应用变性高效液相色谱法检测G6PD基因G392T及C1024T

目的： 通过对葡萄糖-6-磷酸脱氢酶（G6PD）基因两种已知突变的检测，观察变性高效液相色谱法(denaturing high performance liquid chromatography, DHPLC)的实用价值。 方法: 应用DHPLC方法及脱氧核糖核酸序列测定对葡萄糖-6-磷酸脱氢酶缺乏症患者和正常对照者进行已知突变的检测。 结果: 正常对照者第5、9-10外显子为单峰；G6PDG392T有两个峰，G6PDC1024T则有3个峰。 结论: DHPLC方法敏感、自动化、使用方便而且成本低，可能成为今后检测已知和未知突变的重要方法。     

应用变性高效液相色谱技术进行肝豆状核变性的基因突变筛查及产前诊断

目的 探讨变性高效液相色谱(denature high performance liquid chromatography,DHPLC)技术在肝豆状核变性(Wilson's disease,WD)的突变筛查及产前诊断中的临床应用.方法 以6个WD家系中的患者及其父母的DNA为模板,采用PCR技术扩增ATP7B基因的21个外显子及5'非翻译区,PCR产物经DHPLC技术进行突变筛查,对峰型有改变者进行测序验证.在确定了先证者突变类型的基础上,采用相同方法对其中4个家系(1个双胎和3个单胎)进行产前诊断.结果 6例患者中检测出5种已知的致病突变及8种多态类型.患者的父母均为相应突变类型的携带者.产前诊断结果显示,两例妊娠为异常胎儿,其中1例双胎为Arg778Leu/IVS4-1G>C双重杂合子,1例单胎为Ser975Tyr/Pro992Leu双重杂合子,这两对妊娠夫妇选择了终止妊娠.另两例妊娠中,1例为Ser975Tyr杂合子,1例完全正常,他们选择了继续妊娠,出生了表型正常儿.结论 DHPLC在Wilson病的突变检测和产前诊断中有良好的应用前景.     

应用变性高效液相色谱技术检测parkin基因突变

目的应用变性高效液相色谱技术(denaturing high performance liquid chromatography,DHPLC)检测早发性帕金森综合征(early-onset parkinsonism,EOP)致病基因parkin突变。方法散发EOP患者82例,提取外周血细胞DNA,通过PCR扩增parkin基因的12个外显子,应用DHPLC进行变异筛查,峰形异常者进行DNA测序以明确序列变异的种类和位置。结果以100名健康者为正常对照,在82例EOP患者中检测出3种突变,均为点突变,内含子区突变包括IVS1-39G→T和IVS9 18C→T;编码区突变为T1422C,导致所编码的441位氨基酸由半胱氨酸变为精氨酸(Cys441Arg)。结论在散发EOP患者中发现3个杂合型点突变,探讨应用DHPLC在EOP患者中开展parkin基因诊断的可行性。     

应用变性高效液相色谱技术检测汉族人Ⅰ型多囊肾致病基因突变

目的通过采用变性高效液相色谱（denaturing high-pedormanee liquid chromatogtraphy，DHPLC）技术检测汉族人常染色体显性多囊肾病（autosomal dominant polycystic kidney disease，ADPKD）Ⅰ型致病基因PKD1的突变，建立更为快速、敏感的突变筛查系统。方法以来源于19个ADPKD家系的67名成员血样标本的基因组DNA为模板，通过长链PCR和巢式PCR联合扩增的方法扩增PKD1全编码区，然后采用DHPLC方法进行初步筛查，将存在异常色谱图的扩增产物经核苷酸测序，确定突变的具体位点和类型，并与以往采用单链构象多态性（single strand conformation polymorphism，SSCP）方法检测出的突变结果相比较。结果共检测出14个致病突变，包括10个错义突变、1个插入突变、1个缺失突变、2个无义突变，其中12个突变位点与之前SSCP的检测结果相同，另新发现nt32819G→A和nt37137T→C两个突变位点，突变检出率为73．7％。结论DHPLC方法可以作为更为有效筛查汉族人ADPKD PKD1突变位点的检测途径。     

筛查未知SNPs的变性高效液相色谱（DHPLC）技术

本介绍了DHPLC技术的基本原理,主要应用领域,实验技术特点和操作的注意事项。指出DHPLC是快速,准确,高效筛查基因未知SNPs的工具,优于测序等分子生物学方法,在功能基因组学,分子流行病学等领域有广泛应用前景。     

