不同途径感染人群HIV-1亚型分布

目的 了解河北省石家庄市不同感染人群人类免疫缺陷病毒I型(HIV-1)亚型及分布特点。方法 从石家庄市报告的148例HIV-1抗体阳性者抗凝全血中提取前病毒DNA,用套式聚合酶链反应(nested-PCR)扩增病毒膜蛋白(ENV)基因的C2-V3区并进行序列测定,与国际标准参考序列比较确定亚型。结果 148例样品分属8个亚型,45例为欧美B,37例为CRF07-BC,35例为泰国B(B'),25例为CRF01-AE,C和CRF02-AG各2例,CRF03-AB和CRF11-CPX各1例。结论 既往供受血人员和注射吸毒人群感染的HIV-1亚型相对单一,性传播亚型分布较广。     

四川省MSM人群HIV-1原发耐药性分析

目的分析四川省男男同性恋（MSM）人群中未经抗病毒治疗的人类免疫缺陷病毒I型（HIV-1）感染者的耐药突变的流行情况。方法采集成都、绵阳和达州3个地区MSM中未经治疗的HIV-1感染者血样,进行核酸提取、PCR及基因测序,对所得结果登录美国斯坦福大学HIV耐药数据库进行在线分析确定耐药突变情况。结果 77例样本中,11例存在蛋白酶抑制剂次要相关突变,4例存在核苷类逆转录酶抑制剂相关突变,5例存在非核苷类逆转录酶抑制剂相关突变,其中1例潜在耐药。结论四川省MSM中未经治疗的HIV-1感染者少数存在原发耐药相关基因变异,未发现新耐药毒株,原发耐药株仍处于较低流行状态,感染者在抗病毒治疗开始前应定期检测耐药基因突变情况以指导用药。     

湖州市不同感染人群HIV-1流行毒株亚型分析

目的了解湖州市HIV-1型流行毒株的基因型分布情况,为艾滋病防治工作提供科学依据。方法采集204份HIV-1型抗体阳性的全血标本,从样本中提取病毒RNA,采用巢式PCR方法扩增病毒gag基因,对PCR产物进行核苷酸序列测定。应用Clustal W软件对测序结果和HIV分型参考株序列进行多序列比对和分析;使用MEGA 4.0软件进行系统进化分析。结果 204份标本有138份样品扩增出HIV-1的gag基因片段,共存在4种HIV-1亚型和重组型。其中CRF07_BC重组亚型74株(53.62%)、CRF01_AE重组亚型40株(28.99%)、B亚型12株(8.69%)、CRF08_BC重组亚型12株(8.69%)。异性、同性性传播以CRF07_BC和CRF01_AE为主;注射吸毒传播以CRF07_BC为主。结论湖州市不同感染人群中主要存在4种基因亚型,CRF07_BC已成为湖州市不同感染人群中HIV主要流行亚型,重组型毒株占优势,应加强对HIV-1流行毒株亚型变异的监测,及时调整防控策略。     

用BED--CEIA方法估算2010年云南省玉溪市MSM人群HIV-1感染

[目的]用BED—CEIA方法在玉溪市MSM人群艾滋病监测哨点中开展HIV-1新近感染检测,估算新近感染率。[方法]采用横断面调查方法,对玉溪市2010年MSM哨点经过血清学检测确认为HIV-1抗体阳性的样本进行BED-CEIA检测,估算HIV-1年新近感染率。[结果]本研究样本共计105份,检出HIV-1阳性样本13份,完成BED-CEIA检测13份,判为新近感染样本3份。2010年,MSM哨点HIV-1年感染率12．4％,年新近感染率6．67％（95％CI：2．07％~14．18％）。[结论]玉溪市MSMHIV-1年新近感染率远远高于静脉注射吸毒等人群,MSM人群感染HIV-1不容忽视,综合分析、连续监测估算其流行趋势势在必行。     

福建省HIV-1病毒基因亚型分布的研究

目的 了解福建省HIV1各亚型的流行情况,帮助分析其传染来源和判断流行趋势.方法 采集福建省检出的13例HIV1感染者的外周血单核细胞(PBMCs),提取核酸后用套式聚合酶链反应技术进行扩增HIV1膜蛋白(env)基因C2V3区目的核酸片段,应用异源双链泳动分析法(HMA)进行HIV1亚型的分析.结果 13份标本PCR扩增均阳性,亚型分析结果表明福建省存在HIV1B亚型和E亚型.结论 HIV1B亚型和E亚型可能是福建省流行的主要亚型,主要经性途径由境外传入,且经性传播途径在人群中流行.异源双链泳动分析法可作为HIV1分子流行病学分析的筛选技术推广应用.     

