毛细管扩张症突变基因启动子区单核苷酸多态性位点rs189037与广东鼻咽癌相关性研究

目的毛细管扩张症突变(ATM)基因变异与多种肿瘤发生相关,但对ATM基因与鼻咽癌易感性研究报道较少。选择ATM基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)位点rs189037,观察其多态性与广东鼻咽癌发生风险的关系。方法应用PCR方法对176名广东鼻咽癌患者和202名对照人群DNA标本rs189037位点进行扩增、纯化及测序,再进行人群相关性分析。结果 rs189037 G>A,其中杂合型G/A基因型频率在鼻咽癌患者及对照人群中分别为50%(88/176),47.5%(96/202);纯合突变型A/A基因型频率在鼻咽癌患者及对照人群中分别为15.3%(27/176),18.3%(37/202),经统计分析,G/A和A/A这两种基因型在两组间分布无显著性差异(OR=1.022,95%CI=0.668-1.564),进一步行年龄分层及性别分层,各两组间仍无明显差异。结论 ATM基因启动子区rs189037位点多态性在鼻咽癌患者和对照人群中基因型频率差别很小,推测其与中国广东地区鼻咽癌易感性无明显关联。     

ABCG2基因启动子区rs2231142位点单核苷酸多态性与新疆维吾尔自治区汉族男性人群高尿酸血症易感性分析

目的 探讨ABCG2基因rs2231142(G/T)位点单核苷酸多态性与高尿酸血症易感性的关系。方法 以2018～2020年在新疆医科大学附属中医医院、新疆维吾尔自治区人民医院、新疆医科大学第一附属医院就诊的865例男性为研究对象,收集其血液样本,按其血尿酸水平分为高尿酸血症组(n=367)和健康对照组(n=498)。采用多重荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)技术检测ABCG2基因rs2231142(G/T)位点的基因型并观察两组的基因多态性。利用双荧光素酶报告基因实验证实该序列对荧光素酶表达活性的影响。结果 高尿酸血症组的尿酸、体重指数、葡萄糖、肌酐、甘油三酯、舒张压、高密度脂蛋白、低密度脂蛋白高于健康对照组,差异均有统计学意义(P<0.05)。两组基因rs2231142位点均符合Hardy-Weinberg平衡性检验(P＞0.05),表明该位点具有群体代表性。高尿酸血症组和健康对照组中GG、GT、TT 3种基因型的分布频率差异有统计学意义(χ²=17.146,P<0.001),等位基因G和T在两组间分布频率比较差异有统计学意义(χ²=19.115,P<0.001)。不同遗传模型中,TT基因型均表现为高尿酸血症的危险因素(加性模型OR=2.302,95% CI:1.472~3.603;显性模型OR=1.689,95% CI:1.283～2.210;隐性模型OR=1.867,95% CI:1.221～2.874)。尿酸、葡萄糖、甘油三酯在不同基因型分组间比较,差异均有统计学意义(P<0.05)。两两比较结果显示,G/T组与G/G组、T/T组与G/G组组间的尿酸、葡萄糖、甘油三酯水平差异均有统计学意义(P<0.05)。其中T/T组尿酸水平最高,G/G组葡萄糖和甘油三酯水平最高。双荧光素酶活性测定结果显示,rs2231142(G/T)具有启动子功能;且含G等位基因比含T等位基因的重组质粒荧光素酶报告基因的表达水平较高,是其1.120倍(P=0.012)。结论 ABCG2基因rs2231142(G/T)位点单核苷酸多态性与高尿酸血症易感性间存在关联,等位基因T可能是高尿酸血症的危险因素。     

广西人群中IL-22基因启动子区rs2227513A/G位点多态性研究

目的探讨广西正常人群中IL-22基因rs2227513A/G位点的多态性分布特点和不同人群间的多态性差异。方法采取多重单碱基延伸法(SNa Pshot)与DNA测序相结合的方法对280例广西人群的IL-22基因的rs2227513A/G位点进行基因分型检测,并用统计学方法比较不同性别及组间分布差异。结果广西人群中IL-22基因rs2227513A/G存在AA、AG基因型,分布频率分别为95.0%和5.0%,此位点基因型及等位基因频率在广西人群的男女性别间差异无统计学意义(P>0.05)。其基因型和等位基因与人类基因组计划项目(Hap Map)公布的意大利、墨西哥人群相比,差异有统计学意义(P<0.05),而与北京、日本人群比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论 IL-22基因rs2227513A/G基因多态性在不同种族和地区间存在差异。     

