转录因子阴阳1在肝细胞癌中的作用

肝细胞癌(HCC)起病隐匿,大多数患者确诊时进展至中晚期,错过了最佳治疗时机,往往预后不良。转录因子阴阳1(YY1)是一种多功能转录因子,可调节多种重要基因的转录,在多种肿瘤中发挥重要作用。既往研究显示,YY1影响HCC许多生物学行为,如增殖、凋亡、迁移和血管生成,还与HCC的耐药性及不良预后密切相关。本文系统总结了YY1在HCC发生发展中的作用相关研究进展,为HCC的治疗提供一定的理论依据。     

转录因子Sp1在肝细胞癌中的表达

目的通过研究转录因子Sp1在肝细胞癌（HCC）组织中的表达及转化生长因子（TGF）B1对肝癌细胞中Sp1mRNA转录表达的影响,探讨Sp1在HCC中表达的意义及其在细胞凋亡中的作用。方法免疫组织化学方法对51例HCC组织与10例良性病变而切除的正常肝组织中转录因子Sp1进行蛋白检测;体外培养肝癌细胞株HepG2,施加外源性TGFβ1,逆转录一聚合酶链反应方法检测HepG2细胞中Sp1mRNA的表达,并用流式细胞仪检测细胞受到干预后的凋亡情况。结果Sp1蛋白在HCC组织中的表达率明显高于正常肝组织（P〈0．01）;施加外源性TGFβ1与对照组相比HepG2细胞Sp1mRNA的表达显著降低（P〈0．01）,且HepG2细胞凋亡率随着TGF[31浓度的增高而上升。结论Sp1蛋白在HCC中的过表达在肿瘤发生发展中起一定作用;TGFβ1诱导肝癌细胞凋亡,而Sp1基因的抑制在TGFβ1诱导肝癌细胞凋亡中可能起一定作用。     

丝裂原活化蛋白激酶途径与肝细胞癌研究进展

肝细胞癌(HCC)是世界第五大常见肿瘤,也是肝脏最常见的恶性肿瘤。丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)是一类广泛存在于细胞内的高度保守的丝氨酸和苏氨酸蛋白激酶,是细胞内重要的信号转导系统,参与细胞的生长、发育、分化和凋亡等一系列病理生理过程。它是目前研究的热点,参与了包括肝癌在内的多种肿瘤的发生发展过程。     

基于生物信息学分析核仁纺锤体相关蛋白1在肝细胞癌中的表达及对临床预后的影响

目的探讨在肝癌中核仁纺锤体相关蛋白1(NUSAP1)的表达及其对临床预后的影响。方法从基因表达数据库(GEO)下载HCC芯片数据集GSE57957、GSE14520、GSE22058、GSE46444、GSE54236、GSE36376、GSE64041、GSE76297、GSE76427、GSE102079和癌症基因组图谱(TCGA)中的HCC RNA-seq数据,利用R 4.0软件分析NUSAP1在肝癌及癌旁组织的表达差异。应用t-分布邻域嵌入算法(tSNE)对单细胞测序数据的降维,分析NUSAP1在肝癌和癌旁组织中的差异表达。收集2018年1月—2019年11月在青岛大学附属医院进行同种异体肝移植术的42例乙型肝炎相关肝癌患者的癌组织及癌旁组织,收集其临床病理资料并分析与NUSAP1基因表达的相关性。计数资料2组间比较采用χ~2检验。以Kaplan-Meier方法生存分析NUSAP1表达水平与总体生存率及无病间隔生存率之间的关系,运用log-rank进行检验,通过Graphpad prim 7使其结果可视化。结果 NUSAP1在GEO数据库与TCGA数据库数据集中的肝癌组织中均高表达(P值均0.001)。来源于肿瘤组织的细胞其NUSAP1高表达细胞明显高于癌旁组织细胞。NUSAP1在29例患者的肝癌组织中高表达,在13例患者的肝癌组织中低表达,NUSAP1在肝癌组织中高表达组及低表达组间,Child-Pugh分级、TNM分期、Okuda分期比较差异均有统计学意义(χ~2值分别为5.469、6.836、4.617,P值均0.05)。NUSAP1高表达的肝癌患者总体生存率与无病间隔生存率显著低于低表达的肝癌患者,NUSAP1低表达患者1、3、5生存率分别为92.96%、83.80%、76.76%,明显高于高表达的患者(76.76%、67.60%、64.78%),NUSAP1高表达的患者中位生存时间明显低于低表达的患者(61.7个月vs 108.6个月)(P值均0.05)。结论 NUSAP1在肝癌细胞中高表达,可作为乙型肝炎肝癌患者不良预后的潜在标志物。     