人类G6PD顺德型〔Gd（－）Shunde〕基因在大肠杆菌中的表达

为了证明一种人类新突变型Ｇ６ＰＤ顺德型，ｃＤＮＡ５９２Ｃ→Ｔ与酶活性降低和其生化特性改变有关，将正常Ｇ６ＰＤｃＤＮＡ，插入人工诱变载体ｐＡＬＴＥＰＲ－１中，用体外定点诱变技术，将ｃＤＮＡ５９２位的Ｃ置换为Ｔ，然后再插入ｐＡＣＩ，在其本身无Ｇ６ＰＤ活性的大肠杆菌ＨＢ３５１突变株中进行表达。实验证明，从ＨＢ３５１株表达出的人Ｇ６ＰＤ，酶活性降低，ＫｍＧ６Ｐ降低，三种底物同类物利用率明显增高，与人类Ｇ６ＰＤ顺德型的生化参数完全一致，表明５９２Ｃ→Ｔ是引起Ｇ６ＰＤ活性降低和生化特性改变的直接原因。     

变性高效液相色谱基因扫描技术在人类疾病基因诊断中的应用

自 1 992年变性高效液相色谱 (denaturing highperformance liquid chromatography,DHPL C)基因扫描技术建立以来 ,因其在筛查基因突变或单核苷酸多态 (singlenucleotide polymorphism,SNP)位点方面具有准确、敏感、高通量、自动化的特点 ,巳经有 80 0余篇研究论文或应用实例发表 ,而其中的 70 0多篇是在最近 5年内问世 ,涉及 370多个基因 ,由此发现或确认了许多致病基因突变或疾病相关基因 SNP位点。 DHPL C是一种准确、敏感、经济、实用的遗传变异筛查技术 ,可用于单碱基替换、小片段缺失和插入等多种基因序列突变的检测。 DHPL …     

应用变性高效液相色谱技术快速诊断儿童型脊髓性肌萎缩症

目的 介绍变性高效液相色谱(denaturing high-performance liquid chromatography，DHPLC)技术在儿童型脊髓性肌萎缩症(spinal muscular atrophy，SMA)基因诊断中的应用。方法 PCR扩增25名正常人、1份标准样品及25例SMA患者运动神经元生存基因(survival，motor rleuron，SMN)第7外显子及其侧翼区域，PCR产物变性、复性后直接上样于DHPLC系统。通过改变A、B缓冲液的比例来分离各种DNA成份。结果 各种不同DNA成份以色谱峰的形式表现出来。23名正常标本呈现3个峰，依次为SMN1／SMN2异源双链峰、SMN2同源双链峰、SMN1同源双链峰。2名正常标本及1份标准品只有SMN1峰，表明缺失了SMN2。22例SMA患者只有SMN2峰，表明缺失了SMN1。另3例SMA患者呈现3个峰，表明无SMN1或SMN2缺失。结论 DHPLC诊断SMA具有敏感、准确、快速、简便等优点。     

人类G6PD顺德型〔Gd（—）Shunde〕基因在大肠杆菌中的表达

为了证明一种人类新突变型Ｇ６ＰＤ顺德型，ｃＤＮＡ５９２Ｃ→Ｔ与酶活性降低和其生化特性改变有关，将正常Ｇ６ＰＤ ｃＤＮＡ，插入人工诱变载体ｐＡＬＴＥＲ－１中，用体外定点诱变技术，将ｃＤＮＡ５９２位的Ｃ置换为Ｔ，然后再插入ｐＡｃｌ，在其本身无Ｇ６ＰＤ活性的大肠杆菌ＨＢ３５１突变株中进行表达。实验证明，从ＨＢ３５１株表达出的人Ｇ６ＰＤ，酶活性降低，ＫｍＧ６Ｐ降低，三种底物同类物利用率明显增高，与人类Ｇ６     

变性高效液相色谱技术快速检测下呼吸道致病性细菌的实验研究

目的 运用变性高效液相色谱(DHPLC)技术检测5种下呼吸道致病性细菌,建立一种快速检测下呼吸道致病性细菌的分子生物学方法.方法 以下呼吸道致病性细菌16S rRNA基因的保守区设计通用引物,并在引物前加上40-bpGC,特异性扩增该基因的保守区和可变区,运用DH-PLC技术对PCR产物进行分析.选取50株临床分离菌株验证该方法的有效性.结果 通用引物可特异性扩增细菌16S rRNA,PCR产物经DHPLC分析后每种细菌均能得到特征性的洗脱峰.DHPLC检测临床分离菌株结果显示,与常规培养方法的符合率为100%.结论 DHPLC技术具有准确、简便、快捷和高通量等特点,在临床检测下呼吸道致病性细菌中具有潜在的应用价值.     

