浙江省在鼠形动物中检测到伯氏疏螺旋体

目的了解鼠形动物中自然感染伯氏疏螺旋体的状况。方法用巢式聚合酶链反应扩增鼠中的伯氏疏螺旋体5S--23SrRNA间隔区片段，对阳性产物进行测序。结果在浙江省金华市金东区捕获鼠形动物128只，在黄毛鼠、姬鼠、臭鼬鼯中共检测到阳性12份，阳性率分别为9．68％、14．28％和25．00％，并对其中2份进行测序分析，与伯氏疏螺旋体的法雷斯疏螺旋体相同，基因区间序列号分别为AB091447BvalaiOS115和DQ188933BvalaiQX13P25，相似率达100％。结论初步认为浙江省存在伯氏疏螺旋体病原。黄毛鼠、姬鼠、臭鼠句鼯可能为伯氏疏螺旋体的法雷斯疏螺旋体宿主，尚需进一步调查。     

浙江省在鼠类中检测到伯氏疏螺旋体ospA基因

目的了解浙江省磐安县鼠中感染伯氏疏螺旋体的情况,研究以外膜蛋白A(OspA)为靶基因的PCR方法在浙江省的应用。方法利用PCR方法,检测磐安县128份鼠肝、脾标本中ospA基因特异片段;对所检测到的阳性结果进行序列测定,并进行分析。结果从128份鼠肝、脾标本中检测发现4例ospA基因阳性片段,其中3份来自黄毛鼠,1份来自大林姬鼠;核酸序列基本一致,与伯氏疏螺旋体法雷斯疏螺旋体高度相似。结论利用ospA基因能从标本中检测到伯氏疏螺旋体;浙江省部分山区存在鼠感染伯氏疏螺旋体的情况,其中伯氏疏螺旋体法雷斯疏螺旋体占优势。     

伯氏疏螺旋体广西分离株外膜蛋白A基因的克隆和序列分析

目的：探求广西伯氏疏螺旋体外膜蛋白A（OSPA）基因变异情况。方法：应用聚合酶链反应从3株广西莱姆病螺旋体GXLD－4，9，18及1株贵州分离株长14全基因组DNA中将OSPA基因调出，并克隆到pGEM-T Easy Vector载体上，构建重组质粒，测序后与国外其它分离株进行同源性比较。结果：4株莱姆病螺旋体均扩增出约774bp的OSPA基因，编码258个氨基酸。4者之间核苷酸同源性98．8％－99．9％，氨基酸同源性98％－99％，其中GXLD－4与长14同源性最大。与国外分离株（10MT，Ya501)的同源性均较高。结论：莱姆病螺旋体OSPA基因在广西3个分离株及贵州株长14间差异较小，但与国外分离株存在一定差异。     

组氨酸激酶Ⅱ在伯氏疏螺旋体生活史中的功能

目的伯氏疏螺旋体组氨酸激酶Ⅱ(Hk2)和反应调节蛋白Rrp2共同组成一个二元信号系统,控制病原菌侵染哺乳动物所需致病因子的表达,但Hk2的生物学功能有待验证。方法应用同源重组方法得到hk2敲除菌株(hk2-),并利用蜱-鼠动物模型对其生物学功能进行探索。结果 hk2-能够通过人工针刺正常感染小鼠,间接免疫荧光试验显示在吸血的幼蜱和若蜱中肠能够检测到hk2-,定量PCR结果显示hk2敲除并不影响病原菌在若蜱中肠的繁殖,但在蜱叮咬状态下只有50%的小鼠能够被hk2-感染。结论Hk2不影响病原菌从鼠传播到幼蜱及随后在蜱体内的长期寄生,但hk2敲除降低了病原菌在自然条件下(蜱叮咬)感染小鼠的能力,研究结果暗示Hk2在病原菌生活史中的功能是协助病原菌高效地侵染哺乳动物。     

