基于网络药理学探讨四磨汤治疗慢传输型便秘的作用机制研究

目的:运用网络药理学方法探讨四磨汤治疗慢传输型便秘(STC)的机制及作用靶点.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及TCMID数据库检索四磨汤四味药物所有的有效化合物成分及筛选对应作用靶点,借助GeneCards数据库、DisGeNET数据库查找STC的疾病靶点,使用Venny 2.1.0在线软件作图...     

基于网络药理学的济川煎治疗便秘的作用机制研究

目的:基于网络药理学方法研究济川煎治疗便秘的药理机制及作用靶点.方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选济川煎中6味中药的化学成分及其作用靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、DisGeNET、Drugbank数据库查询便秘的疾病靶点;利用R语言筛选成分和疾病的交集靶点,利用STRING数据...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨石菖蒲治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的:借助网络药理学和分子对接技术研究石菖蒲治疗缺血性脑卒中(CIS)的作用机制.方法:以"石菖蒲"为关键词在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索其活性成分和作用靶点,利用Uniprot数据库对靶点蛋白信息进行标准化,构建中药、成分、靶点网络.利用GeneCards、TTD、OMIM和DRUGBANK 4个...     

基于网络药理学及分子对接研究益气养阴清热方治疗2型糖尿病的作用机制

目的:运用网络药理学及分子对接预测益气养阴清热方治疗2型糖尿病的作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、BATMAN-TCM数据库获取益气养阴清热方6味中药的化学成分和作用靶点.通过Gene-Cards数据库获取治疗2型糖尿病相关靶点;利用R软件获取有效成分与疾病相关靶点之交集;利用Cytos...     

基于网络药理学、分子对接及实验验证探讨加味升降散治疗IgA肾病的作用机制

目的:基于网络药理学初步预测加味升降散治疗免疫球蛋白(Ig)A肾病(IgAN)的活性成分、作用靶点及信号通路,通过分子对接及动物实验验证探讨其可能作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),蛋白质数据库(UniProt Knowledge base)数据库,查阅文献及成分靶点预测数据库(Swiss...     

当归四逆加吴茱萸生姜汤调节雷诺病的系统药理学和先导化合物研究

目的：探究当归四逆加吴茱萸生姜汤调节雷诺病的系统药理学机制，筛选先导化合物。方法：基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology, TCMSP)和Cytoscape 3.6分析软件，构建当归四逆加吴茱萸生姜汤的“中药-成分-靶点”调控网络，对本方调节靶点进行通路富集分析，综合使用系统药理学和计算机辅助药物设计的方法，筛选本方的潜在活性成分。结果：本方初步筛选出696个化合物成分，获得401个特异性靶点，形成“化合物-靶点”5 446调控对。本方调节靶点基因本体(gene ontology, GO)富集通路包括氨基酸结合、G蛋白偶联受体活性等生物学过程及线粒体基质、线粒体等细胞组分相关，受预激抑制、谷胱甘肽代谢过程、抑制性突触后电位等分子功能影响；京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)富集包括HIF-1信号通路、cAMP信号通路、IL-17信号通路等。分子对接和药效团筛选得出化合物(-)-Medicocarpin具有较好的...     

大柴胡汤治疗结石性胆囊炎的网络药理学研究及分子对接验证

目的:基于网络药理学和分子对接的方法探讨大柴胡汤治疗胆囊炎(Cholecystitis)的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索相关文献获得大柴胡汤所含中药的主要化学成分,收集其相对应的靶点;胆囊炎疾病靶点来源于GeneCards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)、PharmGkb数据库.结...     

金蝉口服液抗呼吸道合胞病毒感染的网络药理学分析

目的:基于网络药理学方法分析金蝉口服液抗呼吸道合胞病毒感染的主要活性成分、靶点和作用机制.方法 :通过中药系统药理学数据库(TCMSP)和文献资料筛选出金蝉口服液主要活性成分,通过Swiss Target Prediction、STICH数据库预测主要活性成分的作用靶点.利用GAD、DisGeNET数据库查找呼吸道合胞...     

基于网络药理学及体外实验探讨青黄散抗急性髓系白血病的分子机制

目的:基于网络药理学与分子对接技术预测青黄散治疗急性髓系白血病(AML)的潜在活性靶点与信号通路,通过体外细胞实验进一步验证其作用机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)、TargetNet、SwissTargetPrediction数据库获取青黄散活性成分和作用靶点...     

基于网络药理学和实验验证探讨新疆紫草治疗黑色素瘤的分子机制

目的:通过网络药理学及分子对接技术初步预测新疆紫草治疗黑色素瘤的活性成分、作用靶点及信号通路,通过体外实验验证可能的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库(TCMSP),成分靶点预测数据库(SwissTargetPrediction)以及查阅文献获取新疆紫草药理作用的活性成分及相关靶点;通过GeneCards,在线人...     

