克隆外显子探针反向斑点杂交检测MDM基因缺失

目的：制备检测DMD基因常见易缺失外显子的核苷酸探针，通过反向斑点杂交试验验证其特异性，为初步研制DMD基因诊断芯片作准备。方法：从健康人外周静脉血白细胞提取基因组DNA，应用经典18对引物对DMD基因常见易缺失外显子进行PCR扩增。将扩增产物与pGEM@-T Easy载体连接，转化E.coli JM109感受态细胞。克隆目的片段，并作测序鉴定。以此为探针进行反向斑点杂交试验。结果：序列分析表明，克隆片段代表DMD基因18个常见易缺失外显子；以这些片段为探针进行反向斑点杂交，其结果与PCR相符。结论：克隆的基因片段用作探针在反向斑点杂交试验中显示出较好的特异性，可用于DMD基因常见缺失的检测。     

DNA微阵列对DMD基因缺失检测的分析

目的:制备简易DNA微阵列检测DMD基因常见外显子缺失,作为一项新技术的方法学摸索,为开发更完善的DMD基因诊断芯片作准备。方法:应用分子克隆的方法扩增DMD基因18个常见易缺失外显子片段,以此作为探针制备出简易DNA微阵列,对DMD患者和健康对照的基因进行检测分析。结果:应用简易DNA微阵列检测出4例DMD患者具有不同程度的外显子缺失,其结果与PCR验证相符。对照满意。结论:DNA微阵列技术适用于DMD基因缺失检测,具有简便、高通量、灵敏等特点。     

DMD/BMD基因缺失的检测及其临床分析

目的:了解Duchenne/Becker型肌营养不良症(DMD/BMD)致病基因缺失的分布及其与临床病情的关系。方法:应用9对引物多重聚合酶链反应(mPCR)技术对42例DMD/BMD患者进行致病基因检测。结果:21例患者(50.0%)被检出外显子缺失,缺失片段长度各异,其中16例(76.2%)累及中央缺失热区,5例(23.8%)位于5端缺失热区,尤以48号外显子缺失频率最高。结论:多重PCR技术是检测DMD/BMD致病基因缺失的有效方法,该病病情轻重可能与外显子缺失的数量和长度不呈平行关系,而是与缺失类型有关,并受到个体差异的影响。     

DMD基因内含子中的多种,多个重复顺序与外显子缺失关系的探讨

目的为探讨假肥大型肌营养不良症（ＤＭＤ）基因内含子的核苷酸序列特点与存在于内含子中的多个断裂点的关系。方法克隆了含ＤＭＤ基因第５０和５１号内含子的人基因组ＤＮＡ３．１ｋｂ－ＨｉｎｄⅢ片段，测出该片断的全顺序并用计算机分析序列特点。结果该ＤＮＡ片段的长度为３１７９ｂｐ，包含长１６４７ｂｐ的部分第５０号内含子和长１２９９ｂｐ的部分第５１号内含子以及第５１号外显子的全部２３３ｂｐ。在第５０和５１号内含子中发现３６个短串联重复顺序、２２个正向和反向重复顺序和８个同源顺序。结论多种、多个重复顺序的存在及这些重复顺序之间的重组可能导致的ＤＮＡ断裂，并造成第５１号外显子的缺失。     

dystrophin基因常见易缺失外显子片段的克隆

背景：既往研究显示,dystrophin基因缺失集中在两个热点区域即外显子2~20和44~53,其主要缺失可以通过对一系列外显子的检测来发现。DNA微阵列可以将许多基因或基因的许多片段同时进行检测,为检测dystrophin基因缺失提供了一项新技术。 目的：对dystrophin基因18个常见易缺失外显子片段进行克隆、鉴定,以克隆产物作为核苷酸探针为研制dystrophin基因缺失检测微阵列作准备。 设计、时间及地点：分子生物学观察实验,于2002年在第四军医大学附属西京医院神经内科完成。 材料：细菌菌株E.coli JM109由全军基因诊断技术研究所保存,质粒载体pGEM®-T Easy Vector购自美国Promega公司,18对寡核苷酸引物由上海生物工程公司合成。 方法：以人类基因组DNA为模板,应用18对引物对dystrophin基因常见易缺失外显子片段进行PCR扩增。将扩增产物与pGEM-T Easy载体连接,转化E.coli JM109感受态细胞。通过平板培养,挑选阳性克隆。提取重组质粒,Not I酶切,获得完整的探针片段,并作测序鉴定。通过核酸序列数据库相似性检索工具验证序列的来源及其与GeneBank收录序列的相似性。 主要观察指标：①dystrophin基因外显子片段的PCR扩增。②扩增片段与pGEM-T Easy载体连接构成重组质粒并克隆。③重组质粒的Not I酶切及测序鉴定。④克隆片段的序列分析及同源性检索。 结果：PCR扩增出18个片段,与dystrophin基因预期扩增片段大小相一致。重组克隆质粒的酶切产物与PCR产物大小相近,与预期相一致。经测序获得18个克隆片段全序列,其核苷酸数量与预期基本一致,序列相似性检索分析证实了这些克隆片段与GeneBank收录的dystrophin基因片段具有极高的同源性。 结论：克隆产物确为dystrophin基因常见易缺失外显子片段。     