中国MSM人群中HIV-1亚型与不同位点耐药突变发生频率的Meta分析

目的 了解我国男男性行为（men who have sex with men, MSM）人群中人类获得性免疫缺陷病毒1型（human immunodeficiency virus type 1,HIV-1）亚型与不同耐药位点突变发生频率的情况。方法 检索CNKI、CBM、万方、PubMed、Web of science、Embase等数据库,收集有关中国MSM人群HIV-1亚型与耐药基因突变的现况调查研究,采用系统评价的方法严格筛选文献,以美国医疗保健研究与质量局（the agency for healthcare research and quality, AHRQ）质量评价条目评价文献质量,对所提取数据采用Freeman-Tukey双反正弦变换法计算各位点合并的耐药突变发生频率,以不同亚型为分组进行亚组分析,采用Begg's test估计发表偏倚,统计分析由Stata 12.0软件完成。结果 共纳入10篇研究文献,获得耐药突变位点信息23个,包含亚型五种（01AE、07BC、08BC、B、URFs）。突变发生频率超过5%的位点有：A71T/V/I 17.42%（8.20~29.17）,V179D/E 11.06%（6.24~17.00）,Y181C/N 11.95%（0.50~35.28）,L10I/V 7.06%（4.14~10.65）, K103N 5.67%（1.75~11.66）。M46I/L、T69D/NS、L74I/S与K103N/R的突变仅在01AE亚型中检测到, B亚型检测出发生突变的位点其突变发生频率均高于其他亚型。结论 我国MSM感染者中01AE亚型携带更多种类的耐药突变相关位点,B亚型耐药相关位点的突变频率更高,上述两种亚型及其耐药突变对传播耐药发生率的贡献度大,需要加强防治。     

广西HIV-1双阳家庭病毒基因亚型及细胞嗜性分析

目的了解广西地区HIV-1双阳家庭的病毒基因亚型分布特征,同时分析env基因V3环序列变异特征及其辅助受体使用情况。方法收集2014—2015年在广西南宁市、柳州市、桂林市、贺州市、钦州市和贵港市共6个市疾病预防控制中心确证为HIV-1感染者的血浆样本,研究对象共来自95个双阳家庭。采用巢式PCR扩增HIV-1 env区基因,利用Sequencher、Bio Edit、Mega软件对序列进行拼接、整理和分析。结果本研究共分析166例HIV-1双阳家庭感染者env基因V3环序列,共发现6种亚型毒株,其中CRF01-AE为146例,构成比最大(87.95%);发现2例非流行重组体(URF)0107亚型;对CRF01-AE、CRF07-BC和CRF08-BC三种亚型的基因距离进行分析,发现其基因离散率相差不大。在HIV-1不同亚型毒株的四种gp120 V3环顶端四肽中,主要以GPGQ为主(85.54%);共有110(66.27%)条序列的毒株被预测为使用CCR5作为辅助受体,56条(33.73%)被预测为使用CXCR4作为辅助受体,没有发现R5/X4双嗜性毒株。结论在广西HIV-1双阳家庭中,流行毒株以CRF01-AE为主;毒株的gp120 V3环顶端四肽以GPGQ为主。广西HIV-1双阳家庭病毒株主要表现为巨噬细胞嗜性的非合胞体诱导型。     

PEIA法检测吸毒人群HIV-1血清亚型分析

目的建立PEIA法检测HIV-1血清亚型,了解吸毒人群HIV-1感染毒株的血清亚型分布特征,为疫苗和诊断试剂的研制、使用提供科学依据。方法问卷调查了解一般情况和HIV-1感染行为;ELISA法检测HIV-1的抗体阳性率,,nested-PCR检测HIV-1 evn基因V3区;PEIA法检测HIV-1血清亚型。结果吸毒人群HIV-1感染率为57.14%,感染因素为静脉共用注射器吸毒和无保护性交。HIV-1毒株血清亚型为C、E、EC混合型,以C亚型为优势亚型,同一个体可能同时感染不同亚型的病毒株或出现重组毒株。除了上述亚型外,还存在其他未能检测出来的亚型。结论PEIA法检测HIV-1血清亚型具有快速、简便的特点。吸毒人群HIV-1毒株亚型表现为多样性,应加强其变异的监测和研究。     

