重庆地区汉族人群MDR1基因单核苷酸多态性及单倍型分析

目的：研究重庆地区汉族人群多药耐药基因1（MDR1）C1236T,G2677A/T,C3435T单核苷酸多态性（SNP）及单倍型的频率.方法：采用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性（PCR-RELP）方法,对重庆地区196（男112,女84）名没有亲缘关系的汉族健康个体MDR1基因C1236T,G2677T/A,C3435T等3个SNPs位点进行基因分型.用SHEsis软件分析MDR1基因的连锁不平衡及单倍型频率.结果：重庆地区汉族人群中C1236T位点、等位基因频率1236C为33.7%,1236T为66.3%;G2677T/A位点、等位基因频率2677G为44.4%,2677T为43.1%,2677A为12.5%;C3435T位点、等位基因频率3435C为56.4%,3435T为43.6%.重庆地区汉族人群中MDR1基因1236-2677-3435位点构成的3种主要单倍型率（频率〉10%）TTT为31.1%,TGC为21.7%,CGC为15.5%.结论：重庆地区汉族人群MDR1基因C1236T,G2677T/A,C3435T等3个SNPs位点的基因型频率、等位基因频率和单倍型频率,为研究该地区MDR1基因单核苷酸多态性与药物效果、药物毒副作用以及疾病易感性之间的相关性提供依据.     

汉族人群β-纤维蛋白原基因五个位点的单倍型研究

目的探讨汉族人群纤维蛋白原β-148C/T、-249C/T、-455G/A、448G/A、1689T/G基因的单核苷酸多态性(SNP)位点及其构成的单倍型和连锁不平衡关系。方法运用多聚酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性技术,对正常老年组(171人)和脑梗死组(132例)进行纤维蛋白原基因多态性分析。结果正常老年组和脑梗死组之间5种突变基因的基因型频率、等位基因频率均无显著性差异(P>0.05)。-148C/T与-249C/T、-455G/A、448G/A、1689T/G之间均存在较松散连锁不平衡;-249C/T与-455G/A、448G/A、1689T/G之间,-455G/A与448G/A、1689T/G之间,以及448G/A与1689T/G之间均存在强连锁不平衡。结论汉族人群β-纤维蛋白原基因5个SNP位点之间存在着有意义的单倍型和连锁不平衡关系,并且单倍型CA、CA以及CG可能降低脑梗死的发病率。     

汉族人群β-纤维蛋白原基因五个位点的单倍型研究

目的探讨汉族人群纤维蛋白原β-148C/T、-249C/T、-455G/A、448G/A、1689T/G基因的单核苷酸多态性(SNP)位点及其构成的单倍型和连锁不平衡关系.方法运用多聚酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性技术,对正常老年组(171人)和脑梗死组(132例)进行纤维蛋白原基因多态性分析.结果正常老年组和脑梗死组之间5种突变基因的基因型频率、等位基因频率均无显著性差异(P＞0.05).-148C/T与-249C/T、-455G/A、448G/A、1689T/G之间均存在较松散连锁不平衡;-249C/T与-455G/A、448G/A、1689T/G之间,-455G/A与448G/A、1689T/G之间,以及448G/A与1689T/G之间均存在强连锁不平衡.结论汉族人群β-纤维蛋白原基因5个SNP位点之间存在着有意义的单倍型和连锁不平衡关系,并且单倍型CA、CA以及CG可能降低脑梗死的发病率.     

IL-4基因启动子SNP-1098T＞G和-590C＞T多态性与云南汉族人群HCV慢性感染的相关性研究

目的 探讨IL-4基因启动子区SNP-1098T＞G和-590C ＞T位点与HCV慢性感染的相关性.方法 采用TaqMan探针基因分型方法对HCV慢性感染患者192例和健康体检人群170例IL-4基因启动子SNP-1098T＞G和-590C ＞T位点进行基因分型,计算2个SNP位点的连锁不平衡,并构建单倍型,获得以上2个SNP位点及其单倍型与HCV慢性感染的相关性数据.结果 IL-4基因启动子SNP-1098T＞G和-590C＞T位点基因型和等位基因频率分布差异在病例组和对照组中无统计学意义(P＞0.05).连锁不平衡结果显示,SNP-1098T＞G和-590C＞T位点为连锁不平衡,D'值为0.937.构建单倍型后发现,SNP-1098T＞G和-590C＞T位点构建的单倍型频率分布差异在病例组和对照组中无统计学意义(P＜0.05).结论 IL-4基因启动子区SNP-590C＞T和-1098T＞G多态性与云南汉族人群HCV慢性感染的无相关性.     

