传染病动力学模型在新型冠状病毒感染中应用的研究进展

2019年底新型冠状病毒感染疫情的出现给中国及世界造成了极大影响。传染病动力学模型因其可以揭示传染病的特征并预测其传播趋势，被广泛应用于新型冠状病毒感染疫情的预测。目前应用较广泛的传染病动力学模型是仓室模型，其结构相对简单，数据无需太过复杂，应用于早期疫情预测，但缺乏对不同个体间交互作用的考量。微观个体模型和集合种群模型克服了上述不足。微观个体模型从微观个体层面考虑了个体接触交互的异质性，但计算复杂、计算量庞大；集合种群模型考虑了种群的移动性和种群内部个体的异质性，但需要庞大的人类地理位置信息网络来构建模型。本文针对三种不同传染病动力学模型在疫情中的应用进行概述，通过比较不同模型的优缺点，探寻从多水平上建立精准预测重大突发急性传染病传播动态的综合传染病动力学模型的可能性，以期为形成快速有效的防控策略提供数据支撑和理论依据。     

河南省信阳市新型冠状病毒肺炎的流行动态

目的 探讨河南省信阳市新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的流行动态,为优化疫情防控策略、评估干预措施效果提供科学依据。 方法 收集信阳市官方报道的COVID-19病例数据和个案信息,确定感染日期,并由此估计潜伏期,构建SEIR的传染病动力学模型,分析疾病发生发展规律,同时模拟分析改变防控措施实施时间时疫情的动态变化。 结果 信阳市累计报告COVID-19确诊病例274例,罹患率为3.72/10万;潜伏期的中位数为6.00(4.00,7.25)d。模型分析显示,信阳市疫情的基本再生数R0=2.86,采取防控措施后有效再生数降至0.29;若提前3 d采取防控措施,病例数降低50.5%,而推迟3 d采取防控措施,病例数将增加1倍。 结论 信阳市COVID-19疫情快速扩散,但在国家强有力的防控措施下疫情很快得到控制。     

河南省新型冠状病毒肺炎疫情防控效果分析

目的:通过构建河南省新型冠状病毒肺炎的SIR模型和基本再生数的变化趋势,分析评价河南省的防控效果,并针对疾病恢复期提供建议。方法:选取河南省2020年1月21日至2月19日的疫情资料进行分析研究。使用R(3.6.2)来构建SIR模型,ode函数用来求解微分方程,optim函数用来优化模型。最终建立了河南省新型冠状病毒肺炎的流行趋势SIR图,并将之与疾病实际流行过程对比。同时分析了SIR模型下和实际情况下的R0变化趋势,并利用指数平滑模型进行了预测。结果:SIR模型峰值的感染人数大大超过了实际情况,实际变化数据的R0趋势图也低于SIR模型得出的R0变化趋势图,这说明河南省的疫情防控措施起了很大的作用,有效避免了大量人群的感染。结论:河南省针对此次新型冠状病毒肺炎疫情的防控措施有效地限制了疫情的扩散,防治效果显著,应继续做好疫情的针对性防控措施。     

河南省新型冠状病毒肺炎疫情防控效果分析

目的:通过构建河南省新型冠状病毒肺炎的SIR模型和基本再生数的变化趋势,分析评价河南省的防控效果,并针对疾病恢复期提供建议。方法:选取河南省2020年1月21日至2月19日的疫情资料进行分析研究。使用R(3.6.2)来构建SIR模型,ode函数用来求解微分方程,optim函数用来优化模型。最终建立了河南省新型冠状病毒肺炎的流行趋势SIR图,并将之与疾病实际流行过程对比。同时分析了SIR模型下和实际情况下的R_0变化趋势,并利用指数平滑模型进行了预测。结果:SIR模型峰值的感染人数大大超过了实际情况,实际变化数据的R_0趋势图也低于SIR模型得出的R_0变化趋势图,这说明河南省的疫情防控措施起了很大的作用,有效避免了大量人群的感染。结论:河南省针对此次新型冠状病毒肺炎疫情的防控措施有效地限制了疫情的扩散,防治效果显著,应继续做好疫情的针对性防控措施。     

新型冠状病毒肺炎疫情对武汉孕产妇抑郁和焦虑情绪的影响

目的:评估新型冠状病毒肺炎疫情对武汉围产期孕妇抑郁和焦虑状况的影响及因素分析.方法:选取2020年1月24日至3月29日间,在我院生产的孕妇176人,评估患者的一般资料,采用焦虑自评量表(SAS)和抑郁自评量表(SDS)评估产前抑郁和焦虑情绪状况,采用爱丁堡产后抑郁量表(EPDS)评估产后10 d抑郁状况,并对产妇出现...     

