SARI及CCN1基因在结直肠癌中的表达及其意义

目的 探讨SARI及其下游CCN1基因表达与结直肠癌发生、发展的关系及对预后的影响。方法 实时定量PCR检测32例冻存新鲜结直肠癌及癌旁组织SARI、CCNl mRNA表达,逆转录PCR检测人结直肠癌细胞株（Caco-2、HT-29、Lovo）SARI、CCNl mRNA表达。免疫组织化学法检测116例结直肠癌根治切除标本癌及癌旁组织SARI、CCN1蛋白表达。对SARI、CCN1蛋白表达进行关联分析,并分析其与结直肠癌临床病理特征的关系。分析SARI、CCN1蛋白表达水平对患者预后的影响。结果 癌组织中SARI mRNA表达下调,而CCN1 mRNA表达上调（均P＜0.05）,在癌细胞株中二者表达趋势与在组织中一致。癌旁组织和癌组织SARI蛋白阳性表达率分别为76. 7％和28.4％,CCN1蛋白阳性表达率分别为26. 7％和74.1％,差异均有统计学意义（均P＜0.05）;癌组织中SARI蛋白表达与CCN1蛋白表达呈负相关（r= -0.24,P＜0.05）。SARI蛋白阴性表达者肿瘤分化程度差、浸润深度深及TNM分期高（均P＜0. 05）;CCN1蛋白阳性表达者,肿瘤浸润深度深且TNM分期高（均P＜0.05）。SARI蛋白阴性表达者,患者术后生存时间明显缩短(X2=8.47,P＜0.05),SARI蛋白阴性且同时CCN1蛋白阳性表达者,患者术后生存时间进一步缩短(X2=12.56,P＜0.05)。结论 SARI与CCN1异常表达与结直肠癌恶性生物学行为有关,且SARI蛋白阴性表达与结直肠癌患者不良预后有关。     

基于GEO数据库探究结直肠肿瘤相关基因及其功能

目的 利用生物信息学分析方法,结合GEO数据库,探讨获取结直肠肿瘤关键基因的差异表达情况。方法 使用GEO数据库分析结直肠肿瘤患者的肿瘤组织和正常组织基因表达数据,使用GEO2R筛选差异表达基因(differential expression genes, DEGs),利用David数据库对DEG进行基因本体论(gene ontology, GO)富集分析,获得DEG的分子功能、细胞组分和生物过程结果,利用基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)获取差异基因在疾病状态下的信号通路信息,构建差异基因间蛋白质相互作用网络,并使用Cytoscape软件对网络中的关键节点进行拓扑分析,筛选出结直肠肿瘤患者发生过程中的关键基因。结果 通过对GSE21510数据集的生物信息学分析,共鉴定到664个DEGs,其中结直肠肿瘤患者高表达基因234个,低表达基因430个。这些DEGs主要参与细胞分裂、RNA聚合酶II启动子转录正和负调控等生物过程,同时参与细胞核、胞质、细胞质、核浆、细胞膜等细胞成分组成,并参与蛋白质绑定、ATP绑定等分子...     

敲减TLR2基因对结直肠癌细胞增殖的抑制作用及其机制

目的：应用慢病毒RNA干扰技术敲减结直肠癌细胞中Toll样受体2（TLR2）基因,探讨其对结直肠癌细胞增殖的作用,并阐明其作用机制。方法：将处于对数生长期的结直肠癌HCT116细胞和HT29细胞分为未感染对照组、阴性对照组及基因敲减组（TLR2-RNAi组）,分别给予无慢病毒感染、慢病毒RNAi及慢病毒TLR2-RNAi稳定转染。感染后采用蛋白印迹法检测各组细胞中TLR2蛋白表达水平,采用CCK-8法和流式细胞术检测各组细胞增殖活性及不同细胞周期细胞百分率,蛋白印迹法检测各组细胞中磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶（PI3K/Akt）和核因子κB（NF-κB）细胞信号通路相关蛋白及细胞周期相关蛋白cyclin D1、cyclin D3蛋白表达水平。结果：与未感染对照组和阴性对照组比较,TLR2-RNAi组HCT116细胞和HT29细胞中TLR2蛋白表达水平明显降低（P<0.01）。与未感染对照组和阴性对照组比较,TLR2-RNAi组HCT116细胞和HT29细胞增殖活性明显降低（P<0.05）,S期和G₂期细胞百分率明显降低（P<0.05）,G₁期细胞百分率明显升高（P<0.05）。与未感染对照组和阴性对照组比较,TLR2-RNAi组HCT116细胞和HT29细胞中PI3K、p-Akt、p-NF-κβ、cyclin D1和cyclin D3蛋白表达水平明显降低（P<0.01）。结论：敲减TLR2基因可以通过调控PI3K/Akt和NF-κB细胞信号通路及细胞周期相关蛋白cyclin D1和cyclin D3的表达而抑制结直肠癌细胞的增殖。     

