注意缺陷多动障碍与多巴胺转运体基因的关联分析

目的 分析多巴胺转运体基因3′端40bp可变数串联重复多态性与注意缺陷多动障碍之间的关系.方法 运用聚合酶连反应和可变数串联重复多态性分析技术对西安地区汉族人群中54例符合美国精神障碍诊断和统计手册第4版诊断标准的注意缺陷多动障碍儿童(n=54)及其父母(n=108)和正常对照组(n=66)进行多巴胺转运体基因3′端40bp可变数串联重复多态性检测,采用病例对照研究和核心家系关联分析(HRR和TDT)等统计方法进行注意缺陷多动障碍与多巴胺转运体基因多态性的关联分析.结果 所测人群中多巴胺转运体的40bp可变数串联重复多态性表现出7～11倍重复的5种等位基因,其中最常见的等位基因为10倍重复的480bp片段,占90.6%.共检出6种基因型,其中最常见的基因型为480bp/480bp,占82.1%.各基因型频率和等位基因频率在注意缺陷多动障碍组与对照组和核心家系中的分布均无显著性差异(均P>0.05).基因型为非480bp/480bp型在Conners-T教师问卷品行、多动、注意分散、多动指数和行为总分均高于基因型480bp/480bp,但无显著性差异(P>0.05).对54个注意缺陷多动障碍核心家系进行HRR和TDT关联分析,未显示注意缺陷多动障碍和多巴胺转运体基因存在关联.结论 在西安地区汉族人群中多巴胺转运体基因与注意缺陷多动障碍之间无显著性关联,多巴胺转运体基因多态性中的10倍重复等位基因可能不是注意缺陷多动障碍的遗传危险因素.     

DAT13’端VNTR区多态性与异常体液型癌症的相关性研究

目的探讨多巴胺转运体基因1(DAT1)3’端40bp VNTR多态性与新疆省维吾尔族异常体液型癌症的相关性。方法按维吾尔医将癌症患者分为4种体液型,采用聚合酶链式反应(PCR)和VNTR多态性分析技术对新疆省维吾尔族47例异常黑胆质型癌症患者、26例其它异常体液型癌症患者和57例正常对照组DAT1多态性进行检测,比较各组间等位基因和基因型频率分布的差异。结果(1)所测人群中,DAT1 VNTR多态性表现出6～11倍重复的6种等位基因,其中最为常见的等位基因为10倍重复的480bp片段,其基因频率为90.4%。共检出6种基因型,其中最常见的基因型为480bp/480bp,占80.7%。(2)DAT1 VNTR10倍重复等位基因及10/10基因型个体患异常黑胆质型癌症的发病风险与非10倍重复等位基因和非10/10基因型个体差异无统计学意义(P=0.158,OR=1.994,95%CI为0.754～5.275;P=0.138,OR=2.143,95%CI为0.772～5.947);异常黑胆质型癌症患者和其它异常体液型癌症患者的DAT1 VNTR等位基因及基因型频率的差异均无显著性(P=0.729;P=0.782)。结论DAT13’端40bp可变串联重复多态性可能与维吾尔医异常体液型癌症易感性无关。     

注意缺陷多动障碍多巴胺D4受体基因多态性与工作记忆的关系

【目的】 探讨中国汉族男童注意缺陷多动障碍(attention deficit hyperactivity disorder,ADHD)多巴胺 D4 受体基因(DRD4)第3外显子48 bp可变数目串联重复(VNTR)多态性与工作记忆的关系。 【方法】 对80名ADHD男童DRD4 48 bpVNTR多态性进行检测,并采用工作记忆任务(顺背数字、倒背数字、Corsi木块回忆、n-Back)测试,分长重复序列(4~6次)和短重复序列(2~3次)两组进行比较。 【结果】 ADHD男童DRD4 48 bpVNTR次数是2~6次,最常见的等位基因是4次重复(73.125%)和2次重复序列(20%),未发现7次重复序列或更长的片段。ADHD男童DRD4 48 bp长重复序列组在倒背数字中的总分及长度明显低于短重复序列组。 【结论】 ADHD男童DRD4 48 bp长重复序列可能影响工作记忆功能。     

