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相似文献
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1.
目的 应用网络药理学和分子对接技术,探讨肾炎康复片治疗IgA肾病的作用机制。方法 通过数据库筛选肾炎康复片的主要活性成分,进行靶点预测。收集IgA肾病相关靶点,并与肾炎康复片活性成分靶点基因交集,选取共同靶点。构建蛋白质-蛋白质互作网络图和药物-活性成分-共同靶点网络图筛选出药物主要活性成分。通过MetaScape数据库进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析并构建主要活性成分-靶点-信号通路网络图。选取关键成分和核心靶点,使用Pymol、MGLTools、AutoDock等软件做分子对接。结果 肾炎康复片的活性化合物共有182个,涵盖310个作用靶点,IgA肾病相关疾病靶点有1190个。筛选出共同靶点119个,主要涉及肿瘤坏死因子(TNF)、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶(PI3K/Akt)、白细胞介素17(IL-17)、细胞衰老、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等信号通路。网络分析和分子对接结果提示肾炎康复片中关键成分豆甾醇、β-谷甾醇可能通过作用于核心靶点B细胞淋巴瘤-2基因(BCL2)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、胱天蛋白酶3(CASP3)发...  相似文献   

2.
目的 用网络药理学和分子对接方法探索慈丹胶囊治疗肝癌的潜在作用机制。方法 通过检索中药系统药理学数据库与分析平台及相关文献收集慈丹胶囊的活性成分和作用靶标,并用Cytoscape-3.8.0软件构建中药组分-活性成分-关键靶点网络图。用基因名片数据库筛选肝癌的潜在靶点信息。基于蛋白质相互作用数据库构建慈丹胶囊和肝癌交集靶点蛋白的互作网络图。用注释、可视化和集成发现数据库将交集靶点进行基因本体生物过程富集分析和京都基因与基因百科全书信号通路富集分析。通过分子对接考察关键活性成分与潜在靶点蛋白的作用方式。结果 慈丹胶囊可能通过槲皮素、山柰酚、木犀草素等59个主要活性成分作用于肿瘤抑制蛋白p53、肌动蛋白、丝/苏氨酸蛋白激酶1等127个关键靶点,进而调控癌症相关通路、磷脂酰肌醇3激酶-丝/苏氨酸激酶通路等肿瘤相关信号通路,诱导细胞周期阻滞和凋亡,从而达到治疗肝癌的目的。分子对接结果显示,慈丹胶囊中主要活性成分能够与多个度值较高的关键核心靶点很好地结合,进而可能对靶点蛋白产生激活或抑制作用。结论 慈丹胶囊治疗肝癌的潜在作用机制具有多成分、多靶点、多通路的作用特点。  相似文献   

3.
目的 通过网络药理学、分子对接和分子动力学模拟(MD)探讨黄连治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法 利用TCMSP和UniProt数据库获取黄连活性成分及其对应靶点,经GeneCards、OMIM、Drugbank、TTD、DisGeNET数据库筛选溃疡性结肠炎相关靶点,利用Venny 2.1.0获取黄连和溃疡性结肠炎的交集靶点,并上传String 11.0数据库绘制蛋白相互作用(PPI)网络图。通过Cytoscape3.9.0的Cyto Hubb插件和“药物活性成分–靶点–通路网络图”筛选核心靶点。借助Metascape数据库对交集靶点进行基因本体功能注释(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过Autodock Tools 1.5.6软件将活性成分与核心靶点进行分子对接。用分子动力学模拟法验证最佳结合模型的稳定性。结果 共筛选出黄连7个活性成分及其137个靶点,溃疡性结肠炎1 258个相关靶点和81个交集靶点。核心靶点包括蛋白激酶B1(Akt1)、B淋巴细胞2(BCL2)、有丝分裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等。生物过程包括无机物的反应、细胞因子受体结合等。KEGG通路富集主要包括MAPK信号通路等。分子对接结果显示,黄连的核心活性成分能够很好地与关键靶点结合。MD进一步验证了能量结合最好的小檗碱与白细胞介素(IL)-1β的结合能为−36.19 kJ/mol。结论 黄连可能通过多成分、多靶点及多通路参与溃疡性结肠炎的治疗。  相似文献   

