湖北汉族儿童TIM-1基因多态性与变应性哮喘关系的研究

目的　检测湖北地区汉族儿童T细胞免疫球蛋白域粘蛋白域蛋白 1(Tcell,immunoglobulindomainandmucindomainprotein 1,TIM 1)基因第 4外显子插入 /缺失多态性和第 8内含子拼接供体部位(interveningsequence ,IVS) 8 9G/A的单核苷酸多态性 (singlenucleotidepolymorphism ,SNP) ,探讨与儿童变应性支气管哮喘易感性的关系。方法　采用聚合酶链反应检测TIM 1第 4外显子插入 /缺失多态性 ,同时采用PCR 限制性片段长度多态性检测 92名湖北地区健康者和 110例变应性哮喘患儿TIM 1IVS 8 9G/A的SNP ,计算基因型和等位基因频率。结果　 ( 1)湖北地区汉族健康儿童TIM 1第 4外显子缺失 /缺失纯合子、插入 /缺失杂合子和插入 /插入纯合的频率分别是 0 .60 8、0 .3 2 6和 0 .0 65 ;TIM 1IVS 8 9G/G、G/A和A/A的频率分别是 0 .783、0 .196和 0 .0 2 2。 ( 2 )变应性哮喘患儿TIM 1第 4外显子缺失 /缺失纯合子、插入 /缺失杂合子和插入 /插入纯合的频率分别是 0 .63 6,0 3 18,0 .0 45 ,与对照组比较差异无显著性 ,TIM 1IVS 8 9G/G、G/A和A/A的频率分别是 0 .782 ,0 .2 0 9,0 .0 0 9,与对照组比较差异无显著性。结论　湖北汉族儿童存在TIM 1第 4外显子插入 /缺失和第 8内含子IVS 8 9G/A多态性 ,其分布与日本人群相似 ,TI     

TIM-4基因多态性与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性的研究

目的 探讨T细胞免疫球蛋白域及黏蛋白域蛋白-4(T cells immunoglobulindomain andmucindomain protein-4,TIM-4)基因外显子2区Lys65Lys(G/A)、外显子9区Val1365Met(G/A)的单核昔酸多态性(SNP)与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性的关系.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对湖北地区185例哮喘患者和162例健康者TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)、外显子9区Vai365Met(G/A)的多态性进行分析,计算基因型和等位基因频率.结果 (1)湖北地区汉族人群健康者TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)位G/G、G/A、A/A基因型频率分别为0.840、0.160、0,而哮喘人群其频率分别为0.859、0.141、0,其基因型和等位基因型频率与对照组相比差异均无统计学意义(P=0.603,P=0.618);(2)本试验未检测到TIM-4外显子9区Va1365Met(G/A)的多态性.结论 湖北地区汉族人群TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)存在单核苷酸多态性变异,但该位点的变异与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性无关;TIM-4基因外显子9区Va1365Met(G/A)在湖北地区汉族人群中未发现单核苷酸多态性.     

TIM4基因多态性与湖北汉族变应性哮喘的相关性研究

目的分析湖北地区汉族人群T细胞免疫球蛋白域黏蛋白域蛋白4（T cells immunoglobulin domin and mucin domain protein 4，TIM4）基因8570G〉A、11515C〉A单核苷酸多态性，探讨其与变应性哮喘易感性之间的关系。方法采用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性对145例变应性哮喘患者和130名健康对照T／M4基因8570G〉A和11515C〉A多态性进行分析，计算基因型和等位基因频率。结果湖北地区健康人群TIM48570G〉AGG、GA和AA基因型频率分别是0．985、0．015和0，而哮喘患者其频率分别为0．931、0．069、0，基因型和等位基因频率在病例组与对照组间差异有统计学意义（P=0．030，P=0．032）；未检测到T／M4基因11515C〉A的多态性。结论湖北汉族人群T／M4基因8570G〉A存在单核苷酸多态性变异，可能与湖北地区汉族变应性哮喘易感性有关。     