云南省德宏州2011年HIV-1不同亚型人群分布特征分析

目的 研究云南省德宏州HIV-1亚型的流行特点。方法 收集2011年1-5月德宏州HIV-l抗体确认阳性血浆样品300份,提取RNA后用巢式PCR对gag基因和env基因的部分片段进行扩增。扩增产物经基因序列测定,所得序列通过构建系统进化树确定HIV-1的分子亚型。结果 结合2个基因片段,共有222份样品获得分型结果,主要为C亚型(43.2%, 96/222),其他依次为独特重组形式(URF; 27.O%, 60/222)、CRF01_AE(21.2%, 47/222)、CRF08_BC(5.0%, 11/222)、B’(2.3%, 5/222)和CRF07_BC(1.4%, 3/222)。C亚型是性传播人群和注射吸毒人群中的首要亚型,但不同传播途径人群中亚型分布具有不同的模式。异性传播人群包括该地区检测到6种基因型,主要为C亚型(40.7%,70/172)、CRFOI_AE(25.O%, 43/172)和多种URF(25.0%, 43/172),呈现亚型分布的多样化。注射吸毒人群中包括除B''和CRF07_BC以外的3种亚型及多种URF,主要为C亚型(54.8%, 23/42 J和URF(38.1%, 16/42),呈现亚型相对集中的趋势。URF比例的显著上升成为该地区的另一个流行特点,包括BC重组(41.7%, 25/60)和与CRF01 _AE相关的重组(58.3%, 35/60),这两种URF在性传播和注射吸毒人群中分布的差异无统计学意义。结论 德宏州HIV-1流行株较为复杂,存在5种亚型和多种URF．其中C亚型为主要流行株,不同传播途径亚型分布模式存在差异．     

德宏傣族景颇族自治州2017年HIV-1感染者抗病毒治疗前耐药和病毒基因亚型研究

目的 了解德宏傣族景颇族自治州（德宏州）抗病毒治疗（ART）前的HIV-1感染者基因型和耐药株的流行水平。方法 2017年1-6月在德宏州收集初始ART的HIV-1感染者170例,扩增pol基因,进行HIV-1基因分型和基因型耐药分析。结果 147份样品获得了pol基因,通过进化分析,发现12种HIV-1基因型,居于前3位包括C亚型（29.9%,44/147）、独特型重组形式（URFs）（27.2%,40/147）和CRF01_AE（19.7%,29/147）,还检测到了近年该地区新鉴定出的流行重组形式（CRFs）,包括CRF62_BC、CRF64_BC、CRF86_BC和CRF96_cpx。基因型在异性性传播和注射吸毒传播人群中的分布差异有统计学意义。发现耐药突变的比例为8.8%（13/147）。注射吸毒的HIV-1感染者中耐药株的比例（25.0%,8/32）,高于异性性传播的HIV-1感染者（4.6%,5/109）（χ²=10.166,P=0.002）。结论 2017年德宏州初始ART的HIV-1感染者中病毒基因型高度复杂,HIV-1耐药株的流行达中度水平。     

2018—2022年焦作市<18岁人群感染诺如病毒基因分型分析

目的 了解焦作市2018—2022年<18岁人群诺如病毒的流行株基因型及同源性。方法 收集2018—2022年焦作市<18岁人群腹泻病例粪便标本,提取RNA,通过荧光定量PCR方法,检测诺如病毒GⅡ型,筛选出阳性标本,应用RT-PCR扩增RdRp部分基因片段和VP1全长基因片段,RT-PCR阳性扩增产物进行基因测序,分析流行株基因型并构建系统进化树。结果 共采集2 453份粪便标本,检出诺如病毒GⅡ阳性394份,含8个基因亚型,依次为GII.P16/GII.2(占35.79%)、GII.P17/GII.17(占34.26%)、GII.P16/GII.1(占14.97%)、GII.P12/GII.3(占6.60%)、GII.Pe/GII.4(占3.55%)、GII.P8-GII.8(占2.28%)、GII.P7-GII.6(占1.27%)、GII.P7-GII.14(占1.27%)。结论 2018—2022年焦作市<18岁人群诺如病毒感染为多基因型毒株共同流行,可能加速新的基因重组型毒株出现,需加强关注。     