4.
目的 基于高通量基因表达数据库(GEO)、网络药理学和分子对接技术分析归芍地黄汤对新生血管性年龄相关性黄斑变性的可能作用靶点和相关机制,并通过体内实验进行验证。方法 通过查阅文献及中国传统医学公共数据库(TCMSP)确定归芍地黄汤的主要成分及靶标,绘制成分–靶点网络拓扑图。通过整合GEO数据库和公共数据库对新生血管性年龄相关性黄斑变性的疾病靶点进行预测。使用Venny在线平台确定药物–疾病的交集靶点,构建蛋白质相互作用(PPI)网络图,利用Cytoscape软件筛选关键基因(Hub),利用R语言对交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。将归芍地黄汤核心成分与靶基因之间进行分子对接,最后利用光学相干断层扫描和免疫组化显示组织病理学变化,荧光素眼底血管造影观察脉络膜新生血管膜渗漏情况,并验证其对靶基因表达水平的影响。结果 从GSE29801数据集中获得50个差异基因,筛选得到药物–疾病交集靶点134个。核心靶点包括白蛋白(ALB)、肿瘤蛋白p53(TP53)、蛋白激酶B1(Akt1)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、半胱氨酸天冬氨酸蛋...  相似文献   

5.
目的 利用网络药理学和分子对接技术研究化橘红抗酒精性肝损伤的潜在分子作用机制。方法 在中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)中获取化橘红的有效成分以及成分靶点,使用GeneCards、OMIM、TTD和DisGenet数据库获取疾病靶点基因信息,借助韦恩图选取活性成分靶点以及疾病靶点基因的交集获取化橘红治疗酒精性肝损伤的潜在作用靶点;利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络(PPI),并采用Cytoscape软件得到核心靶点网络图;最后使用Metascape数据库对核心靶点进行基因本体论(GO)功能富集和基因百科全书(KEGG)分析,利用AutoDock Tools进行活性成分与核心靶点的分子对接验证。结果 得到10个有效成分、98个成分靶点基因和1 531个疾病靶点基因,两者取交集后获取67个交集靶点。利用STRING数据库和Cytoscape软件最终得到肿瘤蛋白p53(TP53)、前列腺素内过氧化物酶2(PTGS2)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、转录因子AP-1(JUN)、蛋白激酶B1(AKT1)5个核心靶点。GO分析和KEGG分析分别获得过氧化物酶体等50条目和脂质、动脉粥样硬化等20条信号通路。结论 化橘红可通过多个成分作用于多个靶点发挥抗炎、抑制细胞凋亡等作用,进而抑制酒精性肝损伤。  相似文献   

6.
[摘要]目的:通过网络药理学和分子对接探究定喘汤治疗儿童咳嗽变异性哮喘(cough variant asthma,CVA)的作用机制。方法:基于文献研究和中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库挖掘定喘汤中各个药物的活性成分,并利用TCMSP数据库预测活性成分作用靶点,借用Uniprot数据库校正靶点蛋白对应基因;通过GeneCards、OMIM数据库获得咳嗽变异性哮喘的疾病靶点。取药物靶点和疾病靶点的交集靶点并制作韦恩图,运用Cytoscape 3.7.2软件制作“中药-活性成分-靶点”网络并进行网络拓扑分析,利用String数据库构建蛋白互作网络并筛选出核心靶点。基于DAVID对交集靶点进行GO生物过程分析和KEGG通路富集分析;通过AutoDock Vina和Pymol将得到的核心成分和核心靶点进行分子对接。结果:收集定喘汤复方中活性成分218个,得到相关潜在靶点452个,CVA相关靶点689个,得到交集靶点131个。核心靶点主要为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF),共有靶点主要富集于PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路。分子对接结果显示核心成分与靶点具有较好的结合活性。结论:定喘汤治疗CVA具有多成分、多靶点、多通路的特点,为进一步研究定喘汤治疗CVA的作用机制奠定了基础。  相似文献   

