皖籍汉族人群MICA等位基因多态性的分布

目的了解皖籍汉族正常人群中MICA（major histocompatibility complex class I chain—related gene A）等位基因的分布,为进一步研究MICA关联疾病的发病机制奠定基础。方法采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针杂交（polymerase chain reaction and sequence—specific oligonucleotide probing。PCR—SSOP）技术对112例正常人群进行MICA基因外显子2、3、4的多态性分析。结果本研究人群的MICA基因多态性以MICA＊008等位基因频率最高,达30．36％,其次为＊010（16．96％）、＊002（13．84％）和＊009（12．05％）。单倍型分析显示。MICA基因与多个HLA—B位点间存在连锁不平衡现象,有统计学意义的有MICA＊008-B40、B07、B13,MICA＊010-B46、B15,MICA＊002-B35、B15和MICA＊009-B52。结论皖籍汉族正常人群的MICA等位基因分布具有其基本特点,MICA基因与HLA—B位点间存在广泛连锁不平衡。     

广东地区汉族正常人群HLA-E基因多态性研究

为了检测广东地区汉族正常人群HLA—E基N的多态性，并分析HLA—E与典型HLA—Ⅰ类(Ia)位点之间的连锁关系，采用PCR—SSP方法检测广东地区150个无血缘相关的正常人的HLA—E基N型，同时用NIH标准微量淋巴细胞毒方法检测其中106人HLA—A，一B基N型，对HLA—E与HLA—A，-B位点之间作连锁分析。结果发现，在广东地区汉族正常人群中共检出3个HLA—E等位基N：HLA—E*0101，HLA—E*01031，HLA—E*01032，其基N频率分别为45．33％，32．33％，22．33％。未检出E*0102和E*0104。HLA—E与HLA—A，-B位点之间B15／*E01032及A2／E*01032存在连锁不平衡，除此之外其他任何两位点之间不存在连锁不平衡。结论：HLA—E高度保守的多态性提示其生物学特性可能有别于HLA—Ia分子。     

广东汉族人群MICA基因多态性分析

目的获得广东汉族人群MICA基因第2~5外显子多态性分布特点。方法采用直接测序法(se-quence-based typing,SBT)对118名广东籍汉族无偿献血者的MICA基因进行多态性分析。结果 MICA各等位基因分布频率存在差异,其中MICA*010等位基因频率最高(25%),其次为MICA*019(16.5%)、MICA*008∶01(15.3%)和MICA*002∶01(15.3%),频率比较低的是MICA*033、MICA*009∶02、MICA*007∶02及MICA*004.与该基因在其他地区人群进行比较,存在显著差异。结论广东汉族人群MICA等位基因的分布有其自身特点。     

山东地区汉族人群MICA基因多态性分析

目的分析山东地区汉族人群MICA基因外显子2~6多态性,并与国内外其他地区人群进行比较。方法用聚合酶链反应-测序分型法(PCR-SBT)对100例山东地区汉族骨髓库捐献志愿者MICA基因外显子2~6进行多态性分析。结果共检出18个MICA等位基因,基因频率最高的前3位依次为MICA*008:01(35%),MICA*002:01(14%),MICA*010:01(12%)。与南方多地区汉族人群比较,MICA*004*,*019,*008,*010,*027分布差异均有统计学意义(P均0.05);与内蒙古地区汉族人群比较MICA*008,*012,*004差异有统计学意义(P均0.05);与韩国人群比较MICA*008,*010,*019差异有统计学意义(P均0.05);与美国高加索人种比较,只有MICA*045差异有统计学意义(P0.05);与非洲裔美国人比较差异有统计学意义的等位基因达10个。结论山东地区汉族人群MICA基因多态性有高加索人群特征,且与国内外其他地区人群存在较大差异。     

湖北省汉族人群MICA基因外显子2～4的多态性分析

目的 了解湖北省汉族正常人群中MICA等位基因的分布,为研究MICA基因与疾病的关系提供实验基础.方法 采用PCR-SSP方法对193例湖北地区汉族正常人群MICA基因外显子2～4的多态性进行分析.结果 MICA各等位基因分布频率存在差异,其中以MICA*00801/02等位基因频率最高(33.7%),其次为MICA*010(18.4%)、MICA*00201/020(13.9%)和MICA*01201/02(9.6%),频率最低的是MICA*005(0.5%)和MICA*027(0.5%).结论 湖北地区汉族人群MICA等位基因的构成与其他人群之间存在差异,有自己的分布特征.     

