基于网络药理学和生物信息学探讨养血清脑颗粒治疗血管性痴呆的作用机制

目的基于网络药理学及生物信息学探讨养血清脑颗粒治疗血管性痴呆的作用机制。方法通过TCMSP、BATMAN-TCM数据库、GEO数据库、OMIM数据库等获取养血清脑颗粒治疗血管性痴呆的活性成分及潜在靶点;应用R语言绘制GEO数据集相关热图, 使用Cytoscape 3.8.2软件构建"中药-活性成分-潜在靶点"网络, 并采用CytoNCA插件进行PPI网络拓扑分析;使用Metascape网站对潜在靶点进行GO及KEGG富集分析;采用AutoDock Vina 1.5.6软件将活性成分与潜在核心靶点进行分子对接。结果筛选得到养血清脑颗粒活性成分135个及治疗血管性痴呆的潜在靶点186个。GO功能富集分析显示, 主要涉及蛋白激酶结合、转录因子结合等生物功能;KEGG通路富集分析结果主要富集于PI3K-Akt信号通路、AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路等;分子对接结果显示, 养血清脑颗粒主要活性成分与潜在作用靶点有良好的结合活性。结论养血清脑颗粒治疗血管性痴呆具有靶点多、通路广的特点, 可通过抑制神经细胞凋亡、减轻炎性反应等机制发挥治疗作用。     

基于网络药理学和分子对接技术探究半夏治疗肺癌的作用机制

目的：基于网络药理学和分子对接技术探究半夏治疗肺癌的关键作用靶点。方法：在TCMSP数据库中检索半夏的活性成分和靶点,以“lung cancer”为关键词在DisGeNET数据库检索,物种为“Homo sapiens”,检索出肺癌的相关基因,构建靶标蛋白互作（PPI）网络。分别在Metascape平台和HIPLOT数据库平台对核心靶点进行分析,将物种设置为人,进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析,并用AutoDock Tools进行分子对接验证。结果：通过TCMSP数据库,检索到半夏活性化合物13种,潜在基因97个靶点。半夏治疗肺癌潜在作用靶点39个,主要有TP53、AKT1、HIF-1α和VEGFA等。按照P <0.05进行筛选,GO功能富集分析涉及对氧化应激、活性氧、缺氧反应等生物过程,细胞组分及分子功能主要涉及蛋白激酶调节活性、激酶调节活性、蛋白磷酸酶2A结合、过氧化物酶活性、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶复合物和蛋白激酶复合物等。KEGG信号通路富集分析,按照P <0.05进行筛选,主要涉及癌症通路、肿瘤蛋白多糖、PI3K/Akt信号通路、癌症的MicroRNAs...     

基于网络药理学和分子对接探讨虎杖-金钱草药对治疗肝癌作用机制

目的：通过网络药理学及分子对接方法探究虎杖-金钱草药对治疗肝癌的作用机制。方法：以TCMSP、TCMIP、BATMAN-TCM、HERB、GeneCards、OMIM、DisGeNET、TTD数据库为来源,获取虎杖及金钱草的活性成分、作用靶点及肝癌疾病靶点。使用STRING数据库和Cytoscaape软件对共同靶点绘制蛋白质相互作用网络（PPI）获取核心靶点。应用DAVID数据库进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析。应用Cytoscape构建“药物-活性成分-靶点-疾病-信号通路”网络。最后运用AutoDock Tools、PyMOL进行分子对接验证。结果：经过筛选得到“虎杖-金钱草”治疗肝癌的潜在核心靶点17个。GO功能分析得到663条结果,KEGG通路富集分析主要涉及癌症通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等139条通路。分子对接结果显示,虎杖-金钱草主要活性成分与关键潜在作用靶点Akt1、Src、EGFR、HSP90AA1和ErbB2均能自发结合且具有较好的亲和力。结论：虎杖-金钱草可能结合多个成分和靶点,调控多条通路发挥靶向治疗肝癌的作用。     