西安地区注意缺陷多动障碍与HLA-DRB1基因的相关性研究

【目的】探讨注意缺陷多动障碍(attention deficit hyperactivity disorder,ADHD)患儿HLA-DRB1(humanleukocyte antigen-DRB1)基因多态性的分布特征,了解ADHD病例组与正常对照组中HLA-DRB1位点等位基因频率分布上的差异。【方法】采用病例对照的研究方法,应用PCR-SSOP技术对54例ADHD病例组及66例正常对照组儿童进行HLA-DRB1等位基因多态性分析。【结果】在ADHD病例组及对照组中,HLA-DRB1位点共检出13个等位基因,基因频率分别为0.93%~13.89%及0.76%~18.18%;DR1、DR10以及DR12在两组中的分布上差异有显著性,对照组中DR12(15.91%)明显高于ADHD病例组(4.63%),RR为0.218 7;DR1在ADHD病例组为7.41%,在对照组为0.76%,RR为11.304 3;DR10在ADHD病例组为9.26%,在对照组未检出,RR为31.382 0。【结论】①西安地区ADHD患儿及正常对照儿童HLA-DRB1位点上等位基因的遗传信息体现了国人的主要特征。具有一定的代表性。②DR12可能为ADHD的保护基因,DR1和DR10则可能是ADHD的易感基因或与易感基因相连锁。     

多巴胺D4基因48bp可变重复序列多态性与注意缺陷多动障碍相关性的Meta分析

目的 进一步探讨多巴胺D4受体(DRD4)基因第三外显子48 bp可变重复序列(VNTR)多态性与注意缺陷多动障碍(ADHD)儿童青少年的相关情况。方法 通过中国知网(CNKI)、万方、维普、中国生物医学文献数据库(CBM)、PubMed、Cochrane Library、EBSCO、Ovid、Springer数据库,检索国内外关于DRD4基因第3外显子48 bp VNTR多态性与儿童ADHD关联性的病例对照研究,采用Meta分析综合定量分析纳入文献。结果 20篇文献共纳入3 658例ADHD患者和6 272例对照,Meta分析结果提示在总人群中4R、7R和长片段ADHD组与对照组相比差异均有统计学意义,其他片断ADHD组与对照组相比差异均无统计学意义。亚洲人群中各种重复片段的ADHD组与对照组相比差异均无统计学意义。非亚洲人群中4R、7R、短片断和长片段(＞4R)ADHD组与对照组相比差异均有统计学意义,其余重复片段差异均无统计学意义。结论 Meta分析显示总人群DRD4 48 bp 4R、7R、长片段(＞4R)与ADHD间有相关性;非亚洲人群DRD4 48 bp4R、7R、短片段、长片段(＞4R)与ADHD间有相关性;亚洲人群48 bp VNTR多态性与ADHD间均未显示有相关性。     

注意缺陷多动障碍与多巴胺β羟化酶基因的关联分析

【目的】分析DβH基因与注意缺陷多动障碍（attention deficit hyperactivity disordor，ADHD）的关联；探讨ADHD的血浆DβH活性与各基因型的关系。【方法】采用Amp—FLP技术，检测54名ADHD患者及其父母（n=82）和正常对照者（n=30）DβH基因（GT）n多态性的基因型和等位基因频率，运用病例对照研究和核心家系的关联分析（HRR和TDT）分别进行研究，并测定血浆DβH活性。【结果】ADHD组与对照组DβH活性及各基因型的DβH活性差异均无娃著性（P〉0．05）；共发现4种等位基因和8种基因型，A3频率较高。（GT）。多态性各基因型频率和等位基因频率在ADHD组与对照组以及核心家系中的分布差异均无显著性（P均〉0．05）。单纯ADHD组A2频率明显高于共病组（P〈0．05）。A2／A3型在CBCL的社交、注意、攻击及行为总分得分上均明硅高于A3／A3型（P〈0．05）。【结论】DβH基因（GT）n多态性与ADHD之间可能不存在关联，某些基因型可能与临床表现有关。     