肝细胞癌中差异表达EST的生物信息学分析和功能预测

目的 采用生物信息学方法分析、预测在原发性肝细胞癌中差异表达表达序列标签(expression sequence tag，EST)的全长、ORF、电子表达谱、染色体定位和编码蛋白质的功能，指导实验研究。方法 应用多种生物学软件进行分析。结果 获得两条新基因的全长序列，和RACE方法、测序获得的结果一致；两条：EST分别定位于2p13～15、3p14；高表达EST主要表达于肿瘤组织，低表达EST主要表达于正常组织；高表达基因所编码蛋白质参与细胞信号转导、前mRNA加工和细胞骨架组装，低表达编码蛋白质和机体T淋巴细胞介导的免疫反应有关。结论 采用生物信息学技术有助于高效、快速地克隆、鉴定新基因。     

丝裂原活化蛋白激酶信号通路与肝细胞癌的关系

<正>肝细胞癌(HCC)侵袭性强、易复发、预后差,起病隐匿,出现典型临床表现时大多已属中晚期,失去手术机会,自然生存期不超过半年。研究表明,恶性肿瘤的增殖、分化、凋亡、侵袭及转移等过程有多条细胞内信号通路的参与和调控。针对这些通路的分子靶向治疗药物有些已经参与到肿瘤临床的治疗,它们可以单独应用或配合传统化疗发挥作用,在HCC的治疗中拥有巨大潜力~(〔1〕)。众所周知,索拉非尼已被美国食品药品监     

MAGEA4和MAGEC1基因在肝细胞癌组织中表达变化及潜在转录调控机制的生物信息学分析

目的 基于生物信息学方法观察MAGEA4和MAGEC1在肝细胞癌（HCC）组织中的表达水平,分析其对患者预后的影响,及其潜在的转录调控机制。方法 从TCGA和GEO数据库收集HCC高通量数据集TCGA-LIHC、GSE10143、GSE20140、GSE87630和GSE107170,比较MAGEA4和MAGEC1在HCC组织与癌旁肝组织中表达的差异。采用Pearson相关法分析MAGEA4和MAGEC1在HCC组织中表达的相关性。绘制受试者工作特征（ROC）曲线,以中位数区分MAGEA4和MAGEC1的高表达和低表达,依据曲线下面积（AUC）评估MAGEA4和MAGEC1表达区分HCC和癌旁正常肝组织的能力。采用Kaplan-Meier法分析MAGEA4和MAGEC1在HCC中的预后意义;通过ENCORI和Cistrome DB预测调控MAGEA4和MAGEC1表达的转录因子和miRNA。结果 在纳入的5个数据集中,MAGEA4和MAGEC1在HCC组织中的表达水平均高于癌旁正常肝组织（P均<0.05）。在TCGA-LIHC、GSE10143、GSE107170数据集中,MAG...     

