Y染色体单倍型在贵州苗族人群中的多态性分布

目的：调查Y染色体单倍型在贵州省苗族人群中的分布，从父系历史探寻贵州省苗族人的起源和迁移及其与其他民族间的亲缘关系。方法：采用PCR—RFLP法观察了由13个单核苷酸多态位点(SNPs)组成的Y染色体单倍型在贵州省苗族人群中的多态性分布，并将结果与我国其他民族及世界各大洲人群进行比较。结果：贵州省苗族人群中具有我国南方人群特异性的H7、H11和H12单倍型出现，其单倍型分布与我国南方汉族、土家族、彝族、布依族等较为接近，尤以M122(H5 H6)的频率较高。结论：提示贵州省苗族人属于我国南方群体，与南方汉族人及土家族、彝族人有一定的亲缘关系。     

Y-染色体单核苷酸多态性对中国黎族起源的研究

目的使用Y染色体单核苷酸多态性（Y—SNP）的证据从遗传学角度研究中国黎族的起源。方法选取部分与人类迁移相关的Y染色体非重组区的单核苷酸多态位点，采用PCR—RPLF和geno—typing法分析这些单核苷酸多态位点的多态性，观察由这些多态性位点组成的单倍型在黎族五个支系人群中的分布情况，并将结果与其他人群的分布进行比较。结果在黎族人群中发现4种Y染色体单倍型，其中单倍型O＊-175为五支系所共有，且分布频率都在95％以上，其它3个单倍型只在部分支系中很少量存在。结论黎族五个支系可能有共同的起源，起源于中国古代百越的可能性最大，并与台湾原住民关系非常接近。     

中国布依族、苗族人群线粒体DNA Region V区的遗传多态性

目的：研究中国布依族、苗族人群线粒体DNA Region V区的遗传多态性。方法：采用PCR直接测序法对布依族(96份)及苗族人(90份)样本线粒体DNA Region V区进行序列分析。结果：在布依族及苗族样本中只发现标准型和短型两种多态，短型多态(即9 bp缺失)频率在布依族、苗族人群中分别为31．1％和33．3％。结论：中国布依族、苗族人群线粒体DNA Region V区有相似的多态性，而与其他民族或人种有一定差异。     

肾素基因单核苷酸多态与心肌梗死的关系

目的检测中国人群中肾素基因的单核苷酸多态 (SNPs)及其分布,探讨其与中国华东地区汉族人群心肌梗死的关系.方法 PCR-直接测序技术检测24份取自中国不同民族人群的DNA样本,筛查肾素基因启动子区、编码区和外显子-内含子连接区,明确SNPs及其分布;应用PCR-直接测序和SnaPshot法对所发现的SNPs进行基因分型.选择380份无血缘关系的中国华东地区汉族人群(195例心肌梗死和185例健康对照)DNA样本,进行肾素基因候选SNPs的病例-对照关联分析和单倍型分析.结果所检测的5 247 bp 肾素基因序列中共发现8个SNPs,其基因型和等位基因频率分布,在对照组和心肌梗死组间无统计学差异(P>0.05);单倍型分析显示启动子区域单倍型频率分布,在两组人群间无显著性差异(P>0.05).结论肾素基因可能不是中国华东地区汉族人群心肌梗死发病的易感基因.     

Apelin基因与原发性高血压的相关性

目的 探讨apelin基因多态性及单倍型与原发性高血压的相关关系.方法 选取上海地区汉族人群原发性高血压家系248家共1 042人为研究样本,应用TaqMan MGB荧光探针定量PCR技术,检测各样本apelin基因启动子区T-1860C和rs3761581基因多态性分型.应用FBAT软件预测该两个多态性位点可能组成的单倍型,并对多态位点及单倍型与原发性高血压的关系进行分析.结果 所选位点基因型频率在研究人群中的分布均符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律.应用FBAT统计分析结果显示T-1860C、rs3761581及其组成的单倍型A-T与原发性高血压相关.其中T-1860C的T等位基因(Z=1.991,P=0.046)和rs3761581的A等位基因(Z=2.119,P=0.034)可以由亲代下传给患病子代.结论 位于apelin基因启动子区的多态性位点与上海地区汉族人群原发性高血压存在相关关系,单倍型A-T可能参与高血压的发病.     