7.
目的 采用网络药理学和分子对接技术探讨儿脾醒颗粒治疗小儿厌食症的潜在作用机制。方法 通过检索中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库获取儿脾醒颗粒的主要活性成分及对应靶点;检索GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD数据库得到小儿厌食症相关靶点基因;取药物靶点与疾病靶点的交集,得出儿脾醒颗粒治疗小儿厌食症的有效靶点并绘制Venn图;运用Cytoscape 3.9.0软件构建药物与小儿厌食症疾病靶点互作网络图;利用STRING数据库绘制蛋白质相互作用(PPI)的可视化网络图,并进行网络拓扑分析;通过Bioconductor数据库和R语言对交集靶点进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,了解儿脾醒颗粒治疗小儿厌食症可能的生物过程及通路;最后运用SYBYL-x2.0软件实现分子对接验证。结果 获得儿脾醒颗粒主要活性成分46个、药物靶点蛋白236个;检索小儿厌食症疾病相关靶点共1 372个,活性成分与疾病交集靶点118个;发现儿脾醒颗粒通过作用于转录因子AP-1(JUN)、V-Rel网状内皮增生病毒癌基因同源物A(RELA)、肿瘤坏死...  相似文献   

8.
目的 通过网络药理学的方法探究赤芍抗肿瘤转移的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和Pharm Mapper数据库获取赤芍的活性成分及靶点,通过Gene Cards和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库中获得肿瘤转移的相关靶点,进而获得药物活性成分治疗疾病的潜在靶点。构建蛋白质互作(PPI)网络,用DAVID数据库对潜在靶点进行富集分析,并利用Cyto Scape 3.9.0软件对核心成分和关键靶点进行筛选,同时进行分子对接验证。结果 共得到符合条件的药物活性成分29个及其作用靶点132个、交集靶点115个。主要信号通路有癌症信号通路、脂质和动脉粥样硬化、前列腺癌等。分子对接结果表明赤芍抗肿瘤转移的核心成分与疾病的核心靶点有较强的结合活性。结论 赤芍通过多成分、多靶点、多途径发挥抗肿瘤转移作用。  相似文献   

9.
目的 采用网络药理学方法和分子对接技术探讨黄芪治疗卵巢癌的可能机制。方法 利用靶点预测平台TCMSP数据库和PubChem数据库并结合文献,筛选黄芪活性成分及靶点;利用OMIM数据库和GeneCards数据库获取卵巢癌相关靶点;利用Cytoscape 3.7.1软件和String数据库绘制“黄芪活性成分-交集靶点”网络图和蛋白互作图。利用Metascape数据库对交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。利用Autodock Vina 1.2.2进行关键成分和核心靶点的分子对接。结果 获取到黄芪潜在活性成分19种,作用于109个潜在靶点,涉及5829个GO条目和238条信号通路。分子对接结果显示,关键成分与核心靶点结合较好。结论 本研究初步揭示了黄芪治疗卵巢癌的关键成分、核心靶点和主要生物学过程和信号通路,为进一步实验研究提供一定参考。  相似文献   

10.
目的 基于网络药理学方法和分子对接技术探究心可舒片治疗高血压的作用机制。方法 利用TCMSP、HERB、ETCM数据库和Swiss Target Prediction平台检索心可舒片的活性成分及作用靶点;通过OMIM、Gene Cards、TTD和DrugBank数据库获取高血压的相关靶点。筛选出药物与疾病的交集靶点,通过Cytoscape 3.7.2软件和STRING数据库分别构建“中药–活性成分–靶点–疾病”及蛋白相互作用(PPI)网络并筛选出关键活性成分和核心靶点。运用DAVID数据库进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用AutoDockTools软件进行分子对接验证。结果 共获得心可舒片活性成分147个,药物与疾病的交集靶点262个。心可舒片治疗高血压的关键活性成分为丹参醇A、香紫苏醇、三裂鼠尾草素等;核心靶点为原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(SRC)、肿瘤坏死因子(TNF)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)等。GO富集分析涉及238个生物学过程,41个细胞组分,81个分子功能。KEGG富集分析涉及131条信号通路,包括钙信号通路、神经...  相似文献   

