺癌细胞株A549、H1299和PC-9中高于正常肺上皮细胞REAS-2B,差异具有统计学意义(P＜0.01)。TCGA数据库的59对肺腺癌及相邻的正常肺组织的匹配差异分析发现HNRNPC和IGF2BP1在肺腺癌中表达高于正常肺组织,差异具有统计学意义(P＜0.001)。生存曲线分析显示相比低风险组患者,高风险患者总体生存期明显降低(P＜0.01)。ROC曲线结果表明模型可以较好地预测肺腺癌患者预后(AUC=0.724)。多因素Cox回归分析显示该预后风险模型可作为独立预后因素(HR=2.357,P＜0.001)对肺腺癌患者的预后进行预测。结论 本研究构建了基于m6A甲基化调控因子的预后风险评估模型,且该模型具有较好的预测能力,对制定合理及有效的个体化治疗方案具有潜在的参考价值。     

长链非编码RNATTN-AS1 在肺腺癌中的表达及其临床意义

目的：研究肺腺癌组织中长链非编码RNA（long non-coding RNA，lncRNA）肌联蛋白反义RNA1(titin antisense RNA 1，TTN-AS1)的表达情况，并分析其与肺腺癌患者临床病理特征和预后的关系。方法：使用TCGA数据库对肺腺癌数据集中TTN-AS1 的表达情况进行分析；收集在2014 年1 月至2015 年1 月期间在河北医科大学第四医院胸外科行肿瘤切除并经病理证实的52 例肺腺癌患者肿瘤组织及其相应癌旁组织标本，使用qPCR检测其TTN-AS1 的表达水平并分析其与患者临床病理特征的相关性，生存分析探讨其在患者预后中的临床意义。结果：TCGA数据库分析和qPCR检测结果均显示，TTN-AS1 在肺腺癌组织中的表达水平显著高于癌旁组织（均P<0.01）。TTN-AS1 的表达与肺腺癌患者的TNM分期和淋巴结转移相关联（均P<0.05），而与患者性别、年龄、肿瘤侵犯范围无关联（P>0.05）。Kaplan-Meier 单因素分析结果显示，高表达TTN-AS1 较低表达TTN-AS1 的肺腺癌患者术后DFS和OS显著缩短（均P<0.01）。Cox 比例风险回归模型分析结果显示，肿瘤高侵犯范围、阳性淋巴结转移和TTNAS1高表达是影响患者术后PFS 和OS的独立危险因素（P<0.01）。结论：TTN-AS1 在肺腺癌组织中高表达，与患者TNM分期、淋巴结转移以及与患者较差的DFS 和OS 密切关联（均P<0.05），高表达TTN-AS1 可能是提示肺腺癌患者预后不良的生物标志物。     

P2RY6在非小细胞肺癌中的表达和临床意义分析

  目的  探讨P2RY6在非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）患者中的表达及临床意义。  方法  在基因表达集（Gene Expression Omnibus,GEO）和癌症基因组图谱计划（The Cancer Genome Atlas Program,TCGA）数据库中获取多个NSCLC、肺腺癌和肺鳞癌的基因表达以及临床信息数据集。使用非参数检验分析癌组织与邻近正常组织的P2RY6表达水平差异,并且通过免疫组织化学研究肺鳞癌及肺腺癌组织和正常组织的P2RY6蛋白表达情况。使用χ2检验分析P2RY6表达与肺腺癌、肺鳞癌患者临床特征之间的相关性。使用Kaplan-Meier方法和Log-rank检验评估肺腺癌和肺鳞癌P2RY6表达水平与总生存期和无进展生存期之间的关系。使用Cox比例风险回归模型进一步评估P2RY6表达量对肺鳞癌患者总生存期和无进展生存期的预测效能。  结果  P2RY6在NSCLC、肺腺癌和肺鳞癌中均高表达。在肺腺癌患者中,P2RY6表达与生存无关,而与性别有关。在P2RY6高表达的肺鳞癌患者中,总生存期和无进展生存期较短,P2RY6高表达是独立危险因素。  结论  P2RY6与肺鳞癌患者的生存相关,P2RY6高表达预示着肺鳞癌患者总生存期与无进展生存期较短,是预后不良的独立危险因素。      

