骨痹方治疗膝骨关节炎的网络药理学机制探讨

目的通过网络药理学探究骨痹方治疗膝骨关节炎(Knee Osteoarthritis,KOA)的药理学机制。方法通过Disgenet数据库搜集KOA靶点;通过TCMSP、TCMID数据库搜集骨痹方各成分作用靶点,使用Cytoscape软件构建成分-靶点网络分析骨痹方的重要成分。借助Genomics平台分析骨痹方和KOA共有靶点,并利用STRING平台构建共有靶点互作网络(Protein-Protein interaction network,PPI network)预测KOA潜在治疗靶点。在Systems Dock WebSite在线平台对重要成分和潜在靶点进行分子对接评估其结合活性。最后,利用Cytoscape软件"ClueGo插件"分析共有靶点KEGG信号通路并构建成分-靶点-通路网络进行可视化分析。结果共筛选出92个KOA靶点;骨痹方共有66种成分,263个靶点。骨痹方重要成分包含槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇和刺芒柄花素等。其中,共有靶点17个,潜在治疗靶点可能有IL-6、TNF、PTGS2。分子对接显示槲皮素、山柰酚和β-谷甾醇与潜在治疗靶点具有较强的结合能力。KEGG通路富集分析提示共有靶点参与IL-17信号通路、TNF信号通路和NF-κB信号通路等22条通路。结论骨痹方中槲皮素、山奈酚和β-谷甾醇等成分很可能通过IL-6、TNF、PTGS2等靶点作用于IL-17信号通路、TNF信号通路和NF-κB信号通路,发挥治疗KOA的作用。故骨痹方治疗KOA的药理学机制可能是通过多组分、多靶点、多通路实现,但需进一步通过基础和临床研究验证。     

温通膏治疗膝骨关节炎的网络药理学分析

目的 基于网络药理学方法探讨温通膏（补骨脂、续断、干姜等）治疗膝骨关节炎（KOA）的潜在作用机制。方法 利用中药系统药理学分析平台（TCMSP）和BATMAN-TCM数据库筛选温通膏的活性成分及其作用靶点;利用GeneCards、OMIM和DisGeNet数据库检索KOA疾病相关靶点;通过Venny 2.1.0在线平台对温通膏的活性成分作用靶点与KOA疾病相关靶点映射取交集,即得温通膏治疗KOA的关键靶点（共同靶点）;将共同靶点导入STRING平台构建蛋白相互作用（PPI）网络;利用Cytoscape 3.8.0软件构建“活性成分-关键靶点”网络;将共同靶点导入DAVID数据库,进行GO功能及KEGG通路富集分析,并利用Cytoscape 3.8.0软件构建“关键靶点-信号通路”网络。结果 共筛选得到103个活性成分及其作用靶点共348个;得到温通膏治疗KOA的关键靶点（共同靶点）147个;PPI网络分析得到AKT1、TNF、IL6、TP53、IL1B、VEGFA、JUN等核心靶点;槲皮素、β-谷甾醇、山柰酚、豆甾醇等活性成分可能是温通膏治疗KOA的核心成分;GO功能富集分析得到612...     

基于网络药理学和分子对接技术探析通痹健骨方治疗膝骨关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术探析通痹健骨方治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制,并进一步运用细胞实验进行验证.方法:依据中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出通痹健骨方活性成分及其对应的靶点;通过检索GeneCards数据库,在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)及DrugBank数据库获取KOA靶点;将...     