TNF基因多态性与中国汉族人群UC患者相关性的研究

目的以中国汉族人群样本进行TNF基因启动子区域转录起始位点上游6个SNPs检测结果确定其是否与中国汉族人群溃疡性结肠炎(ulcerative colitisus,UC)有关联。方法针对TNF基因启动子区域转录起始位点上游的六个热点SNPs (TNF-1031T/C,-863C/A,-857C/T,-380G/A,-308G/A,-238G/A)多态性,采用PCR-SSP方法检测。结果本研究发现TNF- 308A等位基因频率在患者中为14.6%,而在健康对照者中为8.9%,两者之间有显著性差异(P=0.02)。TNF-857T的携带率在UC患者中为17.3%,而健康对照者为12.2%,但两者之间差异无统计学意义(P=0.06)。单倍体分型显示6种单倍体包括H5(TNF1031T/863C/857C/380G/308A/238G/)和H3(TNF1031C/863C/857C/380G/308A/238G/),这两种单倍体都包含TNF-308A。H5单倍体频率在患者中为12.3%,而在健康对照者为7.5%,两者之间的差异有统计学意义(P=0.03)。结论综述以上结果,均提示TNF-308A可能与中国汉族人群UC患者遗传易感相关。     

内蒙古地区汉族人群TNFβ基因多态性与IgA肾病的相关性

目的研究内蒙古地区汉族人群IgA肾病与TNFβ基因多态性的关系。方法用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术对79例IgA肾病患者及80例正常对照TNFβ1 069位点等位基因A→G单碱基突变多态性进行分析。结果内蒙古地区汉族IgA肾病患者TNFβ*1／1纯合子和TNFβ*2／2纯合子检出率与正常对照组比较均有较大差异(均P< 0．05);TNFβ*2等位基因频率(68．99％)较正常人(53．75％)显著升高(P<0．01)。结论TNFβ*2基因可能与IgA肾病易患性相关。     

用PCR-SSP方法分析南方汉族人群MICA基因多态性

目的调查南方汉族人群MICA基因外显子2~6的多态性。方法采用聚合酶链反应/序列特异性引物(PCR-SSP)方法,调查113例江苏省扬州地区汉族正常人群MICA等位基因的分布情况。结果共检测出18个MICA等位基因,最常见的3种等位基因分别是MICA*008(23.0%),MICA*010(17.6%)和MICA*002/020(11.2%),最罕见的3种等位基因是MICA*042(0.4%),MICA*045(1.3%)和MICA*044(1.3%)。结论中国南方汉族人群MICA等位基因分布频率具有自己的种族特异性。     

北方汉族MICA基因遗传多态性及与HLA-B连锁不平衡研究

目的了解MICA等位基因在中国北方汉族的分布及与HLA-B基因型的连锁关系。方法用直接测序法对北方汉族224个标本的HLA-B和MICA基因的2—6外显子进行测序。用Arlequin软件统计分析2个位点间的连锁关系。结果发现18个MICA的等位基因,其中MICA~*002(16.07%),MICA~*008(23.21%)和MICA~*010(21.65%)最为常见。MICA~*010-HLA-B~*46∶01,MICA~*045-HLA-B~*13∶01,MICA~*049-HLA-B~*51∶01有明显的连锁关系。结论北方汉族人群呈现特异MICA等位基因库,MICA与HLA-B具有连锁关系。     

江苏汉族人群KIR配体HLA-Cw位点基因多态性研究

目的使用序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)法检测江苏地区汉族人群KIR配体HLA-Cw的基因多态性。方法合成10对特异性分型引物及1对内参照引物,对183例江苏地区汉族无关个体进行HLA-Cw低分辨率分型。用χ2检验对等位基因表现频率进行统计分析。结果共检出8种等位基因;HLA-Cw01～08的基因频率分别为0.17、0.01、0.19、0.07、0.00、0.11、0.15、0.11,其中HLA-Cw01、03、06、07型为常见型;有12例样本未扩增出HLA-Cw01～08等位基因型,占总人数的6.60%。经吻合度χ2检验验证,所有样本符合Hardy-Weinberg平衡(χ2=223.5,df=28,P>0.05)。第一组的HLA-Cw02、04、05、06基因频率之和(GF=0.186 9)小于第二组的HLA-Cw01、03、07、08型之和(GF=0.606 3),差异具有统计学意义(P<0.01)。结论江苏地区汉族人群HLA-Cw基因分布具有明显的不均衡性和独特的地理和人种特征。HLA-Cw01～08等位基因的分布以HLA-Cw01、03、06、07为主。     

