德宏傣族景颇族自治州报告的HIV-1新感染者中耐药情况及其影响因素

目的了解云南省德宏傣族景颇族自治州(简称德宏州)新报告的艾滋病病毒(HIV)感染者中新近感染者HIV-1耐药情况及其影响因素,为HIV的预防和治疗提供参考依据。方法采用横断面的方法,对德宏州在2015-2018年期间报告的HIV感染者的首次确证剩余血浆,运用限制性抗原亲和力酶联免疫法(LAg-Avidity EIA)检测发现的新感染者,提取核酸并扩增HIV-1 pol基因片段。将pol基因片段序列提交斯坦福大学的耐药数据库,并根据2014年世界卫生组织耐药监测指南的推荐标准,确定耐药突变位点以及HIV毒株对抗病毒药物的敏感性。结果共有227例成功获得HIV-1 pol基因序列,其中HIV-1毒株C亚型为26.4%(60例),CRF01_AE亚型为21.1%(48例),CRF07_BC亚型12.3%(28例),CRF08_BC亚型6.6%(15例),URF占24.7%(56例),其他占8.8%(20例);HIV-1传播性耐药率为11.5%(26例),包括17例男性,14例农民,16例≤30岁,14例未婚,13例傣族,22例性传播,12例中国籍感染者。非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)和蛋白酶抑制剂(PI)耐药率分别为19例、12例和1例。HIV-1传播性耐药率中国籍为9.6%,缅甸籍为13.7%,两者之间差异无统计学意义(P=0.334)。有8例携带耐药位点K103N同时针对依非韦伦、奈韦拉平高度耐药。多因素Logistics回归分析结果显示,与C亚型相比,CRF08_BC亚型的HIV-1耐药风险更高[调整比值比(aOR)=5.88,95%可信区间(CI):1.16～29.71]。结论德宏州报告HIV感染者中新感染者的HIV-1传播性耐药率较高,应当继续加强德宏州传播性耐药的监测工作。     

广西柳州16～25岁HIV-1感染者中流行毒株亚型及耐药分析

目的通过对广西壮族自治区柳州市,2011-2013年艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)新近感染者毒株基因特征的研究,了解当地HIV毒株流行及耐药毒株发生传播的情况。方法采集当年新确证的、16~25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的血浆样本,共176份。提取病毒核糖核酸(RNA),通过扩增HIV-1 pol区片段,进行测序和耐药基因变异分析。结果 3年共获得pol区序列176条,主要以CRF01_AE为主(86.9%,153/176);其次也发现了少量CRF07_BC、CRF08_BC和B亚型。共有5例(2.8%,5/176)出现耐药突变,4例为异性性传播,1例为注射吸毒传播,其中1例针对蛋白酶类抑制剂(PI),3例针对非核苷类抑制剂(NNRTIs),另有2例针对核苷类抑制剂(NRTIs)发生耐药突变。结论当地主要流行毒株为CRF01_AE,广西柳州HIV-1新近感染者耐药传播目前处于低度传播水平,但仍要进一步加强对新近感染者的耐药监测和病人的治疗管理。     

239例治疗失败的HIV感染者HIV-1亚型及耐药分析

目的分析辽宁地区抗病毒治疗失败的艾滋病病毒(HIV)感染者HIV-1亚型特征及耐药情况。方法收集2018年接受抗病毒治疗满6个月且HIV-1病毒载量≥1 000拷贝/mL的治疗失败病例血浆样本239份,通过核酸提取、pol基因区扩增和测序,进行亚型分析及基因型耐药检测。结果 239份样本中,HIV-1亚型中CRF01_AE占75.7%,B亚型占10.9%,CRF07_BC占7.5%;有148例发现耐药位点突变,总耐药率为61.9%(148例);最常见的突变位点为G190、M184和K65,突变率分别为32.6%(78例)、30.1%(72例)和29.7%(71例);对蛋白酶抑制剂(PIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)及非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)的耐药率分别为5.9%(14例)、49.0%(117例)和59.0%(141例)。结论辽宁地区治疗失败的感染者HIV-1基因亚型以CRF01_AE为主,耐药突变率处于中等水平,但已出现蛋白酶抑制剂类药物耐药情况,需加强耐药监测及抗病毒治疗管理,以防止耐药毒株传播。     