湖北汉族人群TIM-3基因多态性与变应性哮喘的相关性

目的分析湖北地区汉族人群T细胞免疫球蛋白域粘蛋白域蛋白-3（T cell simmunoglobulin domain and mucin domain protein-3，TIM-3）启动子区-1541C／T和-574G／T单核苷酸多态性，探讨其与支气管哮喘易感性之间的关系。方法分别采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性和等位基因特异性聚合酶链反应检测湖北地区153例哮喘患者和130名健康者TIM-3启动子区-1541C／T和-574G／T的单核苷酸多态性，计算基因型和等位基因频率。结果（1）湖北地区健康人群TIM-3启动子区-1541位CC、CT和TT基因型频率分别是0．961、0．039和0，而哮喘人群其频率分别为0．935、0．065、0，其基因型和等位基因频率均与对照组差异无统计学意义（P=0．314，P=0．321）；（2）湖北地区健康人群TIM-3启动子区-574位GG、GT和TT基因型频率分别是0．992、0．008和0，而哮喘人群频率分别为0．941、0．059、0，其基因型和等位基因频率均与对照组差异有统计学意义（P=0．046，P=0．048）。结论湖北汉族人群TIM-3启动子区存在多态性变异，其中-574G／T单核苷酸多态性可能与湖北地区汉族成人变应性哮喘易感性有关。     

系统性红斑狼疮患者血清中Tim-1蛋白水平及其基因多态性

目的:检测T细胞免疫球蛋白黏蛋白域蛋白-1(Tim-1)在系统性红斑狼疮患者和健康对照组血清中的浓度,比较不同基因型间Tim-1蛋白的浓度,及其基因第4外显子插入/缺失多态性,分析其与系统性红斑狼疮的关系。方法:采用ELISA方法测定Tim-1蛋白在血清中的浓度;PCR反应检测TIM-1的第4外显子插入与缺失多态性,计算基因型与等位基因的频率。结果:系统性红斑狼疮患者和健康对照组血清中Tim-1蛋白的浓度分别是:(263.083±276.953)和(58.527±92.424)pg/ml,两组之间的差异有统计学意义;SLE患者TIM-1的第4外显子缺失/缺失纯合子与缺失/插入杂合子的Tim-1蛋白的浓度分别为(307.360±284.079)和(191.750±256.708)pg/ml,两组之间无显著性差异。健康对照组TIM-1的第4外显子缺失/缺失纯合子与缺失/插入杂合子的Tim-1蛋白的浓度分别为(70.295±109.917)和(40.468±41.739)pg/ml,两组之间无显著性差异。对照组的TIM-1的第4外显子缺失/缺失纯合子,缺失/插入杂合子,插入/插入纯合子基因型频率分别是0.617,0.321,0.062;系统性红斑狼疮患者相应的基因型频率是0.652,0.326,0.022。两组之间无显著性差异。结论:Tim-1蛋白在系统性红斑狼疮患者血清中的浓度升高,与系统性红斑狼疮的正相关。但是第4外显子插入与缺失多态性与系统性红斑狼疮无相关性,该突变不改变Tim-1蛋白在血清中的水平。     

信号转导和转录激活因子6基因多态性与湖北汉族人变应性哮喘的相关性研究

目的　探讨信号转导和转录激活因子 (STAT) 6基因 3′非翻译区G2 96 4A位点多态性和第一外显子GT串联重复序列遗传多态性与湖北汉族人变应性哮喘易感性的关系。方法　用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性 (PCR RFLP)技术检测STAT6基因G2 96 4A位点多态性 ;用聚合酶链反应 短串联重复多态性 (PCR STR)技术对STAT6基因第一外显子微卫星进行分型 ,并将PCR产物克隆及测序鉴定 ;采用病例 对照法研究了 1 35例变应性哮喘患者和 1 0 9例对照。结果　 ( 1 )湖北地区汉族人群STAT6基因G2 96 4A位点基因型以GA型最为常见 ;哮喘组与对照组STAT6基因G2 96 4A位点的等位基因频率和基因型频率GG、GA、AA之间差异无统计学意义 (P >0 .0 5)。 ( 2 )STAT6基因第一外显子微卫星多态性共检出GT串联重复次数为 1 3、1 4、1 5、1 6的 4种等位基因 ;第一外显子微卫星的多态性检测出 1 3/1 4基因型在哮喘患者组和正常对照组相比差异具有统计学意义(P =0 .0 0 1 4 )。 ( 3)STAT6基因第一外显子GT二核苷酸串联重复序列多态性中 1 3 GT重复等位基因与 2 96 4A变异体之间存在连锁不平衡 (P =0 .0 0 0 0 2 1 8)。结论　STAT6基因 3′非翻译区G2 96 4A位点多态性与湖北汉族人哮喘易感性无明显相关性 ;第一外显子GT二核苷酸串联重     