MTNR1B基因rs4753426位点单核苷酸多态性与妊娠期糖尿病的关系

目的研究褪黑素受体1B(MTNR1B)基因启动子区主要的功能性位点rs4753426单核苷酸多态性(SNP),在中国汉族妊娠期糖尿病(GDM)孕妇与健康孕妇之间基因型及等位基因频率分布差异,以及与妊娠期糖尿病发病相关性。方法 2011年6月—2012年7月,选择我院门诊和住院的GDM孕妇93例为GDM组,同期健康体检孕妇165例为对照组。记录两组孕妇年龄、孕周、身高、早孕期体质量,并计算体质量指数(BMI),测定两组孕妇空腹胰岛素(FIN)水平、OGTT血糖水平;采用改良Miller法抽提受检者全血DNA,以聚合酶链反应及基因测序方法计算MTNR1B-rs4753426位点基因型和等位基因频率;比较两组孕妇基因型频率、等位基因频率、空腹血糖(FPG)水平、FIN水平、BMI以及稳态模型评估的胰岛素抵抗指数(HOMA-IR)和胰岛β细胞功能指数(HOMA-β)的差异。结果 GDM组孕妇FPG、FIN水平及HOMA-IR高于对照组,差异有显著性(t=2.518～6.074,P<0.05);HOMA-β则较对照组显著降低,差异有显著性(t=18.391,P<0.05)。两组间MTNR1B-rs4753426基因型频率与等位基因频率比较,差异均有显著性(χ2=9.342、5.285,P<0.05)。结论 MTNR1B-rs4753426位点SNP可能与GDM发病相关,C等位基因可能是GDM的易感基因。     

老年性痴呆相关基因nicastrin启动子区单核苷酸多态性分析

【目的】分析老年性痴呆(Alzheimer病)相关基因nicastrin启动子区单核苷酸多态性(SNP),探讨其基因表达可能的分子调控机制。【方法】扩增nicastrin基因ATG上游约1.0kp启动子区DNA片段,与萤火虫荧光素酶报告基因载体pGL3-Basic进行重组质粒的克隆与鉴定,确立启动子区候选功能SNP及其相应位点结合的转录调节因子。应用Lipofectamine 2000对包含功能SNP的重组质粒进行CRL-2137细胞瞬时转染,双荧光素酶相对活性分析及电泳迁移率变动分析。【结果】Nicastrin基因启动子区960 bp DNA片段内存在功能SNP_rs10752637-922 G→T,与其相应位点结合的转录因子为hepatic leukemia factor(HLF),SNP_rs10752637-922 T的序列结构对启动萤火虫荧光素酶报告基因的表达功能较SNP_rs10752637 -922 G的序列结构强(P<0.05,n=3)。【结论】Nicastrin基因核心启动子应该在960 bp DNA片段内,SNP_rs10752637-922 G→T可能是启动子区有功能位点突变,包含rs10752637-922 G/T的核苷酸序列结构可能通过与HLF在内的转录调节因子的作用来实现对nicastrin基因表达差异的调控。     

老年性痴呆相关基因nicastrin启动子区单核苷酸多态性分析

【目的】分析老年性痴呆（Alzheimer病）相关基因nicastrin启动子区单核苷酸多态性（SNP）,探讨其基因表达可能的分子调控机制。【方法】扩增nicastrin基因ATG上游约1.0kp启动子区DNA片段,与萤火虫荧光素酶报告基因载体pGL3-Basic进行重组质粒的克隆与鉴定,确立启动子区候选功能SNP及其相应位点结合的转录调节因子。应用Lipofectamine 2000对包含功能SNP的重组质粒进行CRL-2137细胞瞬时转染,双荧光素酶相对活性分析及电泳迁移率变动分析。【结果】Nicastrin基因启动子区960 bp DNA片段内存在功能SNP_rs10752637-922 G→T,与其相应位点结合的转录因子为hepatic leukemia factor（HLF）,SNP_rs10752637-922 T的序列结构对启动萤火虫荧光素酶报告基因的表达功能较SNP_rs10752637 -922 G的序列结构强（P〈0.05,n=3）。【结论】Nicastrin基因核心启动子应该在960 bp DNA片段内,SNP_rs10752637-922 G→T可能是启动子区有功能位点突变,包含rs10752637-922 G/T的核苷酸序列结构可能通过与HLF在内的转录调节因子的作用来实现对nicastrin基因表达差异的调控。     