2010-2013年新疆HIV亚型和耐药传播研究

目的通过对新疆艾滋病病毒(HIV)感染者的病毒基因序列分析,了解2010-2013年新疆HIV亚型和耐药传播情况。方法采集当年新报告的16~25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的血浆样本,提取病毒核糖核酸(RNA),通过扩增HIV-1 pol区片段,进行测序和耐药基因变异分析。结果 4年共获得pol区序列150条,主要以CRF07_BC为主(96.7%,145/150),共有3例出现耐药,分别针对非核苷类抑制剂(NNRTIs)和核苷类抑制剂(NRTIs)。耐药株主要出现在性传播人群中。结论各传播途径中仍主要流行CRF07_BC,新疆HIV-1耐药传播目前处于低度传播水平,但仍需进一步加强对感染者的耐药监测和病人的治疗管理。     

广西柳州16～25岁HIV-1感染者中流行毒株亚型及耐药分析北大核心

目的通过对广西壮族自治区柳州市,2011-2013年艾滋病病毒Ⅰ型（HIV-1）新近感染者毒株基因特征的研究,了解当地HIV毒株流行及耐药毒株发生传播的情况。方法采集当年新确证的、16~25岁未接受抗病毒治疗的HIV-1感染者的血浆样本,共176份。提取病毒核糖核酸（RNA）,通过扩增HIV-1 pol区片段,进行测序和耐药基因变异分析。结果 3年共获得pol区序列176条,主要以CRF01_AE为主（86.9%,153/176）;其次也发现了少量CRF07_BC、CRF08_BC和B亚型。共有5例（2.8%,5/176）出现耐药突变,4例为异性性传播,1例为注射吸毒传播,其中1例针对蛋白酶类抑制剂（PI）,3例针对非核苷类抑制剂（NNRTIs）,另有2例针对核苷类抑制剂（NRTIs）发生耐药突变。结论当地主要流行毒株为CRF01_AE,广西柳州HIV-1新近感染者耐药传播目前处于低度传播水平,但仍要进一步加强对新近感染者的耐药监测和病人的治疗管理。     

绍兴市HIV-1毒株的耐药变异研究

目的了解绍兴市1型艾滋病病毒(HIV-1)株的耐药变异情况。方法分析2013-2014年绍兴地区新确认未经抗病毒治疗的130例HIV-1感染者,以及2014年前抗病毒治疗满一年且病毒未抑制的34例感染者样本,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)和巢式-聚合酶链式反应(Nested-PCR)方法扩增HIV-1的pol基因区全长,参照美国斯坦福大学HIV耐药数据库,确定HIV亚型及耐药突变位点。结果 34例新诊断HIV感染者及33例病毒未抑制感染者的样品检测到耐药突变,主要亚型为CRF01_AE和CRF07_BC。仅在病毒未抑制感染者中检测到针对核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)的耐药突变,主要类型有M184V(42.42%)、K70R(15.15%)、D67N(12.12%)。在新确认感染者和病毒未抑制感染者两组人群中,均检测到针对非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药的突变,主要类型有V179D/E/T(10.00%和18.18%)、K103N(2.22%和21.21%);在病毒未抑制感染者中还有Y181CY(21.21%)、V90I(12.12%)、G190A(15.15%)。在反转录酶(RT)区和整合酶(IN)区仅检测到少量次要耐药突变。结论绍兴市HIV经抗病毒治疗后易产生耐药性,部分可在新感染人群中传播,应对HIV耐药变异加强监测。     

温州地区未治疗AIDS病人的HIV毒株耐药基因变异研究

目的对温州地区未治疗艾滋病(AIDS)病人体内艾滋病病毒(HIV)毒株耐药基因的突变情况进行调查分析,了解该地区AIDS病人的本底耐药情况。方法对50例未接受抗病毒治疗的AIDS病人HIVpol区的蛋白酶(PR)全长和部分反转录酶(RT)基因进行扩增、脱氧核糖核酸(DNA)测序、亚型鉴定,并与国际HIV耐药数据库比对分析。结果共获得38份有效序列,根据pol区亚型分析发现,CRF01_AE占36.8%(14例),CRF07_BC重组占36.8%(14例),C亚型占18.4%(7例),B亚型占7.89%(3例)。未检出针对蛋白酶抑制剂(PIs)、核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)的耐药病例。针对非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)检出3例耐药病例,突变类型分别为V179D、E138A和K103N。同时,2015年温州HIV耐药毒株的传播水平5%,处于低传播水平。结论对于未经抗病毒治疗组,耐药基因型以CRF01_AE重组、BC重组为主,HIV耐药毒株在温州仍处于低度传播水平,发现一个重要耐药基因突变位点是K103N。     