Tim-3启动子区-574基因多态性与变应性哮喘的关系

目的:探讨引物特异PCR-核酸序列测定技术检测T细胞免疫球蛋白域粘蛋白域蛋白-3(Ti m-3)启动子区-574G>T单核苷酸变异及其与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性之间的关系。方法:分别采用引物特异聚合酶链反应(PCR)-核酸序列测定技术检测湖北地区296例哮喘患者和202例健康对照人群Ti m-3启动子区-574G>T单核苷酸变异,计算基因型和等位基因频率。结果:湖北健康人群中Ti m-3启动子区-574位G/G、G/T和T/T基因型频率分别是0.990、0.010和0,而哮喘患者频率分别为0.929、0.071、0,其基因型频率与对照组差异有显著性(χ2=10.14,P<0.01)。结论:引物特异PCR-核酸序列测定技术可用于检测Ti m-3启动子区-574G>T单核苷酸变异的检测;湖北汉族人群中Ti m-3启动子区存在多态性变异,其中-574G>T多态性可能与湖北汉族人群变应性哮喘易感性有关。     

直接胆红素增高的黄疸患儿SLC25A13基因热点突变分析

目的建立快速诊断citrin缺陷导致的新生儿肝内胆汁淤积症（NICCD）的方法,初步探讨NICCD在直接胆红素增高的黄疸患儿中所占比例。方法应用聚合酶链反应（PCR）和聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析（PCR-RFLP）对122例表现为直接胆红素增高的黄疸患儿SLC25A13基因（热点突变分析位点包括：851del4、1638ins23、IVS6＋5G〉A、IVS16ins3kb和IVS11＋1G〉A）进行热点突变分析。结果在122例纳入实验研究的患者中,发现6例患儿为851del4纯合子;2例为1638ins23/IVS6＋5G〉A突变;2例为851del4/IVS16ins3kb突变。还有8例患儿只发现了一个SLC25A13基因突变,其相应等位突变尚不清楚,但是后续的实验证实了这8例患儿为NICCD。暂时未发现有IVS11＋1G〉A突变。在这些热点突变类型中以851del4突变所占比例最高,占了71.4%（20/28）,其次为IVS16ins3kb和1638ins23,各占10.7%。NICCD患儿占总受检人数的14.7%。结论 1.SLC25A13基因热点突变分析能快速准确地诊断NICCD。2.SLC25A13基因突变以851del最为常见。3.NICCD在直接胆红素增高的黄疸患儿中占相当高的比例。     

浙江地区汉族人群caspase-8、-10基因四个单核苷酸多态性位点的单倍型研究

目的分析汉族人群caspase-8、-10基因的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisins，SNPs）位点及其构成的单倍型，为研究caspase-8、-10基因与多基因复杂疾病的关联分析奠定基础。方法采用PCR、变性高效液相色谱技术和DNA测序技术检测caspase-10基因的第2．5外显子，caspase-8基因的第8-10外显子及其部分侧翼序列的多态性位点；分析配对位点的连锁不平衡关系，最大期望值法估算它们构成的单倍型。结果（1）caspase-10基因的第2、5外显子分别检出一个SNP位点A2823G和A12799G，其中A12799G是新发现的低信息度的SNP；caspase-8基因中检测到3个SNP位点A43466G、G51484A、G52951A，分别位于第8、9外显子和第9内含子；它们均未改变所编码蛋白的一级结构；（2）caspase-10基因中A2823G位点与caspase-8基因中3个位点间已达到连锁平衡，caspase-8基因中A43466G与G52951A、G51484A与G52951A也达到连锁平衡，连锁不平衡系数分别接近于0；只有A43466G与G51484A存在强的连锁不平衡，连锁不平衡系数接近于1；（3）caspase-10基因的A2823G位点与caspase-8基因的3个位点预计产生11种单倍型，其中A-2823／A-43466／G-51484／G-52951是主要单倍型，频率为0．381l，其次是A．2823／A-43466／G-51484／A-52951，频率为0．2536；这4个SNP位点联用，多态信息含量可达到0．7106。结论浙江地区汉族人群caspase-10、-8基因中的SNP位点至少处于3个不同的单倍型块；联合多个相邻的位点构成单倍型，可以弥补单个SNP信息度较低的不足。     