xCT基因rs13120371位点单核苷酸多态性与肺结核易感性的相关性

目的 通过大样本病例与对照研究明确xCT基因功能性SNP与结核病易感性的相关性,明确其调控结核病发生发展的分子机制。方法 从健康对照和结核患者的全血样本中提取基因组DNA,采用TaqMan探针技术对xCT基因rs13120371位点进行基因分型并对基因频率进行关联性分析,结核菌特异性抗原IFN-γ斑点形成细胞的数量和放射影像学分数反应不同基因型与临床指标的相关性,Real-time PCR方法检测健康对照和结核患者外周血单个核细胞中xCT基因及其相关的CXCL1、CXCL2、IL1B基因的表达水平。结果 等位基因位点基因频率分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(χ²=0.678,P>0.05),选择的样本具有群体代表性。rs13120371位点的单核苷酸多态性与结核病的易感性相关,其中结核患者组等位基因A的基因频率为70.2%,等位基因G的基因频率为29.8%;健康对照组等位基因A的基因频率为66.8%,等位基因G的基因频率为33.2%,两组之间的等率基因频率差异具有统计学意义(P=0.02,OR=0.86)。AA基因型患者的结核菌特异性刺激分泌的IFN-r斑点形成细胞数量及炎症反应指标明显高于基因型GG的患者,基因型AA的细胞xCT基因的表达水平也明显上调。结论 xCT基因rs13120371位点的单核苷酸多态性与汉族人群结核感染的易感性相关,并且rs13120371位点是功能性SNP,等位基因A可能增加结核菌感染的风险。     

MnSOD基因单核苷酸多态性位点rs4880与广东鼻咽癌的相关性

摘要：目的研究MnSOD单核苷酸多态性位点rs4880与广东鼻咽癌发生风险的关系。方法选择105例经病理证实的鼻咽癌患
者为病例组,136例同期经南方医院查体中心证实的健康体检者为对照组,应用PCR法检测MnSOD基因Ala-9Val的多态性分
布,比较不同基因型与鼻咽癌的相关关系。结果中国汉族广东人Ala携带者占19.1%。病例组和对照组3种基因型Val/Val、
Val/Ala、Ala/Ala的频率分别为83.8%、14.3%、1.9%和80.9%、16.9%、2.2%,各基因型在两组间分布无显著性差异。基因型Val/
Ala与鼻咽癌的淋巴结转移显著相关（OR=0.308,95%CI=0.095-0.996）,进一步年龄分层,这种杂合子与肿瘤淋巴结转移的关系
在年长人群（>30岁）中同样存在（OR=0.227,95%CI=0.064-0.804）,但在年青人群（≤30岁）中不存在,然而等位基因Ala的分布
与淋巴结转移无显著关系（OR=1.987,95%CI=0.707-5.583）。各基因型在不同T、M、临床分期和病理分型的鼻咽癌患者的等位
基因表达频率均无明显差异。结论MnSOD基因Ala-9Val多态性可能与地域、种族相关;基因型Val/Ala可能与鼻咽癌淋巴结
转移有关,各基因型与广东地区鼻咽癌易感性无明显相关。
     