IL-1RN内含子2和外显子2基因多态性的分布特点及其与血脂的相关关系

目的 探讨武汉地区汉族健康人群白细胞介素-1受体拮抗剂基因(IL-1RN)第2号内含子中可变数串联重复序列(VNTR)多态性和第2号外显子 8006位点单核苷酸多态性(SNP)的分布特点及其与血脂的相关关系。方法 采用聚合酶链反应(PCR)和PCR-限制性片段长度多态性(RFLP)的分析方法,检测了251名武汉地区汉族健康者IL-1RN(VNTR)和IL-1RN( 8006)多态性,同时检测其血脂、IL-1和IL-1Ra水平。结果 IL-1RN(VNTR)的等位基因以Ⅰ型最为常见,其次为Ⅱ型,Ⅳ型较为罕见;IL-1RN( 8006)的等位基因以T型最为常见,其次为C型;IL-1RN(VNTR)的等位基因Ⅱ总是伴随着IL-1RN( 8006)的等位基因C而出现;这两种多态性的分布在男女间差异不显著,且与血脂、IL-1和IL-1Ra水平间不存在相关关系(P>0.05)。结论 武汉地区汉族健康人群IL-1RN内含子2和外显子2中均存在基因多态性,其等位基因间存在连锁不平衡;这两种多态性与血脂、IL-1和IL-1Ra水平间不存在相关关系。     

转化生长因子β3基因多态性与唇腭裂关联的核心家庭分析

目的探讨中国部分地区人群非综合征型唇裂伴或不伴腭裂（nsCL／P）与转化生长因子B3基因CA重复序列多态性之间的关系。方法采用PCR-单链构象多态性方法，对170个nsCL／P核心家庭成员DNA标本进行TGFβ3 CA重复序列多态性的检测。利用传递不平衡检验（TDT）、基于单体型的单体型相对危险度检验（HHRR）和运用家系为基础的相关性检验（FBAT）检验分析该突变与nsCL／P发生之间的关系。结果TDT（OR=1．38，95％C10．93—2．06）和HHRR（OR=1．31，95％C10．93—1．84）检验发现，TGFβ3 CA重复序列多态性与nsCL／P发生之间的关联不具有统计学意义（P〉0．05），但是FBAT检验发现在显性和隐性模型中，TGFβ3基因多态性与nsCL／P发病危险之间的关联具有统计学意义（P〈0．05）。结论TGFβ3 CA重复序列多态性可能是中国部分地区人群发生nsCL／P的危险因素，但还有待于扩大样本量进一步加以验证。     

原发性高血压与eNOS基因多态性相关性分析

目的探讨新疆哈萨克族和汉族原发性高血压(EH)与内皮型一氧化氮合酶(eNOS)基因27bpVNTR多态性相关性。方法选取新疆塔城地区哈萨克族高血压患者363例和健康对照370人,选取汉族高血压患者346例,健康对照385人,运用多重单碱基延伸分型技术(multiplex snapshot)技术进行eNOS基因27bpVNTR多态性分析,比较基因型、等位基因分布频率;采用双抗体夹心法(ELISA试剂盒)测定血浆eNOS含量,分析血浆eNOS水平与原发性高血压的相关性。结果 2个民族中,原发性高血压组的收缩压、舒张压、平均动脉压、脉压、体质指数、腰臀比、胆固醇、低密度脂蛋白、肌酐、尿酸、载脂蛋白A1/B平均水平均高于对照组,差异均有统计学意义(P<0.05);哈萨克族EH组及对照组eNOS基因27 bp VNTR的4种基因型(bba、a、ab、bc)的分布频率差异无统计学意义(P>0.05);汉族EH组未检测到bc基因型,EH组及对照组的基因型和等位基因分布频率差异无统计学意义(P>0.05);汉族居民EH组携带bba、a、ab基因型的血浆eNOS平均值分别为(12.31±15.63)(、13.25±13.55)(、14.27±18.94)ng/mL;对照组分别为(13.84±15.19)(、17.97±13.33)(、13.55±13.73)ng/mL,均高于哈萨克族居民。结论新疆哈萨克族和汉族居民eNOS基因27 bp VNTR多态性与原发性高血压无关;汉族居民携带bba、a、ab基因型的血浆eNOS平均值高于哈萨克族人。     

神经胶质素-4基因多态性与儿童孤独症关系的初步研究

【目的】探讨神经胶质素-4(Neuroligin-4)基因多态性与中国汉族儿童孤独症的关系。【方法】应用聚合酶链式反应与限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)分析方法对80名中国汉族孤独症儿童及82名正常对照儿童进行2个SNP位点rs3810686和rs5916271的等位基因和基因型测定。【结果】Neuroligin-4单核苷酸多态性片段rs3810686和rs5916271的基因型分布频率符合Hardy-Weinberg(P0.05),并且孤独症组和正常对照组在上述各位点等位基因频率和基因型分布无显著差异(P0.05)。【结论】Neuroligin-4基因上的2个单核苷酸多态性片段rs3810686和rs5916271与儿童孤独症的发病无关联。     