基于网络药理学探讨党参治疗2型糖尿病的作用机制

目的:基于网络药理学方法探讨党参治疗2型糖尿病(T2DM)的潜在作用机制.方法:通过中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)及OMIM、TTD、Drugbank等网络数据库分别获取药物有效成分、活性靶点、疾病靶点,并取药物成分和疾病的交集靶点,构建药物活性成分与关键靶点网络、蛋白质相互作用(PPI)网络,并对靶蛋白进...     

基于网络药理学探讨痛泻要方治疗腹泻型肠易激综合征的作用机制

目的：运用网络药理学探讨痛泻要方对腹泻型肠易激综合征(diarrhea predominant irritable bowel syndrome, IBS-D)的潜在作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)获得痛泻要方中四味中药的药物活性成分，并通过TCMSP、Swiss Target Prediction及Pharmapper数据库得到各活性成分的潜在作用靶点。使用在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)、Gene Cards数据库获取IBS-D疾病对应的靶点，将疾病靶点与药物靶点取交集，获得痛泻要方治疗IBS-D的潜在作用靶点，运用Cytoscape 3.7.1软件构建“中药-活性成分-潜在靶点”网络图，并进行拓扑分析筛选关键成分。利用String数据库对潜在作用靶点进行蛋白质相互作用分析，构建蛋白质相互作用(protein-p...     

基于网络药理学与分子对接探讨四妙丸“异病同治”强直性脊柱炎和高尿酸血症的作用机制

目的：以网络药理学与分子对接为基础分析四妙丸“异病同治”强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis, AS)和高尿酸血症(hyperuricemia, HUA)的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)筛选四妙丸的药物活性成分和作用靶点。利用在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)、GeneCards数据库和DrugBank数据库检索AS与HUA的疾病靶点。通过在线工具Venny 2.1.0得到药物相关靶点与疾病相关靶点的交集靶点，即四妙丸治疗AS和HUA的潜在作用靶点。运用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-有效成分-潜在靶点-疾病”网络。借助STRING数据库构建潜在靶点蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks, PPI)并筛选核心靶点。运用DAVID数据...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨杜仲-续断治疗复发性流产作用机制

目的:采用网络药理学和分子对接技术探讨杜仲-续断治疗复发性流产(RSA)的作用机制.方法:利用中药系统药理学数据库(TCMSP)检索杜仲-续断的活性成分和基因靶点.在GeneCards、OMIM和PharmGkb数据库收集RSA疾病靶点,在Cytoscape 3.7.2软件中构建活性成分-靶点网络,基于STRING数据...     

基于网络药理学探讨四君子汤治疗克罗恩病的作用机制

目的:采用网络药理学方法探讨四君子汤治疗克罗恩病的作用靶点和信号通路.方法:通过美国国家生物技术信息中心(NCBI)预测克罗恩病的疾病靶点,中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选四君子汤的主要活性成分和靶点信息.采用Cytoscape 3.7.2软件Bisogenet包构建蛋白质相互作用(PPI)网络,Clu...     

基于网络药理学研究红花治疗膜性肾病的分子机制

目的:基于网络药理学研究红花治疗膜性肾病(MN)的潜在作用靶点及机制.方法:使用中药系统药理学数据库和分析平台筛选红花的有效成分和靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、DrugBank、GAD等数据库查找红花治疗膜性肾病相关的靶点.利用Cytoscape软件构建红花作用靶点与有效成分之间的关系网络,通过生物学...     

基于网络药理学和分子对接探讨桃红四物汤治疗类风湿关节炎的作用机制

目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨桃红四物汤治疗类风湿关节炎的作用机制,为临床应用提供理论依据.方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索桃红四物汤的有效成分及作用靶点,通过GeneCards、OMIM、TTD、PharmGkb、DrugBank数据库收集疾病相关靶点.运用Cytoscape 3.6...     

基于网络药理学和分子对接技术探析通痹健骨方治疗膝骨关节炎的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术探析通痹健骨方治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制,并进一步运用细胞实验进行验证.方法:依据中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出通痹健骨方活性成分及其对应的靶点;通过检索GeneCards数据库,在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)及DrugBank数据库获取KOA靶点;将...     

基于网络药理学和分子对接探讨柴胡-大黄药对防治胆石症的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接技术初步探讨柴胡-大黄药对治疗胆石症的有效物质基础及作用机制.方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索柴胡、大黄的有效活性成分及潜在作用靶点;通过GeneCards、CTD、TTD数据库得出胆石症相关作用靶点.利用Cytoscape 3.7.2软件及STRING数据库构造...     

基于网络药理学探讨小青龙汤治疗过敏性鼻炎的作用机制

目的:运用网络药理学的方法分析小青龙汤治疗过敏性鼻炎的作用机制.方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台筛选出小青龙汤中8味中药的有效成分,经Uniprot数据库进行基因注释,通过GeneCards数据库筛选出过敏性鼻炎的靶点,将二者的靶点进行映射获得潜在作用靶点;再运用STRING数据库和Cytoscape-3.7....