IRF5基因多态性与山东汉族人群系统性红斑狼疮的相关性研究

目的 研究山东地区汉族人群干扰素调节因子5(IRF5)基因rs2004640、rs10954213单核苷酸多态性,探讨其与系统性红斑狼疮(SLE)易感性之间的关系.方法 采用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性等方法对92例SLE患者和88名健康对照IRF5基因rs2004640 G/T、rs10954213 G/A多态性进行分析,计算基因型和等位基因频率.结果 SLE患者IRF5 rs2004640GG、GT、TT基因型频率分别是0.198、0.521和0.281,与对照组比较差异有统计学意义(X2=8.73,P<0.05);SLE患者IRF5 rs10954213 GG、GA、从基因型频率分别是0.318、0.409和0.273,与对照组间差异有统计学意义(X2=6.36,P<0.05).结论 山东汉族人群IRF5基因位点rs2004640、rs10954213的多态性,可能与山东地区汉族人群SLE的易感性有关,需进一步累积更多数据证实.     

干扰素调节因子5基因rs2004640多态性与系统性红斑狼疮遗传易感性的荟萃分析

目的:系统评价干扰素调节因子5基因(IRF5)rs2004640单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮的遗传易感性在不同种族的相关关系。方法:检索Pubmed数据库、万方数据库、CNKI数据库发表的有关IRF5 rs2004640单核苷酸多态性与SLE病例对照研究的文献,应用review manager5软件,采用Mantel-Haenszel-Peto法荟萃分析IRF5 rs2004640单核苷酸多态性在不同种族中的研究。结果:荟萃分析包括亚洲、欧洲-美洲高加索人群、墨西哥印欧混血、美国黑人等不同人群的IRF5 rs2004640单核苷酸多态性14个研究,共11 725例样本。亚洲人群IRF5 rs2004640 T等位基因频率26.3%~45.5%,高加索人群IRF5rs2004640 T等位基因频率44%~56%。分别荟萃分析亚洲和高加索人群与该多态性位点关联,均提示这两种人群IRF5rs2004640 T等位基因与狼疮发病密切相关(亚洲人群OR值1.35,95%CI 1.22~1.50;高加索人群OR值1.42,95%CI 1.32~1.54;P<10-6)。荟萃分析总的结果表明IRF5 rs2004640 T等位基因与狼疮发病密切相关(OR=1.42,P<10-6)。结论:IRF5rs2004640基因多态性在不同种族人群中的荟萃分析肯定了IRF5 rs2004640 T等位基因和系统性红斑狼疮发病相关。     

HLA-DQB1基因多态性与中国汉族人群系统性红斑狼疮的相关性

目的 探讨HLA-DQB1基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNP)与汉族人群系统性红斑狼疮(systemic lupus erthematosus,SLE)遗传易感性的相关性.方法 通过聚合酶链式反应-连接酶检测反应(polymerase chain reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)技术对908例SLE患者和961例健康对照rs3129716(HLA-DQB1)位点进行基因分型,同时结合临床表现分型,分析该位点与疾病及临床表型的相关性.分型结果用PLINK1.07软件进行统计分析.结果 rs3129716(HLA-DQB1)位点等位基因频率和基因型频率在SLE疾病组和对照组的分布差异无统计学意义(P＞0.05).三种遗传模型下的分析显示,两组间差异无统计学意义(P＞0.05).将SLE患者按血清学指标及临床表现分型,未发现相关性.结论 rs3129716(HLA-DQB1)与中国汉族人群SLE患者遗传易感性不相关.     