基于降噪风险基因网络的生存风险基因筛选

目的 对基于降噪风险基因网络的生存风险基因筛选算法CoxLASSO-ISIS-N的表现作出评价,并与其他5种算法进行比较,分析算法的优劣,以期为高维基因表达数据的生存风险基因筛选提供一种新的思路.方法 针对带有噪声的高维基因表达数据的生存风险基因筛选问题,分别利用模拟数据和真实数据,对6种算法(CoxLASSO、Cox...     

An ancestry‐based approach for detecting interactions

1 Background

Epistasis and gene‐environment interactions are known to contribute significantly to variation of complex phenotypes in model organisms. However, their identification in human association studies remains challenging for myriad reasons. In the case of epistatic interactions, the large number of potential interacting sets of genes presents computational, multiple hypothesis correction, and other statistical power issues. In the case of gene‐environment interactions, the lack of consistently measured environmental covariates in most disease studies precludes searching for interactions and creates difficulties for replicating studies.

2 Results

In this work, we develop a new statistical approach to address these issues that leverages genetic ancestry, defined as the proportion of ancestry derived from each ancestral population (e.g., the fraction of European/African ancestry in African Americans), in admixed populations. We applied our method to gene expression and methylation data from African American and Latino admixed individuals, respectively, identifying nine interactions that were significant at . We show that two of the interactions in methylation data replicate, and the remaining six are significantly enriched for low P‐values ().

3 Conclusion

We show that genetic ancestry can be a useful proxy for unknown and unmeasured covariates in the search for interaction effects. These results have important implications for our understanding of the genetic architecture of complex traits.     

维生素D受体和雌激素受体的基因与骨质疏松

骨质疏松症是以低骨量和骨组织微结构退化为特征的全身性疾病,与众多因素有关,而遗传是其中的重要决定因素。在目前研究的若干侯选基因中,维生素D受体基因与雌激素受体基因最受瞩目。该文就维生素D受体基因,雌激素受体基因与骨质疏松的关系及这两个基因之间的协同作用进行综述,从而阐明维生素D受体基因与雌激素受体基因在骨质疏松症发病机制中的作用。     

基因芯片技术及其在遗传毒理中的应用

基因芯片 (genechip)也被称之为DNA微阵列 (DNAarray) ,寡核苷酸微芯片 (oligonucleotidemicro chip)或寡核苷酸微阵列 (oligonucletidearray)。基因芯片技术是近年来发展起来的一项新技术 ,在生命科学研究中有着广泛的应用前景 ,可用于基因测序、基因表达、基因诊断、基因多态性分析等研究。本文介绍基因芯片的原理、类型、制备、工艺流程及其在遗传毒理上的应用     

纳米级与微米级二氧化硅粉尘对小鼠胚胎毒性的比较研究

目的比较研究纳米级(nm-)与微米级二氧化硅粉尘(μm-SiO2)对小鼠胚胎的影响,并观察胚胎Connexin32(Cx32)和Cx40基因有无点突变改变。方法5个实验组(零剂量粉尘组、μm-SiO250mg/m3组、μm-SiO2200mg/m3组、nm-SiO250mg/m3组、nm-SiO2200mg/m3组)共25只雌性小鼠,妊娠0日(E0)至E17日连续呼吸道染尘,观察妊娠期间母鼠体重变化,E18日取出胚胎,观察胚胎发育情况,并采用常规聚合酶链式反应(PCR)、聚合酶链式反应-单链构像多态性(PCR-SSCP)技术对胚胎的Cx32和Cx40基因进行点突变检测。结果E18日,各染尘组的母鼠体重均显著低于对照组;各染尘组的胚胎数、活胎数、胚胎体重显著低于对照组,nm-SiO2200mg/m3组活胎数显著低于nm-SiO250mg/m3组和μm-SiO2200mg/m3组,nm-SiO2200mg/m3组胚胎体重显著低于μm-SiO2200mg/m3组;nm-SiO2200mg/m3组死胎率和吸收胎率均显著高于对照组。Cx32和Cx40基因经检测未发现有突变者。结论SiO2粉尘具有小鼠胚胎毒性,微米级粒子粒径改变为纳米级后,毒性作用增强,且纳米级SiO2粉尘对小鼠胚胎有致死作用。两种粒径的二氧化硅粉体均未发现有致Cx32和Cx40基因点突变。     

