宁波市耐多药肺结核二线抗结核药物耐药状况及耐药基因突变特征研究

  目的  分析宁波地区耐多药肺结核（MDR-TB）二线抗结核药物耐药状况及耐药基因突变特征。  方法  研究纳入本地区2018 — 2019 年结核病耐药监测收集的1597株结核分枝杆菌痰培养阳性菌株中的133株MDR-TB作为研究对象（老年组31例,中青年组102例）,应用RD105缺失基因检测法对133株MDR-TB菌株进行北京基因型鉴定,同时采用1%比例法对其进行卡那霉素、阿米卡星、卷曲霉素、氧氟沙星、左氧氟沙星5种二线抗结核药物的耐药检测。通过PCR DNA直接测序法检测6个二线抗结核药物耐药相关基因（rrs、tlyA、eis、gidB、gyrA、gyrB ）的突变特征。  结果  本地区结核分枝杆菌总的耐多药率为8.33%（133/1597）,133例MDR-TB的卡那霉素、阿米卡星、卷曲霉素、氧氟沙星和左氧氟沙星的耐药率分别为7.52%（10/133）、6.01%（8/133）、3.01%（4/133）、30.08%,（40/133）、29.32%（39/133）。 133例MDR-TB 的准广泛耐药率（Pre-XDR）为28.57%（38/133）、广泛耐药率（XDR-TB）为6.01%,（8/133）。 133例MDR-TB rrs突变率为6.77%（9/133）、tlyA为7.52%（10/133）、eis为1.50%（2/133）、gidB为3.76%（5/133）、gyrA为34.59%（46/133）、gyrB为3.01%（4/133）。 6个基因的突变类型（rrs 2种、tlyA 1种、eis 2种、gidB 2种,gyrA 5种、gyrB 4种）均以点突变为主。  结论  宁波地区MDR-TB二线抗结核药物耐药形势较为严峻,尤其是氟喹诺酮类药物耐药率较高,需进一步加强耐二线抗结核药物MDR-TB的防控工作。     

吡嗪酰胺耐药的耐多药结核分枝杆菌pncA基因表达分析

目的 比较吡嗪酰胺(PZA)耐药的耐多药结核分枝杆菌在PZA药物刺激前后PZA耐药基因pncA的表达，探讨pncA基因表达与结核分枝杆菌PZA耐药的关系。方法 培养PZA耐药的耐多药结核分枝杆菌，检测其利福平和PZA最小抑菌浓度(MIC)；以PZA浓度为0和50μg/mL的培养基培养菌株，实时荧光定量PCR检测菌株pncA的表达水平。结果 21株结核分枝杆菌PZA的MIC≥1 600μg/mL、12株为400～800μg/mL、5株为100～200μg/mL；分别定义相应PZA耐药水平为高、中、低，其利福平的MIC中位数分别为128、128、64μg/mL，任意2组利福平的MIC比较差异均无统计学意义(P均> 0.05)；以相对定量2^-ΔΔCt法计算PZA高、中、低水平耐药结核分枝杆菌pncA表达水平，无药组分别为0.904(0.202,2.653)、1.157(0.658,1.511)、1.147(0.372,1.347),PZA浓度为50μg/mL处理组分别为1.544(0.611,3.191)、0.846(0.421,1.237)、0.726(0.22...     