SHOX2和RASSF1A基因启动子区甲基化检测在早期肺腺癌筛查和诊断中的应用价值

目的探讨SHOX2和RASSF1A基因启动子区甲基化检测对早期肺腺癌筛查及诊断的价值。方法下载癌症基因组图谱(TCGA)数据库中471例肺腺癌患者的mRNA测序数据及相应的413例甲基化数据分别计算两基因启动子区甲基化水平, 分析正常肺组织与肿瘤组织的甲基化水平差异。回顾性分析2018年1月至2019年1月南京大学医学院附属鼓楼医院接受手术的54例早期肺腺癌及31例肺良性肿瘤患者临床资料, 检测肿瘤组织及正常肺组织(距肿瘤>5 cm)(称为:临床样本)SHOX2及RASSF1A甲基化状态, 以任一基因启动子区甲基化阳性为两基因联合甲基化阳性。以病理诊断为金标准, 绘制受试者工作特征(ROC)曲线, 分析基因甲基化阳性诊断早期肺腺癌的效能。筛选出石蜡样本中肿瘤细胞比例>80%的患者, 对其肿瘤组织及正常肺组织进行mRNA高通量测序。分析两基因甲基化阳性与患者临床病理特征的关系, 采用Spearman法分析临床样本和TCGA数据库样本中两基因启动子区甲基化水平与mRNA表达水平的相关性。采用基因集变异分析(GSVA)法分析两基因甲基化阳性临床肺腺癌样本和对应的甲基化阴性肺腺癌样...     

ANGPT1基因在肺腺癌组织中的表达及其预后价值分析

目的:探索血管生成素1（angiopoietin 1,ANGPT1)在肺腺癌组织中的表达及预后意义。方法:从癌症基因组图谱(TCGA)数据库收集肺腺癌和肺鳞癌数据,并下载ANGPT1基因表达谱资料及临床信息资料。采用t检验明确ANGPT1在肺癌组织和正常组织中的表达差异,χ2检验分析ANGPT1基因表达与肺腺癌患者临床病理特征的相关性,Log-rank检验进行生存分析;利用基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis,GSEA）方法,预测肺腺癌中可能受ANGPT1调控的相关通路。结果:ANGPT1基因在肺癌组织中低表达;其表达水平与T分期（P=0.013)呈负相关;ANGPT1低表达的肺腺癌患者预后明显差于高表达患者（P=0.006）,是影响肺腺癌预后的独立保护因素(P＜0.05)。GSEA结果显示,ANGPT1可能通过调节G2M检查点、DNA损伤修复、凋亡、mTOR信号、MYC信号、有丝分裂纺锤体等细胞增殖相关通路影响肺腺癌的发生发展。结论:ANGPT1是肺腺癌的独立预后保护因素,可能成为肺腺癌的潜在预后标志物和治疗靶点。     

肝细胞癌m6A相关免疫基因预后模型构建及DDX1在肝细胞癌中的作用

目的 筛选肝细胞癌中N6-甲基腺苷(m6A)相关免疫基因构建预后模型,并探讨其关键基因DDX1在肝癌细胞中的作用。方法 本研究选取癌症基因组图谱(TCGA)数据库中368例肝癌样本数据作为训练数据集,基因表达综合数据库(GEO)GSE 14520数据集中242例肝癌样本数据作为验证数据集,并基于表达相关性进行m6A相关的免疫基因筛选。通过LASSO Cox回归模型筛选与预后相关的m6A免疫基因,并构建风险评分(RS)模型。根据RS中位数值,分别将训练集和验证集中所有样本分为高与低风险组,Kaplan-Meier法评估高低风险组的生存预后差异。使用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测肝癌细胞系(HuH-7、SK-HEP-1、PLC/PRF/5和SNU-449)以及人正常肝细胞系THLE-2中筛选的关键基因表达水平;挑选表达变化较显著的基因,运用功能加强和缺失实验对其功能进行细胞验证。one-way ANOVA法比较多组间统计学差异,其中两两比较采用Tukey法。结果 基于共表达分析共获得130个m6A相关免疫基因,最终筛选了5个基因(DDX1、HDAC1、HDAC2、NRAS和PLK...     