结直肠癌ZIC1和KLOTHO基因启动子甲基化检测的临床价值初探

目的:观测ZIC1和KLOTHO基因在结直肠癌组织中的表达情况,探讨检测ZIC1和KLOTHO基因启动子甲基化在结直肠癌临床诊断中的价值.方法:选取25对(包括癌和癌旁组织)结直肠癌患者手术标本组织,通过实时荧光定量RT-PCR检测ZIC1和KLOTHO mRNA在结直肠癌和癌旁相对正常组织中的表达;通过甲基化特异性PCR(MSP)检测结直肠癌和癌旁相对正常组织中ZIC1和KLOTHO基因启动子甲基化阳性率,并分析其与结直肠癌患者临床病理资料(年龄,性别,分化程度和TNM分期)的关系.结杲:ZIC1和KLOTHO mRNA在结直肠癌组织中表达较正常组织明显下调(P均<0.0001);在25例结直肠癌患者癌组织中,ZIC1甲基化阳性率为80%,KLOTHO甲基化阳性率为76%,联合检测ZIC1和KLOTHO甲基化阳性率为64%.结论:ZIC1和KLOTHO基因在结直肠癌中表达下调,肿瘤组织基因启动子甲基化高频率发生,联合检测ZIC1和KLOTHO基因甲基化有助于结直肠癌的诊断.     

KAI-1和nm23-H1的表达与结直肠癌侵袭转移的关系研究

目的 检测结直肠癌组织中KAI-1、nm23-H1基因及蛋白的表达,探讨其在结直肠癌浸润转移中的作用及临床意义.方法 以45例结直肠癌手术标本为研究对象,分别采用荧光实时定量PCR和免疫组织化学方法检测肿瘤组织和切端组织中KAI-1、nm23-H1的mRNA及蛋白表达水平,并结合临床病理资料进行统计学分析.结果 结直肠癌组织中KAI-1和nm23-H1的mRNA表达水平及蛋白表达阳性率均显著低于切端组织,差异有统计学意义(P＜0.01);淋巴结转移者KAI-1、nm23-H1的mRNA表达水平及蛋白表达阳性率均显著低于不伴淋巴结转移者,且二者会随着浸润深度及Dukes分期的增加而表达下降,差异有统计学意义(P＜0.01).结直肠癌组织中KAI-1 mRNA的表达均与nm23-H1的表达呈正相关(rs值分别为0.583和0.327,P＜0.05).结论 KAI-1和nm23-H1低表达均与结直肠癌的侵袭转移有关,联合检测这两项指标有助于指导临床治疗和预测肿瘤进展.     

结直肠癌相关基因的研究进展

结直肠癌是人类消化道最常见的恶性肿瘤之一,在全球范围内结直肠癌每年新发病例大约100万,死亡病例约50万[1].随着生活水平的不断提高,饮食习惯的改变,我国结直肠癌的发病率也逐年增高.目前,普遍认为结直肠癌发病是一个多基因、多步骤的复杂过程,涉及多个癌基因激活和抑癌基因失活.现将与结直肠癌发生发展密切相关的基因综述如下.     