广东地区结核分枝杆菌吡嗪酰胺耐药的pncA、rpsA、panD基因分型特征研究

目的探讨广东地区结核分枝杆菌吡嗪酰胺耐药与相关基因pncA、rpsA和panD的突变特征。方法收集2015年12月至2018年2月在该院就诊的327例结核病患者的痰液标本。采用结核分枝杆菌核酸检测法检测痰液中结核杆菌阳性率,采用MGIT960仪器检测吡嗪酰胺的敏感性,采用PCR DNA测序技术对pncA、rpsA和panD的基因序列进行分析。结果经结核分枝杆菌核酸检测,327份结核患者痰液标本中有317份痰液标本为阳性,阳性率为96.94%。根据吡嗪酰胺耐药结果,327株分离株中吡嗪酰胺耐药102株,吡嗪酰胺敏感225株,耐药率为31.19%。225株吡嗪酰胺敏感株中未发现pncA突变,102株吡嗪酰胺耐药株中有67株发现pncA基因突变,突变率为65.69%。102株吡嗪酰胺耐药株中检测出5株rpsA突变,突变率为4.90%;225株吡嗪酰胺敏感株中检测出1株rpsA突变,突变率为0.44%。吡嗪酰胺耐药菌株的rpsA突变率显著高于吡嗪酰胺敏感菌株(χ~2=7.476,P=0.006)。105株吡嗪酰胺耐药株中检测到1株panD突变,为G419→A突变,突变率为0.95%。吡嗪酰胺敏感株中未检测到panD突变。结论在中国广东地区,结核分枝杆菌吡嗪酰胺耐药率较高,其中pncA基因突变较多,突变位点较为分散;而吡嗪酰胺耐药结核分枝杆菌中rpsA和panD基因突变均值得进一步关注。     

耐吡嗪酰胺结核分枝杆菌基因突变研究

目的 研究吡嗪酰胺酶编码基因pncA突变与结核分枝杆菌吡嗪酰胺(pyrazinamide,PZA)耐药的关系.方法 将临床分离的36株结核分枝杆菌进行常规PZA药敏试验和pncA基因序列分析.采用绝对浓度法进行PZA药敏试验;PCR扩增pncA基因及其上游、下游碱基序列,纯化回收PCR产物克隆到T载体并进行全自动测序.结果 36株临床分离株中25株PZA耐药,11株PZA敏感.5株高耐PZA(PZA浓度为250 μg/ml)临床分离株4株pncA基因突变;20株低耐PZA(PZA浓度为50 μg/ml)6株pncA基因突变;25株耐PZA结核分枝杆菌pncA基因突变率为40.0%.3株PZA敏感临床分离株pncA基因出现突变、其中2株为同义突变.11株耐PZA结核分枝杆菌pncA基因上游调控序列突变,其中5株同时有pncA基因突变;2株PZA敏感结核分枝杆菌pncA基因上游序列突变.结论 pncA基因突变可引起结核分枝杆菌对PZA耐药,但pncA基因突变只是结核分枝杆菌耐PZA的一种机制,可能还存在PZA的其他耐药机制.     

结核分枝杆菌异烟肼耐药基因突变与其他抗结核药物耐药的相关性

目的 探讨不同抗结核药物对结核分枝杆菌异烟肼耐药相关基因突变的影响，以进一步准确理解结核分枝杆菌异烟肼耐药的分子机制。方法 在广州地区分枝杆菌菌株库中选择异烟肼、利福平、乙胺丁醇、链霉素、阿米卡星、克拉霉素、左氧氟沙星、莫西沙星、利福布丁、丙硫异烟胺和对氨基水杨酸等11种抗结核药物的药敏性试验临床测定结果明确的结核分枝杆菌分离株进行katG、mabA-inhA、oxy RahpC、kasA和ndh基因测序，以结核分枝杆菌H37Rv标准序列为参照进行基因突变分析，应用卡方检验对比分析H^-(R/F/O)^-与H^-(R/F/O)⁺、H⁺R^-与H⁺R⁺、H⁺F^-与H⁺F⁺和H⁺O^-与H⁺O⁺几大菌群之间5种基因突变发生总频率的差异(其中R、H、F、O...     