分型基因芯片检测疟原虫的研制及应用

目的 研制快速检测间日疟原虫和恶性疟原虫等并可进行分型的基因芯片。方法 筛选疟原虫高度保守而且具有种属特异性的瓣RNA基因片断为探针，制备疟原虫诊断和分型的基因芯片；检测时提取标本中的疟原虫核酸，用不对称PCR技术进行扩增和荧光标记，然后与检测芯片杂交，进行扫描和分析。结果 建立的疟原虫检测芯片能特异和敏感的对间日疟原虫和恶性疟原虫诊断及分型。结论 成功制备用于疟原虫快速侦检和分型的基因芯片，对疟疾的预防和控制具有重要意义。     

二噁英对HepG2和SPC-Al细胞P53和P38 MAPK基因表达的影响

[目的] 探讨二(口恶)英(TCDD)对人体肝癌细胞株(HepG2)和肺腺癌细胞株(SPC-A1)中P53基因和P38 MAPK基因表达的影响,并研究剂量与效应的关系.[方法] 用常规的细胞培养方法,利用RT-PCR方法对2种基因进行表达,并以β-actin作为内对照.对基因表达的强度进行比较分析.[结果] P38 MAPK基因在2种细胞中都有表达,在HepG2中,P38 MAPK基因表达随浓度1、 5、 10、 20 nmol/L增加先抑后扬(表达值分别为0.900、 0.820、 1.260、 0.898,P＜0.05),而在SPC-A1中差异无显著性(表达值分别为0.898、 0.919、 0.808、 0.846,P＞0.05).P53基因在人体肝癌细胞株(HepG2)中有表达,并随浓度增加而上调(表达值分别为0.764、 0.890、 1.099、 1.218、 1.405,P＜0.05)而在肺腺癌细胞株(SPC-A1)中未见表达.[结论] 二英对人体肝癌细胞株(HepG2)中P53基因和P38 MAPK基因有诱导作用,在肺腺癌细胞株(SPC-A1)中仅见对P38 MAPK基因有诱导作用,P53蛋白未见阳性表达.     

HLA-DM基因多态性与子痫前期的相关性

目的 探讨HLA-DM基因多态性与子痫前期的相关性.方法 用序列特异性寡核苷酸探针杂交聚合酶链反应方法分别测定35例子痫前期患者及63例正常孕妇的HLA-DM基因型.结果 HLA-DMB*0103基因频率在子痫前期组比正常妊娠组明显升高,差异有显著性(x2=4.38,P＜0.05),其他各等位基因频率在两组间差异无显著性(P＞0.05).结论 HLA-DMB*0103频率在子痫前期患者中明显增多,提示HLA-DMB*0103可能为子痫前期的易感基因.     

基因芯片在妊娠相关疾病研究中的应用

基因芯片技术以信息量大、处理速度快、所需样品少、污染少等优点被广泛用于药物的筛选、新药的研制开发、疾病的诊断。该文通过几个方面对基因芯片在妊娠相关疾病中的应用加以综述。     

陕西汉族人群细胞连接蛋白Cx37基因多态性分布

目的探讨心血管疾病相关的细胞连接蛋白37（Connexin37，Cx37）基因C1019T多态性在陕西汉族人群的分布。方法采用聚合酶链一限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）技术，对116例无血缘关系的健康陕西汉族人的染色体进行检测，分析基因型频率、等位基因频率分布，并与其他种族进行比较。结果Cx37基因C1019T等位基因频率为：C=68．5％，T=31．5％；基因型频率为：C／C=63．8％，C／T=30．2％，G／G=6．0％；其中男性等位基因频率为：C=76．1％．T=23．9％；基因型频率为：C／C=59．2％，C／T=33．8％，G／G=7．0％；陕西汉族人Cx37基因C1019T基因型频率和等位基因频率在男女之间差异无统计学意义，与瑞典人群相比差异有统计学意义（P〈0．05），而与日本、我国台湾人群相比差异无统计学意义（P〉0．05）。结论陕西汉族人Cx37基因C1019T基因型频率及等位基因频率与东方人种无差异，而有别于西方人种。