基于网络药理学与实验验证探讨凉膈散加减方治疗急性呼吸窘迫综合征的作用机制

基于网络药理学策略,结合分子对接和体外实验验证,研究凉膈散加减方(modified Liangge San, MLGS)治疗急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome, ARDS)的潜在靶点和分子机制。在TCMSP数据库筛选MLGS的活性成分及靶点,整合GeneCards、DisGeNET数据库得到ARDS疾病靶点,两者取交集得到MLGS治疗ARDS的潜在靶点。利用Cytoscape 3.7.2软件构建MLGS的“中药-活性成分-靶点的网络”及“MLGS治疗ARDS的调控网络”,在STRING数据库制作蛋白质相互作用网络,使用Metascape数据库对共同靶点靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,使用分子对接及体外实验对分析结果进行验证。共筛选得到MLGS活性成分211个、关键靶点54个;GO富集分析得到GO条目(P<0.05)709个,包括生物过程(BP)457个、细胞成分(CC)50个和分子功能(MF)98个,主要涉及对脂多糖、对活性氧的反应、凋亡信号通路;KEGG通路富集分析共得到266条通路,主要涉及癌症信号通路、...     

基于GEO芯片挖掘联合网络药理学分析解毒化瘀颗粒治疗肝癌的分子机制

目的 采用GEO基因芯片挖掘、网络药理学及分子对接技术分析解毒化瘀颗粒治疗肝癌的作用机制。方法 从GEO数据库下载肝癌的基因芯片数据集,利用R软件筛选出显著性差异基因,从TCMSP、SymMap、SwissTargetPrediction等数据库获取解毒化瘀颗粒的活性成分、药物靶点,运用Cytoscape软件及STRING、DAVID等平台,对药物-疾病交集靶点进行PPI、GO、KEGG分析,使用PyMOL、AutoDockTools1、AutoDock Vina等软件对活性成分-核心靶点进行分子对接验证。结果 得到肝癌显著性差异基因1 423个、解毒化瘀颗粒作用靶点682个,筛选出药物-疾病交集靶点122个。PPI拓扑分析得出的核心靶点有ESR1、PTGS2、CYP3A4、MMP9、AR、CYP1A1、PTPRC、TYMS、CDK1等。GO功能富集分析主要涉及氧化还原过程、环氧酶P450途径、细胞外泌体、ATP结合等,KEGG通路分析主要富集在化学致癌作用通路、细胞色素P450代谢通路、花生四烯酸代谢通路、P53信号通路、PI3K-Akt信号通路等。分子对接验证显示各主要活性成分与核...     

基于网络药理学和分子对接探究地骨皮调血脂的作用机制

目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨地骨皮调血脂的作用机制。方法 使用TCMSP数据库并查阅相关文献确定地骨皮活性成分;采用SwissTargetPrediction、GeneCard和OMIM数据库预测地骨皮活性成分靶点和高脂血症相关靶点,应用Venny 2.1取两者交集;运用Cytoscape 3.8.2软件绘制成分-靶点-疾病网络;应用String数据库构建交集靶点的蛋白质-蛋白质相互作用（protein-protein interaction,PPI）网络;将交集靶点输入Metascape数据库进行基因本体（gene ontology,GO）功能及京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路富集分析,利用Cytoscape3.8.2软件绘制地骨皮活性成分-靶点-通路网络,预测其调血脂作用机制;采用分子对接和细胞实验进一步探究地骨皮的调血脂作用机制。结果 共筛选出地骨皮潜在活性成分14个以及153个交集靶点;GO功能和KEGG通路分析发现主要涉及过氧化物酶体增殖物激活受体（peroxisome prol...     

基于网络药理学的党参治疗慢性萎缩性胃炎的机制研究

目的运用网络药理学的方法探讨党参治疗慢性萎缩性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)的分子作用机制。方法通过TCMSP数据库和文献挖掘获取党参的主要活性成分,利用人类基因数据库GeneCards预测和筛选党参活性成分的作用靶点。采用String数据库和Cytoscape3.7.1软件绘制蛋白相互作用网络(PPI),借助DAVID6.8数据库进行潜在基因的基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果筛选得到党参21个活性成分,涉及27个作用靶点。GO分析结果显示,党参治疗慢性萎缩性胃炎潜在基因的生物功能主要涉及影响染色体结合,蛋白质异二聚化活性,核受体活性,转录因子活性,类固醇激素受体,类固醇结合,NF-κB结合,雌激素受体,RNA聚合酶II,半胱氨酸型内肽酶等;KEGG通路富集分析结果显示,党参治疗慢性萎缩性胃炎潜在基因的通路主要涉及前列腺癌,细胞凋亡,TNF信号通路,结直肠癌,乙型肝炎,AGE-RAGE信号通路,PI3K-Akt等信号通路。结论党参治疗慢性萎缩性胃炎是多成分、多靶点、多通路的复杂过程,主要通过参与抑制炎性分子、NF-κB结合、细胞凋亡等发挥治疗CAG的作用。     