显微镜观察药物敏感性试验检测结核分枝杆菌对吡嗪酰胺的敏感性

目的:评价显微镜观察药物敏感性(microscopic-observation drug-susceptibility,MODS)试验检测结核分枝杆菌对吡嗪酰胺(pyrazinamide,PZA)敏感性的价值。方法:采用pncA基因测序法、MGIT 960 PZA法、Wayne法及MODS法检测53株结核分枝杆菌对PZA的敏感性。结果:①pncA基因测序结果显示,53株结核分枝杆菌中30株发生了不同位点的突变,另23株为野生型;MGIT 960 PZA法检测结果显示,其中22株对PZA敏感,31株对PZA耐药;经Wayne法检测,28株为PZase阳性,25株为PZase阴性。②MODS法检测结果显示,53株结核分枝杆菌中,12株在规定时间内未生长,41株在5~14 d获得结果,平均时间为7.5 d。③MODS法检测结果与pncA测序法、MGIT960 PZA法及Wayne法比较,符合率分别为95.3%、97.6%及87.8%。结论:MODS法可快速、准确、经济地检测结核分枝杆菌对PZA的敏感性,但小部分菌株会受pH影响而无法生长。对于无法生长的菌株可联合Wayne法、pncA基因测序法、MGIT 960 PZA法弥补检测的不足,以实现用最低的检测成本完成准确快捷的检测。     

174株耐多药结核分枝杆菌对二线抗结核药耐药情况分析

目的：分析该院耐多药结核分枝杆菌对二线抗结核药的耐药情况,为耐多药结核病的治疗提供参考。方法采用回顾性分析法分析2011年5月至2013年5月结核病患者痰标本培养及药敏结果资料,对比分析耐多药分枝结核杆菌对5种二线药物耐药比率。结果初治耐多药结核分枝杆菌对二线耐药情况如下：耐药顺次由高到低依次为左氧氟沙星、对氨基水杨酸、丙硫异烟胺、阿米卡星及卷曲霉素的耐药比率分别为17．7％、14．5％、12．9％、8．1％及3．2％,耐两种的比率为4．8％,耐3种及3种以上的比率均为3．2％;复治情况的耐药顺次同初治顺次,但耐药比率不同,分别为50．0％、33．9％、25．9％、21．4％和16．1％,耐2种的比率为16．1％,耐3种为13．4％,耐3种以上的为12．5％。初治与复治的各种情形耐药比率比较,差异均有统计学意义（P＜0．05）。结论该院耐多药结核杆菌耐药比率低于国内平均水平,复治病例耐药比率高于初治。     

浙江省宁波地区耐多药结核分枝杆菌北京基因型的流行及与喹诺酮耐药关系的研究

目的 初步探讨北京基因型耐多药结核分枝杆菌在宁波地区的流行现况及与喹诺酮类药物耐药相关性,为本地区耐多药结核病的有效防控及分子流行病学研究提供科学依据。方法 应用RD105缺失基因检测法对宁波市疾病预防控制中心收集的106例耐多药结核分枝杆菌临床分离株（MDR-TB）进行北京基因型鉴定,并采用1%比例法对106例MDR-TB菌株进行3种喹诺酮类药物左氧氟沙星（LFX）、氧氟沙星（OFX）、莫西沙星（MXF）耐药性检测。结果 106株MDR-TB菌株中,北京基因型83株（78.3%,83/106）,非北京基因型23株（21.7%,23/106）。北京基因型耐喹诺酮类药物28株（33.7%,28/83）,非北京基因型耐喹诺酮类药物6株（26.1%,6/23）,差异无统计学意义（2=0.483,P0.05）。结论 宁波地区MDR-TB流行以北京基因型为主,MDR-TB对喹诺酮类药物的耐药与北京基因型无关。     

结核分枝杆菌耐药分子生物学机制研究进展

摘要：由于近年抗菌药物的滥用、耐药结核菌株基因突变和艾滋病共患结核患者的增多等因素,结核病的发病率呈上升趋势,临床出现大量的耐药结核病患者,结核病的预防和治疗存在巨大困难。因此,全面了解结核菌耐药的分子机制对于预防和监测结核病的发生,建立快速耐药结核株分子检测方法和抗结核新药的研发至关重要。本文就耐药结核分枝杆菌常见基因突变和分子作用机制进行阐述。     