湖北汉族变应性哮喘患者GPR154基因单倍型分析

目的探讨G蛋白偶联受体154(Gprotein-coupled receptor154,GPR154)基因多态性与湖北汉族变应性哮喘易感性间的关系。方法用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性对145例变应性哮喘患者和120名健康人群GPR154基因的SNP563704和SNP522363位点的多态性进行分析。结果(1)变应性哮喘患者SNP563704 CC、CT和TT基因型频率是0.324、0.524和0.152;与对照组相比差异无统计学意义(χ2=1·880,P>0.05);变应性哮喘组不同基因型间血清总IgE水平差异无统计学意义(F=0.714,P>0.05)。(2)变应性哮喘患者SNP522363CC、CG和GG基因型频率是0.289、0.521和0.190;与对照组相比差异无统计学意义(χ2=0.700,P>0.05);变应性哮喘组不同基因型间血清总IgE水平差异无统计学意义(F=0·083,P>0.05)。(3)对SNP522363和SNP563704进行单倍型分析,4种频率大于0.03的单倍型在哮喘组和对照组间差异有统计学意义(χ2=16.50,P<0.01)。哮喘组CT和GT单倍型频率显著高于对照组,差异有统计学意义(P=0.015;P=0.002)。结论湖北汉族变应性哮喘易感性与单个的单核甘酸多态性无关,但与SNP522363和SNP563704组成的单倍型显著相关。     

Absence of association between two insertion/deletion coding genetic polymorphisms of TIM-1 gene and asthma in Chinese Han population

TIM-1, a member of T-cell immunoglobulin domain and mucin domain (TIM) gene family, was implicated as an asthma susceptibility gene in previous studies. TIM-1 was expressed on CD4(+) T cells after activation and its expression was sustained preferentially in T-helper type 2 (T(H)2) but not in T(H)1 cells, therefore TIM-1 became a good candidate gene for atopic diseases. Recent studies indicated that two insertion/deletion (ins/del) coding genetic polymorphisms in exon 4 of TIM-1 were associated with asthma susceptibility in some but not in all populations. In order to investigate the relationship between TIM-1 genetic polymorphisms and asthma in Chinese Han population, we performed a case-control study for two insertion/deletion polymorphisms in TIM-1 exon 4 (5383_5397ins/del and 5509_5511delCAA) and a single nucleotide polymorphism (SNP) in intron 8 (IVS 8+9 G/A) between a healthy control group of 309 people and an asthma patient group of 352 people recruited from Chinese Han population. The polymorphisms were genotyped and the allele and genotype frequencies were analysed, but none of the three polymorphisms showed association with asthma susceptibility in single-locus association analyses. Linkage disequilibrium (LD) analyses demonstrated that the two insertion/deletion polymorphisms were in strong LD but the haplotypes constructed from these two polymorphisms showed no significant association with asthma. In conclusion, our findings suggest that 5383_5397ins/del, 5509_5511delCAA and SNP IVS 8+9 G/A polymorphisms are not associated with asthma susceptibility in Chinese Han population.     

