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1.
应用IMAC3蛋白芯片分析食管鳞癌患者血清蛋白质谱的变化   总被引:1,自引:0,他引:1  
Liu CZ  Zhu PY  Shi MX  Liu JB  Liao P  Xiang CQ  Zhang YX  Wang WJ 《癌症》2008,27(3):272-278
背景与目的:血清蛋白指纹图谱技术有助于筛选与食管上皮癌变相关的分子变化。本研究通过比较食管鳞癌患者与正常对照血清蛋白表达谱的差异,筛选食管鳞癌相关血清蛋白标志物并建立诊断模型,同时探讨其在食管鳞癌血清学诊断中的意义。方法:收集68例食管鳞癌患者和44例正常对照的血清,其中建模型组90例(55例为食管鳞癌,35例为正常对照),盲法筛选组22例(13例为食管鳞癌,9例为正常对照)。采用固定金属亲和表面(immobilized metalaffinity capture,IMAC3)芯片,经表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(surface enhanced laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,SELDI-TOF-MS)测定得到蛋白质谱,通过Biomarker Wizard软件比较两组人群的血清蛋白质谱的差异,经生物信息学分析得到决策树模型并进行盲法验证。结果:在质荷比(m/z)1.5~20ku范围内,共检测到78个有效蛋白峰,其中25个峰差异有统计学意义(P<0.001)。对建模型组的蛋白质谱数据,通过1000次随机抽样,得到1000个决策树。结合3倍交叉证实方法,构建了"食管鳞癌-正常对照"分组诊断的20个决策树模型。用这20个决策树来对22个盲法筛选样本进行归类预测,预测正确的样本为18个,盲法验证的灵敏度为92.31%,特异度为66.67%。结论:应用SELDI-TOF-MS技术可以筛选出食管鳞癌相关的血清蛋白标志,建立的决策树模型可以对食管鳞癌做出较为准确的预测判断。  相似文献   

2.
目的:应用SELDI-TOF-MS技术寻找食管鳞癌血清中相关差异表达蛋白。方法:应用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术,用WCX2芯片分析了24对食管鳞癌和正常对照的血清蛋白表达谱。结果:与正常对照相比,发现其中6个血清蛋白在食管鳞癌和正常对照组的差异有统计学意义(P<0.05),其中在食管鳞组低表达的有M/Z为4623,5012,5809和9422,而高表达的有5910,11681。结论:SELDI-TOF-MS技术是一种快速、简便易行且高通量的分析方法,不仅能直接筛选出食管癌患者血清中差异表达的潜在标记物,而且可能具有较好的临床应用前景。  相似文献   

3.
摘要:目的筛选鼻咽癌患者血清蛋白差异表达并建立诊断模型,分析不同临床特征患者的血清蛋白质谱差异。方法应用SELDI技术分析102例鼻咽癌患者及118例健康对照的血清样本,Biomarker Wizard和Biomarker Pattern 软件分析两组之间的差异,建立分类树诊断模型并进行盲筛验证;进一步分析鼻咽癌不同临床分型及EB病毒感染状态对患者血清蛋白质表达谱的影响。结果发现鼻咽癌与健康对照之间有25个血清蛋白质谱峰差异有统计学意义(P<0.01), 13个蛋白峰表达下调,12个蛋白峰表达上调。经Biomarker Pattern 软件建立分类树模型,盲法验证其敏感度为97.56%,特异性为88.89%,准确率达92.63%;上行型和下行型鼻咽癌之间发现M/Z为10286Da、7569Da及8149Da的3个血清蛋白质峰差异有统计学意义(P<0.05);EB阳性和EB阴性鼻咽癌间M/Z为9354Da及4596Da的2个血清蛋白质峰差异有统计学意义(P<0.05)。结论SELDI-TOF-MS 技术可筛选出鼻咽癌差异性蛋白并建立鼻咽癌诊断的分类树模型,有望成为鼻咽癌早期诊断的辅助指标;并且用SEDLI技术可以发现一些与鼻咽癌临床特征相关的血清蛋白差异峰。  相似文献   

4.
目的:探讨乳腺癌与乳腺增生症患者在血清蛋白表达方面的差异.方法:采用表面增强激光解析离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测119例乳腺癌和42例乳腺增生症患者的血清蛋白质谱,用生物标记向导和模型匹配软件进行组间差异分析,构建分类决策树以鉴别乳腺癌.结果:乳腺癌与乳腺增生症两组间有23个显著性差异蛋白峰,用其中的8个差异蛋白构建决策树分类模型,在学习模式下灵敏度为100%(119/119),特异性为97.62%(41/42),检测模式下灵敏度和特异性分别为91.60%(109/119)和92.86%(39/42).结论:乳腺癌与乳腺增生症的血清蛋白表达存在差异,差异蛋白质组研究有助于这2种疾病的鉴别诊断.  相似文献   