基于网络药理学探讨玄参-麦冬药对治疗焦虑症作用机制

目的 应用网络药理学方法探讨玄参-麦冬药对治疗焦虑症的作用机制,为临床应用玄参-麦冬药对提供依据。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和中医药整合药理学研究平台（TCMIP）收集玄参、麦冬的化学成分,结合TCMSP、SwissADME数据库及文献筛选活性成分,利用Swiss TargetPrediction数据库预测活性成分作用靶点;通过OMIM、GeneCards、DrugBank数据库获取焦虑症的相关靶点,与活性成分作用靶点取交集;利用STRING数据库建立活性成分-疾病共同靶点蛋白相互作用（PPI）网络,采用Cytoscape3.8软件对PPI网络进行MCODE聚类分析,得出关键靶点;利用DAVID6.8数据库对活性成分-疾病共同靶点进行GO和KEGG富集分析,通过活性成分-靶点-通路网络筛选核心活性成分,用分子对接模拟核心活性成分与关键靶点的结合强度。结果 共筛选出玄参-麦冬药对37个活性成分,潜在靶点471个,焦虑症相关靶点753个,活性成分-疾病共同靶点42个,对其PPI网络进行MCODE聚类分析得到4种类簇,筛选出关键靶点14个。GO和KEGG富集分析显...     

基于网络药理学与分子对接技术探讨乌梅-僵蚕治疗小儿腺样体肥大的机制

目的：运用网络药理学和分子对接技术探讨乌梅-僵蚕治疗小儿腺样体肥大（AH）的活性成分及作用机制。方法：通过中药系统药理数据库与分析平台（TCMSP）数据库和Uniprot数据库得到乌梅、僵蚕的靶点信息,利用GeneCards、OMIM数据库获取AH相关靶点,将交集靶点输入STRING数据库以获取蛋白互作（PPI）,借助Cytoscape3.7.0构建PPI网络、筛选核心靶点,并利用Metascape数据库对乌梅-僵蚕治疗AH靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析。结果：筛选得到槲皮素（Quercetin）、蜕皮素（Ecdysone）、山奈酚（Kaempferol）等为乌梅-僵蚕的主要活性成分,共有539个作用靶标,AH相关靶标165个,包括细胞肿瘤抗原p53 (TP53)、转录信号传感器和激活器3 (STAT3)等核心靶点,GO富集分析得到生物过程2 188条、分子功能3 478条,细胞组分92条,KEGG分析涉及200个信号通路,包括癌症的通路、Th17细胞分化通路、C型凝集素受体信号通路等关键信号通路。分子对接结果显示乌梅-僵蚕的3个主要活性成分与核心靶点MAPK3、STAT3、T...     

基于网络药理学与分子对接技术探讨降糖消渴颗粒治疗糖尿病作用机制

目的运用网络药理学和分子对接技术预测降糖消渴颗粒治疗糖尿病的作用靶点和信号通路, 分析可能的作用机制。方法通过ETCM数据库筛选降糖消渴颗粒的活性成分及作用靶点;检索DisGeNET、GeneCards数据库获得糖尿病靶点, 绘制韦恩图取交集靶点;利用STRING数据库进行基因转换和网络相互作用分析;采用Cytoscape 3.6.0构建PPI网络;运用分子对接技术进行验证;通过Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果共筛选出降糖消渴颗粒128个活性成分, 对应靶点607个。糖尿病相关靶点1 240个, 核心靶点53个。分子对接提示, 活性成分和核心靶点有良好的结合能力。GO功能分析得出46个功能条目, KEGG分析得出15条通路。结论降糖消渴颗粒通过多成分、多靶点参与多种生物过程, 包括影响脂质代谢和动脉粥样硬化、AD、AMPK信号通路、Apelin信号通路、胰高血糖素信号通路, 调节葡萄糖稳态。     