Toll样受体5基因多态性与中国人群脓毒症的相关性研究

目的 探讨Toll样受体5(Toll-like receptor 5, TLR5)基因多态性位点与脓毒症发生风险及疾病严重程度的相关性.方法 采用病例-对照研究设计,募集了255例脓毒症患者和260例对照个体.应用贝克曼公司的商用SNPstream 分型技术和PCR-RFLP 方法对TLR5基因的3个编码区多态性位点进行分型.采用Logistic 回归分析,校正性别、年龄、吸烟和饮酒、慢性病状态、APACHEⅡ评分和脓毒症病因等混杂因素的影响,评价多态性位点与脓毒症的发生风险,以及脓毒症性休克、死亡和器官功能障碍等表型的遗传相关性.结果 TLR5基因的3个多态性位点在病例和对照组中的基因型分布均呈哈-温平衡状态.这3个编码区的多态性位点与脓毒症的发生风险和疾病严重程度均无遗传学关联.结论 TLR5基因的多态性位点可能在脓毒症的发生、发展和病程转归中不发挥重要作用.     

系统性红斑狼疮易感基因单核苷酸多态性研究进展

系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)是一种复杂的多基因自身免疫性疾病,遗传因素重要而复杂.SLE的易感基因包括人类白细胞抗原(HLA)基因、免疫球蛋白Fc受体(FcR)基因、细胞毒性T细胞相关抗原4(CTLA-4)基因、免疫球蛋白受体同源体(FcRL)基因等.对易感基因单核...     

Toll样受体基因多态性与牙周炎相关性研究进展

牙周炎是一种多基因复杂疾病,尽管牙菌斑是该病的始动因子,但不同个体对于菌斑微生物的反应程度不同,因而不同个体对牙周炎的易感性也有所差异。Toll样受体（TLR）是一种重要的模式识别受体,在宿主对病原微生物的免疫反应当中起着重要的作用。近年来有很多关于TLR基因多态性与牙周炎的研究,但其结果存在人群和种族差异。     

IL-10RA基因多态性及其与系统性红斑狼疮关系的研究

目的:确定SLE模型小鼠IL-10RA基因变异及其与SLE表现型是否存在关联。方法:用微卫星遗传标记及数量性状位点(QTL)分析方法确定SLE模型小鼠B/W F1的SLE易感基因精确染色体定位并选取候选易感基因,对候选易感基因进行测序分析,选取有基因序列异常的候选易感基因进行PCR-SSCP分析,确定候选易感基因碱基序列变异位点与抗染色质抗体、抗DNA抗体,抗组蛋白抗体及蛋白尿等SLE表现型的相关关系。结果:QTL分析结果表明B/W F1×NZB小鼠抗染色质抗体易感基因与NZW型IL-10RA基因紧密连锁;测序分析发现IL-10RA基因编码区有18处碱基变异,其中7处碱基变异将导致编码氨基酸的变异;抗染色质抗体、抗DNA抗体,抗组蛋白抗体及蛋白尿等SLE表现型与NZW型IL-10RA基因密切相关。另一种SLE模型小鼠MRL的IL-10RA基因存在相同变异。结论:NZW小鼠IL-10RA基因编码区碱基序列存在变异,B/W F1×NZB小鼠SLE表现型与NZW小鼠第9染色体IL-10RA编码区碱基变异相关,提示IL-10RA可能是SLE模型小鼠的一个SLE易感基因。     

广西人群S100B基因多态性与系统性红斑狼疮的相关性研究

目的:探讨S100B基因rs9984765、rs2839356和rs2186358遗传多态性与系统性红斑狼疮(SLE)的相关性。方法:选取313例SLE患者作为病例组,年龄和性别匹配的396例正常人作为对照组,采用单碱基延伸PCR技术(SBE-PCR)和DNA测序法对S100B基因3个位点进行基因分型检测。结果:rs9984765和rs2186358位点的基因型和等位基因频率在SLE患者组和对照组间分布差异均无统计学显著性,而rs2839356位点的C等位基因在两组间比较差异有统计学意义(P=0. 040)。进一步分析rs2839356位点的等位基因与SLE患者临床表现的关系,发现rs2839356位点的C等位基因在伴有神经系统病变的SLE患者中高于不伴有神经系统病变的SLE患者(P=0. 023)。结论:在广西人群中,S100B基因rs9984765和rs2186358位点的基因多态性可能与SLE的遗传易感性无关,而携带rs2839356的C等位基因可能具有增加SLE及其并发神经系统病变的发病风险。     

