类风湿关节炎易感基因的全基因组关联分析研究进展

类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)是一种炎性侵润关节及其周围结缔组织的系统性自身免疫疾病,也是一种具有复杂遗传模式的多基因遗传病。环境因素和遗传因素共同影响RA的发生、发展。它的易感基因研究给临床的诊断、治疗提供了理论基础。新兴的全基因组关联分析作为寻找易感基因的高通量技术,是发现多基因遗传性疾病包括RA易感基因的强大工具。它不仅能够验证已有的易感基因位点,还能够发现新的候选易感位点。近5年来,用全基因组关联分析研究易感基因取得了很多新的进展,为探明RA的发病机制和治疗RA提供了新的契机。本文就近年来全基因组关联分析技术研究RA易感基因的进展做一综述。     

原发性高血压的易感基因

原发性高血压(EH)是遗传因素和环境因素相互作用引发的复杂疾病,明显的家族聚集现象、同卵双生子发病一致性等研究结果,揭示了EH的多基因遗传性质。鉴定EH易感基因不仅有助于阐明其病因学,也有助于探索预防途径和研制新的治疗药物。本文主要介绍EH易感基因研究策略和已发现的基因变异;分析EH易感基因研究存在的问题和理想样本选择对成功鉴定EH易感基因的作用。     

高血压易感基因位点定位成功

最近 ,由国家人类基因组南方研究中心、复旦大学遗传学研究所和上海市高血压研究所等多家单位联合组成的课题组成功定位了一处高血压易感基因的精细位点。此项研究宣告了我国多基因疾病的研究实现零的突破。人类基因疾病可分为单基因疾病和多基因疾病。与单基因疾病相比 ,多基因疾病涉及的易感基因数量多 ,发病原理也更为复杂。对引起多基因疾病的易感基因的定位和克隆 ,已成为当前国际上疾病基因组学研究的重点。高血压是人类心脑血管疾病中危害最大的一种多基因疾病 ,目前世界各国的科学家都在竞相寻找引起高血压的易感基因。我国科研人员…     

乳腺癌易感基因研究现状

近年来,乳腺癌的发病率明显上升,并呈年轻化趋势。越来越多证据表明,遗传因素对于乳腺癌的发生发展至关重要。通过候选基因、基因连锁分析等策略,已发现很多乳腺癌易感基因,并根据易感基因在人群中的分布频率和患病风险,将这些易感基因分为高、中、低外显率易感等位基因3大类。随着分子生物学技术不断发展,全基因组相关分析策略筛查疾病易感单核苷酸多态性位点已成为乳腺癌基础研究的热点,大量的乳腺癌易感基因和单核苷酸多态性易感位点得以发现,这有利于从分子水平了解乳腺癌的发生与发展,对认识乳腺癌发病机制及筛查高危易感人群具有极为重要的意义。     

银屑病易感基因的研究进展

多数研究认为银屑病是一个多基因,主要涉及MHC（人类HLA）的遗传性皮肤病,并在八个染色体上确定了九个银屑病易感基因位点（PSORS1-9）。PSORS1（银屑病易感基因位点1）是一个主要的银屑病易感位点,大多数的研究显示HLA-Cw6是PSORS1候选区域主要的危险等位基因。本文主要介绍PSORS1及HLA中重点研究的银屑病相关等位基因的研究进展,并简要概括其他银屑病易感基因位点的研究发现。     

疾病易感基因研究样本量的确定

目的：探讨疾病易感基因研究样本量的确定。方法：计算在不同参数时的样本大小，分析各参数对样本大小的影响和变化规律。结果：主要影响样本大小的参数为易感基因频率、环境因素暴露率、基因遗传方式，而疾病的发生率对样本量影响很小。易感基因频率小于30％时隐性遗传研究样本量大，而大于30％则显性遗传研究样本量大。结论：疾病易感基NN究样本量的计算取决于各参数对拟合回归模型的影响。     

结核病易感性的研究进展

大量的遗传学研究表明,结核病是多基因和环境因素共同作用的结果。近年来,结核病易感基因及其单核苷酸多态性(SNP)位点研究成为热点,但与易感性有确切关联的基因和SNP报道较少,并且某些易感基因有种族、人群、地域分布的差异,不同种群或地区的局部研究得到的研究结论常不一致,甚至相反,因此,需要进一步寻找能广泛适用的、有确切关联的易感基因。鉴于此,需要在具备基因多样性的实验动物中进行初筛,然后在动物或人群中验证。协同杂交(Collaborative Cross,CC)小鼠具有遗传多样性并且有清晰的背景基因数据库,可为结核易感性研究提供新的工具。本综述总结已报道的结核易感基因及其SNP的研究进展,展望CC小鼠在此研究的应用和重要意义。     