生物信息学在肝细胞癌风险预测中的应用

生物信息学是一门交叉科学,通过综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具,来阐明和理解大量生物数据所包含的生物学意义。随着基因组学测序技术的不断发展,产生大量的生物学数据资源,从大数据中挖掘所蕴藏的生物学意义,已成为了当前亟待解决的主要任务之一。本文主要归纳总结基于特征基因的肝癌风险预测模型,为肝癌的早期检测、预后和治疗方案的优化提供新观点。     

乙型肝炎病毒相关肝细胞癌核心差异表达基因生物信息学分析

目的 探索与乙型肝炎病毒（HBV）相关肝细胞癌（HCC）发生发展相关的核心基因,为进一步揭示HBV相关HCC发病机制提供参考。方法 从高通量基因表达数据库（GEO）中下载GSE55092、GSE121248两个数据集,采用R语言筛选HCC组织和癌旁组织间差异表达基因（DEGs）,并绘制可视化火山图。对DEGs基因进行基因本体论（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析,构建蛋白质相互作用（PPI）网络,并用Cytoscape 3.9.0开源平台中分子复合物检测（MCODE）和cytoHubba插件筛选核心DEGs。利用UALCAN和Kaplan Meier-plotter数据库中临床样本数据对筛选出的核心DEGs进行差异表达和生存分析验证。结果 从GSE55092数据集和GSE121248数据集中分别筛选出1 148个和686个DEGs,其中下调表达基因分别为703个和477个、上调表达基因分别为445个和209个;两个数据集共筛选出557个共同表达的DEGs,其中下调表达基因384个、上调表达基因173个。GO富集分析显示,DEGs主要参与细胞分裂、细胞增殖、氧化还原、免...     

基于生物信息学分析鉴定肝细胞癌预后生物标志物

目的 运用生物信息学方法筛选出新的肝细胞癌(HCC)预后生物标志物.方法 通过GEO2R筛选GSE14520数据集中的差异表达基因(DEG),利用STRING构建蛋白互作网络(PPI),Cytoscape软件筛选出关键基因.DAVID进行GO和KEGG分析,然后使用GEPIA分析关键基因在HCC中的表达以及与预后的关系...     

人1igatin样基因HCA56的克隆及其生物信息学分析

目的 利用SEREX方法筛选人肝细胞癌(HCC)cDNA表达文库，克隆能引起机体体液免疫应答的抗原编码基因，并对其进行生物信息学分析，以指导对新克隆基因功能的研究。方法采用ZAP—cDNA Gigapack Ⅲ Gold Cloning试剂盒构建人HCC cDNA表达文库，用患者自体血清进行筛选，对筛选得到的阳性克隆进行序列测定。通过生物信息学对筛选得到的阳性克隆HCA56进行染色体定位、基因结构分析、蛋白序列预测以及相似性搜索和功能分析。逆转录多聚酶链反应(RT—PCR)检测HCA56的组织表达谱。结果 通过对一个cDNA表达文库的筛选，获得了一个血清反应阳性克隆HCA56，全长2021bp，编码584个氨基酸，定位于染色体1q31～q32。数据库搜寻表明它与人ligatin编码基因片段有95％的相似性。RT—PCR显示HCA56广泛分布于各种正常组织。结论 HCA56很可能是ligatin的全长编码基因，生物信息学与分子生物学相互结合是进行新基因研究的有效方法。     

原发性肝细胞癌中cyclinD1基因表达的研究

目的　研究ｃｙｃｌｉｎＤ１ 基因在原发性肝细胞癌中的表达，并探讨与ｐ１６ 及ＣＤＫ４ 蛋白表达的关系。方法　用原位杂交检测ｃｙｃｌｉｎＤ１ 基因ｍＲＮＡ 表达，免疫组化检测ｃｙｃｌｉｎＤ１ 蛋白表达。结果　４ 例（１４－３ ％ ） ＨＣＣ 可检测到ｃｙｃｌｉｎＤ１ 基因过表达。均属ⅢⅣ级，４ 例ＨＣＣ 均有ＣＤＫ４ 蛋白表达，其中２ 例为ｐ１６ 蛋白阳性。结论　１）ｃｙｃｌｉｎＤ１ 表达增加只在小部分恶性程度高的ＨＣＣ 中起作用，可能与肿瘤侵袭有关。２） 在ＨＣＣ 中，ｃｙｃｌｉｎＤ１ 基因过表达和／ 或ｐ１６ 蛋白丢失均起重要作用     