同性和异性传播感染人群的HIV-1亚型分布和特征分析

目的了解河北省男男同性传播和异性传播人群HIV-1亚型分布和特征。方法从感染者的血浆样品中提取病毒RNA,逆转录后采用套式PCR扩增HIV-1 gag和env基因的部分片段,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考株序列比对,确定基因型并进行系统进化树分析。结果同性传播的52例HIV-1感染者中,发现了3种HIV-1亚型和重组型,以CRF01-AE为主,占65.4%(34/52),其次为B亚型占30.8%(16/52);异性传播的60例HIV-1感染者中,存在6种亚型和重组型,以B亚型为主占43.3%(26/60),其次是CRF01-AE占30.0%(18/60),CRF07-BC占15%(9/60);两类人群的亚型分布差异有统计学意义(P<0.001)。异性感染人群的各亚型组内基因距离均大于同性感染人群。结论在河北省同性传播人群和异性传播人群中HIV-1亚型分布不均衡。     

HIV-1新发感染2种检测方法在MSM哨点人群中的对比

目的限制性抗原亲和力方法(简称LAg)与BED捕获酶联免疫试验(简称BED)在四川省男男性行为者(Men who have sex with men,简称MSM)人群中新发感染检测结果的比较,为该方法在四川省的推广应用和可能存在的问题提供参考。方法收集四川省2015年10个MSM哨点的新发感染检测样本274份,分别用LAg和BED进行检测,2检验分析两种方法新发感染结果判定的一致性,根据Mc Dougal法的中点公式分别计算并比较2种方法的HIV-1新发感染率。结果 274份纳入新发感染检测的样本,LAg判定为新发感染81人(29.56%,81/274),BED判定为新发感染111(40.51%,111/274)。2种方法判定结果的调整一致率为86.72%,2检验分析发现2种方法判定结果一致性差异有统计学意义(P0.05),BED检出率较高。LAg的HIV-1新发感染率为7.14%(95%CI:5.58%-8.69%),BED的HIV-1新发感染率为7.54%(95%CI:6.13%-8.94%)。结论对于四川省2015年274例MSM哨点样本,LAg判定新发感染比例低于BED,用Mc Dougal法的中点公式计算2种方法的HIV-1新发感染率结果基本一致。HIV-1新发感染率的观察不易采信绝对数值,应以观察变化趋势为宜。     

2015年-2018年临沂市人群布鲁杆菌病监测分析

目的通过实验室检测数据,了解临沂市布鲁杆菌病的发病状况及流行规律,为有针对性的制定科学防控措施提供依据。方法分析2015年-2018年临沂市疾病预防控制中心(临沂市CDC)实验室布鲁杆菌病检测资料,分析发病情况、高发原因及防治措施。结果 2015年-2018年,临沂市疾病预防控中心实验室累计检测布鲁杆菌病阳性病例283例,全市12个县区均有病例检出,发病主要集中在兰陵县(135例)和郯城县(101例);男、女发病比例为2. 6∶1,发病年龄为8岁~86岁,无死亡病例。农民发病占多数,40岁以上发病年龄组占发病总数的80. 21%(227例)。全年各月均有发病,3月-8月呈现一个发病高峰期,5月达到发病峰值。结论临沂市布鲁杆菌病疫情形势较为严峻,呈现快速上升趋势,应进一步落实综合防治措施,加强疫情监测,加强传染源的管理工作,深入开展对重点人群进行宣传教育和行为干预,以控制人群布鲁杆菌病疫情。     

海南省HIV-1基因亚型分析

目的 分析海南省人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)基因亚型,监测HIV毒株的流行状况.方法 从88份HIV-1抗体阳性的血浆中提取RNA,逆转录后采用PCR法扩增HIV-1基因序列中的env及pol基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,经比对分析而确定基因亚型.构建最大似然(ML)进化树,分析感染者间的传播链.结果 88份样品中,有83份样品被扩增出HIV-1的env及pol基因片段;共发现6种HIV-1亚型和重组型,其中CRF01-AE亚型70份,B'亚型8份,C亚型2份,B亚型和CRF08-BC、CRF01-AE/B'重组亚型各1份.在ML进化树上83份样品分成4个传播群(66/83)和非传播群(17/83),其中传播群1最庞大(59/83).结论 海南省HIV/AIDS的HIV-1基因亚型至少有6种,其中CRF01-AE为主要亚型,占84.33%(70/83),主要分布在静脉吸毒者及其性伴侣之间,形成了一个庞大的传播群.其次为B'亚型(9.6%).另外的4种亚型(6%)仅见单个病例.提示海南省静脉吸毒为主要的感染途径(67.5%);经性接触传播的亚型种类复杂多样,包括本次检出的全部亚型和重组株.     