浙江省杭州市结核分枝杆菌氧氟沙星耐药研究

目的 了解杭州市结核分枝杆菌对氧氟沙星的耐药情况及耐药菌株gyrA基因的突变特点。 方法 收集2010年4月至2012年6月杭州市各结核病定点医院分离培养的临床菌株,进行一线抗结核药物、氧氟沙星和卡那霉素敏感性检测,测定氧氟沙星耐药菌株gyrA基因的喹诺酮类药物耐药决定区(QRDR)序列。 结果 收集的1242株临床菌株中, 67株(5.39%)对氧氟沙星耐药,其中32株(47.76%)对氧氟沙星单耐药,23株为耐多药结核病(MDR-TB)菌株,占MDR-TB菌株的22.77%。选取55株耐药株进行gyrA序列分析,其中33株(60%)携带gyrA基因突变位点。突变位点包括第90和94位密码子,突变率分别为27.27%和32.73%。 结论 杭州市氧氟沙星单耐药患者的比例较高,MDR-TB患者中氧氟沙星耐药情况较严重,需加强结核患者的早期发现和用药管理。     

耐多药结核分枝杆菌中embB基因突变与乙胺丁醇耐药的相关性研究

目的 研究耐多药结核分枝菌中embB基因突变与乙胺丁醇耐药的相关性. 方法 比例法检测84株耐多药结核分枝杆菌的乙胺丁醇(EMB)耐药性,基因测序检测embB基因的突变,2检验分析二者之间的相关性. 结果 84株耐多药结核分枝杆菌中有43株(51.2%)对EMB耐药,41株(48.8%)对EMB敏感,57株耐多药菌株(67.9%)的embB基因发生突变.在43株EMB耐药菌株中,embB基因突变的菌株为40株(93.0%),而41株EMB敏感菌株中,embB基因突变的菌株为17株(41.5%),embB基因在耐药菌株中的突变频率远高于敏感菌株(2=25.58,P=0.00).embB306是最常见的突变位点,其在耐药菌株的突变率也高于敏感菌株(2=12.37,P=0.00),embB基因和embB306位点检测EMB耐药的敏感度、特异度和准确性分别为93.0%和65.1%,58.5%和73.2%,76.2%和69.0%. 结论 EMB耐药的产生与embB基因和embB306突变有关,二者用于检测EMB耐药有一定的参考意义.     

耐多药结核分枝杆菌耐药相关基因突变特征分析

目的了解中国耐多药结核分枝杆菌耐药相关基因的分子特征。方法对138株耐多药结核分枝杆菌和45株敏感菌的耐药相关基因inhA、katG和oxyR-ahpC间隔区(异烟肼)、rpob(利福平)、gyrA(氧氟沙星)和rrs(卡那霉素)进行序列测定,分析其基因突变特点。结果 138株耐多药结核分枝杆菌中,14.4%的菌株inhA基因发生突变,72.5%菌株的katG基因发生突变,15.9%菌株的oxyR-ahpC基因发生突变,同时考虑这3种基因,异烟肼耐药相关基因突变检出率可达90.6%;94.2%菌株的rpoB基因发生突变,74.5%菌株的gyrA基因发生突变,61.1%菌株的rrs基因发生突变,主要的突变位点为katG315(66.7%),inhA-15(9.4%),oxyR-ahpC-10(5.1%),rpoB516(13.8%),526(26.1%)和531(49.3%),gyrA90(21.6%)和94(51%),rrs1401(61.1%)。结论我国耐多药结核菌异烟肼、利福平、氧氟沙星和卡那霉素耐药相关基因最常见突变为katG315、inhA-15,rpoB531、526和516,gyrA94和90,rrs1401。     