肺腺癌CASZ1表达临床意义GEO及TCGA数据库资料分析

目的 CASZ1在多种肿瘤中异常表达,并参与肿瘤的发生发展,但其在肺腺癌中的表达及临床意义罕见报道。本研究旨在探讨CASZ1表达水平与肺腺癌临床病理特征和预后的关系。方法通过基因表达谱动态分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库探讨CASZ1在33种肿瘤中的表达情况。通过基因表达综合(Gene Expressi on Omnibus,GEO)数据库及癌症和肿瘤基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库获得CASZ1在肺腺癌中的表达数据及相关病理参数,分析CASZ1表达水平与肺腺癌患者临床病理特征和总生存期(overall survival,OS)的关系,并通过免疫组化验证CASZ1蛋白在肺腺癌中的表达。通过TCGA数据库获得CASZ1在肺腺癌中的甲基化水平,分析肺腺癌中CASZ1表达失调的可能机制。采用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测CASZ1相关的基因通路。结果 GEPIA数据库分析结果显示,与正常组织相比,在11种肿瘤中CASZ1表达水平下调,在2种肿瘤中表达上调。在TCGA及GSE43458、GSE118370和GSE10072既往吸烟、吸烟及从未吸烟数据集中,CASZ1表达水平在肺腺癌组织中均下调,差异有统计学意义,均P<0.001。免疫组化结果提示,CASZ1蛋白在肺腺癌组织中表达也下调,t=5.969,P<0.001。TCGA及GSE68465数据集结果提示,CASZ1基因低表达组预后差于高表达组(χ^2=6.923,P=0.009;χ^2=11.175,P=0.001)。在肺腺癌组织中,CASZ1表达水平与6个甲基化位点(cg01551133、cg08885197、cg20288000、cg14170597、cg22728186和cg20329303)关联(P<0.001),其中cg01551133、cg14170597和cg22728186高甲基化组生存期短于低甲基化水平组(χ^2=11.290,P=0.001;χ^2=12.901,P<0.001;χ^2=7.083,P=0.008)。GSEA结果提示,CASZ1低表达样本富集在G2M检查点(P<0.001,FDR<0.001)、E2F信号通路(P<0.001,FDR<0.001)等基因集。结论肺腺癌中CASZ1表达水平下调,其甲基化水平升高可能是CASZ1失调的潜在机制,CASZ1低表达提示肺腺癌患者的预后差,可作为肺腺癌患者治疗的潜在靶点。     

PD-1/PD-L1抑制剂联合治疗在癌症免疫治疗中的研究进展

程序性死亡蛋白-1(programmed cell death-1,PD-1)是一种免疫检查点的负性调控因子,通过与其配体PD-L1/PD-L2结合,抑制T细胞的免疫功能,而PD-1抑制剂则可恢复免疫系统的抗肿瘤作用。较其他治疗手段而言,PD-1抑制剂有显著的临床疗效,然而其仍然存在不足,即目前仍有很大一部分癌症患者对PD-1抑制剂治疗是无效的。研究表明联合治疗可改善PD-1抑制剂单药治疗的有效率。联合治疗包括联合免疫检查点抑制剂、放疗、化疗、癌症疫苗和其他癌症治疗方法。FDA已批准了PD-1抑制剂联合CTLA-4阻断剂治疗,其抗肿瘤效率与肿瘤微环境以及免疫相关因子有关,但关于免疫系统,特别是T细胞对肿瘤阳性响应率的潜在作用机制研究甚少。本文将综述免疫检查点PD-1抑制剂的临床疗效以及其影响因素、作用机制以及PD-1抑制剂联合其他治疗的研究现状。     