高尿酸血症患者URAT1基因rs524023位点多态性检测及临床意义

目的 检测高尿酸血症(HUA)患者人尿酸盐转运子(URAT1)基因rs524023位点多态性并探讨其临床意义。方法 将2019年3月至2021年4月在上海市宝山区罗店医院进行健康体检的200例体检者纳入研究,详细记录所有体检者的一般资料,采集其血液样本检测血生化指标和URAT1基因rs524023位点多态性。依据是否合并HUA分为合并HUA组47例和不合并HUA组153例,比较两组受检者的临床资料、URAT1基因rs524023位点等位基因和基因型频率分布,采用多因素Logistic回归分析URAT1基因rs524023位点多态性和HUA影响因素的交互作用。结果 合并HUA组和未合并HUA组受检者在年龄、体质量指数(BMI)、血尿酸(SUA)、肌酐(Scr)、血尿素氮(BUN)、甘油三酯(TG)和肾小球滤过率(eGFR)水平方面比较差异均有统计学意义(P<0.05);在URAT1基因rs524023位点上,合并HUA组和未合并HUA组受检者的等位基因C、T的频率分别为27.66%、72.34%vs 41.83%、58.17%,基因型CC、TC、TT的频率分别10.64%、51.0...     

TRAIL基因启动子区单核苷酸多态性与脂肪肝的相关性

目的探讨中国山东汉族人群肿瘤坏死因子凋亡相关诱导配体（Tumor necrosis factor(TNF) related apoptosis inducing ligand, TRAIL）基因启动子区单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)与脂肪肝（FLD）的相关性。方法采用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性（PCR RFLP）分析和四引物法聚合酶链反应（Tetra primer ARMS PCR）的方法检测了42例非酒精性脂肪肝、67例酒精性脂肪肝和132例健康对照者的TRAIL基因启动子区单核苷酸多态性位点-707C/T、-665T/C、-621C/T和-597A/G的基因型,计算相应的基因型频率及等位基因频率,进行χ2检验。结果-707C/T、-665T/C和-597A/G位点在中国山东汉族人群中未检测到单核苷酸多态性;-621C/T位点在中国山东汉族人群中存在单核苷酸多态性,且该位点CC/CT/TT基因型频率在非酒精性脂肪肝、酒精性脂肪肝以及正常对照组中分别为0.238/0.500/0.262、0.269/0.448/0.284和0.280/0.394/0.326。但该位点的基因型频率和等位基因频率在三组之间均没有统计学差异。结论在中国山东汉族人群中,仅检测到TRAIL基因启动子区-621C/T位点的单核苷酸多态性,该多态性与脂肪肝的易感性没有统计学差异(P＞0.05)。     

IL-18单核苷酸多态性rs1946519和rs360718与宫颈癌的关系

目的 探讨IL-18基因单核苷酸多态性rs1946519和rs360718与宫颈癌关系,为研究宫颈癌患病风险奠定基础.方法 常规方法对107例原发性宫颈癌患者和80名正常人群外周血进行基因组DNA抽提,并自行设计引物和探针,用等位基因特异性杂交技术对IL-18基因rs360718和rs1946519位点进行TaqMan探针荧光定量PCR分型,应用x2检验统计分析病例组和对照组等位基因频率、等位基因型频率及其患病风险.结果 宫颈癌患者组与对照组IL-18 rs360718TT和GT基因型频率及其G和T等位基因频率比较无显著性差异(P＞0.05);而宫颈癌患者组与对照组IL-18 rs1946519AA、AC和CC基因型频率及A和C等位基因频率差异显著(P＜0.05),AC和CC基因型及C等位基因的患病风险分别为2.883,2.750和1.611.宫颈癌与正常人群中IL-18 rs1946519和rs360718位点有6种基因型,比较发现AC TT基因型频率较正常对照组高,有显著性差异(P＜0.05).结论 IL-18 rs360718等位基因变异与宫颈癌的易感性无关;IL-18rs1946519与宫颈癌的发生有密切关系,具有AC TT基因型的人发生宫颈癌的危险性相对较高.     

