基于特征图谱及网络药理学的大柴胡汤质量标志物研究

大柴胡汤临床应用广泛、疗效确切,为治疗胆囊炎的经典方剂。然而其成分多样、作用复杂,传统质控指标难以反映其整体功效。因此本研究基于特征图谱和网络药理学预测大柴胡汤质量标志物,以期对大柴胡汤整体质量进行有效控制。研究首先利用虚拟筛选技术获得35个大柴胡汤潜在药效成分。其次采用高效液相色谱-二极管阵列检测器(HPLC-DAD)建立15批大柴胡汤的特征图谱,结合对照品,指认化学成分。初步将芍药内酯苷、芍药苷、柚皮苷、橙皮苷、新橙皮苷、黄芩苷、汉黄芩苷、柴胡皂苷b2、柴胡皂苷b1定为大柴胡汤潜在质量标志物。最后利用网络药理学技术手段,构建“成分-靶点-通路-生命过程”网络图,探究其治疗胆囊炎的作用机制,进而明确质量标志物的准确性。结果显示潜在质量标志物可作用于多靶点从而达到抗炎、调节代谢等目的,进而联合治疗胆囊炎。质量标志物与大柴胡汤主要药理作用吻合,可表征大柴胡汤的整体功效。该研究结合特征图谱及网络药理学,挖掘大柴胡汤的质量标志物,为大柴胡汤的质量控制及评价提供依据。     

基于网络药理学和分子对接探究柴胡清肝汤治疗肉芽肿性乳腺炎的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨柴胡清肝汤治疗肉芽肿性乳腺炎的作用机制。方法 利用TCMSP数据库和Uniprot数据库筛选柴胡清肝汤的有效活性成分和作用靶点信息,利用GeneCards数据库获取肉芽肿性乳腺炎的相关靶点,并利用Cytoscape 3.9.1软件构建药物-成分-共同靶点关系网络。通过Venny 2.1.0构建韦恩图获取药物和疾病的共同靶点,利用STRING数据库获取核心蛋白的相互作用网络,运用DAVID数据库对关键靶点进行GO富集和KEGG通路富集分析,运用AutoDock及Pymol对关键靶点与相应活性成分进行分子对接验证,分析柴胡清肝汤治疗肉芽肿性乳腺炎的潜在作用机制。结果 共获得柴胡清肝汤有效活性成分199个,药物-疾病作用靶点23个,其中槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、豆甾醇、黄芩素等关键有效活性成分与IL-6、TNF、ALB、IL-1β、CXCL8、STAT3、CCL2、IL-4等靶点相互作用,调控IL-17、Toll样受体、细胞因子受体相互作用、NF-κB、TNF等信号通路,分子对接结果显示筛选的主要活性成分与其对应靶蛋白具有较好的结合活性。结论 柴胡清肝...     

基于网络药理学和分子对接的大黄牡丹汤治疗炎症性肠病作用机制研究

目的:初步探讨大黄牡丹汤治疗炎症性肠病的作用机制.方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库及文献筛选大黄牡丹汤成分,通过Swiss target prediction数据库预测其靶点,与Genecards数据库中筛选的炎症性肠病靶点取交集,并在SRTING数据库进行蛋白互作关系分析,筛选关键靶点进行...     

基于网络药理学和生物信息学探讨小柴胡汤治疗肝细胞癌的作用机制

目的 采用TCGA数据挖掘和网络药理学方法分析小柴胡汤治疗肝细胞癌(HCC)的药效物质基础及药理机制.方法 通过TCGA数据库挖掘HCC差异表达基因、通过TCMID、TCMSP数据库和文献检索得到小柴胡汤的活性成分及其作用靶点;绘制韦恩图获得小柴胡汤-HCC共有靶点.通过Cytoscape软件构建疾病-药物-有效成分-...     