芪苓温肾消囊方化学成分及其治疗多囊卵巢综合征的作用机制分析

目的 系统分析芪苓温肾消囊方（QLWS）方的化学成分,探讨该方治疗多囊卵巢综合征（PCOS）的关键活性成分及作用机制。方法 结合对照品比对和文献及数据库,采用超高效液相色谱-四级杆-飞行时间串联质谱法（UPLC-Q-TOF/MS^E）对QLWS方化学成分进行系统分析与鉴定。采用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）及SwissADME平台筛选活性成分并进行网络药理学分析。通过SwissTargetPrediction、GeneCards、疾病相关基因与突变位点数据库（DisGeNET）、DrugBank等数据库获取该方治疗PCOS的潜在成分及靶点。借助STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络筛选核心靶点。利用DAVID数据库对核心靶点进行基因本体（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。运用MOE 2019进行分子对接。结果 从QLWS方中鉴定成分90个,经筛选得到32个活性成分和45个核心靶点。GO功能富集分析共得到429个条目,KEGG通路富集分析共得到110个条目,主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B（PI3K/Akt）信号通路、雌激素信号通路、缺氧诱导因子-1（HIF-1）信号通路等。分子对接结果显示QLWS方中的关键活性成分淫羊藿苷、丹酚酸A/B/C、汉黄芩素、木兰花碱等可能通过调节促分裂原活化的蛋白激酶1（MAPK1）、表皮生长因子受体（EGFR）、促分裂原活化的蛋白激酶3（MAPK3）等靶点发挥治疗PCOS的作用。结论 该研究基于液质联用技术及网络药理学技术初步预测了QLWS方中多个活性成分通过作用于多靶点、多通路治疗PCOS,为阐明全方的药效物质基础及作用机制研究提供思路与参考。     

基于网络药理学探讨四二五合方治疗卵巢早衰的作用机制

目的 探讨四二五合方治疗卵巢早衰的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台数据库（TCMSP）获取四二五合方各中药的活性成分及靶点;通过OMIM、DRUGBANK、Gencards数据库筛选卵巢早衰主要靶点并整合,将四二五合方与卵巢早衰靶点取交集,利用Metascape平台分析交集靶点的生物过程及通路,运用Cytoscape 3.8.2软件构建“四二五合方成分-靶点-通路”网络。结果 四二五合方治疗卵巢早衰的核心活性成分为槲皮素、木犀草素等,核心靶点有PTGS2、NCOA2、PGR、HSP90AA1、PTGS1等。四二五合方治疗卵巢早衰的生物学通路主要作用于癌症通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、癌症中的蛋白多糖、IL-17信号通路、麻疹、细胞凋亡、HIF-1信号通路等。结论 四二五合方可以通过多成分、多靶点、多通路治疗卵巢早衰。     

基于网络药理学探讨通窍活血汤治疗颅脑损伤的作用机制

目的：基于网络药理学探讨通窍活血汤治疗颅脑损伤(TBI)的作用机制。方法：通过检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库筛选出通窍活血汤潜在活性成分及靶点,采用GeneCard与OMIM数据库获得颅脑损伤疾病靶点,得到通窍活血汤的中药与TBI的交集靶点,使用Cytoscape 372软件绘制活性成分靶点疾病交互网络图。采用String数据库构建靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）信号通路富集分析。结果：筛选后收集得所有中药成分127个,收集疾病靶点1 811个,疾病与药物交集靶点共62个。PPI网络提示核心靶点为ALB、IL6、CASP3、EGFR、VEGFA等;GO功能注释得到73条富集结果,包括DNA结合转录激活剂活性,RNA聚合酶Ⅱ特异性等,富集得到PI3K-AKT等75条核心的KEGG通路。结论：通窍活血汤治疗颅脑损伤具有多成分、多靶点、多通路的作用机制特点。     

基于网络药理学和分子对接研究三仁汤治疗肺癌的分子机制

目的：采用网络药理学方法筛选三仁汤君药药对（SRJMP）的活性成分及核心靶点,探讨三仁汤君药药对治疗肺癌的作用机制。方法：依托中药系统药理学分析平台（TCMSP）,检索三仁汤 3 味中药相关的所有化学成分及预测作用靶点,采用STRING 数据库与 Cytoscape 软件构建“药物-活性成分-靶点”网络和蛋白互作网络,通过 ClusterProfiler、ClueGO、DAVID 数据库对核心靶点进行基因本体（GO）分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集。把候选作用靶点映射在 KEGG 通路图上分析结果,最后应用 AutoDock 软件进行分子对接。结果：共筛选出 40 个活性成分和 222 个相应蛋白靶点。首要分析核心靶点47 个,GO 分析共包含 117 条富集结果,KEGG 通路富集筛选出 30 条通路。结论：通过网络药理学验证了 SRJMP 多成分、多靶点、多通路的特点,其可能是通过调控免疫细胞分化,肿瘤相关信号通路以及干预细胞代谢过程,达到抗肿瘤作用。     