广东客家人 G6PD基因突变型研究

目的　研究广东客家人葡萄糖 - 6 -磷酸脱氢酶缺乏症 (glucose- 6 - phosphate dehydrogenase,G6 PD)遗传多样性。方法　应用突变特异性扩增系统法 ,聚合酶链反应 -单链构象多态性并结合 DNA测序技术 ,确定客家人 G6 PD基因突变型的类型及频率。结果　在客家人中发现 G6 PD c DNA1388(G→ A)、1376 (G→ T)、95 (A→ G)、392 (G→ T)、10 2 4 (C→ T)及 1311(C→ T)复合 11内含子 93位 (T→ C)的突变。结论　 G6 PD基因 c DNA1388(G→A)、1376 (G→T)、95 (A→ G)、392 (G→ T)、10 2 4 (C→ T)、1311(C→T)复合 11内含子 93位 (T→C)突变是共同存在于中国人群中的 G6 PD基因突变型。c DNA1388(G→A)、c DNA 1376 (G→ T)是客家人群中最常见的 G6 PD基因突变型。在广东客家人群中未发现新的 G6 PD基因突变型。     

海南汉族、黎族人群葡萄糖—6—磷酸脱氢酶基因的1376G→ …

目的 了解海南汉族、黎族人群Ｇ６ＰＤ缺乏症患者的Ｇ６ＰＤ基因１３７６Ｇ→突变。方法 用盐提取法提取Ｇ６ＰＤ缺乏症患者白细胞的ＤＮＡ,用等位基因特异聚合酶链反应检测１３７６Ｇ→Ｔ突变。结果在分析的５９例汉族患者和３２例黎族患者中,１９例汉族患者和１８例黎族患者有Ｇ６ＰＤ基因１３７６Ｇ→Ｔ突变,该突变在汉族、黎患者中所占的比例分别为３２．２％和５６．２％。结论 Ｇ６ＰＤ基因１３７６Ｇ→Ｔ是引起海南黎族     

Denaturing high-performance liquid chromatography: A review

Denaturing high-performance liquid chromatography (DHPLC) compares two or more chromosomes as a mixture of denatured and reannealed PCR amplicons, revealing the presence of a mutation by the differential retention of homo- and heteroduplex DNA on reversed-phase chromatography supports under partial denaturation. Temperature determines sensitivity, and its optimum can be predicted by computation. Single-nucleotide substitutions, deletions, and insertions have been detected successfully by on-line UV or fluorescence monitoring within 2-3 minutes in unpurified amplicons as large as 1.5 Kb. Sensitivity and specificity of DHPLC consistently exceed 96%. These features and its low cost make DHPLC one of the most powerful tools for the re-sequencing of the human and other genomes. Aside from its application to the mutational analysis of candidate genes, DHPLC has proven instrumental in elucidating human evolution and in the mapping of genes. Employing completely denaturing conditions, the utility of DHPLC has been extended to the genotyping of known polymorphisms by utilizing the ability of poly(styrene-divinylbenzene) to resolve single-stranded DNA molecules of identical size that differ in a single base. Under completely denaturing conditions, it is thus possible to resolve all possible base substitutions with the single exception of C-->G transversions. Improvements in throughput became feasible with the recent introduction of monolithic poly(styrene-divinylbenzene) capillaries that lend themselves to the fabrication of arrays connected to a multi-color laser induced fluorescence scanner or a mass spectrometer.     

Quantification of G6PD in small and large intestine of rat during aging

Numerous studies have demonstrated a decrease in glucose-6-phosphate dehydrogenase (G6PD) activity during aging in many cell types, including red blood cells, fibroblasts and lens cells. Moreover, the intracellular activity of G6PD has been shown to be regulated by binding to cell organelles. To investigate whether binding of G6PD to cell organelles is related with the decrease in its activity during aging, distribution patterns of G6PD activity and protein were assessed in small (SI) and large (LI) intestine of 3-month-old and 28-month-old rats. Enzyme activity, as measured spectrophotometrically, did not show any significant change with aging in SI or LI. Enzyme histochemistry, performed by subtracting activity staining of 6-phosphogluconate dehydrogenase (6PGD) from that of G6PD, showed a lower net G6PD activity in SI and LI epithelium of old rats in comparison with young rats. G6PD activity did not change significantly with aging in the muscularis externa of SI and LI. Immunoelectron microscopic analysis of G6PD protein allowed us to measure the density of G6PD molecules in cellular compartments, and the fraction of enzyme bound to cell organelles. In SI and LI epithelia, density of G6PD molecules was higher in old rats than in young rats; however, the fraction of enzyme bound to cell organelles also increased with aging. These data suggest that G6PD activity in epithelium of SI and LI decreases with aging due to the accumulation of significant amounts of enzyme bound to cell organelles, a condition which makes it less active than the soluble enzyme.     