基于家系的Tim-1基因启动子多态性与儿童过敏性哮喘的关联研究

目的:以家系资料为基础,利用遗传不平衡原理探讨染色体5q31-33区Tim-1基因启动子3多态性-2562GA、-416CG和-232GA与湖北地区汉族儿童过敏性哮喘的关系。方法:应用限制性片段长度多态性技术分析了118个儿童过敏性哮喘核心家系Tim-1基因-2562GA、-416CG和-232GA多态性位点的基因型;采用基于家系的传递不平衡检验(TDT)分析基因分型数据;应用TRANSMIT软件构建单倍型并进行单体型关联分析。结果:①118个核心家庭TDT分析显示-2562GA、-232GA位点由杂合子父母传递给患病子代的等位基因频率没有偏离50%,差异无显著性(P0.05),-416CG位点由杂合子父母传递给患病子代的G等位位点的观察值明显高于期望值(P0.05)。②TRANSMIT单体型传递不平衡分析显示父母传递给患病子女GCA和GGA单体型的观察值与期望值差异有显著性(P0.05);Globalχ2检验结果显示Tim-1的单体型与儿童过敏性哮喘有关联(χ2=17.26,P0.01)。结论:Tim-1基因启动子的-416CG位点与中国湖北地区汉族儿童过敏性哮喘易感性相关,由其构建的单体型也与哮喘相关。Tim-1基因遗传多态性可能在哮喘的发病中起重要的作用。     

新疆汉族和维吾尔族健康人群VKORC1启动子区基因多态性研究

目的了解VKORC1—1639A／G基因多态性在新疆汉族和维吾尔健康人群中的分布及其与国外其他不同民族之间的差异。方法采用PCR—RFLP技术对205名汉族和204名维吾尔族乌鲁木齐地区体检健康者VKORC1—1639A／G基因多态性进行检测，计算其基因型和等位基因频率，并与国外多个民族VKORC1—1639A／G基因多态性分布进行比较。结果新疆汉族和维吾尔族健康人群中共检测到2种等位基因：A和G。汉族A和G等位基因频率分别为87％和13％，维吾尔族A和G等位基冈频率分别为62％和38％。新疆汉族和维吾尔族健康人群VKORC1—1639A／G基因多态性共检测到3种基因型，新疆汉族健康人群以AA基因型常见，基因型频率74％。其次是AG基因型，基因型频率分别为26％。GG基因型的个体仅检测到1例，基因型频率小于1。新疆维吾尔族健康人群以AG基因型常见，基因型频率58％。其次是AA基因型，基因型频率分别为33％。GG基因型频率为9％。结论新疆汉族VKORC1—1639A／G基因多态性以AA基因型为主。维吾尔族VKORC1—1639A／G基因多态性以AG基因型为主，新疆汉族VKORC1—1639A／G基因多态性分布与维吾尔族人群和欧美人群存在较大差异。新疆维吾尔族人群VKORC1—1639A／G基因多态性分布与欧关人群接近。     

正常中国人及肥胖患者解偶联蛋白1基因-3826 A/G多态性的研究

目的 研究解偶联蛋白1(uncoupling protein 1,UCP1)基因-3826 A/G多态性是否与中国人肥胖有关联,为探讨肥胖的分子遗传基础提供依据.方法 应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析法,对成都地区384名汉族人(257例非肥胖者及127例肥胖者)UCP1基因-3826 A/G多态性位点进行分析,采用酶法和单向免疫扩散法对血脂和载脂蛋白水平进行测定.结果 UCP1基因-3826 A/G多态位点A、G等位基因频率在肥胖组为0.508、0.492,在非肥胖组为0.467、0.533,两组间等位基因的频率差异无统计学意义(P>0.05).-3826 A/G位点在肥胖组GG基因型携带者血清载脂蛋白(apolipoprotein,apo)B100水平高于AA基因型者(P<0.05),AG型者apo CⅡ、apo CⅢ水平均分别高于AA基因型携带者(P<0.05).在非肥胖男性亚组,GG纯合基因型携带者血清高密度脂蛋白胆固醇(high-density lipoprotein cholesterol,HDL-C)及apoAⅠ水平显著低于AA基因型携带者(P<0.05);AG型者apoAⅡ水平低于AA基因型者.在肥胖男性亚组,GG基因型携带者血清apo B100水平较AA型者显著升高(P<0.05);在肥胖女性亚组,GG基因型者apo AⅠ水平低于AG型者,AG型者apoCⅡ、apoCⅢ水平均分别高于AA型者(P<0.05).结论 UCP1基因-3826A/G多态性与成都地区中国汉族人肥胖无关联,但与血清HDL-C及apoAⅠ、apoB100等载脂蛋白水平含量有关,且具有性别差异.