中国汉族人群热休克蛋白60基因多态性及连锁不平衡分析

目的分析中国汉族人群热休克蛋白60(HSP60)基因多态性及连锁不平衡关系。方法采用分片断扩增直接测序的方法,结合Taqman探针基因分型技术对30名无关健康汉族志愿者进行HSP60基因多态性检测和单倍型分析。结果(1)共检出13个频率大于1%的HSP60单核苷酸多态性(SNPs)位点,其中4个为新发现SNPs。9个已报道的SNPs分别为rs1116734、rs3749095、rs1050347、rs8539、rs2340690、rs3214832和rs7585486,内含子7无rs编号的(a/c),rs788016;4个新SNPs分别是:位于2号染色体198189061a/g,198184890a/g,198184774ag/--,198180643ac/--(内含子7),杂合度分别为0.06、0.04、0.5和0.5。(2)SNPs:rs1116734、rs1050347、rs8539、rs2340690、和rs788016在不同人种中的分布差异均有显著性(P=0.00)。(3)连锁不平衡分析(LD)后发现rs1116734与198189061a/g,rs1116734与rs788016不存在连锁不平衡。rs1050347、rs2340690、rs3214832、rs7585486及198180659a/c(无rs编号)两两间完全连锁不平衡,rs8539、198184774ag/--、198180643ac/-两两间完全连锁不平衡。以R2大小及最小等位基因频率对13个SNPs进行选择,5个代表性SNPs位点rs1116734、rs3749095、rs8539、rs2340690、和rs788016均可构成9种单倍型。结论中国汉族人群HSP60的SNPs分布有别于其他人种,rs1116734、rs3749095、rs1050347、rs8539、rs2340690、rs3214832、198184774ag/-、rs7585486、198180659a/c、198180643ac/-、rs788016是HSP60基因在中国汉族人群中较常见的SNPs。rs1116734、rs3749095、rs8539、rs2340690和rs788016是5个较有代表性的SNPs。     

肺癌易感性与p73基因多态性关系的研究

目的探讨中国人群p73基因5’UTR区域两个单核苷酸多态性(G4C14，A4T14)与肺癌的关系。方法采用病例对照研究；选择经组织学确诊的肺癌病例425例，地区、年龄和性别频数匹配的对照588名，以聚合酶链反应-单链构象多态性方法进行多态性检测。结果此两个多态性之间具备完全的连锁不平衡，AT(A4T14)单倍型在病例组显著少于对照组(0．225 vs.0．287．P=0．0018)，提示变异的AT单倍型对肺癌具有保护作用。与携带p73 GC／GC单倍型基因型者比较，携带GC／AT单倍型基因型者肺癌风险降低30％(OR=0．70，95％CI：0．53～0．92)，而携带AT／AT单倍型基因型者肺癌风险降低55％(OR=0．70，95％CI：0．26～0．80)。结论p73基因多态改变可能与中国汉族人群肺癌遗传易感性有关。     

热休克蛋白60基因多态性和抗体水平及其与冠心病的关系

目的 探讨热休克蛋白60(Hsp60)基因多态性和抗体水平及其与冠心病(CHD)的关系.方法 采用病例对照研究,选取未治疗过的CHD患者615例,对照以年龄(±1)岁和性别以1:1与CHD组匹配共选取615例.采用间接酶联免疫吸附法测定血浆Hsp60抗体水平;TaqMan-MGB探针检测Hsp60基因上rs2340690、rs788016、rs2565163和rs2305560四个单核苷酸位点的多态性(SNPs).结果 CHD组的Hsp60抗体水平显著高于对照组,差异有统计学意义(P=0.000).上述4个SNPs的基因型频率在CHD组和对照组之间差异均无统计学意义,采用多元Logistic回归分析,对年龄、性别、吸烟、饮酒、高血压史、糖尿病史和家族CHD史等因素进行校正后,未发现4个SNPs的任一基因型与CHD的危险度有关联;多因素协方差分析校正了以上混杂因素后,CHD组和对照组Hsp60基因4个SNPs不同基因型之间的血浆Hsp60抗体水平差异均无统计学意义(P>0.05).结论 Hsp60抗体可能与CHD发病有关,Hsp60基因的多态性和抗体水平与CHD风险均没有显著性关系.     

