基于网络药理学的五味子治疗炎性肠病机制研究

目的：对五味子进行网络药理学研究,阐明其治疗炎性肠病的有效活性成分及潜在靶点。方法：通过生物学信息数据库预测五味子活性成分的潜在作用靶点,采用Cytoscape软件构建五味子的“成分-靶点-通路”网络模型。结果：五味子中8种成分与17个靶点具有潜在相互作用,涉及神经配体相互作用及TNF信号通路在内的多个生物过程,对炎性肠病起到治疗作用。结论：通过与炎性肠病靶点的关联筛选,结合分子对接验证,发现五味子可通过多种信号通路发挥治疗炎性肠病的作用,PTGS1（COX-1）、PTGS2（COX-2）是五味子各活性成分中作用较多的调节靶点,当归酰戈米辛O对这两个靶点的作用较强。     

基于网络药理学研究钩藤治疗高血压的作用机制

目的基于网络药理学方法研究钩藤治疗高血压的作用机制。方法利用TCMSP数据库筛选钩藤中口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18的化学成分作为潜在药效成分,在TCMSP数据库中检索成分作用靶点。结合GeneCards、TTD、OMIM数据库检索高血压疾病相关靶点,提取成分和高血压疾病的共有靶点作为关键靶点。利用CluGO插件对关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,构建"成分-靶点-信号通路"网络。结果筛选得到11种潜在的药效成分,协同作用于PTGS1、PTGS12、CHRM1、ADRα1B等关键靶点,并参与调节神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、5-羟色胺能突触、唾液分泌、间隙连接和脂肪细胞中的脂肪分解6条信号通路。结论本文应用网络药理学方法预测钩藤治疗高血压的潜在药效成分、作用靶点及信号通路,为钩藤治疗高血压的临床应用提供依据。     

基于网络药理学的半夏麻黄丸抗心律失常作用机制研究

目的 利用网络药理学方法探讨半夏麻黄丸治疗心律失常的潜在作用机制。方法 借助中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）,以类药性（DL）、脂水分配系数对数值（ALogP）为条件筛选半夏麻黄丸的活性成分并收集靶点信息;使用人类基因数据库（Genecard）、人类孟德尔遗传数据库（OMIM）获取疾病靶点,进而构建韦恩图,得到半夏麻黄丸治疗心律失常的潜在作用靶点;采用Cystoscap 3.7.2软件构建“中药-成分-疾病-靶点”网络,运用STRING数据库构建蛋白互相作用（PPI）网络,并对靶点基因功能（GO）和KEGG通路进行分析。结果 从半夏麻黄丸中共筛选出槲皮素、芹菜素、木犀草素等36个活性成分,涉及包括PTGS2、PRSS1、RXRA、ADRB2、DPP4在内的165个基因靶点,主要富集于2 467条生物过程、155条分子功能和89个细胞组分,调节175条与心律失常相关的信号通路。结论 半夏麻黄丸可能是通过CRP、CXCL2、CCL2等靶点,调控PI3K-Akt、TNF、IL-17等信号通路,从而发挥多成分、多靶点和多通路治疗心律失常的作用优势。     

基于网络药理学研究甘芩治疗特应性皮炎作用机制

目的：基于网络药理学,探讨甘芩治疗特应性皮炎（Atopic dermatitis,AD）的作用机制。方法：通过TCMSP数据库获取甘芩各药物的已知成分及其作用靶点,通过TCMSP和OMIM数据库获取AD的治疗靶点,进行交联分析,获得甘芩治疗AD的有效成分及作用靶点。用cytoscape软件构建甘芩中化合物与其靶点的网络,采用Davidv平台对作用靶点网络进行通路富集。结果：预测得到甘芩治疗AD的有效成分共158个和作用靶点60个。并推断其作用机制可能与PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等有关,且IL-6、EGFR、ESR1、RELA、NFKBIA、IL-13等靶点基因可能起着主要作用。结论：基于网络药理学探讨了甘芩治疗AD多成分—多靶点—多通路的作用特点,为进一步开展甘芩开发研究提供了思路和方法。     

基于网络药理探讨菟藤方治疗结直肠癌的作用机制

目的 基于网络药理预测菟藤方的潜在作用机制。方法 通过中药及基因数据库平台获得核心方有效成分及药物靶点,构建中药复方调控网络;GO及KEGG富集分析药物靶涉及的主要通路以预测菟藤方应用于晚期肠癌的潜在机制。结果 菟藤方中含有的槲皮素、β-谷甾醇、甘氨酸、山柰酚及L-丙氨酸等53个潜在有效成分,可能作用于AKT1、PTGS2、VEGFA、JUN等241个潜在靶点,通过这些靶点基因表达蛋白之间的相互作用,激活HIF1信号通路、肿瘤蛋白聚糖通路及P53信号通路等,从而调控营养水平、氧化应激反应、缺氧反应、炎性反应等细胞生物学行为以治疗肠癌。结论 菟藤方为多成分、多靶点、多机制协同作用治疗结直肠癌。     

指纹图谱结合网络药理学及实验验证的黄连膏治疗特应性皮炎质量标志物（Q-marker）预测

目的：建立黄连膏的指纹图谱,结合网络药理学和实验验证分析其治疗特应性皮炎（Atopic dermatitis,AD的机制,预测其潜在的质量标志物（Q-Marker）,为其质量控制和临床应用提供依据。方法：建立黄连膏的HPLC指纹图谱,对共有峰进行指认和归属,应用网络药理学筛选和分析黄连膏相关成分的作用靶点和通路,预测其抗AD潜在的Q-Marker;建立1-氯-2,4-二硝基苯（DNCB）诱导的AD小鼠模型,对预测结果进行验证。结果：指纹图谱共标定23个共有峰,并指认出5个色谱峰;将5个成分经网络药理学分析,筛选出EGFR、IL-10、PTGS2、VCAM1、STAT3、ICAM1等作用靶点,癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化、TNF信号通路、细胞凋亡等关键信号通路,以“Q-Marker五原则”为核心,结合指纹图谱及网络药理学分析结果,初步预测小檗碱、姜黄素、藁本内酯、芝麻素、芝麻酚为黄连膏潜在的Q-Marker。动物实验验证,黄连膏能有效改善AD模型小鼠皮损(p<0.001),减少抓挠次数(p<0.001）,降低血清炎症因子IL-6,IFN-γ,TNF-α水平(p<0.0...     