黎族三个支系DYS390、DYS393、DYS395基因座的遗传学研究

目的调查黎族3个支系Y染色体上3个短串联重复序列基因座及单倍型的遗传多样性，探讨黎族不同支系的起源与关系。方法对所有样本的3个Y—STR位点进行PCR扩增，产物在ABIPRISMTM377 DNA Sequencer上进行电泳，结果用Genotyper2．5软件进行分型。结果在3个Y—STR基因座，3个支系人群共发现15个等位基因，25种单倍型。本地黎12个等位基因，8种单倍型，杞黎10个等位基因，9种单倍型，体黎10个等位基因，20种单倍型。单倍型的遗传多样性分别为0．611，0．677，0．871。结论调查的3个Y—STR基因座的等位基因分布有较好的地区种族差异，对海南岛黎族起源、迁移以及各群体的相互关系研究有重要意义。     

APEX1单核苷酸多态性与肝癌易感性关系的研究

目的 探讨中国福建人群APEX1单核苷酸多态性(SNP)与肝细胞癌(HCC)易感性的关系. 方法 应用连接酶检测反应(LDR)及直接测序法检测APEX1 rs2307486、rs1130409及rs33956927 3个SNP位点,并进行连锁不平衡及单倍型分析,探讨3个SNP在福建HCC人群中的分布情况,并分析其与该人群HCC易感性的关系. 结果 相对于GG基因型,rs33956927位点的GA基因型增加了患HCC的风险(P=0.002),而rs2307486和rs1130409多态性与HCC易感性无关(P＞0.05). 结论 APEX1 rs33956927多态位点携带GA基因型人群可能对HCC更易感,APEX1 rs33956927多态性可作为筛查HCC好发的危险因素;rs2307486和rs1130409多态性与HCC的发生无关.     

肝细胞核因子1a基因多态位点与上海地区2型糖尿病相关临床性状的关系

目的 肝细胞核因子(HNF)-1a基因单核苷酸多态(SNP)位点可能与2型糖尿病及其相关性状相关,对以往发现的HNF-1a基因6个标签SNP进行糖尿病相关数量性状分析,以进一步探讨其与糖脂代谢及体脂分布的潜在关系.方法 245名无亲缘关系的上海地区中国人,包括152例早发/多发糖尿病家系先证者(病例组)及93名糖调节正常者(正常对照组).采用直接测序或聚合酶链反应(PCR)-限制性片段长度多态性(RFLP)方法检测受试者基因型,并测定所选人群的糖脂代谢及体脂分布指标.对不同基因型亚组间进行标签SNP的单点和单倍型数量性状分析.结果 正常对照组中,rs1169294、rs1169301和rs2259820的各基因型亚组间的体质指数(BMI)、腰臀比(WHR)和腰股比(WFR)的差异均有统计学意义(P值均＜0.05),且经性别、年龄校正后差异仍有统计学意义(P值均＜0.05).此外,rs1169289的基因型亚组间WFR的差异有统计学意义(P＜0.05).单倍型分析发现,正常对照组中最常见单倍型GCGC携带者的BMI较非GCGC携带者显著降低(p=0.0065),且经年龄和性别校正后,差异仍有统计学意义(p=0.0170).结论 HNF-1a多态位点与中国人体脂分布相关.     

肾素基因单核苷酸多态与心肌梗死的关系

目的 检测中国人群中肾素基因的单核苷酸多态（SNPs）及其分布，探讨其与中国华东地区汉族人群心肌梗死的关系。方法PCR一直接测序技术检测24份取自中国不同民族人群的DNA样本，筛查肾素基因启动子区、编码区和外显子-内含子连接区，明确SNPs及其分布；应用PCR-直接测序和SnaPshot法对所发现的SNPs进行基因分型。选择380份无血缘关系的中国华东地区汉族人群（195例心肌梗死和185例健康对照）DNA样本，进行肾素基因候选SNPs的病例一对照关联分析和单倍型分析。结果所检测的5247bp肾素基因序列中共发现8个SNPs，其基因型和等位基因频率分布，在对照组和心肌梗死组间无统计学差异（P〉0．05）；单倍型分析显示启动子区域单倍型频率分布，在两组人群间无显著性差异（P〉0．05）。结论肾素基因可能不是中国华东地区汉族人群心肌梗死发病的易感基因。     