热休克蛋白70基因多态性与疾病易感性关系

生物体接触高温或其他应激因素时,可以合成一组蛋白质即热休克蛋白(Heat shock proteins,HSPs)。根据同源程度及分子量大小,可分为:Hsp90家族(83~90 kD)、Hsp70家族(66~78 kD)、Hsp60家族及小Hsp家族(15~30 kD),此外还有分子量在100~110 kD的大分子Hsp。HSPs的生物学功能广泛,Hsp70是其中最主要的一种,其最重要的功能是参与耐受的形成,当细胞或机体受到应激时,Hsp70蛋白生成显著增加,避免机体再次应激时遭受更为严重的损伤,与多种疾病发生发展有关⁽¹⁾。     

家族性原发性高血压与基因多态性关系

目的 探讨山东省汉族人群鸟苷酸结合蛋白(G蛋白)β3亚单位基因(GNB3)C825T多态性和血管紧张素原(AGT)基因M235T多态性与家族性原发性高血压(EH)的关系。方法 应用聚合酶链反应(PCR)和限制性内切酶酶切方法,对162例原发性高血压患者和180名正常对照组进行GNB3 C825T和AGT M235T多态性检测。结果 EH组GNB3 C825T各等位基因频率与正常对照组比较差异无统计学意义(P>0.05);EH组AGTM235T多态性的MT+TT基因型及T等位基因频率则高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);在AGT TT纯合子中,GNB3 TT纯合子患病率及收缩压(SBP)、舒张压(DBP)均高于C等位基因携带者(P<0.05);逐步Logistic回归分析结果显示,825TT+235TT基因型高血压的发病危险为其他基因型的3.45倍(P=0.001),高于单基因的AGT 235TT(1.87)。结论 AGT基因M235T多态性T等位基因是山东省汉族原发性高血压家系人群EH发病的危险因素之一。GNB3 825T等位基因对高血压的发病有协同作用。     

肠道感染后IBS与SERT基因多态性关系

目的探讨SERT基因多态性在肠道感染后IBS中的意义。方法用PCR方法对100例健康对照和231例肠道感染后IBS患者SERT基因的VNTRs和5-HTTLPR区多态性进行研究。结果5-HTT’LPR区:肠道感染后C-IBS组L/L基因型频率显著高于对照组;肠道感染后D-IBS组S/S基因型频率显著高于肠道感染后A-IBS和C-IBS组,L/L基因频率显著低于肠道感染后A-IBS和C-IBS组。VNTRs区:肠道感染后IBS患者sTin2.12/10基因型频率明显高于对照组,各亚型间基因型频率差异无显著性。结论具有L/L基因型的人肠道感染后更易患C-IBS,具有L/S基因型的人肠道感染后更易患D-IBS和A-IBS。肠道感染后C-IBS患者12/12,L/L基因型联合的频率显著高于对照组和肠道感染后A-IBS、D-IBS组,说明12/12,L/L基因型联合可能为肠道感染后C-IBS的危险因素。     

军团菌易感性与TLR4基因多态性关系

目的初步探讨军团菌感染与Toll样受体4(Toll-like receptor,TLR4)基因(2244G→A)及(2299A→G)多态性的关系。方法采用聚合酶链反应(PCR)扩增肺部感染患者痰液及尿液中军团菌属特异性16SrRNA基因,酶免疫检测法(EIA)检测尿液中血清1型嗜肺军团菌抗原;采用聚合酶链-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术检测25例军团菌感染者(病例组)、44例其他非革兰氏阴性菌引起的肺部感染者(患者对照组)和47名健康体检者(健康对照组)的TLR4基因(2244G→A)及(2299A→G)位点的多态性。结果病例组、患者对照组、健康对照组TLR4(2244G→A)位点基因型和等位基因频率差异有统计学意义(χ²=17.234,P=0.002;χ²=15.332,P<0.001);经两两比较,TLR4(2244G→A)位点基因型和等位基因频率病例组和患者对照组均高于健康对照组(P<0.05),病例组与患者对照组比较差异无统计学意义(P>0.05);3组TLR4(2299A→G)位点基因型和等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05)。结论TLR4基因(2244G→A)位点多态性与军团菌和其他非革兰氏阴性菌易感性可能有关。     