汉族人群慢性牙周炎患者IL-13和IL-4基因多态性及连锁不平衡研究

目的 研究汉族人群慢性牙周炎患者白介素13(IL-13)和IL-4基因多态性分布情况及其与慢性牙周炎发病的可能关系.方法 采用基质辅助激光解吸离子化-飞行时间质谱法(MALDI-TOF-MS)对慢性牙周炎组(n=278)和健康对照组(n=324)IL-13基因中rs2070874和rs1800925及IL-4基因中rs2243248的单核苷酸多态性(SNP)进行检测,计算等位基因频率和基因型分布,并进行连锁不平衡及单倍型分析.结果 慢性牙周炎组与健康对照组rs1800925的TT基因型和T等位基因与rs2243248的GG基因型和G等位基因频率的差异有统计学意义(P＜0.05);两组间rs2070874 T/rs1800925 T/rs2243248 G单倍型及另外两种单倍型rs2070874 T/rsl800925 C/rs2243248 G与rs2070874 T/rs1800925 T/rs2243248 T的分布差异也有统计学意义(P＜0.05).结论 IL-13基因rs 1800925和IL-4基因rs2243248的SNP可能与中国汉族人群慢性牙周炎的发病易感性相关.     

甘肃裕固族、东乡族、保安族人群CD14基因启动子区-159C/T多态性研究

目的 了解裕固族、东乡族、保安族人群CD14基因启动子区- 159位点基因多态性及其分布特点.方法 采用梯度PCR-RFLP技术研究以上3个民族人群CD14 - 159C/T基因多态性,并与文献报道的我国不同地区汉族人群进行对比分析.结果 裕固族、东乡族、保安族3个民族的研究样本CD14 - 159C/T位点频率分布均服从哈代-温伯格平衡,3个民族CD14 - 159C/T位点均以C等位为主,C等位检测频率分别为68.75％、82.40％、73.33％.我国不同地区汉族人群CD14 - 159C/T位点等位均以T等位为主,T等位频率分布在50.66％ ～63.94％之间.结论 裕固族、东乡族、保安族人群CD14 -159基因多态性分布特点与中国汉族人群存在明显差别,- 159位点等位在裕固族、东乡族、保安族人群中均以C等位为主,我国不同地区汉族人群均以T等位为主.     

CD24分子基因多态性与系统性红斑狼疮的相关性研究

目的:研究CD24基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs52812045与中国汉族人群系统性红斑狼疮(SLE)的相关性。方法:采用聚合酶链反应及限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法,对54例SLE患者及70例健康对照者CD24SNP位点rs52812045进行多态性检测。结果:CD24基因位点rs52812045可以检测到T/T、T/C、C/C 3种等位基因分布;系统性红斑狼疮患者和健康对照者CD24基因型T/T的频率分别为29.6%和11.5%,CD24的杂合基因型T/C的分布分别为51.9%和31.4%,基因型C/C的频率分别为18.5%和57.1%。统计学分析,SLE组CD24基因rs52812045位点T等位基因携带者显著高于正常对照组[分别为73.1%和42.9%,χ2=9.318,P<0.05,OR=2.182(1.068-4.458)],T等位基因频率显著高于对照组(分别为44.4%和27.1%,χ2=8.056,P<0.05)。结论:CD24SNP位点rs52812045与中国汉族人群SLE的发病具有显著相关性;CD24SNP位点rs52812045的T等位基因可能是SLE的易感基因之一。     