醌氧化还原酶1基因多态性与术后认知障碍遗传易感性的关系

目的 探讨烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸:醌氧化还原酶1(NQO1)基因的多态性与术后认知障碍(POCD)的关系.方法 选择择期硬膜外麻醉下行髋关节置换手术患者90例,年龄在59～78岁,术前及术后第7天对患者进行神经心理学测试,根据测试结果分为POCD组与对照组,每组分别取45例行NQO1基因609位点测定.取患者肘静脉血行实时定量PCR,结合特定的Taqman探针基因分型技术,分析NQO1基因多态性(C609T)在对照组和POCD组的分布差异.结果 对照组中有5个样品所提基因组DNA由于质量问题不用于Real-time PCR及后续分析.C/C基因型在对照组中出现频率为30.0%,高于POCD组的11.1%,差异具有显著性(OR=0.292,95%CI 0.092～0.921,P＜0.05);而C/T+T/T基因型个体在POCD组中为88.8%,高于对照组的70%,出现POCD的危险性升高至3.42倍(OR=3.42,95%CI1.08～10.82,P＜0.05).C等位基因在对照组染色体出现频率为56.2%,高于POCD组的40.0%,差异具有显著性(OR=0.519,95%CI 0.282～0.955,P＜0.05);T等位基因在对照组染色体出现频率为43.7%,低于POCD组的60.0%,差异具有显著性(OR=1.93,95%CI 1.047～3.552,P＜0.05).结论 NQO1基因的C609T位点多态性与POCD的遗传易感性密切相关.     

亚甲基四氢叶酸还原酶基因rs1801133位点多态性与肺癌发生风险的关联分析

目的 探讨亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）基因rs1801133位点多态性与肺癌发生风险的相关性。方法 采用病例-对照研究设计,纳入上海市及江苏省泰州地区肺癌患者974例和健康对照1 005例作为研究对象,采集研究对象外周血液后提取全血基因组DNA进行MTHFR基因rs1801133位点基因分型,用非条件logistic回归分析评估该位点单核苷酸多态性与肺癌发生风险的相关性。结果 总人群中MTHFR基因rs1801133位点CT基因型与TT基因型个体肺癌的发生风险均低于CC基因型个体[比值比（OR）=0.801,95%置信区间（CI）：0.651~0.985,P=0.035;OR=0.754,95%CI：0.582~0.975,P=0.032],但经年龄、性别、吸烟状况和恶性肿瘤家族史校正后差异无统计学意义（校正后OR=0.841,95%CI：0.677~1.045,P=0.118;OR=0.799,95%CI：0.609~1.047,P=0.104）。校正后分层分析结果显示,在显性模型中CT+TT基因型男性和恶性肿瘤家族史阳性者肺癌发生风险均较CC基因型对应人群降低（OR=0.764,95%CI：0.597~0.977,P=0.032;OR=0.600,95%CI：0.385~0.925,P=0.022）,CT+TT基因型人群发生肺鳞状细胞癌的风险较CC基因型人群降低（OR=0.727,95%CI：0.542~0.976,P=0.033）。结论 MTHFR基因rs1801133位点C>T突变降低了男性和恶性肿瘤家族史阳性者肺癌的发生风险,尤其是鳞状细胞癌的患病风险。     

A single nucleotide polymorphism in XRCC4 gene is associated with reduced colorectal cancer susceptibility in female

Objective:To investigate the association of XRCC4 polymorphic variants at G-1394T(rs6869366) with colorectal cancer susceptibility.Methods:In this hospital-based case-control study,the association of XRCC4 polymorphism with colorectal cancer risk in Chinese population was investigated.In total,171 patients with colorectal cancer and 171 healthy individuals matched for age and gender were selected.The genomic DNAs of the patients and controls were extracted from peripheral blood and the 300 bp target DNA was...     

成纤维细胞生长因子受体2基因rs1219648位点多态性与青海回族女性乳腺癌易感性的关联研究

目的  探究成纤维细胞生长因子受体2（FGFR2）基因rs1219648位点单核苷酸多态性（SNP）与青海地区回族女性乳腺癌易感性的关系。方法  采用病例对照研究,利用TaqMan-MGB探针法对青海地区110例回族女性乳腺癌病例和110例正常回族女性对照进行FGFR2基因rs1219648位点基因型检测,利用多元Logistic回归分析该位点不同基因型与乳腺癌易感性之间的关系。结果  FGFR2基因rs1219648位点基因型频率在病例组和对照组之间的差异具有统计学意义（P =0.001）。FGFR2基因rs1219648位点A >G改变可以显著的增加青海地区回族女性人群乳腺癌易感性。其中,在校正初潮年龄、是否绝经、乳腺良性疾病史和乳腺癌家族史因素后,该位点A >G的改变仍可以显著增加该地区回族女性人群乳腺癌患病风险（■AG-GG/AA= 2.37,95%CI：1.18,4.73）。结论  FGFR2基因rs1219648位点A >G改变可显著增加青海地区回族女性乳腺癌的患病风险,预期可以作为该地区女性乳腺癌易感性的重要生物标志物。