应用多重PCR检测DMD/BMD患者的基因缺失

目的:了解Duchenne型肌营养不良(DMD)/Becker型肌营养不良(BMD)患者基因缺失的分布规律,并探讨检测技术。方法:应用18对引物多重聚合酶链反应(mPCR)分两组对40例DMD/BMD患者和5例健康者进行Dys-trophin基因缺失检测分析。结果:27例(67.5%)存在外显子缺失,13例(32.5%)未检测到缺失;16例缺失片段集中于44～52号外显子,6例集中于2～20号外显子,5例在以上两个区域均有缺失;45、48、51号外显子缺失频率最高。结论:基因缺失为主要突变类型,缺失片段主要分布于44～52、2～20号外显子两个缺失热区;mPCR具有临床应用价值。     

多重PCR/DHPLC技术检测家族性帕金森病Parkin基因外显子重组突变

目的 了解中国家族性帕金森病患者Parkin基因外显子的缺失、重复及其分布。以进一步探讨突变与临床表型之间的关系。方法 应用多重聚合酶链式反应（PCR）、变性高效液相色谱（DHPLC）、实时荧光定量PCR等方法检测46例健康对照者和来自29个家系的49例患者DNA样本中Parkin基因1～12外显子的缺失和重复。结果正常对照者中未发现重组；8个家系的17例DNA样本中发现重组，集中在外显子2～5、7。结论Parkin基因的缺失或重复很可能是家族性帕金森病的重要发病原因之一；多重PCR结合DHPLC是一种有效的基因定量方法。     

应用PCR—SSCP技术研究非缺失型DMD／BMD患者的基因内点突变

应用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法，结合ＤＮＡ测序技术，对２０例非缺失型ＤＭＤ／ＢＭＤ患者的Ｄｙｓｔｒｏｐｈｉｎ基因１７号外显子区域进行检测，发现了一个由Ｇ－Ｔ碱基置换形成的点突变。表明该方法对非缺失型病例发病机制的阐明具有重要意义。     

多重连接探针扩增和二代测序技术检测Duchenne型肌营养不良基因分析

目的探讨联合应用MLPA和二代基因测序技术对Duchenne型肌营养不良症分子遗传学诊断的作用。方法收集2012-01—2019-12在中山大学孙逸仙纪念医院儿童神经内分泌专科就诊经临床和肌肉活检明确诊断Duchenne型肌营养不良症患儿,联合应用MLPA和二代测序技术,分析其DMD基因单个外显子的缺失情况。结果纳入Duchenne型肌营养不良症患儿59例,均为男性,就诊年龄(4.72±2.42)岁。58例患儿确定了致病基因突变位点,基因诊断阳性率为98.30%。其中缺失突变28例(47.46%),以第45-55号外显子缺失频率最高;重复突变7例(11.86%),23例(38.98%)微小突变,其中包括无义突变8例(13.55%),移码突变6例(10.17%),错义突变6例(10.17%),微缺失3例(5.08%)。结论联合应用MLPA和二代测序技术是明确Duchenne型肌营养不良症致病基因突变位点最佳策略,能为Duchenne型肌营养不良症的精准诊治和家系成员的遗传咨询提供准确的依据。     

应用PCR－SSCP技术研究非缺失型DMD／BMD患者的基因内点突变

应用ＰＣＲ－ＳＳＣＰ方法，结合ＤＮＡ测序技术，对２０例非缺失型ＤＭＤ／ＢＭＤ患者的Ｄｙｓｔｒｏｐｈｉｎ基因１７号外显子区域进行检测，发现了一个由Ｇ～Ｔ碱基置换形成的点突变。表明该方法对非缺失型病例发病机制的阐明具有重要意义。     

Screening of gene deletions by polymerase chain reaction in Japanese patients with Duchenne muscular dystrophy

Summary Gene deletions were screened in 49 Japanese Duchenne muscular dystrophy patients from 43 families, using the polymerase chain reaction. Enzymatic amplification was carried out on six regions prone to deletion. Fifteen of 43 families (33%) had gene deletions in at least one of the six regions. This frequency was almost the same as that previously reported in Caucasians. The mid-part of the dystrophin gene was the location most frequently deleted. The frequency of deletion of the region encompassing exon 45 was higher in Japanese families (18.4%) than in Caucasians.     

