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相似文献
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1.
首例中国株乙型肝炎病毒D基因型全序列测定及分析   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:测定并分析1例中国慢性无症状携带者感染的乙型肝炎病毒(HBV)D基因型的全基因序列。方法:用聚合酶链式反应(PCR)扩增HBV全基因,将PCR产物克隆后对其进行核酸序列分析并与已发表的HBV毒株全列进行同源性比较;对GenBank中已发表的30株HBVD基因型毒株的全序列进行系统进行树分析。结果:该病毒全基因长3182bp,为ayw3亚型,D基因型,此毒株全基因GenBanK Accession No为AF280817,与GenBank中已发表的HBV D基因型全序列同源性为98.3%-94.5%,与已发表的A,B,C,E,F和G基因全序列同源性均小于89.5%,结论:首例中国株HBVD基因型全序列与源于瑞典的四株HBV D基因型全基因的进化距离最近。  相似文献   

2.
3.
目的 从本地樱桃谷鸭血清中克隆鸭乙型肝炎病毒(DHBV)DNA,并进行序列分析。方法 用PCR扩增DHBV全基因,连接至T载体上,挑选克隆进行测序分析,与GenBank中16株DHBV全基因组进行同源性比较,并进行分子进化树分析。结果 24-18与16株DHBV基因组比较,核苷酸同源性介于89.4%~99.3%之间,各开放阅读框氨基酸同源性比较显示差异显著地方位于P区。结论 24-18属于DHBV西方基因型中的一个亚型。  相似文献   

4.
目的 从本地樱桃谷鸭血清中克隆鸭乙型肝炎病毒(DHBV)DNA,并进行序列分析。方法 用PCR扩增HBV全基因.连接至T载体上,挑选克隆进行测序分析,与GenBank中16株:DHBV全基因组进行同源性比较,并进行分子进化树分析。结果 24-18与16株DHBV基因组比较,核苷酸同源性介于89.4%-99.3%之间,各开放阅读框氨基酸同源性比较显示差异显地方位于P区。结论 24-18属于DHBV西方基因型中的一个亚型。  相似文献   

5.
目的:研究维持性血液透析患者乙型肝炎病毒(HBV)感染基因型的分布,对HBV-DNA S基因进行同源性分析。方法:聚合酶链式反应(PCR)对乙肝表面抗原(HBsAg)阳性者进行HBV-DNA S基因扩增,双脱氧末端终止法测序,MEGA5.1软件构建系统发生树行基因型及同源性的分析。结果:HBsAg阳性率20.8%;24例样本PCR扩增出阳性产物,HBV基因型B型13例,C型11例;系统进化分析提示,2例HBV-DNA S基因进化距离0.000,相似度100%。结论:维持性血液透析者HBsAg阳性率较高,存在B、C型两种HBV基因型,2例HBV-DNA S基因同源性极高,提示为同一病毒株感染。  相似文献   

6.
目的探讨HBV的P基因耐药突变的分布特征以及与基因型、临床的相关性。方法对慢性乙肝患者的血液样本进行P基因核苷类似物作用靶区进行聚合酶链反应,扩增产物进行测序,比较序列差异性,同时对其进行基因分型检测。结果 79例乙型肝炎患者共检测出B基因型61例(79.2%),C基因型18例(20.8%)。通过对HBV-DNA进行P区测序表明耐药突变以拉米夫定耐药为主,为27例(51.9%);其中B基因型对拉米夫定和阿德福韦的耐药率分别为31.1%(19/61)和9.8%(7/61),二者交叉耐药率为6.6%(4/61);而C基因型对拉米夫定和阿德福韦的耐药率分别为44.4%(8/18)和22.2%(4/18),二者交叉耐药率为16.7%(3/18),明显高于B型基因(P〈0.05)。慢性肝炎患者中,B型显著多于C型,为89.4%(59/66);肝癌、肝硬化等重症中,B型感染者则明显少于C型感染者,为15.4%(2/13)(P〈0.05)。结论 79例患者HBV基因型以B型为主,C型次之,耐药突变主要以拉米夫定耐药为主,临床与基因型及耐药突变有显著性关联。  相似文献   

7.
目的了解中国不同地区慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染者中HBV基因型及基因亚型分布特点。方法从我国东部(山东、江苏)、西部(新疆)、南部(广东、广西)、北部(吉林、北京)及中部(河南、河北)5个地区的9个省、自治区、直辖市收集735份慢性HBV感染者血清样品,用本实验室建立的型特异性引物巢式聚合酶链反应法(nPCR)检测HBV基因型及基因亚型。结果 735份样品中,71.8%(528/735)为C型,10.3%(76/735)为B型,6.3%(46/735)为D型,11.6%(85/735)为混合型,未检测到其他基因型。528份C型样品中,C2亚型占94.0%(496/528),C1亚型占4.9%(26/528),C1+C2混合亚型占1.1%(6/528);76份B型样品中,B2亚型占90.8%(69/76),B1亚型占5.3%(4/76),B1+B2混合亚型占3.9%(3/76)。除西部新疆地区C型相对较少(31/116,26.7%)外,其他地区均以C型为主。D型主要分布在西部新疆地区,占31.9%(37/116)。混合型在各地区均有发现,但以西部和南部地区相对多见,分别占30.2%(35/116)和20.0...  相似文献   