基于网络药理学研究补肾方治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的：基于网络药理学方法分析补肾方治疗阿尔茨海默病的作用靶点及信号通路,阐明其可能的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）和中药分子机制生物信息学分析工具（BATMAN-TCM）检索补肾方的化学成分、作用靶点,运用Uniprot数据库查询靶点对应基因,利用GeneCards数据库收集阿尔茨海默病作用靶点,使用Venny 2.1将补肾方作用靶点与阿尔茨海默病作用靶点取交集,通过String平台构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。采用Metascape进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。通过Cytoscape 3.7.1软件进行可视化分析。结果：从补肾方4味中药材中筛选获得45个化合物和相应靶点397个。将补肾方主要活性成分调控靶点与阿尔茨海默病的靶点取交集共获得48个关键靶点。共得到1 077生物过程（P<0.01）,128条信号通路（P<0.01）。结论：补肾方作用于阿尔茨海默病核心靶点有AKT1、IL-6、CASP3、TNF、TP53。这些靶点共同参与IL-17信号通路、流体剪切应力与动脉硬化信号通路、HIF-1信号通路、血清素能突触通路、胰岛素抵抗通路发挥下调神经炎症反应、改善血管神经功能障碍、防止蛋白质错误折叠、影响神经递质、调节细胞代谢及线粒体功能等作用,并可以在疾病早期、通路上游进行干预,可能是补肾方治疗阿尔茨海默病的潜在机制。     

基于网络药理学探讨苍耳子治疗白癜风的作用机制

目的：基于网络药理学分析的方法探讨苍耳子对于白癜风的作用机制及关键靶点。方法：通过检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）探讨苍耳子的主要活性成分,活性成分靶点基因通过Pub Chem/Uniprot数据库检索;根据Dis Ge NET/Gene Cards数据库检索白癜风相关基因,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,进行关键靶点的基因本体论（GO）富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选获得苍耳子的主要活性成分有6个,检索到白癜风疾病靶点395个,二者共有5个交集基因。结论：苍耳子治疗白癜风主要机制可能是其中的甾醇类化合物作用于氮新陈代谢通路、蛋白多糖和内分泌抵抗通路、松弛素信号通路以及胆汁酸分泌以及雌激素信号通路等信号通路,调控有机物的定位,通过一系列生物学过程来发挥对白癜风的治疗作用。     

淫羊藿治疗骨质疏松骨折的网络药理学分析

目的 利用网络药理学原理探讨淫羊藿治疗骨质疏松骨折的分子作用机制。方法 利用中药系统药理学分析平台（TCMSP数据库）筛选淫羊藿的主要活性成分和作用靶点,应用GeneCards数据库、OMIM数据库、PharmGkb数据库、TTD数据库、DrugBank数据库预测骨质疏松骨折的相关靶点,制作维恩图获取淫羊藿与骨质疏松骨折的共同靶点,运用Cytoscape软件绘制中药-成分-疾病-靶点调控网络,利用STRING数据库进行蛋白相互作用网络的构建与分析。最后,使用R语言和Bioconductor平台进行基因本体富集分析（GO）和基因相互作用通路分析（KEGG）。结果淫羊藿主要是通过23种活性成分、121个作用靶点及155个生物学通路发挥作用治疗骨质疏松骨折。其中主要活性成分为槲皮素、山奈酚和木犀草素;主要核心靶点有AKT1、TP53、Jun、HSP90AA1和CASP3等;关键通路为脂质和动脉粥样硬化信号通路。结论 通过网络药理学揭示了淫羊藿通过多成分、多靶点、多通路治疗骨质疏松骨折的作用特点,为进一步的研究和实验工作提供了基础。     

