DNA修复基因XRCC1单核苷酸多态性与肿瘤易感性

DNA修复基因单核苷酸多态性是决定机体肿瘤易感性的一个重要因素.当前,DNA修复基因XRCC1单核苷酸多态性与肿瘤易感性的关系的研究结果之间存在分歧,尚无法明确XRCC1单核苷酸多态性与个体肿瘤易感性的关系.单核苷酸多态性与肿瘤易感性关系的研究只有充分考虑遗传、环境、种族等诸多影响因素,才能建立起与某一特定肿瘤易感性之间较为明确的关联,为肿瘤的预防和治疗提供依据.     

宫颈癌相关基因单核苷酸多态性研究进展

宫颈癌是妇科常见的恶性肿瘤之一.与机体遗传背景相关的基因多态性,被认为是决定人乳头瘤病毒(human papilloma virus, HPV)感染后宫颈癌发病与否及预后的重要因素.单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)是指某基因中人群发生率超过1%的单碱基替换或缺失现象.本文就近年来与宫颈癌相关的单核苷酸多态性的研究进展综述如下.     

DNA修复基因XRRC1单核苷酸多态性与肿瘤易感性

DNA修复基因单核苷酸多态性是决定机体肿瘤易感性的一个重要因素。当前，DNA修复基因XRCC1单核苷酸多态性与肿瘤易感性的关系的研究结果之间存在分歧，尚无法明确XRCC1单核苷酸多态性与个体肿瘤易感性的关系。单核苷酸多态性与肿瘤易感性关系的研究只有充分考虑遗传、环境、种族等诸多影响因素，才能建立起与某一特定肿瘤易感性之间较为明确的关联，为肿瘤的预防和治疗提供依据。     

原发性高血压候选基因多态性的分子流行病学研究进展

原发性高血压（EH）是遗传物质与环境因素共同作用的多基因遗传性疾病,发病机制尚不明确。遗传流行病学研究表明：人群中个体血压水平的差异30％～70％归因于遗传因素,遗传背景是EH发病的重要原因。随着人类基因组单核苷酸多态性检测和分型技术的不断完善,近年来人们广泛开展EH候选基因多态性研究,以阐明EH的关键基因,从分子水平来认识其发病机制。本文主要针对近几年来研究的一些热点基因及多态性成果予以综述。     

与高脂血症相关的易感基因多态性研究进展

高脂血症(hyperlipemia,HL)是冠状动脉粥样硬化性心脏病(coronary atheroselerotic heart disease,CHD)、脑卒中等多种心、脑血管疾病最重要的危险因素之一.目前的研究普遍认为高脂血症是遗传、环境和生活方式等多因素造成的,是多个易感基因的多个单核苷酸多态性微效作用的累加,...     

直肠癌相关基因多态性及环境因素的影响因素分析

目的探讨各基因单核苷酸多态性及环境因素对直肠癌所造成的影响。方法采用病例对照研究方法,运用卡方检验、单因素及多因素非条件logistic回归分析模型对直肠癌发病的危险因素进行分析,并比较各因素对直肠癌的影响程度。结果结果显示基因XRCC194位点为杂合子A/a的人群、基因XRCC7位点为纯合子A/A型的人群以及有吸烟生活习惯的人群发生直肠癌的相对危险增加。本研究还发现XRCC194,XRCC7单核苷酸多态性与直肠癌易感性的关系不受年龄、性别及吸烟等因素的影响,说明XRCC194,XRCC7等位基因是直肠癌的独立危险因素。结论吸烟及遗传因素与直肠癌的发病有一定的关联。     

单核苷酸多态性、环境因素与肝细胞肝癌遗传易感性的关系

肝细胞肝癌(HCC)的发生和演进是一个多基因、多因素的复杂过程,是遗传与环境因素相互作用的结果。单核苷酸多态性(SNP)作为第三代遗传标记,充分反映了个体间的遗传差异,决定了个体对疾病的易感性,正成为肝癌遗传易感性研究的重要工具。     

2型糖尿病易感基因单核甘酸多态性的研究进展

2型糖尿病是多基因复杂病,具有高度遗传异质性,不同地区、不同种族人群的遗传背景不同,参与2型糖尿病发生的易感基因也不同。近年来单核苷酸多态性与2型糖尿病发病相关性研究的取得了一定的进展,但尚未发现任何一个SNP在所有人群中均与2型糖尿病相关联。本文拟就2型糖尿病相关易感基因单核苷酸多态性及其发病机制研究进展进行综述。     