2型糖尿病与抵抗素基因多态性关系的研究

2型糖尿病（diabetes mellitus type 2,T2DM）是一种复杂的代谢性疾病,是21世纪威胁人类健康的主要疾病之一,可导致严重的发病率和死亡率,是以血糖升高,碳水化合物、蛋白质和脂类代谢调节紊乱为特征。胰岛素抵抗是T2DM发病的一个主要因素,有研究显示抵抗素（resistin,RETN）与胰岛素抵抗呈正相关。RETN是脂肪细胞分泌的因子之一,并且在T2DM、肥胖介导的炎症和胰岛素抵抗中起决定性因素。随着研究的不断探索,抵抗素基因的多态性逐渐被认识,充分理解抵抗素基因在T2DM中的多态性表达,有助于更加合理的将其应用于T2DM的诊治及预防中。     

精神分裂症与亲核素β基因多态性关系

目的探讨亲核素β(KPNBs)中KPNB1和KPNB2基因与精神分裂症的关系。方法采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,收集中国吉林省汉族精神分裂症患者及其健康父母双亲组成的233个核心家系成员,分别检测位于KPNB1和KPNB2基因上的2个单核苷酸多态性(SNPs)rs11871606和rs266443。利用拟合优度χ²检验分析等位基因和基因型分布频率是否符合哈迪-温伯格定律(Hardy-WeinbergLaw),应用遗传统计学软件(UNPHASED)进行2个SNPs的传递不平衡检验(TDT)以及双位点联合作用分析。结果患者组与其父母组比较,KPNB1基因rs11871606及KPNB2基因rs266443等位基因和基因型频率的分布差异均无统计学意义(P>0.05),符合Hardy-Weinberg平衡定律;TDT结果提示,KPNB1基因rs11871606及KPNB2基因rs266443与精神分裂症无连锁及关联。双位点联合作用分析结果显示,rs11871606与rs266443两位点未显示联合作用(P>0.05)。结论KPNB1基因rs11871606位点及KPNB2基因rs266443位点多态性可能与精神分裂症无关,但不能排除KPNB1基因及KPNB2基因其他SNPs与精神分裂症相关联。     

河南汉族食管鳞癌与XPD基因多态性关系

目的 探讨着色性干皮病基因D(xeroderma pigmentosum group D,XPD)基因多态性与食管鳞癌的关系,为揭示食管癌病因及制定食管癌干预措施提供理论依据。方法 采用病例对照研究方法,选取郑州大学附属第一医院食管鳞癌患者235例,按性别与年龄1:1匹配选取河南省新乡县健康人群235人作为对照,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法,检测XPD 312位点和751位点基因型,采用非条件Logistic回归进行多因素和交互作用分析。结果 与野生型GG比较,XPD 312位点GA、AA和(GA+AA)基因型与食管鳞癌易感性无关,分别调整后OR=0.83(95%CI=0.05～13.55),OR=1.12(95%CI=0.06～19.47)和OR=1.35(95%CI=0.73～2.51);与野生型AA比较,XPD 751位点AC、CC和(AC+CC)基因型与食管鳞癌易感性无关,分别调整后OR=1.21(95%CI=0.80～1.83),OR=0.99(95%CI=0.42～2.31)和OR=1.17(95%CI=0.79～1.75);以GA作为对照单体型,GC、AA和AC单体型与食管鳞癌易感性无关,未发现两位点与吸烟或饮酒之间的交互作用。结论 XPD 312和XPD 751位点多态性可能与河南汉族人群食管鳞癌的发生无关,且与吸烟或饮酒不存在交互作用。     