新型冠状病毒肺炎疫情下某三甲传染病定点医院医务人员职业生命质量现状调查

目的 了解新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情下某三甲传染病定点医院医务人员职业生命质量(QWL)的现状.方法 采用基本情况调查问卷、职业生命质量量表(QWL7-32)对某三甲传染病定点医院的293名医务人员进行调查,分析医务人员的QWL现状及不同特征医务人员的QWL差异.结果 医务人员QWL7-32量表总分为(9...     

广西地区新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的流行病学参数估计

目的 基于广西地区的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)数据,对COVID-19的相关流行病学参数,如世代间隔、基本再生数R0,进行估计.方法 采用三种概率密度分布模型(Gamma分布、Weibull分布、Lognormal分布)来拟合世代间隔的概率分布,采用Akaike信息准则(AIC)衡量统计模型拟合优良性.结果 ...     

SEIQCR传染病模型的构建及在广州市新型冠状病毒肺炎公共卫生防控效果评估中的应用

目的 构建易感者(S)-潜伏者(E)-发病者(I)-隔离者(Q)-确诊者(C)-恢复者(R)模型(SEIQCR),并初步用于评价广州市新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情中公共卫生干预措施的效果。 方法 在SEIR传播动力学模型基础上,添加隔离模块和确诊模块,建立联合考虑潜伏期传播规律和追踪隔离干预措施的SEIQCR传播动力学模型。以2020年1月13日至2020年3月17日广州市疫情数据为基础,拟合得到SEIQCR模型的动力学参数。 结果 SEIQCR模型显示预测每日发病数与实际发病数高度吻合(R2=0.93)。启动一级响应之后,时变再生数(R_t)呈快速下降趋势,提示本地传播得到有效控制。 结论 广州市COVID-19疫情的防控措施是有效的,各地方政府应严格执行隔离制度,切断传播途径,全力遏制COVID-19 传播。SEIQCR模型的构建策略可为其他地区的干预措施评估提供方法学借鉴。     

对新型冠状病毒肺炎疫情的护理防控策略

目的统一对2019新型冠状病毒肺炎疫情中肺部专科医院呼吸内科的护理防控策略。方法从新型冠状病毒相关知识培训及督查、病区日常护理工作流程改进和住院患者流程改进等方面进行护理防控。结果护理防控减少了院内感染。结论完整的护理防控策略可做好医护患者多方面的防护、避免了交叉感染。     

新型冠状病毒肺炎疫情期集中医学隔离观察点社区医务人员同情疲劳状况及影响因素研究

目的探讨新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)疫情期间集中医学隔离观察点社区医务人员同情疲劳状况及影响因素,为医务人员心理健康干预工作提供依据。方法2020年9—10月,采用横断面研究方法,用自行设计的一般资料问卷、职业生命质量量表、一般自我效能感量表、领悟社会支持量表,通过问卷调查方式对上海2个区、13个社区卫生服务中心参与集中隔离观察点工作的213名医务人员开展调查,比较不同人口学特征、一般自我效能感、领悟社会支持状态的医务人员的同情疲劳程度,并分析其影响因素。结果同情疲劳的3个维度中,213名医务人员同情满意得分为33.00(28.25,37.75)分,超临界值者141人(66.20%);职业倦怠得分为26.00(21.50,30.50)分,超临界值者96人(45.07%);继发性创伤应激得分为25.00(20.50,29.50)分,超临界值者192人(90.14%)。多因素logistic回归分析显示,与0 h者相比,污染区工作日均时长>8 h者的同情疲劳程度较高(OR=7.787,95%CI:1.127~53.820,P<0.05);与工作较满意者相比,较不满意者的同情疲劳程度较高(OR=6.209,95%CI:1.474~26.157,P<0.05);与压力一般及较小者相比,压力较大者的同情疲劳程度较高(OR=2.567,95%CI:1.228~5.366,P<0.05);与自信心很高者相比,自信心偏低、自信心较高者的同情疲劳程度均较高(OR=13.519,95%CI:3.394~53.848;OR=3.462,95%CI:1.038~11.548;均P<0.05);与领悟社会支持感高者相比,领悟社会支持感低者的同情疲劳程度较高(OR=2.071,95%CI:1.027~4.175,P<0.05)。结论集中医学隔离观察点医务人员同情疲劳状况待改善,应重点关注污染区日均工作时长较长、工作满意度较低、工作压力较大、一般自我效能感较差、领悟社会支持较差者的同情疲劳状况,及时干预。     