11.
目的 建立鼻渊净胶囊的高效液相色谱(HPLC)指纹图谱。方法 采用Agilent SB-C18(4.6 mm×250 mm,5 μm)色谱柱,乙腈-水为流动相、以1.0 ml/min流速行梯度洗脱,检测波长210 nm,柱温30 ℃,洗脱时间为80 min。采用中药色谱指纹图谱相似度评价系统(2004A版)对检测出色谱进行指纹图谱相似度评价。结果 建立了鼻渊净胶囊的HPLC指纹图谱,确定了20个共有峰,15个峰归属到各药材,其中5个峰确认了化学成分;10批样品的指纹图谱的整体相似度与对照图谱比较,均在90%以上。结论 所建立的鼻渊净胶囊指纹图谱有助于从整体上控制该制剂的质量。  相似文献   

12.
In this study, the antibiotic susceptibilities to tigecycline and tetracycline of 35 selected Bacteroides fragilis group strains were determined by Etest, and the presence of tetQ, tetX, tetX1 and ermF genes was investigated by polymerase chain reaction (PCR). tetQ was detected in all 12 B. fragilis group isolates (100%) exhibiting elevated tigecycline minimum inhibitory concentrations (MICs) (≥8 μg/mL) as well as the 8 strains (100%) with a tigecycline MIC of 4 μg/mL, whilst tetX and tetX1 were present in 15% and 75% of these strains, respectively. All of these strains were fully resistant to tetracycline (MIC ≥ 16 μg/mL). On the other hand, amongst the group of strains with tigecycline MICs < 4 μg/mL (15 isolates), tetQ, tetX and tetX1 were found less frequently (73.3%, 13.3% and 46.7%, respectively). All but two strains harbouring the tetQ gene in this group were non-susceptible to tetracycline, with a MIC > 4 μg/mL. These data suggest that in most cases tigecycline overcomes the tetracycline resistance mechanisms frequently observed in Bacteroides strains. However, the presence of tetX and tetX1 genes in some of the strains exhibiting elevated MICs for tigecycline draws attention to the possible development and spread of resistance to this antibiotic agent amongst Bacteroides strains. The common occurrence of ermF, tetX, tetX1 and tetQ genes together predicted the presence of the CTnDOT-like Bacteroides conjugative transposon in this collection of Bacteroides strains.  相似文献   

13.
New 2,6-piperidinediones 2a–g and 4a–d were prepared by initial condensation of aromatic aldehydes or cycloalkanones with cyanoacetamide to give α-cyanocinnamides la–g or cycloalkylidenes 3a,b which underwent Michae1 addition with ethyl cyanoacetate or diethylmalonate. Compounds 4a–d were alkylated by various alkyl halides to produce the N-alkylated 2,6-piperidinedione derivatives 5a–m. Some new selected compounds 2a–c,f, 4a–d & 5e,h,j were pharmacologically evaluated for potential anticonvulsant, sedative and analgesic activities. These compounds exhibited significant anticonvulsant and analgesic effects after a single I.P. administration 100 mg/kg b.wt. . On the other hand all the investigated compounds induced hypnotic activity and prolonged the phenobarbital sodium- induced sleep as compared with the control group and the most potent compound was found to be 2f.  相似文献   