与克罗恩病临床表型相关的单核苷酸多态性及其研究进展

炎症性肠病（IBD）主要包括溃疡性结肠炎和克罗恩病,近年来其发病呈上升趋势。炎症性肠病的发病机制尚不明确,研究证实遗传因素在其中起着重要作用,基因的单核苷酸多态性与IBD疾病易感性及临床表型相关,本文将对与克罗恩病临床表型相关的主要的单核苷酸多态性作一综述。     

DNA芯片技术与SNP分析

基因芯片技术作为一种新兴的生物技术，近年来得到迅速发展，其应用具有巨大的潜力。单核苷酸多态性(SNP)作为新的遗传标记对基因定位及相关疾病研究的意义亦非常重大。本文主要介绍了DNA芯片技术的原理和分类、单核苷酸多态性检测方法及DNA芯片技术在单核苷酸多态性检测方面的应用。     

非综合征型单纯腭裂遗传流行病学研究进展

单纯腭裂是一种较为常见的出生缺陷,其中非综合征型单纯腭裂（NSCPO）占50%。NSCPO是受遗传和环境共同作用的复杂疾病,与非综合征型唇裂伴或不伴腭裂（NSCL/P）不同,通过全基因组关联研究发现的与NSCPO相关的常见遗传变异相对较少。本文对NSCPO的遗传流行病学研究进展进行综述。根据现有研究证据将已发现的NSCPO候选基因分为研究证据比较充分的候选基因、具备一定研究证据的候选基因和现有研究证据较少的候选基因三类,展望了表观遗传学研究、新一代测序技术、交互作用分析在NSCPO病因探索中的应用,为进一步开展病因学研究提供线索。     

中国人群WNT代谢通路与非综合征型唇腭裂的亲源效应分析

目的 非综合征型唇裂合并或不合并腭裂（NSCL/P）是一类常见的出生缺陷,遗传致病因素一直是其病因学研究的热点。本研究拟基于家系设计在WNT代谢通路基因中探索亲源效应对NSCL/P发病风险的影响。方法 本研究人群为“唇腭裂的基因组学国际合作组研究”项目在中国地区募集的806个NSCL/P核心家系。利用对数线性模型探索WNT基因及其单体型的亲源效应与疾病的关联,采用Wald检验探索亲源效应与环境因素的交互作用。经过Bonferroni多重检验校正后,统计学检验的显著性阈值设为P<3.47×10^-4。结果 质量控制后共纳入7个基因上144个单核苷酸多态性位点进行分析。结果显示,NSCL/P家系中有8个位点具有潜在的亲源效应（P<0.05）,但经Bonferroni多重检验校正后,均未达到统计学显著性水平（P>3.47×10^-4）。NSCL/P家系中位于WNT9A rs4074668-rs12725747单体型（T-A）具有亲源效应,且经Bonferroni校正后差异仍有统计学意义（P=2.74×10^-4）。但该单体型的亲源效应与环境因素（被动吸烟、复合维生素补充）的交互作用并未达到统计学显著水平。结论 WNT代谢通路基因可能通过亲源效应影响NSCL/P的发生风险。位于WNT9A基因rs4074668-rs12725747单体型（T-A）亲源效应与NSCL/P发病风险存在显著关联。未来仍需其他独立样本验证以进一步确认WNT代谢通路在NSCL/P发生中的作用。     

胎儿唇腭裂产前诊断及预后研究现状

唇腭裂是最常见的颜面部畸形,对于该病的病因迄今尚未阐明,目前多认为该病是由于遗传、环境因素共同作用所致。中孕期通过超声、MRI等辅助检查方法可诊断胎儿唇腭裂。部分胎儿唇腭裂合并其他畸形,部分存在基因、染色体异常,影响患儿出生后生存质量及预后等,因此产前对胎儿唇腭裂的明确诊断至关重要。胎儿唇腭裂宫内手术治疗目前尚处于研究阶段,非综合征性唇腭裂(NSCL/P)患儿于婴幼儿期进行手术治疗后,多数可以康复。笔者拟就胎儿唇腭裂产前诊断及预后研究现状进行阐述,以提高临床对该病的诊治水平。     

Evidence for SNP‐SNP interaction identified through targeted sequencing of cleft case‐parent trios

Nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate (NSCL/P) is the most common craniofacial birth defect in humans, affecting 1 in 700 live births. This malformation has a complex etiology where multiple genes and several environmental factors influence risk. At least a dozen different genes have been confirmed to be associated with risk of NSCL/P in previous studies. However, all the known genetic risk factors cannot fully explain the observed heritability of NSCL/P, and several authors have suggested gene‐gene (G × G) interaction may be important in the etiology of this complex and heterogeneous malformation. We tested for G × G interactions using common single nucleotide polymorphic (SNP) markers from targeted sequencing in 13 regions identified by previous studies spanning 6.3 Mb of the genome in a study of 1,498 NSCL/P case‐parent trios. We used the R‐package trio to assess interactions between polymorphic markers in different genes, using a 1 degree of freedom (1df) test for screening, and a 4 degree of freedom (4df) test to assess statistical significance of epistatic interactions. To adjust for multiple comparisons, we performed permutation tests. The most significant interaction was observed between rs6029315 in MAFB and rs6681355 in IRF6 (4df P = 3.8 × 10^?8) in case‐parent trios of European ancestry, which remained significant after correcting for multiple comparisons. However, no significant interaction was detected in trios of Asian ancestry.     

非综合征性唇腭裂环境危险因素病例对照研究

目的分析非综合征性唇腭裂(nsCL/P)与孕早期环境暴露因素之间的关系。方法选择在贵阳医学院附属医院和广西百色市人民医院就诊的212例nsCL/P患者作为病例组,221例外伤病人和骨折病人作为对照组。采用自行设计的调查表,通过面对面询问433例研究对象的父母亲获取问卷资料,运用单因素及多因素非条件Logis-tic回归模型分析环境危险因素与非综合征性唇腭裂的关联性。结果病例组父亲和母亲具有高中及以上文化程度的比例(37.7%,27.4%)明显低于对照组(60.6%,57.0%);病例组父亲和母亲为农民的比例(77.4%,77.8%)明显高于对照组(52.5%,52.5%);在调整了父母的文化程度和职业分布影响后,多因素分析结果显示,母亲孕早期被动吸烟(OR=1.643)、母亲孕早期感染史(OR=2.741)、父亲知晓怀孕前饮酒(OR=1.793)明显增加nsCL/P的发病风险。结论怀孕夫妇在孕早期应避免烟酒等不良嗜好并注意防止感染的发生,以减少后代患唇腭裂的风险。     

RF6基因多态性与黔北人群非综合征性唇腭裂的相关性研究

目的 探讨黔北地区人群IRF6基因rs2235371和rs2235373 SNP位点的多态性及其与非综合征性唇腭裂的相关性。方法 采用PCR和测序方法对153个对照儿童和123个NSCL/P儿童的IRF6基因中2个SNP位点rs2235371和rs2235373进行扩增和测序;对样本群体进行Hardy-Weinberg平衡分析,比较2组人群的基因型频率、等位基因频率及OR分析;两位点连锁不平衡分析。结果 对照组与病例组人群rs2235371基因型均含有GG、GA和AA型,rs2235373位点均含有CC、CT和TT型。对于2个位点,对照组和病例组均符合Hardy-Weinberg平衡法则(P＞0.05)。2组人群中,rs2235371和rs2235373位点的等位基因和基因型差异均有统计学意义(P＜0.05);rs2235371位点GGvsGA的OR值(95%CI) =1.725(1.025～2.902),GGvsAA的OR值(95%CI) = 2.100(1.109～4.328);rs2235373位点CCvsTT的OR值(95%CI) = 2.263(1.348～5.015),CTvsTT的OR值(95%CI) = 2.061(1.108～2.169);(P＜0.05)。rs2235371和rs2235373位点存在连锁不平衡,GC单倍型是主要的单倍体型,对NSCL/P均有致病风险,OR值(95%CI)= 1.722(1.219～2.431), (P＜0.05)。结论 在黔北地区人群中,IRF6基因 rs2235371和rs2235373位点均具有多态性;rs2235371位点的GG基因型和rs2235373位点的CC、CT基因型与NSCL/P的发生有相关性;rs2235371和rs2235373位点存在连锁不平衡,GC单倍型对NSCL/P有致病风险。     