2008-2013年福建省HIV-1毒株耐药基因变异研究

目的 分析2008-2013年福建HIV-1毒株耐药基因变异情况。方法 收集2008-2013年福建省病毒载量大于1 000 copy/mL艾滋病患者,采用自建HIV-1基因型耐药检测进行耐药检测和分析。结果 共收集226例病毒载量大于1 000 copy/mL样本,平均载量值1.62×10⁵copy/mL;124例样本扩增及测序后获得蛋白酶以及部分反转录酶基因序列,亚型分析显示92例(74.2%)为CRF_01AE亚型,14例(11.3%)为B亚型,C和BC亚型各有7例,另4例为其他亚型。77对反转录酶以及蛋白酶抑制剂有不同程度耐药;对核苷类和非核苷类反转录酶抑制剂的耐药分别有63例(50.8%)和74例(59.7%),对蛋白酶抑制剂耐药9例(7.3%);核苷类反转录酶抑制剂主要耐药突变包括了M184V、M41L、D67N、L70R、T219F、K219Q等,造成对3TC、AZT、D4T等不同程度耐药;非核苷类反转录酶抑制主要耐药突变包括K101E、Y181C、K103N、G190A等,造成对NVP和EFV不同程度耐药。结论 福建省HIV-1感染者总体耐药率较低,但是随着治疗人数增加以及治疗时间延长,对反转录酶抑制剂出现较高程度耐药,仍需加强艾滋病患者耐药检测。     

北京地区男男性行为人群HIV感染者中传播耐药状况

目的了解北京地区男男性行为人群(MSM)的艾滋病病毒(HIV)传播耐药流行状况。方法收集536例新诊断的HIV感染者基线耐药检测数据,包括266例急性或早期感染者和270例慢性感染者。比较两组患者在病毒亚型和主要传播耐药突变模式,以及对目前我国一线、二线抗病毒治疗药物的预测敏感性差异。结果 536名感染者中,CRF01_AE亚型占52.1%,B亚型占24.8%,CRF07_BC/CRF08_BC占21.6%,另外有1.3%的患者属于独特的重组形式。7.8%的患者带有一种以上的传播耐药突变,其中,蛋白酶抑制剂(PI)类药物相关的耐药突变流行率为6.2%,核苷类反转录酶抑制剂(NRTI)类药物相关的耐药突变流行率为0.9%,非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTI)类药物相关的耐药突变流行率为1.7%。仅1例患者(0.2%)被预测对NRTI类药物中的阿巴卡韦(ABC)显著耐药,PI类药物的显著耐药率为0,依非韦伦(EFV)和奈韦拉平(NVP)的显著耐药率为1.3%。急性或近期感染者与慢性感染者相比,在传播耐药流行率、耐药突变模式及预测的药物敏感性上都没有显著差异。结论中国MSM的HIV感染者总体传播耐药率较低,但是PI类药物相关的耐药突变流行率相对较高,值得临床医生予以重视。     

浦东新区MSM HIV-1分子流行病学的研究

目的了解上海市浦东新区近年来男男性行为人群(MSM)中,未经抗病毒治疗的艾滋病病毒1型(HIV-1)抗体阳性者,其HIV-1亚型分布和原发性耐药特征,监测该地区MSM HIV-1毒株的最新流行情况,为当前该区制定艾滋病防治策略提供科学依据。方法选取2011年至2014年4月份期间确认的MSM HIV-1感染者血浆标本70份,应用巢式反转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增pol基因,并对扩增产物进行测序,用Mega 6.0软件将测序结果与各亚型国际参考株比对,根据系统进化树分析确定基因亚型及其特征以及耐药情况。结果获62份pol区基因全序列片段,得到CRF01-AE、CRF07_BC、01B(CRF01_AE与B重组亚型)和B四种亚型。分布显示:CRF01-AE占58.06%(36/62),CRF07_BC占30.65%(19/62),01B占6.45%(4/62),B占4.84%(3/62)。离散率显示:CRF01-AE亚型的平均离散率为(2.1±0.2)%(n=36),CRF07-BC亚型的平均离散率也为(2.1±0.2)%(n=19),B亚型的平均离散率为(5.7±0.6)%(n=3),01B重组亚型的平均离散率为(6.3±.0.6)%(n=4)。耐药特征:62例中有7例分别产生了对核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)、非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)及蛋白酶类抑制剂(PIs)的耐药突变,其中2例产生了低度耐药,4例具有潜在的耐药特点。结论上海市浦东新区2011年至2014年4月间,MSM新确证HIV-1感染者中,基因亚型呈多元化趋势,以CRF01-AE和CRF07-BC为主,并已形成了浦东新区范围内的局部流行趋势,新的01B重组毒株已在浦东新区开始出现;HIV-1原发耐药株的传播尚处于低度流行水平,密切监视其流行趋势已显十分必要。     

