文本挖掘技术在医学信息教育中的应用

信息素养是医学教育中的基本素质,信息分析能力的培养则是信息素养教育中的难点。本文介绍了中国医科大学针对研究生和长学制学生开展利用文本挖掘技术帮助学生选择科研方向和题目的尝试,以培养学生了解和分析某领域研究热点和方向的能力,课程内容包括概念介绍、教学实践、数据获取、数据抽取、数据分析、结论归纳,教学效果令人满意。     

A method for systematic discovery of adverse drug events from clinical notes

Objective Adverse drug events (ADEs) are undesired harmful effects resulting from use of a medication, and occur in 30% of hospitalized patients. The authors have developed a data-mining method for systematic, automated detection of ADEs from electronic medical records.Materials and Methods This method uses the text from 9.5 million clinical notes, along with prior knowledge of drug usages and known ADEs, as inputs. These inputs are further processed into statistics used by a discriminative classifier which outputs the probability that a given drug–disorder pair represents a valid ADE association. Putative ADEs identified by the classifier are further filtered for positive support in 2 independent, complementary data sources. The authors evaluate this method by assessing support for the predictions in other curated data sources, including a manually curated, time-indexed reference standard of label change events.Results This method uses a classifier that achieves an area under the curve of 0.94 on a held out test set. The classifier is used on 2 362 950 possible drug–disorder pairs comprised of 1602 unique drugs and 1475 unique disorders for which we had data, resulting in 240 high-confidence, well-supported drug-AE associations. Eighty-seven of them (36%) are supported in at least one of the resources that have information that was not available to the classifier.Conclusion This method demonstrates the feasibility of systematic post-marketing surveillance for ADEs using electronic medical records, a key component of the learning healthcare system.     

数据挖掘在医学科技查新中的应用

数据挖掘技术是基于关系数据库的一种有效的信息发掘工具。通过介绍数据挖掘技术在医学科技查新领域的应用情况，即在文献资料分析以及科研管理中的运用，分析探讨了数据挖掘技术在医学科技查新领域的应用前景和未来发展方向。     

关注患者安全 提高医疗服务质量

从加强组织领导，落实相关制度；强调质量管理、重视技术安全；关注患者心理安全；加强行政安全；院科检查，持续改进等方面介绍了南京医科大学附属南京第一医院关注患者安全，提高医疗服务质量的做法和经验。     

关联规则在小儿肺炎病案信息挖掘中的应用

目的：探讨关联规则在小儿肺炎病案信息挖掘中的应用。方法：以小儿肺炎的病案信息为切入点,合并诊疗数据,摘录用药信息并组建数据库,对药物进行频次统计分析,建立Apriori模型,进行关联规则分析。结果：共获得小儿肺炎诊断记录584条,使用频次超过100次的药物有20种,共获得联合用药关联规则60则。抗炎、祛痰、平喘、止咳、抗感染是肺炎患儿的主要治疗措施。结论：治疗小儿肺炎时最常使用的药物符合小儿肺炎治疗的用药特点,与小儿肺炎治疗的临床指南相符,从而验证了关联规则分析在病案信息挖掘中的有效性。     