RhoA基因在结直肠癌组织中的表达

目的：研究RhoA基因mRNA在结直肠癌中的表达,方法：建立测定RhoA基因mRNA表达的逆转录聚合酶链反应（RT－PCR）最适条件,在半定量水平测定42例结、直肠癌手术标本正常粘膜组织、癌组织的RhoA基因mRNA表达的相对分子,探讨与临床病理学指标的关系。结果：42例结、直肠癌中RhoA基因表达较相应正常粘膜组织,差异有非常显著意义（P＜0．01）。以42例肿瘤与正常粘膜表达量比值平均值为界,将患者分为过度表达组和高表达组,过度表达组中淋巴结转移发生率较高,肿瘤分期较晚（P＜0．05）。结论：RhoA基因在结、直癌进展中起重要作用,并可能与结直肠癌浸润和转移相关。     

结直肠癌和p53基因

结直肠癌和ｐ５３基因田文，张国华，谷志远抑癌基因的发现使人们对肿瘤的认识进入了一个新水平。癌症实质上是由一些基因突变引起的。这些突变基因分为两类：一类是癌基因，其突变和过度表达都是致癌的；另一类就是抑癌基因，其作用是抑致肿瘤形成，但如果发生突变和缺失...     

肿瘤干细胞调节基因Hes1在结直肠癌中的表达及其临床意义

目的 探讨肿瘤干细胞调节基因发状分裂相关增强子1( Hes1)在结直肠癌中的表达及其临床病理特征与肿瘤预后之间的关系.方法 前瞻性收集2004年8月至2006年9月,在南京中医药大学第三附属医院全国肛肠医疗中心行手术治疗的结直肠癌患者,146例结直肠癌患者建立队列,男84例(57.5％)、女62例(42.5％),平均年龄(61±11)岁.对患者肿瘤标本建立组织芯片并采用免疫组织化学方法检测Hes1基因表达,对患者随访并对相关资料进行统计学处理.结果 在146例结直肠癌标本中,Hes1阴性或弱阳性表达占8％ (12/146),阳性(+)为77％ (112/146),而阳性(++)为15％ (22/146);单因素分析结果显示Hes1基因表达与分化程度有关(P =0.033).134例成功随方,随访率91.8％,平均随访时间(42±13)个月,以Kaplan-Meier生存曲线估计该组患者总1年生存率93％ (136/146)、总3年生存率74％( 108/146)、总5年生存率67％ (98/146).肿瘤的预后与TNM分期和病理学类型均相关(均P=0.000),与Hes1基因表达不相关(P =0.267).结论 肿瘤于细胞调节基因Hes1表达与分化程度有关,多因素分析显示Hes1与生存不相关.     

结直肠癌早期检测的基因标志物

研究表明,肿瘤的发生和发展与癌基因和抑癌基因有着密不可分的关系.随着分子生物学理论和技术的发展,对癌基因和抑癌基因的检测已成为肿瘤临床预警和诊断的重要途径.自Fearon和Vogelstein 1990年提出结直肠癌发生的分子模型以来,结直肠癌发病的分子机制不断被阐明,通过对与结直肠癌相关的基因改变的检测可以为结直肠癌早期预警提供帮助.尤其是对具有家族病史的人进行相关基因改变的检测,检出率已经达到相当高的水平.本文对近年来被认为与结直肠癌相关的基因作一综述.     

RNF2在结直肠癌中的表达及其对结直肠癌细胞生物学行为的影响

目的 探讨环指蛋白2（RNF2）在结直肠癌中的表达及其对结直肠癌细胞生物学行为的影响。方法 采用免疫组织化学法检测RNF2在结直肠癌组织和癌旁正常组织中的表达，并利用过表达的慢病毒转染HCT116细胞构建过表达RNF2的HCT116细胞系，通过CCK-8法、划痕实验、Transwell实验检测过表达RNF2对结直肠癌细胞增殖、迁移、侵袭等生物学行为的影响。结果 结直肠癌组织中RNF2阳性表达率高于癌旁正常组织（P <0.05）；不同年龄、组织学类型、分化程度、Dukes分期、淋巴结转移的结直肠癌患者的RNF2表达阳性率比较，差异有统计学意义（P <0.05）；HCT116组、HCT116-control组、HCT116-RNF2组HCT116细胞增殖、迁移能力及侵袭能力比较，差异有统计学意义（P <0.05）；HCT116-RNF2组细胞增殖速度、迁移能力及侵袭能力均高于HCT116-control组和HCT116组（P <0.05）。结论 RNF2在结直肠癌中呈高表达，且过表达RNF2可促进结直肠癌细胞迁移、增殖、侵袭能力，可为结直肠癌治疗提供新的治疗靶点。     