Primary drug resistance in South Africa: data from 10 years of surveys

HIV-1 transmitted drug resistance (TDR) could reverse the gains of antiretroviral rollout. To ensure that current first-line therapies remain effective, TDR levels in recently infected treatment-naive patients need to be monitored. A literature review and data mining exercise was carried out to determine the temporal trends in TDR in South Africa. In addition, 72 sequences from seroconvertors identified from Africa Centre's 2010 HIV surveillance round were also examined for TDR. Publicly available data on TDR were retrieved from GenBank, curated in RegaDB, and analyzed using the Calibrated Population Resistance Program. There was no evidence of TDR from the 2010 rural KwaZulu Natal samples. Ten datasets with a total of 1618 sequences collected between 2000 and 2010 were pooled to provide a temporal analysis of TDR. The year with the highest TDR rate was 2002 [6.67%, 95% confidence interval (CI): 3.09-13.79%; n=6/90]. After 2002, TDR levels returned to <5% (WHO low-level threshold) and showed no statistically significant increase in the interval between 2002 and 2010. The most common mutations were associated with NNRTI resistance, K103N, followed by Y181C and Y188C/L. Five sequences had multiple resistance mutations associated with NNRTI resistance. There is no evidence of TDR in rural KwaZulu-Natal. TDR levels in South Africa have remained low following a downward trend since 2003. Continuous vigilance in monitoring of TDR is needed as more patients are initiated and maintained onto antiretroviral therapy.     

The impact of transmitted drug resistance on the natural history of HIV infection and response to first-line therapy

BACKGROUND: Transmission of drug-resistant HIV-1 is well recognized. However, the impact of such transmission on natural history of infection remains unknown. METHODS: Three hundred HIV-1-infected, antiretroviral-naive individuals, recruited between 1987 and 1993, and with resistance tests undertaken within 18 months of infection were assessed. We estimated the impact of transmitted drug resistance (TDR) on subsequent CD4 cell count decline in the absence of treatment. We also used Kaplan-Meier methods to assess the response to antiretroviral therapy based on the number of active drugs utilized (according to genotypic resistance results). RESULTS: Infection with any form of drug-resistant HIV-1 was associated with a steeper decline of CD4 cell count over the first year of infection. Estimated rates of decline in the first year were 5.0 [95% confidence interval (CI), 2.8-7.3] and 1.7 (95% CI, 0.8-2.6) radicalCD4 cells per year for TDR and no TDR, respectively (P = 0.005). For an individual at a CD4 cell count of 500 cells/microl at seroconversion, these rates correspond to a CD4 cell loss of 199 and 73 cells/microl, respectively, in the first year. Thereafter we found no evidence of a difference in the rate of CD4 cell decline (P = 0.32). Initiation of HAART after calendar year 2000, but not number of active drugs, was associated with improved responses. CONCLUSIONS: The impact of transmitted HIV-1 drug resistance on CD4 cell decline is time dependent, with greater rates of decline in the first year following infection. We found no evidence of a longer term effect of TDR on natural history of HIV-1 infection.     