乙酰辅酶A羧化酶基因多态性与冠心病关系

目的探讨乙酰辅酶A羧化酶基因多态性与中国广东汉族人群冠心病的关联性。方法采用SNPscan^TM多重SNP分型试剂盒,对筛选的一个tagSNP(rs2268388)在1 044例冠心病患者和1 349名健康对照中进行基因分型,并应用卡方检验、logistic回归模型等方法分析SNP位点与冠心病的关联性。结果校正性别、年龄、高血压、糖尿病、吸烟史、总胆固醇和体质指数后,rs2268388在等位基因关联分析和基因型关联分析中均无统计学意义(P=0.508,OR=0.956,95%CI=0.835~1.093);进一步按性别、是否患高血压、是否患糖尿病分层后进行基因型关联分析显示在糖尿病组rs2268388与冠心病显著关联(P=0.019,OR=7.856,95%CI=1.406~43.89)。结论在中国广东汉族人群中,乙酰辅酶A羧化酶基因rs2268388多态性可能与冠心病合并糖尿病有关。     

广东汉族人群GLUT4基因多态性与冠心病关系

目的 探讨中国广东汉族人群葡萄糖转运蛋白-4(GLUT4)基因多态性与冠心病易感性之间的关系。方法 采用多重单核苷酸多态性(SNP)分型试剂盒,对筛选的2个tagSNP位点(rs16956647、rs5435)在1044例冠心病患者和1349例非冠心病患者为对照进行基因分型;采用遗传分析软件Plink和统计分析软件SPSS 17.0分析SNP位点与冠心病的关联性。结果 SNP rs5435未满足Hardy-Weinberg平衡条件,予以剔除。校正性别、年龄、高血压、糖尿病、吸烟史、总胆固醇、甘油三酯、心率和体质指数后,rs16956647基因型与冠心病存在明显关联[加性模型:P=0.016,OR=0.80(95%CI=0.67~0.96);显性模型:P=0.002,OR=0.71(95%CI=0.57~0.89)]。进一步按是否患糖尿病分层后进行基因型关联分析,结果显示仅在糖尿病组rs16956647位点与冠心病呈显著关联[加性模型:P=0.048,OR=0.82(95%CI=0.67~0.99);显性模型:P=0.007,OR=0.72(95%CI=0.56~0.91)]。结论 在中国广东汉族人群中,GLUT4基因多态性与冠心病易感性之间的关联可能与患者胰岛素抵抗有关。     

中国人群脂联素基因+276G/T多态性与冠心病相关性研究

目的系统评价中国人脂联素基因+276G/T多态性与冠心病相关性。方法通过文献检索收集2012年12月以前完成或发表的中国人脂联素基因+276G/T多态性与冠心病相关性的病例对照研究,剔除不符合要求的文献,以漏斗图检验入选文献的偏倚,并根据各入选文献结果的同质性检验结果进行数据合并,计算总OR值,Meta分析采用Review Manager 4.2版软件。结果共8篇文献符合条件纳入研究,入选文献无明显偏倚,各文献间异质性检验显示有关+276G/T(χ2=12.38,P=0.09)等位基因分布情况的文献之间无显著异质性。Meta分析显示+276G/T基因多态性与冠心病易感性总OR=1.93,95%CI 1.32～2.82,P=0.0007。结论中国人群脂联素基因+276G/T多态性与冠心病易感性具有相关性。     

MTHFR 677C-T和1298A-C基因多态性与先天性小耳畸形相关性

目的探讨叶酸代谢的关键酶亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因677C-T和1298A-C单核苷酸多态与中国汉族人群先天性小耳畸形发病风险的关系。方法收集2012-2014年南京地区先天性小耳畸形患者183例, 对照组188例来自同期健康体检者。采用PCR-内切酶消化和基因测序方法进行基因分型, 采用χ²检验进行MTHFR 677C-T单核苷酸多态性与先天性小耳畸形关联分析。结果MTHFR 677C-T突变基因型频率在病例和对照中的分布差异有统计学意义(P<0.05), 进一步进行不同性别分层分析, MTHFR 677C-T突变基因型主要增加男性先天性小耳畸形的发病风险(P<0.05), MTHFR基因1298A-C多态性在病例和对照组中的分布差异无统计学意义(P>0.05), 两个多态性位点存在连锁不平衡。结论MTHFR 677C-T单核苷酸多态可能与男性先天性小耳畸形的遗传易感性有关。     