系统性红斑狼疮与CTLA—4基因多态性的相关性研究

系统性红斑狼疮 ( SL E)是自身免疫性疾病的原型 ,以自身抗体的产生和免疫复合物的聚集为特征。而 B淋巴细胞产生自身抗体有赖于 CD4 + T淋巴细胞的活化。细胞毒性 T淋巴细胞相关分子 - 4 ( CTL A- 4 )和 CD2 8结构相似 ,同属免疫球蛋白超家族的成员 ,且结合的配体 ( B7)相同。 CD2 8与 B7分子结合 ,可产生共刺激作用并进一步引起 T细胞的活化 ;相反 ,CTL A- 4与 B7结合对 T细胞活化则起负性调节作用 [1 ] 。 CTL A - 4基因位于人类染色体 2 q3 3 ,已发现其外显子 1第 4 9位碱基 A→ G点突变与 Graves’病和 型糖尿病发病有关…     

STAT4基因单核苷酸多态性与系统性红斑狼疮关系的研究

系统性红斑狼疮(Systemic lupus erythematosus,SLE)是一种累及多脏器的慢性炎性自身免疫性疾病,遗传因素、环境因素、免疫因素在该病的发生中发挥重要作用。最近国外多项研究表明STA T4rs7574865 SNP与多种自身免疫性疾病如类风湿关     

TLR4基因多态性在中国人群中的初步研究

目的检测中国人Toll样受体4(Toll—like receptor 4．TLR4)基因调控区和编码区的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms，SNPs)．寻找TLR4基因的遗传标记。方法采用直接测序的方法检测基因的5′区、编码区、部分内含子区和3′区，以确定中国人群中TLR4基因SNP的位置和类型，并用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性对重庆汉族样本进行了抽样调查。结果在4．98kb的测序范围内，发现5个新的SNP，3个位于5′区．2个位于3′非翻译区。在重庆地区汉族样本中．两个高频分布SNP的等位基因频率分别是0．266和0．404。结论在TLR4基因新发现的两个高频多态性位点在我国人群中比较常见，可以作为关联分析的遗传标记。     

广东地区汉族人群TLR1 基因多态性的测序研究

目的: 人类Toll样受体1(TLR1)在先天性免疫中起着重要作用。本文将着重研究广东地区汉族正常人群中TLR1 基因功能区的单核苷酸多态性(SNPs)图谱和频率分布。方法: 随机收集50例健康、无亲缘关系的中国广东地区汉族人外周血液,对TLR1 基因的启动子区、5'和3'非翻译区、4个外显子区的序列进行PCR扩增和直接测序,找出多态性位点及其频率分布规律。在此基础上对多态性位点进行Hardy-Weinberg平衡分析、中性进化分析和连锁不平衡分析。结果: 共发现17个SNPs以及2个插入/缺失多态位点,其中2个是首次发现的新多态性位点。位于编码区的新SNP位点+1 378 A/G为非同义突变位点,能导致460位丝氨酸(Ser)残基替换为甘氨酸(Gly)残基,并且这个氨基酸残基的替换处于TLR1胞外区的LRR结构域中,从而有可能影响蛋白的识别功能。另外,频率最高的SNPs是+743 A/G和+1 518 A/G,其次要等位基因频率均达到48%。所有多态性位点均符合Hardy-Weinberg平衡。中性检验显示广东汉族人群 TLR1 基因不符合中性进化假说,很可能是其调控区受到平衡选择作用的原因。连锁不平衡分析显示多态性位点-6 912 C/TA、-6 876 C/T、-6 399 C/T和-6 375 C/T之间,-6 847 A/G和-6 737 A/T之间,以及-5 984 -/CT、-5 531 A/G和-5 490 C/G之间完全连锁。结论: 本研究首次报道了汉族正常人群TLR1 基因的功能性多态性图谱,发现了一些种族特异性的多态性位点及频率分布规律,为今后开展汉族人基因多态性与疾病相关性研究打下一定的基础。     