基于网络药理学和分子对接法探讨柴胡疏肝散治疗功能性消化不良的作用机制

目的 探讨柴胡疏肝散治疗功能性消化不良的潜在分子机制.方法 通过TCMSP收集筛选柴胡疏肝散有效成分,通过PubChem和Swiss Target Prediction得到柴胡疏肝散的潜在靶点,利用GeneCards、OMIM、DisGeNET及DrugBank数据库得到功能性消化不良疾病靶点.采用Cytoscape ...     

基于网络药理学的三黄汤治疗湿疹作用机制研究

目的：基于网络药理学方法并结合体外THP-1巨噬细胞炎症模型预测三黄汤治疗湿疹的有效成分及可能作用机制。方法：采用中药系统药理数据库和分析平台（TCMSP）筛选三黄汤中的活性化学成分,通过GeneCard数据库查找化合物与湿疹共有靶点;采用Cytoscape软件构建“成分-靶点-疾病”网络,利用STRING数据库进行蛋白互作（PPI）网络分析,用DAVID数据库进行基因功能注释分析（GO）和信号通路富集分析（KEGG）,预测三黄汤治疗湿疹的作用机制。使用PMA联合脂多糖（LPS）刺激THP-1细胞,同时三黄汤干预,荧光定量（qRT-PCR）、酶联免疫吸附（Elisa）分别检测细胞炎症因子表达,蛋白质印迹法（Western blot）检测相关蛋白表达。结果：共筛选出42个活性化合物,74个共有靶点,分析出91条生物过程,包括细胞因子受体结合、受体配体活性、受体调节活性、转录因子活性调节序列特异性DNA结合、核受体的活动、辅因子结合等。密切相关的通路有AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路、Toll样受体信号通路、人巨细胞病毒感染、C型凝集素受体信号通路、Th17细胞...     

基于网络药理学的大补脾汤治疗2型糖尿病的作用机制

目的运用网络药理学的方法探究大补脾汤治疗2型糖尿病的作用机制。方法借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)、SwissTargetPrediction检索大补脾汤中单药的化学成分和作用靶点,通过DrugBank,TTD,TCMSP,DisGeNet数据库查询与2型糖尿病相关的基因。利用UniProt数据库查询靶点对应的基因,进而采用Cytoscape 3.7.0构建化合物-靶点-疾病网络、蛋白相互作用(PPI)网络筛选出核心靶点,最后借助Omicshare Tools在线软件对京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析和基因本体(GO)功能分析进行可视化。结果通过筛选得到151个活性化学成分,791个靶点,其中与2型糖尿病靶点有关的靶点有80个,根据度值和介数中心度的筛选,得到23个关键靶点,包括ALB,PPARG,CYP3A4,SIRT1,SLC2A4,MAOB,NR3C1等。大补脾汤治疗2型糖尿病的通路可能包括胆汁分泌、神经活性配体-受体相互作用、AMPK信号通路、VEGF信号通路、cAMP信号通路等。结论大补脾汤是通过多成分以及多靶点的相互作用,调控多条通路治疗2型糖尿病,但具体的调控机制需要进一步的实验研究验证。     

基于网络药理学的黄芩汤治疗溃疡性结肠炎的潜在机制研究

利用网络药理学和系统生物学方法探究黄芩汤治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)分子机制。从中药系统药理学分析平台TCMSP挖掘黄芩汤中4味中药相关的化学成分和作用靶点;通过OMIM数据库、TTD数据库以及GeneCard数据库筛选UC的预测靶点。利用Cytoseape_v3.7.1软件构建化合物-靶点网络;基于STRING数据库,构建黄芩汤治疗UC靶点互作网络,根据拓扑学参数筛选黄芩汤治疗UC的核心靶点。利用Bioconductor中的R包clusterprofile version 3.12.0对疾病与药物交集靶点进行GO (gene ontology)生物学过程富集分析和KEGG (KEGG pathway analysis)通路注释分析。结果发现,黄芩汤化合物-UC靶点网络包含128个化合物和相应靶点141个,核心靶点涉及AKTI、IL6、PTGS2、IL10、IL1β等。GO功能富集分析得到151个GO条目, KEGG富集筛选得到33条和UC有关通路,主要涉及PI3K-AKT信号通路、NF-κB信号通路、TNF信号通路、Toll样受...     