8.
目的对广州地区无症状携带者HBV基因型分布及变异情况进行初步分析,为其科学防制提供数据支持。方法测定65例广州地区无症状携带者HBV基因组全序列,应用DNAman软件构建系统发育树,确定基因型,并应用blastn进行各基因型同源性分析。结果 65例HBV无症状携带者中检测出B基因型50例(76.9%),C基因型14例(21.5%),D基因型1例(1.6%),广州地区以B基因型流行占优势。同源性分析结果表明,相同基因型间同源性高、稳定性好。结论广州地区HBV流行以B基因型为主,相同基因型的序列间同源性高、基因稳定性好。  相似文献   

9.
目的:了解池州地区乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)B、C基因型的分布情况及其与临床指标的关系。方法:通过荧光定量PCR法测定116例乙型肝炎患者B、C基因型,并比较B、C基因型各项临床指标的关联性。结果:116例血清标本中,B基因型75例,C基因型39例,B/C混合型2例。不同基因型各临床指标差异无统计学意义(P0.05)。C基因型HBeAg阳性率为53.8%,B基因型为30.7%,差异有统计学意义(χ2=5.82,P0.05)。结论:池州地区HBV-DNA基因型分布以B型为主,C型次之;C基因型与较严重肝脏疾病的发生有关。  相似文献   

10.
一株TT病毒中国分离株结构区全基因的克隆及序列测定   总被引:8,自引:0,他引:8  
目的 克隆和序列测定TT病毒(TTV)中国分离株全国基因。方法 采用长片段PCR技术从一例临床非甲-非庚型肝炎病人血清中扩增TTV全基因,获得3个互相重叠的片段,分别为199、3269和434bp。用标准分离子生物学方法测定这3个片段的序列,从而得到全长TTV基因序列。结果 TTV中国分离株全基因长3739个核苷酸,含两个开放读码框架。第一个ORF位于589至2901位核苷酸,编码770个氨基酸;  相似文献   

11.
目的:探讨长春地区慢性乙型肝病患者中乙型肝炎病毒(HBV)基因型特点。方法:慢性乙型肝病患者血清中提取HBV DNA,经巢式聚合酶链法(nested-PCR )扩增HBV S基因区片断,利用双脱氧链末端终止法检测HBV S区核苷酸序列并进行基因型分析。结果:39株HBV中C基因型23株,其中16株为C基因型adr亚型,7株为C基因型adw亚型;16株为B基因型adw亚型; 未发现ayr及ayw型;有2株存在“a”决定簇变异;与参照序列比较,S基因存在多处点突变,部分 点突变导致所编码的氨基酸变异;同以往研究的结果类似,未发现癌特异性的HBV S基因变异。结论:研究对象中HBV存在C基因型和B基因型, C基因型为主要基因型;HBV相关性慢性肝病患者中HBV S基因存在序列多态性。  相似文献   

12.
目的探讨拉米夫定对B、C基因型乙型肝炎(乙肝)患者治疗作用。方法观察未用、使用拉米夫定治疗的慢性乙肝患者随时间延长血清病毒标志物HBV DNA水平、HBeAg血清转换率及随拉米夫定疗程延长乙肝病毒聚合酶及转录酶区酪氨酸-蛋氨酸-门冬氨酸-门冬氨酸基序(HBV YMDD)耐药变异率等的变化,对比分析拉米夫定抗病毒治疗对B、C基因型乙肝患者的病毒抑制效应。结果(1)未用拉米夫定治疗的乙肝患者, B基因型者HBV DNA水平低于C基因型者,而自发HBeAg血清转换率高于C基因型者。(2)使用拉米夫定治疗的乙肝患者,B、C基因型者之间HBV DNA水平、HBeAg血清转换率及YMDD变异率没有明显差异。(3) B、C基因型患者均随拉米夫定疗程延长HBV DNA水平下降,HBeAg血清转换率增加,但YMDD变异率也增加。结论(1)未用拉米夫定治疗的自然状况下C基因型乙肝患者携带的乙肝病毒复制能力强于B基因型患者者且不易清除。(2)使用拉米夫定疗程相同时B、C基因型患者之间拉米夫定的病毒抑制效应及HBV YMDD耐药变异率相似。(3)C基因型HBV感染的乙肝患者及早使用拉米夫定抗病毒治疗意义更大。  相似文献   