14.
穆向荣  林林  焦阳  林永强 《药学研究》2019,38(7):419-423
瓜蒌子、瓜蒌皮、瓜蒌、天花粉来源于栝楼的不同药用部位,4味药材均为常用的大宗药材,现行版《中国药典》对其制定的质量标准过于简单,无法科学合理地控制其质量。本文对瓜蒌子、瓜蒌皮、瓜蒌、天花粉安全性和有效组分的研究进行综述,明确了相关研究存在的问题并针对问题提出建议,为科学全面的药材及饮片标准的制定提供参考依据。  相似文献   

15.
喙果黑面神化学成分研究   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的研究大戟科植物喙果黑面神(Breynia rostrata Merr.)的化学成分。方法利用硅胶、凝胶等色谱技术分离纯化化学成分,根据化合物的理化性质和光谱数据进行结构鉴定。结果从喙果黑面神的正丁醇萃取部分分离得到4个化合物,分别鉴定为6-O-甲基丙酰基-α-D-吡喃葡糖(6-O-methylpropanoyl-α-D-glucopyranose,1);4″-苯酚基-6-O-甲基丙酰基-β-D-吡喃葡糖苷(4″-phenolic-6-O-methylpropanoyl-β-D-glucopyranoside,2);1-O-没食子酰基-β-D-吡喃葡糖苷(1-O-galloyl-β-D-glucopyranoside,3);熊果苷(arbutin,4)。结论化合物1和2为新化合物,3和4均为首次从该种植物分离得到。  相似文献   

16.
目的 探讨抗幽门螺杆菌(HP)活性挥发油的药效物质,初步预测潜在活性成分及其作用机制。方法 微量稀释法(96 微孔板)测定丁香、广藿香、紫苏、牛至、枳实、厚朴、薄荷、肉桂 8 种挥发油对 HP 的抑制率,筛选出抑菌活性最强的 3种挥发油。气相色谱-质谱法联用(GC-MS)分析 3 种挥发油的化学成分,利用 TCMSP、Swiss Target Prediction、PubChem数据库获取 3 种挥发油主要活性成分及其对应靶点信息;网络药理学技术预测其潜在活性成分、相关通路及关键靶点;AUTO DOCK Vina 软件对核心成分及关键靶点基因进行分子对接,初步验证潜在活性成分及关键靶点。结果 广藿香、牛至和肉桂挥发油抑制 90% 细菌生长的最低药物浓度(MIC90)分别为 0.250、0.250、0.125 μL·mL-1,具有较强的抑菌活性;从以上 3 种挥发油中分别鉴定出 27、26、15 个化学成分,共筛选出 15 个活性成分,涉及 232 个基因靶点,影响了与抑制 HP相关的癌症通路、化学致癌-受体激活及 EGFR 酪氨酸激酶抑制剂耐药性等 275 条信号通路;分子对接验证结果显示 3 种挥发油抗 HP 与 SRC 蛋白密切相关,15 个活性成分与关键靶点 SRC 的结合较为稳定。结论 广藿香、牛至、肉桂 3 种活性挥发油通过多成分、多靶点、多通路的形式发挥抗 HP 作用。  相似文献   

17.
The toxigenic freshwater cyanobacterium Cylindrospermopsis raciborskii T3 has been used as a model to study and elucidate the biosynthetic pathway of tetrahydropurine neurotoxins associated with paralytic shellfish poisoning (PSP). There are nevertheless several inconsistencies and contradictions in the toxin profile of this strain as published by different research groups, and claimed to include carbamoyl (STX, NEO, GTX2/3), decarbamoyl (dcSTX), and N-sulfocarbamoyl (C1/2, B1) derivatives. Our analysis of the complete genome of another PSP toxin-producing cyanobacterium, Raphidiopsis brookii D9, which is closely related to C. raciborskii T3, resolved many issues regarding the correlation between biosynthetic pathways, corresponding genes and the T3 toxin profile. The putative sxt gene cluster in R. brookii D9 has a high synteny with the T3 sxt cluster, with 100% nucleotide identity among the shared genes. We also compared the PSP toxin profile of the strains by liquid chromatography coupled to mass spectrometry (LC-MS/MS). In contrast to published reports, our reassessment of the PSP toxin profile of T3 confirmed production of only STX, NEO and dcNEO. We gained significant insights via correlation between specific sxt genes and their role in PSP toxin synthesis in both D9 and T3 strains. In particular, analysis of sulfotransferase functions for SxtN (N-sulfotransferase) and SxtSUL (O-sulfotransferase) enzymes allowed us to propose an extension of the PSP toxin biosynthetic pathway from STX to the production of the derivatives GTX2/3, C1/2 and B1. This is a significantly revised view of the genetic mechanisms underlying synthesis of sulfated and sulfonated STX analogues in toxigenic cyanobacteria.  相似文献   