白细胞介素-18基因多态性与广西壮族系统性红斑狼疮的遗传易感性

目的 探讨白细胞介素-18(interleukin 18,IL-18)基因单核苷酸多态性与广西壮族系统性红斑狼疮(systematic lupus erythematosus,SLE)易感性之间的关系.方法 以115例SLE患者和160名健康对照者为研究对象,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性和DNA测序的方法对IL-18基因-137G/C、-607C/A单核苷酸多态性进行基因分型.结果 IL-18基因-137G/C多态性在SLE组和正常人群中的分布差异无统计学意义(P>0.05),而IL-18基因-607C/A多态性在两组人群中的分布差异有统计学意义(P<0.05),等位基因频率的相对风险分析发现,-607 C等位基因携带者患系统性红斑狼疮的风险是-607A等位基因的1.619倍(OR=1.619,95%CI:1.150-2.281).联合基因型分析发现,IL-18的-137G/-607C等位基因频率在SLE组中显著高于对照组(P<0.05).-137G/-607C等位基因携带者显著增加了SLE的发病风险(OR=1.484,95%CI:1.056-2.087).结论 IL-18基因-607C/A多态性与SLE的发病具有相关性,其中-607 C等位基因可能是SLE的遗传易感基因.     

Association study of interleukin-19 rs2243188 polymorphism with systemic lupus erythematosus in a Chinese population

Abstract

The purpose of this study was to evaluate whether a single-nucleotide polymorphism (SNP), rs2243188 of interleukin-19 (IL-19), show significant evidence for association with SLE in a Chinese population. A total of 545 SLE patients and 613 healthy controls were collected in the present study. The genotyping of IL-19 rs2243188 polymorphism was detected by TaqMan allele discrimination assay on the 7300 real time polymorphism chain reaction system. The minor C allele of rs2243188, relative to the major A allele, appeared to have a significantly lower frequency in SLE patients (31.0%) as compared with controls (35.5%) (χ²?=?5.19, p?=?0.023). We also discovered a statistical significance in the dominant model (CC?+?CA versus AA: OR?=?0.755, 95% CI?=?0.598–0.953, p?=?0.018). However, no significant difference in genotype distribution was found between SLE patients and controls (p?=?0.056). Furthermore, an increased frequency of CC genotype were also detected in lupus nephritis (LN) groups as compared with non-LN groups (p?=?0.024). Besides, the individuals with CC genotype had a 2.201-fold higher risk for the susceptibility to LN than those A allele carriers (AA?+?CA) (p?=?0.006). Unfortunately, the analyses on the relationship of IL-19 rs2243188 with several clinical manifestations of SLE failed to find any significant results. In conclusion, our observations suggested the minor C allele of SNP rs2243188 might be a protective factor for SLE in a Chinese Han population. Moreover, the subgroup analysis highlighted that IL-19 rs2243188 SNP was associated with the susceptibility to LN patients.     

Influence of the TNFSF4 rs1234315 polymorphism in the susceptibility to systemic lupus erythematosus and rheumatoid arthritis

ObjectivesThe tumour necrosis factor superfamily 4 (TNFSF4) is a candidate gene for autoimmune diseases. We investigated the relationship of this gene with systemic lupus erythematosus (SLE) and rheumatoid arthritis (RA) in a Chinese Guangxi population.MethodsA total of 294 patients with SLE, 210 with RA, and 282 healthy controls were genotyped for single nucleotide polymorphism (SNP) rs1234315 using the polymerase chain reaction–restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP). The potential functional effects of the SNP were predicted by in silico analysis.ResultsStatistically significant associations with SLE and RA were detected at rs1234315, both by allele analysis (odds ratio 1.47, 95% confidence interval 1.17–1.86, p = 0.001; odds ratio 1.49, 95% confidence interval 1.15–1.92, p = 0.002; respectively), and genotype analysis (p = 0.003 and p = 7.000 × 10⁻⁵, respectively). The Akaike’s information criterion (AIC) values indicated that the recessive model may serve as the best-fit model for the SNP for SLE and RA.ConclusionOur results provided support for TNFSF4 rsl234315 as a SLE and RA susceptibility locus in a Chinese Guangxi population.     