云南汉族人群IL-10基因启动子多态性与HCV慢性感染的相关性研究

目的探讨IL-10基因启动子SNP-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)、-592C/A(rs1800872)位点与HCV慢性感染的相关性.方法入选云南地区汉族人群HCV慢性感染患者379例,健康对照364例.采用Taq Man探针基因分型方法对IL-10基因启动子SNP-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)、-592C/A(rs1800872)的3个位点进行基因分型,并构建单倍型,评估上述3个SNPs及单倍型与HCV慢性感染的相关性.结果在病例组和对照组中,IL-10基因启动子SNP-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)、-592C/A(rs1800872)基因型频率和等位基因频率差异没有统计学意义(P>0.05).单倍型分析结果显示,SNP-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)和-592C/A(rs1800872)构建的单倍型频率的差异无统计学意义(P>0.05).结论在云南汉族群体中,IL-10基因启动子SNP-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)、-592C/A(rs1800872)与HCV慢性感染没有相关性.     

云南汉族人群KRAS基因多态性与宫颈癌发生风险的相关性

目的 探讨Kirsten大鼠肉瘤病毒癌基因同源物(KRAS)基因中的单核苷酸多态性位点(SNPs)与云南汉族人群宫颈癌发生风险的相关性。方法 选取云南地区汉族人群宫颈癌患者496例作为病例组、健康个体499例作为对照组,采用TaqMan探针基因分型法对KRAS基因3′-UTR区域3个SNPs位点rs12587(G>T)、rs12245(A>C)、rs1137282(A>G)进行基因分型,并分析其与云南汉族地区人群宫颈癌易感性的相关性。结果 KRAS基因3′-UTR区域3个SNPs位点的等位基因和基因型在病例组和对照组中分布频率比较,差异无统计学意义(P>0.05);单倍型分析结果显示,单倍型rs12587T-rs12245A-rs1137282A在病例组中的分布频率显著低于对照组(P<0.001),该单倍型可能是宫颈癌发生的保护性因素(OR=0.517, 95%CI:0.384～0.697)。结论 KRAS基因3′-UTR区域SNP位点rs12587(G>T)、rs12245(A>C)及rs1137282(A>G)组成的单倍型可能与云南汉...     

中国汉族女性中G72基因与精神分裂症的关系

目的 研究在中国汉族女性中NMDA受体途径重要基因G72与精神分裂症的关系。方法 在545名中国汉族女性(精神分裂症患者260例,正常对照285例)中对位于G72基因的3个单核苷酸多态性位点(rs3916965、rs3916967和rs2391191)进行基因分型和连锁不平衡分析。结果 遗传标记rs3916967的等位基因G(P=0.038 6)和rs2391191的等位基因A(P=0.009 6)均与精神分裂症相关。此外,由3个单核苷酸多态性位点构建的单倍型分析表明,单倍型GAG在病例-对照组中表现出统计学差异(P=0.002 4)。结论 在中国汉族女性中,G72基因是精神分裂症的一个重要易感基因,在后续的研究中有必要对本结果进行进一步的验证。     

CD14和IL-8基因多态性与新生儿坏死性小肠结肠炎易感性的关联性分析

目的：探讨白细胞分化抗原14（CD14）-159C/T（rs2569190）和白细胞介素8（IL-8）-251A/T（rs4073）基因多态性与坏死性小肠结肠炎（NEC）易感性之间的关系,阐明NEC易感性的可能影响因素,为NEC的发病机制研究提供遗传学理论依据。方法：选取28例NEC新生儿（NEC组）和41例非NEC新生儿（对照组）作为研究对象,提取并应用基因聚合酶链式反应（PCR）扩增其外周血DNA,并采用Sanger基因测序方法,检测CD14-159C/T和IL-8-251A/T区域的等位基因频数和基因型频数的分布,探讨其与NEC易感性的关联性。结果：CD14-159C/T和IL-8-251A/T位点基因型频数分布符合Hardy-Weinberg平衡定律（P>0.05）;CD14-159C/T的等位基因和基因型频数分布在2组间比较差异无统计学意义（P>0.05）;IL-8-251A/T位点的基因型频数分布在2组间比较差异无统计学意义（P>0.05）;而NEC组IL8-251A/T基因位点T等位基因频数分布高于对照组（χ²=4.184,P=0.041,OR=2.14,95% CI：1.03~4.46）。结论：CD14-159C/T的基因位点多态性和NEC的发病无关联,而IL-8基因的-251 T位点与NEC发病易感性存在关联,IL-8基因的-251 T等位基因突变可能是NEC的危险因素之一。     