基于网络药理学与分子对接的蒲公英抗乳腺癌的机制研究

[目的]基于网络药理学和分子对接法研究蒲公英抗乳腺癌的作用机制,以期为其临床抗乳腺癌机制的阐明提供参考。[方法]通过Batman-TCM、TCMID、TCMSP和CancerHSP数据库筛选蒲公英有效成分及其作用靶点,运用Cytoscape软件构建蒲公英有效成分与其靶点的互作网络;通过GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET、Pharmgkb、Malacards数据库筛选乳腺癌疾病靶点;通过STRING构建蛋白互作网络（PPI）,并通过DAVID数据库对核心靶点进行GO功能注释和KEGG通路富集分析;通过Pymol软件和AntoDock软件预测结合能力。[结果]通过4个成分靶点数据库和6个疾病数据库共筛选到10个蒲公英潜在有效成分和136个作用靶点,1 856个乳腺癌疾病靶点,41个潜在靶点基因;PPI网络中得到10个蒲公英治疗乳腺癌的关键靶点,经过GO和KEGG分析后得到53条GO分析结果和12条KEGG通路,GO分析结果表明蒲公英抗乳腺癌可能与RNA聚合酶Ⅱ启动子的转录起始过程、核染色质、DNA结合等过程相关;KEGG分析结果表明蒲公英抗乳腺癌可能涉及癌症通路、含血清...     

基于网络药理学-分子对接技术研究柴胡治疗卒中后抑郁的药效物质基础及作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术,探讨柴胡治疗卒中后抑郁（Post-stroke Depression, PSD）的潜在活性成分和可能的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和蛋白质序列数据库（Uniprot）筛选出柴胡主要活性成分及其靶点基因,并将目标蛋白名称标准化,通过GeneCards、OMIM数据库获取PSD靶点基因;对两者靶点取交集后采用STRING数据库构建柴胡治疗PSD的潜在靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络图;利用Cytoscape-v3.9.1软件进行核心靶点筛选;利用DAVID数据库对潜在靶点进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。最后,利用PyMol软件和AutoDockTools-1.5.7软件对柴胡主要活性成分与核心靶点使用分子对接技术绘制相应的分子对接图。结果：共筛选得到柴胡活性成分17个,去重后对应靶点175个,疾病靶点852个,经Venny数据库预测到疾病-药物交集靶点45个。GO功能富集分析结果显示共获得323个GO功能注释,KEGG通路富集分析结果显示获得106条信号通路。分子对接...     

基于网络药理学与分子对接探讨丹参-石菖蒲-丁公藤治疗排卵障碍性不孕症的作用机制

目的：基于网络药理学与分子对接,探讨丹参-石菖蒲-丁公藤治疗排卵障碍性不孕症的作用机制。方法：采用TCMSP筛选出丹参、石菖蒲、丁公藤的有效活性成分及对应靶点,通过GeneCards数据库找出疾病靶点,并在UniProt数据库中将靶点基因名称标准化。通过韦恩图的绘制寻找出药物-疾病的潜在靶点基因,运用STRING数据库和Cytoscape构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。利用Cytoscape选出关键靶点,导入DAVID数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过AutoDock与Pymol将关键活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果：共获得丹参-石菖蒲-丁公藤的70种有效活性成分,1071个潜在靶点。共得到GO功能富集条目376个,其中生物过程234个、细胞组分68个、分子功能74个。KEGG通路富集分析共得到通路93条。分子对接结果显示,药物主要活性成分与疾病关键靶点均有较好的结合活性。结论：丹参-石菖蒲-丁公藤的多种有效成分通过不同的通路发挥其治疗排卵障碍性不孕症的作用,具有良好的临床运用前景。     

基于网络药理学和分子对接技术研究五达颗粒治疗胃肠动力障碍的分子机制

目的：利用网络药理学和分子对接技术研究分析五达颗粒治疗胃肠动力障碍（Gastrointestinal motility disorder,GMD）的分子机制。方法：采用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）收集五达颗粒有效成分及其作用靶点,GeneCards与OMIM数据库收集胃肠动力障碍相关靶点,Cytoscape软件构建“成分-靶点”网络,STRING数据库构建靶点蛋白PPI网络,所获关键靶点行GO生物功能注释及KEGG通路分析,五达颗粒核心活性成分及胃肠动力障碍关键靶点用AutoDockTools软件行分子对接。结果：“成分-靶点”网络显示五达颗粒核心活性成分为槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇及山奈酚;PPI网络显示JUN、IL-6及FOS等蛋白作用显著;GO功能富集为信号转导、炎症反应及免疫反应等;KEGG通路富集在TNF及IL-17等信号通路;分子对接结果显示核心活性成分与关键靶点均有较好的结合活性。结论：五达颗粒治疗GMD的作用机制可能是槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇及山奈酚作用于JUN、IL-6及FOS以调节信号转导、炎症反应及免疫反应。     