宫颈癌相关基因的筛选及生物信息学分析

目的 从分子水平揭示官颈癌的发病机制,为临床诊疗提供新工具.方法 在公共基因芯片数据库GEO中找到宫颈癌的相关基因芯片数据,使用BRB-ArrayTools软件包对其进行统计学分析,找到官颈癌相关基因;利用Panther在线分析软件对这些基因进行生物学分析.结果 在宫颈癌组织共找到37条差异表达基因,上调23条,下调14条.这些基因的功能大致分为细胞骨架结构、转运载体、细胞信号转导、转录调控、细胞粘附、细胞凋亡等.结论 利用生物信息学的方法 能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息,官颈癌的发生是由于多种基因表达改变所致,为确定宫颈癌的早期诊断标志与新治疗靶位开辟了新的思路.     

基于生物信息学方法筛选结直肠癌转移的相关基因

目的：　应用生物信息学对基因芯片数据进行分析,探讨结直肠癌的转移机制,寻找潜在的转移及预后标记物。方法：　从GEO数据库选取GSE41568、GSE68468进行分析,使用R语言limma包筛选结直肠原发癌与转移瘤之间的差异基因,获得2个数据集的共同差异基因;运用clusterProfiler包进行功能富集分析并进行可视化;通过STRING数据库、Cytoscape软件进行蛋白质互作网络分析及关键模块的筛选;使用TCGA数据库的结直肠癌数据对差异基因进行表达分析和生存分析。结果：　共筛选出108个共同差异基因;通过基因富集分析发现,差异基因主要富集在补体及凝血级联等通路及生物学过程中;通过蛋白质互作网络分析发现3个关键模块;基于TCGA数据对共同差异基因分析发现,CLCA1、COLEC11、FCGBP、PDZD2、SERPINA1、SPINK4共6个基因在Ⅰ-Ⅱ和Ⅲ-Ⅳ期结直肠癌的表达有显著差异（P<0.05）,并且与结直肠癌的预后显著相关（P<0.05）。结论：　通过生物信息学筛选出108个共同差异基因及3个关键模块,并得到6个预后相关基因,为研究结直肠癌的转移机制及预后、靶向治疗提供了一定的理论支持。     

大肠癌中Pokemon的表达及其临床意义

目的:探讨原癌基因Pokemon(POK erythroid myeloid ontogenic)在大肠癌组织中的表达及其与临床特征之间的关系.方法:采用逆转录酶聚合酶链反应(RT-PCR)方法检测47例大肠癌患者癌、癌旁组织、癌以远大肠组织中Pokemon mRNA的表达水平,分析其与临床特征之间的关系;采用免疫组化ABC法检测53例大肠癌组织中Pokemon蛋白的表达,结合随访资料分析其与患者生存时间的关系.结果:大肠癌癌组织和癌旁组织中Pokemon mRNA水平显著高于正常大肠组织(P<0.05),而癌与癌旁组织中的表达无显著性差异;Pokemon mRNA的表达水平与大肠癌Dukes分期、分化程度及淋巴结转移相关(P<0.05),而与患者的性别、年龄、吸烟、饮酒、肿瘤位置、大小及浸润深度无关;Pokemon表达阴性的大肠癌患者存活率明显高于阳性表达患者(P<0.05).结论:Poke-mon在大肠癌和癌旁组织中高表达,并对大肠癌的预后评价有重要意义,且可能成为大肠癌治疗中有效的新的靶基因.     