巢式PCR法检测鼠肝脾标本伯氏疏螺旋体

目的应用巢式PCR方法检测鼠肝脾组织中伯氏疏螺旋体外膜蛋白A（ospa）基因,了解淳安县鼠中伯氏疏螺旋体感染情况。方法于2012年8月收集淳安县102份鼠肝脾标本,采用巢式PCR法检测伯氏疏螺旋体ospA基因特异片段,统计标本阳性率。结果在38只黑线姬鼠中检测到伯氏疏螺旋体ospA基因特异片段阳性标本3份,在13只黄毛鼠中检测到伯氏疏螺旋体ospA基因特异片段阳性标本3份,鼠伯氏疏螺旋体总阳性率为5．88％（6／102）。结论淳安县鼠中检测到伯氏疏螺旋体ospA基因片段,有引起蜱媒传染病莱姆病发生的潜在可能,应引起公共卫生部门的重视。     

广西莱姆病螺旋体5s-23srRNA间隔区基因的克隆和序列分析

目的：对广西莱姆病螺旋体分离株基因型鉴定。方法：应用聚合酶链反应从3株广西莱杂病螺旋体及1株贵州分离株全基因组DNA中将5S－23SrRNA间隔区基因调出，并克隆至质粒PGEM－T中，构建重组质粒，测序后与国外其它分离株进行同源性比较。结果：4例莱杂病螺旋体均扩增出约242bp的5s-23srRNA间隔区基因，同源性99％以上，与B.valaisiana基因型的同源性均比其他基因型高，同源性97．1％－97．9％。结论：4莱姆病螺旋体均属于B.valaisiana基因型，此基因型在为我国为首次报道。     

青海省互助、泽库和祁连县啮齿类动物伯氏疏螺旋体调查

目的调查确定青海省3县啮齿类标本中伯氏疏螺旋体带菌情况。方法从青海省互助、泽库和祁连县共采集啮齿类动物202只,采用巢式PCR方法检测其伯氏疏螺旋体的带菌率。结果采用巢式PCR方法检测啮齿类动物标本202份,阳性49份,伯氏疏螺旋体平均阳性率为24.26%。其中互助县标本共67份,阳性12份,阳性率为17.91%;泽库县标本共78份,阳性27份,阳性率为34.62%;祁连县标本共57只,阳性10份,阳性率为17.54%。3个县的啮齿类动物伯氏疏螺旋体阳性率差异有统计学意义(χ2=7.40,P<0.05)。结论青海省互助、泽库和祁连县啮齿类动物中均存在伯氏疏螺旋体感染,应进一步对当地的媒介和人群进行调查,从而为当地莱姆病的防控提供参考。     

16S rRNA基因检测在新生儿败血症早期诊断中的应用

目的 建立基于16S rRNA基因的聚合酶链反应(PCR)细菌学检测方法,以指导临床快速诊断新生儿败血症.方法 以细菌16S rRNA基因为靶序列,利用计算机软件设计合成所有细菌保守区共有的一对通用引物,通过PCR扩增已知10株实验室保存菌株、人类基因组DNA、巨细胞病毒、白色假丝酵母菌和空白对照,并对其灵敏度和特异性作一评价.结果 对所测已知10株实验室保存菌株均获得920 bp扩增产物,其与人类基因组DNA、巨细胞病毒和白色假丝酵母菌无交叉阳性反应;PCR阳性率为26.8％,血培养阳性率为11.3％,两者比较有差异有统计学意义(P＜0.05),PCR灵敏度高于血培养.结论 与血培养比较,PCR具有检测速度快、特异性及敏感度高等特点.     