重庆地区人群HLA-A,B基因和单倍型的多态性分析

目的 对重庆地区人群HLA-A,B基因座位的单倍型分布特征及基因相关性进行研究.方法 采集重庆地区201名无血缘关系健康个体静脉血,应用聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-SSP)方法对其HLA-A,B基因座位进行等位基因分型,计算HLA-A,B基因型频率及基因频率,统计HLA-A,B单倍型出现情况并做连锁相关性分析.结果 在重庆地区的人群中,最常见的HLA-A-B 单倍型是HLA-A*02-B*46、HLA-A*11-B*13和HLA-A*24-B*46、HLA-A*30-B*13.HLA-A*02-B*46、HLA-A*11-B*60和HLA-A*30-B*13为重庆分库最常见、连锁不平衡最显著的单倍型.与我国北方、南方汉族比较,更接近南方汉族人群.结论 重庆地区人群HLA- A,B基因具有较为丰富的多态性,其分布符合南方汉族的特点,HLA单倍型分布特征与南方汉族人群相近,但也有其自身特点.     

Apelin基因与原发性高血压的相关性

目的探讨apelin基因多态性及单倍型与原发性高血压的相关关系。方法选取上海地区汉族人群原发性高血压家系248家共1042人为研究样本，应用TaqMan MGB荧光探针定量PCR技术，检测各样本apelin基因启动子区T-1860C和rs3761581基因多态性分型。应用FBAT软件预测该两个多态性位点可能组成的单倍型，并对多态位点及单倍型与原发性高血压的关系进行分析。结果所选位点基因型频率在研究人群中的分布均符合Hardy—Weinberg遗传平衡定律。应用FBAT统计分析结果显示T-1860C．rs3761581及其组成的单倍型A—T与原发性高血压相关。其中T-一1860C的T等位基因（Z=1．991，P=0．046）和rs3761581的A等位基因（Z=2．119，P=0．034）可以由亲代下传给患病子代。结论位于apelin基因启动子区的多态性位点与上海地区汉族人群原发性高血压存在相关关系，单倍型A—T可能参与高血压的发病。     

血管紧张素转换酶1基因单倍型与血浆酶活性及血压的关系

目的:探讨中国汉族群体血管紧张素转换酶1(ACE1)活性、ACE1基因连锁不平衡状态及与高血压间相互关系。方法:检测204例汉族个体ACE1基因4个常见多态位点的分布,估计基因连锁不平衡状态和单倍型结构,并检测血浆酶活性,同时对295例高血压患者与198例血压正常人中进行关联分析。结果:ACE1基因多态间存在高度连锁不平衡(P<0.0001),4个多态存在于常见的7个单倍型中,最常见的单倍型为A(A-A-T-I)和B(C-T-C-D)。ACE1基因各位点多态性在个体中的分布与血浆中ACE1活性有关。单个位点除A-240T外,其余各位点均未见与高血压关联,单倍型D的频率在高血压患者中高于对照组。结论:本组研究群体中,T-240位点可能与高血压易感位点连锁不平衡。     

肝细胞核因子1α基因多态位点与上海地区2型糖尿病相关临床性状的关系

目的肝细胞核因子(HNF)-1α基因单核苷酸多态(SNP)位点可能与2型糖尿病及其相关性状相关,对以往发现的HNF-1α基因6个标签SNP进行糖尿病相关数量性状分析,以进一步探讨其与糖脂代谢及体脂分布的潜在关系。方法245名无亲缘关系的上海地区中国人,包括152例早发/多发糖尿病家系先证者(病例组)及93名糖调节正常者(正常对照组)。采用直接测序或聚合酶链反应(PCR)-限制性片段长度多态性(RFLP)方法检测受试者基因型,并测定所选人群的糖脂代谢及体脂分布指标。对不同基因型亚组间进行标签SNP的单点和单倍型数量性状分析。结果正常对照组中,rs1169294、rs1169301和rs2259820的各基因型亚组间的体质指数(BMI)、腰臀比(WHR)和腰股比(WFR)的差异均有统计学意义(P值均<0.05),且经性别、年龄校正后差异仍有统计学意义(P值均<0.05)。此外,rs1169289的基因型亚组间WFR的差异有统计学意义(P<0.05)。单倍型分析发现,正常对照组中最常见单倍型GCGC携带者的BMI较非GCGC携带者显著降低(P=0.006 5),且经年龄和性别校正后,差异仍有统计学意义(P=0.017 0)。结论HNF-1α多态位点与中国人体脂分布相关。     