p38丝裂原活化蛋白激酶和乙型肝炎病毒X蛋白在人肝癌发生中对细胞增殖和凋亡的作用

目的 研究人肝癌发生过程中p38MAPK和乙型肝炎病毒X蛋白(HBX)对细胞增殖和凋亡的影响,探讨肝癌发生的机制. 方法 应用免疫组织化学和DNA原位末端标记(TUNEL)法原位检测人肝癌(36例)和相关慢性肝病组织(慢性乙型肝炎、肝硬化和癌周肝硬化分别为20、20、36例)的p38MAPK、HBX、细胞周期G2/M期相关因子(cdc25B,p34cdc2,细胞周期蛋白B1)、细胞增殖因子Ki-67和细胞凋亡情况.根据资料不同分别采用x2检验、One-Way ANOVA或t检验进行统计学处理. 结果 HBX在慢性乙型肝炎(65.0％)和肝癌组(44.4％)阳性率较高,主要表达于胞核; p38MAPK、cdc25B、细胞周期蛋白B1、p34cdc2的阳性率从正常肝组织(40.0％,20.0％,20.0％,30.0％)、慢性乙型肝炎(60.0％,65.0％,40.0％,50.0％)、肝硬化(65.0％,75.0％,70.0％,55.0％)、癌周肝硬化(66.7％,75.0％,75.0％,63.9％)到肝癌组(77.8％,80.6％,80.6％,72.2％)逐渐增高,表达部位发生改变.p38MAPK胞核表达主要见于慢性乙型肝炎组和肝硬化组,胞质表达见于癌周肝硬化组和肝癌组,癌周肝硬化组与肝癌组之间的差异无统计学意义(x2=1.11,P＞0.05).正常肝、慢性乙型肝炎、肝硬化、癌周肝硬化和肝癌组织中的增殖指数(0.0000±0.000,0.0502±0.011,0.0411±0.009,0.0762±0.017,0.1810±0.036)和凋亡指数(0.0351±0.024,0.0607±0.022,0.0562±0.013,0.0716±0.011,0.1200±0.018)比较,除肝硬化外也逐渐增高,增殖指数在肝癌分化差组(0.2285±0.062)高于分化好组(0.1216±0.032,t=2.082,P=0.044),凋亡指数肝癌在分化好组(0.152±0.026)高于分化差组(0.081±0.022,t=2.129,P=0.041).结论 肝癌发生过程中,HBX可能通过p38MAPK通路引起细胞周期、细胞增殖和凋亡的异常改变.细胞增殖基本与凋亡相伴随,肝癌增殖程度高于凋亡程度.癌周肝硬化不同于不伴癌的肝硬化,与肝癌的关系更密切.     

hMLH1和hMSH2蛋白在肝细胞癌中的表达及意义

本研究采用免疫组织化学法 ,对ＤＮＡ错配修复 (ＭＭＲ)系统中 2个主要基因ｈＭＬＨ1和ｈＭＳＨ2在肝细胞癌 (ＨＣＣ)中的表达状况进行了检测和相关指标分析 ,以进一步了解ＭＭＲ路径在ＨＣＣ发生中的可能作用。一、对象与方法1 .研究对象 :随机选择第二军医大学东方肝胆外科医院病理科 2 0 0 0年 6月～ 7月期间连续手术切除的ＨＣＣ标本 50例 ,患者中男 40例 ,女 1 0例 ,年龄范围 35～ 76岁 ,所有患者术前均未做过放疗或化疗。于癌和癌旁肝组织交界处取材 ,1 0 %中性甲醛固定 ,常规石蜡包埋 ,4μｍ连续组织切片 ,分别行常规ＨＥ染色和ｈＭ…     

基于TCGA数据库构建肝细胞癌中RNA结合蛋白预后评估模型

目的 采用生物信息学方法,构建肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)患者RNA结合蛋白(RNA-binding proteins,RBPs)预后评估模型,并判断对HCC患者预后情况.方法 从肿瘤基因组图谱(the cancer genome atlas program,TCGA)数据库中下...     