不同HIV-1亚型毒株混合感染的分子流行病学分析

应用巢式-PCR方法对3例HIV-1感染者外周血单个核细胞中的HIV-1膜蛋白基因进行扩增,并对C2-V3及其邻区360个核苷酸序列进行测定和分析,计算基因离散率和系统进化树.结果,3例感染者体内有B和C或B'和E两种不同HIV-1亚型毒株序列,各亚型毒株与相应的Bcon、Ccon、Econ国际亚型毒株序的基因离散率分别为5.07～7.26%、3.23%、5.38～5.99%;同一个体内不同亚型毒株序列间的基因离散率分别为23.52%、20.69%、28.44%;根据gp120 V3环顶端四肽序列特征,发现有卖淫和静脉吸毒史妓女体内的sz46-1具有典型的欧美B亚型GPGR序列,sz8-2为GPGH,其它毒株均为泰国B(B')和E亚型所特有的GPGQ序列;进一步系统树分析显示,sz1-2、sz8-1、sz46-1与Bcon丛集一起,sz1-1、sz8-2和sz46-1分别与Econ、Ccon丛集.结论同一个体可以同时感染不同亚型HIV-1毒株,多种高危行为可能是导致混合感染的主要原因.     

天津市不同感染途径HIV-1感染者流行毒株亚型分析

目的 了解天津市HIV-1毒株的流行情况,比较不同感染途径HIV-1感染者中流行毒株的亚型分布.方法 采集100例感染途径已知的HIV-1感染者抗凝全血标本,提取DNA,用巢式聚合酶链式反应扩增病毒gag基因,并进行序列测定和亚型分析.结果 100份样品中,有87份样品被成功扩增出HIV-1的gag基因片段,通过系统进化分析,确定天津市HIV-1流行毒株分属4个亚型和重组型,其中CRF01 _AE比例最大,达59.77％(52/87),主要分布在通过同性和异性性传播的HIV-1感染者中,而在通过静注吸毒感染的HIV-1感染者中以CRF07_BC亚型为主.结论 天津市HIV-1流行株至少有4种基因亚型,且不同感染途径HIV-1感染者流行毒株的亚型分布略有不同,应加强对HIV-1毒株亚型变异的监测,及时调整防治策略.     

云南省2014―2018年HIV-1流行毒株遗传变异及基因亚型分布

  目的   调查云南省2014―2018年人类免疫缺陷病毒1（human immunodeficiency virus type 1,HIV-1）毒株基因亚型和重组型流行分布情况及其原始传播溯源。   方法   收集2014―2018年云南省16个州（市）2 604例在定点医院随访的HIV感染者或艾滋病患者的血样及流行病学信息,扩增HIV-1pol区基因,应用Genotyping和BLAST在线分析工具及软件MEGA 6.06确定毒株亚型,通过计算基因距离和系统进化树分析鉴定HIV-1重组型,阐明云南省HIV-1基因亚型的地区和人群分布特征。   结果   经扩增后共获得1 843条pol区序列,云南省HIV-1毒株主要亚型占比为CRF08_BC 55.8%,CRF07_BC 13.4%,CRF01_AE 14.3%,C亚型3.1%,B（B'）亚型2.6%,独特重组型（unique recombinant forms,URFSs）8.1%,其他2.7%。其中,CRF08_BC为最常见亚型。HIV-1基因型分布在年龄,感染途径,民族上的差异均有统计学意义（均有P < 0.05）。16个州（市）各亚型的分布均有差异（均有P < 0.05）。其中,德宏、保山和怒江主要以CRF01_AE为主,丽江和迪庆主要以CRF07_BC为主,其余地州主要以CRF08_BC为主。   结论   云南省16个州（市）HIV-1亚型以CRF08_BC流行为主,各种常见亚型均存在,仍有新型流行重组型（circulating recombinant forms,CRFs）出现,与2012―2014年的资料相比较,在地区、民族、年龄和感染途径方面有变化,应密切监测。