圆锥动脉干畸形患者TBX1基因单倍型分析

目的检测分析单核苷酸多态（SNP）位点在圆锥动脉干畸形患者和正常人群中的分布情况,以及与所构成单倍型与圆锥动脉干畸形的相关性.方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法分析130例圆锥动脉干畸形患者及200名正常人3个SNP位点基因型;应用列联表法统计分析患者组和对照组各SNP位点基因型及等位基因频率;应用PHASE软件构建单倍型并统计分析患者组及对照组单倍型频率是否存在差异.结果 G2963A位点等位基因频率及基因型频率在患者组和对照组中的分布差异显著,患者组G等位基因频率明显高于对照组（χ^2=8.14, P〈0.005）;单倍型分析可见4种单倍型在患者组和对照组中的分布频率差异有统计学意义 （χ^2=22.39 P〈0.005）：G2857/G2963/A6571和G2857/G2963/T6571为人群中常见单倍型.患者组中G2857/G2963/A6571、C2857/A2963/T6571两种单倍型频率较对照组高.结论 TBX1基因编码区的SNP位点G2963A与圆锥动脉干畸形有明显的相关性,具有G等位基因的人发生圆锥动脉干畸形的危险性相对增高;3个SNP位点所构成的单倍型有一定意义,可能与圆锥动脉干畸形易感基因相连锁.     

贵州3个民族亚甲基四氢叶酸还原酶基因的遗传多态性

目的对贵州侗族、布依族、苗族亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因多态性进行研究。方法应用TaqManMGB探针基因分型方法检测贵州3个民族MTHFR基因两个SNP(677及1 298位)多态位点的基因频率及基因型频率,并构建单倍型。结果 MTHFR 677C/T位点3个民族之间基因型和等位基因频率差异有统计学意义(P<0.05),其中布依族与苗族间基因型和布依族与侗族、苗族间等位基因频率差异有统计学意义(P<0.01)。MTHFR 1298A/C位点3个民族之间基因型和等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05)。677CC/1298AA双野生型频率以布依族最低,3个民族中均未见677TT/1298CC双纯和突变及677TT/1298AC组合。3个民族中以677C-1298A(54.3%)单倍型所占平率最高。布依族和苗族两位点间存在677C/T和1298A/C连锁不平衡现象。结论 MTHFR基因677C/T和1298A/C位点在不同民族、不同地区间的分布存在明显差异。     

肿瘤坏死因子α基因与上海地区汉族人群冠心病发病风险的关系

目的 研究肿瘤坏死因子α(TNF-α)基因启动子区域5种单核苷酸多态及其构成单倍型与上海地区汉族人群冠心病(CAD)发病的相关性.方法 采用质谱检测方法,对438例CAD患者和330名健康对照者的TNF-α基因启动子区域的T-1031C、C-863A、C-857T、G-308A和G-238A多态进行基因分型;并检测受试者的血糖和血脂浓度.结果 C-857T多态基因型分布及其等位基因频率在CAD组和对照组间比较差异有统计学意义(P＜0.05),-857C等位基因携带者的CAD发病风险是T携带者的1.45倍(95%CI=1.092～1.927).CAD患者中,C/C基因型和C/T基因型的血清总胆固醇浓度和低密度脂蛋白胆同醇浓度明显高于其T/T基因型携带者,差异有统计学意义(P＜0.05).两组间G-308A多态等位基因频率比较差异也有统计学意义(P＜0.05),-308A等位基因携带者的CAD风险是非携带者的1.43倍(95%CI=1.055～1.949).单倍型分析提示,单倍型CCCGA和TCCAG频率在CAD组明显升高,与对照组相比差异有统计学意义(P＜0.05和P＜0.01),其携带者的CAD风险分别是非携带者的2.96和1.67倍(95%CI分别为1.176～7.430和1.166～2.379);而单倍型TCTGG在对照组中明显增加,可降低CAD的发病风险(OR=0.57,95%CI=0.415～0.784,P＜0.01).结论 TNF-α基因启动子区域多态可能与上海地区汉族人群CAD的发病相关.     