5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶基因多态性与先天性心脏病关系

目的 探讨5,10-亚甲基四氢叶酸还原酶（MTHFR）基因多态性与先天性心脏病（CHD）的关系,为CHD的防治提供参考依据。方法 采用以医院为基础的病例对照研究方法抽取2012年12月-2013年11月山东大学齐鲁儿童医院就诊的150例患有单纯性CHD的患儿及同期在该医院儿童保健科进行查体的150名健康儿童分别作为病例组和对照组,检测2组儿童MTHFR基因C677T、A1298C、G1793A的基因型及其分布。结果 MTHFR C677T位点T等位基因儿童患CHD的风险为C等位基因的1.813倍（χ²=12.990,P=0.000）,CT、TT、CT+TT基因儿童患CHD的风险分别为CC基因的2.249、3.121、2.489倍（P<0.01）;MTHFR A1298C位点C等位基因儿童患CHD的风险为A等位基因的2.017倍（χ²=5.785,P=0.016）,AC基因儿童患CHD的风险为AA基因的2.177倍（χ²=6.434,P=0.011）;MTHFR G1793A位点G与A等位基因和GG与GA基因儿童患CHD的风险差异均无统计学意义（均P>0.05）;MTHFR C677T与A1298C位点CC/AC、CT/AA、CT/AC、TT/AA、TT/AC组合基因儿童患CHD的风险分别为CC/AA组合基因的3.039、2.718、3.545、2.861、7.091倍（均P<0.05）;MTHFR C677T与G1793A位点TT/GG组合基因儿童患CHD的风险为CC/GG组合基因的2.551倍（χ²=7.133,P<0.05）;MTHFR A1298C与G1793A位点AC/GG组合基因儿童患CHD的风险为AA/GG组合基因的2.505倍（χ²=6.448,P=0.011）。结论 MTHFR C677T、A1298C突变是CHD发生的危险因素,MTHFR C677T与A1298C、MTHFR C677T与G1793A、MTHFR A1298C与G1793A组合基因对CHD的发生存在联合作用     

内皮型一氧化氮合酶基因多态性与冠心病关系

目的探讨内皮型一氧化氮合酶（eNOS）基因内含子4可变串联重复序列（VNTR）多态性与早发冠心病的关系。方法以医院为基础的病例对照研究，选择新诊断的冠心病患者为研究对象。男性≤55岁及女性≤65岁患冠心病为早发冠心病，以188例早发冠心病患者为病例组，315例迟发冠心病患者为对照组。应用聚合酶链反应（PCR）技术检测eNOS基因内含子4VNTR多态性。结果eNOS基因内含子4VNTRc／c、c／b、b／b、b／a、a／a基因型频率，早发冠心病组分别为0．53％，0．00％。81．38％，16．49％，1．60％；迟发冠心病组分别是0．00％。0．32％，77．46％，20．32％，1．90％。c／c＋c／b＋b／b与b／a＋a／a基因型在2组之间分布差异无统计学意义（P=0．268，OR=1．294，95％CI=0．8202．043）。c、b、a等位基因频率。早发冠心病组分别是0．53％。89．63％，9．84％；迟发冠心病组分别是0．16％。87．78％。12．06％。c＋b与a的等位基因频率在2组间分布差异无统计学意义（P=0．280，OR=1.257,95％CI=0．8301．904）。在n=0．05显著性水平上，用多元逐步非条件Logistic回归分析调整性别、吸烟、饮酒、收缩压、体质指数、腰臀比、甘油三酯和总胆固醇后，eNOS基因内含子4VNTR多态性与早发冠心病也无显著相关（P=0．427。OR=0．819，95％CI=0．500-1．341）。结论eNOS基因内含子4VNTR多态性可能不是早发冠心病发病的危险因素。     