5.
Wang SJ  Zhang LW  Yu WF  Yu JK  Zheng S  Li YS  Er LM  Wen DG  Gao JH 《中华肿瘤杂志》2007,29(6):441-443
目的用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)分析食管鳞癌患者血清蛋白表达谱的改变,筛选并建立高发区食管癌血清蛋白指纹图诊断模型,探究其临床价值。方法采用CM10蛋白芯片及SELDI-TOF-MS技术,对36例食管癌患者和38例正常对照者的血清进行蛋白指纹图谱检测,支持向量机分析实验数据,建立食管癌诊断模型,采用盲法验证。结果在分子量2000~20000范围内,共检测到31个蛋白质荷比峰,差异有统计学意义(P<0.01)。以4个质荷比峰建立了食管癌诊断模型,并用留一法交叉验证作为评估模型判别效果的方法,其准确率为85.1%,敏感性为86.1%,特异性为84.2%,真阳性率为83.8%。结论由4个质荷比峰构成的诊断模型可以区分食管癌和正常对照,为高发区食管癌的筛查与诊断提供了一条新的途径。  相似文献   

6.
Ying MG  Chen Q  Ye YB  Chen HJ  Chen X  Zheng HY  Wu F 《中华肿瘤杂志》2010,32(9):698-702
目的 建立乳腺癌的血清蛋白质谱诊断模型,评价其在乳腺癌辅助诊断中的价值.方法 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测113例乳腺癌患者、103例乳腺良性肿瘤患者及92例健康女性的血清蛋白质谱,采用Biomarker Pattern(BPS)软件分析蛋白质谱,建立分类树模型,然后对模型进行盲筛验证.结果 比较乳腺癌患者与健康女性的血清蛋白质谱,筛选出12个差异蛋白质峰.经验证,所建立的分类树模型Ⅰ诊断乳腺癌的灵敏度为91.9%,特异度为81.2%.比较乳腺良性肿瘤患者与健康女性的血清蛋白质谱,筛选出11个差异蛋白质峰.经验证,所建立的分类树模型Ⅱ诊断乳腺良性肿瘤的灵敏度为87.9%,特异度为81.2%.比较乳腺癌与乳腺良性肿瘤患者的血清蛋白质谱,筛选出2个差异蛋白质峰.经验证,所建立的分类树模型Ⅲ诊断乳腺癌的灵敏度为81.8%,特异度为78.3%.应用这些差异蛋白及分类树模型,分别对93例CA15-3阴性乳腺癌患者与36例乳腺良性疾病患者的血清、20例CA15-3阳性乳腺癌患者与36例乳腺良性疾病患者的血清进行盲筛,诊断乳腺癌的敏感度和特异度分别为80.6%和91.7%、75.0%和91.7%,明显高于传统的乳腺癌标志物CA15-3,而CA15-3阴性与CA15-3阳性乳腺癌未见明显的差异蛋白质峰.结论 应用SELDI-TOF-MS技术可筛选出乳腺癌、乳腺良性肿瘤和健康女性血清蛋白质谱存在的差异蛋白质峰,据此建立的诊断模型可用于乳腺癌的辅助诊断.  相似文献   

7.
胃癌患者血清蛋白质指纹图谱的初步探讨   总被引:9,自引:0,他引:9  
目的:探讨胃癌发生、发展过程中患者血清蛋白质指纹图谱,筛选与胃癌病理分期密切相关的蛋白质分子。方法:用WCX2(弱阳离子交换芯片)蛋白芯片结合表面增强激光解吸电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测30例胃癌患者和26例健康者、3例胃良性病患者血清样本的蛋白质谱,同时采用相关计算机软件筛选不同组别间差异蛋白。结果:初步筛选出对早期胃癌有代表性的4个差异蛋白,质荷比(M/Z)分别为6193、6363、16073和16317;2个与胃癌脏器转移相关的差异蛋白(32463、34906M/Z)。结论:SELDI-TOF-MS蛋白质芯片用于胃癌患者血清蛋白质谱分析可筛选出有意义的差异表达蛋白,有进一步研究的价值。  相似文献   