UHRF1通过调控细胞自噬抑制肺腺癌细胞增殖的分子机制研究

目的 探讨泛素样含PHD和环指结构域1(Ubiquitin like with PHD and ring finger domains 1, UHRF1)在肺腺癌(Lung adenocarcinoma)细胞的增殖、自噬中的作用及其潜在机制。方法 通过生物信息学网站(TCGA)检测UHRF1在肺腺癌组织中的表达。qRT-PCR和Western blot检测肺腺癌细胞系(PC-9、A549和H1299)以及人支气管上皮细胞(16HBE)中UHRF1的表达。转染UHRF1-shRNA后, 采用CCK-8、克隆形成以及Ki-67检测肺腺癌A549细胞活性和增殖能力的改变;蛋白免疫印记检测自噬相关LC3-I/II、Beclin-1蛋白以及增殖相关蛋白CDK6、Rb和PCNA蛋白的变化;透射电镜观察敲除UHRF1后A549细胞中对于自噬小体的影响。结果 在肺腺癌患者组织中UHRF1表达明显高于癌旁组织, 而相对于正常的支气管上皮细胞16HBE, 肺腺癌细胞系A549与H1299中UHRF1的mRNA和蛋白水平均明显升高。此外, CCK-8法和克隆形成实验表明沉默UHRF1能够降低肺腺癌细胞系A549的生长效率。Ki-67免疫荧光法检测结果显示敲除UHRF1后A549细胞增殖能力相对于正常对照组明显降低。此外我们发现, 敲除UHRF1导致CKD6和PCNA蛋白水平相对于Control-siRNA组表达升高, 而Rb蛋白表达下调。我们同时还发现, 沉默UHRF1后能够提高LC3-II/LC3-I的比例, 诱导Beclin-1的表达上调。沉默UHRF1促进A549细胞中自噬小体的形成。结论 UHRF1在肺腺癌中高表达, 沉默UHRF1能够发挥抑制增殖的作用。而这种作用可能是通过促进细胞自噬产生的。     

DEPDC1在肺腺癌中高表达并促进肿瘤细胞增殖

背景与目的 肺癌是目前世界范围内造成死亡人数最多的癌症之一,而肺腺癌是其主要分型.DEPDC1(DEP domain containing 1)被证实与多数肿瘤的发生发展密切相关,DEPDC1在肺腺癌中过表达已被初步证实,本研究旨在探究DEPDC1的表达与肺腺癌临床预后的关系,对DEPDC1作为肺腺癌潜在生物标志物和治...     

Krüppel样转录因子3在肺腺癌中表达的意义

  目的  探讨Krüippel样转录因子3(Krüippel-like factor 3, KLF3)在肺腺癌中的表达及其与临床特征的关系, 为探索KLF3在肺腺癌中的作用提供依据。  方法  荧光定量PCR及Western blot分析KLF3的mRNA及蛋白在肺腺癌细胞株中的表达。收集72例肺腺癌患者的肿瘤组织标本, 免疫组织化学法分析KLF3在肺腺癌组织中表达并分析KLF3表达与患者临床特征的关系。  结果  KLF3在肺腺癌细胞株中表达下调。大部分肺腺癌组织中KLF3低表达(50/72), 其表达主要定位于胞浆及胞核内。KLF3表达与肺腺癌临床病理分期(P < 0.000 1)及T分期(P=0.004)、N分期(P < 0.000 1)、M分期(P < 0.000 1)明显相关。  结论  KLF3可能是一个重要的肺腺癌抑癌基因, 并有望成为新的抗肿瘤治疗靶点。      

肺腺癌组织HDAC1、HDAC5和E-cadherin表达及相关性研究

目的检测组蛋白去乙酰化酶1(HDAC1)、组蛋白去乙酰化酶5(HDAC5)和上皮型钙粘蛋白(E-cadherin)在肺腺癌组织中的表达,并分析三者表达的相关性。方法采用免疫组化SP法检测93例肺腺癌组织和48例癌旁组织中HDAC1、HDAC5和E-cadherin的表达情况。分析三者表达与肺腺癌临床病理特征的关系,以及三者表达的相关性。结果肺腺癌组织中HDAC1的阳性表达率为58.06%,高于癌旁组织的20.83%,差异有统计学意义(P<0.05);癌旁组织中HDAC5和E-cadherin的阳性表达率分别为66.67%、68.75%,均高于肺腺癌组织的48.39%、45.16%,差异有统计学意义(P<0.05)。HDAC1和E-cadherin表达与年龄有关(P<0.05),E-cadherin表达还与分化程度有关(P<0.05);HDAC5表达与肺腺癌临床病理特征均无关(P>0.05)。HDAC1分别与HDAC5、E-cadherin表达呈负相关(r=-0.224、r=-0.236,P<0.05);HDAC5与E-cadherin表达无明显相关性(r=0.159,P>0.05)。结论在肺腺癌组织中联合检测HDAC1、HDAC5和E-cadherin可能对判断预后、合理选择药物有一定指导意义。     