中国3个民族群体Y染色体上17个双等位基因位点的遗传分析

目的研究中国不同民族群体Y染色体的遗传多样性.方法采用PCR和等位基因特定PCR(ASPCR)的方法,对山东汉族、白族和土族共计76份男性DNA样本进行Y染色体上17个双等位基因位点的基因分型,确定每一个体的单倍型,统计3个群体各单倍型的频率分布,与国内其他群体的结果进行对比分析,并进行这些群体的主成分分析.结果有6个位点在3个群体中没有发现多态变异,YAP 在土族、白族和山东汉族中的分布分别为23.8%、6.7%和4%;3个群体共发现11种单倍型,山东汉族7种,土族8种,白族9种,主要单倍型频率集中在H1、H3、H5、H6、H8和H11.主成分分析结果显示白族与北方汉族相近,山东汉族与南方汉族等南方群体聚在一起,土族与彝族、回族和满族相近.结论山东汉族可能与一些南方群体有过基因交流,白族基因池中融入汉族基因流.中亚人群的基因流可能对东亚人群的遗传结构有过影响.     

广西壮族和汉族人群白细胞介素-18基因单核苷酸多态性及单倍型分析

目的了解白细胞介素-18(IL-18)基因启动子-137G/C,-607C/A多态性及单倍型在广西地区壮族及汉族人群中的分布频率,比较其在不同种族间分布的差异。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术和DNA测序法检测160名壮族人和150名汉族人的IL-18基因-137G/C,607C/A多态性,比较两组IL-18基因型、等位基因及单倍型的分布频率;并结合文献进行不同种族间的比较分析。结果在广西壮族及汉族人群中IL-18基因单核苷酸多态性及单倍型的分布频率差异均无显著性(P>0·05),但与欧洲人群比较,IL-18基因单核苷酸多态性及单倍型的分布频率均差异有显著性(P<0·05)。结论在广西地区壮族及汉族人群中存在IL-18基因多态性,其基因单核苷酸多态性及单倍型的分布频率差异均无显著性,但与其他种族人群比较差异有显著性,这种差异可能是导致一些疾病在不同种族间的发病率和临床表现存在显著不同的因素之一。     

血管紧张素原基因与黎族原发性高血压并脑梗死相关性

目的 研究血管紧张素原（AGT）基因四个位点的单核苷酸多态及其构成的单倍型与海南黎族原发性高血压并脑梗死的相关性.方法 选择海南黎族人群为研究对象,利用PCR-直接测序法,在100例原发性高血压并脑梗死患者和100例健康对照者中,对AGT基因启动子区域的G-152A,A-20C,C-18T,A-6G多态进行基因分型.结果原发性高血压并脑梗死组与健康对照组相比,C-18T多态的基因型和等位基因频率分布差异均有显著性（P=0.002,P=0.002）.A-6G多态的G等位基因频率在原发性高血压并脑梗死组显著高于对照组（P=0.016）.单倍型分析提示由-20C和-6G构成的H6单倍型在原发性高血压并脑梗死组中明显增加,与对照组相比有显著性差异（P=0.003）.结论 在海南黎族人群中,A-20C,C-18T,A-6G多态可能是原发性高血压并脑梗死发病的遗传危险因素.     

NTNG1基因多态性与精神分裂症的关系

目的 探讨中国北方汉族人群中NTNG1基因rs4132604、rs2218404、rs1373336基因多态性与精神分裂症的关系.方法 采用聚合酶链式反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法,检测中国北方汉族316例精神分裂症患者及311例健康对照者的基因型,应用遗传统计学方法进行等住基因型及等位基因频率分析、单倍型分析.结果 病例组和对照组NTNG1基因的rs4132604、rs2218404、rs1373336基因型频数分布均符合Hardy-Weinberg平衡定律(P>0.05);rs4132604等位基因频率(χ2=7.86,P=0.01)和基因型分布(χ2=7.67,P=0.02)在病例组和对照组间存在显著性差异,提示该基因在中国北方汉族人群中同精神分裂症的发病明显相关.病例组与对照组比较,rs2218404、rs1373336等位基因频率和基因型分布未见显著性差异.在单倍型分析中,rs4132604与rs2218404中的GG(χ2=6.11,P=0.01)和TG(χ2=5.28,P=0.02)、rs2218404与rs1373336中的GT(χ2=5.38,P=0.02)和GC(χ2=4.72,P=0.03)、三者中GGT(χ2=13.40,P=0.00)和TGT(χ2=6.56,P=0.01),两组间存在显著性差异.结论 NTNG1基因的rs4132604多态位点同精神分裂症存在关联.IWNG1基因的rs4132604、rs2218404、rs1373336构成的单倍型上存在同精神分裂症发病的相关位点.