结核分支杆菌临床分离株耐药性调查与耐多药结核病流行特点探讨

目的调查结核临床分离株的耐药性,探讨多耐药结核病（MDR-TB）流行特点。方法采用匡氏琼脂培养基按比例法测定287株结核菌（56株来自初治病例）对8种抗痨药物的耐药性。结果初治病例菌株和复治病例菌株对异烟肼、利福平、链霉素、吡嗪酰胺高度耐药率分别为1．8％、3．6％、17．9％、0％和74．9％、58．0％、68．4％、32．0％,差异均极显著（P〈0．001）。复治病例MDR株占63．2％,广泛耐药（XDR）株占10％,15．8％的MDR株为XDR株;初治病例无XDR株感染,MDR株占1.8％,极显著低于复治病例MDR株比率（P〈0．001）。结论住院结核病患者MDR株和XDR株感染率高,且主要由获得性耐药产生。DOTS策略仍是我国耐药结核病防治重点。     

应用基因芯片技术诊断淋巴结核及其耐药性分析

目的分析淋巴结核诊断及耐药性分析中基因芯片技术的临床应用价值。 方法收集江西省赣州市第五人民医院2016年8月至2019年10月收治的疑似淋巴结核患者80例,分别给予患者基因芯片及培养法进行菌种鉴定,并对已确定为结核分枝杆菌（MTB）复合群样本进行上述两种方法的利福平、异烟肼耐药性检测,统计患者临床症状。将传统罗氏固体培养法检测结果作为参考标准,统计基因芯片技术用于非结核分枝杆菌（NTM）鉴定的诊断符合率,并以药敏实验结果为参考标准,统计基因芯片技术用于利福平、异烟肼耐药性检测的符合率、敏感度、特异度。 结果80例疑似淋巴结核患者的主要临床表现包括肿块、畏寒、消瘦、咯痰、憋气,占比分别为78.75%（63/80）、32.50%（26/80）、31.25%（25/80）、33.75%（27/80）、30.00%（24/80）;基因芯片技术对淋巴结核患者NTM鉴定的诊断符合率达100%。利福平耐药性检测中基因芯片技术的敏感度、特异度、符合率占比分别为98.57%（69/70）、100.00%（17/17）、98.11%（52/53）,传统罗氏固体培养法的敏感度、特异度、符合率占比分别100.00%（70/70）、100.00%（18/18）、100.00%（52/52）,差异未见显著性（P＞0.05）。异烟肼耐药性检测中基因芯片技术的敏感度、特异度、符合率占比分别为98.57%（69/70）、100.00%（23/23）、97.87%（46/47）,传统罗氏固体培养法的敏感度、特异度、符合率占比分别100.00%（70/70）、100.00%（24/24）、100.00%（46/46）,差异未见显著性（P＞0.05）。 结论临床淋巴结核患者诊断工作中基因芯片技术具有较高应用价值,其诊断效能及MTB耐药性检测效能与传统培养法基本相同,可积极推广使用。     

结核分支杆菌耐喹诺酮等四种耐药基因检测的临床应用和评价

目的：采用聚合酶链反应-单链构象多态性分析(PCR—SSCP)检测结核分支杆菌耐药基因(rPOB、katG、rPSL和gyrA)，评估它的临床应用价值。方法：通过Bactec-960快速培养，利用PCR-SSCP和药物敏感试验了解96例肺结核病人结核分支杆菌耐药情况，分析临床治疗效果。结果：利福平、异烟肼、链霉素和喹诺酮类耐药率分别为59．4％、52．1％、62．5％和51．0％。分离株rPOB、katG、rPSL和gyrA基因突变率分别为57．3％、45，8％、58，3％和47．9％，药敏试验联合耐药基因检测指导治疗效果满意。结论：结核分支杆菌耐药与基因突变有关，耐药基因检测指导治疗是一种新探索，与药敏试验联合应用可互相弥补，可成为临床指导用药的好方法。     