基于网络药理学研究五苓散治疗慢性肾衰竭的潜在机制

目的：基于网络药理学方法,研究五苓散治疗慢性肾衰竭的机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索五苓散活性成分,使用有机小分子生物活性（PubChem）数据库、瑞士生物信息学研究所(SIB)数据库进行靶点排查。根据GeneCards数据库得到疾病相关靶点。并利用Omicshare平台将药物及疾病靶点进行匹配。采用String Version 10.5数据库构建靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。利用Omicshare软件对关键靶点进行基因本体（GO）富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。采用CytoscapeVersion3.8.0对药物-成分-靶点-信号通路进行分析。结果：筛选得到五苓散活性成分532个,治疗靶点112个,五苓散治疗疾病的主要活性成分包括啤酒甾醇（Cerevisterol）,β谷甾醇（β-sitosterol）,泽泻醇（Alisol B）等;治疗疾病的核心靶点包括肿瘤坏死因子-α（TNF-α）、白细胞介素-6（IL-6）等;主要涉及的信号通路包括Toll-like Receptor（TLR）、T Cell Receptor（TCR）等,生物过程主要包括细胞凋亡过程、磷酸盐代谢过程等。结论：本研究以网络药理学方式探究了五苓散治疗慢性肾衰竭的多途径-多靶点的作用机制,推断五苓散主要通过调节TLR／NF-κB、T Cell Receptor等信号通路,抑制TNF-α、IL-6等相关炎症介质活性从而延缓慢性肾衰竭。为进一步的实验提供理论参考。     

基于网络药理学及分子对接研究苦参治疗慢性乙型肝炎的作用机制＊

目的 本研究通过网络药理学及分子对接方法研究苦参治疗慢性乙型肝炎的物质基础与分子机制。方法 依据中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）筛选苦参有效化学成分及靶点基因。检索GeneCards数据库及OMIM数据库获取慢性乙型肝炎（CHB）相关靶点基因。采用Cytoscape3.7.2构建苦参治疗CHB的“相关活性成分-潜在作用靶点”网络并进行拓扑结构分析，利用STRING平台进行蛋白质相互作用分析，构建PPI网络，通过R 3.6.2进行基因富集分析。依据AutoDock vina将关键活性成分与核心靶点进行分子对接。结果 获得苦参治疗CHB的相关活性成分23个，潜在作用靶点97个。网络分析结果提示苦参可能通过作用于IL-6、ESR1、AR、RELA、PPARG和CASP3 6个核心靶点及相关通路以达到治疗CHB的目的。分子对接预测结果提示关键活性成分与核心靶点稳定结合。结论 本研究初步揭示了苦参治疗慢性乙型肝炎多成分、多靶点、多通路的作用机制，为苦参的临床开发提供基础。     

基于网络药理学和分子对接技术的银柴胡解热作用机制探讨

目的：采用网络药理学与分子对接技术探讨银柴胡解热作用的机制。方法：借助中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、中医药整合药理学研究平台（TCMIP）和中药分子机制生物信息学分析工具（BATMANTCM）筛选银柴胡活性成分和相关作用靶点;使用GeneCards、OMIM和TTD数据库筛选发热相关靶点;通过STRING数据库构建活性成分靶点与发热疾病靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络;利用Cytoscape软件的Network Analysis插件对获得的PPI网络进行拓扑分析,筛选核心节点;使用Venny软件获得银柴胡活性成分靶点、发热疾病靶点和核心节点的交集靶点,并通过进一步的拓扑分析筛选得到关键成分和关键靶点;通过DAVID数据库进行基因本体（GO）功能注释和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析;利用Schr?dinger软件对关键靶点与对应的关键成分进行分子对接。结果：银柴胡解热关键成分为银柴胡胺D和银柴胡新木质素-β-D-葡萄糖苷A～D,71个关键靶点主要包括促丝裂原活化蛋白激酶10 (MAPK10)、蛋白激酶B1 (Akt1)、热休克蛋白90AA1(HS...     

基于网络药理学和分子对接探讨枸杞子治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的：基于网络药理学方法及分子对接研究枸杞子治疗阿尔茨海默病（AD）的作用机制。方法：采用网络药理学方法,通过检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）,GeneCards、NCBI基因数据库及OMIM数据库,筛选枸杞子治疗AD的相关靶点,通过构建韦恩图,得到枸杞子-AD共同靶点,运用STRING数据库构建二者靶点蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图,并且运用Cytoscape 3.8.0软件进行可视化处理,筛选关键基因,同时对药物-疾病共有靶点进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）,并使用AutodockTools1.5.6进行分子对接,验证靶点与小分子的结合度。结果：通过筛选,共得到121个枸杞子-AD共有靶点,41个关键靶点,包括JUN、AKT1、MAPK1、RELA、IL-6等,GO分析发现,生物学过程主要与氧化应激、衰老等相关,KEGG通路分析富集在AGE-RAGE、HIF-1等信号通路。将靶点MAPK1与β-谷甾醇进行分子对接发现,结合活性较好。结论：本研究初步探讨了枸杞子治疗阿尔茨海默病的主要活性成分、相关靶点及其相关通路,发现其多成分、多靶点、多通路的特点,为后续实验验证提供了一定的参考和物质基础。     