张家口籍汉族人CD14 基因及其-159C/T 位点多态性与心血管疾病关联研究

目的：探讨人白细胞分化抗原14（cluster of differentiation antigen 14,CD14）基因编码蛋白的理化性质、功能和基因多态性与心血管疾病的相关性,为预防、治疗心血管疾病提供依据。方法：收集心血管疾病患者血浆标本75 例（男性患者42 例,女性患者33 例）;健康对照组125 例（男性患者80 例,女性患者45 例）,抽取静脉血提取基因组DNA,利用聚合酶链反应- 限制性片段长度多态性（polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP）技术检测CD14 基因-159C/T（rs2569190）位点多态性,并通过电泳观察酶切结 果,统计基因型频率,判断其与心血管疾病的相关性。利用生物信息学方法对CD14 基因编码蛋白进行理化性质、结构、功能和互作分析论证CD14 基因编码蛋白与心血管疾病发生存在的联系。结果：在患病组CD14-159C/T（rs2569190）的TT 基因型分布频率为56%,显著高于正常对照组（40.8%）,差异具有统计学意义（P<0.05）,其余基因型均无统计学意义（P>0.05）。CD14 为分泌蛋白,位于细胞外基质,无跨膜区,亲水性较弱。CD14 蛋白二级 结构中无规则卷曲较多（占41.87%）。CD14 与10 个蛋白直接互作,在Toll 样受体4 信号通路和MyD88 依赖的Toll 样受体信号转导途径中发挥重要作用。结论：CD14 基因-159C/T（rs2569190） TT 基因型,与心血管疾病发生密切相关,CD14 蛋白可能在心血管疾病的发生发展过程中发挥重要作用。     

广西地区汉族人群CD14基因启动子-159C/T多态性研究

目的 了解CD14基因启动子-159C／T多态性各等位基因及基因型在广西地区汉族人群中的分布频率,比较其在不同种族间分布的差异。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）技术检测208例汉族人的CD14基因型,并结合文献对不同种族间的CD14基因型和等住基因的分布频率进行比较分析。结果在广西汉族人群中CC,CT和TT基因型频率分别为14．9％,54．3％和30．8％;等位基因C及T频率分别为42．1％和57．9％,CD14基因多态性分布在男女间差异均无显著性（P〉0．05）。与德国人、挪威人、希腊人、捷克人、以色列人、意大利人比较,CD14基因多态性差异存在显著性（P〈0．05）。结论在广西地区汉族人群中存在CD14基因启动子-159C／T多态性。其在不同种族间的分布可能存在差异,这种差异可能是导致一些疾病在不同种族间的发生、转归和预后不同的遗传因素之一。     

CD14基因启动子多态性与冠心病的关系

目的: 研究白细胞分化抗原14(CD14)基因启动子-159C/T,-260C/T多态性各等位基因及基因型在冠心病患者中的分布频率,分析CD14基因型及血清CD14水平与冠心病的相关性. 方法: 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,检测246例冠心病患者及258名正常人对照组CD14的基因多态性,同时采用酶联免疫吸附试验(ELISA)检测血清CD14水平. 结果: 冠心病组血清CD14水平显著高于对照组(P<0.01),CD14基因-159C/T多态性在冠心病组和正常人群中的分布差异无显著性(P>0.05),而CD14基因-260C/T多态性在两组人群中的分布差异存在显著性(P<0.05),等位基因频率的相对风险分析发现,T等位基因携带者患冠心病的风险是C等位基因的1.417倍(OR=1.417,95%CI:1.106～1.816),携带T等位基因的冠心病患者血清CD14水平显著高于不携带者(P<0.05). 结论: CD14基因启动子-260C/T多态性与冠心病的发病具有相关性,其中T等位基因可能是冠心病发病的遗传易感基因;携带T等位基因的个体可能通过促进CD14的高度表达进而增加了冠心病的发病风险.     