肝豆状核变性8号外显子778密码子基因突变的酶切检测

目的应用酶切方法对中国人肝豆状核变性患者ＡＴＰ７Ｂ基因中的高频突变点进行检测，并对家系进行基因诊断分析。方法根据高频突变点所处序列设计合适的内切酶ＭｓｐⅠ，对中国人肝豆状核变性３９个家系４５个患者以及６０例正常人的ＡＴＰ７Ｂ基因８号外显子ＰＣＲ扩增后进行酶切分析。对有异常者进行序列分析（自动测序）。结果正常人组未见异常，患者组有２例突变纯合子，占患者总数４４％，１１例杂合子，占患者总数２４４％。酶切的异常率为２８８％。序列分析证实所有异常表现者均为Ｇ２２７３Ｔ置换，即Ａｒｇ７７８Ｌｅｕ突变。并检测和分析了３个高频突变家系。结论ＡＴＰ７Ｂ基因的８号外显子７７８密码子为中国人肝豆状核变性患者的高频突变点。用ＰＣＲ－酶切的方法可以作为检测中国人肝豆状核变性患者基因突变的快速诊断方法     

Detection of deletions within the dystrophin gene in Polish families affected with Duchenne/Becker muscular dystrophy

DNA analysis was performed in 190 cases of Duchenne and Becker muscular dystrophies (DMD/BMD), including 150 cases with DMD and 40 cases with BMD, using Southern blotting and PCR multiplex techniques with application of 25 pairs of primers. Deletions in the overall material were found in 109 cases: 81 (54%) in patients with DMD and 28 (70%) in patients with BMD. All the deletions in DMD were out of frame with the exception of two cases, whereas in BMD all the deletions but two were in frame. Junction fragments were detected in 12 cases of DMD. In five cases duplications were found: four in patients with DMD and one in a patient with BMD.     

雌激素对MPP+诱导的PC12细胞损伤过程中细胞凋亡相关基因的研究

目的　探讨雌激素 (Estrogen ,E)在 1-甲基 - 4 -苯基吡啶离子 (MPP+ )对PC12细胞损伤过程中对神经细胞的作用机制 ,特别是雌激素与细胞凋亡的关系。方法　用半定量逆转录PCR(RT PCR)检测细胞凋亡过程中促进细胞增殖基因Bcl x和促进细胞死亡基因白细胞介素 1β转换酶 (interleukin 1βconverten zyme ,ICE)的有效蛋白mRNA的表达水平 ,比较各组的差异。 结果　雌激素组的Bcl x的有效蛋白mRNA的表达水平显著高于对照组、MPP+ 组及E +MPP+ 组 (P <0 .0 5 ) ;ICE的有效蛋白mRNA的表达水平显著低于对照组、MPP+ 组及E +MPP+ 组 (P <0 .0 5 )。E +MPP+ 组Bcl x的有效蛋白mRNA的表达水平显著高于MPP+ 组 ;ICE的有效蛋白mRNA的表达水平显著低于MPP+ 组 (P <0 .0 5 )。E +MPP+ 组和对照组相比无显著性差异 (P >0 .0 5 )。结论　雌激素对于MPP+ 诱导的ICE增加和Bcl x降低可起一定的拮抗作用 ,从而在一定程度上抑制了凋亡的发生。     

Primary malignant lymphoma of the brain: demonstration of immunoglobulin gene rearrangements in four cases by the Southern blot hybridization technique

Summary Using the Southern blot hybridization technique, four cases of the primary malignant lymphomas of the brain, histologically diffuse large cell lymphoma, were examined for the immunoglobulin gene rearrangements. In three lymphomas, the rearrangements were observed in both heavy and light chain genes, providing strong evidence for a B cell lineage of these tumors. On the other hand, in the remaining lymphoma, the rearrangement was observed only in the heavy chain gene. Despite this, immunohistochemical examination revealed positive stainings for heavy and light chain immunoglobulins in tumor cells, suggesting the occurrence of light chain gene rearrangement at the undetectable level. Thus, B lymphocytic differentiation at the gene level was demonstrated in three, or possibly all, of the primary intracerebral malignant lymphomas examined. Since no more than two rearrangements were detected in each immunoglobulin gene, these lymphomas were considered to be monoclonal in nature.     

广东省家族性致死性失眠症一家系临床特征及基因突变分析

目的 研究广东省家族性致死性失眠症(FFI)一家系患者的临床特征以及朊蛋白基因突变检测.方法 总结来自广东的一个FFI家系2例患者的临床表现特征,应用聚合酶链反应(PCR)、DNA直接测序技术对1例患者进行朊蛋白基因突变检测.结果 先证者主要临床表现为进行性加重的睡眠障碍和行为、认知紊乱,病程后期出现肌阵挛,病程为9个月;先证者哥哥具有类似的临床表现,病程为11个月.先证者朊蛋白基因突变检测结果发现患者为朊蛋白D178N突变,第129位多态位点为甲硫氨酸纯合型.结论 典型的临床表现有助于FFI的诊断,朊蛋白基因检测有助于确诊FFI.