新型冠状病毒肺炎疫情下住院医师规范化培训的管理与策略

面对这次国际关注的突发公共卫生事件,复旦大学附属中山医院积极探索疫情防控下的住院医师规范化培训管理与策略,包括精准摸排、重点监测、分类管理住院医师返岗工作前的健康状况;采取多重方式进行新型冠状病毒肺炎知识的培训,合理安排临床工作及探索创新的教学模式;确保在疫情防控期间的常规监控基础上,能保证住院医师规范化培训工作尽快恢复至常态。实践发现,亟需高度重视和培养住院医师应对突发公共卫生事件的能力,且管理部门应该加强应对突发公共卫生事件的处置管理能力。     

地理信息系统在新型冠状病毒肺炎疫情防控中的应用进展述评

新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)疫情发生以来,地理信息系统等空间信息技术在描述新冠肺炎疫情流行分布状况、地域传播特征、不同区域疫情风险等级和早期预测预警等方面提供了大量的技术手段和应用实例,从而为科学防控和精准施策奠定了基础。本文结合地理信息系统技术方法在新冠肺炎疫情防控中的应用现状进行述评,为进一步提升防控水平提供参考,指导实施更加精准的疫情防控措施。     

基于泊松过程的山东省新型冠状病毒肺炎的再生数估计及流行动态分析

目的 探讨山东省新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的流行动态,为未来预防和控制COVID-19二次暴发以及其他新发传染病的暴发提供科学依据。 方法 收集山东省卫生健康委员会报告的559例COVID-19确诊病例信息,确定病例的感染日期,基于泊松过程建立传播模型并计算山东省COVID-19疫情期间的基本再生数和瞬时再生数,并对比分析基于顺序贝叶斯和时间-依赖方法的瞬时再生数估计结果。 结果 确诊病例的发病日期与被报告日期的天数之差大致服从威布尔分布。山东省COVID-19开始暴发时,基本再生数R0=2.64(95%CI:1.37~4.51),瞬时再生数随着时间的推移,大致呈现逐渐下降趋势,且3种计算方法的结果均显示出此种趋势。 结论 经过防控措施的干预后,山东省COVID-19的本地流行已经基本结束,但仍需提高警惕,防止疫情二次暴发。     

新型冠状病毒肺炎疫情防控措施对重庆市流行性感冒传播和流行的影响

目的 分析新冠肺炎疫情的防控措施对重庆市流感传播和流行的影响,为制定有针对性的流感防控措施提供重要参考。方法 通过国家流感哨点监测系统收集重庆市2018—2020年流感监测资料,分析流感流行的季节性特征,比较2020年与2018—2019年各年同期流感样病例百分比（ILI%）和流感病毒核酸阳性率,评价新冠肺炎疫情防控对流感流行特征的影响。结果 流感监测资料和实验室检测结果显示,2018—2020年度重庆市报告ILI%依次为3.53%、2.23%和1.20%;流感病毒核酸阳性检出率分别为13.97%、23.81%和2.65%。2018—2019年ILI%分布相似,2020年2月开始,ILI%骤降并维持在较低水平。流感病毒核酸阳性率在2018—2019年每年12月至次年3月达到高峰,2020年2月后迅速下降,3月降为0。ILI%与流感病毒核酸阳性率呈正相关（r=0.404 8,P<0.05）。2020年与2018—2019年各年同期相比,ILI%增长率分别为-66.09%和-46.32%,流感病毒核酸阳性率分别下降81.03%和88.87%,其中1月降幅较小,下降率为39.87%;2...     