上海市普陀区1996～2003年间原发结核分枝杆菌感染的耐药性分析

目的 了解我区1996～2003年间结核分枝杆菌原发耐药性.方法 采用绝对浓度法进行异烟肼（INH）、利福平（RFP）、链霉素（SM）、乙胺丁醇（EMB）4种抗结核药物的耐受性测定.结果 总原发耐药率由1996～1997年的14.6%上升至2002～2003年的19.7%（上升了34.9%）.耐INH、SM、RFP率由1996～1997年的8.9%、9.8%、5.7%上升至2002～2003年的15.3%、10.9%、8.0%,（分别上升了71.9%、11.2%和40.4%）,耐EMB率由2.4%下降至0.7%,原发耐多药率2002～2003年为5.8%,与1996年相比,无明显上升.结论 本区结核分枝杆菌原发耐药性呈上升趋势,耐多药菌株仍占一定比例.     

云浮地区肺结核病患者结核分枝杆菌复合群耐药性分析

目的 分析云浮地区肺结核病患者结核分枝杆菌复合群(MTBC)耐药特点,为制定个体化治疗方案提供指导.方法 收集云浮市区及4个县区结核病门诊初诊结核病患者痰培养阳性菌株1571株,采用对硝基苯甲酸(PNB)鉴定培养管进行MTBC鉴别试验;采用比例法进行菌株对9种抗结核病药物(4种一线,5种二线)的体外药物敏感性试验.结果...     

上海市普陀区1996～2003年间原发结核分枝杆菌感染的耐药性分析

目的了解我区1996~2003年间结核分枝杆菌原发耐药性。方法采用绝对浓度法进行异烟肼(INH)、利福平(RFP)、链霉素(SM)、乙胺丁醇(EMB)4种抗结核药物的耐受性测定。结果总原发耐药率由1996~1997年的14.6%上升至2002~2003年的19.7%(上升了34.9%)。耐INH、SM、RFP率由1996~1997年的8.9%、9.8%、5.7%上升至2002~2003年的15.3%、10.9%、8.0%,(分别上升了71.9%、11.2%和40.4%),耐EMB率由2.4%下降至0.7%,原发耐多药率2002~2003年为5.8%,与1996年相比,无明显上升。结论本区结核分枝杆菌原发耐药性呈上升趋势,耐多药菌株仍占一定比例。     

中国结核分枝杆菌寡核苷酸基因分型及其耐药性分析

目的 选用间隔区寡核苷酸分型方法对有中国代表性的菌株进行基因分型,研究不同基因型在中国的流行情况,并分析基因型与耐药表型的关系.方法 中国疾病预防控制中心于2007-2008年,按照流行病学抽样的原则从中国31个省收集涂片阳性的结核病患者的临床分离株4 017株,采用比例法进行药物敏感性实验,选用寡核苷酸分型方法对菌株进行基因分型.基因型检出率差异比较采用x2检验.结果 在4017株结核分枝杆菌临床分离株中,北京基因型菌株包括2 500株(62.2％).北方地区来源菌株北京基因型检出率达76.5％(1 913株),高于南方地区检出率(53.2％,1 330株),差异有统计学意义(x2=219.69,P＜0.05).南方地区T1型检出率达13.3％(332株),高于北方地区检出率(4.3％,108株),差异有统计学意义(x2=88.07,P＜0.05).北京基因型在耐利福平(21.7％)、耐氧氟沙星(4.9％)和MDR( 11.3％)的比例都高于非北京基因型的相应菌株比例18.4％、2.4％和7.4％,差异有统计学意义(x2值分别为22.10、14.42和14.83,P均＜0.05).结论 北京基因型目前仍然是中国主要流行基因型,并且比例呈现出地域差别,北方地区显著高于南方地区.北京基因型菌株与耐利福平、耐氧氟沙星和MDR有关.