基于网络药理学的菊苣抗高脂血症作用机制研究

目的 采用网络药理学方法,揭示菊苣抗高脂血症的活性成分、潜在药物靶点和作用机制。方法 通过公共数据库中获取菊苣的活性成分、潜在药物靶点以及高脂血症的相关基因,并结合相关软件进行网络药理学分析,包括蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）、基因本体（GO）分析和京都基因和基因组百科全书（KEGG）分析。结果 从TCMSP数据库共筛选菊苣活性成分12个,包括β-谷甾醇、木犀草素等核心成分,涉及相关基因靶点156个。PPI网络涉及56个潜在药物靶点,Degree值排名前5的核心靶点分别是AKT1、IL6、TP53、TNF、VGEFA。GO功能分析共获得269个条目（P<0.05）,KEGG通路富集得到71条信号通路（P<0.05）,包括VEGF信号通路、脂肪细胞因子信号通路、细胞凋亡等通路。结论 菊苣抗高脂血症是多成分、多靶点、多通路的综合效应,其机制可能与参与脂质合成、炎症反应、细胞凋亡等过程相关。     

基于网络药理学研究二仙汤治疗乳腺癌的作用机制

目的:利用网络药理学方法,探讨二仙汤治疗乳腺癌的潜在作用机制.方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)收集二仙汤药物的活性成分和其作用靶点,运用G...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨柴胡-桂枝治疗急性缺血性脑卒中的作用机制

目的:应用网络药理学方法,探讨柴胡-桂枝治疗急性缺血性脑卒中的核心成分、关键靶点、生物学功能及信号通路,并通过分子对接技术初步验证.方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis p...     

基于网络药理学探讨小陷胸汤治疗血脂异常的作用机制

目的： 探讨小陷胸汤治疗血脂异常的作用机制。方法： 通过在TCMSP平台对小陷胸汤进行活性成分筛选并收集靶点信息；在Genecard，malacard，omim，digsee以及DisGenet等数据库中进行检索，获取疾病靶点；构建韦恩图，得到小陷胸汤治疗血脂异常的潜在作用靶点；并进行GO功能注释和KEGG通路富集分析；构建小陷胸汤中药-成分-靶点-信号通路网络，进行网络特征分析；结合前期研究结果，构建相关网络并分析。结果： 共挖掘到小陷胸汤中38种成分及101个潜在靶点，血脂异常疾病1 201个相关靶点，得到小陷胸汤-疾病共同靶点50个。共同靶点主要富集于343个生物过程和49条信号通路上。槲皮素可调节PPARA、eNOS，而与PPARA、eNOS相关的30个靶点中有7个靶点参与动脉粥样硬化通路的调控。结论： 小陷胸汤可能是通过RELA，IL6，PRKCA，NCOA2，CASP3等靶点，调控动脉粥样硬化通路、AGE-RAGE、TNF-α等信号通路，来调节血脂并预防或延缓AS的发生、发展。     