用温度调控高效液相色谱探索基因组单核苷酸多态性的方法研究

目的　优化并评估一种新的探索基因组单核苷酸多态 (single nucleotide polymorphism,SNP)的温度调控高效液相色谱技术。方法　从洗脱方式、洗脱温度、检测器流通池规格、适应片段大小、检测灵敏度等方面 ,探讨适合探索基因组 SNP的温度调控高效液相色谱技术参数及实用价值。结果　找到在普通高效液相色谱仪上检测 SNP的具有普遍意义的色谱条件。 d NTP、PCR引物峰与被检测 PCR产物峰完全分离 ,纯合子和杂合子样本能有效区分。建立起在普通高效液相色谱仪上进行快速筛选突变型DNA的温度调控高效液相色谱法。结论　温度调控高效液相色谱法是一种高效、灵敏、操作简便、对较大片段具有普遍适用意义的探索基因组 SNP方法     

应用荧光斑点法和G6PD/6PGD比值法检测新生儿G6PD

目的建立适合于G6PD缺乏的新生儿筛查及确诊方法。方法应用荧光斑点法(FST)对新生儿筛查滤纸干血片进行检测,对可疑阳性者召回,抽静脉血以G6PD/6PGD比值法进行确诊,同时结合新生儿父母亲的G6PD结果 ,根据遗传关系综合分析。结果 FST筛查95471例新生儿,G6PD缺乏阳性率为4.53%(4321/95471),G6PD/6PGD比值法确诊检出率为4.20%(4009/95471),与比值法的符合率为92.78%,G6PD重度缺乏者的符合率为100%,G6PD中间缺乏者的符合率为86.13%,室间质量控制结果与反馈结果符合率为100%。结论 FST具有高的敏感性、特异性和准确性,方法简便、快捷、费用低廉,可对滤纸干血片标本进行大规模的筛查检测,同时利用比值法进行确诊,适宜在高发区开展G6PD缺乏的新生儿筛查和早期诊断及防治工作中应用。     

引物延伸变性高效液相色谱产前诊断β-地中海贫血

目的建立针对中国人常见β-地中海贫血(β-地贫)基因型的产前诊断新方法。方法PCR扩增的靶序列,经引物延伸,得到中国人β-地贫5个常见突变的特异性延伸片段,用全变性高效液相色谱分析延伸片段混合物,分离图谱可鉴定被检样本的基因型。结果盲法分析显示,36个家系108例样品的引物延伸变性高效液相色谱与反向点杂交(reversedotblot,RDB)检测结果符合率为100%。其中6例RDB诊断为上述5个常见突变以外的突变。该法的突变检出率为94.4%(102/108),对产前诊断家庭的诊断率为97.2%(35/36)。结论该法是一种准确、高效的β-地贫突变分析方法,可用于β-地贫的产前诊断。     

温度调控高效液相色谱探索人类基因组变异的进展

温度调控高效液相色谱法是探索人类基因组ＤＮＡ序列变异的新手段。温度调控高效液相色谱法通过比较异源双链与同源双链，而非逐个样本直接测序，可以敏感而准确地发现ＤＮＡ变异。唯发现的变异需进一步测序鉴定。对于旨在发现新突变或新多态性的课题。该方法可以明显减少测序工作量，而对于检出稀少的变异型，可明显降低所需成本。通过自动化操作，更能显著加快获取数据的速度，本文介绍温度调控高效液相色谱法的原理与命名、技术的     

应用变性高效液相色谱检测31例家族性腺瘤性息肉病家系结肠腺瘤性息肉病基因突变

目的 应用变性高效液相色谱(denaturing high performance liquid chromatography,DHPLC)技术检测我国家族性腺瘤性息肉病(familial adenomatons polyposis,FAP)家系的结肠腺瘤性息肉病(adenoinatous pelyposis coli,APC)基因变异特征,研究其病因机制.方法 采集31个家系的先证者、患者和家系成员的外周血淋巴细胞,抽提DNA并以降落式PCR扩增APC基因各外显子和启动子.基因突变检测先由DHPLC进行筛选,发现异常峰者进行测序鉴定并TA克隆鉴定,结果与网络数据进行比对.结果 31个家系中共有15个家系检出了12种不同的突变类型,FAP家系APC基因的突变检出率为48.39%.发现了4种新的突变及3例不同的内含子突变.4个新的突变分别位于255、677、1192、1403密码子,均为移码突变.证明了DHPLC能检出APC基因的突变.在APC基因的突变中,移码突变占86.67%,无义突变占13.33%,说明移码突变是中国人APC基因突变的主要方式.在突变位点上,第15外显子突变最常见,约占86.67%.结论 FAP家系APC基因的突变检出率为48.39%,发现了4种新的导致蛋白编码改变的突变.证实中国人FAP家系中APC基因突变位点以第15外显子最常见,类型以移码突变为主.