利用全基因组寡核苷酸筛选大肠癌差异表达基因

目的 筛查人大肠癌组织与相应正常大肠粘膜差异表达基因。方法 应用美国AffymetrixHG-U133寡核苷酸芯片(代表迄今所知的32264个人类全基因,包括19308个已知的人类基因和12956个EST簇)检测9例大肠癌组织及相应正常大肠粘膜基因表达谱,并以实时荧光定量PCR技术对基因芯片检测结果进行验证;综合运用交集补集、秩和检验及t检验比较两组表达谱数据。结果 获得大肠癌组织与正常大肠粘膜组织差异表达基因和ESTs3125个(包括肿瘤上调基因ESTs974个、下调基因ESTs2151个);大肠癌组织表达而相应正常粘膜不表达的ESTs245个;大肠癌组织不表达而正常粘膜表达的ESTs162个;最重要的大肠癌差异表达基因ESTs17个。本研究所筛得之大肠癌差异表达基因80.1%未见报道。结论 综合运用交集补集分析、t检验、秩和检验对基因谱数据进行挖掘的策略,可为寻找大肠癌分子标记物和从整体上探讨大肠癌发生的分子机制奠定基础。     

利用全基因组寡核苷酸筛选大肠癌差异表达基因

目的筛查人大肠癌组织与相应正常大肠粘膜差异表达基因。方法应用美国AffymetrixHG—U133寡核苷酸芯片（代表迄今所知的32264个人类全基因．包括19308个已知的人类基因和12956个EST簇）检测9例大肠癌组织及相应正常大肠粘膜基因表达谱，并以实时荧光定量PCR技术对基因芯片检测结果进行验证；综合运用交集补集、秩和检验及t检验比较两组表达谱数据结果获得大肠癌组织与正常大肠粘膜组织差异表达基因和ESTs3125个（包括肿瘤上调基因ESTs974个、下调基因ESTs2151个）；大肠癌组织表达而相应正常粘膜不表达的ESTs245个：大肠癌组织不表达而正常粘膜表达的ESTs162个；最重要的大肠癌差异表达基因ESTs17个。本研究所筛得之大肠癌差异表达基因80．1％未见报道。结论综合运用交集补集分析、t检验、秩和检验对基因谱数据进行挖掘的策略，可为寻找大肠癌分子标记物和从整体上探讨大肠癌发生的分子机制奠定基础。     

circRNA作为ceRNA在结直肠癌中的研究进展

环状RNA(circRNA)是由前体mRNA反向剪接而产生的共价闭合RNA分子,在疾病中发挥着重要的调控作用。circRNA有潜力成为新型生物标志物,在肿瘤早期诊断、治疗和预后方面发挥重要作用。circRNA可以作为竞争性内源RNA(ceRNA),通过与miRNA相互作用,进而参与基因的转录后调控。本文重点概述了circRNA作为ceRNA调控结直肠癌发生发展的机制,以求能为结直肠癌的诊断与治疗拓展新视野。     

大肠癌组织中p53蛋白和MAD2蛋白表达及意义

目的研究大肠癌组织中p53、MAD2基因的表达及意义.方法应用免疫组化SP方法检测40例大肠癌组织中基因p53、MAD2的表达.结果正常黏膜p53表达阴性,腺癌表达率为55%,两者差异有显著性(P＜0.01).正常黏膜中MAD2蛋白表达阳性率为50%,腺癌中MAD2阳性率为85%,两者差异有显著性(P＜0.01),MAD2表达与大肠癌组织分化无关(P＜0.05).结论p53基因突变及MAD2基因异常在大肠癌发生中起重要作用.     

GLI4在结肠癌中的表达及对癌细胞生物学行为的影响

正常分化的细胞主要依靠线粒体的氧化磷酸化为细胞供能,而大多数肿瘤细胞则依赖有氧糖酵解。各种非编码RNA(ncRNA),如微小RNA(miRNA)、长链非编码RNA(lncRNA)和环状RNA(circRNA),已被证明在胃癌糖代谢中发挥潜在作用。本文总结了ncRNA在胃癌糖代谢中的作用及机制,以及在胃癌预后及治疗等方面的临床应用前景。