Diversity and duplicity

Conclusion Given the central role of Ig in bridging the innate and acquired immune systems through both the affector and effector arms, it is not surprising that receptors for Ig play an important role in immune function. Strategies to block their function have been developed by microbial pathogens, and evolution has endowed humans with a diverse set of physiologically relevant receptor variants, presumably to allow fine tuning of the immune response. At least several of these variants appear to be risk factors for autoimmune disease, and they demonstrate the importance of more subtle variation in structure and function. These observations may assist in guiding the engineering of MAbs and Fc-fusion proteins for more effective Ig-based therapeutics.     

安徽省汉族SLE患者和正常人RANTES单核苷酸多态性及CCR5基因多态性的比较

目的　探讨中国汉族系统性红斑狼疮 (SLE)患者和正常人群RANTES单核苷酸多态性(SNP)及其受体CCR5多态性。方法　收集 14 6例确诊的SLE患者和 15 9名正常对照。通过PCR RFLP方法检测研究对象RANTES启动区SNP及其受体CCR5△ 32突变频率。结果　病例组RANTES 4 0 3位点G G、G A、A A基因型频率分别为 76 .71%、2 1.92 %、1.37% ;对照组分别为 6 7.30 %、2 9.5 6 %和3.14 % ,两组间基因型分布差异无显著性 (P >0 .0 5 )。两组突变等位基因 4 0 3A频率分别为 12 .3%、17.9% (P >0 .0 5 )。病例组RANTES 2 8位点C C、C G、G G基因型频率分别为 93.15 %、6 .85 %、0 ;对照组分别为 86 .79%、12 .5 8%和 0 .6 3% (P >0 .0 5 )。两组突变等位基因 2 8G频率分别为 3.4 %、6 .9% (P>0 .0 5 )。病例组和对照组突变等位基因CCR5△ 32频率分别为 0、0 .3% (P >0 .0 5 )。中国汉族人群RANTES突变基因型 4 0 3A A低于北美黑人和西非黑人 (P <0 .0 5 ) ,与北美高加索、北美西班牙人和北美亚洲人一致。RANTES 2 8位点基因型分布与北美亚洲人一致 ,但与北美高加索、北美西班牙人、北美黑人和西非黑人相差较大 (P <0 .0 5 )。结论　本次研究发现RANTES 4 0 3位点和 2 8位点单核苷酸多态性与SLE发病没有直接的关系。CCR5△ 32     

广东汉族正常人群TLR4基因单核苷酸多态性研究(英)

目的：人类Toll样受体4（TLR4）是先天免疫系统中一个重要的病原微生物识别受体。本研究将建立中国汉族正常人群TLR4基因座位的单核苷酸多态性图谱。方法：收集191例健康、无亲缘关系的中国广东汉族人外周血液,通过对TLR4基因的启动子区、3个外显子区以及它们周围的内含子区进行PCR扩增和测序,得到汉族正常人群TLR4基因座位单核苷酸多态性图谱及其频率分布特点。结果：共发现8个单核苷酸多态性位点,其中5个是首次发现的新位点。分布频率最高（0.283）的单核苷酸多态性位点是-1607 C/T。常见于高加索人中的2个非同义突变Asp299Gly和Thr399Ile在汉族人中没有被发现。中性检验显示汉族人群TLR4基因符合中性进化模型。结论：本研究建立了汉族正常人群TLR4基因座位的单核苷酸多态性图谱,发现了一些种族特异性的单核苷酸多态性位点,这些工作将为今后开展汉族人基因多态性与疾病相关性研究以及人群进化研究提供一定的帮助。