13.
慢性乙型肝炎病毒基因型与血清病毒载量的关系   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的探讨徐州地区慢性乙型肝炎(CHB)患者血清中乙型肝炎病毒(HBV)基因型与病毒载量的关系。方法采用型特异性引物多重PCR方法对徐州地区160例CHB患者的HBV进行基因分型,用荧光定量PCR方法检测HBVDNA水平。结果B型14例(8.7%),C型88例(55.0%),BC混合型51例(31.9%),未分型7例(4.4%),未发现A、D、E、F型。不同基因型之间HBVDNA载量无明显差别。结论徐州地区CHB患者中HBV基因型主要是C型和BC混合型,感染的HBV基因型与血清病毒载量之间无明显相关。  相似文献   

14.
目的 了解成都市乙型肝炎病毒(HBV)基因型分布特点,探讨HBV基因型与疾病临床表现的相关性.方法 随机选择成都市HBV感染者422例,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性法(PCR-RFLP)鉴定HBV基因型.结果 HBV/B基因型366例占86.7%(366/422),HBV/C基因型53例占12.6%(53/422),HBV/D基因型3例占0.7%(3/422).B、C基因型感染者相比,HBeAg、抗-HBeAg阳性率及HBV DNA水平的差异均无统计学意义(P>0.05),C基因型感染者更易发生肝硬化(P=0.004)及肝细胞癌(P=0.029).结论 成都市HBV感染者所携带的HBV存在B、C、D 3种基因型,以B型为主,其次c型,D型最少;C基因型感染者更易发生较严重的肝脏疾病,如肝硬化及肝细胞癌.  相似文献   

15.
目的:分析乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)阿德福韦酯耐药株的基因序列。方法:从已发生阿德福韦酯临床耐药的慢性乙型肝炎患者血清中提取HBV DNA,设计保守引物,采用高保真聚合酶对耐药株HBV DNA进行全序列扩增,通过克隆技术构建PGEM-HBV重组质粒,测序后进行序列分析。结果:获得阿德福韦酯耐药的HBV DNA全长序列克隆,序列长度为3261 bp,序列分析发现在逆转录区有rtA181V位点突变。结论:阿德福韦酯耐药株HBV DNA全长序列克隆的成功构建,为阿德福韦酯临床耐药性研究提供参考。  相似文献   

16.
目的:研究广东地区乙型肝炎病毒基因型分布情况,B、C 基因型与乙型肝炎患者临床表现之间的关系。方法:回顾性分析172例慢性乙型肝炎病毒患者[慢性乙型病毒性肝炎(CHB)、乙型肝炎后肝硬化(LC)、原发性肝癌(HCC)]的乙型肝炎病毒基因分型结果,并根据基因分型结果进行分组,比较 B、C基因型患者的临床表现、HBeAg 定性、HBV-DNA 定量、ALT 及 AST 结果。结果:172例患者的乙肝病毒型分别为 B 型94例(54.7%)、C 型69例(40.1%)、D 型3例(1.7%)、未分型6例(3.5%);C 型在 LC 组、HCC组中的比例与 CHB 组比较,差异有统计学意义(P﹤0.05);C 型的 HBeAg 阳性率高于 B 型(P﹤0.05);B、C型两组的 ALT、AST 差异有显著统计学意义(P﹤0.01);两组基因型间 HBV-DNA 水平的差异无统计学意义(P﹥0.05)。结论:广东地区 HBV 感染以 B、C 基因型为主,以 B 型居高;C 基因型肝功能损害更严重,发展为肝硬化、肝癌的可能性更大,感染不同 HBV 基因型与 HBV-DNA 水平无明显相关。  相似文献   

17.
目的:了解重庆地区乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)基因型的分布情况并进行精确定量分析。方法:采用荧光分型定量聚合酶链反应法(Real-time genotyping and quantitative PCR,GQ-PCR)对收集的血清标本进行HBV基因分型并定量。结果:152株血清标本成功分型148株(97.37%),其中B基因型109例(男88例、女21例)[定量值范围4~12 log10copies/ml、均值和标准差(7.94±1.44)log10copies/ml]、C基因型10例(男6例、女4例)[定量值范围5~10 log10copies/ml、均值和标准差(8.12±1.64)log10copies/ml]、基因B+C混合型29例(男24例、女5例)[定量值范围4~10 log10copies/ml、均值和标准差(7.45±1.59)log10copies/ml]。检出率分别为73.65%(男74.58%、女70.00%)、6.76%(男5.08%、女13.30%)、19.59%(男20.34%、女16.70%)。结论:重庆地区HBV优势基因型以B型和B+C混合型为主,...  相似文献   

18.
乙型肝炎是全球性传染病,严重危害人类的健康,乙型肝炎病毒(HBV)基因型是影响HBV感染者预后的重要原因之一,因此作者就HBV基因型研究概况及其临床意义的相关性进行扼要的综述。  相似文献   

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