23S rRNA基因在临床诊断细菌性感染中的应用

细菌23S rRNA存在于细菌核糖体大亚基中,几乎为所有细菌所共有,其编码的基因具有保守性和变异性。本文就23S rRNA基因的分子结构和特征,在临床诊断细菌性感染中的应用,以及进一步分析其PCR产物的分子生物学方法等研究进展作了综述。     

16S rRNA、16S-23S rRNA基因测序分析检测主要血流感染病原菌比较

目的比较细菌16S rRNA、16S-23S rRNA 基因测序分析在血流感染病原菌检测中的作用。方法提取临床上血流感染常见的金黄色葡萄菌、表皮葡萄球菌、大肠埃希菌、粪肠球菌、肺炎链球菌、铜绿假单胞菌、阴沟肠杆菌、鲍曼不动杆菌、洛菲不动杆菌、肺炎克雷伯杆菌、化脓性链球菌、奇异变形杆菌、潘尼变形杆菌、屎肠球菌、粘质沙雷菌、宋内志贺菌、产气肠杆菌、小肠结肠炎耶尔森菌、腐生葡萄球菌基因组 DNA,运用 16S rRNA、16S-23S rRNA 基因进行 PCR 扩增。扩增产物经测序后在美国国家生物技术中心(NCBI)上进行比对分析,确定菌种。结果在所分析的 19 种临床血流感染常见细菌中,16S rRNA 基因测序分析可将除粘质沙雷菌外的细菌鉴定到种的水平,但无法完全区分近缘种属;16S-23SrRNA 成功鉴定 17 种细菌,除大肠埃希菌、宋内志贺菌外所有细菌均成功鉴定到单一种的水平。结论 16S-23S rRNA 基因可作为血流感染细菌检测较好的分子靶标。     

沙门菌PCR-dHPLC基因分型方法建立

目的建立沙门菌聚合酶链反应-变性高效液相色谱(PCR-dHPLC)基因分型方法。方法采用16S～23S rRNA内转录间隔(ITS)作为沙门菌分型目的基因,确定特异性扩增引物,进行PCR扩增,扩增产物经dHPLC分离,根据dHPLC图谱峰型差异进行分型,并与血清学和生化分型结果比较。结果89株沙门菌共分为12个dHPLC型(D型);所有沙门菌均有1个相同色谱峰,克隆测序结果表明,其片断大小为600 bp,其他8种食源性致病菌对照株无此色谱峰,应为沙门菌16S～23S rRNA基因序列的特征性条带,分型结果与血清学差异较大,与生化分型结果有一定一致性。结论所建立的沙门菌PCR-dHPLC基因分型方法具快速、操作方便、重复性好、成本低廉、高通量和自动化的特点。     

中国莱姆病螺旋体PD91重组OspC的鉴定和抗原性检测

目的 重组中国莱姆病螺旋体PD91外膜蛋白C(OspC)并在大肠埃希菌中表达，用于早期莱姆病诊断的研究。方法 用聚合酶链反应(PCR)扩增出PD91外膜蛋白C基因，定向克隆到表达载体PET-llD，构建重组质粒PET-llD-ospC。用PCR、限制性内切酶分析及序列测定等方法鉴定重组质粒。用Western Blot检测其抗原性。结果 OspC基因被正确克隆到表达载体PET-llD中。序列测定结果证实与国外已报道的序列存在一定的差异。OspC具有强抗原性。结论 该项研究为国内莱姆病的早期特异性诊断的研究奠定了基础。     