上海地区脑梗死患者肝脂酶基因启动子4个位点的连锁不平衡分析

目的：探讨上海地区脑梗死患者肝脂酶启动子250G／A、514C／T、710T／C和763A／G基因的单核苷酸多态性（SNP）位点及其构成的单倍型和连锁不平衡关系。方法：运用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术,对脑梗死组（133例）和健康对照组（112名）进行肝脂酶基因多态性分析。结果：与健康对照组相比,脑梗死组的-250G／A、-514C／T基因型和等位基因频率分布差异均有统计学意义（均P〈0．05）;与健康对照组相比,脑梗死组的-710T／C、-763A／G基因型和等位基因频率分布差异无统计学意义（均P〉0．05）。同时配对连锁不平衡检验表明,-250G／A与-514C／T、-710T／C、-763A／G之间,-514C／T与-710T／C、-763A／G之间,以及-710T／C与-763A／G之间均存在强连锁不平衡。另外,等位基因-250G与-514C、-710C、-763G以及-514C与-710C、-763G分别配对时,在脑梗死组的出现率明显低于在对照组的出现率;等位基因-250A与-514T、-710T、-710C、-763G,-514T与-710C、-763G以及-710T与-763G分别配对时,在脑梗死组的出现率明显高于在对照组的出现率。结论：上海地区脑梗死患者肝脂酶基因4个SNP位点之间存在着有意义的单倍型和连锁不平衡关系,并且单倍型GC、GG以及CC可能降低脑梗死的发病率。而单倍型AT、AC、AG、TC以及TG可能提高脑梗死的发病率。     

广西壮族人群白细胞介素-27基因rs17855750G/T、rs40837A/G多态性分布特点

目的 分析广西壮族人群白细胞介素(IL)-27基因rs17855750 G/T、rs40837 A/G多态性分布特点,对比其基因型和等位基因频率与不同国家(地区)间种族的分布差异.方法 采用单碱基延伸的PCR技术对168例广西壮族人群IL-27基因rs17855750 G/T、rs40837 A/G进行多态性检测,对比国际人类基因组计划(HapMap)公布的中国北京人、日本人、非洲人和意大利人的单核苷酸多态性(SNP)分型数据,分析5个人群rs17855750 G/T、rs40837 A/G位点的基因型和等位基因频率差异.结果 在广西壮族人群中IL-27基因rs17855750 G/T位点TT基因型最常见,约为70.2％,T等位基因频率最高,约为50.3％,rs40837 A/G多态性位点AA基因型最常见,约为35.7％,A等位基因频率最高,约为52.1％,IL-27基因rs17855750 G/T、rs40837 A/G多态性位点基因型及等位基因频率男女性别间比较差异无统计学意义(P＞0.05),IL-27 rs17855750 G/T与北京人比较差异无统计学意义(P＞0.05),但与日本人、意大利人和非洲人比较差异有统计学意义(P＜0.01);IL-27 rs40837 A/G与北京人比较差异有统计学意义(P＜0.05),且与日本人、非洲人和意大利人比较差异也有统计学意义(P＜0.01).结论 IL-27基因rs17855750 G/T、IL-27 rs40837 A/G位点基因型和等位基因在广西壮族人群中的分布频率与其他国家(地区)人群相比存在差异,这种差异可能是导致某些疾病在不同人群发病率和临床表现存在差异的原因之一.     

炎症性肠病CD14基因启动子159多态性及其意义

目的了解上海地区汉族炎症性肠病(IBD)患者CD14基因启动子159多态性和等位基因频率的分布情况,探讨其多态性与IBD的关系。方法采用PCR-RFLP法,对IBD组(n=84)[溃疡性结肠炎(UC)组(n=43)、克罗恩病(CD)组(n=41)]和健康对照组(n=135)CD14基因启动子159位点进行基因分型,计算等位基因频率分布,测定PCR产物核苷酸序列。结果IBD组CD14-159CC、CT、TT基因型分别为14.29%、50.00%、35.71%,对照组分别为14.07%、53.33%、32.59%,两组的基因型和等位基因频率间均无统计学差异(P>0.05);CD、UC组的基因型和等位基因频率与对照组比较也无统计学差异(P>0.05)。对照组男性的T等位基因频率显著高于女性(64.67%vs52.50%,P=0.043)。结论CD14基因启动子C-159T多态性与上海地区汉族IBD无明显相关性;CD14基因多态性可能存在性别差异。     