实脾散治疗肾源性水肿作用机制的网络药理学分析

目的基于网络药理学方法探讨实脾散治疗肾源性水肿（Renal edema）的作用机制。方法通过TCMSP 数据库检索实脾散的中药活性化合物,通过Swiss Target Prediction 数据库查询其活性化合物对应的作用靶点, 并以TCMSP 数据库中相应化合物的靶点作为补充。通过GeneCards 数据库获取肾源性水肿的相关疾病基因, 并与实脾散活性化合物靶点取交集作为潜在作用靶点。将潜在作用靶点提交至STRING 平台,获取蛋白互 作（PPI）关系并分析筛选得到关键靶点。利用Cytoscape 软件构建关键靶点PPI 网络及中药-活性成分-关键靶点 网络。通过DAVID 平台对关键靶点进行GO 功能富集分析及KEGG 通路富集分析。结果筛选得到实脾散活 性化合物164 个,对应靶点共1 157 个,筛选出关键靶点73 个,主要涉及PIK3CA、STAT3、MAPK1、SRC、 MAPK3 等。GO 功能富集分析结果共得到679 个GO 条目,显示实脾散对细胞表面信号转导、分子功能、刺激 蛋白酶的活性和转录等生物学过程具有调节作用。KEGG 通路富集分析结果共得到116 条相关通路,主要涉及 PI3K-Akt 信号通路、Ras 信号通路、Rap1 信号通路、MAPK 信号通路等。结论实脾散可能主要通过发挥抗 炎、改善血液循环、抗氧化、保护足细胞损伤、抗肾脏纤维化及利尿等药理作用,从而起到治疗肾源性水肿的 作用。     

基于网络药理学和分子对接研究补肾促卵方治疗多囊卵巢综合征不孕的分子机制

该文运用网络药理学和分子对接的方法,研究补肾促卵方治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome, PCOS)导致不孕的作用机制。首先,通过TCMSP数据库获取补肾促卵方活性成分和药物潜在靶点;应用GeneCards数据库检索PCOS导致不孕的疾病靶点。将药物靶点与疾病靶点经过Uniprot数据库校正后取交集基因。结合STRING数据库和Cytoscape 3.7.2对交集基因进行PPI分析。应用Cytoscape 3.7.2的ClueGO插件对交集基因进行GO富集分析及KEGG信号通路富集分析。最后运用AutoDockVina和MGLtools软件对补肾促卵方关键活性成分与作用靶点进行分子对接验证。结果在补肾促卵方中共获得136个药物活性成分,314个药物靶点,GeneCards数据库获得136个疾病靶点,49个药物与疾病交集基因;GO富集发现,主要涉及肌肉细胞凋亡过程的调节、小分子代谢过程的正调控、核心启动子结合、RNA聚合酶Ⅱ对pri-miRNA转录的调控、跨膜运输的负调控等生物功能;经过KEGG通路富集分析,其主要涉及MAPK、PI3K-Akt、p53、HIF-1等信号通路。分子对接结果显示槲皮素(quercetin)和PTGS2能稳定的结合并通过氨基酸残基THR206、TRP387、ASN382等发生相互作用。该研究初步揭示了补肾促卵方治疗PCOS导致不孕的多成分、多靶点、多途径作用机制,为进一步研究提供依据。     

运用网络药理学和分子对接探究山药-陈皮治疗孤独症谱系障碍的机制

目的:运用网络药理学及分子对接探究山药-陈皮治疗孤独症谱系障碍(ASD)的分子机制。方法:检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)并筛选山药-陈皮活性成分及靶点,检索Genecards、DisGenet、TTD数据库并筛选ASD疾病相关靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件建立山药-陈皮靶点基因蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络及ASD疾病基因PPI网络,提取Hithubs网络,即山药-陈皮治疗ASD的关键靶点。运用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。运用Autodock软件对山药-陈皮活性成分与关键靶点进行分子对接。结果:筛选山药-陈皮活性成分21个及对应靶点109个,检索ASD相关靶点476个,提取山药-陈皮治疗ASD的关键靶点141个,GO分析结果显示91个生物过程,68个细胞组分和77个分子功能相关过程,KEGG通路富集条目10条(P<0.05)。这些关键靶点涉及rRNA加工、核转录基因分解代谢过程、翻译起始、靶向膜的SRP依赖性共转运蛋白、病毒转录、核糖核酸聚合酶Ⅱ启动子转录正调控、凋亡过程负调控、细胞周期、拼接体、核苷酸切除修复等。分子对接结果显示山药-陈皮活性成分与关键靶点结合构象稳定。结论:山药-陈皮治疗ASD可能通过脑神经网络连接、基因表达、信号转导、炎症反应、病毒转录等途径起效。     