肺腺癌组织SIRT1表达及其临床意义

目的 沉默信息调节因子1 (silent mating-type information regulation 2 homolog 1,SIRT1)与多种肿瘤的发生发展密切相关,但与肺腺癌的关系尚未明确.因此本研究将重点探讨肺腺癌组织中SIRT1的表达水平与临床病理参数和预后的关系,阐明其在肺腺癌发生发展中的作用.方法 肺腺癌芯片购自上海芯超生物科技有限公司,包括75例癌组织和配对癌旁正常组织(距切缘≥2 cm).采用免疫组织化学染色法,检测肺腺癌组织芯片中75例癌组织及配对癌旁正常组织中SIRT1的表达.x2检验分析SIRT1表达与临床病理特征的关系;Kaplan-Meier法及Log-rank检验分析临床病理参数和SIRT1表达与总生存期(overall survival,OS)的关系;拟合多因素Cox模型,采用风险比(hazard ratio,HR)评价不同临床指标与死亡风险的相关性.结果 肺腺癌组织中SIRT1的表达高于癌旁正常组织,H-score评分均值分别为260和113,P＜0.001;肺腺癌组织中SIRT1的表达水平与患者的性别(P=0.232)、年龄(P=0.318)、淋巴结转移(P=0.377)、肺腺癌亚型(P=0.245)、远处转移(P=1.000)和TNM分期(P=0.216)无显著相关性,而与病理分级显著相关,P=0.029.SIRT1高表达组肺腺癌患者的死亡风险较低表达组显著增加,单因素显示,HR=3.991,95％CI为1.411～11.288,P=0.009;多因素回归分析显示,HR=4.388,95％CI为1.192～16.155,P=0.026.结论 肺腺癌组织SIRT1表达与病理分级显著相关,且SIRT1高表达提示肺腺癌预后较差.     

失巢凋亡相关LncRNAs在肺腺癌中的预后价值及免疫浸润分析

目的 探究失巢凋亡相关的长链非编码RNA(arlncRNAs)在肺腺癌中的预后价值和免疫浸润分析。方法 从TCGA数据库下载肺腺癌的RNA-seq数据及临床信息,从GeneCards和Harmonizome数据库获取失巢凋亡相关基因。通过共表达分析、差异分析和WGCNA分析,筛选与肺腺癌发生密切相关的差异表达的arlncRNAs。基于arlncRNAs构建预后风险模型,对其预测效能进一步验证。最后利用共识聚类识别肺腺癌失巢凋亡相关的分子亚型。结果 确定了7个预后arlncRNAs,其建立的预后风险模型、ROC曲线AUC值均大于0.7。生存分析和免疫浸润分析发现,低风险患者的总生存率较高,具有较高的免疫浸润,对低风险组患者可能有更好的免疫治疗效果。药物敏感性分析表明,高风险组患者对常用的化疗药更敏感。根据模型基因的表达,通过共识聚类确定了亚型C1和C2,C1显示较好的预后。结论 7个arlnc RNAs建立的预后风险模型能有效预测肺腺癌患者的预后。免疫相关和药物敏感性分析结果,为肺腺癌患者精确的个体化治疗提供参考依据。     

OLC1在肺鳞癌组织中的过表达与患者的不良预后相关

背景与目的 OLC1(overexpressed in lung cancer 1)是本实验室前期工作中筛选克隆出的一个新型肺癌相关基因.它在肺癌和其它恶性肿瘤中均有较高表达,并与食管鳞癌、卵巢癌、乳腺癌、结直肠癌患者的不良预后相关.本研究旨在检测OLC1在肺鳞癌(squamous cell carcinoma,SCC)和腺癌(adenocarcinoma,ADC)患者肿瘤组织中的表达情况,研究其与肺癌患者预后之间的关系.方法 分别对108例肺鳞癌和90例肺腺癌的癌组织进行免疫组织化学染色,检测OLC1蛋白的表达水平,分析OLC1的表达水平与临床特征及预后的关系.结果 OLC1在肺腺癌组织中的过表达率显著高于鳞癌(87.5%vs 55.3%,P<0.001).OLC1在癌组织中的过表达与肺腺癌患者的预后无显著相关性,与肺鳞癌患者的预后关系的单因素分析显示两者存在相关性(P=0.042),而多因素分析则显示OLC1过表达与鳞癌患者预后的相关性无统计学意义(P=0.05).结论 OLC1在肺腺癌组织中的过表达高于鳞癌,在癌组织中的过表达仅与鳞癌患者的不良预后相关,但不能作为影响预后的独立危险因素.     