撒丁人群中HLA区域内基因位点间的相互作用影响多发性硬化症的病程

先前的研究发现撒丁人群中HLA基因位点与多发性硬化症（MS）有关，本研究在835例复发型（R）和100例原发进展型（PP）患者中探讨等位基因对临床病程的影响。对易感基因0301或不相关的DPB1等位基因、易感的或不相关的DRB1-DQB1单体型、既易感又不易感以及负相关的和非负相关的D6S1683等位基因进行多变量分析，并将其相互作用考虑在内。患者个体内的分析显示，易感或保护性D6S1683等位基因的存在与易感基因DP0301间的相互作用调节PP的患病风险。上述发现提示HLA-Ⅰ类基因末端的基因位点影响DPB1基因位点而调节疾病的病程。     

结核病易感基因研究进展

核苷酸多样性可能影响结核杆菌感染者的免疫调节,导致个体对于结核的易感性产生差异。近年来有大量关于宿主遗传因素与结核易感性关联的研究,有多个易感基因被发现,如HLA基因、SLC11A1基因、VDR基因、MBL基因、NOS2A基因、SP110基因、P2X7基因等,这些易感基因的发现和研究,不仅更全面地揭示结核病的发病机理,对于建立和健全结核病预防和控制措施也起到不可忽视的作用。本文对过往研究中的结核易感基因的特点、作用机制作一综述,希望对于结核病的防治实践有指导意义。     

中国皮肤遗传病研究现状

目前因遗传导致的皮肤病有300多种,其中170多种单基因皮肤病已确定致病基因,近100多种单基因皮肤病和多基因皮肤病已经基因定位.近几年来我国皮肤遗传病研究也取得了飞速发展,如发现家族性多发性毛发上皮瘤和原发性红斑肢痛症的致病基因,成功进行了汉族人群银屑病和白癜风易感基因的定位,为搜寻其易感基因奠定了坚实基础.     

溃疡性结肠炎的基因多态性研究进展

溃疡性结肠炎(UC)是一种病因尚不明确的直肠和结肠的慢性非特异性炎症性疾病。遗传因素在UC的发病中有一定的作用,大多数调查发现UC在血缘家族的发病率较高,血缘关系越近,发病率越高。近年来,UC基因多态性研究已成为热点,UC的发病是多基因参与、作用于免疫系统和靶器官的疾病。对UC基因组多态性的研究发现其存在许多易感基因,现就UC易感基因及新发现易感基因的多态性进行综述。     

SA基因与原发性高血压的关系

原发性高血压(essential hypertension,EH)是受环境因素影响的多基因病,遗传因素或曰易感基因对EH的发生起着基础性的允许作用.因此,识别EH易感基因是阐明其发病机制、制定新的防治策略的关键.目前已发现了50多个EH相关基因,但仍没有准确识别出任何一个EH易感基因.近年来,SA基因这一新的EH侯选基因引起了一些学者的高度重视,可望成为EH易感基因之一.     

2型糖尿病易感基因的遗传定位

随着人类基因组计划的逐步完成 ,疾病基因的定位及功能的研究已经成为当代医学研究的热点和难点 ,尤其是诸如2型糖尿病 (ＤＭ)这类复杂性疾病的易感基因的定位已成为可能。近年来 ,与 2型糖尿病易感基因位点相关区域的报道逐渐增多 ,如 :2 0 ｑ12～ 2 0ｑ13.1[1] 、2 ｐ13[2 ] 、1ｑ2 4～ 1ｑ2 5 [3 ] 、8ｐ2 1～ 2 2 [3 ] 、9ｑ[4] 、12 ｑ[5] 等等。本文主要讨论 2型糖尿病易感基因定位的策略、方法以及相关位点的一些研究现状。1　 2型ＤＭ易感基因定位策略和方法2型ＤＭ易感基因定位研究总的策略是应用已知遗传标志在患者或者患者家系中…     

精神分裂症全基因组关联研究进展

精神分裂症属于多基因复杂遗传病,对其易感基因的研究策略主要包括传统的候选基因策略和新兴的全基因组关联研究(Genome-Wide Association Study,或者Whole-Genome Association Study,GWA).候选基因研究常难以彼此重复或验证,应在严格纯化样本临床表型基础上,突破单个候选基因关联研究思路,从全基因组范围内筛选易感基因.本文简要介绍了GWA的研究内容、研究设计方法以及近两年来其在精神分裂症研究领域的主要进展;总结了GWA在精神分裂症研究中的优势和不足;并对未来的工作重点和待解决的问题进行了展望.     