18.
银杏叶提取物与刺梨配伍抗实验性肝损伤作用   总被引:4,自引:0,他引:4  
目的:比较复方银杏叶胶囊(CGB)与单方银杏叶提取物(GBE)的保肝作用。方法:用CGB、GBE给小鼠灌胃30d后,腹腔注射CCl4诱发肝损伤,测定小鼠血清丙氨酸氨基转移酶(ALT)、天门冬氨酸氨基转移酶(AST)及肝匀浆超氧化物歧化酶(SOD)、丙二醛(MDA)含量;用H2O2诱导人肝L-02细胞氧化损伤,观察细胞增殖及总抗氧化能力。结果:CGB2.4、0.8和0.4g/kg3个剂量组与模型组比较,小鼠血清ALT、AST明显降低(P〈0.01,P〈0.05),同时肝匀浆中SOD显著升高、MDA下降(P〈0.01,P〈0.05);CGB组细胞增殖率和总抗氧化能力分别较模型组和单方组显著提高(P〈0.05、P〈0.01)。结论:CGB的抗肝损伤作用优于单方银杏叶提取物。  相似文献   

19.
COX (cyclooxygenase) is one of the key enzymes involved in the synthesis of a variety of prostaglandins (PGs), some of which have been strongly linked to inflammation. One of its two well-known isoforms, COX-2, is an inducible enzyme whose induction and expression is dynamically regulated by growth factors, mitogens, and tumor promoters. Several animal and clinical studies have reported the chemopreventive effect of celecoxib, a selective COX-2 inhibitor; and in particular, a few studies have shown that celecoxib prevents the development of gastric cancer. Administration of celecoxib also showed increases in cardiovascular risk and disruption of renal physiology. Therefore, studies hoping to clarify how selective COX-2 inhibitors modulate gastric cancer must keep in mind that coxibs have also been linked to serious cardiovascular events and disruption of renal physiology. Received 12 July 2006; accepted 21 August 2006  相似文献   

20.
目的 分析克拉玛依市中心医院2017—2020年住院患者常见分离菌分布及耐药率的变迁情况,为指导抗菌药物临床合理应用提供依据。方法 收集2017—2020年克拉玛依市中心医院住院患者抗菌药物使用情况及分离菌,分析主要分离菌对常见抗菌药物的耐药率变化趋势。结果 2017—2019克拉玛依市中心医院抗菌药物使用率和使用强度呈下降趋势,4年共有分离菌12 135株,其中革兰阳性菌2 567株,占21.15%;革兰阴性菌6 310株,占52.00%;真菌3 258株,占26.85%。居前5位的分离菌分别是白色假丝酵母菌(19.59%)、大肠埃希菌(16.84%)、肺炎克雷伯菌(13.33%)、鲍曼不动杆菌(8.71%)和铜绿假单胞菌(7.94%)。主要分离菌对常用抗菌药物耐药率总体呈下降趋势,肠杆菌科细菌对临床常用抗菌药物耐药性下降最明显。结论 克拉玛依市中心医院分离菌逐年增加,耐药率有下降趋势,抗菌药物临床应用基本合理,但需完善真菌检测能力。  相似文献   

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