还原叶酸载体1基因A80G多态性与非综合征型唇腭裂的相关性研究

目的探讨还原叶酸载体(RFC)1基因A80G多态性与非综合症型唇腭裂(NSCL/P)相关性。方法收集97个核心家庭和104个对照家庭,用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性方法,进行RFC1基因A80G位点多态性检测,用人群关联研究分析、NSCL/P核心家庭的TDT、HHRR、FBAT等检验统计分析。结果人群关联研究分析,子代、父亲、母亲病例组和对照组之间基因型和等位基因的分布差异无显著性(P>0.05)。AG基因型相对于AA基因型的比值比OR(95%CI)、P值分别为子代0.87(0.44～1.70)、0.657;父亲1.09(0.54～2.21)、0.788;母亲1.63(0.79～3.36)、0.152。GG基因型相对于AA基因型的OR(95%CI)、P值分别为子代0.48(0.19～1.23)、0.094;父亲0.93(0.38～2.23)、0.850;母亲1.30(0.46～3.67)、0.584。G基因相对于A基因的OR(95%CI)、P值分别为子代1.22(0.78～1.94)、0.386;父亲1.02(0.64～1.61)、0.945;母亲0.91(0.58～1.41)、0.660。携带有突变基因G并不能增加患NSCL/P的危险。NSCL/P核心家庭分析,TDT检验中传递G等位基因给患病子代的为40次,传递A等位基因的为71次,等位基因A比突变等位基因G更易传递给患病子代(χ2=8.658,P<0.05;HHRR检验χ2=10.31,P<0.05;FBAT检验Z=2.942,P<0.05)。结论利用核心家庭资料进行统计分析的结果则认为RFC1基因A80G位点变异存在传递不平衡现象,这与NSCL/P发病危险之间存在有一定的关联关系,等位基因A可能与NSCL/P的高危显性有关系。     

新疆维、汉两民族非综合征性唇腭裂IRF6基因多态性分析

目的:探讨非综合征性唇腭裂(NSCL/P)干扰素调节因子6(IRF6)rs2013162位点单核苷酸多态性(SNP)在新疆维、汉两民族内和民族间基因型和等位基因型的频率差异。方法:抽取100例NSCL/P患者作为NSCL/P组(维吾尔族50例、汉族50例),对照组100例(维吾尔族50例、汉族50例),运用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(PCR-RELF)技术来分析IRF6基因的多态性,病例-对照研究分析两组基因型和等位基因型频率及两民族内和民族间频率的差异。结果:rs2013162位点GG基因型和等位基因G和T频率在NSCL/P组和对照组中分布差异有统计学意义(P<0.05),维、汉两民族内rs2013162位点维吾尔族中GG和TT基因型及等位基因G和T分布差异有统计学意义(P<0.05),维、汉两民族间rs2013162位点NSCL/P组中维吾尔族GG和TT基因型和等位基因G的频率均高于汉族,两民族间基因型和等位基因型分布差异均无统计学意义(P>0.05)。结论:新疆维、汉族NSCL/P与rs2013162位点GG基因型及等位基因G存在相关性。     

非综合征性唇腭裂高危因素的条件Logistic回归分析

目的探讨非综合征性唇腭裂（nonsyndromic cleft lip and palate,NSCL/P）发病的主要危险因素；筛选可能存在的保护因素，为临床预防该病的发生提供理论依据。方法采用1：1配对病例对照研究，病例组（n=76）来源于2006年9月至2007年9月在潍坊医学院附属医院、潍坊市人民医院、菏泽市立医院、烟台毓璜顶医院口腔科进行唇腭裂矫正手术的非综合征性唇腭裂患儿；对照组（n=76）来源于同一医疗机构门诊或病房，符合配对条件的非唇腭裂儿童。对病例组和对照组患儿的父母进行42项可能导致发生唇腭裂因素的问卷调查，使用条件Logistic回归，首先对病例资料进行单因素分析，然后对单因素筛选的变量结合非综合征性唇腭裂相关医学专业知识进行多因素分析，筛选主要危险因素及可能存在的保护因素。结果病例组与对照组作对照分析，进入条件Logistic回归模型的变量包括：母亲孕期感染史（P=0．010）、家族唇腭裂遗传史（P=0．009）、母亲孕期饮食是否规律（P=0．007）、胎次（P=0．004）、母亲孕期异常情绪史（P=0．000）、父亲学历（P=0．000）。结论母亲孕期情绪异常、胎次增加、母亲孕期饮食不规律、家族唇腭裂遗传病史、母亲孕期感染史，是非综合征性唇腭裂发病的促进因素；父亲学历是保护因素。     

Spatial and temporal clustering of isolated cleft lip with or without cleft palate in Poland

Background: Geographic variation in the prevalence of isolated cleft lip with or without cleft palate may be due to exogenous environmental factors or genetic variation. In this study, we aim to evaluate the prevalence of isolated cleft lip with or without cleft palate in Polish urban and rural environments in order to identify geographic areas with high prevalence (defect clusters). Methods: We use all cases of congenital malformations reported to the Polish Registry of Congenital Malformations in the years 1998–2008 from the total population of 2,362,502 births. Results: We detect a strong signal of increased prevalence of isolated cleft lip with or without cleft palate in a single region of Poland, the Dolno?l?skie voivodeship. Furthermore, we demonstrate a statistically significant prevalence differences between the urban and rural areas within this region. Through our comprehensive spatiotemporal analysis, we precisely define the cluster of the highest risk that comprises the eastern part of this voivodeship.