修正SEIR传染病动力学模型应用于湖北省2019冠状病毒病(COVID-19)疫情预测和评估

目的: 建立可用于2019冠状病毒病（COVID-19）疫情评估的SEIR传染病动力学模型,并对湖北省COVID-19疫情进行预测和评估。方法: 考虑COVID-19潜伏期患者不易被有效隔离,且具有较强的传染能力,建立了联合考虑潜伏期传播能力和追踪隔离干预措施的COVID-19 SEIR传染病动力学模型。以2020年1月23日至2月24日的湖北省疫情数据为依据,拟合得到了新建立的修正SEIR模型的动力学参数。通过欧拉数值方法实现修正SEIR传染病动力学模型的求解,对湖北省疫情进行分析,评估防控隔离和集中收治等措施对疫情发展的影响。结果: 修正的SEIR传染病动力学模型对疫情的理论估计与湖北省疫情的实际情况较为符合。模型理论分析表明,防控隔离和医学追踪隔离等措施对疫情大面积传播有重要抑制作用;集中接收、分层治疗等重要措施对感染人数峰值的迅速回落起到了关键作用;此外,个人提高防范意识,采取严格自我防护措施,遏制了感染人数的新增。结论: 修正的SEIR传染病动力学模型可用于COVID-19传播态势分析,以便为制订未来的疫情干预决策提供一定的理论支持。     

应用R软件制作新型冠状病毒肺炎动态交互地图

目的 介绍使用R软件leaflet程序包制作疾病动态交互地图的方法和具体步骤,为展示疾病的地区分布、疫情的分析和现场处置提供帮助。方法 通过传染病信息报告系统收集海南省截至2020年8月30日新型冠状病毒肺炎确诊病例和无症状感染者地址、病例分类、发病日期等资料。将病例地址录入高德地图坐标拾取系统,获取病例地址的经纬度坐标。利用R软件leaflet程序包调用高德地图、Esri卫星地图做为底图,添加病例标记,病例聚合功能及测量工具。结果 R软件制作的海南省新冠病毒动态交互地图可以实现放大、缩小、拖拽等操作,可以切换行政区划地图和卫星地图,点击病例可以显示病例序号,现住址和发病日期等信息,可将地图以html文件方式分享给相关研究人员,并可以测量病例间或病例与可疑暴露地点间的距离。结论 R软件作为一款免费、开源的软件,可以简便、灵活的制作疾病动态交互地图,直观、全面的展示疾病的地区分布,对于分析传染病的传播过程、疫情的现场处置起到很好的辅助作用,在流行病学调查研究中值得推广应用。     

2019冠状病毒病疫情期间湖北省医务人员未成年子女心理行为研究

目的: 调查2019冠状病毒病（COVID-19）疫情期间湖北省医务人员未成年子女心理行为状态。方法: 采取横断面调查方法,于2020年3月13至15日通过问卷星在微信群及朋友圈中发放调查问卷,包括一般资料调查表及Conners父母症状问卷（PSQ）。问卷全部填写完毕方可提交,通过IP地址剔除湖北省外的问卷,同时剔除答题时间过短（答题时间少于150 s）的问卷。分析父母职业状态对不同年龄组儿童心理行为状态的影响。结果: 本次调查共回收有效问卷391份,其中男性207名（52.9%）,女性184名（47.1%）;3~ < 6岁91名（23.3%）,6~ < 10岁183名（46.8%）,10~16岁117名（29.9%）;父母均为医务人员87名（22.3%）,父母一方为医务人员139名（35.5%）,父母均非医务人员165名（42.2%）。无论父母是否为医务人员,3~ < 6岁儿童的PSQ得分在各因子水平差异均无统计学意义（均P>0.05）;父母均为医务人员的6~ < 10岁儿童的多动-冲动因子得分、学习问题因子得分和总分均高于父母均非医务人员的同龄儿童（均P < 0.05）,学习问题因子得分高于父母一方为医务人员的同龄儿童（P < 0.05）,父母一方或均为医务人员的子女焦虑因子得分高于父母均非医务人员的子女（均P < 0.05）;父母一方为医务人员的10~16岁儿童的品行问题、学习问题、多动-冲动、多动指数及总分均低于父母均为医务人员或父母均非医务人员的同龄儿童（P < 0.05或P < 0.01）,而身心问题、焦虑因子得分与其他两组差异无统计学意义（均P>0.05）。结论: COVID-19疫情期间,湖北省医务人员与非医务人员未成年子女心理行为状态随着年龄段不同而表现出差异,3~ < 6岁学龄前儿童心理行为状态无明显差异,而6~ < 10岁和10~16岁医务人员子女心理行为状态差于非医务人员子女心理行为状态,需对该年龄段医务人员子女心理行为状态予以关注。