Tag SNPs在鉴定肿瘤易感性基因研究中的应用

以标签单核苷酸多态性(Tag SNP)为基础的关联研究是鉴定肿瘤易感基因的重要策略,有效地获取和利用Tag SNPs成为肿瘤易感基因领域研究的热点之一.作者对Tag SNPs的获取、检测及其在肿瘤易感性研究中的应用作一综述.     

单核苷酸多态性在复杂性状疾病易感基因研究中的应用

大多数常见病都是一些复杂性状的遗传病,致病机制是由多个遗传易感基因与环境因素相互作用所致.目前认为一些常见的遗传变异,主要是指单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)与复杂性状疾病的易感有关.本文在以下几个方面对SNPs与复杂性状疾病易感基因研究的策略和方法学问题作了较为详细的综述:(1)SNP特点及其有关网上资源;(2)对直接测序法、单碱基延伸法、TaqMan法、基于实时动态荧光(动力学)PCR的等位基因特异扩增法,变性高效液相色谱(DHPLC)法和OLA/PCR 的SNPs基因分型方法的原理、通量和优缺点进行了比较;(3)SNPs与复杂性状疾病易感基因关联研究的策略.     

2型糖尿病相关基因的研究进展

<正>2型糖尿病是一种多基因遗传性疾病,其遗传表现型具有很大的异质性,寻找2型糖尿病的易感基因一直是人类基因研究的主要任务。目前,研究2型糖尿病易感基因的策略有以下几种:(1)定位克隆策略,以微卫星为遗传标记,通过遗传连锁分析,将2型糖尿病易感基因定位在特定的染色体区域,然后再通过不断缩小定位区域并最终克隆该基因,进     

中国人群冠心病相关基因的精细定位研究

目的：全基因组关联研究（genome?wide association studies,GWASs）已发现了多个冠心病（coronary heart disease,CHD）易感区域。然而,这些易感区域内的致病基因和真正致病位点尚不清楚。本研究旨在通过对报道的易感区域进行靶向测序来鉴定CHD相关基因和变异。方法：基于GWAS Catalog数据库筛选满足GWAS显著水平的CHD易感位点,经过多个数据库评估和基因功能检索,系统筛选了19个CHD易感区域内的关键基因。针对上述易感基因,在192例中国人群冠心病患者和192例健康对照中进行捕获测序。通过Logistic回归和计数法评估常见、罕见变异与CHD发生之间的关联。对于鉴定的CHD相关变异,采用功能注释和表达数量性状（eQTL）分析来评估其潜在的生物学功能。结果：5个常见变异关联P值<0.05,功能注释表明其中rs12970与心血管组织中APOA1表达增加显著相关。鉴定了3个功能性罕见变异：WDR35 rs139543775、KLHDC10 rs60941031、CTSH rs3129。结论：通过在GWAS报道的区域中进行精细定位研究,为CHD遗传研究提供了新线索,但是仍需进一步大样本研究和功能实验来验证。     

基于多因子降维法的肺结核易感基因-基因交互作用研究

目的 分析宁夏银川地区肺结核易感基因间的交互作用.方法 结合前期病例对照研究结果(PCRRFLP法检测肺结核易感基因MCP-1、CCR2、VDR、NRAMP1-3'UTR、NRAMP1D543N、NRAMP1INT4及MBLG54A分型,银川地区肺结核病例271例,健康对照299例),运用MDR法分析肺结核易感基因-基因交互作用模型.结果 有统计学意义的最佳交互模型包含VDR基因和CCR2基因,该模型的检验样本准确度为0.6248,交叉验证一致性的结果为10/10.结论 VDR基因和CCR2基因可能协同增强了宿主对结核杆菌的易感性,从而增加了宿主肺结核病的患病风险.     

全基因组关联研究在冠心病中的研究进展

目前认为冠心病( CAD)是一种由多因素交互作用的慢性复杂性疾病,是危害人类健康的重大疾病之一,对CAD遗传机制的研究一直备受关注。近些年,全基因组关联研究( GWAS)的引入使CAD易感基因的研究更加快速、可靠,世界各地的医学研究者应用此研究策略已成功发现了多个CAD遗传易感基因或易感位点。现就近些年 GWAS 的进展、面临的挑战及其发展趋势进行阐述。