基于数据挖掘探讨士材学派医家治疗肿瘤的用药规律

目的应用数据挖掘技术对士材学派医家治疗肿瘤的医案进行分析探讨其用药规律。方法于2017年1月～2018年12月期间整理士材学派历代医家治疗肿瘤的医案,通过人工筛选后将姓名、性别、年龄、诊断、临床表现、舌苔脉象、病机治法、处方用药等信息逐条录入Medcase V3.2仓公诊籍国医脉案数据挖掘系统,建立士材学派医家辨治肿瘤医案数据库,数据挖掘方法主要采用频数统计、关联规则、聚类分析等。结果共涉及药物234味,其中使用频次15次以上的15味,分别是当归(40次)、甘草(39次)、生白术(38次)、白芍(37次)、茯苓(32次)、陈皮(29次)、香附(23次)、党参(21次)、石斛(17次)、蜀羊泉(16次)、木香(16次)、青皮(15次)、瓦楞子(15次)、延胡索(15次)、乌梅(15次),分析15味药物四气温(6味)、平(6味)、寒(3味),五味排名前3位的是苦(9味)、甘(7味)、辛(6味),主要归经有脾(11味)、肝(8味)、肺(8味)、胃(6味),经聚类分析得到4个核心方。结论士材学派医家认为寒邪是肿瘤的重要致病因素,临床上善用温药,分初、中、末三期辨治肿瘤,主张用甘温补益之剂,配伍清热解毒、软坚散结、行气止痛之剂。     

基于开放数据的降血脂药物不良反应数据挖掘

目的：分析降血脂药的主要不良反应及其可能的影响因素。方法：利用国家人口与健康科学数据共享平台,获取579名患者的降血脂药不良反应报告记录,药物名称统一用“药物名+剂型”格式进行规范,不良反应描述参照世界卫生组织创建的药品不良反应术语集（WHO Adverse Reaction Terminology,WHO-ART）,构建不良反应匹配词典。随后利用数据挖掘方法对数据集进行多维度分析。结果：引起不良反应的给药途径以静脉滴注（75.4%）为主,主要不良反应表现为胸闷、瘙痒、呼吸困难;累及器官系统主要表现为全身性损害（61.1%）,临床表现为发热、不适、厌食等。单因素分析和多因素logistic回归分析显示给药途径是影响不良反应严重程度的因素。结论：降血脂药的不良反应常涉及全身性损害、皮肤及其附件损害等多器官系统,给药途径对不良反应的影响程度最大。     

A systematic review of automatic text summarization for biomedical literature and EHRs

ObjectiveBiomedical text summarization helps biomedical information seekers avoid information overload by reducing the length of a document while preserving the contents’ essence. Our systematic review investigates the most recent biomedical text summarization researches on biomedical literature and electronic health records by analyzing their techniques, areas of application, and evaluation methods. We identify gaps and propose potential directions for future research.Materials and MethodsThis review followed the PRISMA methodology and replicated the approaches adopted by the previous systematic review published on the same topic. We searched 4 databases (PubMed, ACM Digital Library, Scopus, and Web of Science) from January 1, 2013 to April 8, 2021. Two reviewers independently screened title, abstract, and full-text for all retrieved articles. The conflicts were resolved by the third reviewer. The data extraction of the included articles was in 5 dimensions: input, purpose, output, method, and evaluation.ResultsFifty-eight out of 7235 retrieved articles met the inclusion criteria. Thirty-nine systems used single-document biomedical research literature as their input, 17 systems were explicitly designed for clinical support, 47 systems generated extractive summaries, and 53 systems adopted hybrid methods combining computational linguistics, machine learning, and statistical approaches. As for the assessment, 51 studies conducted an intrinsic evaluation using predefined metrics.Discussion and ConclusionThis study found that current biomedical text summarization systems have achieved good performance using hybrid methods. Studies on electronic health records summarization have been increasing compared to a previous survey. However, the majority of the works still focus on summarizing literature.     

医学文献检索教学的改革

探讨了优化教材内容,编制配套资料;改进教学方式和教学手段以及完善考试方法等文检课改革办法,提出编写"教材"和"讲义"两个版本;建立以网络检索为核心的教材体系;采用基于问题的教学法和启发式教学模式;开发网上资源模拟课件,现场上网教学模式和文检课计算机模拟考核等具体改革方案.     