基于网络药理学与分子对接技术的金花清感颗粒防治新型冠状病毒肺炎的潜在药效物质研究

目的探究金花清感颗粒防治新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的潜在物质基础。方法采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索金花清感颗粒中11味药材所含化学成分与作用靶点。借助Uniprot数据库查询靶点对应基因,采用Cytoscape软件构建"药材-成分-靶点"网络,运用DAVID对相关靶点进行GO功能与KEGG通路富集分析。通过分子对接评价"药材-成分-靶点"网络中核心成分与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)3CL水解酶及血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)的结合作用。结果金花清感颗粒"药材-成分-靶点"网络包含154个化合物和276个相关靶点,关键靶点涉及PTGS2、HSP90AB1、HSP90AA1、PTGS1、NCOA2等。GO功能富集分析得到278个条目,主要涉及ATP结合、转录因子活化、细胞凋亡进程调控等。KEGG通路富集得到127条信号通路,涉及TNF、PI3K/Akt及HIF-1等与肺损伤保护相关通路。分子对接显示金花清感颗粒中芒柄花黄素、豆甾醇、β-谷甾醇、脱水淫羊藿素等核心成分与SARS-CoV-2 3CL水解酶及ACE2的亲和作用较好。结论金花清感颗粒可能通过多成分...     

基于网络药理学和分子对接技术研究黄芪-白花蛇舌草治疗非小细胞肺癌的作用机制

目的：通过网络药理学和分子对接技术，探讨黄芪-白花蛇舌草抗非小细胞肺癌(NSCLC)的潜在活性成分和作用机制。方法：利用TCMSP和Uniprot数据库获取黄芪-白花蛇舌草的主要活性成分及靶点基因；GeneCards、OMIM数据库获取NSCLC靶点基因；绘制韦恩图得到疾病和活性成分共同靶点；STRING数据库构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络；Cytoscape 3.9.1软件绘制成分-靶点网络图，通过网络拓扑分析筛选出关键靶点及成分；DAVID数据库及Bioinformatics平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析；PyMol软件和AotoDock软件绘制相应的分子对接图。结果：经筛选共得到653个黄芪-白花蛇舌草活性成分靶点和6178个疾病靶点，两者交集靶点154个。GO功能富集到747个生物过程、83个分子功能和150个细胞组分，KEGG通路富集分析得到167条信号通路。分子对接结果显示，PTGS1蛋白与活性成分槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素均结合稳定。结论：黄芪-白花蛇舌草可能通过槲皮素、山柰酚、芒柄花黄...     

基于网络药理学和分子对接技术研究黄芩治疗糖尿病脑病的作用

目的 采用网络药理学和分子对接技术研究黄芩治疗糖尿病脑病的作用机制。方法 通过TCMSP数据库检索黄芩主要活性成分和作用靶点，通过OMIM、GeneCards、TTD及DrugBank等数据库筛选糖尿病和阿尔茨海默病的主要靶点，构建活性成分-靶点网络；利用STRING 11.0进行蛋白质互作分析，构建PPI网络以筛选重要靶点；运用Metascape库对关键交集靶点进行GO和KEGG富集分析；利用Cytoscape 3.7.2将分析得到的重要靶点和通路构建药物成分-疾病靶点-通路网络；进一步对关键活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果 筛选出黄芩重要活性成分有汉黄芩素、黄芩素、金合欢素、降穿心莲黄酮等，PPI网络中关键交集靶点61个，核心靶点有AKT1、IL-6、MAPK14、TNF、PRKCA、VEGFA等。GO富集分析得到细胞组成101条，分子功能76条，生物过程1 413条；KEGG通路富集分析得到258条，主要涉及AGE-RAGE信号介导的糖尿病并发症通路、IL-17、MAPK、TNF、PI3K-Akt信号通路、胰岛素抵抗通路等。分子对接结果可知，汉黄芩素、金合欢素、黄芩素、红...