     

端粒酶逆转录酶基因单核苷酸部分位点多态性可能增加罹患肝癌和肝癌转移的风险

目的本研究拟通过对原发性肝癌及肝癌转移患者hTERT单核苷酸多态性的分布进行调查,探索其在肝癌转移中的潜在作用。方法选取全血样本和血清样本,290例男性样本诊断明确,分组如下,原发性肝癌组162例,原发性肝癌合并转移组22例,对照组106例。采用美国Beckman公司的超高通量液相芯片SNP基因分型系统SNPStream进行测定对基因进行分型。结果 rs2853690和rs10069690两个位点具有统计学差异。等位基因频率分析中,rs10069690和rs6554743 C和T等位基因间存在统计学差异。rs10069690在等位基因频率和携带率分析中具有统计学差异,在肝癌和肝癌转移中比例较高。结论本研究发现hTERT部分位点多态性可能增加罹患肝癌和肝癌转移的风险,为肝癌发病和转移机制提供一定的理论依据。     

SNAPC3 gene rs12093 polymorphism is significantly associated with ischemic stroke wind syndrome

Objective: To investigate whether The small nuclear RNA activating complex polypeptide 3 (SNAPC3) gene rs12093 polymorphism is associated with ischemic stroke (IS) and Traditional Chinese Medicine (TCM) syndromes of IS. Methods: This study enrolled 774 patients with ischemic stroke (IS) and 793 normal controls. Massarray technology was used for genotyping. And genetic association analysis was estimated by PLINK program. Results: ①SNAPC3 gene rs12093 polymorphism was significantly associated with the risk of ischemic stroke wind syndrome of IS [OR=0.76, 95％CI(0.58-0.99), P=0.047 in dominant model)]. ②After adjusting age and gender, SNAPC3 gene rs12093 polymorphism and the score of ischemic stroke wind syndrome(Padj=0.037 in additive model;Padj=0.009 in recessive model), the correlation is statistically significant. ③After adjusting age and gender, platelet (PLT) (Padj=0.024 in addiction model; Padj=0.039 in dominant model)and thrombin time(TT)(Padj=0.042 in dominant model) were significantly associated with rs12093 polymorphism in patients with ischemic stroke wind syndrome. Conclusion: SNAPC3 gene rs12093 polymorphism may affect the occurrence of ischemic stroke wind syndrome.     

Prostasin gene polymorphism at rs12597511 is associated with severe preeclampsia in Chinese Han women

Background Preeclampsia,characterized by hypertension and proteinuria,is a multifactorial disease associated with shallow invasion of trophoblast cells and inadequate spiral artery remodeling.Trophoblast and tumor cells have similar invasion mechanism.Prostasin is closely related to tumor development,invasion and metastasis and influences blood pressure through activating epithelial sodium channel.The effect of prostasin on the pathogenesis of preeclampsia remains unclear.This study investigated the association of prostasin gene at rs12597511 with severe preeclampsia.Methods A single nucleotide polymorphism,rs12597511,was tested with polymerase chain reaction and restrictionfragment length polymorphism analyses in 179 severe preeclampsia patients and 222 normal pregnant women.Results The frequencies of TC ＋ CC genotypes were significantly higher in severe preeclampsia group compared with in control group （the adjusted odds ratio was 2.030,95% confidence interval 1.195-3.449,P=0.009）.The C allele of rs12597511 was present significantly more often among women with severe preeclampsia （P=0.001）.Genotyping analysis showed that the C allele of rs12597511 could confer a risk for severe preeclampsia.Conclusion The higher frequency of C allele of prostasin gene at rs12597511 is associated with severe preeclampsia.