CMTM6 在肺腺癌组织中的表达及其临床意义

[摘要] 目的: 检测人类趋化因子CMTM6在肺腺癌组织中的表达水平,探索其与患者临床病理特征和预后间的联系。方法: 选取苏州大学附属第三医院于2004年9月至2009年6月期间经病理学方法确诊为肺腺癌患者的癌组织和癌旁组织各86例,应用免疫组织化学法检测其中CMTM6 的表达水平。收集52 例肺腺癌确诊患者手术前后的血清及32例健康体检者的血清,采用ELISA检测手术前后外周血中CMTM6 和PD-L1的水平。采用卡方检验分析CMTM6表达情况与临床病理特征的关系,Kaplan-Meier 法及Log-rank检验分析患者生存数据。结果: CMTM6在肺腺癌组织中广泛表达,与相应癌旁组织比较,30%上调、70%无差异。CMTM6表达水平与临床分期、远处转移有关（均P<0.05）,与患者的年龄、性别、肿瘤大小、T分期无显著相关（均P>0.05）。Kaplan-Meier生存分析显示CMTM6表达上调患者的生存率显著低于表达不变者(P=0.014),Ⅲ期患者中CMTM6 上调者生存率显著低于CMTM6表达不变者(P=0.001)。Cox回归模型多因素分析显示,CMTM6 的表达状态是肺腺癌患者预后的独立危险因素。CMTM6 在肺腺癌术前术后及健康体检者3组间血清表达水平差异有统计学意义（P<0.05）,与患者肿瘤大小和年龄有关。Spearman相关性分析显示血清CMTM6和PD-L1表达水平显著相关（r=0.623,P<0.01）。结论: CMTM6是肺腺癌患者预后的独立危险因素,在肺腺癌发生发展中发挥重要作用,是潜在的抑癌基因。     

SEMA6D在肾透明细胞癌中的预后价值和分子机制探索

目的 探讨信号素-6D (SEMA6D)在肾透明细胞癌(KIRC)中的表达、临床预后价值及调节KIRC的相关分子机制。方法 首先通过USCS、TCGA数据库及临床试验研究SEMA6D在KIRC肿瘤组织和正常组织中的表达。接着,通过分层分析比较SEMA6D的表达与临床病理特征及启动子甲基化的关系。通过Cox比例风险回归模型分析SEMA6D在KIRC患者中的预后价值。利用LinkedOmics数据库研究SEMA6D调控KIRC的潜在分子机制。应用GSCALite数据库对SEMA6D及其互作蛋白进行了肿瘤通路活性分析。最后,使用CIBERSORT算法研究SEMA6D表达与免疫细胞浸润之间的相关性。结果 SEMA6D在多种肿瘤中差异表达并与患者预后相关(P<0.05)。SMEA6D的mRNA和蛋白表达水平在KIRC中下调(P<0.05)。KIRC中SEMA6D的mRNA表达和启动子的甲基化水平与组织学分级、病理分期和N分期有关(P<0.05)。单因素和多因素Cox回归分析显示,SEMA6D是KIRC患者总生存期(OS)的独立预后因素(P<0.05)。功能富集分析结果表明...     

基于TCGA数据库筛选和鉴定肺腺癌免疫治疗临床获益关键基因

目的 基于全基因组测序分析,探索影响肺腺癌免疫疗效预测的关键基因及其可能的机制。方法 选取癌症基因组图谱中肺腺癌数据集（MSKCC, Science 2015）为研究对象,根据免疫治疗疗效持续时间分为两组：持久临床获益组（durable clinical benefit, DCB）和非持久临床获益组（nondurable clinical benefit, Non-DCB）。分析两组之间基因突变谱的差异,进而探索影响肺腺癌免疫治疗的关键分子及潜在生物学功能。结果 基因突变谱在DCB组和Non-DCB组之间存在差异;进一步对DCB组基因突变谱研究,这些基因主要参与了Ca2+通道、Rap1、PI3K-Akt等相关信号通路;蛋白互作网络分析中,筛选出6个节点度最高的核心基因KRAS、PPP2CB、CDC20、DYNCLI2、BRCA1、AKAP9,其中CDC20、BRCA1等基因与肺腺癌患者预后相关。结论 DCB组涉及的关键核心基因有可能指导肺腺癌的免疫特征分型,对于更加精准的免疫治疗具有重要意义。CDC20和BRCA1有可能成为肺腺癌免疫治疗中潜在的治疗靶点。