基于网络药理学分析“附子-白术”药对治疗乳腺癌骨转移的作用机制

目的：基于网络药理学分析“附子-白术”治疗乳腺癌骨转移的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库并结合文献筛选附子和白术的活性成分,使用TCMSP及Swiss Target Prediction数据库预测作用靶点,通过GeneCards数据库收集乳腺癌骨转移的治疗靶点,绘制韦恩图获取药物疾病共同靶点,并导入Cytoscape371软件构建“药物-成分-疾病-靶点”网络。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,同时利用R软件进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析。结果：“附子-白术”通过25个活性成分作用于205个乳腺癌骨转移治疗靶点。主要通过9种核心活性成分,作用于AKT1、IL6、MAPK3等30个核心靶点,调控雌激素、破骨细胞分化、PI3K-AKT、HIF-1、MAPK等信号通路,发挥治疗乳腺癌骨转移的作用。结论：“附子-白术”通过多成分、多靶点、多通路来调控乳腺肿瘤增殖、凋亡、转移并减轻骨破坏、骨痛。     

基于网络药理学及分子对接探讨补肾和脉方核心中药治疗单纯性收缩期高血压作用机制

目的：利用网络药理学和分子对接技术，研究补肾和脉方核心中药在单纯性收缩期高血压（ISH治疗中的潜在作用机制。方法：在中药系统药理学数据库（TCMSP）中检索补肾和脉方核心中药的化学成分以及作用靶点，通过多个数据库检索与ISH治疗相关的靶点，利用R4.0.2软件中的Venn包对药物靶点与疾病靶点取交集。利用STRING数据库构建靶点蛋白-蛋白相互作用（PPI）网络，使用Cytoscape的CytoNCA插件进行集中性分析，筛选出关键基因。利用R4.0.2软件以及拓展包对靶基因进行基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组数据库（KEGG）富集分析。利用AutoDockVina软件进行核心药物成分与靶点的分子对接。结果：在补肾和脉方核心药物中筛选出39种活性成分，并与疾病具有141个共同靶点。PPI拓扑分析筛选出转录因子JUN、丝裂原蛋白活化激酶1(MAPK1)、丝裂原蛋白活化激酶14(MAPK14)、肿瘤坏死因子（TNF）等13个核心靶点。GO生物过程分析显示，补肾和脉方治疗ISH可以影响脂多糖反应、循环系统中的血管进程和管径调节等多种生物过程。KEGG通路富集分析显示，主要涉及流体剪切...     

基于网络药理学探讨健脾益肾化浊方治疗卒中后认知障碍的作用机制

目的：采用网络药理学方法探讨健脾益肾化浊方治疗卒中后认知障碍（PSCI）的作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）、中医药综合数据库（TCMID）及ETCM数据库筛选健脾益肾化浊方的活性成分,运用Swiss Target Prediction数据库对活性成分进行靶点预测;运用GeneCards数据库筛选PSCI相关疾病靶点;运用RStudio软件对健脾益肾化浊方及PSCI共同靶点绘制韦恩图;将二者共同靶点通过STRING及Metascape数据库分别进行PPI分析,基因本体（GO）富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析;运用Cytoscape 3.6.0绘制“健脾益肾化浊方-靶点-PSCI-通路”网络图;采用AutoDock对核心成分及核心靶点进行分子对接验证。结果：筛选出健脾益肾化浊方39种活性成分和553个靶点,筛选出PSCI潜在靶点2 305个,二者共同靶点为254个。通过GO及KEGG富集分析,发现健脾益肾化浊方可能通过突触可塑性、抗细胞凋亡、抗炎等多靶点、多途径发挥对PSCI的治疗作用。分子对接结果提示活性成分Stigmasterol与核心靶点（MAPK1、SRC、MAPK3、TP53、HSP90AA1）,Palmatine与核心靶点（AKT1）具有较好的结合活性。结论：健脾益肾化浊方治疗PSCI可能通过调节突触可塑性、抗细胞凋亡、抗炎等生物学过程发挥作用。     