Prevalence of transmitted HIV drug resistance in Botswana: lessons learned from the HIVDR-Threshold Survey conducted among women presenting for routine antenatal care as part of the 2007 national sentinel survey

The emergence and spread of transmitted drug resistance (TDR) poses a major threat to the success of the rapidly expanding antiretroviral treatment (ART) programs in resource-limited countries. The World Health Organization recommends the use of the HIV Drug Resistance Threshold Survey (HIVDR-TS) as an affordable means to monitor the presence of TDR in these settings. We report our experiences and results of the 2007 HIVDR-TS in Botswana, a country with one of the longest-existing national public ART programs in Africa. The HIVDR-TS and HIV-1 incidence testing were performed in the two largest national sites as part of the 2007 antenatal Botswana Sentinel Survey. The HIVDR-TS showed no significant drug resistance mutations (TDR less than 5%) in one site. TDR prevalence, however, could not be ascertained at the second site due to low sample size. The agreement between HIVDR-TS eligibility criteria and laboratory-based methodologies (i.e., BED-CEIA and LS-EIA) in identifying recently HIV-1 infected adults was poor. Five years following the establishment of Botswana's public ART program, the prevalence of TDR remains low. The HIVDR-TS methodology has limitations for low-density populations as in Botswana, where the majority of antenatal sites are too small to recruit sufficient numbers of patients. In addition, the eligibility criteria (age <25 years and parity (first pregnancy)) of the HIVDR-TS performed poorly in identifying recent HIV-1 infections in Botswana. An alternative sampling strategy should be considered for the surveillance of HIVDR in Botswana and similar geographic settings.     

云南省临沧市2012年HIV-1基因型和耐药传播警戒线调查

目的了解2012年临沧市未经抗病毒治疗的艾滋病病毒I型（HIV1）感染者中,病毒的基因型分布和耐药株传播水平。方法根据HIV-1耐药警戒线调查实施方案,对2012年2—7月,临沧市符合方案要求的50份年龄在18—25岁的、新发现的HIV-1感染者的血浆样本,进行耐药基因型检测和耐药株传播水平分析。结果50份血浆样本中,36份完成了基因型及耐药鉴定。通过进化分析对pol区进行分型,75．0％（27／36）的样本为CRF08-BC,其他依次为URF—BC（8．3％,3／36）、CRF07-BC（5．6％,2／36）、CRF01-AE（5．6％,2／36）和c亚型（5．6％,2／36LURF—BC重组中有两例重组模式相同。获得的序列中未检测到监测相关的耐药突变（Surveillancedrugresistancemutations,SDRM）,按照耐药警戒线的统计方法估算,耐药株流行率〈5％。结论临沧市目前主要流行的HIV-1亚型为CRF08-BC,HIV-1耐药株处于低度流行水平。为控制耐药传播水平的上升,在加强重点人群艾滋病防治的基础上,应加强规范艾滋病抗病毒治疗及科学管理,同时有计划地开展相关的耐药监测。     

广西壮族自治区HIV-1耐药警戒线研究

目的通过对广西艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)新近感染者耐药基因变异的研究,了解当地HIV耐药毒株传播的水平。方法通过序贯抽样的方法,采集70例2007年8-10月新确证的、年龄在15～25岁的HIV感染者的全血样本,使用In-house法扩增HIV-1 pol区部分基因片段,并进行耐药基因变异分析。结果得到47条序列,其中有1份在蛋白酶区发生主要耐药突变M46L,可引起对ATV和NFV的低水平耐药性;在反转录酶区存在T69NT突变,仅引起对d4T和DDI的潜在耐药性。根据WHO HIV耐药警戒线监测方法判断,广西HIV耐药株属于低传播水平(<5%)。结论广西HIV新近感染者中已有HIV耐药株的传播,但是目前传播水平还较低,应继续开展HIV耐药毒株传播的监测工作。     

HIV-1耐药突变的研究进展

至2015年止,全球约有1 700万HIV/AIDS病例得到抗逆转录病毒治疗,使HIV-1死亡率和发病率迅速下降。随着抗逆转录病毒治疗向所有感染HIV者全面推进,HIV耐药突变问题对长期治疗也构成了威胁,并对全球2030年消除艾滋病这一重要公共卫生战略产生了负面影响。本综述试图从不同的经济和地理环境出发,从个体和群体水平上阐述了常用的抗逆转录病毒药物的遗传屏障、交互耐药程度、耐药突变的流行病学和耐药管理;同时本文汇总了高、中低两类国家的可传播性耐药(TDR)和获得性耐药(ADR)的流行方式,分析了两类具有重要的公共卫生意义HIV耐药突变问题,即治疗前耐药和暴露前预防性服药的耐药。此外,鉴于有效地对不同类国家的HIV病例的治疗和管理,分别分析了基因型耐药性检测和治疗实践方面的关联,这些内容对我国的艾滋病防治也具有一定的参考作用。