8.
Wang LD  Wang DC  Zheng S  Fan ZM  Li JL  Feng CW  Zhang YR  Liu B  Gao SS  He X  Feng XS 《癌症》2006,25(5):549-554
背景与目的:食管癌和癌前病变组织中部分分子改变可在血液中反映出来,但这些指标的灵敏度和特异性较低,临床应用受到限制。血清蛋白质质谱分析技术有助于筛选癌变密切相关蛋白。本研究通过探讨食管癌高发区人群食管正常粘膜(normal,NOR)、食管上皮基底细胞过度增生(basalcellhyperplasia,BCH)、不典型增生(dysplasia,DYS)和食管癌(esophagealcarcinomc,EC)患者的血清蛋白质质谱的变化特征,为筛选和建立早期诊断和高危人群检测的血清学指标提供理论依据。方法:采用弱阳离子结合芯片(WCX2)及表面增强激光解吸电离飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)检测EC高发区无症状普查人群130人(NOR63人、BCH40人、DYS27人)和高发区EC30人的血清蛋白质质谱进行分析。应用BiomarkerPattern软件建立决策树分类模型,经10倍交叉验证得到该分类模型进行验证,测试组病变人群的诊断率和特异性(排除率)。结果:BCH组质荷比(M/Z)为M9306.61u的一种、DYS组M/Z为M13765.90u的一种及EC组M/Z为M2942.15u和M15953.40u的两种蛋白质分别建立决策树分类模型,训练组BCH、DYS和EC的敏感性(检出率)分别为57.5%(23/40)、88.8%(24/27)和96.6%(29/30),特异性分别为96.8%(61/63)、63.4%(40/63)和92.0%(58/63);测试组BCH、DYS和EC敏感性分别为57.5%(23/40)、66.6%(18/27)和60.0%(18/30),特异性为95.2%(60/63)、71.4%(45/63)和84.1%(53/63)。结论:M/Z为M9233.09u、M13657.15u、M2918.91u和M15827.37u的4种蛋白质可能包含有可用于食管癌高发区人群筛查的血清标记物,血清蛋白质质谱检测为食管癌和癌前病变的诊断和筛查提供了新的手段。  相似文献   

9.
目的 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选乳腺癌的特异性蛋白标志物.方法 用SELDI-TOF-MS仪及CM10蛋白芯片检测110例乳腺癌患者治疗前及100名健康对照的血清蛋白指纹图谱,应用软件自动采集数据、筛选差异表达蛋白,对表达有差异蛋白的诊断效率进行统计分析,采用多变量的Logistic回归模型校正混杂因素.结果 乳腺癌组与健康对照组相比,共有49个蛋白峰的强度差异有统计学意义(P<0.05).结合以前的文献,筛选出6个蛋白标志物,质荷比(M/Z)分别为3264、3968、4376、8124、8924和9180,组建成乳腺癌诊断模型,其中表达下调的蛋白M/Z有4376、8126和8924,表达上调的有3264、3968和9180.M/Z为3264、3968、4376、8126、8924的蛋白诊断乳腺癌的ROC曲线下面积分别为0.936、0.933、0.727、0.976和0.751,可作为诊断乳腺癌的标志物.M/Z为9180的蛋白与乳腺癌的TNM分期和Her-2的表达相关(P<0.05),M/Z为8926的蛋白峰与乳腺癌淋巴结转移有一定的关系(P<0.05).结论 SELDI蛋白质谱技术可能有效地区分乳腺癌患者和健康人,筛选出的蛋白对乳腺癌诊断的灵敏度和特异度较高.SELDI在乳腺癌的诊断及乳腺癌特异性分子生物标志物的筛选方面具有一定的应用价值.  相似文献   

10.
目的 建立胰腺癌血清学诊断模型,探讨评估胰腺癌分期和治疗疗效的生物学标志物.方法 采用强阴离子交换(SAX2)芯片和表面增强激光解吸电离飞行时间质谱仪(SELDI-TOF-MS)技术,测定58例胰腺癌患者和51例正常对照者的血清蛋白质指纹图谱;应用Biomarker Wizard统计软件以及决策树算法、Logistic回归和ROC曲线,建立决策树和二分类回归诊断模型.结果 在质荷比(M/Z)值为2000~30 000范围内,建立10个决策树诊断模型,其预测胰腺癌的正确率为92.9%(13/14),诊断胰腺癌的敏感性为83.3%,特异性为100%.应用Logistic回归联合多种差异蛋白峰诊断胰腺癌的曲线下面积(AUC)为0.976±0.011(P<0.001),敏感性为77.6%~91.4%,特异性为92.2%~100%.联合6个差异蛋白峰诊断胰腺癌Ⅰ与Ⅱ期、Ⅱ与Ⅲ期以及Ⅲ与Ⅳ期的AUC值分别为0.897±0.054、0.978±0.021和0.792±0.107(P<0.05).胰腺癌组中高表达的差异蛋白峰(M/Z 4016)在手术前后有下调趋势(P<0.05).结论 应用SELDI-TOF-MS技术进行胰腺癌血清蛋白质指纹图谱分析,采用统计学方法建立胰腺癌决策树和二分类回归诊断模型,对胰腺癌的诊断和鉴别诊断有一定的价值;筛选出的差异蛋白峰对胰腺癌的预后和疗效评估有一定的应用价值.  相似文献   