新疆人群感染莱姆病螺旋体分子流行病学调查

目的 探讨新疆部分自然疫源地自然人群感染莱姆病螺旋体的自然进程及感染莱姆病螺旋体的基因型情况.方法 在2002年夏季完成的1406人莱姆病螺旋体感染血清流行病学调查的基础上,2006年在上述1406人中的1390人阴性人群中,随机抽取119人,与2002年16例阳性(共计135人)为研究对象,在这两个时点收集的血清标本均应用蛋白印迹(Western blot,WB)方法检测抗Borrelia burgdorferi抗体IgM和IgG,并完成莱姆病表现频率调查问卷.同时留取135份尿液标本,应用巢式PCR扩增尿液标本中莱姆病螺旋体5S～23S rRNA间隔区片段,对部分阳性产物测序分析,确定莱姆病螺旋体的基因型,并将PCR检测结果与血清学的检测结果相比较.结果 2002年1406份血清标本中,抗体阳性16份,阴性1390份,阳性率为1.14％(16/1406)(16例中IgM阳性12例,IgG阳性2例,IgM、IgG均阳性者2例).2006年上述16例抗体阳性的感染者中,有7例抗体转为阴性,阴转率为43.75％(7/16),4例由IgM阳性转为IgG阳性,IgM持续阳性5例,2002年抗体阴性的119人中,2006年有58例抗体转为阳性(IgM阳性14例,IgG阳性25例,IgM和IgG均阳性的19例),阳转率为48.74％(58/119),确诊为莱姆病2例.2006年抗B.burgdorferi抗体总阳性率为49.63％(67/135)(2006年阳性58例+2002年阳性9例).无症状IgG血清转换率为34.07％ (46/135)(2002年IgM阳性转换为IgG阳性的4例+2006年IgG阳性的25例、IgM和IgG均阳性的19例,其中确诊莱姆病2例);3例发展为莱姆病(2.22％).135份尿液PCR检测,阳性22份,阳性率为16.30％ (22/135).8份PCR阳性结果测序分析显示7份为B.garinii,1份为B.afzelii基因型.结论 新疆自然疫源地人群莱姆病螺旋体感染大多为隐性感染,自然进程较为良性,临床莱姆病少有发生.新疆人群莱姆病螺旋体感染基因型主要为B.garinii,其次是B.afzelii.     

全沟硬蜱在黑龙江小兴安岭莱姆病螺旋体传播中的作用

目的：探讨全沟硬蜱在莱姆病螺旋体传播中的作用。方法：用布旗法在林区草地采蜱，并分类鉴定；用直接荧光抗体法检查蜱类中肠带菌情况，并分离菌株。结果：全沟硬蜱为当地优势蜱种，人群发病与该蜱叮咬率密切相关；该蜱中肠带菌率为４０％，并从１４组（７０只）蜱中分离出２株莱姆病螺旋体；新分离株的单克隆抗体反应与国内分离株Ｍ７相同，而与美国菌株Ｂ３１有区别。结论：当地全沟硬蜱是莱姆病螺旋体的主要生物媒介。     

Specific detection of Coxiella burnetii through partial amplification of 23S rDNA

A previously published sequence of the 23S rRNA gene of Coxiella burnetii has been reported to contain an intervening sequence of 444 base pairs (bp). The sequence information on the intervening sequence and the 23S rRNA gene was exploited to develop a specific PCR-based assay for C. burnetii. A primer set was designed that amplified a 477-bp fragment encompassing part of the intervening sequence and part of the 23S rDNA. From all of nine C. burnetii strains tested, a fragment of the expected size was amplified. As predicted from the published sequence, restriction endonuclease digestion of the PCR product from the Coxiella strains with RsaI produced two distinct fragments approximately 210- and 270-bp in size. The PCR-based method showed a detection limit of 10² bacteria as determined by visualization of the amplicon on an agarose gel. When experimentally infected blood was analyzed, the detection limit was 10³ bacteria. No visible amplicons were observed when 41 bacterial strains, representing 29 species other than C. burnetii, were tested. The presence of the DNA in all bacterial samples was confirmed by amplification of a 350-bp fragment of the 16S rDNA using two universal primers. The described method proved to be specific for C. burnetii and may become a rapid and sensitive diagnostic assay for C. burnetii. The results also demonstrate that the intervening sequence within the 23S rRNA gene is generally found among isolates of C. burnetii.     

黑龙江林区野鼠伯氏疏螺旋体核酸检测与序列分析

伯氏疏螺旋体共有13个基因种,国内分离到的菌株包括5个基因种[1-3],本研究对黑龙江地区啮齿动物中伯氏疏螺旋体进行分子流行病学调查和分析. 1.材料与方法: (1)样本采集、处理及DNA提取:2009-2011年4-7月从黑龙江林区采用夹夜法采集野鼠,每样点100×2夹次,按5m距离布放鼠夹,晚放晨收.现场鉴定鼠种后,将捕获的鼠放入鼠袋内,乙醚麻醉后,消毒,无菌取脾脏低温保存.采用天根生化科技(北京)有限公司血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒提取脾脏DNA,-20℃贮存备用.