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日本血吸虫(中国大陆株)成虫表达序列标签的获取及新基因的发现 总被引:4,自引:1,他引:3
运用表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)技术快速、经济地发现日本血吸虫(中国大陆株)新基因。方法 随机挑取日本血吸虫(中国大陆株)成虫cDNA文库单个重组克隆进行部分测序以获得EST,获得的EST通过BLAST程序同EMBL寄生虫数据库和GenBank数据库进行比较及同源性分析。结果 本研究共随机挑取日本血吸虫(中国大陆株)成虫cDNA文库单个重组克隆200个,获得了76个有EST价值的序列,其中7.9%为日本血吸虫已知序列,5.3%为日本血吸虫同源序列。曼氏血吸虫或其他生物的同源序列占有EST价值的序列的22.4%,未知序列占59.2%。在获得的76个有EST价值的序列中,66个成功在GenBank dbEST中登录。通过同源性分析,发现了一些令人感兴趣的基因。结论 EST方法有助于快速、经济地发现日本血吸虫(中国大陆株)成虫新基因。 相似文献
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日本血吸虫(中国大陆株)成虫表达序列标签的获取及新基因的发现 总被引:2,自引:1,他引:1
目的运用表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)技术快速、经济地发现日本血吸虫(中国大陆株)新基因.方法随机挑取日本血吸虫(中国大陆株)成虫cDNA文库单个重组克隆进行部分测序以获得EST,获得的EST通过BLAST程序同EMBL寄生虫数据库和GenBank数据库进行比较及同源性分析.结果本研究共随机挑取日本血吸虫(中国大陆株)成虫cDNA 文库单个重组克隆200个,获得了76个有EST价值的序列,其中7.9%为日本血吸虫已知序列,5.3%为日本血吸虫同源序列.曼氏血吸虫或其他生物的同源序列占有EST价值的序列的22.4%,未知序列占59.2% .在获得的76个有EST价值的序列中,66个成功在GenBank dbEST中登录.通过同源性分析,发现了一些令人感兴趣的基因.结论 EST方法有助于快速、经济地发现日本血吸虫(中国大陆株)成虫新基因. 相似文献
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日本血吸虫表达序列标签和新基因的获取和分析 总被引:3,自引:0,他引:3
目的分离、鉴定和分析日本血吸虫表达基因序列,为日本血吸虫病提供侯选疫苗分子和药物靶点。方法筛选日本血吸虫成虫 cDNA 文库,对重组阳性克隆进行测序以获取的 EST;对可能成为新基金的克隆进行步移法测序获取全长 cDNA,并进行生物信息学分析。结果共获得149个 EST,分析发现某些 EST 与血吸虫的生活史的不同阶段和不同性别序列有一定的同源性。共获取18个日本血吸虫新基因,大部分为管家基因,其中部分基因可作为日本血吸虫的侯选疫苗分析和药物靶点。结论EST 技术可用于快速、经济地发现日本血吸虫成虫新基因。 相似文献
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日本血吸虫(中国大陆株)表达基因的分离和EST序列测定 总被引:21,自引:3,他引:21
目的 运用表达标签技术(EST方法),从SjcDNA文库中分离、鉴定血吸虫表达基因序列。方法 应用EST方法,人SjcDNA文库中随机挑出单个重组克陲 PCR直接序列分析,通过互联网将获得的EST序列送入NCBIGenBank进行同源性检素,并将发现的未知基因EST序列送入NCBIdbEST以获得GenBank进入号。结果 分离了100个SjGenBank中已知的血吸虫基因序列,19个为未知基因序 相似文献
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日本血吸虫大陆株GST抗原 总被引:3,自引:1,他引:3