人肝细胞癌中转移抑制基因nm23编码蛋白的表达

目的探讨肝脏冷保存与移植肝原发性无功能的关系。方法采用具有免疫耐受性的同种大鼠原位肝移植模型进行研究。将鼠肝分别在４℃ＵＷ液中保存１，６和２４ｈ，分别在移植后１ｈ和２４ｈ取肝脏做病理观察。结果保存在ＵＷ液中的肝脏基本保存了正常的组织结构，而在移植后则不同程度地出现了变性或坏死，并且肝细胞的坏死是以小叶中央静脉为中心。保存时间越长，病变越严重。结论肝脏冷保存时间与移植肝原发性无功能的发生密切相关。     

肝细胞癌组织SOCS1和STAT3蛋白的表达意义

目的:探讨SOCS1和STAT3蛋白在HCC组织中的表达、相互关系及在HCC发生发展中的意义.方法:应用免疫组化方法检测48例HCC组织和癌周肝组织、肝硬化(liver cirrhosis,LC)组织(n=11)及正常肝组织中(n=11)SOCS1和STAT3的表达水平.结果:癌周肝组织中SOCS1蛋白表达强度显著高于HCC组织,SOCS1蛋白在LC组织及正常肝组织中全部呈阴性表达.HCC组织和癌周肝组织STAT3蛋白阳性表达率显著高于LC组织和正常肝组织;SOCS1在瘤体大小间的表达有显著性差异(P<0.01).STAT3在表达AFP阴性和阳性癌组织组间有显著性差异(P<0.05).HCC组织中SOCS1和STAT3表达具有显著等级正相关(rs=0.431,P<0.01).结论:SOCS1和STAT3表达与HCC的发生密切相关,且两者之间的表达强度具有显著等级正相关.     

DLC-1基因在肝细胞癌组织中表达的研究

目的 研究肝癌缺失基因-1（DLC-1）在人原发性肝癌组织中的表达及与肝细胞癌侵袭转移的关系。方法收集51例复旦大学附属中山医院外科手术切除的肝细胞癌及癌旁正常组织标本,用荧光定量RT-PCR方法分析组织中DLC-1基因的表达。结果在51对配对的肝细胞癌与癌旁无瘤肝组织中,前者DLC-1基因表达水平明显低于后者（P〈0．01）,且高侵袭性肝细胞癌组明显低于低侵袭性肝细胞癌组（P〈0．05）。结论DLC-1基因在HCC组织中呈低表达,其表达水平与其侵袭性高低相关。     

原发性肝细胞癌中CD44v6和nm23H1基因的转录表达及临床意义

研究CD44v6 mRNA和nm23H1 mRNA表达与肝细胞癌（HCC）侵袭转移和预后的关系。应用原位杂交方法，检测分析HCC组织中CD44v6 mRNA和nm23H mRNA表达。99例HCC中，CD44v6 mRNA和nm23H1 mRNA表达阳性率分别为41．4％和76．8％。CD44v6mRNA表达与nm23H1mRNA表达呈负相关。CD44v6和nm23HmRNA表达均与HCC侵袭转移倾向和预后相关。检测CD44v6和nm23H1表达有可能成为HCC 侵袭转移和预后判断的病理生物学指标。     

叉头转录因子家族在肝细胞癌中的作用机制及其作为治疗靶点的前景

肝细胞癌(HCC)是最常见的恶性癌症之一,发病率和病死率一直居高不下,预后很差。叉头框(FOX)转录因子家族可调控细胞的生长、分化及组织发育,在肿瘤中具有重要的生物学作用。综述了FOX家族分子表达与HCC发生发展及预后的关系,分析了FOX在HCC进展中发挥作用的机制,提出FOX家族分子有望成为HCC治疗的新靶点。