Association between the promoter polymorphism T/C at position -159 of the CD14 gene and anti-inflammatory therapy in patients with inflammatory bowel disease

Immune response to intestinal bacteria and genetic predisposition seem to play a crucial role in the pathogenesis of inflammatory bowel disease. A single nucleotide polymorphism in the promoter of the lipopolysaccharide-receptor CD14 gene (T/C at position -159) has recently been described. To evaluate the role of the CD14 gene in anti-inflammatory therapy, the functionally relevant T(-159)-->C promoter polymorphism has been genotyped in 72 patients with inflammatory bowel disease and associated with the cumulative steroid dose. Cumulative corticosteroid dose was significantly higher in ulcerative colitis patients with the TT genotype (2447.7 +/- 927.0 mg/yr) compared with the CT genotype (142.3 +/- 142.3 mg/yr, p=0.016) and the CC genotype (391.7 +/- 272.7 mg/yr, p=0.047). In contrast, in patients with Crohn's disease there was no significant difference of the cumulative corticosteroid doses between the various T(-159)-->C promoter CD14 genotypes. An altered immune response to lipopolysaccharides with influence on the anti-inflammatory therapy seems to play a role in the genetic predisposition to ulcerative colitis. Genetic stratification will lead to the development of individualized therapies in inflammatory bowel disease.     

肿瘤坏死因子基因组多态性在脓毒症发病中的作用

目的　探讨肿瘤坏死因子 (TNF)及内毒素受体 (CD14 )基因组上单个核苷酸多态性(SNP)的频率、基因型与外科感染病人脓毒症发病的关系 ,观察SNP对在体单个核细胞 (PBMC)内TNF αmRNA表达的影响。方法　选择 113例外科感染的患者 ,10 0例正常人群为对照组 ,对TNF基因上 3个位点及CD14基因 1个位点进行PCR扩增、限制性内切酶酶切分析SNP基因型。患者分全身炎症反应综合征 (SIRS)组和脓毒症组 ,对各SNP基因型的频率进行分析。在出现脓毒症临床表现 2 4h内 ,对PBMC内TNF αmRNA表达水平进行测定。结果　TNF基因组上的 3个SNP均可影响在体PBMC内TNF αmRNA的表达。CD14基因组 - 15 9位点C→T、TNF基因组上 - 30 8位点G→A、- 86 3C→A 3个SNP与脓毒症的发生有相关性 (P <0 .0 5 )。结论　TNF基因组上的SNP通过影响TNF αmRNA的表达而影响机体对感染的反应性 ,产生SIRS甚至脓毒症等临床表现。     

APOBEC3G基因多态性与慢性乙型肝炎易感性的关系

目的探讨载脂蛋白B mRNA编辑酶催化多肽3G（APOBEC3G）基因rs185983011位点在人群中的多态性分布,并研究其
与慢性乙型肝炎易感性的关系。方法分别收集186例HBsAg和HBeAg皆阴性的健康者、159例慢性乙型肝炎患者的血液样
本。应用Sanger测序方法检测该研究对象APOBEC3G基因rs185983011位点的多态性,确定其基因型及等位基因分布情况。
并将该位点的多态性与慢性乙型肝炎的易感性之间的关系进行统计学分析。结果SNP rs185983011位点存在于检测人群中的
基因型只有C/C和C/T,其中以C/C为主（97.7%）。SNP rs185983011位点的基因型频率和等位基因频率在慢性乙型肝炎患者组
和健康者组中的分布无统计学差异（P>0.05）。结论研究人群APOBEC3G基因中rs185983011位点的基因型主要是C/C,未发
现该位点的多态性与慢性乙型肝炎易感性存在相关性。