藏药二十五味珊瑚丸治疗阿尔茨海默病的网络药理学研究

目的通过网络药理学方法 ,探讨藏药二十五味珊瑚丸治疗阿尔茨海默病的药理作用机制。方法采用反向药效团匹配法,对二十五味珊瑚丸主要入血成分的潜在靶点进行预测,并结合生物信息学手段,对主要生物学功能及细胞信号通路进行系统分析。结果二十五味珊瑚丸作为一种多组分药物,具有多个潜在靶点。可能参与以丝裂原活化蛋白激酶、胰岛素、哺乳动物雷帕霉素靶蛋白为主的细胞信号传导通路,涉及以炎症、凋亡、β淀粉样蛋白的表达及清除为主的生物学功能。结论二十五味珊瑚丸能够通过多组分和多靶点的协同作用,共同干预阿尔茨海默病的进程。     

基于网络药理学及分子对接探讨二至天癸方治疗女性不孕症的作用机制

目的从网络药理学的层面观察二至天癸方对于女性不孕症的干预机制,为高龄女性不孕症的中医药治疗提供系统生物学信息和基础。方法基于网络药理学,检索二至天癸方的主要化学成分及作用靶点,分析其生物学通路,并采用分子对接技术预测其结合活性。结果筛选出活性成分159种,对应靶点283个,女性不孕症相关疾病靶点1078个,交集靶点共104个,主要涉及PTGS2、ESR1、HSP90AA1、AR、NOS2、PPARG、NCOA2等关键靶蛋白。生物学通路主要作用于PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等。结论该研究初步探讨了二至天癸方调治女性不孕症的多途径、多成分、多靶点的作用机理,其主要活性成分与Mfn-1、Mfn-2较好结合,可能对高龄女性不孕症发挥治疗作用。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨柏子养心丸治疗失眠症的作用机制

目的 采用网络药理学方法及分子对接技术探讨柏子养心丸治疗失眠症的潜在分子机制。方法 通过TCMSP数据库收集柏子养心丸的主要化学成分,经ADME筛选活性化合物并获取其作用靶点;搜索GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD、DrugBank数据库归并失眠症相关疾病基因;使用R语言程序对药物与疾病靶点取交集并上传至STRING平台构建蛋白相互作用（PPI）网络,应用Cytoscape软件进一步判别其核心模块;基于R语言平台对交集靶点进行基因本体（GO）功能与京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用Cytoscape软件构筑“柏子养心丸活性成分–失眠症基因”网络,并使用CytoNCA工具分析其关键药效组分与核心靶点;运用AutoDock套件进行网络关键成分与靶点的分子对接验证,并追溯PPI核心模块与其关联成分实行潜在成分与靶标的二次挖掘。结果 共筛选出槲皮素、山柰酚、木犀草素、黄芩素、柚皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、7-O-甲基异微凸剑叶莎醇、7-甲氧基-2-甲基异黄酮等柏子养心丸的有效成分,治疗失眠症的作用靶点为前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、雌激素受体1(...     

基于网络药理学探讨真武汤治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的: 通过网络药理学的方法探讨真武汤治疗慢性心力衰竭(chronic cardiac failure,CHF) 的作用机制。方法: 通过中药网络药理学分析平台(TCMSP)获取真武汤中候选化合物,利用Swiss Target Prediction平台,进行候选靶标预测,并将TCMSP中相应化合物的靶点作为补充,利用Uniprot数据库将靶点蛋白转化成基因名;通过CTD和TTD数据库获取CHF的相关基因,将真武汤靶标(基因)与CHF相关基因取交集作为真武汤治疗CHF的潜在靶标,将交集基因提交至STRING11.0在线数据库进行蛋白互做分析,并借助网络可视化软件 Cytoscape 3. 7. 1绘制蛋白相互作用网络图,利用Excel构建真武汤中药-潜在化合物-潜在靶标网络,并利用Cytoscape 3. 7. 1进行可视化;通过RStudio的clusterProfiler包进行通路富集分析。结果: 通过设置OB和DL值筛选得到真武汤汤化合物59种,在获得交集基因36个后,剔除不含交集基因（靶标）的化学成分后,最终筛得化合物49种,KEGG富集分析共获得36条,其中13条与CHF相关。结论: 去甲乌头碱、3β-乙酰氧基苍术酮、山奈酚、芍药苷、豆甾醇、β-谷甾醇等为真武汤主要活性成分,白介素6、内皮型一氧化碳合酶、血红素加氧酶1 、前列腺素G/H合酶2、过氧化氢酶等为主要作用靶标,主要调控环鸟苷酸-蛋白激酶G信号通路、肾素分泌、钙信号通路等通路。本研究初步明确了真武汤通过多成分-多靶点-多通路治疗CHF的作用机制, 为深入研究真武汤的药效物质基础和作用机制奠定基础。