MICA第5外显子微卫星多态性与大肠癌易感相关性研究

目的研究MHC-Ⅰ类链相关基因A(MICA)第5外显子微卫星多态性与大肠癌之间的相关性。方法应用荧光PCR微卫星分型技术分析103名大肠癌患者和100名正常人群MICA基因第5外显子微卫星等位基因频率。结果 MICA*A6基因频率在患者组(23.3%)高于对照组(14.5%),相对风险(OR)为1.791 4(P0.05);其余各基因频率在患者组与对照组之间的差异无统计学意义(P0.05)。结论 MICA-STR MICA*A6等位基因多态性与大肠癌相关,MICA*A6是人群个体中1个大肠癌遗传易感标记。     

肿瘤坏死因子a多态性与临床进展

肿瘤坏死因子ａ基因位于第６号染色体短臂人类白细胞抗原第３区，有１６个多态性位点，与人类部分自身免疫性疾病、肿瘤和急、慢性感染有关。     

肿瘤坏死因子a多态性与临床进展

肿瘤坏死因子a(Tumor necrosis factor alpha,TNFa)基因位于第6号染色体短臂人类白细胞抗原(Human leukocyte antigen,HLA)第3区,有16个多态性位点,与人类部分自身免疫性疾病、肿瘤和急、慢性感染有关。     

南京地区汉族人群中人类血小板抗原基因多态性及分析

人类血小板抗原(Ｈｕｍａｎｐｌａｔｅｌｅｔａｎｔｉｇｅｎ,ＨＰＡ)分型对临床上一些因血小板同种免疫反应导致的同种免疫性疾病,如新生儿同种免疫性血小板减少性紫癜(ＮＡＩＴＰ),输血后紫癜(ＰＴＰ)及血小板输注无效(ＰＴＲ)等的诊断和治疗有重要意义[13]。长时期来,人们一直沿用传统的血清学方法进行ＨＰＡ分型,但由于难以获得高质量、特异性抗血清等多种因素的制约,ＨＰＡ分型工作始终无法深入下去。随着对ＨＰＡ基因研究的深入,近年来国外陆续报道将基因检测技术用于血小板分型研究中。本文应用聚合酶链序列特异性引物(ＰＣＲＳＳＰ)…     

MICA基因多态性与结直肠癌的易感关联性研究

目的研究MICA等位基因多态性与结直肠癌易感性之间的关联性。方法采用PCR-SSP和PCR-SBT方法对样本MICA等位基因的多态性进行检测。结果结直肠癌患者中检出7种MICA等位基因;和对照组相比较,结直肠癌患者组中MICA*010等位基因分布频率更高,可能是结直肠癌的易感基因(30.0%vs 6.2%,OR=6.43,95%CI:3.51-11.76,Pc0.05),MICA*008和MICA*045等位基因分布频率更低,可能是保护基因(MICA*008:14%vs 25.4%,OR=0.48,95%CI:0.29-0.78,Pc0.05;MICA*045:2%vs 12.9%,OR=0.14,95%CI:0.05-0.40,Pc0.05)。结论 MICA等位基因多态性与结直肠癌的易感性间存在关联性。     

湖北土家族人群HLA-DRB1基因多态性研究

目的研究湖北土家族人群HLA-DRB1基因多态性,了解其分布特征,为开展群体遗传学相关研究奠定基础。方法采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(PCR-SSOP)流式细胞技术对342份无血缘关系健康的湖北恩施土家族人群样本进行HLA-DRB1等位基因分型检测,分析等位基因分布频率,并与其他地区人群进行比较。结果共检出13种等位基因,其中以DRB1*09(0.174 0)、DRB1*04(0.136 0)、DRB1*12(0.125 7)、DRB1*15(0.118 4)、DRB1*08(0.109 6)最为常见,未检出DRB1*03(18)。湖北土家族人群HLA-DRB1等位基因总体分布分别与湖南苗族人群比较P>0.05;分别与昆明汉族、云南纳西族比较P<0.05;分别与湖北汉族、内蒙古鄂温克族、宁夏回族、内蒙古蒙古族、西藏珞巴族、昆明彝族、新疆克尔克孜族比较,P<0.01。结论了解湖北恩施土家族人群的HLA-DRB1的遗传多态性,对于追溯土家族起源和民族间的血缘遗传关系具有重要意义。     