谷胱苷肽转移酶(GST)是以谷胱苷肽为共同底物的一组具有解毒功能的同工酶。国外研究证明血吸虫的GSTs含量丰富,是研究日本血吸虫疫苗的主要侯选抗原之一。有关日本血吸虫大陆株GST抗原的研究,作者曾在日本血吸虫24—26kDa和90kDa蛋白质“靶抗原”的抗原性研究,应用24—26kDa和90kDa蛋白质“靶抗原”免疫小鼠研制抗血吸虫“靶抗原”单克隆抗体,24—26kDa和90kDa蛋白质抗原用于血吸虫病诊断的可能性探讨,日本血吸虫24—26kDa抗原和重组Sj26抗原的抗原性和免疫原性比较研究等论文以及有关血吸虫疫苗研制的综 相似文献
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日本血吸虫中国大陆株23kDa膜蛋白的基因克隆与序列分析 总被引:2,自引:4,他引:2
本研究根据曼氏血吸虫疫苗候选分子Sm23的基因序列,设计了一对引物,并通过聚合酶链反应(PCR)基因克隆技术,从日本血吸虫中国大陆株cDNA文库中克隆出了中国大陆株23kDa膜蛋白基因。DNA序列分析表明,编码日本血吸虫中国大陆株Sj23膜蛋白的基因含有657bp,与曼氏血吸虫Sm23的核着酸有79.5%的同源性,而与日本血吸虫菲律宾株的Sj23的同源性为100%。该研究为发展Sj23多肽疫苗奠定了基础。 相似文献
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目的从日本血吸虫成虫cDNA文库中分离、鉴定和分析表达基因序列,为日本血吸虫病的防治提供侯选疫苗和药物靶点。方法构建日本血吸虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,将获取的表达序列标签(Expressed Sequence Tag, EST)登录GenBank;对某些感兴趣的序列进行步移法测序获取全长cDNA,并进行生物信息学分析和登录。结果随机挑取382 个阳性克隆进行测序,获得149个EST,同源性比较发现,部分序列与血吸虫的生活史的不同阶段和不同性别序列有一定的同源性。共获取18个日本血吸虫全长cDNA,大部分为管家基因,其中部分可作为日本血吸虫的候选疫苗分析和药物靶点。结论EST技术有助于快速、经济地获取日本血吸虫表达序列。 相似文献
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用表达序列标签(EST)法发现日本血吸虫新基因的研究 总被引:1,自引:0,他引:1
日本血吸虫基因组计划的研究有助于我们从多方面了解血吸虫这种复杂的多细胞生物 ,以促进抗血吸虫疫苗的研制 ,寻找新的杀虫药物以及研究血吸虫与宿主的关系。表达序列标签法 (EST)是一种快速筛选生物新基因的常用方法。本文运用这种技术对日本血吸虫 (中国大陆株 )成虫 c DNA文库进行随机挑选 ,提取噬菌体 DNA作模板 ,进行 PCR反应 ,将产物大于 50 0 bp c DNA插入片段测序 ,得到1 1 5个表达序列标签 (EST) ,其中有 75个新基因 ,并得到一些有重要功能 c DNA的克隆。材料和方法1 材料日本血吸虫 (中国大陆株 )成虫 c DNA文库由南… 相似文献
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应用定向克隆方法,将日本血吸虫虫卵cDNA片段重组入噬菌体载体λgt11Sfi-Not的EcoRⅠ和NotⅠ双酶切位点之间。所构建的基因表达文库的容量为1.07×107重组子。经含有IPTG及X-Gal的颜色选择平皿测定,初步提示重组效率达100%。 相似文献
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目的从日本血吸虫(Schistosoma japonicum)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新基因,为日本血吸虫病的防治提供候选疫苗和药物靶点.方法构建日本血吸虫成虫cDNA文库,随机挑取重组阳性克隆进行测序,对部分序列进行步移法测序获取全长cDNA,登录GenBank,利用BLAST程序对同源性高的基因进行核苷酸和氨基酸水平的同源性比较;并利用pcgene软件对其蛋白质结构进行初步分析.结果获得了1个日本血吸虫新基因普遍性结合酶E基因(ubiqui-tin-conjugating enzyme E,AY251608),长854bp,编码149个氨基酸,与人类普遍性结合酶E具有55%的同源性,编码蛋白的理论分子量为7.149 8 kDa,等电点为8.01;抗原表位可能位于氨基酸序列373~396处.结论步移法测序和生物信息学技术相结合有利于发现日本血吸虫新基因. 相似文献