探讨药对金银花-连翘干预痤疮的网络药理学机制

目的：基于网络药理学原理探讨药对金银花-连翘干预痤疮的分子通路及作用机制。方法：应用中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索金银花、连翘化学成分、作用靶点;通过GeneCards数据库获取痤疮差异性靶点基因,预测中药中痤疮相关的作用靶点;通过STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,构建“中药-成分-关键靶标-主要通路”的可视化网络图。运用DAVID数据库对筛选出的靶点基因进行基因富集分析,从而获得基因本体论（GO）生物功能及京都基因和基因组百科全书（KEGG）信号通路注释结果,进而探究中药干预痤疮的分子作用机制。结果：药对金银花-连翘干预痤疮共预测得到活性成分29个,涉及核心靶点基因97个、GO生物功能103个、KEGG信号通路119个。结论：药对金银花-连翘主要活性成分通过多靶点、多通路干预痤疮,主要涉及核受体的活性、转录因子活性等功能,以及白细胞介素（Interleukin,IL）-17信号通路、肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor,TNF）信号通路和磷脂酰肌醇3激酶（Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K）-丝氨酸...     

基于网络药理学的血府逐瘀汤治疗继发性闭经作用机制研究

目的：利用网络药理学方法探讨血府逐瘀汤治疗继发性闭经的潜在作用机制。方法：利用中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）以及ETCM数据库查找出血府逐瘀汤中所有药物的活性成分,通过DrugBank数据库、DisGeNET数据库、GeneCards数据库查找继发性闭经相关靶点,利用Cytoscape 3.8.0软件构建血府逐瘀汤中所有中药的活性成分及对应靶点（活性成分-靶点）网络。利用STRING网络数据库构建及扩增血府逐瘀汤与继发性闭经之间的交集靶点蛋白相互作用（PPI）网络,使用Cytoscape 3.8.0软件绘制PPI网络图。通过DAVID数据库对核心靶点进行基因本体（GO）分类富集分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果：筛选出163个血府逐瘀汤作用靶点,其中与继发性闭经相关的作用靶点有34个,扩增以后一共得到64个相关靶点。血府逐瘀汤主要通过作用于白细胞介素-6、肿瘤抑制因子P53等靶点,调控类固醇功能、肿瘤信号通路等多个生物过程及通路,来发挥治疗继发性闭经的作用。结论：血府逐瘀汤可作用于继发性闭经患者的多个靶点,参与多条信号通路的调控。     

西黄丸治疗非小细胞肺癌作用机制的网络药理学探究和分子对接验证

目的：采用网络药理学和分子对接的方法探究西黄丸防治非小细胞肺癌（NSCLC）潜在分子机制。方法：在中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）及BATMAN-TCM数据库中筛选分析西黄丸的有效活性成分及作用靶点。在GeneCards数据库与人类孟德尔遗传数据库（OMIM）中检索获取NSCLC的相关靶点,选取与西黄丸的交集靶点作为研究靶点。利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络图。采用Cytoscape 3.7.0软件构建药物-靶点-疾病可视化互作网络图。使用DAVID数据对筛选分析出的关键靶点,进行基因本体（GO）功能富集分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,最后运用AutoDock Vina软件和Pymol软件对药物有效活性成分和关键靶点进行分子对接验证。结果：通过筛选得到西黄丸51个主要活性成分,包括槲皮素、β-谷甾醇等,其中作用于NSCLC的靶点有178个,关键靶点有MAPK1、JUN、AKT1、TP53、RELA等。GO和KEGG分析结果显示,西黄丸治疗NSCLC的机制涉及多个生物学过程及PI3K-AKT信号通路、MAPK信号通路、TNF信号通路等多种信号通路。药物有效活性成分与关键靶点对接活性良好。结论：网络药理学分析显示西黄丸治疗NSCLC是多成分、多靶点、多通路协同起效,为后续相关实验提供了充分的理论依据。