11.
12.
我院1975年6月~1990年7月共收治食管平滑肌瘤10例,占同期食管肿瘤总数的0.192%(10/1092)。位于食管上段2例,中段5例,下段3例。X线食管钡餐造影是诊断本病的主要方法。行食管粘膜外肿瘤摘除9例,食管部分切除1例,效果良好。本文就其诊断与手术治疗进行了讨论。  相似文献   

13.
背景与目的: 研究仙人掌原液的毒性。 材料与方法: 小鼠急性毒性试验、Ames试验、小鼠骨髓嗜多染红细胞微核试验、小鼠精子畸形试验、大鼠30 d喂养试验。 结果: 仙人掌原液雌、雄小鼠LD50均大于20.0 g/kg,属无毒物质;Ames试验、微核试验和精子畸形试验结果均为阴性;大鼠30 d喂养试验结果显示该样品30 d喂养对大鼠各项观察指标未见毒性作用。结论: 在本次实验条件下,仙人掌原液为无毒物质,未显示有遗传毒性和亚急性毒性作用。  相似文献   

14.
Chronic experiments on CBA and C57B1 mice and acute experiments on CBA mice established: (a) carcinogenic effect of sodium nitrite given continuously with drinking water (0.1; 1.0 and 10.0 maximum allowable concentration) in combination with morpholine fed with bread, and (b) endogenous synthesis of nitrosomorpholine as a result of simultaneous intragastric administration of same doses of sodium nitrite and morpholine. Also, nitrosomorpholine and N-nitrosodimethylamine synthesis was observed in vitro following addition of low-dose sodium nitrite, morpholine and amidopyrine to human gastric juice. Carcinogenic hazard associated with low-dose nitrite consumption in humans is discussed.  相似文献   

15.
背景与目的:研究仙人掌原液的毒性。材料与方法:小鼠急性毒性试验、Ames试验、小鼠骨髓嗜多染红细胞微核试验、小鼠精子畸形试验、大鼠30 d喂养试验。结果:仙人掌原液雌、雄小鼠LD50均大于20.0 g/kg,属无毒物质;Ames试验、微核试验和精子畸形试验结果均为阴性;大鼠30 d喂养试验结果显示该样品30 d喂养对大鼠各项观察指标未见毒性作用。结论:在本次实验条件下,仙人掌原液为无毒物质,未显示有遗传毒性和亚急性毒性作用。  相似文献   

16.
中晚期贲门癌148例的外科治疗   总被引:3,自引:0,他引:3  
目的 总结贲门癌手术治疗影响生存率的因素 ,提供今后工作参考。方法 对 14 8例经手术治疗的贲门癌患者进行术后并发症、绝对生存率的X2 检验。结果 本组切除率为 94.5 9% ,近半胃切除占 72 .14 % ,1、3、5年生存率分别为 67.9%、45 %和 2 4.3 %。病期、外侵程度和淋巴结转移等因素对 5年生存率有显著影响 (P <0 .0 1)。术后并发症以吻合口瘘及肺癌并发症为多见 ,其发生率为 3 .6% ,手术死亡率 1.4%。结论 提高生存率的关键在于早期诊断 ,根治手术和术后积极综合治疗。  相似文献   

17.
目的探索胆囊癌的防治方法。方法分析29例胆囊癌病人临床资料、治疗方法及结果。结果术前诊断明确者21例,剖腹探查发现已属晚期,9例为Ⅳ期行根治术,12例为Ⅴ期未行根治术,均于术后1年内死亡。术前怀疑胆囊癌者5例,剖腹探查冰冻切片证实为Ⅴ期及Ⅳ期者各1例,Ⅴ期未行根治术,Ⅳ期行根治术,均于术后1年内死亡;Ⅲ期者3例,行胆囊癌根治术分别于术后10月、13月、17月死亡。2例术中冰冻切片发现的Ⅱ期胆囊癌,行胆囊癌根治术,分别于术后23月、26月死亡。1例意外胆囊癌属Ⅰ期胆囊癌,术后5年半死亡。结论要减少胆囊癌危害,重在及时治疗胆囊结石。  相似文献   

18.
19.
20.
目的通过总结胰头癌病人的临床表现和影象学检查结果来评价手术切除的可能性。方法总结32例胰头癌病人的临床表现和CT、磁共振(MRI)检查结果,判断肿瘤是否已发生邻近浸润或远处转移,以此来评价其手术切除的可能性。结果在22例作CT检查的病例中,判断正确的为17例,准确率为77.3%。作MR检查9例,全部判断正确,准确率为100%。结论某些特殊的临床表现和CT、MR检查对判断肿瘤是否发生邻近浸润或转移有较大价值,为术前评价手术切除的可能性提供依据。  相似文献   

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