MnSOD 9Ala/Val基因多态性与冠心病的关系

目的探讨锰超氧化物歧化酶9 Ala/Val(MnSOD9 Ala/Val)基因多态性与冠心病、总超氧化物歧化酶(T-SOD)和锰超氧化物歧化酶(MnSOD)活性以及丙二醛(MDA)浓度的关系。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法检测262例冠心病患者和100例对照组的MnSOD9 Ala/Val基因多态性的基因型,采用比色法测定血浆T-SOD、MnSOD活性以及MDA浓度。结果与对照组比较,冠心病患者的血浆T-SOD和MnSOD活性[(23.61±16.51)U/ml与(44.01±22.68)U/ml,P<0.001和(21.56±13.11)U/ml与(28.79±8.65)U/ml,P<0.001]明显降低,MDA浓度显著增高[(2.47±0.73),(2.15±0.55)nmol/ml,P<0.01];冠心病患者的MnSOD 9 AA基因型和A等位基因频率较对照组明显增多(64.2%与43.0%,P=0.001和80.0%与67.0%,P=0.014);MnSODAA基因型的MnSOD活牲较VV基因型明显降低[(22.87±13.47)与(32.04±9.19)U/ml,P<0.01)];MnSOD与MDA负相关(r=-0.15,P<0.01)。结论冠心病患者的血浆T-SOD和MnSOD活性明显降低,MDA浓度显著增高;MnSOD 9 Ala/Val基因多态性AA基因型的血浆MnSOD活性降低。     

淋巴毒素α基因rs1800683 G>A位点多态性与川崎病的关联性研究

目的 通过检测淋巴毒素α(LTA)基因rs1800683 G>A位点多态性,探讨淋巴毒素α基因rs1800683 G>A位点多态性与川崎病(KD)发病及KD冠脉损伤的关联性。方法 应用基因测序方法,对100例KD组与92例健康对照组儿童淋巴毒素α基因rs1800683 G>A位点多态性进行基因检测;结果 KD组的淋巴毒素α基因rs1800683 G>A位点AG、AA、GG基因型分布和A、G等位基因频率与健康对照组比较差异无统计学意义(χ²=3.78和2.84,P均>0.05),KD组的合并CAL组与NCAL组基因型和等位基因频率比较差异亦无统计学意义(χ²=3.76和0.43,P均>0.05)。结论 未发现淋巴毒素α基因rs1800683 G>A位点多态性与KD的发病及其冠脉损伤存在明显关联性。     

冠心病基因检测与冠心病的关联性

目的观察冠心病基因检测与冠心病是否有关联性,以及关联程度如何。方法选取120例住院患者,其中60例为冠心病人,60例为非冠心病人。年龄40—65岁。冠心病为观察A组,非冠心病为对照B组,记录性别、年龄、冠心病家族史、高血压史、糖尿病史,并均抽血行冠心病基因检测。A组选1人和B组选1人按年龄相近、性别相同配对,共形成60对。开始进行1：1条件Logistic回归分析。结果冠心病家族史、高血压史、糖尿病史、以及冠心病基因检测与冠心病均有关联性。其中冠心病基因检测与冠心病的关联程度低于其他3个因素。结论冠心病基因检测与冠心病有关联性。     

eNOS基因T-786C变异与早发冠心病关系

目的探讨内皮型-氧化氮合酶（eNOS）基因T-786C变异与早发冠心病的关系。方法以188例早发冠心病为病例组,315例迟发冠心病为对照组,运用PCR-（限制性片断长度多态性）（RFLP）方法检测eNOS基因T-786C变异;应用单因素及多元逐步Logistic回归分析eNOS基因T-786C变异与早发冠心病的关系。结果T-786C基因型频率早发冠心病组与迟发冠心病组比较,差异无统计学意义（P=0.105）,但TC＋CC基因型频率早发冠心病组显著高于迟发冠心病组（P=0.039）。C等位基因频率早发冠心病组（14.63%）也显著高于迟发冠心病组（10.32%）（P=0.041,OR=1.489,95%CI=1.014～2.187）。在0.05显著水平上,用多元逐步Logistic回归分析调整性别、吸烟、饮酒、超重后,T-786C变异仍对早发冠心病具有显著影响（P=0.013,OR=1.791,95%CI=1.131～2.897）。结论eNOS基因T-786C变异可能是早发冠心病的重要危险因素之一。