基于网络药理学研究蒙药复方三子汤治疗类风湿关节炎的作用机制

目的 基于网络药理学研究蒙药复方三子汤治疗类风湿关节炎（RA）的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索三子汤组方中药物的活性成分,通过UniProt数据库进行靶点预测;通过人类基因数据库（GeneCards）、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）获取RA疾病的相关靶点;绘制韦恩图并获取三子汤活性成分与RA的共同靶点;基于String数据库构建药物疾病共同靶点的蛋白相互作用（PPI）网络;采用Cytoscape 3.8.0软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络,应用网络分析仪（NetworkAnalyzer）工具进行拓扑分析筛选三子汤发挥治疗RA作用的重要活性成分及核心靶点;对相关靶点进行基因本体（GO）生物功能分析和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析研究三子汤治疗RA的作用机制。结果 从三子汤中共筛选出32个活性成分及201个相关靶点;得到三子汤治疗RA的靶点97个;通过网络拓扑分析得出三子汤发挥治疗RA作用的重要靶点基因主要有IL-6、TNF、AKT1、VEGFA、IL-1β等,重要活性成分有槲皮素、山柰酚、鞣花酸、β-谷甾醇等;GO生...     

基于网络药理学探讨甘露消毒汤治疗新型冠状病毒肺炎的作用机制

目的:基于网络药理学的研究方法,探讨甘露消毒汤治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的可能机制.方法:采用SPSS Clementine 12.0软件对甘露消毒汤中所有药材的性味归经进行网络关联规则分析;通过中药系统药理学数据库和分析平台、中药系统药理学成分分析平台、中医药综合数据库等数据库,获取甘露消毒汤的活性成分...     

基于网络药理学探讨栀子豉汤治疗抑郁、焦虑和失眠的作用机制

目的 基于网络药理学方法探讨栀子豉汤治疗抑郁、焦虑和失眠的作用机制.方法 筛选栀子豉汤活性成分;通过PharmMapper和CTD获取成分对应的靶点;将成分靶点与TTD、OMIM、DrugBank、CTD、Gene-Cards、DisGeNET数据库中获取的抑郁、焦虑和失眠疾病靶点分别取交集,将交集靶点分别导入Stri...     

乌头汤治疗骨关节炎作用机制的网络药理学研究

目的:研究乌头汤治疗骨关节炎的作用机制,为骨关节炎的治疗提供新的方向与靶点。方法:以口服生物利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18为指标,借助中药系统药理学数据库及分析平台(TCMSP)筛选乌头汤中川乌、麻黄、黄芪、白芍与甘草的活性成分;通过检索治疗靶点数据库(TTD)等数据库和挖掘基因表达数据库(GEO)中的芯片数据获取骨关节炎的作用靶点;利用生物学信息注释数据库(DAVID)对靶点基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:从乌头汤中共筛选出活性成分30个,包括槲皮素、丁子香萜、栀子醇等,与骨关节炎相关的作用靶点31个,包括β2肾上腺素能受体、花生四烯酸5-脂氧合酶、雄激素受体等。乌头汤治疗骨关节炎的生物过程与白细胞介素1受体信号转导、过氧化物酶增殖激活受体的协同激活作用、酪氨酸激酶受体2的信号转导作用等有关。乌头汤主要通过调节肿瘤坏死因子信号通路、血管内皮生长因子信号通路、破骨细胞分化信号通路、核转录因子κB信号通路、Toll样受体信号通路等发挥治疗骨关节炎的作用。结论:本研究采用网络药理学分析了乌头汤治疗骨关节炎的潜在作用机制,可为进一步研究乌头汤治疗骨关节炎的药效物质基础及作用靶点提供参考。     

大柴胡汤治疗胆囊积液

大柴胡汤随症加减治疗胆囊积液,取得较好疗效,现报告如下: 1 资料与方法 1.1 资料 本组30例,均为2004-2007年就诊的门诊或住院患者.其中女18例、男12例,年龄在28～61岁,平均为40.5岁.病程3个月～3年.     

基于网络药理学研究梅花入骨丹治疗骨性关节炎的潜在靶点和作用机制

目的 采用网络药理学和生物信息学方法探讨中药梅花入骨丹治疗骨性关节炎的主要成分、潜在作用靶点和作用机制.方法 收集获取梅花入骨丹化学成分及SDF结构,利用Swiss ADME和Swiss Target Prediction数据库筛选其有效活性成分并预测其作用靶点;通过GeneCards、OMIM、TTD数据库检索骨性关...