文本挖掘在中医药文献分析中的应用

文本挖掘能从海量的中医药文献中发现知识以促进中医临床研究和中药研发。本文总结现有研究指出文本分类和信息抽取是中医药文献知识发现的关键技术,指出中医药文本分类、非关联知识发现和中医药文献信息抽取为三个主要研究方向,并论述了三个研究领域中需解决的关键问题和研究方向,最后展望文本挖掘在中医药学科的应用前景,指出非关联文献知识将成为中西医结合研究的热点。     

医学科技文献平台建设中的信息资源整合

结合山西省建设中的信息资源整合,分析了在科技信息资源平台建设中的信息资源整合重要性,介绍了科技平台建设中信息资源整合的初步成果。     

“基于结果的教育理论”的医学查新课程建设

将基于结果的教育(OBE)理论引入到混合学习中,以医学查新课程为例,从3个方面分析了OBE理论与混合学习结合的合理性,认为OBE理论与混合学习的理念相辅相成,按照基于OBE理论的课程设计模型进行医学查新课程设计是可行的。 〖HT5”H〗 ［关键词］混合学习;基于结果的教育;医学查新课程     

数据挖掘技术在文献研究法中的应用——以RefViz为例

在科学研究文献激增的今天,将数据挖掘技术引入文献研究领域势在必行.RefViz是一款可视化的数据挖掘工具,利用其独特的算法能够发现文献之间的关联性,并从中挖掘出某一研究领域的热点问题和发展趋势.     

我国网上药店资质安全现状调查研究

目的：对我国合法网上药店资质现状进行调查分析,了解国家主要监管政策,为网上药店的健康发展提供参考依据。方法：用网站调研的方法对我国33家合法网上药店进行逐个调查统计,计算网上药店资质安全项目比例。用文献研究的方法了解国家法律对资质安全的维护措施。结果：91%的网上药店给出的资质项目不齐全,93%的受访者能认识到资质安全的重要性但不了解其具体内容。结论：消费者对资质安全相关内容了解不全面,不会利用相关法律维护自身合法权益,网上药店应补充欠缺的资质文件,加大资质安全相关教育。     

信息时代对多层面开设文检课的探讨

本文针对不同层次学生特点,从培养目标、课程建设诸方面讨论了信息时代医学文献检索课的分层次教学以及利用网络计算机技术改进教学手段的问题。     

需求驱动的医疗健康大数据挖掘模型构建

将跨行业数据挖掘标准流程模型（简称“CRISP-DM模型”）和需求、数据、数据挖掘方法三者的对应关系相结合构建需求驱动的数据挖掘模型。该模型主要包括需求、数据和数据挖掘方法3个核心概念与需求理解、数据理解、数据准备、建模、评估和部署6个过程步骤，分为需求层、数据层、算法层和部署层4个层次。需求驱动的医疗健康大数据挖掘模型可打破“数据先入为主”的习惯性思维，降低盲目进行数据挖掘研究引发的失败风险。整理需求、数据和数据挖掘方法之间的对应关系，可优化医疗健康大数据挖掘路径，降低数据挖掘新手的学习成本，对临床医疗和健康管理实践都具有现实意义，可用于未来的医疗健康大数据开发策略研究。     

从查新工作角度探讨医学信息专业学生的培养

从医学科技查新工作角度分析了医学信息系学生从事查新实践存在的问题及其原因,就如何培养优秀医学科技查新人员提出了建议.     

文献检索课对医学生信息认知能力的影响

目的：探讨如何利用医学文献检索课提高医学生的信息认知能力。方法：随机抽取川北医学院三、四年级的医学本科生为实验组和对照组。实验组采用新的教学计划,对照组按传统的教学计划实施教学,教学结束后采用自编问卷调查表进行调查。结果数据用SPSS软件系统处理,并行频数统计、组间方差分析和卡方检验,以分析医学生的认知结构、认知方式、认知能力和信息加工策略。结果：实验组与对照组在信息认知方面存在有明显差别,尤其在信息获取目的、途径、方式、难易程度、动机影响因素和主要内容,具有统计学意义（p〈0．05）。结论：采用新的教学计划,有利于医学生形成良好的思维习惯和正确的认知结构,能有效提高医学生的信息认知能力,促进医学生自我发展。