南方汉族人群HLA-DPA1和-DPB1基因多态性与鼻咽癌的关联研究

目的 探讨人类白细胞抗原(HLA)-DPA1和-DPB1基因多态性与中国南方汉族人群鼻咽癌的相关性.方法 选择2012年2月至7月于广西梧州市红十字会医院及深圳市武警医院经病理学检查确诊为鼻咽癌(NPC)病变的南方汉族患者74例为研究对象,纳入研究组;计算机随机选择同期于本中心献血的南方汉族健康志愿捐者160例,纳入对照组(本研究遵循的程序符合本院人体试验委员会所制定的伦理学标准,得到该伦理会批准,分组征得受试对象本人的知情同意,并与之签订临床研究知情同意书).采用测序分型方法对研究组和对照组的血液样本进行HLA-DPA1和-DPB1基因第2外显子双向测序,用Assign 3.5 SBT分析软件判定等位基因型.采用Wolf法进行x2检验并计算P值和相对危险度(RR),比较研究组和对照组HLA-DPA1和-DPB1等位基因频率的差异.结果 研究组和对照组中,均检出4个DPA1等位基因,即DPAl* 01:03,02:01,02:02和04:01.作为多态性丰富的HLA-DPB1位点,研究组中共检出14个等位基因,对照组中共检出18个等位基因.研究组与对照组的HLA-DPA1和-DPB1等位基因的基因检出率比较,差异均无统计学意义(x2＜3.84,P＞0.05).结论 本文的结果初步显示中国南方汉族人群中HLA-DPA1和-DPB1基因多态性与NPC无相关性.     

世界11个不同人群MICA基因遗传多态性研究及聚类分析

目的 探讨MICA基因在世界11个不同人群的遗传多态性分布特征,并绘制系统发生树.方法 应用11个人群MICA基因频率数据,采用PHYLIP软件,计算不同群体的遗传距离,绘制遗传树,并进行聚类分析.结果 MICA*001基因主要分布在欧洲和美洲地区,MICA*002基因在亚洲人及高加索人中均有检出,但在黑人和印第安人基因频率相对较高,MICA*008基因频率在高加索人种中有较高的分布;中国、泰国、日本和韩国等亚洲人彼此遗传关系相对较近聚为一大类;美国、英国的高加索人种聚为一类;中国的浙江和湖北汉族人遗传距离最近.结论 MICA基因在不同人种、不同地区人群分布不同,具有高度遗传多态性.建立稳定的MICA基因技术检测平台有助于开展中国人群MICA基因多态性研究,为人类学、MICA基因和疾病相关性和器官移植等研究提供遗传学参考数据.     

中国西南地区汉族人群肿瘤坏死因子基因多态性与鼻咽癌遗传易感性

目的:分析肿瘤坏死因子基因多态性分布与中国西南地区汉族人群鼻咽癌易感性的关系。方法:选择2000-10/2005-09在华西医科大学第一附属医院就诊的100例鼻咽癌患者为鼻咽癌组,均经过病理科活检确诊,其中包括未治疗44例,放疗后37例,放疗加化疗后19例,选择100名同期入院健康体检者为对照组。所有受试对象为中国西南地区汉族人,均对检测项目知情同意。采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性的方法检测100例中国西南地区汉族鼻咽癌患者和100名健康对照者肿瘤坏死因子α基因启动子区-308位点及肿瘤坏死因子β基因第一内含子252位点的等位基因以及基因型频率,分析两位点多态性与鼻咽癌遗传易感性的关系。结果:鼻咽癌组患者肿瘤坏死因子β( 252)位点G/A杂合子基因型频率显著高于对照组(57%,29%,P<0.01),野生型(G/G基因型)频率低于健康对照组(23%,51%,P<0.01),等位基因A的频率高于健康对照组(48.5%,13%,P<0.01);肿瘤坏死因子α(-308)位点基因型以及等位基因频率与对照组相比较无统计学差异。结论:本实验人群中未发现肿瘤坏死因子α(-308)位点多态性与鼻咽癌易感性无关;肿瘤坏死因子β( 252)位点基因多态性与鼻咽癌具有相关性,A等位基因可能是鼻咽癌的遗传易感基因,G/A杂合子基因型个体较易患鼻咽癌。     

广西地区汉族人群HLA-B15和HLA-B40组抗原多态性研究

目的研究广西地区汉族人群HLA-B15和HLA-B40组抗原的等位基因和特异性的分布情况,探讨其可能对临床供者选择的影响。方法采用多聚酶链式反应-基于测序的分型技术(PCR-SBT)对广西地区1 644名汉族人进行HLA-B基因分型,采用直接计算法计算每个等位基因的频率,分析各等位基因的抗原特异性,将HLA-B15和HLA-B40组的基因频率和与其他人群比较。结果 1 644名广西地区汉族人HLA-B位点基因频率不符合Hardy-Weinberg遗传平衡(P0.05)。HLA-B15组共检出14个等位基因,分属5种抗原特异性;HLA-B40组共检出6个等位基因,分属2种抗原特异性。结论广西地区汉族人群HLA-B15和HLA-B40组抗原多态性比较接近中国南方汉族人群,但也有广西地区特点。