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日本血吸虫磷酸丙糖异构酶小鼠免疫试验 总被引:8,自引:1,他引:8
目的:探讨从日本血吸虫大陆株成虫分离的天然磷酸丙糖异构酶抗原(SjcTPI)免疫小鼠后对尾蚴攻击感染的保护性作用。方法:采用丙酮沉淀法从日本血吸虫大陆株成虫中提取天然的TPI抗原,并以所提纯的SjcTPI抗原加福氏佐剂经皮下和肌肉注射免疫NIH小鼠,攻击感染后6wk收集小鼠血清并计数成虫负荷及肝、肠组织虫卵数。同时设有日本血吸虫成虫抗原(SWAP)免疫对照组和攻击感染对照组。结果:天然SjcTPI抗原免疫小鼠后减虫率为21.4%-25.0%,肝组织减卵率达57.8%-60.3%;ELISA法检测TPI免疫小鼠血清抗TPI抗体OD值明显高于对照组小鼠的OD值(P<0.05)。结论:天然的SjcTPI抗原具明显的免疫原性和抗原性,可以继续进行编码TPI基因的克隆与表达。 相似文献
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目的:从日本血吸虫虫卵文库中筛选并鉴定出与免疫诊断及免疫预防有关的基因克隆。方法:采用S.jSEA超免疫兔血清对日本血吸虫卵文库进行筛选。先去除抗大肠杆菌抗体,经三轮筛选得到12个阳性克隆,然后,用辅助噬菌体进行体内剪切,经抗菌素平板筛选含重组质粒的阳性菌落,每个菌落分为2份,一份进行PCR扩增以测定插入片段的大小。另一份用于制备纯质粒DNA模板,进行DNA序列测定,通过GCG软件对所得DNA序列与GenBank中的序列进行同源性比较。结果:共筛得12个阳性克隆,PCR后测得其长度大多为1.2kb,其中8个与S.j热休克蛋白70的基因同源,2个与S.j钙网蛋白同源,1个与S.mimmunophilin同源,1个与S.j23kDa蛋白同源。结论:本研究首次报道用抗SEA血清对日本血吸虫虫卵文库的筛选结果,所得的12个阳性克隆均为编码日本血吸虫免疫诊断及预防有关的基因。 相似文献
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旋毛虫感染鼠血清筛选日本血吸虫成虫cDNA文库 总被引:3,自引:0,他引:3
目的 探讨旋毛虫与血吸虫之间交叉免疫的分子机制,并寻找有效的日本血吸虫疫苗侯选分子。方法 以旋毛虫感染鼠血清为探针,筛选日本血吸虫成虫cDNA文库,对获得的阳性克隆插入片段进行PCR扩增。结果 共筛选出11个阳性克隆,其插入的cDNA片段大小在1.4-5.0kb之间,其中1.4kb片段2个,5.0kb片段9个。结论 获得的阳性在隆插入基因片段可能为编码旋毛虫与日本血吸虫共同的抗原基因,其表达产物可能有抗日本血吸虫感染的作用。 相似文献
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目的 从日本血吸虫 (Schistosomajaponicum ,Sj)成虫cDNA文库中获得并分析日本血吸虫新基因 ,为防治日本血吸虫病提供药物靶标或候选疫苗。 方法 构建日本血吸虫成虫cDNA文库 ,用序列标签法随机挑取重组阳性克隆进行测序 ,对部分序列进行步移法测序获取其全长cDNA ,并进行生物信息学分析和登录。 结果 获得了 1个日本血吸虫新基因 ,全长 14 3 9bp ,编码 44 3个氨基酸 ,与肝片形吸虫微管蛋白基因具有 79%的同源性。编码蛋白的理论分子质量为 7.2 198ku ,等电点为 9.12 ;抗原表位可能位于cDNA序列 3 73~ 3 96处。 结论 表达序列标签法、步移法测序和生物信息学技术有利于发现日本血吸虫新基因。 相似文献
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应用聚合酶链反应技术,从日本血吸虫(大陆株)23kD分子基因中扩增出其大亲水肽段的DNA序列,将此片段插入到表达载体pGEX-5X-1中进行表达,经IPTG诱导产生分子量约33.5kD的融合蛋白(GSTHD)。用FactorXa对融合蛋白进行切割获得纯化的大亲水肽段,Westernblotting分析表明,融合蛋白及大亲水肽段均能为血吸虫病人血清识别。 相似文献